Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4225
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4225, 794 aa
1>>>pF1KE4225 794 - 794 aa - 794 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3238+/-0.0006; mu= -2.8660+/- 0.037
mean_var=441.4523+/-93.377, 0's: 0 Z-trim(116.4): 270 B-trim: 44 in 1/52
Lambda= 0.061043
statistics sampled from 27292 (27585) to 27292 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.672), E-opt: 0.2 (0.323), width: 16
Scan time: 11.730
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016857766 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 854) 2392 226.6 3.5e-58
NP_005656 (OMIM: 602942) ecotropic viral integrati ( 810) 2330 221.1 1.5e-56
XP_016857773 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 777) 2318 220.0 3.1e-56
XP_016857770 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 818) 2318 220.1 3.2e-56
NP_001295177 (OMIM: 602942) ecotropic viral integr ( 821) 2318 220.1 3.2e-56
XP_016857774 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 741) 2241 213.2 3.3e-54
XP_016857772 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 785) 2241 213.3 3.4e-54
XP_016857769 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 826) 2241 213.3 3.5e-54
XP_016857765 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 859) 2241 213.3 3.6e-54
XP_016857760 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 903) 2241 213.3 3.7e-54
XP_016857767 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 848) 1819 176.1 5.5e-43
XP_016857771 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 812) 1742 169.3 5.8e-41
XP_016857768 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 841) 1742 169.4 6e-41
XP_016857763 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 886) 1742 169.4 6.2e-41
XP_016857762 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 886) 1742 169.4 6.2e-41
XP_016857764 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 886) 1742 169.4 6.2e-41
XP_016857761 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 897) 1742 169.4 6.2e-41
XP_016857759 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 927) 1742 169.4 6.3e-41
XP_016857758 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 930) 1742 169.4 6.4e-41
XP_016857777 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 722) 1588 155.7 6.6e-37
XP_016857775 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 722) 1588 155.7 6.6e-37
XP_016857776 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic v ( 722) 1588 155.7 6.6e-37
XP_006711756 (OMIM: 609238) PREDICTED: rab GTPase- ( 985) 905 95.7 1e-18
XP_005245738 (OMIM: 609238) PREDICTED: rab GTPase- (1014) 902 95.5 1.2e-18
XP_011508525 (OMIM: 609238) PREDICTED: rab GTPase- (1051) 902 95.5 1.3e-18
XP_005245737 (OMIM: 609238) PREDICTED: rab GTPase- (1051) 902 95.5 1.3e-18
XP_016870059 (OMIM: 615882) PREDICTED: rab GTPase- ( 900) 872 92.8 7.2e-18
XP_011516744 (OMIM: 615882) PREDICTED: rab GTPase- ( 900) 872 92.8 7.2e-18
XP_011516743 (OMIM: 615882) PREDICTED: rab GTPase- (1069) 872 92.9 8e-18
XP_016870057 (OMIM: 615882) PREDICTED: rab GTPase- (1069) 872 92.9 8e-18
XP_016870056 (OMIM: 615882) PREDICTED: rab GTPase- (1069) 872 92.9 8e-18
XP_016870058 (OMIM: 615882) PREDICTED: rab GTPase- (1069) 872 92.9 8e-18
NP_036329 (OMIM: 615882) rab GTPase-activating pro (1069) 872 92.9 8e-18
XP_011516742 (OMIM: 615882) PREDICTED: rab GTPase- (1069) 872 92.9 8e-18
XP_016858483 (OMIM: 609238) PREDICTED: rab GTPase- ( 778) 832 89.2 7.6e-17
NP_055672 (OMIM: 609238) rab GTPase-activating pro ( 815) 832 89.2 7.8e-17
XP_016876373 (OMIM: 612465,616087) PREDICTED: TBC1 ( 487) 602 68.7 7.1e-11
XP_016876372 (OMIM: 612465,616087) PREDICTED: TBC1 (1017) 602 69.1 1.1e-10
XP_016876371 (OMIM: 612465,616087) PREDICTED: TBC1 (1054) 602 69.1 1.1e-10
XP_005266662 (OMIM: 612465,616087) PREDICTED: TBC1 (1117) 602 69.1 1.2e-10
XP_006719966 (OMIM: 612465,616087) PREDICTED: TBC1 (1140) 602 69.1 1.2e-10
NP_001273588 (OMIM: 612465,616087) TBC1 domain fam (1235) 602 69.2 1.3e-10
XP_011533633 (OMIM: 612465,616087) PREDICTED: TBC1 (1261) 602 69.2 1.3e-10
XP_005266660 (OMIM: 612465,616087) PREDICTED: TBC1 (1273) 602 69.2 1.3e-10
NP_001273587 (OMIM: 612465,616087) TBC1 domain fam (1290) 602 69.2 1.3e-10
NP_055647 (OMIM: 612465,616087) TBC1 domain family (1298) 602 69.2 1.3e-10
XP_011511972 (OMIM: 609850) PREDICTED: TBC1 domain ( 494) 584 67.1 2.1e-10
XP_006714064 (OMIM: 609850) PREDICTED: TBC1 domain ( 546) 584 67.1 2.3e-10
XP_016863410 (OMIM: 609850) PREDICTED: TBC1 domain (1039) 584 67.5 3.4e-10
XP_005262706 (OMIM: 609850) PREDICTED: TBC1 domain (1146) 584 67.5 3.6e-10
>>XP_016857766 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic viral (854 aa)
initn: 3062 init1: 2187 opt: 2392 Z-score: 1165.5 bits: 226.6 E(85289): 3.5e-58
Smith-Waterman score: 3247; 66.0% identity (81.9% similar) in 791 aa overlap (1-749:49-804)
10 20
pF1KE4 MASPTLS-PDSSSQEALSAPTCSPTSDSEN
.:::. : .::. .::.:. ::.: :.
XP_016 ATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTSSSTTLSTPALSPSSPSQ-
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 LSPDELELLAKLEEQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWIL
::::.:::::::::::::::.::::.::.:::::::::::::::::::::::::::.:::
XP_016 LSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRSVNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDSWIL
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 WGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDMPVKNQYSELLKMSSP
::::.::::. :..::: .:::..:::::::::::::::::: .::.:.::::::::.::
XP_016 WGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVHKGIPHHFRAIVWQLLCSAQSMPIKDQYSELLKMTSP
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 CEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
::::::::::::::::.::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 MPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTS
:::::::::::.:::.:::::::::::::::::.:::: :.::.::.: .::.:::::::
XP_016 MPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMAELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTS
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 MYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEGMSQ
:::::::::.::::::::.:::.::::: :::::::::::::::.::::::::::::: :
XP_016 MYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDMEGMLQ
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 YFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENR
.::.:::::::. ::::. ::::::: ::::.:::::...:.::::::.::::::::::
XP_016 HFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNSKKMKKLEKEYTTIKTKEMEEQVEIKRLRTENR
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 LLKQRIETLEKGQVTRAQEAEENYVIKRELAVVRQQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQEN
::::::::::: ... :.. .....:::
XP_016 LLKQRIETLEKESASLADR------------LIQHKCSSN--------------------
440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 PRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKVLDMEKRNSSLPDENNVAQLQEELK
.:::: .:: :: :.:: :.:. ::.::::::::.::::.:::::::.:.:::::
XP_016 --YNEDFVLQLEKELVQARLSEAESQCALKEMQDKVLDIEKRNNSLPDENNIARLQEELI
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 ALKVREGQAVASTRELKLQLQELSDTWQAHLARG-GRWKESPRKLVVGELQDELMSVRLR
:.:.::..:. . .::. :...: . :: :::: ::::. :.: ...:::::::..:::
XP_016 AVKLREAEAIMGLKELRQQVKDLEEHWQRHLARTTGRWKDPPKKNAMNELQDELMTIRLR
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 EAQALAEGRELRQRVVELETQDHIHRNLLNRVEAERAALQEKLQYLAAQNKGLQTQLSES
::.. :: ::..::..:.:::..:. : : :.: : .::::.:::.:::::: :::::.
XP_016 EAETQAEIREIKQRMMEMETQNQINSNHLRRAEQEVISLQEKVQYLSAQNKGLLTQLSEA
590 600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KE4 RRKQAEAECKSKEEVMAVRLREADSMAAVAEMRQRIAELEIQREEGRIQGQLNHSDSSQY
.::::: :::.::::::::::::::.:::::.::.:::::::.:::..:::::.:::.::
XP_016 KRKQAEIECKNKEEVMAVRLREADSIAAVAELRQHIAELEIQKEEGKLQGQLNKSDSNQY
650 660 670 680 690 700
690 700 710
pF1KE4 IRELKDQIEELKAE---------------------------------VRLLKGPPPFEDP
: :::::: ::. : .: ::: :
XP_016 IGELKDQIAELNHEGELGREGRNVIPDWHSPHAEGNLMSGKQHSSPTLRCLKGQRGFSGQ
710 720 730 740 750 760
720 730 740 750 760
pF1KE4 LAFDGLSLARHL--DEDSLPSSDEELLG-----VGVGAALQDALYPLSPRDARFFRRLER
:::. .. :: :..:. ::::... .::: :.
XP_016 PPFDGIHIVNHLIGDDESFHSSDEDFIDNSLQETGVGFPLHGKSGSMSLDPAVADGSESE
770 780 790 800 810 820
770 780 790
pF1KE4 PAKDSEGSSDSDADELAAPYSQGLDN
XP_016 TEDSVLETRESNQVVQKERPPRRRESYSTTV
830 840 850
>>NP_005656 (OMIM: 602942) ecotropic viral integration s (810 aa)
initn: 2972 init1: 2207 opt: 2330 Z-score: 1136.2 bits: 221.1 E(85289): 1.5e-56
Smith-Waterman score: 3294; 68.7% identity (84.3% similar) in 758 aa overlap (1-749:49-760)
10 20
pF1KE4 MASPTLS-PDSSSQEALSAPTCSPTSDSEN
.:::. : .::. .::.:. ::.: :.
NP_005 ATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTSSSTTLSTPALSPSSPSQ-
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 LSPDELELLAKLEEQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWIL
::::.:::::::::::::::.::::.::.:::::::::::::::::::::::::::.:::
NP_005 LSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRSVNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDSWIL
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 WGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDMPVKNQYSELLKMSSP
::::.::::. :..::: .:::..:::::::::::::::::: .::.:.::::::::.::
NP_005 WGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVHKGIPHHFRAIVWQLLCSAQSMPIKDQYSELLKMTSP
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 CEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
::::::::::::::::.::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 MPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTS
:::::::::::.:::.:::::::::::::::::.:::: :.::.::.: .::.:::::::
NP_005 MPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMAELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTS
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 MYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEGMSQ
:::::::::.::::::::.:::.::::: :::::::::::::::.::::::::::::: :
NP_005 MYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDMEGMLQ
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 YFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENR
.::.:::::::. ::::. ::::::: ::::.:::::...:.::::::.::::::::::
NP_005 HFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNSKKMKKLEKEYTTIKTKEMEEQVEIKRLRTENR
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 LLKQRIETLEKGQVTRAQEAEENYVIKRELAVVRQQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQEN
::::::::::: ..:::
NP_005 LLKQRIETLEK-----------------------HKCSSN--------------------
440 450
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 PRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKVLDMEKRNSSLPDENNVAQLQEELK
.:::: .:: :: :.:: :.:. ::.::::::::.::::.:::::::.:.:::::
NP_005 --YNEDFVLQLEKELVQARLSEAESQCALKEMQDKVLDIEKRNNSLPDENNIARLQEELI
460 470 480 490 500 510
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 ALKVREGQAVASTRELKLQLQELSDTWQAHLARG-GRWKESPRKLVVGELQDELMSVRLR
:.:.::..:. . .::. :...: . :: :::: ::::. :.: ...:::::::..:::
NP_005 AVKLREAEAIMGLKELRQQVKDLEEHWQRHLARTTGRWKDPPKKNAMNELQDELMTIRLR
520 530 540 550 560 570
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 EAQALAEGRELRQRVVELETQDHIHRNLLNRVEAERAALQEKLQYLAAQNKGLQTQLSES
::.. :: ::..::..:.:::..:. : : :.: : .::::.:::.:::::: :::::.
NP_005 EAETQAEIREIKQRMMEMETQNQINSNHLRRAEQEVISLQEKVQYLSAQNKGLLTQLSEA
580 590 600 610 620 630
630 640 650 660 670 680
pF1KE4 RRKQAEAECKSKEEVMAVRLREADSMAAVAEMRQRIAELEIQREEGRIQGQLNHSDSSQY
.::::: :::.::::::::::::::.:::::.::.:::::::.:::..:::::.:::.::
NP_005 KRKQAEIECKNKEEVMAVRLREADSIAAVAELRQHIAELEIQKEEGKLQGQLNKSDSNQY
640 650 660 670 680 690
690 700 710 720 730 740
pF1KE4 IRELKDQIEELKAEVRLLKGPPPFEDPLAFDGLSLARHL--DEDSLPSSDEELLG-----
: :::::: ::. :.: ::: : :::. .. :: :..:. ::::...
NP_005 IGELKDQIAELNHELRCLKGQRGFSGQPPFDGIHIVNHLIGDDESFHSSDEDFIDNSLQE
700 710 720 730 740 750
750 760 770 780 790
pF1KE4 VGVGAALQDALYPLSPRDARFFRRLERPAKDSEGSSDSDADELAAPYSQGLDN
.::: :.
NP_005 TGVGFPLHGKSGSMSLDPAVADGSESETEDSVLETRESNQVVQKERPPRRRESYSTTV
760 770 780 790 800 810
>>XP_016857773 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic viral (777 aa)
initn: 2952 init1: 2187 opt: 2318 Z-score: 1130.7 bits: 220.0 E(85289): 3.1e-56
Smith-Waterman score: 3323; 68.9% identity (85.5% similar) in 758 aa overlap (1-749:5-727)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MASPTLS-PDSSSQEALSAPTCSPTSDSENLSPDELELLAKLEEQNRLLEADSKSM
.:::. : .::. .::.:. ::.: :. ::::.:::::::::::::::.::::.
XP_016 MASQVASPSTSLHTTSSSTTLSTPALSPSSPSQ-LSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 RSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWILWGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKG
::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::. :..::: .:::..::
XP_016 RSVNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDSWILWGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVHKG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 IPHHFRAIVWQLLCSATDMPVKNQYSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLG
:::::::::::::::: .::.:.::::::::.::::::::::::::::::.::: .::::
XP_016 IPHHFRAIVWQLLCSAQSMPIKDQYSELLKMTSPCEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 QEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::
XP_016 QEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 MAELGLCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDI
:::::::.:::: :.::.::.: .::.::::::::::::::::.::::::::.:::.:::
XP_016 MAELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTSMYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 FMYEGLEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEGMSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKY
:: :::::::::::::::.::::::::::::: :.::.:::::::. ::::. ::::::
XP_016 FMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDMEGMLQHFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 NPKKMKRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENRLLKQRIETLEKGQVTRAQEAEENYVI
: ::::.:::::...:.::::::.::::::::::::::::::::: ... :..
XP_016 NSKKMKKLEKEYTTIKTKEMEEQVEIKRLRTENRLLKQRIETLEKESASLADR-------
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 KRELAVVRQQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQENPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETL
.....::: .:::: .:: :: :.:: :.:.
XP_016 -----LIQHKCSSN----------------------YNEDFVLQLEKELVQARLSEAESQ
420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 GALREMQDKVLDMEKRNSSLPDENNVAQLQEELKALKVREGQAVASTRELKLQLQELSDT
::.::::::::.::::.:::::::.:.::::: :.:.::..:. . .::. :...: .
XP_016 CALKEMQDKVLDIEKRNNSLPDENNIARLQEELIAVKLREAEAIMGLKELRQQVKDLEEH
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 WQAHLARG-GRWKESPRKLVVGELQDELMSVRLREAQALAEGRELRQRVVELETQDHIHR
:: :::: ::::. :.: ...:::::::..:::::.. :: ::..::..:.:::..:.
XP_016 WQRHLARTTGRWKDPPKKNAMNELQDELMTIRLREAETQAEIREIKQRMMEMETQNQINS
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 NLLNRVEAERAALQEKLQYLAAQNKGLQTQLSESRRKQAEAECKSKEEVMAVRLREADSM
: : :.: : .::::.:::.:::::: :::::..::::: :::.::::::::::::::.
XP_016 NHLRRAEQEVISLQEKVQYLSAQNKGLLTQLSEAKRKQAEIECKNKEEVMAVRLREADSI
570 580 590 600 610 620
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 AAVAEMRQRIAELEIQREEGRIQGQLNHSDSSQYIRELKDQIEELKAEVRLLKGPPPFED
:::::.::.:::::::.:::..:::::.:::.::: :::::: ::. :.: ::: :
XP_016 AAVAELRQHIAELEIQKEEGKLQGQLNKSDSNQYIGELKDQIAELNHELRCLKGQRGFSG
630 640 650 660 670 680
720 730 740 750 760
pF1KE4 PLAFDGLSLARHL--DEDSLPSSDEELLG-----VGVGAALQDALYPLSPRDARFFRRLE
:::. .. :: :..:. ::::... .::: :.
XP_016 QPPFDGIHIVNHLIGDDESFHSSDEDFIDNSLQETGVGFPLHGKSGSMSLDPAVADGSES
690 700 710 720 730 740
770 780 790
pF1KE4 RPAKDSEGSSDSDADELAAPYSQGLDN
XP_016 ETEDSVLETRESNQVVQKERPPRRRESYSTTV
750 760 770
>>XP_016857770 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic viral (818 aa)
initn: 2952 init1: 2187 opt: 2318 Z-score: 1130.5 bits: 220.1 E(85289): 3.2e-56
Smith-Waterman score: 3323; 68.9% identity (85.5% similar) in 758 aa overlap (1-749:46-768)
10 20
pF1KE4 MASPTLS-PDSSSQEALSAPTCSPTSDSEN
.:::. : .::. .::.:. ::.: :.
XP_016 ATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTSSSTTLSTPALSPSSPSQ-
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 LSPDELELLAKLEEQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWIL
::::.:::::::::::::::.::::.::.:::::::::::::::::::::::::::.:::
XP_016 LSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRSVNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDSWIL
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 WGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDMPVKNQYSELLKMSSP
::::.::::. :..::: .:::..:::::::::::::::::: .::.:.::::::::.::
XP_016 WGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVHKGIPHHFRAIVWQLLCSAQSMPIKDQYSELLKMTSP
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 CEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
::::::::::::::::.::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 MPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTS
:::::::::::.:::.:::::::::::::::::.:::: :.::.::.: .::.:::::::
XP_016 MPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMAELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTS
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 MYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEGMSQ
:::::::::.::::::::.:::.::::: :::::::::::::::.::::::::::::: :
XP_016 MYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDMEGMLQ
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330 340 350 360 370 380
pF1KE4 YFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENR
.::.:::::::. ::::. ::::::: ::::.:::::...:.::::::.::::::::::
XP_016 HFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNSKKMKKLEKEYTTIKTKEMEEQVEIKRLRTENR
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390 400 410 420 430 440
pF1KE4 LLKQRIETLEKGQVTRAQEAEENYVIKRELAVVRQQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQEN
::::::::::: ... :.. .....:::
XP_016 LLKQRIETLEKESASLADR------------LIQHKCSSN--------------------
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450 460 470 480 490 500
pF1KE4 PRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKVLDMEKRNSSLPDENNVAQLQEELK
.:::: .:: :: :.:: :.:. ::.::::::::.::::.:::::::.:.:::::
XP_016 --YNEDFVLQLEKELVQARLSEAESQCALKEMQDKVLDIEKRNNSLPDENNIARLQEELI
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 ALKVREGQAVASTRELKLQLQELSDTWQAHLARG-GRWKESPRKLVVGELQDELMSVRLR
:.:.::..:. . .::. :...: . :: :::: ::::. :.: ...:::::::..:::
XP_016 AVKLREAEAIMGLKELRQQVKDLEEHWQRHLARTTGRWKDPPKKNAMNELQDELMTIRLR
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570 580 590 600 610 620
pF1KE4 EAQALAEGRELRQRVVELETQDHIHRNLLNRVEAERAALQEKLQYLAAQNKGLQTQLSES
::.. :: ::..::..:.:::..:. : : :.: : .::::.:::.:::::: :::::.
XP_016 EAETQAEIREIKQRMMEMETQNQINSNHLRRAEQEVISLQEKVQYLSAQNKGLLTQLSEA
590 600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KE4 RRKQAEAECKSKEEVMAVRLREADSMAAVAEMRQRIAELEIQREEGRIQGQLNHSDSSQY
.::::: :::.::::::::::::::.:::::.::.:::::::.:::..:::::.:::.::
XP_016 KRKQAEIECKNKEEVMAVRLREADSIAAVAELRQHIAELEIQKEEGKLQGQLNKSDSNQY
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690 700 710 720 730 740
pF1KE4 IRELKDQIEELKAEVRLLKGPPPFEDPLAFDGLSLARHL--DEDSLPSSDEELLG-----
: :::::: ::. :.: ::: : :::. .. :: :..:. ::::...
XP_016 IGELKDQIAELNHELRCLKGQRGFSGQPPFDGIHIVNHLIGDDESFHSSDEDFIDNSLQE
710 720 730 740 750 760
750 760 770 780 790
pF1KE4 VGVGAALQDALYPLSPRDARFFRRLERPAKDSEGSSDSDADELAAPYSQGLDN
.::: :.
XP_016 TGVGFPLHGKSGSMSLDPAVADGSESETEDSVLETRESNQVVQKERPPRRRESYSTTV
770 780 790 800 810
>>NP_001295177 (OMIM: 602942) ecotropic viral integratio (821 aa)
initn: 2952 init1: 2187 opt: 2318 Z-score: 1130.4 bits: 220.1 E(85289): 3.2e-56
Smith-Waterman score: 3323; 68.9% identity (85.5% similar) in 758 aa overlap (1-749:49-771)
10 20
pF1KE4 MASPTLS-PDSSSQEALSAPTCSPTSDSEN
.:::. : .::. .::.:. ::.: :.
NP_001 ATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTSSSTTLSTPALSPSSPSQ-
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 LSPDELELLAKLEEQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWIL
::::.:::::::::::::::.::::.::.:::::::::::::::::::::::::::.:::
NP_001 LSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRSVNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDSWIL
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90 100 110 120 130 140
pF1KE4 WGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDMPVKNQYSELLKMSSP
::::.::::. :..::: .:::..:::::::::::::::::: .::.:.::::::::.::
NP_001 WGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVHKGIPHHFRAIVWQLLCSAQSMPIKDQYSELLKMTSP
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150 160 170 180 190 200
pF1KE4 CEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
::::::::::::::::.::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
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210 220 230 240 250 260
pF1KE4 MPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTS
:::::::::::.:::.:::::::::::::::::.:::: :.::.::.: .::.:::::::
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:::::::::.::::::::.:::.::::: :::::::::::::::.::::::::::::: :
NP_001 MYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDMEGMLQ
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pF1KE4 YFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENR
.::.:::::::. ::::. ::::::: ::::.:::::...:.::::::.::::::::::
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390 400 410 420 430 440
pF1KE4 LLKQRIETLEKGQVTRAQEAEENYVIKRELAVVRQQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQEN
::::::::::: ... :.. .....:::
NP_001 LLKQRIETLEKESASLADR------------LIQHKCSSN--------------------
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pF1KE4 PRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKVLDMEKRNSSLPDENNVAQLQEELK
.:::: .:: :: :.:: :.:. ::.::::::::.::::.:::::::.:.:::::
NP_001 --YNEDFVLQLEKELVQARLSEAESQCALKEMQDKVLDIEKRNNSLPDENNIARLQEELI
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pF1KE4 ALKVREGQAVASTRELKLQLQELSDTWQAHLARG-GRWKESPRKLVVGELQDELMSVRLR
:.:.::..:. . .::. :...: . :: :::: ::::. :.: ...:::::::..:::
NP_001 AVKLREAEAIMGLKELRQQVKDLEEHWQRHLARTTGRWKDPPKKNAMNELQDELMTIRLR
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pF1KE4 EAQALAEGRELRQRVVELETQDHIHRNLLNRVEAERAALQEKLQYLAAQNKGLQTQLSES
::.. :: ::..::..:.:::..:. : : :.: : .::::.:::.:::::: :::::.
NP_001 EAETQAEIREIKQRMMEMETQNQINSNHLRRAEQEVISLQEKVQYLSAQNKGLLTQLSEA
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pF1KE4 RRKQAEAECKSKEEVMAVRLREADSMAAVAEMRQRIAELEIQREEGRIQGQLNHSDSSQY
.::::: :::.::::::::::::::.:::::.::.:::::::.:::..:::::.:::.::
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pF1KE4 IRELKDQIEELKAEVRLLKGPPPFEDPLAFDGLSLARHL--DEDSLPSSDEELLG-----
: :::::: ::. :.: ::: : :::. .. :: :..:. ::::...
NP_001 IGELKDQIAELNHELRCLKGQRGFSGQPPFDGIHIVNHLIGDDESFHSSDEDFIDNSLQE
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750 760 770 780 790
pF1KE4 VGVGAALQDALYPLSPRDARFFRRLERPAKDSEGSSDSDADELAAPYSQGLDN
.::: :.
NP_001 TGVGFPLHGKSGSMSLDPAVADGSESETEDSVLETRESNQVVQKERPPRRRESYSTTV
770 780 790 800 810 820
>>XP_016857774 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic viral (741 aa)
initn: 3320 init1: 2194 opt: 2241 Z-score: 1094.3 bits: 213.2 E(85289): 3.3e-54
Smith-Waterman score: 3445; 72.2% identity (88.9% similar) in 738 aa overlap (1-718:5-741)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MASPTLS-PDSSSQEALSAPTCSPTSDSENLSPDELELLAKLEEQNRLLEADSKSM
.:::. : .::. .::.:. ::.: :. ::::.:::::::::::::::.::::.
XP_016 MASQVASPSTSLHTTSSSTTLSTPALSPSSPSQ-LSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSL
10 20 30 40 50
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pF1KE4 RSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWILWGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKG
::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::. :..::: .:::..::
XP_016 RSVNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDSWILWGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVHKG
60 70 80 90 100 110
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pF1KE4 IPHHFRAIVWQLLCSATDMPVKNQYSELLKMSSPCEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLG
:::::::::::::::: .::.:.::::::::.::::::::::::::::::.::: .::::
XP_016 IPHHFRAIVWQLLCSAQSMPIKDQYSELLKMTSPCEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLG
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pF1KE4 QEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::
XP_016 QEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 MAELGLCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTSMYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDI
:::::::.:::: :.::.::.: .::.::::::::::::::::.::::::::.:::.:::
XP_016 MAELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTSMYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDI
240 250 260 270 280 290
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pF1KE4 FMYEGLEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEGMSQYFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKY
:: :::::::::::::::.::::::::::::: :.::.:::::::. ::::. ::::::
XP_016 FMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDMEGMLQHFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KE4 NPKKMKRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENRLLKQRIETLEK-----------GQVT
: ::::.:::::...:.::::::.::::::::::::::::::::: ::::
XP_016 NSKKMKKLEKEYTTIKTKEMEEQVEIKRLRTENRLLKQRIETLEKESASLADRLIQGQVT
360 370 380 390 400 410
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pF1KE4 RAQEAEENYVIKRELAVVRQQCSSAAEDLQKAQSTIRQLQEQQE----NPRLTEDFVSHL
:::::::::.::::::...:: . :. :..:..:::.::.::. . .:::: .:
XP_016 RAQEAEENYLIKRELATIKQQSDEASAKLEQAENTIRKLQHQQQWHKCSSNYNEDFVLQL
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pF1KE4 ETELEQSRLRETETLGALREMQDKVLDMEKRNSSLPDENNVAQLQEELKALKVREGQAVA
: :: :.:: :.:. ::.::::::::.::::.:::::::.:.::::: :.:.::..:.
XP_016 EKELVQARLSEAESQCALKEMQDKVLDIEKRNNSLPDENNIARLQEELIAVKLREAEAIM
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KE4 STRELKLQLQELSDTWQAHLARG-GRWKESPRKLVVGELQDELMSVRLREAQALAEGREL
. .::. :...: . :: :::: ::::. :.: ...:::::::..:::::.. :: ::.
XP_016 GLKELRQQVKDLEEHWQRHLARTTGRWKDPPKKNAMNELQDELMTIRLREAETQAEIREI
540 550 560 570 580 590
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pF1KE4 RQRVVELETQDHIHRNLLNRVEAERAALQEKLQYLAAQNKGLQTQLSESRRKQAEAECKS
.::..:.:::..:. : : :.: : .::::.:::.:::::: :::::..::::: :::.
XP_016 KQRMMEMETQNQINSNHLRRAEQEVISLQEKVQYLSAQNKGLLTQLSEAKRKQAEIECKN
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 KEEVMAVRLREADSMAAVAEMRQRIAELEIQREEGRIQGQLNHSDSSQYIRELKDQIEEL
::::::::::::::.:::::.::.:::::::.:::..:::::.:::.::: :::::: ::
XP_016 KEEVMAVRLREADSIAAVAELRQHIAELEIQKEEGKLQGQLNKSDSNQYIGELKDQIAEL
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KE4 KAE---VRLLKGPPPFEDPLAFDGLSLARHLDEDSLPSSDEELLGVGVGAALQDALYPLS
. : ... : : . : .:
XP_016 NHESTSAQVPKRPEGLLRPTSF
720 730 740
>>XP_016857772 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic viral (785 aa)
initn: 3320 init1: 2194 opt: 2241 Z-score: 1094.0 bits: 213.3 E(85289): 3.4e-54
Smith-Waterman score: 3445; 72.2% identity (88.9% similar) in 738 aa overlap (1-718:49-785)
10 20
pF1KE4 MASPTLS-PDSSSQEALSAPTCSPTSDSEN
.:::. : .::. .::.:. ::.: :.
XP_016 ATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTSSSTTLSTPALSPSSPSQ-
20 30 40 50 60 70
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 LSPDELELLAKLEEQNRLLEADSKSMRSMNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDTWIL
::::.:::::::::::::::.::::.::.:::::::::::::::::::::::::::.:::
XP_016 LSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRSVNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDSWIL
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 WGRIANEWEEWRRRKEKLLKELIRKGIPHHFRAIVWQLLCSATDMPVKNQYSELLKMSSP
::::.::::. :..::: .:::..:::::::::::::::::: .::.:.::::::::.::
XP_016 WGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVHKGIPHHFRAIVWQLLCSAQSMPIKDQYSELLKMTSP
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 CEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
::::::::::::::::.::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 MPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTS
:::::::::::.:::.:::::::::::::::::.:::: :.::.::.: .::.:::::::
XP_016 MPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMAELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTS
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 MYASSWFLTLFLTTFPLPVATRVFDIFMYEGLEIVFRVGLALLQVNQAELMQLDMEGMSQ
:::::::::.::::::::.:::.::::: :::::::::::::::.::::::::::::: :
XP_016 MYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDMEGMLQ
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 YFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENR
.::.:::::::. ::::. ::::::: ::::.:::::...:.::::::.::::::::::
XP_016 HFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNSKKMKKLEKEYTTIKTKEMEEQVEIKRLRTENR
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KE4 LLKQRIETLEK-----------GQVTRAQEAEENYVIKRELAVVRQQCSSAAEDLQKAQS
::::::::::: :::::::::::::.::::::...:: . :. :..:..
XP_016 LLKQRIETLEKESASLADRLIQGQVTRAQEAEENYLIKRELATIKQQSDEASAKLEQAEN
440 450 460 470 480 490
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 TIRQLQEQQE----NPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKVLDMEKRNSS
:::.::.::. . .:::: .:: :: :.:: :.:. ::.::::::::.::::.:
XP_016 TIRKLQHQQQWHKCSSNYNEDFVLQLEKELVQARLSEAESQCALKEMQDKVLDIEKRNNS
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500 510 520 530 540 550
pF1KE4 LPDENNVAQLQEELKALKVREGQAVASTRELKLQLQELSDTWQAHLARG-GRWKESPRKL
::::::.:.::::: :.:.::..:. . .::. :...: . :: :::: ::::. :.:
XP_016 LPDENNIARLQEELIAVKLREAEAIMGLKELRQQVKDLEEHWQRHLARTTGRWKDPPKKN
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560 570 580 590 600 610
pF1KE4 VVGELQDELMSVRLREAQALAEGRELRQRVVELETQDHIHRNLLNRVEAERAALQEKLQY
...:::::::..:::::.. :: ::..::..:.:::..:. : : :.: : .::::.::
XP_016 AMNELQDELMTIRLREAETQAEIREIKQRMMEMETQNQINSNHLRRAEQEVISLQEKVQY
620 630 640 650 660 670
620 630 640 650 660 670
pF1KE4 LAAQNKGLQTQLSESRRKQAEAECKSKEEVMAVRLREADSMAAVAEMRQRIAELEIQREE
:.:::::: :::::..::::: :::.::::::::::::::.:::::.::.:::::::.::
XP_016 LSAQNKGLLTQLSEAKRKQAEIECKNKEEVMAVRLREADSIAAVAELRQHIAELEIQKEE
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680 690 700 710 720 730
pF1KE4 GRIQGQLNHSDSSQYIRELKDQIEELKAE---VRLLKGPPPFEDPLAFDGLSLARHLDED
:..:::::.:::.::: :::::: ::. : ... : : . : .:
XP_016 GKLQGQLNKSDSNQYIGELKDQIAELNHESTSAQVPKRPEGLLRPTSF
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740 750 760 770 780 790
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>>XP_016857769 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic viral (826 aa)
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.:::. : .::. .::.:. ::.: :. ::::.:::::::::::::::.::::.
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:::::::::::::::: .::.:.::::::::.::::::::::::::::::.::: .::::
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:::::::.:::: :.::.::.: .::.::::::::::::::::.::::::::.:::.:::
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:: :::::::::::::::.::::::::::::: :.::.:::::::. ::::. ::::::
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: :: :.:: :.:. ::.::::::::.::::.:::::::.:.::::: :.:.::..:.
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. .::. :...: . :: :::: ::::. :.: ...:::::::..:::::.. :: ::.
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.::..:.:::..:. : : :.: : .::::.:::.:::::: :::::..::::: :::.
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pF1KE4 KEEVMAVRLREADSMAAVAEMRQRIAELEIQREEGRIQGQLNHSDSSQYIRELKDQIEEL
::::::::::::::.:::::.::.:::::::.:::..:::::.:::.::: :::::: ::
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pF1KE4 KAEVRLLKGPPPFEDPLAFDGLSLARHL--DEDSLPSSDEELLG-----VGVGAALQDAL
. :.: ::: : :::. .. :: :..:. ::::... .::: :.
XP_016 NHELRCLKGQRGFSGQPPFDGIHIVNHLIGDDESFHSSDEDFIDNSLQETGVGFPLHGKS
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pF1KE4 YPLSPRDARFFRRLERPAKDSEGSSDSDADELAAPYSQGLDN
XP_016 GSMSLDPAVADGSESETEDSVLETRESNQVVQKERPPRRRESYSTTV
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>>XP_016857765 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic viral (859 aa)
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pF1KE4 MASPTLS-PDSSSQEALSAPTCSPTSDSENLSPDELELLAKLEEQNRLLEADSKSM
.:::. : .::. .::.:. ::.: :. ::::.:::::::::::::::.::::.
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::
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:: :::::::::::::::.::::::::::::: :.::.:::::::. ::::. ::::::
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: ::::.:::::...:.::::::.::::::::::::::::::::: ::::
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:::::::::.::::::...:: . :. :..:..:::.::.::. . .:::: .:
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: :: :.:: :.:. ::.::::::::.::::.:::::::.:.::::: :.:.::..:.
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480 490 500 510 520 530
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. .::. :...: . :: :::: ::::. :.: ...:::::::..:::::.. :: ::.
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.::..:.:::..:. : : :.: : .::::.:::.:::::: :::::..::::: :::.
XP_016 KQRMMEMETQNQINSNHLRRAEQEVISLQEKVQYLSAQNKGLLTQLSEAKRKQAEIECKN
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pF1KE4 KEEVMAVRLREADSMAAVAEMRQRIAELEIQREEGRIQGQLNHSDSSQYIRELKDQIEEL
::::::::::::::.:::::.::.:::::::.:::..:::::.:::.::: :::::: ::
XP_016 KEEVMAVRLREADSIAAVAELRQHIAELEIQKEEGKLQGQLNKSDSNQYIGELKDQIAEL
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700 710 720
pF1KE4 KAE---------------------------------VRLLKGPPPFEDPLAFDGLSLARH
. : .: ::: : :::. .. :
XP_016 NHEGELGREGRNVIPDWHSPHAEGNLMSGKQHSSPTLRCLKGQRGFSGQPPFDGIHIVNH
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730 740 750 760 770
pF1KE4 L--DEDSLPSSDEELLG-----VGVGAALQDALYPLSPRDARFFRRLERPAKDSEGSSDS
: :..:. ::::... .::: :.
XP_016 LIGDDESFHSSDEDFIDNSLQETGVGFPLHGKSGSMSLDPAVADGSESETEDSVLETRES
780 790 800 810 820 830
>>XP_016857760 (OMIM: 602942) PREDICTED: ecotropic viral (903 aa)
initn: 3368 init1: 2194 opt: 2241 Z-score: 1093.3 bits: 213.3 E(85289): 3.7e-54
Smith-Waterman score: 3456; 68.1% identity (84.2% similar) in 806 aa overlap (1-749:49-853)
10 20
pF1KE4 MASPTLS-PDSSSQEALSAPTCSPTSDSEN
.:::. : .::. .::.:. ::.: :.
XP_016 ATDKVAEKLSSTLSWVKNTVSHTVSQMASQVASPSTSLHTTSSSTTLSTPALSPSSPSQ-
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30 40 50 60 70 80
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::::.:::::::::::::::.::::.::.:::::::::::::::::::::::::::.:::
XP_016 LSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRSVNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEEDSWIL
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::::.::::. :..::: .:::..:::::::::::::::::: .::.:.::::::::.::
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140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 CEKLIRRDIARTYPEHEFFKGQDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
::::::::::::::::.::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CEKLIRRDIARTYPEHNFFKEKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQ
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 MPEEEAFCVFVRLMQEYRLRELFKPSMAELGLCIYQFEYMLQEQLPDLNTHFRSQSFHTS
:::::::::::.:::.:::::::::::::::::.:::: :.::.::.: .::.:::::::
XP_016 MPEEEAFCVFVKLMQDYRLRELFKPSMAELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTS
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
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:::::::::.::::::::.:::.::::: :::::::::::::::.::::::::::::: :
XP_016 MYASSWFLTIFLTTFPLPIATRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDMEGMLQ
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330 340 350 360 370 380
pF1KE4 YFQRVIPHQFDSCPDKLVLKAYQVKYNPKKMKRLEKEYAAMKSKEMEEQIEIKRLRTENR
.::.:::::::. ::::. ::::::: ::::.:::::...:.::::::.::::::::::
XP_016 HFQKVIPHQFDGVPDKLIQAAYQVKYNSKKMKKLEKEYTTIKTKEMEEQVEIKRLRTENR
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KE4 LLKQRIETLEK-----------GQVTRAQEAEENYVIKRELAVVRQQCSSAAEDLQKAQS
::::::::::: :::::::::::::.::::::...:: . :. :..:..
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440 450 460 470 480 490
pF1KE4 TIRQLQEQQE----NPRLTEDFVSHLETELEQSRLRETETLGALREMQDKVLDMEKRNSS
:::.::.::. . .:::: .:: :: :.:: :.:. ::.::::::::.::::.:
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::::::.:.::::: :.:.::..:. . .::. :...: . :: :::: ::::. :.:
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560 570 580 590 600 610
pF1KE4 VVGELQDELMSVRLREAQALAEGRELRQRVVELETQDHIHRNLLNRVEAERAALQEKLQY
...:::::::..:::::.. :: ::..::..:.:::..:. : : :.: : .::::.::
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:..:::::.:::.::: :::::: ::. :
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pF1KE4 --VRLLKGPPPFEDPLAFDGLSLARHL--DEDSLPSSDEELLG-----VGVGAALQDALY
.: ::: : :::. .. :: :..:. ::::... .::: :.
XP_016 PTLRCLKGQRGFSGQPPFDGIHIVNHLIGDDESFHSSDEDFIDNSLQETGVGFPLHGKSG
800 810 820 830 840 850
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pF1KE4 PLSPRDARFFRRLERPAKDSEGSSDSDADELAAPYSQGLDN
XP_016 SMSLDPAVADGSESETEDSVLETRESNQVVQKERPPRRRESYSTTV
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794 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 17:09:23 2016 done: Mon Nov 7 17:09:24 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]