Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4174
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4174, 634 aa
1>>>pF1KE4174 634 - 634 aa - 634 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5949+/-0.00047; mu= 23.7128+/- 0.029
mean_var=77.7151+/-16.296, 0's: 0 Z-trim(109.2): 366 B-trim: 937 in 1/50
Lambda= 0.145486
statistics sampled from 16960 (17364) to 16960 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.204), width: 16
Scan time: 10.430
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001003760 (OMIM: 610749) kelch-like protein 31 ( 634) 4230 898.4 0
XP_016866347 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 4230 898.4 0
XP_005249164 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 4230 898.4 0
NP_061335 (OMIM: 611201) kelch-like protein 9 [Hom ( 617) 1325 288.6 4.3e-77
NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 613) 1315 286.5 1.8e-76
NP_001161773 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 1315 286.6 1.9e-76
XP_016885439 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 639) 1315 286.6 1.9e-76
NP_001161774 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 1315 286.6 1.9e-76
NP_001161772 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 649) 1315 286.6 1.9e-76
XP_011529713 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 655) 1315 286.6 1.9e-76
NP_277030 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 iso ( 655) 1315 286.6 1.9e-76
NP_001161771 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 658) 1315 286.6 1.9e-76
XP_011529711 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 1315 286.6 1.9e-76
XP_011529712 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 1315 286.6 1.9e-76
NP_065856 (OMIM: 613772) kelch-like protein 14 [Ho ( 628) 985 217.3 1.3e-55
NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 781 174.4 9.6e-43
NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 781 174.5 1.1e-42
NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 781 174.6 1.2e-42
XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 781 174.6 1.2e-42
XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 781 174.6 1.2e-42
XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 781 174.6 1.2e-42
XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 781 174.6 1.2e-42
XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 789) 781 174.6 1.2e-42
XP_011512001 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 781 174.6 1.2e-42
XP_016863763 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 781 174.6 1.2e-42
XP_016863762 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 781 174.6 1.2e-42
XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 575) 774 173.0 2.7e-42
NP_065917 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 isof ( 748) 774 173.1 3.2e-42
NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718) 753 168.7 6.6e-41
NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720) 753 168.7 6.6e-41
NP_001273654 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 i ( 687) 739 165.7 4.9e-40
NP_950240 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 694) 732 164.2 1.4e-39
XP_016876168 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 525) 730 163.7 1.5e-39
XP_006724581 (OMIM: 300980,300982) PREDICTED: kelc ( 604) 683 153.9 1.6e-36
NP_085127 (OMIM: 300980,300982) kelch-like protein ( 604) 683 153.9 1.6e-36
NP_071324 (OMIM: 256850,605379) gigaxonin [Homo sa ( 597) 677 152.6 3.7e-36
XP_016863164 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 415) 621 140.7 1e-32
XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 615 139.5 2.6e-32
XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 615 139.5 2.8e-32
NP_569713 (OMIM: 614214) kelch-like protein 6 [Hom ( 621) 586 133.5 2.1e-30
NP_001026880 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-li ( 586) 536 123.0 3e-27
XP_016867928 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 564) 519 119.4 3.4e-26
XP_016862148 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 519 119.5 3.6e-26
XP_005247610 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 519 119.5 3.6e-26
XP_005247611 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 519 119.5 3.6e-26
XP_005247609 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 519 119.5 3.6e-26
XP_011511240 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 519 119.5 3.6e-26
XP_005247613 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 519 119.5 3.6e-26
NP_060114 (OMIM: 611295) kelch-like protein 24 [Ho ( 600) 519 119.5 3.6e-26
XP_016862149 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 519 119.5 3.6e-26
>>NP_001003760 (OMIM: 610749) kelch-like protein 31 [Hom (634 aa)
initn: 4230 init1: 4230 opt: 4230 Z-score: 4800.2 bits: 898.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4230; 99.8% identity (100.0% similar) in 634 aa overlap (1-634:1-634)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAPKKKIVKKNKGDINEMTIIVEDSPLNKLNALNGLLEGGNGLSCISSELTDASYGPNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAPKKKIVKKNKGDINEMTIIVEDSPLNKLNALNGLLEGGNGLSCISSELTDASYGPNLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 EGLSKMRQENFLCDLVIGTKTKSFDVHKSVMASCSEYFYNILKKDPSIQRVDLNDISPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGLSKMRQENFLCDLVIGTKTKSFDVHKSVMASCSEYFYNILKKDPSIQRVDLNDISPLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LATVIAYAYTGKLTLSLYTIGSIISAAVYLQIHTLIKMCSDFLIREMSVENCMYVVNIAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
NP_001 LATVIAYAYTGKLTLSLYTIGSIISAAVYLQIHTLVKMCSDFLIREMSVENCMYVVNIAE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TYSLKNAKAAAQKFIRDNFLEFAESDQFMKLTFEQINELLIDDDLQLPSEIVAFQIAMKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TYSLKNAKAAAQKFIRDNFLEFAESDQFMKLTFEQINELLIDDDLQLPSEIVAFQIAMKW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LEFDQKRVKYAADLLSNIRFGTISAQDLVNYVQSVPRMMQDADCHRLLVDAMNYHLLPYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEFDQKRVKYAADLLSNIRFGTISAQDLVNYVQSVPRMMQDADCHRLLVDAMNYHLLPYH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QNTLQSRRTRIRGGCRVLVTVGGRPGLTEKSLSRDILYRDPENGWSKLTEMPAKSFNQCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QNTLQSRRTRIRGGCRVLVTVGGRPGLTEKSLSRDILYRDPENGWSKLTEMPAKSFNQCV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 AVMDGFLYVAGGEDQNDARNQAKHAVSNFCRYDPRFNTWIHLASMNQKRTHFSLSVFNGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVMDGFLYVAGGEDQNDARNQAKHAVSNFCRYDPRFNTWIHLASMNQKRTHFSLSVFNGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VYAAGGRNAEGSLASLECYVPSTNQWQPKTPLEVARCCHASAVADGRVLVTGGYIANAYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VYAAGGRNAEGSLASLECYVPSTNQWQPKTPLEVARCCHASAVADGRVLVTGGYIANAYS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 RSVCAYDPASDSWQELPNLSTPRGWHCAVTLSDRVYVMGGSQLGPRGERVDVLTVECYSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSVCAYDPASDSWQELPNLSTPRGWHCAVTLSDRVYVMGGSQLGPRGERVDVLTVECYSP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 ATGQWSYAAPLQVGVSTAGVSALHGRAYLVGGWNEGEKKYKKCIQCFSPELNEWTEDDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATGQWSYAAPLQVGVSTAGVSALHGRAYLVGGWNEGEKKYKKCIQCFSPELNEWTEDDEL
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE4 PEATVGVSCCTLSMPNNVTRESRASSVSSVPVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PEATVGVSCCTLSMPNNVTRESRASSVSSVPVSI
610 620 630
>>XP_016866347 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like prot (634 aa)
initn: 4230 init1: 4230 opt: 4230 Z-score: 4800.2 bits: 898.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4230; 99.8% identity (100.0% similar) in 634 aa overlap (1-634:1-634)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAPKKKIVKKNKGDINEMTIIVEDSPLNKLNALNGLLEGGNGLSCISSELTDASYGPNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAPKKKIVKKNKGDINEMTIIVEDSPLNKLNALNGLLEGGNGLSCISSELTDASYGPNLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 EGLSKMRQENFLCDLVIGTKTKSFDVHKSVMASCSEYFYNILKKDPSIQRVDLNDISPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EGLSKMRQENFLCDLVIGTKTKSFDVHKSVMASCSEYFYNILKKDPSIQRVDLNDISPLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LATVIAYAYTGKLTLSLYTIGSIISAAVYLQIHTLIKMCSDFLIREMSVENCMYVVNIAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
XP_016 LATVIAYAYTGKLTLSLYTIGSIISAAVYLQIHTLVKMCSDFLIREMSVENCMYVVNIAE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TYSLKNAKAAAQKFIRDNFLEFAESDQFMKLTFEQINELLIDDDLQLPSEIVAFQIAMKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TYSLKNAKAAAQKFIRDNFLEFAESDQFMKLTFEQINELLIDDDLQLPSEIVAFQIAMKW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LEFDQKRVKYAADLLSNIRFGTISAQDLVNYVQSVPRMMQDADCHRLLVDAMNYHLLPYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LEFDQKRVKYAADLLSNIRFGTISAQDLVNYVQSVPRMMQDADCHRLLVDAMNYHLLPYH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QNTLQSRRTRIRGGCRVLVTVGGRPGLTEKSLSRDILYRDPENGWSKLTEMPAKSFNQCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QNTLQSRRTRIRGGCRVLVTVGGRPGLTEKSLSRDILYRDPENGWSKLTEMPAKSFNQCV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 AVMDGFLYVAGGEDQNDARNQAKHAVSNFCRYDPRFNTWIHLASMNQKRTHFSLSVFNGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AVMDGFLYVAGGEDQNDARNQAKHAVSNFCRYDPRFNTWIHLASMNQKRTHFSLSVFNGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VYAAGGRNAEGSLASLECYVPSTNQWQPKTPLEVARCCHASAVADGRVLVTGGYIANAYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VYAAGGRNAEGSLASLECYVPSTNQWQPKTPLEVARCCHASAVADGRVLVTGGYIANAYS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 RSVCAYDPASDSWQELPNLSTPRGWHCAVTLSDRVYVMGGSQLGPRGERVDVLTVECYSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RSVCAYDPASDSWQELPNLSTPRGWHCAVTLSDRVYVMGGSQLGPRGERVDVLTVECYSP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 ATGQWSYAAPLQVGVSTAGVSALHGRAYLVGGWNEGEKKYKKCIQCFSPELNEWTEDDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ATGQWSYAAPLQVGVSTAGVSALHGRAYLVGGWNEGEKKYKKCIQCFSPELNEWTEDDEL
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE4 PEATVGVSCCTLSMPNNVTRESRASSVSSVPVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PEATVGVSCCTLSMPNNVTRESRASSVSSVPVSI
610 620 630
>>XP_005249164 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like prot (634 aa)
initn: 4230 init1: 4230 opt: 4230 Z-score: 4800.2 bits: 898.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4230; 99.8% identity (100.0% similar) in 634 aa overlap (1-634:1-634)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAPKKKIVKKNKGDINEMTIIVEDSPLNKLNALNGLLEGGNGLSCISSELTDASYGPNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MAPKKKIVKKNKGDINEMTIIVEDSPLNKLNALNGLLEGGNGLSCISSELTDASYGPNLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 EGLSKMRQENFLCDLVIGTKTKSFDVHKSVMASCSEYFYNILKKDPSIQRVDLNDISPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EGLSKMRQENFLCDLVIGTKTKSFDVHKSVMASCSEYFYNILKKDPSIQRVDLNDISPLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LATVIAYAYTGKLTLSLYTIGSIISAAVYLQIHTLIKMCSDFLIREMSVENCMYVVNIAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
XP_005 LATVIAYAYTGKLTLSLYTIGSIISAAVYLQIHTLVKMCSDFLIREMSVENCMYVVNIAE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TYSLKNAKAAAQKFIRDNFLEFAESDQFMKLTFEQINELLIDDDLQLPSEIVAFQIAMKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TYSLKNAKAAAQKFIRDNFLEFAESDQFMKLTFEQINELLIDDDLQLPSEIVAFQIAMKW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LEFDQKRVKYAADLLSNIRFGTISAQDLVNYVQSVPRMMQDADCHRLLVDAMNYHLLPYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LEFDQKRVKYAADLLSNIRFGTISAQDLVNYVQSVPRMMQDADCHRLLVDAMNYHLLPYH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QNTLQSRRTRIRGGCRVLVTVGGRPGLTEKSLSRDILYRDPENGWSKLTEMPAKSFNQCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QNTLQSRRTRIRGGCRVLVTVGGRPGLTEKSLSRDILYRDPENGWSKLTEMPAKSFNQCV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 AVMDGFLYVAGGEDQNDARNQAKHAVSNFCRYDPRFNTWIHLASMNQKRTHFSLSVFNGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AVMDGFLYVAGGEDQNDARNQAKHAVSNFCRYDPRFNTWIHLASMNQKRTHFSLSVFNGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 VYAAGGRNAEGSLASLECYVPSTNQWQPKTPLEVARCCHASAVADGRVLVTGGYIANAYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VYAAGGRNAEGSLASLECYVPSTNQWQPKTPLEVARCCHASAVADGRVLVTGGYIANAYS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 RSVCAYDPASDSWQELPNLSTPRGWHCAVTLSDRVYVMGGSQLGPRGERVDVLTVECYSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RSVCAYDPASDSWQELPNLSTPRGWHCAVTLSDRVYVMGGSQLGPRGERVDVLTVECYSP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 ATGQWSYAAPLQVGVSTAGVSALHGRAYLVGGWNEGEKKYKKCIQCFSPELNEWTEDDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ATGQWSYAAPLQVGVSTAGVSALHGRAYLVGGWNEGEKKYKKCIQCFSPELNEWTEDDEL
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE4 PEATVGVSCCTLSMPNNVTRESRASSVSSVPVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PEATVGVSCCTLSMPNNVTRESRASSVSSVPVSI
610 620 630
>>NP_061335 (OMIM: 611201) kelch-like protein 9 [Homo sa (617 aa)
initn: 1332 init1: 614 opt: 1325 Z-score: 1505.0 bits: 288.6 E(85289): 4.3e-77
Smith-Waterman score: 1325; 35.6% identity (68.5% similar) in 593 aa overlap (50-628:27-614)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 IIVEDSPLNKLNALNGLLEGGNGLSCISSELTDASYGPNLLEGLSKMRQENFLCD--LVI
.:. ... .:.:....: :..::: ::
NP_061 MKVSLGNGEMGVSAHLQPCKAGTTRFFTSNTHSSVVLQGFDQLRIEGLLCDVTLVP
10 20 30 40 50
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XP_016 DDVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDP
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pF1KE4 ELNEWTEDDELPEATVGVSCCTLSM--PNNVT-RESRASSVSSVPVSI
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XP_016 DKDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
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pF1KE4 THFSLSVFNGLVYAAGGRNAEGSLASLECYVPSTNQWQPKTPLEVARCCHASAVADGRVL
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NP_001 TFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMY
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pF1KE4 VTGGYIANAYSRSVCAYDPASDSWQELPNLSTPRGWHCAVTLSDRVYVMGGSQLGPRGER
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NP_001 ISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]