Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4228
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4228, 803 aa
1>>>pF1KE4228 803 - 803 aa - 803 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9574+/-0.00041; mu= 16.9912+/- 0.025
mean_var=102.8995+/-20.547, 0's: 0 Z-trim(113.6): 401 B-trim: 225 in 1/52
Lambda= 0.126435
statistics sampled from 22535 (22988) to 22535 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.633), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16
Scan time: 10.830
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_008920 (OMIM: 607943) ras GTPase-activating pro ( 803) 5357 988.8 0
XP_016867150 (OMIM: 607943) PREDICTED: ras GTPase- ( 840) 5094 940.9 0
XP_011514025 (OMIM: 607943) PREDICTED: ras GTPase- ( 682) 4055 751.3 3.3e-216
NP_001073346 (OMIM: 607943) ras GTPase-activating ( 757) 4051 750.6 5.9e-216
XP_016867151 (OMIM: 607943) PREDICTED: ras GTPase- ( 794) 4051 750.6 6.1e-216
XP_016875517 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 805) 2490 465.9 3.2e-130
NP_001288131 (OMIM: 604118) rasGAP-activating-like ( 805) 2490 465.9 3.2e-130
XP_011537155 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 804) 2486 465.1 5.3e-130
NP_004649 (OMIM: 604118) rasGAP-activating-like pr ( 804) 2486 465.1 5.3e-130
XP_005254007 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 806) 2478 463.7 1.5e-129
XP_006719704 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 806) 2478 463.7 1.5e-129
NP_001180449 (OMIM: 604118) rasGAP-activating-like ( 806) 2478 463.7 1.5e-129
XP_011537154 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 806) 2478 463.7 1.5e-129
XP_006719705 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 805) 2474 462.9 2.4e-129
XP_016875520 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 779) 2315 433.9 1.3e-120
XP_016875518 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 780) 2303 431.7 5.8e-120
XP_016875519 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 780) 2303 431.7 5.8e-120
NP_001180450 (OMIM: 604118) rasGAP-activating-like ( 776) 1987 374.1 1.3e-102
XP_011537156 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-acti ( 447) 1196 229.6 2.3e-59
NP_001290174 (OMIM: 601589) ras GTPase-activating ( 850) 830 163.1 4.7e-39
NP_006497 (OMIM: 601589) ras GTPase-activating pro ( 849) 825 162.2 8.9e-39
NP_001290175 (OMIM: 601589) ras GTPase-activating ( 853) 819 161.1 1.9e-38
XP_011511361 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 853) 818 160.9 2.2e-38
XP_016862457 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 872) 818 160.9 2.2e-38
XP_016862458 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 871) 813 160.0 4.1e-38
NP_031394 (OMIM: 605182) ras GTPase-activating pro ( 834) 812 159.8 4.5e-38
NP_001307751 (OMIM: 605182) ras GTPase-activating ( 802) 784 154.7 1.5e-36
XP_011533143 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase- ( 802) 784 154.7 1.5e-36
XP_011533144 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase- ( 802) 784 154.7 1.5e-36
XP_016862459 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 707) 595 120.1 3.3e-26
XP_016862461 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 442) 581 117.4 1.4e-25
XP_016875928 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase- ( 451) 509 104.3 1.2e-21
XP_016875927 (OMIM: 605182) PREDICTED: ras GTPase- ( 451) 509 104.3 1.2e-21
NP_001307750 (OMIM: 605182) ras GTPase-activating ( 451) 509 104.3 1.2e-21
XP_016862460 (OMIM: 601589) PREDICTED: ras GTPase- ( 573) 448 93.3 3.3e-18
XP_006719639 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 419) 313 68.5 6.8e-11
XP_005269170 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 419) 313 68.5 6.8e-11
NP_001278830 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isofor ( 419) 313 68.5 6.8e-11
XP_011537012 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 422) 313 68.5 6.8e-11
NP_001129278 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isofor ( 422) 313 68.5 6.8e-11
NP_005630 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isoform 1 ( 422) 313 68.5 6.8e-11
NP_001129277 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isofor ( 422) 313 68.5 6.8e-11
XP_016875398 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 422) 313 68.5 6.8e-11
XP_006723404 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 383) 305 67.0 1.7e-10
NP_003171 (OMIM: 600782) synaptotagmin-5 isoform 1 ( 386) 305 67.0 1.8e-10
XP_016882664 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 305 67.0 1.8e-10
XP_016882665 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 305 67.0 1.8e-10
XP_006723402 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 305 67.0 1.8e-10
NP_783860 (OMIM: 613528) synaptotagmin-9 [Homo sap ( 491) 304 66.9 2.4e-10
XP_011518206 (OMIM: 613528) PREDICTED: synaptotagm ( 492) 304 66.9 2.4e-10
>>NP_008920 (OMIM: 607943) ras GTPase-activating protein (803 aa)
initn: 5357 init1: 5357 opt: 5357 Z-score: 5285.2 bits: 988.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5357; 99.8% identity (100.0% similar) in 803 aa overlap (1-803:1-803)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAKRSSLYIRIVEGKNLPAKDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 MAKRSSLYIRIVEGKNLPAKDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 LPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 HLRLEVWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVRYKGRTRETSIVKKSCYPRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 HLRLEVWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVRYKGRTRETSIVKKSCYPRW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NETFEFELQEGAMEALCVEAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 NETFEFELQEGAMEALCVEAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQLIPLIEETTST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 SRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQLIPLIEETTST
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 ECRQDVATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSVESFLKVAG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
NP_008 ECRQDVATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSMESFLKVAG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 MQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQTLRAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 MQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQTLRAHL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 GALLSALSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFFSPAIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 GALLSALSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFFSPAIM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 SPKLFHLRERHADARTSRTLLLLAKAVQNVGNMDTPASRAKEAWMEPLQPTVRQGVAQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 SPKLFHLRERHADARTSRTLLLLAKAVQNVGNMDTPASRAKEAWMEPLQPTVRQGVAQLK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 DFITKLVDIEEKDELDLQRTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYFSLTTEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 DFITKLVDIEEKDELDLQRTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYFSLTTEA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LSFAKTPSSKKSALIKLANIRAAEKVEEKSFGGSHVMQVIYTDDAGRPQTAYLQCKCVNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 LSFAKTPSSKKSALIKLANIRAAEKVEEKSFGGSHVMQVIYTDDAGRPQTAYLQCKCVNE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 LNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTLQEWNDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 LNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTLQEWNDP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 LDRDLEAQLIYRHLLGVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGKVPEDSLARLLRVLQDLR
::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 LDHDLEAQLIYRHLLGVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGKVPEDSLARLLRVLQDLR
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KE4 EAHSSSPAGSPPSEPNCLLELQT
:::::::::::::::::::::::
NP_008 EAHSSSPAGSPPSEPNCLLELQT
790 800
>>XP_016867150 (OMIM: 607943) PREDICTED: ras GTPase-acti (840 aa)
initn: 5343 init1: 5094 opt: 5094 Z-score: 5025.6 bits: 940.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5245; 95.3% identity (95.6% similar) in 835 aa overlap (1-798:1-835)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAKRSSLYIRIVEGKNLPAKDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAKRSSLYIRIVEGKNLPAKDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 HLRLEVWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVRYKGRTRETSIVKKSCYPRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HLRLEVWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVRYKGRTRETSIVKKSCYPRW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NETFEFELQEGAMEALCVEAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NETFEFELQEGAMEALCVEAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQLIPLIEETTST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQLIPLIEETTST
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 ECRQDVATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSVESFLKVAG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
XP_016 ECRQDVATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSMESFLKVAG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 MQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQTLRAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQTLRAHL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 GALLSALSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFFSPAIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GALLSALSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFFSPAIM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 SPKLFHLRERHADARTSRTLLLLAKAVQNVGNMDTPASRAKEAWMEPLQPTVRQGVAQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPKLFHLRERHADARTSRTLLLLAKAVQNVGNMDTPASRAKEAWMEPLQPTVRQGVAQLK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 DFITKLVDIEEKDELDLQRTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYFSLTTEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DFITKLVDIEEKDELDLQRTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYFSLTTEA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LSFAKTPSSKKSALIKLANIRAAEKVEEKSFGGSHVMQVIYTDDAGRPQTAYLQCKCVNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSFAKTPSSKKSALIKLANIRAAEKVEEKSFGGSHVMQVIYTDDAGRPQTAYLQCKCVNE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 LNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTLQEWNDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTLQEWNDP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KE4 LDRDLEAQLIYRHLLGVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGK-----------------
::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LDHDLEAQLIYRHLLGVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGKGRSCPPGTCSWPEPPPE
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800
pF1KE4 --------------------VPEDSLARLLRVLQDLREAHSSSPAGSPPSEPNCLLELQT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MHGWGPRAHSQGPSRLPLPTVPEDSLARLLRVLQDLREAHSSSPAGSPPSEPNCLLELQT
790 800 810 820 830 840
>>XP_011514025 (OMIM: 607943) PREDICTED: ras GTPase-acti (682 aa)
initn: 4095 init1: 4053 opt: 4055 Z-score: 4002.6 bits: 751.3 E(85289): 3.3e-216
Smith-Waterman score: 4055; 96.8% identity (98.3% similar) in 633 aa overlap (1-626:1-633)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAKRSSLYIRIVEGKNLPAKDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MAKRSSLYIRIVEGKNLPAKDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 HLRLEVWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVRYKGRTRETSIVKKSCYPRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HLRLEVWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVRYKGRTRETSIVKKSCYPRW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NETFEFELQEGAMEALCVEAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NETFEFELQEGAMEALCVEAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQLIPLIEETTST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQLIPLIEETTST
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 ECRQDVATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSVESFLKVAG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
XP_011 ECRQDVATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSMESFLKVAG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 MQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQTLRAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQTLRAHL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 GALLSALSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFFSPAIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GALLSALSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFFSPAIM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 SPKLFHLRERHADARTSRTLLLLAKAVQNVGNMDTPASRAKEAWMEPLQPTVRQGVAQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SPKLFHLRERHADARTSRTLLLLAKAVQNVGNMDTPASRAKEAWMEPLQPTVRQGVAQLK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 DFITKLVDIEEKDELDLQRTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYFSLTTEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DFITKLVDIEEKDELDLQRTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYFSLTTEA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KE4 LSFAKTPSSKKSALI-------KLANIRAAEKVEEKSFGGSHVMQVIYTDDAGRPQTAYL
::::::::::. .. : ..:::.. .
XP_011 LSFAKTPSSKEFPFVSGSRATGKSSDIRATKYIWRVLEYLRAWPRGQRRLKSSPHQPPGL
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 QCKCVNELNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVT
XP_011 LPSRCLPWGQVELLPPKRRDSV
670 680
>>NP_001073346 (OMIM: 607943) ras GTPase-activating prot (757 aa)
initn: 4051 init1: 4051 opt: 4051 Z-score: 3998.1 bits: 750.6 E(85289): 5.9e-216
Smith-Waterman score: 4961; 94.0% identity (94.3% similar) in 803 aa overlap (1-803:1-757)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAKRSSLYIRIVEGKNLPAKDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAKRSSLYIRIVEGKNLPAKDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 HLRLEVWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVRYKGRTRETSIVKKSCYPRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HLRLEVWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVRYKGRTRETSIVKKSCYPRW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NETFEFELQEGAMEALCVEAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NETFEFELQEGAMEALCVEAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQLIPLIEETTST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQLIPLIEETTST
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 ECRQDVATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSVESFLKVAG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
NP_001 ECRQDVATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSMESFLKVAG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 MQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQTLRAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQTLRAHL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 GALLSALSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFFSPAIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GALLSALSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFFSPAIM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 SPKLFHLRERHADARTSRTLLLLAKAVQNVGNMDTPASRAKEAWMEPLQPTVRQGVAQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPKLFHLRERHADARTSRTLLLLAKAVQNVGNMDTPASRAKEAWMEPLQPTVRQGVAQLK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 DFITKLVDIEEKDELDLQRTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYFSLTTEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DFITKLVDIEEKDELDLQRTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYFSLTTEA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LSFAKTPSSKKSALIKLANIRAAEKVEEKSFGGSHVMQVIYTDDAGRPQTAYLQCKCVNE
:::::::::: ::::
NP_001 LSFAKTPSSK----------------------------------------------CVNE
610
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 LNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTLQEWNDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTLQEWNDP
620 630 640 650 660 670
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 LDRDLEAQLIYRHLLGVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGKVPEDSLARLLRVLQDLR
::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDHDLEAQLIYRHLLGVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGKVPEDSLARLLRVLQDLR
680 690 700 710 720 730
790 800
pF1KE4 EAHSSSPAGSPPSEPNCLLELQT
:::::::::::::::::::::::
NP_001 EAHSSSPAGSPPSEPNCLLELQT
740 750
>>XP_016867151 (OMIM: 607943) PREDICTED: ras GTPase-acti (794 aa)
initn: 4300 init1: 4051 opt: 4051 Z-score: 3997.8 bits: 750.6 E(85289): 6.1e-216
Smith-Waterman score: 4877; 89.9% identity (90.1% similar) in 840 aa overlap (1-803:1-794)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAKRSSLYIRIVEGKNLPAKDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAKRSSLYIRIVEGKNLPAKDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 HLRLEVWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVRYKGRTRETSIVKKSCYPRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HLRLEVWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVRYKGRTRETSIVKKSCYPRW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NETFEFELQEGAMEALCVEAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NETFEFELQEGAMEALCVEAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQLIPLIEETTST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQLIPLIEETTST
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 ECRQDVATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSVESFLKVAG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
XP_016 ECRQDVATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSMESFLKVAG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 MQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQTLRAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQTLRAHL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 GALLSALSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFFSPAIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GALLSALSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFFSPAIM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 SPKLFHLRERHADARTSRTLLLLAKAVQNVGNMDTPASRAKEAWMEPLQPTVRQGVAQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SPKLFHLRERHADARTSRTLLLLAKAVQNVGNMDTPASRAKEAWMEPLQPTVRQGVAQLK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 DFITKLVDIEEKDELDLQRTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYFSLTTEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DFITKLVDIEEKDELDLQRTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYFSLTTEA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LSFAKTPSSKKSALIKLANIRAAEKVEEKSFGGSHVMQVIYTDDAGRPQTAYLQCKCVNE
:::::::::: ::::
XP_016 LSFAKTPSSK----------------------------------------------CVNE
610
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 LNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTLQEWNDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTLQEWNDP
620 630 640 650 660 670
730 740 750 760
pF1KE4 LDRDLEAQLIYRHLLGVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGK-----------------
::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LDHDLEAQLIYRHLLGVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGKGRSCPPGTCSWPEPPPE
680 690 700 710 720 730
770 780 790 800
pF1KE4 --------------------VPEDSLARLLRVLQDLREAHSSSPAGSPPSEPNCLLELQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MHGWGPRAHSQGPSRLPLPTVPEDSLARLLRVLQDLREAHSSSPAGSPPSEPNCLLELQT
740 750 760 770 780 790
>>XP_016875517 (OMIM: 604118) PREDICTED: rasGAP-activati (805 aa)
initn: 1110 init1: 1067 opt: 2490 Z-score: 2458.8 bits: 465.9 E(85289): 3.2e-130
Smith-Waterman score: 2490; 48.9% identity (74.7% similar) in 796 aa overlap (1-783:1-787)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAKRSSLYIRIVEGKNLPAKDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVH
::: ::: .:.:::. :::::..:::::::.::::.: . ::::::..: ::::::: ::
XP_016 MAKSSSLNVRVVEGRALPAKDVSGSSDPYCLVKVDDEVVARTATVWRSLGPFWGEEYTVH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEI
:: :: .::::.:::....::.:::. :.:..:.. :.:...: .:..:::: ::::::
XP_016 LPLDFHQLAFYVLDEDTVGHDDIIGKISLSREAITADPRGIDSWINLSRVDPDAEVQGEI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 HLRLEVWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVRYKGRTRETSIVKKSCYPRW
: ... ... ::: ::.::::::.: .::::::.:: . ... ::: .::. .:.:
XP_016 CLSVQMLEDGQGRCLRCHVLQARDLAPRDISGTSDPFARVFWGSQSLETSTIKKTRFPHW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NETFEFELQEGAMEALCVEAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSK
.:..:.. . :: : :: ::::.:..::::: : .. . :. . .::::: : .
XP_016 DEVLELREMPGAPSPLRVELWDWDMVGKNDFLGMVEFSPKTLQQ-KPPKGWFRLLP-FPR
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE4 SRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQL-----IPLIE
... . ::::.:...::: .. ::::. ::::..:: . : :::.. . :.:
XP_016 AEEDSGGNLGALRVKVRLIEDRVLPSQCYQPLMELLMESV----QGPAEEDTASPLALLE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 ETTSTECRQDVATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSVESF
: : .::::.::.:.:::::.::: ::: : . :..:: . :::::::::::::.:.:
XP_016 ELTLGDCRQDLATKLVKLFLGRGLAGRFLDYLTRREVARTMDPNTLFRSNSLASKSMEQF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 LKVAGMQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQT
.:..:: ::: :: :.:..:::::::.:::: :... . ... .: .. : :
XP_016 MKLVGMPYLHEVLKPVISRVFEEKKYMELDPCKMDLGRTRRISFKGALSEEQMRETSLGL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 LRAHLGALLSALSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFF
: ..:: ...:. :: :: ..: .:.:: :::.:::: :.:..: ..:...:: ::::
XP_016 LTGYLGPIVDAIVGSVGRCPPAMRLAFKQLHRRVEERFPQAEHQDVKYLAISGFLFLRFF
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 SPAIMSPKLFHLRERHADARTSRTLLLLAKAVQNVGNMDTPASRAKEAWMEPLQPTVRQG
.:::..:::: ::..::: .:::.:::::::::..::. ...:: :: ::.: . :
XP_016 APAILTPKLFDLRDQHADPQTSRSLLLLAKAVQSIGNLGQQLGQGKELWMAPLHPFLLQC
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 VAQLKDFITKLVDIEEKDELDLQ-RTLSLQAPPVKEGPLFIHRTKGKGPLMSSSFKKLYF
:....::. .:::.. .: . :.: . :.:: :. .. . : .::: :
XP_016 VSRVRDFLDRLVDVDGDEEAGVPARALFPPSAIVREGYLLKRKEEPAGLATRFAFKKRYV
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 SLTTEALSFAKTPSSKKSALIKLANIRAAEKVEEKSFGGSHVMQVIYTDDAGRPQTAYLQ
:. :.:::.:.: . : ...:::.:.:.: .: :::::. : .: .:.:::
XP_016 WLSGETLSFSKSPEWQMCHSIPVSHIRAVERVDEGAFQLPHVMQVVTQDGTGALHTTYLQ
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 CKCVNELNQWLSALRKVSINNTGLLGSYHPGVFRGDKWSCCHQKEKTGQGCDKTRSRVTL
:: :::::::::::::.: : . :.. :::.::. .:.:: : :... ::..:.: :::
XP_016 CKNVNELNQWLSALRKASAPNPNKLAACHPGAFRSARWTCCLQAERSAAGCSRTHSAVTL
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760
pF1KE4 QEWNDPLDRDLEAQLIYRHLL-GVEAMLWERHRELSGGAEAGTVPTSPGKVPE------D
.:.:::: : ::: .::.:: : . . : . : . :. .. : ::
XP_016 GDWSDPLDPDAEAQTVYRQLLLGRDQL---RLKLLEDSNMDTTLEADTGACPEVLARQRA
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800
pF1KE4 SLARLLRVLQDLREAHSSSPAGSPPSEPNCLLELQT
. ::::.:: :: .::
XP_016 ATARLLEVLADLDRAHEEFQQQERGKAALGPLGP
780 790 800
>>NP_001288131 (OMIM: 604118) rasGAP-activating-like pro (805 aa)
initn: 1110 init1: 1067 opt: 2490 Z-score: 2458.8 bits: 465.9 E(85289): 3.2e-130
Smith-Waterman score: 2490; 48.9% identity (74.7% similar) in 796 aa overlap (1-783:1-787)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAKRSSLYIRIVEGKNLPAKDITGSSDPYCIVKVDNEPIIRTATVWKTLCPFWGEEYQVH
::: ::: .:.:::. :::::..:::::::.::::.: . ::::::..: ::::::: ::
NP_001 MAKSSSLNVRVVEGRALPAKDVSGSSDPYCLVKVDDEVVARTATVWRSLGPFWGEEYTVH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LPPTFHAVAFYVMDEDALSRDDVIGKVCLTRDTIASHPKGFSGWAHLTEVDPDEEVQGEI
:: :: .::::.:::....::.:::. :.:..:.. :.:...: .:..:::: ::::::
NP_001 LPLDFHQLAFYVLDEDTVGHDDIIGKISLSREAITADPRGIDSWINLSRVDPDAEVQGEI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 HLRLEVWPGARACRLRCSVLEARDLAPKDRNGTSDPFVRVRYKGRTRETSIVKKSCYPRW
: ... ... ::: ::.::::::.: .::::::.:: . ... ::: .::. .:.:
NP_001 CLSVQMLEDGQGRCLRCHVLQARDLAPRDISGTSDPFARVFWGSQSLETSTIKKTRFPHW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NETFEFELQEGAMEALCVEAWDWDLVSRNDFLGKVVIDVQRLRVVQQEEGWFRLQPDQSK
.:..:.. . :: : :: ::::.:..::::: : .. . :. . .::::: : .
NP_001 DEVLELREMPGAPSPLRVELWDWDMVGKNDFLGMVEFSPKTLQQ-KPPKGWFRLLP-FPR
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE4 SRRHDEGNLGSLQLEVRLRDETVLPSSYYQPLVHLLCHEVKLGMQGPGQL-----IPLIE
... . ::::.:...::: .. ::::. ::::..:: . : :::.. . :.:
NP_001 AEEDSGGNLGALRVKVRLIEDRVLPSQCYQPLMELLMESV----QGPAEEDTASPLALLE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 ETTSTECRQDVATNLLKLFLGQGLAKDFLDLLFQLELSRTSETNTLFRSNSLASKSVESF
: : .::::.::.:.:::::.::: ::: : . :..:: . :::::::::::::.:.:
NP_001 ELTLGDCRQDLATKLVKLFLGRGLAGRFLDYLTRREVARTMDPNTLFRSNSLASKSMEQF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 LKVAGMQYLHGVLGPIINKVFEEKKYVELDPSKVEVKDVGCSGLHRPQTEAEVLEQSAQT
.:..:: ::: :: :.:..:::::::.:::: :... . ... .: .. : :
NP_001 MKLVGMPYLHEVLKPVISRVFEEKKYMELDPCKMDLGRTRRISFKGALSEEQMRETSLGL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 LRAHLGALLSALSRSVRACPAVVRATFRQLFRRVRERFPGAQHENVPFIAVTSFLCLRFF
: ..:: ...:. :: :: ..: .:.:: :::.:::: :.:..: ..:...:: ::::
NP_001 LTGYLGPIVDAIVGSVGRCPPAMRLAFKQLHRRVEERFPQAEHQDVKYLAISGFLFLRFF
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 SPAIMSPKLFHLRERHADARTSRTLLLLAKAVQNVGNMDTPASRAKEAWMEPLQPTVRQG
.:::..:::: ::..::: .:::.:::::::::..::. ...:: :: ::.: . :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]