FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4208, 728 aa
1>>>pF1KE4208 728 - 728 aa - 728 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6063+/-0.00107; mu= 14.4832+/- 0.064
mean_var=127.2237+/-26.310, 0's: 0 Z-trim(106.8): 88 B-trim: 5 in 2/51
Lambda= 0.113708
statistics sampled from 9127 (9212) to 9127 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16
Scan time: 3.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4115.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5 ( 728) 4941 822.7 0
CCDS75287.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5 ( 716) 4809 801.0 0
CCDS78047.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5 ( 573) 3881 648.7 7e-186
CCDS58033.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 ( 736) 1779 304.0 5.4e-82
CCDS72931.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 ( 746) 1779 304.0 5.4e-82
CCDS1097.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 ( 759) 1779 304.0 5.5e-82
CCDS72932.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 ( 633) 1708 292.3 1.5e-78
CCDS60285.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 ( 551) 1365 236.0 1.2e-61
CCDS9703.1 TRIM9 gene_id:114088|Hs108|chr14 ( 710) 610 112.2 2.8e-24
CCDS45105.1 TRIM9 gene_id:114088|Hs108|chr14 ( 550) 599 110.3 8.1e-24
CCDS14138.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX ( 667) 570 105.6 2.5e-22
CCDS14533.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX ( 705) 558 103.7 1e-21
CCDS14532.2 MID2 gene_id:11043|Hs108|chrX ( 735) 558 103.7 1.1e-21
CCDS73048.1 TRIM67 gene_id:440730|Hs108|chr1 ( 721) 429 82.5 2.5e-15
CCDS44333.1 TRIM67 gene_id:440730|Hs108|chr1 ( 783) 429 82.6 2.6e-15
CCDS6765.3 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9 ( 497) 409 79.1 1.8e-14
CCDS47999.1 FSD1L gene_id:83856|Hs108|chr9 ( 530) 399 77.5 5.9e-14
CCDS6185.1 TRIM55 gene_id:84675|Hs108|chr8 ( 452) 382 74.6 3.6e-13
CCDS6187.1 TRIM55 gene_id:84675|Hs108|chr8 ( 540) 382 74.7 4.1e-13
CCDS6184.1 TRIM55 gene_id:84675|Hs108|chr8 ( 548) 382 74.7 4.2e-13
CCDS1746.2 TRIM54 gene_id:57159|Hs108|chr2 ( 358) 367 72.1 1.7e-12
CCDS75952.1 MID1 gene_id:4281|Hs108|chrX ( 540) 357 70.6 7.1e-12
CCDS273.1 TRIM63 gene_id:84676|Hs108|chr1 ( 353) 334 66.7 7.1e-11
>>CCDS4115.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5 (728 aa)
initn: 4941 init1: 4941 opt: 4941 Z-score: 4389.0 bits: 822.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4941; 99.9% identity (100.0% similar) in 728 aa overlap (1-728:1-728)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LLTLDDSFNDVGSDNSNQSSPRLRLPSPSMDKIDRINRPGWKRNSLTPRTTVFPCPGCEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LLTLDDSFNDVGSDNSNQSSPRLRLPSPSMDKIDRINRPGWKRNSLTPRTTVFPCPGCEH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 HANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 THFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLLENNGLVGYAQEVLKETD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 THFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLLENNGLVGYAQEVLKETD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 QSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFFSSGIDVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFFSSGIDVP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 EINEEQSKVYNNALINWHHPEKDKADSYVLEYRKINRDDEMSWNEIEVCGTSKIIQDLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 EINEEQSKVYNNALINWHHPEKDKADSYVLEYRKINRDDEMSWNEIEVCGTSKIIQDLEN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 SSTYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SSTYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 AGFNLLLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVKVGVASSDKLQEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 AGFNLLLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVKVGVASSDKLQEW
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENRVL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 PMPTSIGIFLDCDKGKVNFYDMDQMKCLYERQVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAK
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PMPTSIGIFLDCDKGKVDFYDMDQMKCLYERQVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAK
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 YLEYQEDM
::::::::
CCDS41 YLEYQEDM
>>CCDS75287.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5 (716 aa)
initn: 4809 init1: 4809 opt: 4809 Z-score: 4272.0 bits: 801.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4809; 99.9% identity (100.0% similar) in 707 aa overlap (22-728:10-716)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MEGDGSDSPVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LLTLDDSFNDVGSDNSNQSSPRLRLPSPSMDKIDRINRPGWKRNSLTPRTTVFPCPGCEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LLTLDDSFNDVGSDNSNQSSPRLRLPSPSMDKIDRINRPGWKRNSLTPRTTVFPCPGCEH
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 DVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCN
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGN
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 HANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 THFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLLENNGLVGYAQEVLKETD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 THFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLLENNGLVGYAQEVLKETD
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 QSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFFSSGIDVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 QSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFFSSGIDVP
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 EINEEQSKVYNNALINWHHPEKDKADSYVLEYRKINRDDEMSWNEIEVCGTSKIIQDLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EINEEQSKVYNNALINWHHPEKDKADSYVLEYRKINRDDEMSWNEIEVCGTSKIIQDLEN
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 SSTYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SSTYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESR
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 AGFNLLLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVKVGVASSDKLQEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AGFNLLLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVKVGVASSDKLQEW
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENRVL
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 PMPTSIGIFLDCDKGKVNFYDMDQMKCLYERQVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAK
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PMPTSIGIFLDCDKGKVDFYDMDQMKCLYERQVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAK
650 660 670 680 690 700
pF1KE4 YLEYQEDM
::::::::
CCDS75 YLEYQEDM
710
>>CCDS78047.1 TRIM36 gene_id:55521|Hs108|chr5 (573 aa)
initn: 3881 init1: 3881 opt: 3881 Z-score: 3450.6 bits: 648.7 E(32554): 7e-186
Smith-Waterman score: 3881; 99.8% identity (100.0% similar) in 573 aa overlap (156-728:1-573)
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCNECFKI
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCNECFKI
10 20 30
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 HHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGNHANHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 HHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGNHANHR
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 VTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAITHFEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAITHFEK
100 110 120 130 140 150
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLLENNGLVGYAQEVLKETDQSCFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLLENNGLVGYAQEVLKETDQSCFV
160 170 180 190 200 210
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 QTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFFSSGIDVPEINEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 QTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFFSSGIDVPEINEE
220 230 240 250 260 270
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 QSKVYNNALINWHHPEKDKADSYVLEYRKINRDDEMSWNEIEVCGTSKIIQDLENSSTYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 QSKVYNNALINWHHPEKDKADSYVLEYRKINRDDEMSWNEIEVCGTSKIIQDLENSSTYA
280 290 300 310 320 330
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 FRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 FRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNL
340 350 360 370 380 390
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 LLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVKVGVASSDKLQEWLRSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVKVGVASSDKLQEWLRSPR
400 410 420 430 440 450
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 DAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENRVLPMPTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENRVLPMPTS
460 470 480 490 500 510
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 IGIFLDCDKGKVNFYDMDQMKCLYERQVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAKYLEYQ
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 IGIFLDCDKGKVDFYDMDQMKCLYERQVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAKYLEYQ
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 EDM
:::
CCDS78 EDM
>>CCDS58033.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 (736 aa)
initn: 1457 init1: 626 opt: 1779 Z-score: 1585.6 bits: 304.0 E(32554): 5.4e-82
Smith-Waterman score: 2102; 42.8% identity (75.3% similar) in 726 aa overlap (24-720:1-722)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
.::.:.::.::.:.:.. .::.::: :..:. :..:.
CCDS58 MKNMEKELLCPVCQEMYKQPLVLPCTHNVCQACAREV
10 20 30
70 80 90 100
pF1KE4 LLTLDDSFNDVGSDNSNQ-----SSPRLRLPS------PSMDKIDRINR------PGWKR
: .... :.: :.. :.: : : :. :..::. . :: ::
CCDS58 L--GQQGYIGHGGDPSSEPTSPASTPSTRSPRLSRRTLPKPDRLDRLLKSGFGTYPGRKR
40 50 60 70 80 90
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 NSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPP
..: :.. .::::.:. ::.:::::. :::::.::: .::::::.. .. ::.:.:::::
CCDS58 GALHPQVIMFPCPACQGDVELGERGLAGLFRNLTLERVVERYRQSVSVGGAILCQLCKPP
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 PQESTKSCMDCSASYCNECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMY
: :.::.: .: :..::::::. ::::: ::::: . :: .:::: ::::.:. :... :
CCDS58 PLEATKGCTECRATFCNECFKLFHPWGTQKAQHEPTLPTLSFRPKGLMCPDHK-EEVTHY
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 CELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNL
:. :.: ::.::.. .:..:..: . :::..::.::.:.. :..:... :..:: ::.
CCDS58 CKTCQRLVCQLCRVRRTHSGHKITPVLSAYQALKDKLTKSLTYILGNQDTVQTQICELEE
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 LMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLL
...:: .:..::::. . : ::::...:.:.::. .. :: ....:..:...::
CCDS58 AVRHTEVSGQQAKEEVSQLVRGLGAVLEEKRASLLQAIEECQQERLARLSAQIQEHRSLL
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 ENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQ
...::::::::::::::: ::::.::::: :: .:::.:..:::::..::. ......
CCDS58 DGSGLVGYAQEVLKETDQPCFVQAAKQLHNRIARATEALQTFRPAASSSFRHCQLDVGRE
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450
pF1KE4 TELLGELSFFSSGIDVPEINEEQSKVYNNALINWH-HPEKDKADSYVLEYRKIN---RDD
.:: ::.:. ..: :. ... .:.. .. :. :.. : :..:.:. . .
CCDS58 MKLLTELNFLRVP-EAPVIDTQRTFAYDQIFLCWRLPPHSPPAWHYTVEFRRTDVPAQPG
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 EMSWNEIE-VCGTSKIIQDLENSSTYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFD
:.. : : ::: .... ...:.:..:::. . . . :... ::::::::. :..:
CCDS58 PTRWQRREEVRGTSALLENPDTGSVYVLRVRGCNKAGYGEYSEDVHLHTPPAPVLHFFLD
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 EKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNLLLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAF
. : . :.: .. . :.: :. :::::.:. .: . :.: ..::...:.:. .::
CCDS58 SRWGASRERLAISKDQRAVRSVPGLPLLLAADRLLTGCHLSVDVVLGDVAVTQGRSYWAC
520 530 540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 RVEPYSYLVKVGVASSDKLQEWLRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTI
:.: ::::::::. .:::: ... :..::::. :::::::.::: ..: ::...::
CCDS58 AVDPASYLVKVGVGLESKLQESFQGAPDVISPRYDPDSGHDSGAEDATVEASPPFAFLTI
580 590 600 610 620 630
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 GMQKFFIPKSPTSSNEPENR-------VLPMPTSIGIFLDCDKGKVNFYDMDQMKCLYER
:: :... .. .:. .: ..:.: .:: :: ..:.:.: : ... : :
CCDS58 GMGKILLGSGASSNAGLTGRDGPTAGCTVPLPPRLGICLDYERGRVSFLDAVSFRGLLEC
640 650 660 670 680 690
700 710 720
pF1KE4 QVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAKYLEYQEDM
.::: . ::: ..:.:..::.::. .:
CCDS58 PLDCSGPVCPAFCFIGGGAVQLQEPVGTKPERKVTIGGFAKLD
700 710 720 730
>>CCDS72931.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 (746 aa)
initn: 1457 init1: 626 opt: 1779 Z-score: 1585.5 bits: 304.0 E(32554): 5.4e-82
Smith-Waterman score: 2109; 42.7% identity (75.3% similar) in 730 aa overlap (20-720:7-732)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
: ...::.:.::.::.:.:.. .::.::: :..:. :..:.
CCDS72 MGAKGNGLTSMKNMEKELLCPVCQEMYKQPLVLPCTHNVCQACAREV
10 20 30 40
70 80 90 100
pF1KE4 LLTLDDSFNDVGSDNSNQ-----SSPRLRLPS------PSMDKIDRINR------PGWKR
: .... :.: :.. :.: : : :. :..::. . :: ::
CCDS72 LG--QQGYIGHGGDPSSEPTSPASTPSTRSPRLSRRTLPKPDRLDRLLKSGFGTYPGRKR
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 NSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPP
..: :.. .::::.:. ::.:::::. :::::.::: .::::::.. .. ::.:.:::::
CCDS72 GALHPQVIMFPCPACQGDVELGERGLAGLFRNLTLERVVERYRQSVSVGGAILCQLCKPP
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 PQESTKSCMDCSASYCNECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMY
: :.::.: .: :..::::::. ::::: ::::: . :: .:::: ::::.:. :... :
CCDS72 PLEATKGCTECRATFCNECFKLFHPWGTQKAQHEPTLPTLSFRPKGLMCPDHK-EEVTHY
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 CELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNL
:. :.: ::.::.. .:..:..: . :::..::.::.:.. :..:... :..:: ::.
CCDS72 CKTCQRLVCQLCRVRRTHSGHKITPVLSAYQALKDKLTKSLTYILGNQDTVQTQICELEE
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 LMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLL
...:: .:..::::. . : ::::...:.:.::. .. :: ....:..:...::
CCDS72 AVRHTEVSGQQAKEEVSQLVRGLGAVLEEKRASLLQAIEECQQERLARLSAQIQEHRSLL
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 ENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQ
...::::::::::::::: ::::.::::: :: .:::.:..:::::..::. ......
CCDS72 DGSGLVGYAQEVLKETDQPCFVQAAKQLHNRIARATEALQTFRPAASSSFRHCQLDVGRE
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KE4 TELLGELSFFSSGIDVPEINEEQSKVYNNALINWH-HPEKDKADSYVLEYRKIN---RDD
.:: ::.:. ..: :. ... .:.. .. :. :.. : :..:.:. . .
CCDS72 MKLLTELNFLRVP-EAPVIDTQRTFAYDQIFLCWRLPPHSPPAWHYTVEFRRTDVPAQPG
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 EMSWNEIE-VCGTSKIIQDLENSSTYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFD
:.. : : ::: .... ...:.:..:::. . . . :... ::::::::. :..:
CCDS72 PTRWQRREEVRGTSALLENPDTGSVYVLRVRGCNKAGYGEYSEDVHLHTPPAPVLHFFLD
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 EKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNLLLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAF
. : . :.: .. . :.: :. :::::.:. .: . :.: ..::...:.:. .::
CCDS72 SRWGASRERLAISKDQRAVRSVPGLPLLLAADRLLTGCHLSVDVVLGDVAVTQGRSYWAC
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 RVEPYSYLVKVGVASSDKLQEWLRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTI
:.: ::::::::. .:::: ... :..::::. :::::::.::: ..: ::...::
CCDS72 AVDPASYLVKVGVGLESKLQESFQGAPDVISPRYDPDSGHDSGAEDATVEASPPFAFLTI
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 GMQKFFIPKSPTSSNEPENR-------VLPMPTSIGIFLDCDKGKVNFYDMDQMKCLYER
:: :... .. .:. .: ..:.: .:: :: ..:.:.: : ... : :
CCDS72 GMGKILLGSGASSNAGLTGRDGPTAGCTVPLPPRLGICLDYERGRVSFLDAVSFRGLLEC
650 660 670 680 690 700
700 710 720
pF1KE4 QVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAKYLEYQEDM
.::: . ::: ..:.:..::.::. .:
CCDS72 PLDCSGPVCPAFCFIGGGAVQLQEPVGTKPERKVTIGGFAKLD
710 720 730 740
>>CCDS1097.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 (759 aa)
initn: 1474 init1: 626 opt: 1779 Z-score: 1585.4 bits: 304.0 E(32554): 5.5e-82
Smith-Waterman score: 2140; 42.3% identity (75.3% similar) in 749 aa overlap (1-720:1-745)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
:.:. .:. : ::. ... ....::.:.::.::.:.:.. .::.::: :..:. :..:.
CCDS10 MAEGEDMQTFTSIMDALVRISTSMKNMEKELLCPVCQEMYKQPLVLPCTHNVCQACAREV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KE4 LLTLDDSFNDVGSDNSNQ-----SSPRLRLPS------PSMDKIDRINR------PGWKR
: .... :.: :.. :.: : : :. :..::. . :: ::
CCDS10 LG--QQGYIGHGGDPSSEPTSPASTPSTRSPRLSRRTLPKPDRLDRLLKSGFGTYPGRKR
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 NSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPP
..: :.. .::::.:. ::.:::::. :::::.::: .::::::.. .. ::.:.:::::
CCDS10 GALHPQVIMFPCPACQGDVELGERGLAGLFRNLTLERVVERYRQSVSVGGAILCQLCKPP
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 PQESTKSCMDCSASYCNECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMY
: :.::.: .: :..::::::. ::::: ::::: . :: .:::: ::::.:. :... :
CCDS10 PLEATKGCTECRATFCNECFKLFHPWGTQKAQHEPTLPTLSFRPKGLMCPDHK-EEVTHY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 CELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNL
:. :.: ::.::.. .:..:..: . :::..::.::.:.. :..:... :..:: ::.
CCDS10 CKTCQRLVCQLCRVRRTHSGHKITPVLSAYQALKDKLTKSLTYILGNQDTVQTQICELEE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 LMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLL
...:: .:..::::. . : ::::...:.:.::. .. :: ....:..:...::
CCDS10 AVRHTEVSGQQAKEEVSQLVRGLGAVLEEKRASLLQAIEECQQERLARLSAQIQEHRSLL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 ENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQ
...::::::::::::::: ::::.::::: :: .:::.:..:::::..::. ......
CCDS10 DGSGLVGYAQEVLKETDQPCFVQAAKQLHNRIARATEALQTFRPAASSSFRHCQLDVGRE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KE4 TELLGELSFFSSGIDVPEINEEQSKVYNNALINWH-HPEKDKADSYVLEYRKIN---RDD
.:: ::.:. ..: :. ... .:.. .. :. :.. : :..:.:. . .
CCDS10 MKLLTELNFLRVP-EAPVIDTQRTFAYDQIFLCWRLPPHSPPAWHYTVEFRRTDVPAQPG
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 EMSWNEIE-VCGTSKIIQDLENSSTYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFD
:.. : : ::: .... ...:.:..:::. . . . :... ::::::::. :..:
CCDS10 PTRWQRREEVRGTSALLENPDTGSVYVLRVRGCNKAGYGEYSEDVHLHTPPAPVLHFFLD
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 EKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNLLLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAF
. : . :.: .. . :.: :. :::::.:. .: . :.: ..::...:.:. .::
CCDS10 SRWGASRERLAISKDQRAVRSVPGLPLLLAADRLLTGCHLSVDVVLGDVAVTQGRSYWAC
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 RVEPYSYLVKVGVASSDKLQEWLRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTI
:.: ::::::::. .:::: ... :..::::. :::::::.::: ..: ::...::
CCDS10 AVDPASYLVKVGVGLESKLQESFQGAPDVISPRYDPDSGHDSGAEDATVEASPPFAFLTI
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KE4 GMQKFFIPKSPTSSNEPENR-------VLPMPTSIGIFLDCDKGKVNFYDMDQMKCLYER
:: :... .. .:. .: ..:.: .:: :: ..:.:.: : ... : :
CCDS10 GMGKILLGSGASSNAGLTGRDGPTAGCTVPLPPRLGICLDYERGRVSFLDAVSFRGLLEC
660 670 680 690 700 710
700 710 720
pF1KE4 QVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAKYLEYQEDM
.::: . ::: ..:.:..::.::. .:
CCDS10 PLDCSGPVCPAFCFIGGGAVQLQEPVGTKPERKVTIGGFAKLD
720 730 740 750
>>CCDS72932.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 (633 aa)
initn: 1281 init1: 626 opt: 1708 Z-score: 1523.5 bits: 292.3 E(32554): 1.5e-78
Smith-Waterman score: 1868; 44.3% identity (77.0% similar) in 621 aa overlap (112-720:1-619)
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 RLRLPSPSMDKIDRINRPGWKRNSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETI
.::::.:. ::.:::::. :::::.::: .
CCDS72 MFPCPACQGDVELGERGLAGLFRNLTLERV
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 VERYRQAARAATAIMCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCNECFKIHHPWGTIKAQHEYVGP
::::::.. .. ::.:.:::::: :.::.: .: :..::::::. ::::: ::::: . :
CCDS72 VERYRQSVSVGGAILCQLCKPPPLEATKGCTECRATFCNECFKLFHPWGTQKAQHEPTLP
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 TTNFRPKILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYKTLKEKLS
: .:::: ::::.:. :... ::. :.: ::.::.. .:..:..: . :::..::.::.
CCDS72 TLSFRPKGLMCPDHK-EEVTHYCKTCQRLVCQLCRVRRTHSGHKITPVLSAYQALKDKLT
100 110 120 130 140
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 KDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERKSSVLKAI
:.. :..:... :..:: ::. ...:: .:..::::. . : ::::...:.:.::
CCDS72 KSLTYILGNQDTVQTQICELEEAVRHTEVSGQQAKEEVSQLVRGLGAVLEEKRASLLQAI
150 160 170 180 190 200
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 DSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLLENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHLRIQKATES
. .. :: ....:..:...::...::::::::::::::: ::::.::::: :: .:::.
CCDS72 EECQQERLARLSAQIQEHRSLLDGSGLVGYAQEVLKETDQPCFVQAAKQLHNRIARATEA
210 220 230 240 250 260
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 LKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFFSSGIDVPEINEEQSKVYNNALINWH-HP
:..:::::..::. ...... .:: ::.:. ..: :. ... .:.. .. :. :
CCDS72 LQTFRPAASSSFRHCQLDVGREMKLLTELNFLRVP-EAPVIDTQRTFAYDQIFLCWRLPP
270 280 290 300 310 320
450 460 470 480 490
pF1KE4 EKDKADSYVLEYRKIN---RDDEMSWNEIE-VCGTSKIIQDLENSSTYAFRVRAYKGSIC
.. : :..:.:. . . :.. : : ::: .... ...:.:..:::. . .
CCDS72 HSPPAWHYTVEFRRTDVPAQPGPTRWQRREEVRGTSALLENPDTGSVYVLRVRGCNKAGY
330 340 350 360 370 380
500 510 520 530 540 550
pF1KE4 SPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNLLLAAERIQVGY
. :... ::::::::. :..: . : . :.: .. . :.: :. :::::.:. .:
CCDS72 GEYSEDVHLHTPPAPVLHFFLDSRWGASRERLAISKDQRAVRSVPGLPLLLAADRLLTGC
390 400 410 420 430 440
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 YTSLDYIIGDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVKVGVASSDKLQEWLRSPRDAVSPRYEQDS
. :.: ..::...:.:. .:: :.: ::::::::. .:::: ... :..::::. ::
CCDS72 HLSVDVVLGDVAVTQGRSYWACAVDPASYLVKVGVGLESKLQESFQGAPDVISPRYDPDS
450 460 470 480 490 500
620 630 640 650 660
pF1KE4 GHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENR-------VLPMPTSIGIF
:::::.::: ..: ::...:::: :... .. .:. .: ..:.: .::
CCDS72 GHDSGAEDATVEASPPFAFLTIGMGKILLGSGASSNAGLTGRDGPTAGCTVPLPPRLGIC
510 520 530 540 550 560
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 LDCDKGKVNFYDMDQMKCLYERQVDCSHTLYPAFALMGSGGIQLEEPITAKYLEYQEDM
:: ..:.:.: : ... : : .::: . ::: ..:.:..::.::. .:
CCDS72 LDYERGRVSFLDAVSFRGLLECPLDCSGPVCPAFCFIGGGAVQLQEPVGTKPERKVTIGG
570 580 590 600 610 620
CCDS72 FAKLD
630
>>CCDS60285.1 TRIM46 gene_id:80128|Hs108|chr1 (551 aa)
initn: 1483 init1: 617 opt: 1365 Z-score: 1220.2 bits: 236.0 E(32554): 1.2e-61
Smith-Waterman score: 1566; 43.0% identity (76.5% similar) in 533 aa overlap (1-511:1-529)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
:.:. .:. : ::. ... ....::.:.::.::.:.:.. .::.::: :..:. :..:.
CCDS60 MAEGEDMQTFTSIMDALVRISTSMKNMEKELLCPVCQEMYKQPLVLPCTHNVCQACAREV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KE4 LLTLDDSFNDVGSDNSNQ-----SSPRLRLPS------PSMDKIDRINR------PGWKR
: .... :.: :.. :.: : : :. :..::. . :: ::
CCDS60 L--GQQGYIGHGGDPSSEPTSPASTPSTRSPRLSRRTLPKPDRLDRLLKSGFGTYPGRKR
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 NSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETIVERYRQAARAATAIMCDLCKPP
..: :.. .::::.:. ::.:::::. :::::.::: .::::::.. .. ::.:.:::::
CCDS60 GALHPQVIMFPCPACQGDVELGERGLAGLFRNLTLERVVERYRQSVSVGGAILCQLCKPP
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 PQESTKSCMDCSASYCNECFKIHHPWGTIKAQHEYVGPTTNFRPKILMCPEHETERINMY
: :.::.: .: :..::::::. ::::: ::::: . :: .:::: ::::.:. :... :
CCDS60 PLEATKGCTECRATFCNECFKLFHPWGTQKAQHEPTLPTLSFRPKGLMCPDHK-EEVTHY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 CELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYKTLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNL
:. :.: ::.::.. .:..:..: . :::..::.::.:.. :..:... :..:: ::.
CCDS60 CKTCQRLVCQLCRVRRTHSGHKITPVLSAYQALKDKLTKSLTYILGNQDTVQTQICELEE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 LMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERKSSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQGLL
...:: .:..::::. . : ::::...:.:.::. .. :: ....:..:...::
CCDS60 AVRHTEVSGQQAKEEVSQLVRGLGAVLEEKRASLLQAIEECQQERLARLSAQIQEHRSLL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 ENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHLRIQKATESLKSFRPAAQTSFEDYVVNTSKQ
...::::::::::::::: ::::.::::: :: .:::.:..:::::..::. ......
CCDS60 DGSGLVGYAQEVLKETDQPCFVQAAKQLHNRIARATEALQTFRPAASSSFRHCQLDVGRE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KE4 TELLGELSFFSSGIDVPEINEEQSKVYNNALINWH-HPEKDKADSYVLEYRKIN---RDD
.:: ::.:. ..: :. ... .:.. .. :. :.. : :..:.:. . .
CCDS60 MKLLTELNFLRVP-EAPVIDTQRTFAYDQIFLCWRLPPHSPPAWHYTVEFRRTDVPAQPG
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 EMSWNEIE-VCGTSKIIQDLENSSTYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFD
:.. : : ::: .... ...:.:..:::. . . . :... :::::::
CCDS60 PTRWQRREEVRGTSALLENPDTGSVYVLRVRGCNKAGYGEYSEDVHLHTPPAPGIQNLAR
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 EKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAGFNLLLAAERIQVGYYTSLDYIIGDTGITKGKHFWAF
CCDS60 RGGACLQFQLLGRLR
540 550
>>CCDS9703.1 TRIM9 gene_id:114088|Hs108|chr14 (710 aa)
initn: 595 init1: 223 opt: 610 Z-score: 549.4 bits: 112.2 E(32554): 2.8e-24
Smith-Waterman score: 748; 25.9% identity (56.2% similar) in 644 aa overlap (24-606:1-613)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
....:.:: ::.: .. .:.::::.:..:. :....
CCDS97 MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNI
10 20 30
70 80
pF1KE4 L------------------------LTLD--------DS-FNDVGSDNSNQSSPRLRLPS
: : :: :: ... :. : ..: . :.
CCDS97 LVQTPESESPQSHRAAGSGVSDYDYLDLDKMSLYSEADSGYGSYGGFASAPTTPCQKSPN
40 50 60 70 80 90
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 ------PSMDKIDRINRPGWKRNSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETI
:.: :. . .::.. . :: :.... : .::. :. .: .:: .
CCDS97 GVRVFPPAMPPPATHLSPAL---APVPRNSCITCPQCHRSLILDDRGLRGFPKNRVLEGV
100 110 120 130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 VERYRQAARAATAIMCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCNEC-FKIHHPWGTIKAQHEYVG
..::.:. :.:. :.::. :.:.: : .:.. ::. : .. : : : . :.:. :
CCDS97 IDRYQQSK--AAALKCQLCEKAPKEATVMCEQCDVFYCDPCRLRCHPPRGPL-AKHRLVP
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250
pF1KE4 P-----TTNFRP-KILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYK
: . . : :. : .:: : .::: :. :::. : :.:..:.: .... .:
CCDS97 PAQGRVSRRLSPRKVSTCTDHELENHSMYCVQCKMPVCYQCLEEGKHSSHEVKALGAMWK
220 230 240 250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 TLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERK
: .::. .. : . ...: . .: .... . :. . . ... . :...:..::
CCDS97 LHKSQLSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRNMVQQIQENSVEFEACLVAQCDALIDALNRRK
280 290 300 310 320 330
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 SSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQ-GLLENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHL
...: ... .. .: . :. . : ...::. : ::.::.: : :.: . :
CCDS97 AQLLARVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKLRQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIR
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420
pF1KE4 RIQKATESLK--SFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFF----SSGIDV-PEINEEQ
:.. . .. .. : :.: : ...: . . .:.: :: . . : .. :.
CCDS97 RVHLTEDQWGKGTLTPRMTTDF-DLSLDNSPLLQSIHQLDFVQVKASSPVPATPILQLEE
400 410 420 430 440 450
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 SKVYNN-ALINWHHPEKDK--ADSYVLEYRKINRDDEMSWNEIEVCG-TSKIIQDLENSS
..:: : ..:..: . ::.:.:: .. . .. :. : : .. :. .:
CCDS97 CCTHNNSATLSWKQPPLSTVPADGYILE---LDDGNGGQFREVYVGKETMCTVDGLHFNS
460 470 480 490 500
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 TYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAG
:: ::.:.. . :: :. :.:.: . : : :: ....
CCDS97 TYNARVKAFNKTGVSPYSKTLVLQT--SEVAWFAFDPGSAHSD-----------------
510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE4 FNLLLAAERIQVGYYTSLDYII-GDTGITKGKHFWAFRVEPYSYLVK--VGVASSDKLQE
..:. . . : . : .. : ::..:: :.: . :. :. ::: : ...
CCDS97 --IILSNDNLTVTCSSYDDRVVLGKTGFSKGIHYWELTVDRYDNHPDPAFGVARMDVMKD
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 WLRSPRDAVSPRYEQDSGHDSGSEDACFDSSQPFTLVTIGMQKFFIPKSPTSSNEPENRV
. . :
CCDS97 VMLGKDDKAWAMYVDNNRSWFMHNNSHTNRTEGGITKGATIGVLLDLNRKNLTFFINDEQ
610 620 630 640 650 660
>>CCDS45105.1 TRIM9 gene_id:114088|Hs108|chr14 (550 aa)
initn: 595 init1: 223 opt: 599 Z-score: 541.1 bits: 110.3 E(32554): 8.1e-24
Smith-Waterman score: 703; 26.9% identity (58.5% similar) in 542 aa overlap (24-507:1-532)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MSESGEMSEFGYIMELIAKGKVTIKNIERELICPACKELFTHPLILPCQHSICHKCVKEL
....:.:: ::.: .. .:.::::.:..:. :....
CCDS45 MEEMEEELKCPVCGSFYREPIILPCSHNLCQACARNI
10 20 30
70 80
pF1KE4 L------------------------LTLD--------DS-FNDVGSDNSNQSSPRLRLPS
: : :: :: ... :. : ..: . :.
CCDS45 LVQTPESESPQSHRAAGSGVSDYDYLDLDKMSLYSEADSGYGSYGGFASAPTTPCQKSPN
40 50 60 70 80 90
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 ------PSMDKIDRINRPGWKRNSLTPRTTVFPCPGCEHDVDLGERGINGLFRNFTLETI
:.: :. . .::.. . :: :.... : .::. :. .: .:: .
CCDS45 GVRVFPPAMPPPATHLSPAL---APVPRNSCITCPQCHRSLILDDRGLRGFPKNRVLEGV
100 110 120 130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 VERYRQAARAATAIMCDLCKPPPQESTKSCMDCSASYCNEC-FKIHHPWGTIKAQHEYVG
..::.:. :.:. :.::. :.:.: : .:.. ::. : .. : : : . :.:. :
CCDS45 IDRYQQSK--AAALKCQLCEKAPKEATVMCEQCDVFYCDPCRLRCHPPRGPL-AKHRLVP
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250
pF1KE4 P-----TTNFRP-KILMCPEHETERINMYCELCRRPVCHLCKLGGNHANHRVTTMSSAYK
: . . : :. : .:: : .::: :. :::. : :.:..:.: .... .:
CCDS45 PAQGRVSRRLSPRKVSTCTDHELENHSMYCVQCKMPVCYQCLEEGKHSSHEVKALGAMWK
220 230 240 250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 TLKEKLSKDIDYLIGKESQVKSQISELNLLMKETECNGERAKEEAITHFEKLFEVLEERK
: .::. .. : . ...: . .: .... . :. . . ... . :...:..::
CCDS45 LHKSQLSQALNGLSDRAKEAKEFLVQLRNMVQQIQENSVEFEACLVAQCDALIDALNRRK
280 290 300 310 320 330
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 SSVLKAIDSSKKLRLDKFQTQMEEYQ-GLLENNGLVGYAQEVLKETDQSCFVQTAKQLHL
...: ... .. .: . :. . : ...::. : ::.::.: : :.: . :
CCDS45 AQLLARVNKEHEHKLKVVRDQISHCTVKLRQTTGLMEYCLEVIKENDPSGFLQISDALIR
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420
pF1KE4 RIQKATESLK--SFRPAAQTSFEDYVVNTSKQTELLGELSFF----SSGIDV-PEINEEQ
:.. . .. .. : :.: : ...: . . .:.: :: . . : .. :.
CCDS45 RVHLTEDQWGKGTLTPRMTTDF-DLSLDNSPLLQSIHQLDFVQVKASSPVPATPILQLEE
400 410 420 430 440 450
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 SKVYNN-ALINWHHPEKDK--ADSYVLEYRKINRDDEMSWNEIEVCG-TSKIIQDLENSS
..:: : ..:..: . ::.:.:: .. . .. :. : : .. :. .:
CCDS45 CCTHNNSATLSWKQPPLSTVPADGYILE---LDDGNGGQFREVYVGKETMCTVDGLHFNS
460 470 480 490 500
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 TYAFRVRAYKGSICSPCSRELILHTPPAPVFSFLFDEKCGYNNEHLLLNLKRDRVESRAG
:: ::.:.. . :: :. :.:.:
CCDS45 TYNARVKAFNKTGVSPYSKTLVLQTSEGKALQQYPSERELRGI
510 520 530 540 550
728 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 16:40:55 2016 done: Mon Nov 7 16:40:56 2016
Total Scan time: 3.710 Total Display time: 0.170
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]