Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4181
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4181, 653 aa
1>>>pF1KE4181 653 - 653 aa - 653 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4738+/-0.00098; mu= 11.2420+/- 0.059
mean_var=171.2781+/-34.618, 0's: 0 Z-trim(111.1): 53 B-trim: 175 in 2/49
Lambda= 0.097999
statistics sampled from 12049 (12102) to 12049 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.705), E-opt: 0.2 (0.372), width: 16
Scan time: 3.670
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 4351 627.7 1.6e-179
CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 2243 329.6 7.4e-90
CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 2188 321.8 1.5e-87
CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 1910 282.4 9.3e-76
CCDS55625.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 356) 1341 201.9 1.3e-51
CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 1280 193.4 6.4e-49
CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 1216 184.4 4e-46
CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 1199 182.0 1.9e-45
CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 1120 170.8 4.2e-42
CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 721 114.6 6.2e-25
CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 716 113.9 9.7e-25
CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 701 111.5 2.8e-24
CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 626) 641 103.1 1.2e-21
CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 635) 641 103.1 1.2e-21
CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 632 101.7 2.3e-21
CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 511) 626 100.9 4.5e-21
CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 585) 627 101.1 4.5e-21
CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 625 100.8 5e-21
CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs108|chr19 ( 757) 620 100.2 1.1e-20
CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 610 98.7 2.2e-20
CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 605 97.9 3.3e-20
CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 594 96.4 1e-19
CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 585 95.1 2.2e-19
CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 585 95.1 2.4e-19
CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 583 94.9 3.1e-19
CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 571 93.1 8.7e-19
CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 553 90.6 6e-18
CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 613) 519 85.9 1.8e-16
CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 618) 519 85.9 1.8e-16
CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 629) 519 85.9 1.9e-16
CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 638) 519 85.9 1.9e-16
CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 558) 517 85.6 2.1e-16
CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 583) 517 85.6 2.2e-16
CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 512 84.9 3.8e-16
CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 510 84.6 4.5e-16
CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 506 84.1 6.7e-16
CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 506 84.1 6.9e-16
>>CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 (653 aa)
initn: 4351 init1: 4351 opt: 4351 Z-score: 3336.7 bits: 627.7 E(32554): 1.6e-179
Smith-Waterman score: 4351; 100.0% identity (100.0% similar) in 653 aa overlap (1-653:1-653)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MEVAMVSAESSGCNSHMPYGYAAQARARERERLAHSRAAAAAAVAAATAAVEGSGGSGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MEVAMVSAESSGCNSHMPYGYAAQARARERERLAHSRAAAAAAVAAATAAVEGSGGSGGG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 SHHHHQSRGACTSHDPQSSRGSRRRRRQRSEKKKAHYRQSSFPHCSDLMPSGSEEKILRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SHHHHQSRGACTSHDPQSSRGSRRRRRQRSEKKKAHYRQSSFPHCSDLMPSGSEEKILRE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LSEEEEDEEEEEEEEEEGRFYYSEDDHGDECSYTDLLPQDEGGGGYSSVRYSDCCERVVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LSEEEEDEEEEEEEEEEGRFYYSEDDHGDECSYTDLLPQDEGGGGYSSVRYSDCCERVVI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 NVSGLRFETQMKTLAQFPETLLGDPEKRTQYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NVSGLRFETQMKTLAQFPETLLGDPEKRTQYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LKRPVNVPFDIFTEEVKFYQLGEEALLKFREDEGFVREEEDRALPENEFKKQIWLLFEYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LKRPVNVPFDIFTEEVKFYQLGEEALLKFREDEGFVREEEDRALPENEFKKQIWLLFEYP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 ESSSPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDDRDLVMALSAGGHGGLLNDTSAPHLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ESSSPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDDRDLVMALSAGGHGGLLNDTSAPHLE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 NSGHTIFNDPFFIVETVCIVWFSFEFVVRCFACPSQALFFKNIMNIIDIVSILPYFITLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NSGHTIFNDPFFIVETVCIVWFSFEFVVRCFACPSQALFFKNIMNIIDIVSILPYFITLG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 TDLAQQQGGGNGQQQQAMSFAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGHTLRASMRELGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TDLAQQQGGGNGQQQQAMSFAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGHTLRASMRELGL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 LIFFLFIGVILFSSAVYFAEADEPTTHFQSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMKPITVGGKIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LIFFLFIGVILFSSAVYFAEADEPTTHFQSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMKPITVGGKIV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 GSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETENEEQTQLTQNAVSCPYLPSNLLKKFRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETENEEQTQLTQNAVSCPYLPSNLLKKFRSS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KE4 TSSSLGDKSEYLEMEEGVKESLCAKEEKCQGKGDDSETDKNNCSNAKAVETDV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TSSSLGDKSEYLEMEEGVKESLCAKEEKCQGKGDDSETDKNNCSNAKAVETDV
610 620 630 640 650
>>CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 (575 aa)
initn: 1907 init1: 868 opt: 2243 Z-score: 1726.7 bits: 329.6 E(32554): 7.4e-90
Smith-Waterman score: 2252; 63.4% identity (79.9% similar) in 576 aa overlap (90-653:15-575)
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 GSHHHHQSRGACTSHDPQSSRGSRRRRRQRSEKKKAH--YRQSSFPHCSDLMPSG-SEEK
: ...:: : .: :. : .:
CCDS82 MDERLSLLRSPPPPSARHRAHPPQRPASSGGAHTLVNHGYAEPA
10 20 30 40
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 ILRELSEEEE----DEEEEEEEEEEGRFYYSEDDHGDECSYTDLLPQDEGGGGYSSVRYS
::: . :. : : . : . : :. . :: . ..: .
CCDS82 AGRELPPDMTVVPGDHLLEPEVADGGGAPPQGGCGGGGCDRYEPLPPSLPAAGEQ-----
50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DCC-ERVVINVSGLRFETQMKTLAQFPETLLGDPEKRTQYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAI
::: ::::::.::::::::.::: ::::::::::..: .:::::::::::::::::::::
CCDS82 DCCGERVVINISGLRFETQLKTLCQFPETLLGDPKRRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAI
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 LYYYQSGGRLKRPVNVPFDIFTEEVKFYQLGEEALLKFREDEGFVREEEDRALPENEFKK
:::::::::..::::::.:::.::..::::::::. ::::::::.:::: : ::. .:..
CCDS82 LYYYQSGGRIRRPVNVPIDIFSEEIRFYQLGEEAMEKFREDEGFLREEE-RPLPRRDFQR
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 QIWLLFEYPESSSPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDDRDLVMALSAGGHGGLL
:.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::..: . : . .
CCDS82 QVWLLFEYPESSGPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDEKDYPASTSQDSFEAAG
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 NDTSAPHLENSGHTIFNDPFFIVETVCIVWFSFEFVVRCFACPSQALFFKNIMNIIDIVS
:.::. . .: . :.::::.:::.::.:::::..:: :::::.: : .::::.::::.
CCDS82 NSTSGSR---AGASSFSDPFFVVETLCIIWFSFELLVRFFACPSKATFSRNIMNLIDIVA
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 ILPYFITLGTDLAQQQGGGNGQQQQAMSFAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGHTL
:.::::::::.::..::.: :::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::
CCDS82 IIPYFITLGTELAERQGNG----QQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTL
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 RASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADEPTTHFQSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMK
.::::::::::::::::::::::::::::::.::. :.:::::::::::::::::::::.
CCDS82 KASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADDPTSGFSSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMH
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 PITVGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETENEEQTQLTQNAVSCPYLPS
:.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.: ... :: .: :
CCDS82 PVTIGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQSQY-MHVGSCQHLSS
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640
pF1KE4 NLLKKFRSSTSSSLGDKSEYLEMEEG-VKESLCAKEEKCQGKGDDSETDKNN---CSNAK
. ...:.. :.: .::::. .::: ...: . :.. . : .:: : : :
CCDS82 SA-EELRKARSNSTLSKSEYMVIEEGGMNHSAFPQTPFKTGNSTATCTTNNNPNSCVNIK
520 530 540 550 560
650
pF1KE4 AVETDV
. :::
CCDS82 KIFTDV
570
>>CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 (499 aa)
initn: 1877 init1: 872 opt: 2188 Z-score: 1685.5 bits: 321.8 E(32554): 1.5e-87
Smith-Waterman score: 2200; 71.7% identity (85.3% similar) in 477 aa overlap (146-621:7-468)
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 KILRELSEEEEDEEEEEEEEEEGRFYYSEDDHGDECSYTDLLPQDEGGGGYSSVRYSDCC
: .:: . ::: :. .::
CCDS82 MTVATGDPADEAAALPGHPQDT----YDPEADHECC
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 ERVVINVSGLRFETQMKTLAQFPETLLGDPEKRTQYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYY
::::::.::::::::.::::::::::::::.:: .:::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ERVVINISGLRFETQLKTLAQFPETLLGDPKKRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYY
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 QSGGRLKRPVNVPFDIFTEEVKFYQLGEEALLKFREDEGFVREEEDRALPENEFKKQIWL
::::::.::::::.:::.::..::.:::::. ::::::...::: : ::::::..:.::
CCDS82 QSGGRLRRPVNVPLDIFSEEIRFYELGEEAMEMFREDEGYIKEEE-RPLPENEFQRQVWL
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 LFEYPESSSPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDDRDLVMALSAGGHGGLLNDTS
::::::::.::: ::::::.::::::: ::::::: :::. . . : : .. :
CCDS82 LFEYPESSGPARIIAIVSVMVILISIVSFCLETLPIFRDENE-----DMHGSGVTFHTYS
160 170 180 190 200
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 APHLENSGHTIFNDPFFIVETVCIVWFSFEFVVRCFACPSQALFFKNIMNIIDIVSILPY
. . : :.::::::::.::.::::::.:: :::::.: :: :::::::::.:.::
CCDS82 NSTIGYQQSTSFTDPFFIVETLCIIWFSFEFLVRFFACPSKAGFFTNIMNIIDIVAIIPY
210 220 230 240 250 260
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 FITLGTDLAQQQGGGNGQQQQAMSFAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGHTLRASM
::::::.::.. .. : :::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::.:::
CCDS82 FITLGTELAEKPEDAQ-QGQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASM
270 280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 RELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADEPTTHFQSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMKPITV
:::::::::::::::::::::::::::: ..: :::::::::::.::::::::: : :.
CCDS82 RELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADERESQFPSIPDAFWWAVVSMTTVGYGDMVPTTI
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 GGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETENEEQTQLTQNAVSCPYLPSNL-L
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.: : ..::: .::. :
CCDS82 GGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQAQYLQ-VTSCPKIPSSPDL
390 400 410 420 430 440
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 KKFRSSTSSSLGDKSEYLEMEEGVKESLCAKEEKCQGKGDDSETDKNNCSNAKAVETDV
:: ::... : ::.:.:..:::..:
CCDS82 KKSRSASTIS---KSDYMEIQEGVNNSNEDFREENLKTANCTLANTNYVNITKMLTDV
450 460 470 480 490
>>CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 (456 aa)
initn: 1944 init1: 821 opt: 1910 Z-score: 1473.6 bits: 282.4 E(32554): 9.3e-76
Smith-Waterman score: 1910; 69.4% identity (86.4% similar) in 412 aa overlap (174-581:11-415)
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 EDDHGDECSYTDLLPQDEGGGGYSSVRYSDCCERVVINVSGLRFETQMKTLAQFPETLLG
::::.:.::.::::::. .::..::.::::
CCDS12 MEPRCPPPCGCCERLVLNVAGLRFETRARTLGRFPDTLLG
10 20 30 40
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 DPEKRTQYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRLKRPVNVPFDIFTEEVKFYQLGE
:: .: ...: : ::::::.::::::.::::::::::.::..::.:.: ::: :: ::
CCDS12 DPARRGRFYDDARREYFFDRHRPSFDAVLYYYQSGGRLRRPAHVPLDVFLEEVAFYGLGA
50 60 70 80 90 100
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 EALLKFREDEGFVREEEDRALPENEFKKQIWLLFEYPESSSPARGIAIVSVLVILISIVI
:: ..::::: : : ::. : .:.:::::.::::. :: .:.:::::::.:::.
CCDS12 AALARLREDEGCPVPPE-RPLPRRAFARQLWLLFEFPESSQAARVLAVVSVLVILVSIVV
110 120 130 140 150
330 340 350 360 370
pF1KE4 FCLETLPEFRDDRD---LVMALSAGGHGGLLNDTSA-PHLENSGHTIFNDPFFIVETVCI
:::::::.:::::: :. : .:: . :: .: : : . ::::::.:::.::
CCDS12 FCLETLPDFRDDRDGTGLAAAAAAGPFPAPLNGSSQMPG--NPPRLPFNDPFFVVETLCI
160 170 180 190 200 210
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 VWFSFEFVVRCFACPSQALFFKNIMNIIDIVSILPYFITLGTDLAQQQGGGNGQQQQAMS
:::::..:: ..:::.:.::::.::.::.:.:::::..:::.::.:.: : :::::
CCDS12 CWFSFELLVRLLVCPSKAIFFKNVMNLIDFVAILPYFVALGTELARQRGVG----QQAMS
220 230 240 250 260 270
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 FAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGHTLRASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFA
.::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS12 LAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLRASMRELGLLIFFLFIGVVLFSSAVYFA
280 290 300 310 320 330
500 510 520 530 540 550
pF1KE4 EADEPTTHFQSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMKPITVGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVI
:.:. .:: :::..:::::::::::::::: :.:::::::::::::::::::.::::::
CCDS12 EVDRVDSHFTSIPESFWWAVVTMTTVGYGDMAPVTVGGKIVGSLCAIAGVLTISLPVPVI
340 350 360 370 380 390
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 VSNFNYFYHRETENEEQTQLTQNAVSCPYLPSNLLKKFRSSTSSSLGDKSEYLEMEEGVK
::::.::::::::.:: ....
CCDS12 VSNFSYFYHRETEGEEAGMFSHVDMQPCGPLEGKANGGLVDGEVPELPPPLWAPPGKHLV
400 410 420 430 440 450
>>CCDS55625.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 (356 aa)
initn: 1054 init1: 658 opt: 1341 Z-score: 1040.2 bits: 201.9 E(32554): 1.3e-51
Smith-Waterman score: 1349; 65.2% identity (80.7% similar) in 322 aa overlap (146-467:7-315)
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 KILRELSEEEEDEEEEEEEEEEGRFYYSEDDHGDECSYTDLLPQDEGGGGYSSVRYSDCC
: .:: . ::: :. .::
CCDS55 MTVATGDPADEAAALPGHPQDT----YDPEADHECC
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 ERVVINVSGLRFETQMKTLAQFPETLLGDPEKRTQYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYY
::::::.::::::::.::::::::::::::.:: .:::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ERVVINISGLRFETQLKTLAQFPETLLGDPKKRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYY
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 QSGGRLKRPVNVPFDIFTEEVKFYQLGEEALLKFREDEGFVREEEDRALPENEFKKQIWL
::::::.::::::.:::.::..::.:::::. ::::::...::: : ::::::..:.::
CCDS55 QSGGRLRRPVNVPLDIFSEEIRFYELGEEAMEMFREDEGYIKEEE-RPLPENEFQRQVWL
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 LFEYPESSSPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDDRDLVMALSAGGHGGLLNDTS
::::::::.::: ::::::.::::::: ::::::: :::. . . : : .. :
CCDS55 LFEYPESSGPARIIAIVSVMVILISIVSFCLETLPIFRDENE-----DMHGSGVTFHTYS
160 170 180 190 200
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 APHLENSGHTIFNDPFFIVETVCIVWFSFEFVVRCFACPSQALFFKNIMNIIDIVSILPY
. . : :.::::::::.::.::::::.:: :::::.: :: :::::::::.:.::
CCDS55 NSTIGYQQSTSFTDPFFIVETLCIIWFSFEFLVRFFACPSKAGFFTNIMNIIDIVAIIPY
210 220 230 240 250 260
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 FITLGTDLAQQQGGGNGQQQQAMSFAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGHTLRASM
::::::.::.. .. : :::::.::::.::: : : .. .. ..: : :
CCDS55 FITLGTELAEKPEDAQ-QGQQAMSLAILRVIRLER--RPLQSQKSKRGRQHLNTSHDCTL
270 280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 RELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADEPTTHFQSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMKPITV
CCDS55 GINLVAGMTVQWTRASGPDDRQTPAVTTLHRMY
330 340 350
>>CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 (495 aa)
initn: 1874 init1: 859 opt: 1280 Z-score: 991.7 bits: 193.4 E(32554): 6.4e-49
Smith-Waterman score: 2217; 68.7% identity (85.4% similar) in 508 aa overlap (149-653:10-495)
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 RELSEEEEDEEEEEEEEEEGRFYYSEDDHGDECSYTDLLPQDEGGGGYSSVRYSD---CC
:: : . ::: :.: : ::
CCDS85 MTVMSGENVDEASAAPGHPQD---GSYPRQADHDDHECC
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 ERVVINVSGLRFETQMKTLAQFPETLLGDPEKRTQYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYY
::::::.::::::::.:::::::.::::.:.:: .:::::::::::::::::::::::::
CCDS85 ERVVINISGLRFETQLKTLAQFPNTLLGNPKKRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYY
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 QSGGRLKRPVNVPFDIFTEEVKFYQLGEEALLKFREDEGFVREEEDRALPENEFKKQIWL
::::::.::::::.:.:.::.:::.:::::. ::::::::..::: : :::.:...:.::
CCDS85 QSGGRLRRPVNVPLDMFSEEIKFYELGEEAMEKFREDEGFIKEEE-RPLPEKEYQRQVWL
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 LFEYPESSSPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDDRDLVMALSAGGHGGLLNDTS
::::::::.::: ::::::.::::::::::::::::..::.:.. : ...:.
CCDS85 LFEYPESSGPARVIAIVSVMVILISIVIFCLETLPELKDDKDFT------GTVHRIDNTT
160 170 180 190 200
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 APHLENSGHTIFNDPFFIVETVCIVWFSFEFVVRCFACPSQALFFKNIMNIIDIVSILPY
. . :: .::.::::::::.::.:::::.::: :::::.. :::::::.::::.:.::
CCDS85 V--IYNS--NIFTDPFFIVETLCIIWFSFELVVRFFACPSKTDFFKNIMNFIDIVAIIPY
210 220 230 240 250 260
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 FITLGTDLAQQQGGGNGQQQQAMSFAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGHTLRASM
::::::..:.:.:. .:. :: :.::::.:::::::::::::::::::::::.::.:::
CCDS85 FITLGTEIAEQEGNQKGE--QATSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASM
270 280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 RELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADEPTTHFQSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMKPITV
::::::::::::::::::::::::::.: .::.:::::::::::.::::::::: :.:.
CCDS85 RELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEAEEAESHFSSIPDAFWWAVVSMTTVGYGDMYPVTI
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 GGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETENEEQTQLTQNAVSCPYLPSNLLK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:: . :: : : :.
CCDS85 GGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQAQLLH--VSSPNLASDSDL
390 400 410 420 430 440
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 KFRSSTSSSLGDKSEYLEMEEGVKESLCAKEEKCQGKGDDSETDKNNCSNAKAVETDV
. :::.. : ::::.:.:: ...:. :. .. . . . : ..:: : . . :::
CCDS85 SRRSSSTMS---KSEYMEIEEDMNNSI-AHYRQVNIRTANCTTANQNCVNKSKLLTDV
450 460 470 480 490
>>CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 (613 aa)
initn: 2173 init1: 877 opt: 1216 Z-score: 941.6 bits: 184.4 E(32554): 4e-46
Smith-Waterman score: 2064; 57.4% identity (74.8% similar) in 610 aa overlap (41-632:13-589)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 SGCNSHMPYGYAAQARARERERLAHSRAAAAAAVAAATAAVEGSGGSGGGSHHHHQSRGA
: .: .. : : : . :: . . :
CCDS85 MEIALVPLENGGAMTVRGGDEARAGCGQATGGELQCPPTAGL
10 20 30 40
80 90 100 110 120
pF1KE4 CTSHDPQSSRGSRRRRRQRSEKKKAHYRQSSFPHCSDLMPSGSEEKILRELSEE--EEDE
. . .: :. .. : .: : :. . : : :: . .
CCDS85 SDGPKEPAPKG-------RGAQRDADSGVRPLPPLPD--PG---VRPLPPLPEELPRPRR
50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 EEEEEEEEEGRFYYSEDDHGDECSYTDLLPQDEGGGGYSSVRYSDCCERVVINVSGLRFE
:.::::: : : : .. . : .:... .:: ::.::::::
CCDS85 PPPEDEEEEG-------DPG-------LGTVEDQALGTASLHH----QRVHINISGLRFE
100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TQMKTLAQFPETLLGDPEKRTQYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRLKRPVNVP
::. ::::::.:::::: :: .:::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::
CCDS85 TQLGTLAQFPNTLLGDPAKRLRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDGILYYYQSGGRLRRPVNVS
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 FDIFTEEVKFYQLGEEALLKFREDEGFVREEEDRALPENEFKKQIWLLFEYPESSSPARG
.:.:..:..:::::.::. .:::::::..::: . ::.:::..:.::.:::::::. ::.
CCDS85 LDVFADEIRFYQLGDEAMERFREDEGFIKEEE-KPLPRNEFQRQVWLIFEYPESSGSARA
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350
pF1KE4 IAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDDRDLVM---------ALSAGGHG-GLLNDTSAPH
:::::::::::::. :::::::::::.:.:. : . :..: :.. :.:
CCDS85 IAIVSVLVILISIITFCLETLPEFRDERELLRHPPAPHQPPAPAPGANGSGVMAPPSGPT
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 LENSGHTIFNDPFFIVETVCIVWFSFEFVVRCFACPSQALFFKNIMNIIDIVSILPYFIT
. . ::::::::.:..::.::..:: :::::.: : .:::::::.:.:.:::::
CCDS85 VAPLLPRTLADPFFIVETTCVIWFTFELLVRFFACPSKAGFSRNIMNIIDVVAIFPYFIT
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 LGTDLAQQQ--GGGNGQQ-QQAMSFAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGHTLRASM
:::.::.:: :::.::. :::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::.:::
CCDS85 LGTELAEQQPGGGGGGQNGQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGKTLQASM
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 RELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADEPTTHFQSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMKPITV
:::::::::::::::::::::::::::. :::.:::::::::::::::::::::.::::
CCDS85 RELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADNQGTHFSSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMRPITV
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 GGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETENEEQTQLTQNAVSC---PYLPSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:: . : .. . : : .
CCDS85 GGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETDHEEPAVLKEEQGTQSQGPGLDRG
500 510 520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 LLKKFRSSTSSSLGDKSEYLEMEEGVKESLCAKEEKCQGKGDDSETDKNNCSNAKAVETD
. .: :.. .:. . :: ...... : : ::. :
CCDS85 VQRKV-SGSRGSFCKAGGTLENADSARRGSCPLE-KCNVKAKSNVDLRRSLYALCLDTSR
560 570 580 590 600
pF1KE4 V
CCDS85 ETDL
610
>>CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 (529 aa)
initn: 2058 init1: 864 opt: 1199 Z-score: 929.5 bits: 182.0 E(32554): 1.9e-45
Smith-Waterman score: 2019; 65.9% identity (80.6% similar) in 501 aa overlap (148-613:20-503)
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 LRELSEEEEDEEEEEEEEEEGRFYYSEDDHGDECSYTDLLPQDEGGGGYSSVRYSDCC--
:.. . :. :. :::: ::
CCDS85 MRSEKSLTLAAPGEVRGPEGEQQDAGDF-PEAGGGGG--------CCSS
10 20 30 40
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 ERVVINVSGLRFETQMKTLAQFPETLLGDPEKRTQYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYY
::.:::.::::::::..::. ::.:::::: .:...::::::::::::::::::::::::
CCDS85 ERLVINISGLRFETQLRTLSLFPDTLLGDPGRRVRFFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYY
50 60 70 80 90 100
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 QSGGRLKRPVNVPFDIFTEEVKFYQLGEEALLKFREDEGFVRE--EEDRALPENEFKKQI
::::::.::::::.::: ::..:::::.::: :::::: . : :... :: . :..:.
CCDS85 QSGGRLRRPVNVPLDIFLEEIRFYQLGDEALAAFREDEGCLPEGGEDEKPLPSQPFQRQV
110 120 130 140 150 160
300 310 320 330 340
pF1KE4 WLLFEYPESSSPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFR-DDR-------DLVMALSAG
::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.:: : : . : .: :
CCDS85 WLLFEYPESSGPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPQFRVDGRGGNNGGVSRVSPVSRG
170 180 190 200 210 220
350 360 370 380
pF1KE4 G--------------HG---GLLNDTSAPHLENSGHTIFNDPFFIVETVCIVWFSFEFVV
. :: : .. .. : . : ..:.::::.:::.:::::.::..:
CCDS85 SQEEEEDEDDSYTFHHGITPGEMGTGGSSSLSTLGGSFFTDPFFLVETLCIVWFTFELLV
230 240 250 260 270 280
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 RCFACPSQALFFKNIMNIIDIVSILPYFITLGTDLAQQQ-----GGGNGQQ-QQAMSFAI
: ::::. ::.:::::::.:.:.::::::::.:.::: .::.::. :::::.::
CCDS85 RFSACPSKPAFFRNIMNIIDLVAIFPYFITLGTELVQQQEQQPASGGGGQNGQQAMSLAI
290 300 310 320 330 340
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 LRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGHTLRASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEAD
::.:::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 LRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGKTLQASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEAD
350 360 370 380 390 400
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 EPTTHFQSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMKPITVGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSN
. . : ::::::::::::::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 DDDSLFPSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMYPMTVGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSN
410 420 430 440 450 460
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 FNYFYHRETENEEQTQLTQNAVSCPYLPSNLLKKFRSSTSSSLGDKSEYLEMEEGVKESL
::::::::::.::: : :. :.: :. :. .:...:: : .. :
CCDS85 FNYFYHRETEQEEQGQYTH--VTCGQ-PAPDLR----ATDNGLG-KPDFPEANRERRPSY
470 480 490 500 510
630 640 650
pF1KE4 CAKEEKCQGKGDDSETDKNNCSNAKAVETDV
CCDS85 LPTPHRAYAEKRMLTEV
520
>>CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 (511 aa)
initn: 1983 init1: 839 opt: 1120 Z-score: 869.3 bits: 170.8 E(32554): 4.2e-42
Smith-Waterman score: 1917; 66.0% identity (84.8% similar) in 447 aa overlap (138-579:49-476)
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 LMPSGSEEKILRELSEEEEDEEEEEEEEEEGRFYYSEDDHGDECSYTDLLPQDEGGG-GY
:.. ::. . : ... : : : . :
CCDS82 SDEIQEEPGYATDFDSTSPKGRPGGSSFSNGKILISESTN-HETAFSKL-PGDYADPPGP
20 30 40 50 60 70
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 SSVRYSDCCERVVINVSGLRFETQMKTLAQFPETLLGDPEKRTQYFDPLRNEYFFDRNRP
: .. .::.::..:::::::..::.::::::::: ::: :.:: .:::::::::::
CCDS82 EPVVLNEGNQRVIINIAGLRFETQLRTLSQFPETLLGDREKRMQFFDSMRNEYFFDRNRP
80 90 100 110 120 130
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 SFDAILYYYQSGGRLKRPVNVPFDIFTEEVKFYQLGEEALLKFREDEGFVREEEDRALPE
:::.:::::::::...::.:::.:::..:..::.:: ::. .:::::::... : ::
CCDS82 SFDGILYYYQSGGKIRRPANVPIDIFADEISFYELGSEAMDQFREDEGFIKDPET-LLPT
140 150 160 170 180 190
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 NEFKKQIWLLFEYPESSSPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDDRDLVMALSAGG
:....:.::::::::::: ::..:.:::::..:::.:::::::::::.::.:
CCDS82 NDIHRQFWLLFEYPESSSAARAVAVVSVLVVVISITIFCLETLPEFREDREL--------
200 210 220 230 240
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 HGGLLNDTSAPHLENS----GHTIFNDPFFIVETVCIVWFSFEFVVRCFACPSQALFFKN
.. : :.:. : ..:.:.::::.::..:::::.::.:.: .:::.. ::.:
CCDS82 --KVVRD---PNLNMSKTVLSQTMFTDPFFMVESTCIVWFTFELVLRFVVCPSKTDFFRN
250 260 270 280 290 300
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 IMNIIDIVSILPYFITLGTDLAQQQGGGNGQQQQAMSFAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSK
:::::::.::.::: :: :.:.:. . . :: ::.::::::::::::::::::::::
CCDS82 IMNIIDIISIIPYFATLITELVQET---EPSAQQNMSLAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSK
310 320 330 340 350
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 GLQILGHTLRASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADEPTTHFQSIPDAFWWAVVTM
::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::.::: .::.::::.::::::::
CCDS82 GLQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEVDEPESHFSSIPDGFWWAVVTM
360 370 380 390 400 410
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 TTVGYGDMKPITVGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETENEEQTQLTQN
:::::::: : : ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::. ..
CCDS82 TTVGYGDMCPTTPGGKIVGTLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETENEEKQNIPGE
420 430 440 450 460 470
590 600 610 620 630 640
pF1KE4 AVSCPYLPSNLLKKFRSSTSSSLGDKSEYLEMEEGVKESLCAKEEKCQGKGDDSETDKNN
CCDS82 IERILNSVGSRMGSTDSLNKTNGGCSTEKSRK
480 490 500 510
>>CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 (911 aa)
initn: 999 init1: 528 opt: 721 Z-score: 561.1 bits: 114.6 E(32554): 6.2e-25
Smith-Waterman score: 926; 38.7% identity (67.1% similar) in 434 aa overlap (169-575:28-432)
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 RFYYSEDDHGDECSYTDLLPQDEGGGGYSSVRYSDCCERVVINVSGLRFETQMKTLAQFP
.: . : .:: :::.:: :. .:: ..:
CCDS62 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLP
10 20 30 40 50
200 210 220 230 240
pF1KE4 ETLLGD------PEKRTQYFDPL---RNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGG--RLKRPVNV
.: :: :. . : .:::::::. .: .:: .:..: ... .
CCDS62 RTRLGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCAL
60 70 80 90 100 110
250 260 270 280 290
pF1KE4 PF----------DIFTE---EVKFYQLGEEALLKFREDEGFVREEEDRALPEN---EFKK
: .:. : .....: :. ..:.. .::.: . . .. . .:
CCDS62 SFGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDKRK
120 130 140 150 160 170
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 QIWLLFEYPESSSPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDDRDLVMALSAGGHGGLL
..: :.: :.:: :. .::::.: :..: . . :.::::... .. : :
CCDS62 KLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEF----------GQL
180 190 200 210 220
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 NDTSAPHLENSGHTIFNDPFFIVETVCIVWFSFEFVVRCFACPSQALFFKNIMNIIDIVS
:: : . ::.:::.::..:...: .. :.. :::. .:.::...
CCDS62 ND--------------NRQLAHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLA
230 240 250 260 270
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 ILPYFITLGTDLAQQQGGGNGQQQQAMSFAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGHTL
::::..:. . ... . : :.. ...:.:..:..::.::.::: ::: :: ::
CCDS62 ILPYYVTI---FLTESNKSVLQFQNVRR--VVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTL
280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 RASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADEPTTHFQSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMK
: :. ::::::.:: .:...::: :.::: :: .:.: ::: .::::..:::::::::.
CCDS62 RRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIY
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 PITVGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETENEEQTQLTQNAVSCPYLPS
: :. :::::.:: :::::.::::.:.::.::. ::... ..:.
CCDS62 PKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGS
390 400 410 420 430 440
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 NLLKKFRSSTSSSLGDKSEYLEMEEGVKESLCAKEEKCQGKGDDSETDKNNCSNAKAVET
CCDS62 IVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSF
450 460 470 480 490 500
653 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 01:26:50 2016 done: Sun Nov 6 01:26:51 2016
Total Scan time: 3.670 Total Display time: 0.130
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]