Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4210
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4210, 730 aa
1>>>pF1KE4210 730 - 730 aa - 730 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3464+/-0.000348; mu= 5.8312+/- 0.022
mean_var=161.3301+/-32.884, 0's: 0 Z-trim(119.4): 91 B-trim: 156 in 1/55
Lambda= 0.100976
statistics sampled from 33213 (33305) to 33213 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.722), E-opt: 0.2 (0.39), width: 16
Scan time: 13.820
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001139130 (OMIM: 600278) rap1 GTPase-activating ( 727) 2085 316.1 3.2e-85
XP_016857469 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 719) 2065 313.2 2.4e-84
XP_016857477 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 663) 1990 302.2 4.3e-81
NP_002876 (OMIM: 600278) rap1 GTPase-activating pr ( 663) 1990 302.2 4.3e-81
XP_016857462 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 663) 1990 302.2 4.3e-81
XP_016857476 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 663) 1990 302.2 4.3e-81
XP_016857475 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 663) 1990 302.2 4.3e-81
XP_016857478 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 655) 1970 299.3 3.2e-80
XP_016857479 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 655) 1970 299.3 3.2e-80
XP_016857464 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 655) 1970 299.3 3.2e-80
XP_016857461 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 655) 1970 299.3 3.2e-80
XP_016857474 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 681) 1885 286.9 1.8e-76
XP_016857460 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 804) 1877 285.8 4.6e-76
XP_016857463 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 651) 1791 273.2 2.3e-72
NP_001139129 (OMIM: 600278) rap1 GTPase-activating ( 681) 1791 273.2 2.4e-72
XP_016857459 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 681) 1791 273.2 2.4e-72
XP_016857473 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 681) 1791 273.2 2.4e-72
XP_005246012 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 681) 1791 273.2 2.4e-72
XP_016857471 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 689) 1791 273.2 2.4e-72
XP_016857457 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 689) 1791 273.2 2.4e-72
XP_016857458 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 689) 1791 273.2 2.4e-72
XP_016857472 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 689) 1791 273.2 2.4e-72
XP_016857470 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 689) 1791 273.2 2.4e-72
XP_016857466 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 617) 1790 273.1 2.4e-72
XP_016857480 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 625) 1790 273.1 2.4e-72
XP_016857465 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 625) 1790 273.1 2.4e-72
XP_016857455 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 740) 1782 271.9 6.3e-72
XP_016857468 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 740) 1782 271.9 6.3e-72
XP_006710868 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 740) 1782 271.9 6.3e-72
XP_006710867 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 748) 1782 271.9 6.4e-72
NP_001317312 (OMIM: 600278) rap1 GTPase-activating ( 748) 1782 271.9 6.4e-72
XP_016857454 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 748) 1782 271.9 6.4e-72
XP_016857456 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase ( 710) 1777 271.2 1e-71
XP_016857387 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1704) 717 117.0 6.4e-25
XP_016857386 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1704) 717 117.0 6.4e-25
XP_005273270 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1722) 717 117.0 6.5e-25
XP_005273269 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1722) 717 117.0 6.5e-25
NP_065859 (OMIM: 611609) signal-induced proliferat (1722) 717 117.0 6.5e-25
XP_011542545 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1722) 717 117.0 6.5e-25
XP_016857385 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1722) 717 117.0 6.5e-25
XP_005273268 (OMIM: 611609) PREDICTED: signal-indu (1722) 717 117.0 6.5e-25
XP_016882007 (OMIM: 616655,616851) PREDICTED: sign (1780) 715 116.7 8.2e-25
XP_005258728 (OMIM: 616655,616851) PREDICTED: sign (1781) 715 116.7 8.2e-25
NP_055888 (OMIM: 616655,616851) signal-induced pro (1781) 715 116.7 8.2e-25
XP_011524959 (OMIM: 616655,616851) PREDICTED: sign (1781) 715 116.7 8.2e-25
XP_016882006 (OMIM: 616655,616851) PREDICTED: sign (1781) 715 116.7 8.2e-25
NP_006738 (OMIM: 602180) signal-induced proliferat (1042) 664 109.2 9e-23
NP_694985 (OMIM: 602180) signal-induced proliferat (1042) 664 109.2 9e-23
XP_005274246 (OMIM: 602180) PREDICTED: signal-indu (1042) 664 109.2 9e-23
XP_011543516 (OMIM: 602180) PREDICTED: signal-indu (1042) 664 109.2 9e-23
>>NP_001139130 (OMIM: 600278) rap1 GTPase-activating pro (727 aa)
initn: 2058 init1: 1609 opt: 2085 Z-score: 1651.0 bits: 316.1 E(85289): 3.2e-85
Smith-Waterman score: 2276; 51.8% identity (74.2% similar) in 726 aa overlap (1-710:1-706)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MFGRKRSVSFGGFGWIDKTMLASLKVKKQELANS---SDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSS
: ::::: .::..: .::.. . .: ... :. . : : : : :..
NP_001 MSGRKRSFTFGAYGGVDKSFTSRRSVWRSDGQNQHFPQALDLSRVNLVPSYTPSLYPKNT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 EFFEMLEKMQGIKLEEQK---PGPQKNKDDYIPYPSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWI
..:::.::::: ...::. : : :...:::::::. ::. . ::.: ..:::::::::
NP_001 DLFEMIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPYPSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 EDPENVGTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKLECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGS
: :: . .:: : : ::.: ::::. :: ::.:::::.:.:.: .
NP_001 E-----GTNHEI-TSI--PETEPLQSPTT-KVKLECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDA
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 SLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHERIPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGL
.::.:..:.: . :.::..::.: .: :. ::.. :...:.: :.:: :.:.
NP_001 ALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDVIPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 RFNPVLYPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQKARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLL
:: ::::::::..::..::: ..:.::::::::: :: :::::..::::::: :::..:
NP_001 RFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQKLGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 GDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRDREIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRH
:. . :::::::::::::::::::.:::: .::..:::::::::::.:.:::::::::::
NP_001 GQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRNKEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 IGNDIVAIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQVETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGP
:::::::..::.::::::::::::::::::.:::.: : . : ::::::::.::: :::
NP_001 IGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQAEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 PLPSPPVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDKFAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQA
:::.: ::.:::::.::::::: ::: :: :..::::::.:::::::..:..::: :.:.
NP_001 PLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEKFAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 MLGLGPEEDKFENG-GHGGFLESFKRAIRVRSHSMETMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISH
:.::: .:::.::: : :::.:::::.:: ::.::..: ..:: .. . : ::...
NP_001 MMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQSMDAMGLSNKKPNT--VSTSHSGSFAP
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 NSMEVTKTTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLFPRLHT---GSEGQGDSRARCDSTSST
:. ...:.. .: ..:: ...:: : .. : :. . . . .: .
NP_001 NNPDLAKAAGISLIV------PGKSPTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAG
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640
pF1KE4 PKTPDGGHSSQEIKSETSSNPSSPEI--CPNKEKPFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTA
::::.:: ::: :::.::. ::::. :. . . : . .::::::.:: .:..
NP_001 QKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAETAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVV
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KE4 GEGEAMEEGDSG-GSQPSTTSPFKQEVFVYSP--SPSSESPSLGAAATPIIMSRSP-TDA
: :... :.: : :. .: :.. :.:: : . : :.. : :::: ::
NP_001 EETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKRDSFIYSTWLEDSVSTTSGGSSPGP---SRSPHPDA
650 660 670 680 690 700
710 720 730
pF1KE4 KSRNSPRSNLKFRFDKLSHASSGAGH
. ..:
NP_001 GKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
710 720
>>XP_016857469 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase-act (719 aa)
initn: 2096 init1: 1609 opt: 2065 Z-score: 1635.3 bits: 313.2 E(85289): 2.4e-84
Smith-Waterman score: 2256; 52.8% identity (75.5% similar) in 691 aa overlap (1-678:1-674)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MFGRKRSVSFGGFGWIDKTMLASLKVKKQELANS---SDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSS
: ::::: .::..: .::.. . .: ... :. . : : : : :..
XP_016 MSGRKRSFTFGAYGGVDKSFTSRRSVWRSDGQNQHFPQALDLSRVNLVPSYTPSLYPKNT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 EFFEMLEKMQGIKLEEQK---PGPQKNKDDYIPYPSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWI
..:::.::::: ...::. : : :...:::::::. ::. . ::.: ..:::::::::
XP_016 DLFEMIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPYPSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 EDPENVGTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKLECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGS
: :: . .:: : : ::.: ::::. :: ::.:::::.:.:.: .
XP_016 E-----GTNHEI-TSI--PETEPLQSPTT-KVKLECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDA
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 SLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHERIPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGL
.::.:..:.: . :.::..::.: .: :. ::.. :...:.: :.:: :.:.
XP_016 ALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDVIPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 RFNPVLYPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQKARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLL
:: ::::::::..::..::: ..:.::::::::: :: :::::..::::::: :::..:
XP_016 RFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQKLGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 GDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRDREIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRH
:. . :::::::::::::::::::.:::: .::..:::::::::::.:.:::::::::::
XP_016 GQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRNKEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 IGNDIVAIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQVETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGP
:::::::..::.::::::::::::::::::.:::.: : . : ::::::::.::: :::
XP_016 IGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQAEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 PLPSPPVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDKFAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQA
:::.: ::.:::::.::::::: ::: :: :..::::::.:::::::..:..::: :.:.
XP_016 PLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEKFAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 MLGLGPEEDKFENG-GHGGFLESFKRAIRVRSHSMETMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISH
:.::: .:::.::: : :::.:::::.:: ::.::..: ..:: .. . : ::...
XP_016 MMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQSMDAMGLSNKKPNT--VSTSHSGSFAP
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 NSMEVTKTTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLFPRLHT---GSEGQGDSRARCDSTSST
:. ...:.. .: . .:: ...:: : .. : :. . . . .: .
XP_016 NNPDLAKAAGISLIVPG------KSPTRKKSGPFGSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAG
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640
pF1KE4 PKTPDGGHSSQEIKSETSSNPSSPEI--CPNKEKPFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTA
::::.:: ::: :::.::. ::::. :. . . : . .::::::.:: .:..
XP_016 QKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAETAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVV
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KE4 GEGEAMEEGDSG-GSQPSTTSPFKQEVFVYSPSPSSESPSLGAAATPIIMSRSPTDAKSR
: :... :.: : :. .: :.. :.::
XP_016 EETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKRDSFIYSTWLEDSVSTTSGGSSPDAGKLGDPACPEI
650 660 670 680 690 700
710 720 730
pF1KE4 NSPRSNLKFRFDKLSHASSGAGH
XP_016 KIQLEASEQHMPQLGC
710
>>XP_016857477 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase-act (663 aa)
initn: 1964 init1: 1609 opt: 1990 Z-score: 1576.8 bits: 302.2 E(85289): 4.3e-81
Smith-Waterman score: 2181; 53.8% identity (76.0% similar) in 662 aa overlap (62-710:1-642)
40 50 60 70 80
pF1KE4 ANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFFEMLEKMQGIKLEEQK---PGPQKNKDDYIPY
:.::::: ...::. : : :...:::::
XP_016 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPY
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 PSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENVGTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKL
::. ::. . ::.: ..:::::::::: :: . .:: : : . ::.: ::
XP_016 PSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIE-----GTNHEI-TSIPETEPLQ--SPTT-KVKL
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 ECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHER
::. :: ::.:::::.:.:.: ..::.:..:.: . :.::..::.: .: :.
XP_016 ECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDV
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 IPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVLYPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQK
::.. :...:.: :.:: :.:. :: ::::::::..::..::: ..:.:::::::::
XP_016 IPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQK
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 ARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRD
:: :::::..::::::: :::..::. . :::::::::::::::::::.:::: .::.
XP_016 LGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRN
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 REIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIVAIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQ
.:::::::::::.:.::::::::::::::::::..::.::::::::::::::::::.:::
XP_016 KEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQ
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 VETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPPVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDK
.: : . : ::::::::.::: ::::::.: ::.:::::.::::::: ::: :: :..:
XP_016 AEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEK
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 FAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGPEEDKFENG-GHGGFLESFKRAIRVRSHS
:::::.:::::::..:..::: :.:.:.::: .:::.::: : :::.:::::.:: ::.:
XP_016 FAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQS
390 400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 METMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISHNSMEVTKTTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLF
:..: ..:: .. . : ::... :. ...:.. .: . .:: ...:: :
XP_016 MDAMGLSNKKPNT--VSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLIVPG------KSPTRKKSGPF
450 460 470 480 490
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 PRLHT---GSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSSQEIKSETSSNPSSPEI--CPNKEK
.. : :. . . . .: . ::::.:: ::: :::.::. ::::. :. .
XP_016 GSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAGQKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAE
500 510 520 530 540 550
630 640 650 660 670
pF1KE4 PFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG-GSQPSTTSPFKQEVFVYSP--
. : . .::::::.:: .:.. : :... :.: : :. .: :.. :.::
XP_016 TAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVVEETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKRDSFIYSTWL
560 570 580 590 600 610
680 690 700 710 720 730
pF1KE4 SPSSESPSLGAAATPIIMSRSP-TDAKSRNSPRSNLKFRFDKLSHASSGAGH
: . : :.. : :::: :: . ..:
XP_016 EDSVSTTSGGSSPGP---SRSPHPDAGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
620 630 640 650 660
>>NP_002876 (OMIM: 600278) rap1 GTPase-activating protei (663 aa)
initn: 1964 init1: 1609 opt: 1990 Z-score: 1576.8 bits: 302.2 E(85289): 4.3e-81
Smith-Waterman score: 2181; 53.8% identity (76.0% similar) in 662 aa overlap (62-710:1-642)
40 50 60 70 80
pF1KE4 ANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFFEMLEKMQGIKLEEQK---PGPQKNKDDYIPY
:.::::: ...::. : : :...:::::
NP_002 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPY
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 PSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENVGTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKL
::. ::. . ::.: ..:::::::::: :: . .:: : : . ::.: ::
NP_002 PSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIE-----GTNHEI-TSIPETEPLQ--SPTT-KVKL
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 ECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHER
::. :: ::.:::::.:.:.: ..::.:..:.: . :.::..::.: .: :.
NP_002 ECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDV
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 IPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVLYPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQK
::.. :...:.: :.:: :.:. :: ::::::::..::..::: ..:.:::::::::
NP_002 IPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQK
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 ARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRD
:: :::::..::::::: :::..::. . :::::::::::::::::::.:::: .::.
NP_002 LGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRN
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 REIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIVAIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQ
.:::::::::::.:.::::::::::::::::::..::.::::::::::::::::::.:::
NP_002 KEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQ
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 VETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPPVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDK
.: : . : ::::::::.::: ::::::.: ::.:::::.::::::: ::: :: :..:
NP_002 AEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEK
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 FAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGPEEDKFENG-GHGGFLESFKRAIRVRSHS
:::::.:::::::..:..::: :.:.:.::: .:::.::: : :::.:::::.:: ::.:
NP_002 FAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQS
390 400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 METMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISHNSMEVTKTTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLF
:..: ..:: .. . : ::... :. ...:.. .: . .:: ...:: :
NP_002 MDAMGLSNKKPNT--VSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLIVPG------KSPTRKKSGPF
450 460 470 480 490
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 PRLHT---GSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSSQEIKSETSSNPSSPEI--CPNKEK
.. : :. . . . .: . ::::.:: ::: :::.::. ::::. :. .
NP_002 GSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAGQKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAE
500 510 520 530 540 550
630 640 650 660 670
pF1KE4 PFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG-GSQPSTTSPFKQEVFVYSP--
. : . .::::::.:: .:.. : :... :.: : :. .: :.. :.::
NP_002 TAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVVEETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKRDSFIYSTWL
560 570 580 590 600 610
680 690 700 710 720 730
pF1KE4 SPSSESPSLGAAATPIIMSRSP-TDAKSRNSPRSNLKFRFDKLSHASSGAGH
: . : :.. : :::: :: . ..:
NP_002 EDSVSTTSGGSSPGP---SRSPHPDAGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
620 630 640 650 660
>>XP_016857462 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase-act (663 aa)
initn: 1964 init1: 1609 opt: 1990 Z-score: 1576.8 bits: 302.2 E(85289): 4.3e-81
Smith-Waterman score: 2181; 53.8% identity (76.0% similar) in 662 aa overlap (62-710:1-642)
40 50 60 70 80
pF1KE4 ANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFFEMLEKMQGIKLEEQK---PGPQKNKDDYIPY
:.::::: ...::. : : :...:::::
XP_016 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPY
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 PSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENVGTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKL
::. ::. . ::.: ..:::::::::: :: . .:: : : . ::.: ::
XP_016 PSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIE-----GTNHEI-TSIPETEPLQ--SPTT-KVKL
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 ECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHER
::. :: ::.:::::.:.:.: ..::.:..:.: . :.::..::.: .: :.
XP_016 ECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDV
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 IPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVLYPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQK
::.. :...:.: :.:: :.:. :: ::::::::..::..::: ..:.:::::::::
XP_016 IPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQK
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 ARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRD
:: :::::..::::::: :::..::. . :::::::::::::::::::.:::: .::.
XP_016 LGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRN
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 REIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIVAIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQ
.:::::::::::.:.::::::::::::::::::..::.::::::::::::::::::.:::
XP_016 KEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQ
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 VETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPPVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDK
.: : . : ::::::::.::: ::::::.: ::.:::::.::::::: ::: :: :..:
XP_016 AEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEK
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 FAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGPEEDKFENG-GHGGFLESFKRAIRVRSHS
:::::.:::::::..:..::: :.:.:.::: .:::.::: : :::.:::::.:: ::.:
XP_016 FAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQS
390 400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 METMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISHNSMEVTKTTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLF
:..: ..:: .. . : ::... :. ...:.. .: . .:: ...:: :
XP_016 MDAMGLSNKKPNT--VSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLIVPG------KSPTRKKSGPF
450 460 470 480 490
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 PRLHT---GSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSSQEIKSETSSNPSSPEI--CPNKEK
.. : :. . . . .: . ::::.:: ::: :::.::. ::::. :. .
XP_016 GSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAGQKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAE
500 510 520 530 540 550
630 640 650 660 670
pF1KE4 PFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG-GSQPSTTSPFKQEVFVYSP--
. : . .::::::.:: .:.. : :... :.: : :. .: :.. :.::
XP_016 TAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVVEETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKRDSFIYSTWL
560 570 580 590 600 610
680 690 700 710 720 730
pF1KE4 SPSSESPSLGAAATPIIMSRSP-TDAKSRNSPRSNLKFRFDKLSHASSGAGH
: . : :.. : :::: :: . ..:
XP_016 EDSVSTTSGGSSPGP---SRSPHPDAGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
620 630 640 650 660
>>XP_016857476 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase-act (663 aa)
initn: 1964 init1: 1609 opt: 1990 Z-score: 1576.8 bits: 302.2 E(85289): 4.3e-81
Smith-Waterman score: 2181; 53.8% identity (76.0% similar) in 662 aa overlap (62-710:1-642)
40 50 60 70 80
pF1KE4 ANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFFEMLEKMQGIKLEEQK---PGPQKNKDDYIPY
:.::::: ...::. : : :...:::::
XP_016 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPY
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 PSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENVGTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKL
::. ::. . ::.: ..:::::::::: :: . .:: : : . ::.: ::
XP_016 PSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIE-----GTNHEI-TSIPETEPLQ--SPTT-KVKL
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 ECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHER
::. :: ::.:::::.:.:.: ..::.:..:.: . :.::..::.: .: :.
XP_016 ECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDV
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 IPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVLYPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQK
::.. :...:.: :.:: :.:. :: ::::::::..::..::: ..:.:::::::::
XP_016 IPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQK
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 ARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRD
:: :::::..::::::: :::..::. . :::::::::::::::::::.:::: .::.
XP_016 LGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRN
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 REIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIVAIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQ
.:::::::::::.:.::::::::::::::::::..::.::::::::::::::::::.:::
XP_016 KEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQ
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 VETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPPVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDK
.: : . : ::::::::.::: ::::::.: ::.:::::.::::::: ::: :: :..:
XP_016 AEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEK
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 FAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGPEEDKFENG-GHGGFLESFKRAIRVRSHS
:::::.:::::::..:..::: :.:.:.::: .:::.::: : :::.:::::.:: ::.:
XP_016 FAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQS
390 400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 METMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISHNSMEVTKTTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLF
:..: ..:: .. . : ::... :. ...:.. .: . .:: ...:: :
XP_016 MDAMGLSNKKPNT--VSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLIVPG------KSPTRKKSGPF
450 460 470 480 490
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 PRLHT---GSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSSQEIKSETSSNPSSPEI--CPNKEK
.. : :. . . . .: . ::::.:: ::: :::.::. ::::. :. .
XP_016 GSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAGQKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAE
500 510 520 530 540 550
630 640 650 660 670
pF1KE4 PFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG-GSQPSTTSPFKQEVFVYSP--
. : . .::::::.:: .:.. : :... :.: : :. .: :.. :.::
XP_016 TAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVVEETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKRDSFIYSTWL
560 570 580 590 600 610
680 690 700 710 720 730
pF1KE4 SPSSESPSLGAAATPIIMSRSP-TDAKSRNSPRSNLKFRFDKLSHASSGAGH
: . : :.. : :::: :: . ..:
XP_016 EDSVSTTSGGSSPGP---SRSPHPDAGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
620 630 640 650 660
>>XP_016857475 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase-act (663 aa)
initn: 1964 init1: 1609 opt: 1990 Z-score: 1576.8 bits: 302.2 E(85289): 4.3e-81
Smith-Waterman score: 2181; 53.8% identity (76.0% similar) in 662 aa overlap (62-710:1-642)
40 50 60 70 80
pF1KE4 ANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFFEMLEKMQGIKLEEQK---PGPQKNKDDYIPY
:.::::: ...::. : : :...:::::
XP_016 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPY
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 PSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENVGTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKL
::. ::. . ::.: ..:::::::::: :: . .:: : : . ::.: ::
XP_016 PSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIE-----GTNHEI-TSIPETEPLQ--SPTT-KVKL
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 ECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHER
::. :: ::.:::::.:.:.: ..::.:..:.: . :.::..::.: .: :.
XP_016 ECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDV
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 IPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVLYPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQK
::.. :...:.: :.:: :.:. :: ::::::::..::..::: ..:.:::::::::
XP_016 IPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQK
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 ARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRD
:: :::::..::::::: :::..::. . :::::::::::::::::::.:::: .::.
XP_016 LGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRN
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 REIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIVAIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQ
.:::::::::::.:.::::::::::::::::::..::.::::::::::::::::::.:::
XP_016 KEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQ
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 VETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPPVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDK
.: : . : ::::::::.::: ::::::.: ::.:::::.::::::: ::: :: :..:
XP_016 AEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEK
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 FAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGPEEDKFENG-GHGGFLESFKRAIRVRSHS
:::::.:::::::..:..::: :.:.:.::: .:::.::: : :::.:::::.:: ::.:
XP_016 FAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQS
390 400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 METMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISHNSMEVTKTTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLF
:..: ..:: .. . : ::... :. ...:.. .: . .:: ...:: :
XP_016 MDAMGLSNKKPNT--VSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLIVPG------KSPTRKKSGPF
450 460 470 480 490
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 PRLHT---GSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSSQEIKSETSSNPSSPEI--CPNKEK
.. : :. . . . .: . ::::.:: ::: :::.::. ::::. :. .
XP_016 GSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAGQKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAE
500 510 520 530 540 550
630 640 650 660 670
pF1KE4 PFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG-GSQPSTTSPFKQEVFVYSP--
. : . .::::::.:: .:.. : :... :.: : :. .: :.. :.::
XP_016 TAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVVEETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKRDSFIYSTWL
560 570 580 590 600 610
680 690 700 710 720 730
pF1KE4 SPSSESPSLGAAATPIIMSRSP-TDAKSRNSPRSNLKFRFDKLSHASSGAGH
: . : :.. : :::: :: . ..:
XP_016 EDSVSTTSGGSSPGP---SRSPHPDAGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
620 630 640 650 660
>>XP_016857478 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase-act (655 aa)
initn: 2002 init1: 1609 opt: 1970 Z-score: 1561.1 bits: 299.3 E(85289): 3.2e-80
Smith-Waterman score: 2161; 55.0% identity (77.4% similar) in 627 aa overlap (62-678:1-610)
40 50 60 70 80
pF1KE4 ANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFFEMLEKMQGIKLEEQK---PGPQKNKDDYIPY
:.::::: ...::. : : :...:::::
XP_016 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPY
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 PSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENVGTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKL
::. ::. . ::.: ..:::::::::: :: . .:: : : ::.: ::
XP_016 PSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIE-----GTNHEI-TSI--PETEPLQSPTT-KVKL
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 ECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHER
::. :: ::.:::::.:.:.: ..::.:..:.: . :.::..::.: .: :.
XP_016 ECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDV
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 IPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVLYPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQK
::.. :...:.: :.:: :.:. :: ::::::::..::..::: ..:.:::::::::
XP_016 IPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQK
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 ARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRD
:: :::::..::::::: :::..::. . :::::::::::::::::::.:::: .::.
XP_016 LGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRN
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 REIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIVAIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQ
.:::::::::::.:.::::::::::::::::::..::.::::::::::::::::::.:::
XP_016 KEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQ
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 VETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPPVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDK
.: : . : ::::::::.::: ::::::.: ::.:::::.::::::: ::: :: :..:
XP_016 AEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEK
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 FAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGPEEDKFENG-GHGGFLESFKRAIRVRSHS
:::::.:::::::..:..::: :.:.:.::: .:::.::: : :::.:::::.:: ::.:
XP_016 FAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQS
390 400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 METMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISHNSMEVTKTTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLF
:..: ..:: .. . : ::... :. ...:.. .: . .:: ...:: :
XP_016 MDAMGLSNKKPNT--VSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLIVPG------KSPTRKKSGPF
450 460 470 480 490
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 PRLHT---GSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSSQEIKSETSSNPSSPEI--CPNKEK
.. : :. . . . .: . ::::.:: ::: :::.::. ::::. :. .
XP_016 GSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAGQKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAE
500 510 520 530 540 550
630 640 650 660 670 680
pF1KE4 PFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG-GSQPSTTSPFKQEVFVYSPSP
. : . .::::::.:: .:.. : :... :.: : :. .: :.. :.::
XP_016 TAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVVEETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKRDSFIYSTWL
560 570 580 590 600 610
690 700 710 720 730
pF1KE4 SSESPSLGAAATPIIMSRSPTDAKSRNSPRSNLKFRFDKLSHASSGAGH
XP_016 EDSVSTTSGGSSPDAGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
620 630 640 650
>>XP_016857479 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase-act (655 aa)
initn: 2002 init1: 1609 opt: 1970 Z-score: 1561.1 bits: 299.3 E(85289): 3.2e-80
Smith-Waterman score: 2161; 55.0% identity (77.4% similar) in 627 aa overlap (62-678:1-610)
40 50 60 70 80
pF1KE4 ANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFFEMLEKMQGIKLEEQK---PGPQKNKDDYIPY
:.::::: ...::. : : :...:::::
XP_016 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPY
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 PSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENVGTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKL
::. ::. . ::.: ..:::::::::: :: . .:: : : ::.: ::
XP_016 PSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIE-----GTNHEI-TSI--PETEPLQSPTT-KVKL
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 ECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHER
::. :: ::.:::::.:.:.: ..::.:..:.: . :.::..::.: .: :.
XP_016 ECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDV
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 IPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVLYPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQK
::.. :...:.: :.:: :.:. :: ::::::::..::..::: ..:.:::::::::
XP_016 IPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQK
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 ARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRD
:: :::::..::::::: :::..::. . :::::::::::::::::::.:::: .::.
XP_016 LGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRN
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 REIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIVAIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQ
.:::::::::::.:.::::::::::::::::::..::.::::::::::::::::::.:::
XP_016 KEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQ
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 VETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPPVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDK
.: : . : ::::::::.::: ::::::.: ::.:::::.::::::: ::: :: :..:
XP_016 AEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEK
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 FAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGPEEDKFENG-GHGGFLESFKRAIRVRSHS
:::::.:::::::..:..::: :.:.:.::: .:::.::: : :::.:::::.:: ::.:
XP_016 FAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQS
390 400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 METMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISHNSMEVTKTTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLF
:..: ..:: .. . : ::... :. ...:.. .: . .:: ...:: :
XP_016 MDAMGLSNKKPNT--VSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLIVPG------KSPTRKKSGPF
450 460 470 480 490
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 PRLHT---GSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSSQEIKSETSSNPSSPEI--CPNKEK
.. : :. . . . .: . ::::.:: ::: :::.::. ::::. :. .
XP_016 GSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAGQKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAE
500 510 520 530 540 550
630 640 650 660 670 680
pF1KE4 PFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG-GSQPSTTSPFKQEVFVYSPSP
. : . .::::::.:: .:.. : :... :.: : :. .: :.. :.::
XP_016 TAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVVEETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKRDSFIYSTWL
560 570 580 590 600 610
690 700 710 720 730
pF1KE4 SSESPSLGAAATPIIMSRSPTDAKSRNSPRSNLKFRFDKLSHASSGAGH
XP_016 EDSVSTTSGGSSPDAGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
620 630 640 650
>>XP_016857464 (OMIM: 600278) PREDICTED: rap1 GTPase-act (655 aa)
initn: 2002 init1: 1609 opt: 1970 Z-score: 1561.1 bits: 299.3 E(85289): 3.2e-80
Smith-Waterman score: 2161; 55.0% identity (77.4% similar) in 627 aa overlap (62-678:1-610)
40 50 60 70 80
pF1KE4 ANSSDATLPDRPLSPPLTAPPTMKSSEFFEMLEKMQGIKLEEQK---PGPQKNKDDYIPY
:.::::: ...::. : : :...:::::
XP_016 MIEKMQGSRMDEQRCSFPPPLKTEEDYIPY
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 PSIDEVVEKGGPYPQVILPQFGGYWIEDPENVGTPTSLGSSICEEEEEDNLSPNTFGYKL
::. ::. . ::.: ..:::::::::: :: . .:: : : ::.: ::
XP_016 PSVHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIE-----GTNHEI-TSI--PETEPLQSPTT-KVKL
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 ECKGEARAYRRHFLGKDHLNFYCTGSSLGNLILSVKCEEAEGIEYLRVILRSKLKTVHER
::. :: ::.:::::.:.:.: ..::.:..:.: . :.::..::.: .: :.
XP_016 ECNPTARIYRKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGDQEHLRLLLRTKCRTYHDV
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 IPLAGLSKLPSVPQIAKAFCDDAVGLRFNPVLYPKASQMIVSYDEHEVNNTFKFGVIYQK
::.. :...:.: :.:: :.:. :: ::::::::..::..::: ..:.:::::::::
XP_016 IPISCLTEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLYPKASRLIVTFDEHVISNNFKFGVIYQK
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 ARQTLEEELFGNNEESPAFKEFLDLLGDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQTGVESVYTTFRD
:: :::::..::::::: :::..::. . :::::::::::::::::::.:::: .::.
XP_016 LGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTESVYCNFRN
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 REIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIVAIIFQEENTPFVPDMIASNFLHAYIVVQ
.:::::::::::.:.::::::::::::::::::..::.::::::::::::::::::.:::
XP_016 KEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENTPFVPDMIASNFLHAYVVVQ
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 VETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPPVFQKGPEFREFLLTKLTNAENACCKSDK
.: : . : ::::::::.::: ::::::.: ::.:::::.::::::: ::: :: :..:
XP_016 AEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINAEYACYKAEK
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 FAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGPEEDKFENG-GHGGFLESFKRAIRVRSHS
:::::.:::::::..:..::: :.:.:.::: .:::.::: : :::.:::::.:: ::.:
XP_016 FAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFKRVIRSRSQS
390 400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 METMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISHNSMEVTKTTFSPPVVAATVKNQSRSPIKRRSGLF
:..: ..:: .. . : ::... :. ...:.. .: . .:: ...:: :
XP_016 MDAMGLSNKKPNT--VSTSHSGSFAPNNPDLAKAAGISLIVPG------KSPTRKKSGPF
450 460 470 480 490
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 PRLHT---GSEGQGDSRARCDSTSSTPKTPDGGHSSQEIKSETSSNPSSPEI--CPNKEK
.. : :. . . . .: . ::::.:: ::: :::.::. ::::. :. .
XP_016 GSRRSSAIGIENIQEVQEKRESPPAGQKTPDSGHVSQEPKSENSSTQSSPEMPTTKNRAE
500 510 520 530 540 550
630 640 650 660 670 680
pF1KE4 PFMKLKENGRAISRSSSSTSSVSSTAGEGEAMEEGDSG-GSQPSTTSPFKQEVFVYSPSP
. : . .::::::.:: .:.. : :... :.: : :. .: :.. :.::
XP_016 TAAQRAEALKDFSRSSSSASSFASVVEETEGVDGEDTGLESVSSSGTPHKRDSFIYSTWL
560 570 580 590 600 610
690 700 710 720 730
pF1KE4 SSESPSLGAAATPIIMSRSPTDAKSRNSPRSNLKFRFDKLSHASSGAGH
XP_016 EDSVSTTSGGSSPDAGKLGDPACPEIKIQLEASEQHMPQLGC
620 630 640 650
730 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 03:20:38 2016 done: Sun Nov 6 03:20:40 2016
Total Scan time: 13.820 Total Display time: 0.200
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]