Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4183
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4183, 655 aa
1>>>pF1KE4183 655 - 655 aa - 655 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5123+/-0.000952; mu= 9.9331+/- 0.057
mean_var=142.9875+/-28.330, 0's: 0 Z-trim(109.9): 85 B-trim: 104 in 1/50
Lambda= 0.107257
statistics sampled from 11099 (11189) to 11099 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.344), width: 16
Scan time: 3.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 4336 683.0 3.6e-196
CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 3248 514.6 1.7e-145
CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 2757 438.6 1.2e-122
CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 2487 396.8 4.8e-110
CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 769 130.9 4.1e-30
CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 741 126.8 1.3e-28
CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 715 122.7 2.1e-27
CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 666 115.0 2.9e-25
CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 654 113.1 9.5e-25
CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 652 112.8 1.1e-24
CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 647 112.0 2e-24
CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 636 110.3 6.4e-24
CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 568 99.8 9.1e-21
CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 540 95.5 1.9e-19
CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 519 92.2 1.8e-18
CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 506 90.3 9.1e-18
CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 504 89.9 9.5e-18
CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 505 90.1 9.6e-18
CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 490 87.8 4.3e-17
CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 457 82.6 1.2e-15
CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 428 78.1 3e-14
CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 398 73.5 8.1e-13
CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 393 72.7 1.2e-12
CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 384 71.4 3.6e-12
CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 368 68.9 2.1e-11
>>CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 (655 aa)
initn: 4336 init1: 4336 opt: 4336 Z-score: 3635.4 bits: 683.0 E(32554): 3.6e-196
Smith-Waterman score: 4336; 100.0% identity (100.0% similar) in 655 aa overlap (1-655:1-655)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVANCPMPLAPADKNKRQDELIVLNVSGRRFQTWRTTLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVANCPMPLAPADKNKRQDELIVLNVSGRRFQTWRTTLER
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 YPDTLLGSTEKEFFFNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTGKLHYPRYECISAYDDELAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 YPDTLLGSTEKEFFFNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTGKLHYPRYECISAYDDELAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YGILPEIIGDCCYEEYKDRKRENAERLMDDNDSENNQESMPSLSFRQTMWRAFENPHTST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 YGILPEIIGDCCYEEYKDRKRENAERLMDDNDSENNQESMPSLSFRQTMWRAFENPHTST
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVPCGTVPGSKELPCGERYSVAFFCLDTACVMIFTVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 LALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVPCGTVPGSKELPCGERYSVAFFCLDTACVMIFTVE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 YLLRLFAAPSRYRFIRSVMSIIDVVAIMPYYIGLVMTNNEDVSGAFVTLRVFRVFRIFKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 YLLRLFAAPSRYRFIRSVMSIIDVVAIMPYYIGLVMTNNEDVSGAFVTLRVFRVFRIFKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 SRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSIPASFWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSIPASFWY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 TIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 AQKKARLARIRVAKTGSSNAYLHSKRNGLLNEALELTGTPEEEHMGKTTSLIESQHHHLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 AQKKARLARIRVAKTGSSNAYLHSKRNGLLNEALELTGTPEEEHMGKTTSLIESQHHHLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 HCLEKTTGLSYLVDDPLLSVRTSTIKNHEFIDEQMFEQNCMESSMQNYPSTRSPSLSSHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 HCLEKTTGLSYLVDDPLLSVRTSTIKNHEFIDEQMFEQNCMESSMQNYPSTRSPSLSSHP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 GLTTTCCSRRSKKTTHLPNSNLPATRLRSMQELSTIHIQGSEQPSLTTSRSSLNLKADDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 GLTTTCCSRRSKKTTHLPNSNLPATRLRSMQELSTIHIQGSEQPSLTTSRSSLNLKADDG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KE4 LRPNCKTSQITTAIISIPTPPALTPEGESRPPPASPGPNTNIPSIASNVVKVSAL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 LRPNCKTSQITTAIISIPTPPALTPEGESRPPPASPGPNTNIPSIASNVVKVSAL
610 620 630 640 650
>>CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 (636 aa)
initn: 3237 init1: 3237 opt: 3248 Z-score: 2725.7 bits: 514.6 E(32554): 1.7e-145
Smith-Waterman score: 4173; 97.1% identity (97.1% similar) in 655 aa overlap (1-655:1-636)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVANCPMPLAPADKNKRQDELIVLNVSGRRFQTWRTTLER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVANCPMPLAPADKNKRQDELIVLNVSGRRFQTWRTTLER
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 YPDTLLGSTEKEFFFNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTGKLHYPRYECISAYDDELAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 YPDTLLGSTEKEFFFNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTGKLHYPRYECISAYDDELAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YGILPEIIGDCCYEEYKDRKRENAERLMDDNDSENNQESMPSLSFRQTMWRAFENPHTST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 YGILPEIIGDCCYEEYKDRKRENAERLMDDNDSENNQESMPSLSFRQTMWRAFENPHTST
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVPCGTVPGSKELPCGERYSVAFFCLDTACVMIFTVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 LALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVPCGTVPGSKELPCGERYSVAFFCLDTACVMIFTVE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 YLLRLFAAPSRYRFIRSVMSIIDVVAIMPYYIGLVMTNNEDVSGAFVTLRVFRVFRIFKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 YLLRLFAAPSRYRFIRSVMSIIDVVAIMPYYIGLVMTNNEDVSGAFVTLRVFRVFRIFKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 SRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSIPASFWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSIPASFWY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 TIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 TIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 AQKKARLARIRVAKTGSSNAYLHSKRNGLLNEALELTGTPEEEHMGKTTSLIESQHHHLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 AQKKARLARIRVAKTGSSNAYLHSKRNGLLNEALELTGTPEEEHMGKTTSLIESQHHHLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 HCLEKTTGLSYLVDDPLLSVRTSTIKNHEFIDEQMFEQNCMESSMQNYPSTRSPSLSSHP
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 HCLEKTT-------------------NHEFIDEQMFEQNCMESSMQNYPSTRSPSLSSHP
490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 GLTTTCCSRRSKKTTHLPNSNLPATRLRSMQELSTIHIQGSEQPSLTTSRSSLNLKADDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 GLTTTCCSRRSKKTTHLPNSNLPATRLRSMQELSTIHIQGSEQPSLTTSRSSLNLKADDG
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650
pF1KE4 LRPNCKTSQITTAIISIPTPPALTPEGESRPPPASPGPNTNIPSIASNVVKVSAL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 LRPNCKTSQITTAIISIPTPPALTPEGESRPPPASPGPNTNIPSIASNVVKVSAL
590 600 610 620 630
>>CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 (630 aa)
initn: 2635 init1: 1482 opt: 2757 Z-score: 2315.1 bits: 438.6 E(32554): 1.2e-122
Smith-Waterman score: 3189; 73.8% identity (87.1% similar) in 660 aa overlap (1-655:1-630)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVANCPMPLAPADKNKR-QDELIVLNVSGRRFQTWRTTLE
:::::::::::::::::::::::. ::: : .. :: :: :::::::: :::::. :::
CCDS57 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVASGPMPAPPRQERKRTQDALIVLNVSGTRFQTWQDTLE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 RYPDTLLGSTEKEFFFNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTGKLHYPRYECISAYDDELA
:::::::::.:..::.. .:..:::::::..:: .:::::::::::::.:::::::.:::
CCDS57 RYPDTLLGSSERDFFYHPETQQYFFDRDPDIFRHILNFYRTGKLHYPRHECISAYDEELA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 FYGILPEIIGDCCYEEYKDRKRENAERLMDDNDSENNQES-MPSLSFRQTMWRAFENPHT
:.:..:::::::::::::::.:::::::.:: :... :: .:... :: .:::::::::
CCDS57 FFGLIPEIIGDCCYEEYKDRRRENAERLQDDADTDTAGESALPTMTARQRVWRAFENPHT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 STLALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVPCGTVPGS-KELPCGERYSVAFFCLDTACVMIF
::.:::::::::::::::::.:::::::::. :: :::::::::.::::::::::::::
CCDS57 STMALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETVPCGSSPGHIKELPCGERYAVAFFCLDTACVMIF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 TVEYLLRLFAAPSRYRFIRSVMSIIDVVAIMPYYIGLVMTNNEDVSGAFVTLRVFRVFRI
:::::::: ::::::::.::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS57 TVEYLLRLAAAPSRYRFVRSVMSIIDVVAILPYYIGLVMTDNEDVSGAFVTLRVFRVFRI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 FKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSIPAS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS57 FKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSIPAA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 FWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRAD
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 KRRAQKKARLARIRVAKTGSSNAYLHSKRNGLLNEALELTGTPEEEHMGKTTSLIESQHH
::::::::::::::.::.::.:::..:::::::.. :. .. :. ..:. : .:.:::
CCDS57 KRRAQKKARLARIRAAKSGSANAYMQSKRNGLLSNQLQ-SSEDEQAFVSKSGSSFETQHH
430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 HLLHCLEKTTGLSYLVDDPLLSVRTSTIKNHEFIDEQMFEQNCMESSMQNYPSTRSPSLS
:::::::::: ::::.:::.::..::: . : ::..:::::
CCDS57 HLLHCLEKTT-------------------NHEFVDEQVFEESCMEVATVNRPSSHSPSLS
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 SHPGLTTTCCSRRSKKTTHLPNSNLPATRLRSMQELSTIHIQGSEQPSLTTSRSSLNLKA
:. :.:.:::::: ::: ..::.:. ... :.::::::.:. :. :..:::::: :
CCDS57 SQQGVTSTCCSRRHKKTFRIPNANVSGSHQGSIQELSTIQIRCVERTPLSNSRSSLNAKM
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 DDGLRPNCKTSQITTAIISIPTPPALTPEGESRP--PPASPGPNTNIPSIASNVVKVSAL
.. .. ::. .:::::::::::. ::::..:: : : : :.:.::::
CCDS57 EECVKLNCEQPYVTTAIISIPTPPVTTPEGDDRPESPEYSGG----------NIVRVSAL
590 600 610 620 630
>>CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX (647 aa)
initn: 2673 init1: 1335 opt: 2487 Z-score: 2089.2 bits: 396.8 E(32554): 4.8e-110
Smith-Waterman score: 2711; 63.9% identity (81.4% similar) in 678 aa overlap (1-655:1-647)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVANCPMPLAPADKNKRQDELIVLNVSGRRFQTWRTTLER
::::.:.:::::::::.::.:.:. :.: ::. : .: ::..:.:::::::.::..::.:
CCDS14 MAAGLATWLPFARAAAVGWLPLAQQPLPPAPGVKASRGDEVLVVNVSGRRFETWKNTLDR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 YPDTLLGSTEKEFFFNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTGKLHYPRYECISAYDDELAF
::::::::.:::::.. :. ::::::::..:: ::::::::.:: :: :::.:.:.::::
CCDS14 YPDTLLGSSEKEFFYDADSGEYFFDRDPDMFRHVLNFYRTGRLHCPRQECIQAFDEELAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE4 YGILPEIIGDCCYEEYKDRKRENAERLMDDNDSENNQESMPSL----SFRQTMWRAFENP
::..::..:::: :::.:::.:::::: .:...:. .. :.: :.:: .:::::::
CCDS14 YGLVPELVGDCCLEEYRDRKKENAERLAEDEEAEQAGDG-PALPAGSSLRQRLWRAFENP
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 HTSTLALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVPC-GTVP-GSKELPCGERYSVAFFCLDTACV
:::: :::::::::::::::::.:::::.:: :.. .:.: :::::. ::::.:::::
CCDS14 HTSTAALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETIPCRGSARRSSREQPCGERFPQAFFCMDTACV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 MIFTVEYLLRLFAAPSRYRFIRSVMSIIDVVAIMPYYIGLVMTNNEDVSGAFVTLRVFRV
.::: :::::::::::: ::.:::::.::::::.::::::.. .:.::::::::::::::
CCDS14 LIFTGEYLLRLFAAPSRCRFLRSVMSLIDVVAILPYYIGLLVPKNDDVSGAFVTLRVFRV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 FRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. ..::::
CCDS14 FRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFATVMFYAEKGTNKTNFTSI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 PASFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQ
::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPSTIAGKIFGSICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQ
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 RADKRRAQKKARLARIRVAKTGSSNAYLHSKRNGLLNEALELTGTPEEEHMG-KTTSLIE
::::::::.:.::::::.::.:..::.:. :.:: .:: .:. ::. . .. : .:
CCDS14 RADKRRAQQKVRLARIRLAKSGTTNAFLQYKQNG----GLEDSGSGEEQALCVRNRSAFE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 SQHHHLLHCLEKTTGLSYLVDDPLLSVRTSTIKNHEFIDEQMFEQNCMESSMQNYPSTRS
.::::::::::::: ::: :: : . : . ..::
CCDS14 QQHHHLLHCLEKTT-------------------CHEFTDELTFSEALGAVSPGGR-TSRS
480 490 500 510
540 550 560 570 580
pF1KE4 PSLSSHP----GLTTTCCSRRSKKTT-HLPNSNLPATRLRSMQELSTIHIQGSEQPSLTT
:.::.: .: ..:: ::.:. . .: ::. ..: :::::. . : ..
CCDS14 TSVSSQPVGPGSLLSSCCPRRAKRRAIRLANSTASVSR-GSMQELDML--AGLRRSHAPQ
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630
pF1KE4 SRSSLNLKADDGLRPNCKTSQITTAIISIPTPPALTPEGESRPPPASPGP---------N
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CCDS14 SRSSLNAKPHDSLDLNCDSRDFVAAIISIPTPPANTPD-ESQP--SSPGGGGRAGSTLRN
580 590 600 610 620
640 650
pF1KE4 TNI--PSIASNVVKVSAL
... : . ..::.:.:
CCDS14 SSLGTPCLFPETVKISSL
630 640
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.: .... .:.. ::.::.: : . :
CCDS16 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLS
10 20 30 40
60 70 80 90 100
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CCDS16 QYPETRLAELINCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKK
50 60 70 80 90 100
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: . .:. :. . ... ::: . .....: : .:. :. . . :.
CCDS16 GICPICFKNEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREELEEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWR
110 120 130 140 150 160
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pF1KE4 LSFRQTMWRAFENPHTSTLALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVPC-GTVPGSKELPC-GE
.. .:. .:.:..: : : .. ..: :: . : : ::.: . : :.
CCDS16 -RCQKCVWKFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSV------VMCMGTIPELQVLDAEGN
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CCDS16 RVEHPTLENVETACIGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHL
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pF1KE4 -------EDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAI
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CCDS16 GARMMELTNVQQAVQALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGI
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pF1KE4 IIFATVMFYAEKGSSASKFTSIPASFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGV
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CCDS16 FVFSALGYTMEQSHPETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGV
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pF1KE4 LVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQKKARLARIRVA-----KTGSSNAYLHS-KR
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CCDS16 IAIALPIHPIINNFVR-YYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGGEGKTGGSRSDLDNLPP
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pF1KE4 NGLLNEALELTGTPEEEHMGKTTSLIESQHHHLLHCLEKTTGLSYLVDDPLLSVRTSTIK
. .:: .. . : :. ..::
CCDS16 EPAGKEAPSCSSRLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK
460 470 480 490
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 NHEFIDEQMFEQNCMESSMQNYPSTRSPSLSSHPGLTTTCCSRRSKKTTHLPNSNLPATR
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CCDS62 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRT-
10 20 30 40 50
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CCDS62 LDRLPRTRLGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMME
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: .. .:: ..:: . .:: .:...:.. :.: . .. : . : . .
CCDS62 EMCALSFGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCC
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CCDS62 PDKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLP--ELQETDEFGQLNDN
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230 240 250 260 270
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CCDS62 RQLAH--VEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNK
240 250 260 270 280
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pF1KE4 -----EDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIII
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CCDS62 SVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMI
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pF1KE4 FATVMFYAEKGSSASKFTSIPASFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLV
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CCDS62 FSSLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLV
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pF1KE4 IALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQKKARLARIRVAKTGSSNAYLHSKRNGLLNEAL
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CCDS62 IALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREA-LER---AKRNGSIVSMNLKDA--FARSM
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:: . :. :.... .: . .:: : . . :: .::. :. : .
CCDS62 ELIDVAVEK-AGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKA-------LS-ETSSNKSFENKYQ
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pF1KE4 QMFEQNCMESSMQNYPSTRSPSLSSHPGLTTTCCSRRSKKTTHLPNSNLPATRLRSMQEL
.. ... :. ..: :. ::.. ... .: :: . :
CCDS62 EVSQKDSHEQ-LNNTSSSSPQHLSAQKLEMLYNEITKTQPHSH-PNPDCQEKPERPSAYE
520 530 540 550 560 570
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:... .:: ... .. ...:. ... .: :. : : :: . .
CCDS62 EEIEMEEVVCPQEQLAVAQTEVIVDMKSTSSIDSFTSCATDFTETE--RSPLPPPSASHL
580 590 600 610 620
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pF1KE4 ESRPPPASPGPNTNIPSIASNVVKVSAL
. . : ::
CCDS62 QMKFPTDLPGTEEHQRARGPPFLTLSREKGPAARDGTLEYAPVDITVNLDASGSQCGLHS
630 640 650 660 670 680
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CCDS13 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIV-RSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRT-LD
10 20 30 40 50
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CCDS13 RLPRTRLGKLRDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEM
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: ....:: ..:: . .:: .:...:.. :.: . .. : . : . .
CCDS13 CALSFSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAE
120 130 140 150 160 170
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pF1KE4 -RQTMWRAFENPHTSTLALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVPCGTVPGSKEL-PCGERYS
:. .: .:.:..:. : .. .. .::..:.:. ..:.: . . :. . .
CCDS13 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLP--ELQSLDEFGQSTDNPQ
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pF1KE4 VAFFCLDTACVMIFTVEYLLRLFAAPSRYRFIRSVMSIIDVVAIMPYYIGLVMTNN----
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CCDS13 LAH--VEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSV
230 240 250 260 270 280
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pF1KE4 ---EDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFA
..: . .:..:..::.:..::: ::. ::.::. .:::.:.. :.:.:.::.
CCDS13 LQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFS
290 300 310 320 330 340
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...:.::: . .:: :::::::.. .::::.::::. :::. ::: :..: ..::::::
CCDS13 SLVFFAEKDEDDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIA
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pF1KE4 LPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQKKARLARIRVAKTGSSNAYLHSKRNGLLNEALEL
::.:.::.:::..:....: .: : :. : : :. ..:: .. . . : ...
CCDS13 LPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEK--AIKR-REALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDI
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pF1KE4 TGTPEEEHMGKTTSLIESQHHHLLHCLEKTTGLSYLVDDPLLSVRTSTIKNHEFIDEQMF
. . :.::: .. : .:: : : . . : .:. . : .
CCDS13 VVEKNGENMGKKDKV---QDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEKARSSSS
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pF1KE4 EQNCMESSMQNYPSTRSPSLSSHPGLTTTCCSRRSKKTTHLPNSNLPATRLRSMQELSTI
:. ...... . . . .:.: :.: . .:: .: ..:.
CCDS13 PQHLNVQQLEDMYN-KMAKTQSQPILNTKESAAQSKPKEELEMESIPSPVAPLPTRTEGV
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pF1KE4 HIQGSEQPSLTTSRSSLNLKADDGLRPNCKTSQITTAIISIPTPPALTPEGESRPPPASP
CCDS13 IDMRSMSSIDSFISCATDFPEATRFSHSPLTSLPSKTGGSTAPEVGWRGALGASGGRFVE
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CCDS82 GDHLLEPEVADGGGAPPQGGCGGGGCDRYEPLPPSLPAAGEQDCCGERVVINISGLRFET
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60 70 80 90 100 110
pF1KE4 WRTTLERYPDTLLGSTEKEF-FFNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTG-KLHYPRYECI
:: ..:.::::. .... .:. .::::::. : .: .:..: ... : :
CCDS82 QLKTLCQFPETLLGDPKRRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRIRRPVNVPI
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120 130 140 150 160 170
pF1KE4 SAYDDELAFYGILPEIIGDCCYEEYKDRKRENAERLMDDNDSENNQESMPSLSFRQTMWR
. ...:. :: . :. .:.... :.. ..... .: .:.. .:
CCDS82 DIFSEEIRFYQL-----GEEAMEKFRE----------DEGFLREEERPLPRRDFQRQVWL
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180 190 200 210
pF1KE4 AFENPHTSTLALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVP---------CGTVPGSKELP----C
:: :..: : . :. . : .:.. .::.: .: : :
CCDS82 LFEYPESSGPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDEKDYPASTSQDSFEAAGNSTS
230 240 250 260 270 280
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pF1KE4 GER-----YSVAFFCLDTACVMIFTVEYLLRLFAAPSRYRFIRSVMSIIDVVAIMPYYIG
: : .: :: ..: :.. :. : :.:.:: ::. : :..:..::.:::.::.:
CCDS82 GSRAGASSFSDPFFVVETLCIIWFSFELLVRFFACPSKATFSRNIMNLIDIVAIIPYFIT
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pF1KE4 LVM-------TNNEDVSGAFV-TLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLL
: .... .: :.. ..:. :::::::.::::.::.::: :::. :::.:.
CCDS82 LGTELAERQGNGQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLI
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pF1KE4 FSLTMAIIIFATVMFYAEKGSSASKFTSIPASFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGS
: : ...:.:......:: . .: :.::: .::...:::::.::::: : ::.::: ::
CCDS82 FFLFIGVILFSSAVYFAEADDPTSGFSSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMHPVTIGGKIVGS
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pF1KE4 ICSLSGVLVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRR-----------AQKKARLARIRVAK
.:...:::.::::::::::::. .::.. ..... ... .: . : .
CCDS82 LCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQSQYMHVGSCQHLSSSAEELRKARSNS
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pF1KE4 TGSSNAYLHSKRNGLLNEALELTGTPEEEHMGKTTSLIESQHHHLLHCLEKTTGLSYLVD
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CCDS82 TLSKSEYMVIEEGGMNHSAFPQTPFKTGNSTATCTTNNNPNSCVNIKKIFTDV
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: :.. . :.: ...:..: ::.:
CCDS82 FSNGKILISESTNHETAFSKLPGDYADPPGPEPVVLNEGNQR----VIINIAGLRFETQL
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60 70 80 90 100 110
pF1KE4 TTLERYPDTLLGSTEKEF-FFNEDTKEYFFDRDPEVFRCVLNFYRTG-KLHYPRYECISA
:: ..:.::::. ::.. ::. .::::::. : .: .:..: :.. : :.
CCDS82 RTLSQFPETLLGDREKRMQFFDSMRNEYFFDRNRPSFDGILYYYQSGGKIRRPANVPIDI
110 120 130 140 150 160
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pF1KE4 YDDELAFYGILPEIIGDCCYEEYKDRKRENAERLMDDNDSENNQESMPSLSFRQTMWRAF
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CCDS82 FADEISFYELGSEAM---------DQFRED-EGFIKDPETL-----LPTNDIHRQFWLLF
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180 190 200 210 220
pF1KE4 ENPHTSTLALVFYYVTGFFIAVSVITNVVETVP-------CGTV--PG---SKELPCGER
: :..:. : . :. . ...:. .::.: .: :. :: .
CCDS82 EYPESSSAARAVAVVSVLVVVISITIFCLETLPEFREDRELKVVRDPNLNMSKTVLSQTM
210 220 230 240 250 260
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pF1KE4 YSVAFFCLDTACVMIFTVEYLLRLFAAPSRYRFIRSVMSIIDVVAIMPYYIGLVM-----
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CCDS82 FTDPFFMVESTCIVWFTFELVLRFVVCPSKTDFFRNIMNIIDIISIIPYFATLITELVQE
270 280 290 300 310 320
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pF1KE4 ---TNNEDVSGAFVTL-RVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAI
. ....: :.. . :. :::::::.::::.::.::: :::. :::.:.: : ...
CCDS82 TEPSAQQNMSLAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGV
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CCDS82 ILFSSAVYFAEVDEPESHFSSIPDGFWWAVVTMTTVGYGDMCPTTPGGKIVGTLCAIAGV
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pF1KE4 LVIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRA--QKKARLARIRVAKTGSSNAYLHSKRNGLL
:.::::::::::::. .::.. . .... . :. .. ::... .: ::
CCDS82 LTIALPVPVIVSNFNYFYHRETENEEKQNIPGEIERILNSVGSRMGSTDSL--NKTNGGC
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 NEALELTGTPEEEHMGKTTSLIESQHHHLLHCLEKTTGLSYLVDDPLLSVRTSTIKNHEF
CCDS82 STEKSRK
510
>>CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 (456 aa)
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:: : . .. .::::.: ::.: :: :
CCDS12 MEPRCPPPCGCCER-------LVLNVAGLRFETRARTLGR
10 20 30
70 80 90 100 110
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CCDS12 AFYGLGAAALA---------RLRE------DEGCPVPPERPLPRRAFARQLWLLFEFPES
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CCDS12 SQAARVLAVVSVLVILVSIVVFCLETLPDFRDDRDGTGLAAAAAAGPFPAPLNGSSQMPG
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