FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4244, 909 aa
1>>>pF1KE4244 909 - 909 aa - 909 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6178+/-0.00143; mu= 2.1364+/- 0.084
mean_var=353.5856+/-77.721, 0's: 0 Z-trim(109.6): 875 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.068207
statistics sampled from 10059 (11005) to 10059 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.668), E-opt: 0.2 (0.338), width: 16
Scan time: 3.480
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS64999.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 590) 698 83.9 9.9e-16
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CCDS33132.2 ZNF749 gene_id:388567|Hs108|chr19 ( 778) 679 82.1 4.3e-15
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CCDS33130.1 ZNF543 gene_id:125919|Hs108|chr19 ( 600) 648 79.0 3e-14
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CCDS31418.1 ZNF214 gene_id:7761|Hs108|chr11 ( 606) 642 78.4 4.6e-14
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CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 638 77.9 5.8e-14
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CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 627 76.8 1.1e-13
CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 632 77.6 1.2e-13
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 627 76.8 1.2e-13
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 627 76.9 1.2e-13
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 627 76.9 1.2e-13
CCDS54214.1 ZNF177 gene_id:7730|Hs108|chr19 ( 481) 625 76.6 1.3e-13
CCDS43429.1 ZNF391 gene_id:346157|Hs108|chr6 ( 358) 622 76.1 1.3e-13
>>CCDS30960.1 ZBTB41 gene_id:360023|Hs108|chr1 (909 aa)
initn: 6292 init1: 6292 opt: 6292 Z-score: 3368.6 bits: 634.5 E(32554): 2.6e-181
Smith-Waterman score: 6292; 100.0% identity (100.0% similar) in 909 aa overlap (1-909:1-909)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MKKRRKVTSNLEKIHLGYHKDSSEGNVAVECDQVTYTHSAGRPTPEALHCYQELPPSPDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MKKRRKVTSNLEKIHLGYHKDSSEGNVAVECDQVTYTHSAGRPTPEALHCYQELPPSPDQ
10 20 30 40 50 60
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pF1KE4 RKLLSSLQYNKNLLKYLNDDRQKQPSFCDLLIIVEGKEFSAHKVVVAVGSSYFHACLSKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RKLLSSLQYNKNLLKYLNDDRQKQPSFCDLLIIVEGKEFSAHKVVVAVGSSYFHACLSKN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PSTDVVTLDHVTHSVFQHLLEFLYTSEFFVYKYEIPLVLEAAKFLDIIDAVKLLNNENVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PFHSELTEKSSPEETLNELTGRLSNNHQCKFCSRHFCYKKSLENHLAKTHRSLLLGKKHG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LKMLERSFSARRSKRNRKCPVKFDDTSDDEQESGDGSDNLNQENFDKEKSDRNDSEDPGS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 EYNAEEDELEEEMSDEYSDIEEQSEKDHNDAEEEPEAGDSVGNVHEGLTPVVIQNSNKKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EYNAEEDELEEEMSDEYSDIEEQSEKDHNDAEEEPEAGDSVGNVHEGLTPVVIQNSNKKI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LQCPKCDKTFDRIGKYESHTRVHTGEKPFECDICHQRYSTKSNLTVHRKKHSNETEFHKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LQCPKCDKTFDRIGKYESHTRVHTGEKPFECDICHQRYSTKSNLTVHRKKHSNETEFHKK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 EHKCPYCNKLHASKKTLAKHVKRFHPENAQEFISIKKTKSESWKCDICKKSFTRRPHLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 EHKCPYCNKLHASKKTLAKHVKRFHPENAQEFISIKKTKSESWKCDICKKSFTRRPHLEE
430 440 450 460 470 480
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pF1KE4 HMILHSQDKPFKCTYCEEHFKSRFARLKHQEKFHLGPFPCDICGRQFNDTGNLKRHIECT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HMILHSQDKPFKCTYCEEHFKSRFARLKHQEKFHLGPFPCDICGRQFNDTGNLKRHIECT
490 500 510 520 530 540
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pF1KE4 HGGKRKWTCFICGKSVRERTTLKEHLRIHSGEKPHLCSICGQSFRHGSSYRLHLRVHHDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HGGKRKWTCFICGKSVRERTTLKEHLRIHSGEKPHLCSICGQSFRHGSSYRLHLRVHHDD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 KRYECDECGKTFIRHDHLTKHKKIHSGEKAHQCEECGKCFGRRDHLTVHYKSVHLGEKVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KRYECDECGKTFIRHDHLTKHKKIHSGEKAHQCEECGKCFGRRDHLTVHYKSVHLGEKVW
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 QKYKATFHQCDVCKKIFKGKSSLEMHFRTHSGEKPYKCQICNQSFRIKKTLTKHLVIHSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QKYKATFHQCDVCKKIFKGKSSLEMHFRTHSGEKPYKCQICNQSFRIKKTLTKHLVIHSD
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pF1KE4 ARPFNCQHCNATFKRKDKLKYHIDHVHEIKSPDDPLSTSEEKLVSLPVEYSSDDKIFQTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ARPFNCQHCNATFKRKDKLKYHIDHVHEIKSPDDPLSTSEEKLVSLPVEYSSDDKIFQTE
730 740 750 760 770 780
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pF1KE4 TKQYMDQPKVYQSEAKTMLQNVSAEVCVPVTLVPVQMPDTPSDLVRHTTTLPPSSHEILS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TKQYMDQPKVYQSEAKTMLQNVSAEVCVPVTLVPVQMPDTPSDLVRHTTTLPPSSHEILS
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pF1KE4 PQPQSTDYPRAADLAFLEKYTLTPQPANIVHPVRPEQMLDPREQSYLGTLLGLDSTTGVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PQPQSTDYPRAADLAFLEKYTLTPQPANIVHPVRPEQMLDPREQSYLGTLLGLDSTTGVQ
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pF1KE4 NISTNEHHS
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CCDS30 NISTNEHHS
>>CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280 aa)
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Smith-Waterman score: 998; 37.1% identity (64.6% similar) in 404 aa overlap (355-752:391-776)
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pF1KE4 EKDHNDAEEEPEAGDSVGNVHEGLTPVVIQNSNKKILQCPKCDKTFDRIGKYESHTRVHT
....: .: .: : :. .. .: .::
CCDS54 VIHTGEKPYKCEECGKAYKWPSTLSYHKKIHTGEKPYKCEECGKGFSMFSILTKHEVIHT
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390 400 410 420 430 440
pF1KE4 GEKPFECDICHQRYSTKSNLTVHRKKHSNETEFHKKEHKCPYCNKLHASKKTLAKHVKRF
::::..:. : . .. .::: :.: :..:: . :: :.: . . :.:: : .
CCDS54 GEKPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKKIHTGETPY-----KCEECGKGFSMFSILTKH-KVI
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pF1KE4 H----PENAQEFISIKKTKSESWKCDICKKSFTRRPHLEEHMILHSQDKPFKCTYCEEHF
: : . .: . .. . .::. : :.:. .: :: .:. .::.:: : . :
CCDS54 HNGEKPYKCEECDKATHAGEKPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKRIHTGEKPYKCEECGKSF
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: :. : ... .: : :. :. ::. .. ...:. : . : .. . : :::. .
CCDS54 -STFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWSSTLSYH-KKIHTVEKPYKCEECGKAFNQ
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. : .: :::.::::. : ::..: . :. : .: .: :.: :::::::. . :
CCDS54 SAILIKHKRIHTGEKPYKCEECGKTFSKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKTFIKVSTL
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pF1KE4 TKHKKIHSGEKAHQCEECGKCFGRRDHLTVHYKSVHLGEKVWQKYKATFHQCDVCKKIFK
: :: ::.::: ..:.:::: :.. . :: : : .: ::: :: :. : : :.
CCDS54 TTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKFSILTKH-KVIHTGEK---PYK-----CEECGKAFN
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.:.: : : :.:::::::. :..:: ..:::: :::. .:..:..:. ..: ..
CCDS54 WSSNLMEHKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSVLTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWSST
710 720 730 740 750 760
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pF1KE4 LKYHIDHVHEIKSPDDPLSTSEEKLVSLPVEYSSDDKIFQTETKQYMDQPKVYQSEAKTM
:.:: ..: ...:
CCDS54 LSYH-KKIHTVEKPYKCEECGKAFNRSAILIKHKRIHTDEKPYKCEECGKTFSKVSTLTT
770 780 790 800 810 820
>--
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Smith-Waterman score: 919; 34.8% identity (62.8% similar) in 400 aa overlap (355-752:799-1168)
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 EKDHNDAEEEPEAGDSVGNVHEGLTPVVIQNSNKKILQCPKCDKTFDRIGKYESHTRVHT
....: .: .: :::.... .: .:.
CCDS54 KIHTVEKPYKCEECGKAFNRSAILIKHKRIHTDEKPYKCEECGKTFSKVSTLTTHKAIHA
770 780 790 800 810 820
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pF1KE4 GEKPFECDICHQRYSTKSNLTVHRKKHSNETEFHKKEHKCPYCNKLHASKKTLAKHVKRF
::::..: : . .: : :: :. :..: : .:: :.: . .::. : :..
CCDS54 GEKPYKCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTGE-----KPYKCEECGKAYKWPSTLSYH-KKI
830 840 850 860 870 880
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pF1KE4 HPENAQEFISIKKTKSESWKCDICKKSFTRRPHLEEHMILHSQDKPFKCTYCEEHFKSRF
: : . .::. : :.:. : .: ..:. .::.:: : . : : .
CCDS54 H------------TGEKPYKCEECGKGFSMFSILTKHEVIHTGEKPYKCEECGKAF-SWL
890 900 910 920
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 ARLKHQEKFHLGP--FPCDICGRQFNDTGNLKRHIECTHGGKRKWTCFICGKSVRERTTL
. .....: : : . :. ::. ......:. : . : .. . :::. . :
CCDS54 SVFSKHKKTHAGEKFYKCEACGKAYKSSSTLSYH-KKIHTEEKPYKYEECGKGFSTFSIL
930 940 950 960 970 980
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 KEHLRIHSGEKPHLCSICGQSFRHGSSYRLHLRVHHDDKRYECDECGKTFIRHDHLTKHK
.: ::.::::. : ::..: .:. : ..: . :.:.:: :.: . ::.::
CCDS54 TKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKKIHTGETPYKCEECDKAFSWPSSLTEHK
990 1000 1010 1020 1030 1040
630 640 650 660 670 680
pF1KE4 KIHSGEKAHQCEECGKCFGRRDHLTVHYKSVHLGEKVWQKYKATFHQCDVCKKIFKGKSS
:.::: ..:::::: :. ..:: : :..: :: . :: :. : : :. .:.
CCDS54 ATHAGEKPYKCEECGKAFSWPSRLTEH-KATHAGE---EPYK-----CEECGKAFNWSSN
1050 1060 1070 1080 1090
690 700 710 720 730 740
pF1KE4 LEMHFRTHSGEKPYKCQICNQSFRIKKTLTKHLVIHSDARPFNCQHCNATFKRKDKLKYH
: : : :.:::::::. :..:: . :::: :::. .:..:..:. ..: .. :.::
CCDS54 LMEHKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWSSTLSYH
1100 1110 1120 1130 1140 1150
750 760 770 780 790 800
pF1KE4 IDHVHEIKSPDDPLSTSEEKLVSLPVEYSSDDKIFQTETKQYMDQPKVYQSEAKTMLQNV
..: ...:
CCDS54 -KKIHTVEKPYKCEECGKGFVMFSILAKHKVIHTGEKLYKCEECGKAYKWPSTLRYHKKI
1160 1170 1180 1190 1200 1210
>>CCDS12988.1 MZF1 gene_id:7593|Hs108|chr19 (734 aa)
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. : . .: .:.: :. :..: : : :.. . . : .: .: :
CCDS12 SECGRSFSRSSHLLRHQLTHTEERPF-----VCGDCGQGFVRSARLEEH-RRVH------
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: . ..: : .:: .: .: .:. .:.. :: :.
CCDS12 ------TGEQPFRCAECGQSFRQRSNLLQHQRIHGDPPGPGAKPPAPPGAPEPPGPFPCS
440 450 460 470 480
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:.: : : . :.:: : : : : ::..:. . : .: . .:.:.: ..: :
CCDS12 ECRESFARRAVLLEHQA-VHTGDKSFGCVECGERFGRRSVLLQHRR-VHSGERPFACAEC
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:.: :.:..: .: :::.::.: :. ::..::. . ::::: .: . : :::. :
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.. .::.:.. :.::: ..: ::: : . ..:: : . .: ::. . :
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: . :. ...: .: : :.::.:: : :...:: . :::.:: : .:: :: :.
CCDS12 CGQSFRQHANLTQHRRIHTGERPYACPECGKAFRQRPTLTQHLRTHRREKPFACQDCGRR
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:... :: : ..::
CCDS12 FHQSTKLIQH-QRVHSAE
720 730
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CCDS75 GRKDRLGCKEDYACPQCESSFTSEDILAEHLQTLHQKPTEEKEFKCKNCGKKFPVKQALQ
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CCDS75 RHFEQHQETCRGDARFVCKADSCGKRLKSKDALKRHQENVHTGDP---KKKLICSVCNKK
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CCDS75 TREK---PYK-----CSECSKAFSQKRGLDEHKRTHTGEKPFQCDVCDLAFSLKKMLIRH
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CCDS75 KMTHNPNRPLAECQFCHKKFTRNDYLKVHMDNIHGVADS
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CCDS64 CGKAFSRSSYLIEHQR-IHTRAQWFYEYGNALEGSTFVSRKKVNTIKKLHQCEDCEKIFR
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CCDS42 ECKECEKTFNRSSNLIIHQRIHTGNKPYVCNECGKDSNQSSNLIIHQRIHTGKKPYICHE
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. .... . .. . . .: :.. .: . .:.. .: : : :: :.
CCDS42 CGKDFNQSSNLVRHKQIHSGGNPYECKECGKAFKGSSNLVLHQRIHSRGKPYLCNKCGKA
190 200 210 220 230 240
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CCDS42 FSQSTDLIIHHRIHTGEKPYECYDCGQMFSQSSHLVPHQRIHTGE-----KPLKCNECEK
250 260 270 280 290 300
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CCDS42 AFRQHSHLTEH-QRLHSGEKPYECHRCGKTFSGRTAFLKHQRLHAGEKIEECEKTFSKDE
310 320 330 340 350 360
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CCDS42 ELREEQRIHQEEKAYWCNQCGRNFQGTSDLIRHQVT-HTGEKPYECKECGKTFNQSSDLL
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CCDS42 KIHTGEKPYQCTECGKAFRRRSLLIQHRRIHSGEKPYECKECGKLFIWRTAFLKH-QSLH
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CCDS64 CGKAFSRSSYLIEHQR-IHTRAQWFYEYGNALEGSTFVSRKKVNTIKKLHQCEDCEKIFR
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