FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4226, 801 aa
1>>>pF1KE4226 801 - 801 aa - 801 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2841+/-0.000929; mu= -2.1983+/- 0.056
mean_var=271.5193+/-55.372, 0's: 0 Z-trim(113.8): 45 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.077835
statistics sampled from 14392 (14424) to 14392 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.764), E-opt: 0.2 (0.443), width: 16
Scan time: 5.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45938.1 DENND1C gene_id:79958|Hs108|chr19 ( 801) 5423 622.8 7e-178
CCDS77225.1 DENND1C gene_id:79958|Hs108|chr19 ( 757) 5103 586.8 4.4e-167
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CCDS35133.1 DENND1A gene_id:57706|Hs108|chr9 (1009) 1153 143.4 1.8e-33
CCDS72996.1 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1 ( 396) 1002 126.1 1.1e-28
>>CCDS45938.1 DENND1C gene_id:79958|Hs108|chr19 (801 aa)
initn: 5423 init1: 5423 opt: 5423 Z-score: 3307.0 bits: 622.8 E(32554): 7e-178
Smith-Waterman score: 5423; 99.9% identity (100.0% similar) in 801 aa overlap (1-801:1-801)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MESRAEGGSPAVFDWFFEAACPASLQEDPPILRQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVERE
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PPSPAVQHFTFALTDLAGNRRFGFCRLRAGTQSCLCILSHLPWFEVFYKLLNTVGDLLAQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DQVTEAEELLQNLFQQSLSGPQASVGLELGSGVTVSSGQGIPPPTRGNSKPLSCFVAPDS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GRLPSIPENRNLTELVVAVTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GRLPSIPENRNLTELVVAVTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 MRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVREKALEDVVVLNVDANTLETTFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVREKALEDVVVLNVDANTLETTFN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DVQALPPDVVSLLRLRLRKVALAPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 VFLAQKPGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEARLEKLNKGEGFSDQFEQEITGCGASSGALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VFLAQKPGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEARLEKLNKGEGFSDQFEQEITGCGASSGALR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 SYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGVQSLLMYKDGDSVLQRGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGVQSLLMYKDGDSVLQRGGS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 LRAPALPSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSRRRQLEEGTSEPPGAGTPPLSPEDEGCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LRAPALPSRSDRLQQRLPITQHFGKNRPLRPSRRRQLEEGTSEPPGAGTPPLSPEDEGCP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 WAEEALDSSFLGSGEELDLLSEILDSLSVGAKSAGSLRPSQSLDCCHRGDLDSCFSLPNI
::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WAEEALDSSFLGSGEELDLLSEILDSLSMGAKSAGSLRPSQSLDCCHRGDLDSCFSLPNI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 PRWQPDDKKLPEPEPQPLSLPSLQNASSLDATSSSKDSRSQLIPSESDQEVTSPSQSSTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PRWQPDDKKLPEPEPQPLSLPSLQNASSLDATSSSKDSRSQLIPSESDQEVTSPSQSSTA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 SADPSIWGDPKPSPLTEPLILHLTPSHKAAEDSTAQENPTPWLSTAPTEPSPPESPQILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SADPSIWGDPKPSPLTEPLILHLTPSHKAAEDSTAQENPTPWLSTAPTEPSPPESPQILA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 PTKPNFDIAWTSQPLDPSSDPSSLEDPRARPPKALLAERAHLQPREEPGALNSPATPTSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PTKPNFDIAWTSQPLDPSSDPSSLEDPRARPPKALLAERAHLQPREEPGALNSPATPTSN
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KE4 CQKSQPSSRPRVADLKKCFEG
:::::::::::::::::::::
CCDS45 CQKSQPSSRPRVADLKKCFEG
790 800
>>CCDS77225.1 DENND1C gene_id:79958|Hs108|chr19 (757 aa)
initn: 5103 init1: 5103 opt: 5103 Z-score: 3113.2 bits: 586.8 E(32554): 4.4e-167
Smith-Waterman score: 5103; 99.9% identity (100.0% similar) in 757 aa overlap (45-801:1-757)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 WFFEAACPASLQEDPPILRQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVEREPPSPAVQHFTFALT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MQMVPKFCFPFDVEREPPSPAVQHFTFALT
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 DLAGNRRFGFCRLRAGTQSCLCILSHLPWFEVFYKLLNTVGDLLAQDQVTEAEELLQNLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DLAGNRRFGFCRLRAGTQSCLCILSHLPWFEVFYKLLNTVGDLLAQDQVTEAEELLQNLF
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 QQSLSGPQASVGLELGSGVTVSSGQGIPPPTRGNSKPLSCFVAPDSGRLPSIPENRNLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QQSLSGPQASVGLELGSGVTVSSGQGIPPPTRGNSKPLSCFVAPDSGRLPSIPENRNLTE
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 LVVAVTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYPMRWEHVLIPTLPPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LVVAVTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYPMRWEHVLIPTLPPH
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 LLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVREKALEDVVVLNVDANTLETTFNDVQALPPDVVSLLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVREKALEDVVVLNVDANTLETTFNDVQALPPDVVSLLR
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 LRLRKVALAPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEEVFLAQKPGAPLQAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LRLRKVALAPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEEVFLAQKPGAPLQAF
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 HRRAVHLQLFKQFIEARLEKLNKGEGFSDQFEQEITGCGASSGALRSYQLWADNLKKGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HRRAVHLQLFKQFIEARLEKLNKGEGFSDQFEQEITGCGASSGALRSYQLWADNLKKGGG
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 ALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGVQSLLMYKDGDSVLQRGGSLRAPALPSRSDRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGVQSLLMYKDGDSVLQRGGSLRAPALPSRSDRLQ
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KE4 QRLPITQHFGKNRPLRPSRRRQLEEGTSEPPGAGTPPLSPEDEGCPWAEEALDSSFLGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QRLPITQHFGKNRPLRPSRRRQLEEGTSEPPGAGTPPLSPEDEGCPWAEEALDSSFLGSG
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 EELDLLSEILDSLSVGAKSAGSLRPSQSLDCCHRGDLDSCFSLPNIPRWQPDDKKLPEPE
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EELDLLSEILDSLSMGAKSAGSLRPSQSLDCCHRGDLDSCFSLPNIPRWQPDDKKLPEPE
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KE4 PQPLSLPSLQNASSLDATSSSKDSRSQLIPSESDQEVTSPSQSSTASADPSIWGDPKPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PQPLSLPSLQNASSLDATSSSKDSRSQLIPSESDQEVTSPSQSSTASADPSIWGDPKPSP
580 590 600 610 620 630
680 690 700 710 720 730
pF1KE4 LTEPLILHLTPSHKAAEDSTAQENPTPWLSTAPTEPSPPESPQILAPTKPNFDIAWTSQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LTEPLILHLTPSHKAAEDSTAQENPTPWLSTAPTEPSPPESPQILAPTKPNFDIAWTSQP
640 650 660 670 680 690
740 750 760 770 780 790
pF1KE4 LDPSSDPSSLEDPRARPPKALLAERAHLQPREEPGALNSPATPTSNCQKSQPSSRPRVAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LDPSSDPSSLEDPRARPPKALLAERAHLQPREEPGALNSPATPTSNCQKSQPSSRPRVAD
700 710 720 730 740 750
800
pF1KE4 LKKCFEG
:::::::
CCDS77 LKKCFEG
>>CCDS72997.1 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1 (775 aa)
initn: 1718 init1: 848 opt: 1635 Z-score: 1008.4 bits: 197.4 E(32554): 7.6e-50
Smith-Waterman score: 1692; 46.9% identity (72.3% similar) in 599 aa overlap (1-584:1-592)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MESRAEGGSPAVFDWFFEAACPASLQEDPPILRQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVERE
:. :.... .:: ... : :: .::: .: .:: :: ::: .: ::::::::::::
CCDS72 MDCRTKANPDRTFDLVLKVKCHASENEDPVVLWKFPEDFGDQEILQSVPKFCFPFDVERV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 PPSPAVQHFTFALTDLAGNRRFGFCRLRAGTQSCLCILSHLPWFEVFYKLLNTVGDLLAQ
. . :::::.:::. ...::::::: .: ::::::.::::::.::::::..: ::.
CCDS72 SQNQVGQHFTFVLTDIESKQRFGFCRLTSGGTICLCILSYLPWFEVYYKLLNTLADYLAK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DQVTEAEELLQNLFQQSLSGPQASVGLELGSGVTVSSGQGIPPPTRGNSKPLSCFVAPDS
. .. .: :..:... . .. :.: ... . .. : . . : : :.:::
CCDS72 ELENDLNETLRSLYNHPVPKANTPVNLSVNQEIFIACEQVLK--DQPALVPHSYFIAPDV
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GRLPSIPENRNLTELVVAVTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYP
::.:::.::::: ::: .:.. :.:..: :::... .:::::::.:.:.: :::::
CCDS72 TGLPTIPESRNLTEYFVAVDVNNMLQLYASMLHERRIVIISSKLSTLTACIHGSAALLYP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 MRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVREKALEDVVVLNVDANTLETTFN
: :.:. ::.::::::::::::::::::.:.:: :::..:.:::::.::::.::::. :.
CCDS72 MYWQHIYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHSSLIERVKNKSLEDVVMLNVDTNTLESPFS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 DVQALPPDVVSLLRLRLRKVALAPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEE
:.. :: :::: :. .:.: . : :.::.: ::.::: :::.::::: .::.:.:: ::
CCDS72 DLNNLPSDVVSALKNKLKKQSTATGDGVARAFLRAQAALFGSYRDALRYKPGEPITFCEE
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 VFLAQKPGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEARLEKLNKGEGFSDQFEQEITGCGASSGALR
:. .. .. .. : . :..::::::::..:: ::: :.:::: ::.:::. : .: :
CCDS72 SFVKHRSSV-MKQFLETAINLQLFKQFIDGRLAKLNAGRGFSDVFEEEITSGGFCGGNPR
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KE4 SYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKS----GLKGVQSLLMYKDGDSVLQ
::: :. ..:::: ::.... .:. :::.. :. ::. ::: :.: : .:...
CCDS72 SYQQWVHTVKKGG-ALFNTAMTKATPAVRTAYKFAKNHAKLGLKEVKSKLKHKENEEDYG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 RGGS--LRAPALPSRSDRL--QQRLPITQHFGKNRPLRPSRRRQLEEGTSEPPGAGTPPL
.: .:. .... ... ..: : :::. : : . .. . :
CCDS72 TCSSSVQYTPVYKLHNEKGGNSEKRKLAQARLK-RPLK-SLDGALYDDEDDDDIERASKL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580
pF1KE4 SPED--EGCPWAEEALDSSFLG-----SGEELDLLSEILDSLSVGAKSAGSLRPSQSLDC
: :: :. . :. :: ::: .:::.::::.::. ... :.: ..:::
CCDS72 SSEDGEEASAYLYESDDSVETRVKTPYSGE-MDLLGEILDTLSTHSSDQGKLAAAKSLDF
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE4 CHRGDLDSCFSLPNIPRWQPDDKKLPEPEPQPLSLPSLQNASSLDATSSSKDSRSQLIPS
CCDS72 FRSMDDIDYKPTNKSNAPSENNLAFLCGGSGDQAEWNLGQDDSALHGKHLPPSPRKRVSS
600 610 620 630 640 650
>>CCDS41452.2 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1 (426 aa)
initn: 1475 init1: 827 opt: 1503 Z-score: 932.0 bits: 182.4 E(32554): 1.4e-45
Smith-Waterman score: 1503; 53.2% identity (78.2% similar) in 417 aa overlap (1-417:1-414)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MESRAEGGSPAVFDWFFEAACPASLQEDPPILRQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVERE
:. :.... .:: ... : :: .::: .: .:: :: ::: .: ::::::::::::
CCDS41 MDCRTKANPDRTFDLVLKVKCHASENEDPVVLWKFPEDFGDQEILQSVPKFCFPFDVERV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 PPSPAVQHFTFALTDLAGNRRFGFCRLRAGTQSCLCILSHLPWFEVFYKLLNTVGDLLAQ
. . :::::.:::. ...::::::: .: ::::::.::::::.::::::..: ::.
CCDS41 SQNQVGQHFTFVLTDIESKQRFGFCRLTSGGTICLCILSYLPWFEVYYKLLNTLADYLAK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DQVTEAEELLQNLFQQSLSGPQASVGLELGSGVTVSSGQGIPPPTRGNSKPLSCFVAPDS
. .. .: :..:... . .. :.: ... . .. : . . : : :.:::
CCDS41 ELENDLNETLRSLYNHPVPKANTPVNLSVNQEIFIACEQVLKD--QPALVPHSYFIAPDV
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GRLPSIPENRNLTELVVAVTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYP
::.:::.::::: ::: .:.. :.:..: :::... .:::::::.:.:.: :::::
CCDS41 TGLPTIPESRNLTEYFVAVDVNNMLQLYASMLHERRIVIISSKLSTLTACIHGSAALLYP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 MRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVREKALEDVVVLNVDANTLETTFN
: :.:. ::.::::::::::::::::::.:.:: :::..:.:::::.::::.::::. :.
CCDS41 MYWQHIYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHSSLIERVKNKSLEDVVMLNVDTNTLESPFS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 DVQALPPDVVSLLRLRLRKVALAPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEE
:.. :: :::: :. .:.: . : :.::.: ::.::: :::.::::: .::.:.:: ::
CCDS41 DLNNLPSDVVSALKNKLKKQSTATGDGVARAFLRAQAALFGSYRDALRYKPGEPITFCEE
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 VFLAQKPGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEARLEKLNKGEGFSDQFEQEITGCGASSGALR
:. .. .. .. : . :..::::::::..:: ::: :.:::: ::.:::. : .:
CCDS41 SFVKHRSSV-MKQFLETAINLQLFKQFIDGRLAKLNAGRGFSDVFEEEITSGGFCGGKDK
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 SYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGVQSLLMYKDGDSVLQRGGS
CCDS41 LQYDYPFSQ
420
>>CCDS35134.1 DENND1A gene_id:57706|Hs108|chr9 (559 aa)
initn: 1139 init1: 991 opt: 1153 Z-score: 717.9 bits: 143.2 E(32554): 1.1e-33
Smith-Waterman score: 1584; 48.4% identity (72.6% similar) in 525 aa overlap (1-511:1-502)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MESRAEGGSPAVFDWFFEAACPAS--LQEDPPILRQFPPDFRDQEAMQMVPKFCFPFDVE
: :: . . ..:. . :.: : . :: . :::: :. :::..: . :::::: :.
CCDS35 MGSRIKQNPETTFEVYVEVAYPRTGGTLSDPEVQRQFPEDYSDQEVLQTLTKFCFPFYVD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 REPPSPAVQHFTFALTDLAGNRRFGFCRLRAGTQSCLCILSHLPWFEVFYKLLNTVGDLL
: . :.:::.:::. ...::::::: .:..::.::::.:::::::::::: ..:
CCDS35 SLTVSQVGQNFTFVLTDIDSKQRFGFCRLSSGAKSCFCILSYLPWFEVFYKLLNILADYT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 AQDQVTEAEELLQNLFQQSLSGPQASVGLELGSGVTVSSGQGIPPPTRGNSKPLSCFVAP
.. : .. .:::..: . . : .:: : . : :: :
CCDS35 TKRQENQWNELLETLHKLPIPDPGVSVHLSVHSYFTV----------------------P
130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DSGRLPSIPENRNLTELVVAVTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALL
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CCDS35 DTRELPSIPENRNLTEYFVAVDVNNMLHLYASMLYERRILIICSKLSTLTACIHGSAAML
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CCDS35 PTPTLGSI-TIPRPQGRKTPELGIVPPPP------IPRPAKLQAAGAALGDVSERL-QTD
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]