Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4240
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4240, 875 aa
1>>>pF1KE4240 875 - 875 aa - 875 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.8062+/-0.00125; mu= -12.9590+/- 0.074
mean_var=442.3665+/-93.240, 0's: 0 Z-trim(113.2): 113 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.060979
statistics sampled from 13713 (13821) to 13713 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.729), E-opt: 0.2 (0.425), width: 16
Scan time: 5.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2 ( 875) 5879 532.3 1.4e-150
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 ( 600) 1109 112.6 2.2e-24
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 1017 104.5 6e-22
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 1013 104.1 8.2e-22
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 1001 103.0 1.5e-21
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8 ( 581) 998 102.8 1.9e-21
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 987 101.8 3.6e-21
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 ( 609) 948 98.4 4.1e-20
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 945 98.1 4.8e-20
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 945 98.1 4.9e-20
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 944 98.1 5.3e-20
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11 ( 583) 941 97.8 6.1e-20
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 931 96.9 1.1e-19
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 913 95.3 3e-19
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 884 92.8 1.9e-18
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 884 92.8 2e-18
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15 ( 589) 858 90.5 9.7e-18
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 847 89.5 1.7e-17
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 496) 812 86.4 1.4e-16
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 589) 809 86.2 1.9e-16
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17 ( 608) 789 84.4 6.7e-16
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 782 83.8 9.7e-16
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 781 83.7 1.1e-15
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 782 83.9 1.2e-15
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 782 83.9 1.2e-15
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 737 79.8 1.5e-14
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 732 79.4 2.4e-14
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 731 79.4 2.7e-14
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 620) 725 78.8 3.4e-14
CCDS34478.1 KLHL31 gene_id:401265|Hs108|chr6 ( 634) 723 78.6 3.9e-14
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 516) 710 77.4 7.3e-14
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 427) 693 75.9 1.8e-13
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 687) 693 76.0 2.6e-13
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 671 74.0 8.6e-13
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 671 74.0 8.6e-13
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 718) 656 72.8 2.5e-12
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 639 71.3 7.2e-12
CCDS77937.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 544) 631 70.5 9.4e-12
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 618 69.4 2.2e-11
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 611 68.8 3.5e-11
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19 ( 624) 606 68.3 4.8e-11
>>CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2 (875 aa)
initn: 5879 init1: 5879 opt: 5879 Z-score: 2816.8 bits: 532.3 E(32554): 1.4e-150
Smith-Waterman score: 5879; 100.0% identity (100.0% similar) in 875 aa overlap (1-875:1-875)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSRHHSRFERDYRVGWDRREWSVNGTHGTTSICSVTSGAGGGTASSLSVRPGLLPLPVVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MSRHHSRFERDYRVGWDRREWSVNGTHGTTSICSVTSGAGGGTASSLSVRPGLLPLPVVP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SRLPTPATAPAPCTTGSSEAITSLVASSASAVTTKAPGISKGDSQSQGLATSIRWGQTPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SRLPTPATAPAPCTTGSSEAITSLVASSASAVTTKAPGISKGDSQSQGLATSIRWGQTPI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 NQSTPWDTDEPPSKQMRESDNPGTGPWVTTVAAGNQPTLIAHSYGVAQPPTFSPAVNVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NQSTPWDTDEPPSKQMRESDNPGTGPWVTTVAAGNQPTLIAHSYGVAQPPTFSPAVNVQA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 PVIGVTPSLPPHVGPQLPLMPGHYSLPQPPSQPLSSVVVNMPAQALYASPQPLAVSTLPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PVIGVTPSLPPHVGPQLPLMPGHYSLPQPPSQPLSSVVVNMPAQALYASPQPLAVSTLPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 VGQVARPGPTAVGNGHMAGPLLPPPPPAQPSATLPSGAPATNGPPTTDSAHGLQMLRTIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VGQVARPGPTAVGNGHMAGPLLPPPPPAQPSATLPSGAPATNGPPTTDSAHGLQMLRTIG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VGKYEFTDPGHPREMLKELNQQRRAKAFTDLKIVVEGREFEVHQNVLASCSLYFKDLIQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VGKYEFTDPGHPREMLKELNQQRRAKAFTDLKIVVEGREFEVHQNVLASCSLYFKDLIQR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 SVQDSGQGGREKLELVLSNLQADVLELLLEFVYTGSLVIDSANAKTLLEAASKFQFHTFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SVQDSGQGGREKLELVLSNLQADVLELLLEFVYTGSLVIDSANAKTLLEAASKFQFHTFC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAEAMQCSELYHMAKAFALQIFPEVAAQEEILSISKDDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAEAMQCSELYHMAKAFALQIFPEVAAQEEILSISKDDF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 IAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPATRTQYAAELLAVVRLPFIHPSYLLNVVDNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPATRTQYAAELLAVVRLPFIHPSYLLNVVDNE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 ELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLPHARQEMQTPRTRPRLSAGVAEVIVLVGGRQMVGMTQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLPHARQEMQTPRTRPRLSAGVAEVIVLVGGRQMVGMTQR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 SLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYDREFFSVVSAGDNIYLSGGMESGVTLADVWCYMSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYDREFFSVVSAGDNIYLSGGMESGVTLADVWCYMSLL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 DNWNLVSRMTVPRCRHNSLVYDGKIYTLGGLGVAGNVDHVERYDTITNQWEAVAPLPKAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DNWNLVSRMTVPRCRHNSLVYDGKIYTLGGLGVAGNVDHVERYDTITNQWEAVAPLPKAV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 HSAAATVCGGKIYVFGGVNEAGRAAGVLQSYVPQTNTWSFIESPMIDNKYAPAVTLNGFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HSAAATVCGGKIYVFGGVNEAGRAAGVLQSYVPQTNTWSFIESPMIDNKYAPAVTLNGFV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 FILGGAYARATTIYDPEKGNIKAGPNMNHSRQFCSAVVLDGKIYATGGIVSSEGPALGNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FILGGAYARATTIYDPEKGNIKAGPNMNHSRQFCSAVVLDGKIYATGGIVSSEGPALGNM
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KE4 EAYEPTTNTWTLLPHMPCPVFRHGCVVIKKYIQSG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EAYEPTTNTWTLLPHMPCPVFRHGCVVIKKYIQSG
850 860 870
>>CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 (600 aa)
initn: 1124 init1: 485 opt: 1109 Z-score: 551.2 bits: 112.6 E(32554): 2.2e-24
Smith-Waterman score: 1251; 36.7% identity (66.6% similar) in 569 aa overlap (304-871:40-593)
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 LPSGAPATNGPPTTDSAHGLQMLRTIGVGKYEFTD-PGHPREMLKELNQQRRAKAFTDLK
..:.. .: ...:. .:. : .. :::.
CCDS32 NREDLGVRDSPATKRKVFEMDPKSLTGHEFFDFSSGSSHAENILQIFNEFRDSRLFTDVI
10 20 30 40 50 60
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 IVVEGREFEVHQNVLASCSLYFKDLIQRSVQDSGQGGREKLELVLSNLQADVLELLLEFV
: :::.:: :. ::..:: ::. .. . ..: :: : . .... :...: .:..:
CCDS32 ICVEGKEFPCHRAVLSACSSYFRAMFCNDHRES----REML-VEINGILAEAMECFLQYV
70 80 90 100 110 120
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 YTGSLVIDSANAKTLLEAASKFQFHTFCKVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAEAMQCSELY
:::.. : . :.. :.:..: ::. .. .:..:::.:: ::::. .:.. . . :.
CCDS32 YTGKVKITTENVQYLFETSSLFQISVLRDACAKFLEEQLDPCNCLGIQRFADTHSLKTLF
130 140 150 160 170 180
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 HMAKAFALQIFPEVAAQEEILSISKDDFIAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPATR
: :::: : .:. .::.: ..::..: :. .: : ::.:.:.:..:. . :
CCDS32 TKCKNFALQTFEDVSQHEEFLELDKDELIDYICSDELVIGKEEMVFEAVMRWVYRAVDLR
190 200 210 220 230 240
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 TQYAAELLAVVRLPFIHPSYLLNVVDNEELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLPHARQEMQTP
:::. ::::..::.:....:. ..::..: : .:..::.:::.: . ::..:
CCDS32 RPLLHELLTHVRLPLLHPNYFVQTVEVDQLIQNSPECYQLLHEARRYHILGN---EMMSP
250 260 270 280 290 300
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 RTRPRLSAGVAEVIVLVGGRQMVGMTQRSLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYDREFFSVV
::::: :.: .::::.::: . :: .: . :..: ...: ::.:: . . ..:
CCDS32 RTRPRRSTGYSEVIVVVGGCERVG--GFNLPYTECYDPVTGEWKSLAKLPEFTKSEYAVC
310 320 330 340 350
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 SAGDNIYLSGGMESGVTLADVWCYMSLLDNWNLVSRMTVPRCRHNSLVYDGKIYTLGGLG
. ..: .::: .. ::: : : :. : :. .. : ::. : ::.:..::
CCDS32 ALRNDILVSGGR---INSRDVWIYNSQLNIWIRVASLNKGRWRHKMAVLLGKVYVVGGYD
360 370 380 390 400 410
700 710 720 730 740 750
pF1KE4 VAGNVDHVERYDTITNQWEAVAPLPKAVHSAAATVCGGKIYVFGGVNEAGRAAGVLQSYV
. .. :: ::...:.: :::: .:: : :.: : ::..:.:: . . . .:::
CCDS32 GQNRLSSVECYDSFSNRWTEVAPLKEAVSSPAVTSCVGKLFVIGGGPDDNTCSDKVQSYD
420 430 440 450 460 470
760 770 780 790 800 810
pF1KE4 PQTNTWSFIESPMIDNKYAPAVTLNGFVFILGGAYARATTIYDPEKGNIKAGPNMNHSRQ
:.::.: . . : .. ::.::..... :: ..: ::: . : ..
CCDS32 PETNSWLLRAAIPIAKRCITAVSLNNLIYVAGG-LTKAIYCYDPVEDYWMHVQNTFSRQE
480 490 500 510 520 530
820 830 840 850 860 870
pF1KE4 FCSAVVLDGKIYATGGIVSSEGPALGNMEAYEPTTNTWTLLPHMPCPVFRHGCVVIKKYI
:. : .:::: :: .: : .. :.:.:. : . :: :: ::::.:..:
CCDS32 NCGMSVCNGKIYILGG-RRENGEATDTILCYDPATSIITGVAAMPRPVSYHGCVTIHRYN
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 QSG
CCDS32 EKCFKL
600
>>CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 (587 aa)
initn: 979 init1: 483 opt: 1017 Z-score: 507.6 bits: 104.5 E(32554): 6e-22
Smith-Waterman score: 1017; 31.8% identity (66.1% similar) in 570 aa overlap (308-870:29-585)
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 APATNGPPTTDSAHGLQMLRTIGVGKYEFTDPGHPREMLKELNQQRRAKAFTDLKIVVEG
.:.: . .: .:. : . . :. ::.:
CCDS41 MEGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRTITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAED
10 20 30 40 50
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 REFEVHQNVLASCSLYFKDLIQRSVQDSGQGGREKLELVLSNLQADVLELLLEFVYTGSL
:.:.:. :::.:: :: .. . : ... .:.:. .......: :....::. .
CCDS41 VEIEAHRVVLAACSPYFCAMF---TGDMSESKAKKIEI--KDVDGQTLSKLIDYIYTAEI
60 70 80 90 100 110
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 VIDSANAKTLLEAASKFQFHTFCKVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAEAMQCSELYHMAKA
. :...:: ::: .:. . : .::..:: .::::. :.:.. :..: ..:.:
CCDS41 EVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANA
120 130 140 150 160 170
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 FALQIFPEVAAQEEILSISKDDFIAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPATRTQYAA
.: : :::: ::.::.: :. . .:.:.:....:: :.:.::.::. . :: .. :
CCDS41 YAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMA
180 190 200 210 220 230
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 ELLAVVRLPFIHPSYLLNVVDNEELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLP-HARQEMQTPRTRP
.:. ::::.. .::...:..: :::....:.:.. :: .::.:: : ...:::.:
CCDS41 KLMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKP
240 250 260 270 280 290
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 RLSAGVAEVIVLVGGRQMVGMTQRSLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYDREFFSVVSAGD
: ... .:...:::. . ... .: :.. ....: .: :: : .:: .
CCDS41 RTPVSLPKVMIVVGGQ-----APKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELP-SRRCRAGVVFMAG
300 310 320 330 340
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 NIYLSGGMESGVTLADVWCYMSLLDNWNLVSRMTVPRCRHNSLVYDGKIYTLGGLGVAGN
..: ::..... . : : .. :.:. .. : : .. : . .:..::. . .
CCDS41 HVYAVGGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTG
350 360 370 380 390 400
700 710 720 730 740 750
pF1KE4 VDHVERYDTITNQWEAVAPLPKAVHSAAATVCGGKIYVFGGVNEAGRAA-GVLQSYVPQT
. :: :. ::.: :::. :... : ::.:. :: . :.: .....: : :
CCDS41 LASVEAYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPAT
410 420 430 440 450 460
760 770 780 790 800 810
pF1KE4 NTWSFIESPMIDNKYAPAVTLNGFVFILGGAYA----RATTIYDPEKGNIKAGPNMNHSR
: : .. . . : . .:.: .. :: . ... .::: .. : .:: :
CCDS41 NEWIYVADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCR
470 480 490 500 510 520
820 830 840 850 860 870
pF1KE4 QFCSAVVLDGKIYATGGIVSSEGPALGNMEAYEPTTNTWTLLP-HMPCPVFRHGCVVIKK
. .. ...: .:..:: .: . :...: :.:.:. ::::: .: : .::.:
CCDS41 RNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCN--LASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHK
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 YIQSG
CCDS41 SL
>>CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 (642 aa)
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:: ::::: :: : . .. :.. ..:.: : . .. : .. .
CCDS30 GPEAPPPPPPQPPAPEAERTRPRQARPAAPMEGAVQLLSREG-HSVAHNSKRHYHDAFVA
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....:. . :. . : ..:...:. :::::: ::. .. ...: : ...:
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... ..:. :..:.::. .:. .:..::: ::: .:.. .: .:: .:: :::::
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. ..:.: .::.: . :. ..:: : .:: ::.. . . . ::.::::. .:: ::
CCDS30 IRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVDVAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVY
200 210 220 230 240 250
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..:..:.:.: .: :.. .:. ::::.. ..::. :: : :.. :.::. :: .
CCDS30 RAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRLPLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALK
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.:.::. : . : ::::: :.. :. ::: : :: :. : .. ....
CCDS30 FHLLPEQRGVLGTSRTRPRRCEGAGPVLFAVGG----G----SLFAIHGDCEAYDTRTDR
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CCDS30 WHVVASMSTR-RARVGVAAVGNRLYAVGGYDGTSDLATVESYDPVTNTWQPEVSMGTRRS
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. . : .:. :: :. .. .:::: .:. : .:: . . . ... :..:.
CCDS30 CLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPLTGTWTSVAAMSTRRRYVRVATLDGNLYA
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:: . ... : : ..: ::.:.:: . : . . : ...:.: ... :: . . ..
CCDS30 VGGYDSSSHLATV-EKYEPQVNVWSPVASMLSRRSSAGVAVLEGALYVAGGNDGTSCLNS
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. :.:. : .. :: :. . :..:: .::.:: .. . .:...: :.: :: :
CCDS30 VERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDGWLYAVGG--NDGSSSLNSIEKYNPRTNKW
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pF1KE4 TLLPHMPCPVFRHGCVVIKKYIQSG
CCDS30 VAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSVSSTSL
610 620 630 640
>>CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 (555 aa)
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CCDS58 MGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIEAHRV
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CCDS58 VLAACSPYFCAMF---TGDMSESKAKKIEI--KDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQ
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pF1KE4 TLLEAASKFQFHTFCKVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAEAMQCSELYHMAKAFALQIFPE
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CCDS58 VLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPE
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: ::.::.: :. . .:.:.:....:: :.:.::.::. . :: .. :.:. :::
CCDS58 VMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRL
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CCDS58 PLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPK
210 220 230 240 250 260
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CCDS58 VMIVVGGQ-----APKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELP-SRRCRAGVVFMAGHVYAVGGF
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.... . : : .. :.:. .. : : .. : . .:..::. . .. :: :.
CCDS58 NGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYS
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pF1KE4 TITNQWEAVAPLPKAVHSAAATVCGGKIYVFGGVNEAGRAA-GVLQSYVPQTNTWSFIES
::.: :::. :... : ::.:. :: . :.: .....: : :: : .. .
CCDS58 YKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVAD
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. : . .:.: .. :: . ... .::: .. : .:: :. .. ..
CCDS58 MSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAV
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CCDS58 NGLLYVVGG---DDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
510 520 530 540 550
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: : ..:..::. :... .::..: .
CCDS43 MDEESLDGLLFKDHDFSSDLLRQLNSLRQSRILTDVSICA
10 20 30 40
340 350 360 370 380 390
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.::. :.::::: : ::. .. : ...... :..: .... .:. .. .::::
CCDS43 GAREIPCHRNVLASSSPYFRAMFCSSFREKSEA---KVQL--KGIDPPTLDQIVSYVYTG
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: . :. ..:::: .:: . ..: :.:..::. :::::.. ..: ..: : . :
CCDS43 EAHIATDNVLPVMEAASMLQFPKLFEACSSYLQSQLAPSNCLGMIRLSEILSCETLKKKA
100 110 120 130 140 150
460 470 480 490 500 510
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. :: ::::::. .. . .. :...:.: . :: :.:... :::.: .: .:
CCDS43 REVALTSFPEVAASADLKELCALELRDYLGDDGLCGE-EEKVFEALMVWIKHDLQARKRY
160 170 180 190 200 210
520 530 540 550 560
pF1KE4 AAELLAVVRLPFIHPSYLLNVVDNEELIKSSEACRDLVNEAKRYHM------LPHARQEM
::. ::: .:::... . . :. :..:: ::. ... ::: . .: . .
CCDS43 MQELFKQVRLQYIHPAFFHHFIANDALLQSSPACQIILETAKRQMFSLCGTTVPDCKLLL
220 230 240 250 260 270
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..: :: : . ..:.:::. .: :. : .. :...: ::.:: : .
CCDS43 HVP---PRNS--YQDFLILLGGRKDSQQTTRD---VLLYSKQTGQWQSLAKLP--TRLYK
280 290 300 310 320
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pF1KE4 FSVVSAGDNIYLSGGME--SGVTLA--DVWCYMSLLDNWNLVSRMTVPRCRHNSLVYDGK
:... .::. ::: :: .:. .:. . :..: : : : : : : .. .
CCDS43 ASAITLHRSIYVLGGMAVSSGRSLVSHNVYIFSLKLNQWRLGEPMLVARYSHRSTAHKNF
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pF1KE4 IYTLGGLGVAGNV-DHVERYDTITNQWEAVAPLPKAVHSAAATVCGGKIYVFGGVNEAGR
:...::.: . .. .::::.: : ::..: .: .: :..: ..:.::: .
CCDS43 IFSIGGIGEGQELMGSMERYDSICNVWESMASMPVGVLHPAVAVKDQRLYLFGGEDIMQN
390 400 410 420 430 440
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pF1KE4 AAGVLQSYVPQTNTWSFIESPMIDNKYAPAVTLNGFVFILGGAYARATTIYDPEKGNIKA
. ..: : . :.: .:. :: : ::::.:. . :.:: :.: :::.....
CCDS43 PVRLIQVYHISRNSWFKMETRMIKNVCAPAVVLGERIVIVGG-YTRRILAYDPQSNKFVK
450 460 470 480 490 500
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pF1KE4 GPNMNHSRQFCSAVVLDGKIYATGG---IVSSEGPALGNMEAYEPTTNTWTLLPHMPCPV
.:. :. .:.:. .:.:.::: .. . .... :.: :.::: ..: .
CCDS43 CADMKDRRMHHGATVMGNKLYVTGGRRLTTDCNIEDSASFDCYDPETDTWTSQGQLPHKL
510 520 530 540 550 560
870
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: :.:....
CCDS43 FDHACLTLQCIPRTSGLP
570 580
>>CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 (568 aa)
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: . .:. .:. :..... :. . :: ..:
CCDS14 MGGIMAPKDIMTNTHAKSILNSMNSLRKSNTLCDVTLRVEQKDF
10 20 30 40
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.:. :::.:: :: .. ....: : . ...: :...:.::.:::: .. .
CCDS14 PAHRIVLAACSDYFCAMFTSELSEKG-----KPYVDIQGLTASTMEILLDFVYTETVHVT
50 60 70 80 90
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:.. :: :: .:.. ..: :::.:: :::::. .::. .: .:.. :..:.
CCDS14 VENVQELLPAACLLQLKGVKQACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVDLMQAAEVFSQ
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. ::::. .::.. .:. . .. : ... .:: :.:.::.:.:. : . .::
CCDS14 KHFPEVVQHEEFILLSQGEVEKLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKEREESLPNLL
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CCDS14 QYVRMPLLTPRYITDVIDAEPFIRCSLQCRDLVDEAKKFHLRPELRSQMQGPRTRARL--
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CCDS14 GANEVLLVVGG---FGSQQSPIDVVEKYDPKTQEWSFLPSIT-RKRRYVASVSLHDRIYV
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pF1KE4 SGGMESGVTLADVWC--YMSLLDN-WNLVSRMTVPRCRHNSLVYDGKIYTLGGLGVAGNV
::... :..: : : . :. : :. :.: : .. . ::. ::. .
CCDS14 IGGYDGRSRLSSVECLDYTADEDGVWYSVAPMNVRRGLAGATTLGDMIYVSGGFDGSRRH
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.:::: .:: .. . : ..:. .: .: :: .:: . . .: ..: :.:.
CCDS14 TSMERYDPNIDQWSMLGDMQTAREGAGLVVASGVIYCLGGYDGLNILNSV-EKYDPHTGH
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pF1KE4 WSFIESPMIDNKYAPAVTL-NGFVFILGG----AYARATTIYDPEKGNIKAGPNMNHSRQ
:. . .:: .. . .:.: : ....:: :. .. :. . . . .:. :
CCDS14 WTNV-TPMATKRSGAGVALLNDHIYVVGGFDGTAHLSSVEAYNIRTDSWTTVTSMTTPRC
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pF1KE4 FCSAVVLDGKIYATGGIVSSEGPAL-GNMEAYEPTTNTWTLLPHMPCPVFRHG-CVVIKK
. .:.:: :..:: .: .: .: ...: :.: ..: .. : : ::. .:
CCDS14 YVGATVLRGRLYAIAGY---DGNSLLSSIECYDPIIDSWEVVTSMGTQRCDAGVCVLREK
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>>CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 (609 aa)
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pF1KE4 TLPSGAPATNGPPTTDSAHGLQMLRTIGVGKYEFTDPGHPREMLKELNQQRRAKAFTDLK
.. . . :::. :. .: :. . . :.
CCDS13 IRPGETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVV
20 30 40 50 60 70
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pF1KE4 IVVEGREFEVHQNVLASCSLYFKDLIQRSVQDSGQGGREKLELVLSNLQADVLELLLEFV
.:: .... .:. .:..:: ::. .. . .: : :.:. ... ..:::..:.
CCDS13 LVVGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQ-----TEVVIRDIDERAMELLIDFA
80 90 100 110 120
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pF1KE4 YTGSLVIDSANAKTLLEAASKFQFHTFCKVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAEAMQCSELY
::...... .:..::: :: .:. . ..: ::..:: :::::. :.:.. .: ::
CCDS13 YTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELL
130 140 150 160 170 180
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 HMAKAFALQIFPEVAAQEEILSISKDDFIAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPATR
..: :. . : :: .::.. . ...: .:.: ::...:: :...:. :.: . :
CCDS13 RIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQER
190 200 210 220 230 240
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 TQYAAELLAVVRLPFIHPSYLLNVVDNEELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLPHARQEMQTP
..: ::::.. :..:...: .. ::::.: :::::.::: : .::. : :: :
CCDS13 RPQLPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQERPLMQGP
250 260 270 280 290 300
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pF1KE4 RTRPRLSAGVAEVIVLVGGRQMVGMTQRSLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYDREFFSVV
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CCDS13 RTRPRKPIRCGEVLFAVGGW----CSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMS-KRRCGVGVS
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: .: :: ... : .: : ..:. :. .. : . : : .:..::
CCDS13 VLDDLLYAVGGHDGSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQ
370 380 390 400 410 420
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pF1KE4 GVAGNVDHVERYDTITNQWEAVAPLPKAVHSAAATVCGGKIYVFGGVNEAGRAAGVLQSY
.. .. ::::: :.: :: . ..:..: :: .:. :: ... .... :
CCDS13 DGVSCLNIVERYDPKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGG-SDGTSPLNTVERY
430 440 450 460 470 480
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pF1KE4 VPQTNTWSFIESPM-IDNKYAPAVTLNGFVFILGG----AYARATTIYDPEKGNIKAGPN
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CCDS13 NPQENRWHTI-APMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVA
490 500 510 520 530
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]