Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4169
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4169, 621 aa
1>>>pF1KE4169 621 - 621 aa - 621 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3109+/-0.000447; mu= 18.9506+/- 0.028
mean_var=79.5340+/-15.912, 0's: 0 Z-trim(111.3): 347 B-trim: 389 in 1/51
Lambda= 0.143813
statistics sampled from 19524 (19923) to 19524 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.234), width: 16
Scan time: 11.100
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_689606 (OMIM: 615340,615348) kelch-like protein ( 621) 4131 867.6 0
NP_006054 (OMIM: 607701,615731) kelch-like protein ( 606) 1328 286.0 2.6e-76
NP_001026880 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-li ( 586) 626 140.3 1.8e-32
XP_016867928 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 564) 621 139.3 3.5e-32
NP_061334 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-like ( 538) 613 137.6 1.1e-31
NP_036421 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 552 125.0 7.8e-28
XP_005260230 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 552 125.0 7.8e-28
NP_987096 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 552 125.0 7.8e-28
XP_011526754 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 552 125.0 7.8e-28
XP_005260231 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 552 125.0 7.8e-28
NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718) 539 122.3 5.6e-27
NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720) 539 122.4 5.6e-27
NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 519 118.1 8.3e-26
NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 519 118.2 9.9e-26
NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 519 118.2 1e-25
XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 519 118.2 1.1e-25
XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 519 118.2 1.1e-25
XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 519 118.2 1.1e-25
XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 519 118.2 1.1e-25
XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 789) 519 118.2 1.1e-25
XP_016863762 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 519 118.2 1.1e-25
XP_011512001 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 519 118.2 1.1e-25
XP_016863763 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 519 118.2 1.1e-25
XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 575) 510 116.3 3.1e-25
NP_065917 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 isof ( 748) 510 116.3 3.8e-25
NP_055666 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 iso ( 597) 499 114.0 1.5e-24
XP_005247609 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 491 112.3 4.9e-24
XP_005247611 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 491 112.3 4.9e-24
NP_060114 (OMIM: 611295) kelch-like protein 24 [Ho ( 600) 491 112.3 4.9e-24
XP_005247613 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 491 112.3 4.9e-24
XP_011511240 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 491 112.3 4.9e-24
XP_005247612 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 491 112.3 4.9e-24
XP_005247610 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 491 112.3 4.9e-24
XP_016862148 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 491 112.3 4.9e-24
XP_016862149 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 491 112.3 4.9e-24
NP_001273654 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 i ( 687) 470 108.0 1.1e-22
XP_016867929 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 325) 461 105.9 2.3e-22
NP_001311238 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 ( 500) 461 106.0 3.2e-22
XP_016876168 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 525) 460 105.9 3.8e-22
XP_016867930 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 303) 456 104.8 4.4e-22
NP_950240 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 694) 452 104.3 1.5e-21
NP_115894 (OMIM: 616607) kelch repeat and BTB doma ( 601) 444 102.6 4.2e-21
NP_001290038 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 467) 432 100.0 1.9e-20
XP_011508139 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 522) 432 100.0 2.1e-20
XP_016863164 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 415) 426 98.7 4.2e-20
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 426 98.8 5.3e-20
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 426 98.8 5.5e-20
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 426 98.8 5.6e-20
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 425 98.7 6.7e-20
XP_011511576 (OMIM: 614214) PREDICTED: kelch-like ( 327) 418 97.0 1.1e-19
>>NP_689606 (OMIM: 615340,615348) kelch-like protein 40 (621 aa)
initn: 4131 init1: 4131 opt: 4131 Z-score: 4633.9 bits: 867.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4131; 100.0% identity (100.0% similar) in 621 aa overlap (1-621:1-621)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MALGLEQAEEQRLYQQTLLQDGLKDMLDHGKFLDCVVRAGEREFPCHRLVLAACSPYFRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 MALGLEQAEEQRLYQQTLLQDGLKDMLDHGKFLDCVVRAGEREFPCHRLVLAACSPYFRA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RFLAEPERAGELHLEEVSPDVVAQVLHYLYTSEIALDEASVQDLFAAAHRFQIPSIFTIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 RFLAEPERAGELHLEEVSPDVVAQVLHYLYTSEIALDEASVQDLFAAAHRFQIPSIFTIC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VSFLQKRLCLSNCLAVFRLGLLLDCARLAVAARDFICAHFTLVARDADFLGLSADELIAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 VSFLQKRLCLSNCLAVFRLGLLLDCARLAVAARDFICAHFTLVARDADFLGLSADELIAI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ISSDGLNVEKEEAVFEAVMRWAGSGDAEAQAERQRALPTVFESVRCRLLPRAFLESRVER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 ISSDGLNVEKEEAVFEAVMRWAGSGDAEAQAERQRALPTVFESVRCRLLPRAFLESRVER
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 HPLVRAQPELLRKVQMVKDAHEGRITTLRKKKKGKDGAGAKEADKGTSKAKAEEDEEAER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 HPLVRAQPELLRKVQMVKDAHEGRITTLRKKKKGKDGAGAKEADKGTSKAKAEEDEEAER
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 ILPGILNDTLRFGMFLQDLIFMISEEGAVAYDPAANECYCASLSNQVPKNHVSLVTKENQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 ILPGILNDTLRFGMFLQDLIFMISEEGAVAYDPAANECYCASLSNQVPKNHVSLVTKENQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 VFVAGGLFYNEDNKEDPMSAYFLQFDHLDSEWLGMPPLPSPRCLFGLGEALNSIYVVGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 VFVAGGLFYNEDNKEDPMSAYFLQFDHLDSEWLGMPPLPSPRCLFGLGEALNSIYVVGGR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 EIKDGERCLDSVMCYDRLSFKWGESDPLPYVVYGHTVLSHMDLVYVIGGKGSDRKCLNKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 EIKDGERCLDSVMCYDRLSFKWGESDPLPYVVYGHTVLSHMDLVYVIGGKGSDRKCLNKM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 CVYDPKKFEWKELAPMQTARSLFGATVHDGRIIVAAGVTDTGLTSSAEVYSITDNKWAPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 CVYDPKKFEWKELAPMQTARSLFGATVHDGRIIVAAGVTDTGLTSSAEVYSITDNKWAPF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 EAFPQERSSLSLVSLVGTLYAIGGFATLETESGELVPTELNDIWRYNEEEKKWEGVLREI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 EAFPQERSSLSLVSLVGTLYAIGGFATLETESGELVPTELNDIWRYNEEEKKWEGVLREI
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KE4 AYAAGATFLPVRLNVLCLTKM
:::::::::::::::::::::
NP_689 AYAAGATFLPVRLNVLCLTKM
610 620
>>NP_006054 (OMIM: 607701,615731) kelch-like protein 41 (606 aa)
initn: 2269 init1: 780 opt: 1328 Z-score: 1491.0 bits: 286.0 E(85289): 2.6e-76
Smith-Waterman score: 2246; 51.1% identity (81.4% similar) in 618 aa overlap (6-621:6-606)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MALGLEQAEEQRLYQQTLLQDGLKDMLDHGKFLDCVVRAGEREFPCHRLVLAACSPYFRA
: ::: ::::.:::::::::.::. ::.::...::.. .:::::.:.:::::::
NP_006 MDSQRELAEELRLYQSTLLQDGLKDLLDEKKFIDCTLKAGDKSLPCHRLILSACSPYFRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE4 RFLAEPERAG--ELHLEEVSPDVVAQVLHYLYTSEIALDEASVQDLFAAAHRFQIPSIFT
::.: ..: :. :..:.: .. ...:::.. : :....:::.:: : ::::::.::
NP_006 YFLSEIDEAKKKEVVLDNVDPAILDLIIKYLYSASIDLNDGNVQDIFALASRFQIPSVFT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 ICVSFLQKRLCLSNCLAVFRLGLLLDCARLAVAARDFICAHFTLVARDADFLGLSADELI
.:::.::::: .::::..:::::::: :::..::.:. .:. . .. ::. :: .:::
NP_006 VCVSYLQKRLAPGNCLAILRLGLLLDCPRLAISAREFVSDRFVQICKEEDFMQLSPQELI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 AIISSDGLNVEKEEAVFEAVMRWAGSGDAEAQAERQRALPTVFESVRCRLLPRAFLESRV
..::.:.::::::::::::::.:. . : : .: . : ::. .: ::. . .....:
NP_006 SVISNDSLNVEKEEAVFEAVMKWVRT-DKE---NRVKNLSEVFDCIRFRLMTEKYFKDHV
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ERHPLVRAQPELLRKVQMVKDAHEGRITTLRKKKKGKDGAGAKEADKGTSKAKAEEDEEA
:. .....:.: .:....::: :.. .:. .: ::: ..: : .::
NP_006 EKDDIIKSNPDLQKKIKVLKDAFAGKLPE-PSKNAAKTGAGEVNGDVG------DED---
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 ERILPGILNDTLRFGMFLQDLIFMISEEGAVAYDPAANECYCASLSNQVPKNHVSLVTKE
.::: ::: : :::..:::..... .::::::. :::: ..:..:.:.:: :.::..
NP_006 --LLPGYLNDIPRHGMFVKDLILLVNDTAAVAYDPTENECYLTALAEQIPRNHSSIVTQQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 NQVFVAGGLFYNEDNKEDPMSAYFLQFDHLDSEWLGMPPLPSPRCLFGLGEALNSIYVVG
::..:.:::. .:.::..:...::.:.: . :::.:.::::: ::::::::. ..::::.
NP_006 NQIYVVGGLYVDEENKDQPLQSYFFQLDSIASEWVGLPPLPSARCLFGLGEVDDKIYVVA
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 GREIKDGERCLDSVMCYDRLSFKWGESDPLPYVVYGHTVLSHMDLVYVIGGKGSDRKCLN
:.... : ::::.::: .. ::.: :: ::::.:.:: ..: .::: .:.:: :
NP_006 GKDLQT-EASLDSVLCYDPVAAKWNEVKKLPIKVYGHNVISHKGMIYCLGGKTDDKKCTN
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 KMCVYDPKKFEWKELAPMQTARSLFGATVHDGRIIVAAGVTDTGLTSSAEVYSITDNKWA
.. ...::: .::.::::. ::.::..:: :.:..:.:::. ::..:.:....: :::
NP_006 RVFIFNPKKGDWKDLAPMKIPRSMFGVAVHKGKIVIAGGVTEDGLSASVEAFDLTTNKWD
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 PFEAFPQERSSLSLVSLVGTLYAIGGFATLETESGELVPTELNDIWRYNEEEKKWEGVLR
. :::::::.:::::.:.:::::::: .. :: :..:::.::::.:....:.: :.:.
NP_006 VMTEFPQERSSISLVSLAGSLYAIGGFAMIQLESKEFAPTEVNDIWKYEDDKKEWAGMLK
530 540 550 560 570 580
600 610 620
pF1KE4 EIAYAAGATFLPVRLNVLCLTKM
:: ::.::. : .:::.. :.:.
NP_006 EIRYASGASCLATRLNLFKLSKL
590 600
>>NP_001026880 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-like p (586 aa)
initn: 704 init1: 326 opt: 626 Z-score: 704.1 bits: 140.3 E(85289): 1.8e-32
Smith-Waterman score: 638; 26.2% identity (55.2% similar) in 603 aa overlap (23-618:34-573)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MALGLEQAEEQRLYQQTLLQDGLKDMLDHGKFLDCVVRAGEREFPCHRLVLA
...: . . : .. . ::..: ::.:::
NP_001 SGVEKSSKKKTEKKLAAREEAKLLAGFMGVMNNMRKQKTLCDVILMVQERKIPAHRVVLA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 ACSPYFRARFLAE--PERAGELHLEEVSPDVVAQVLHYLYTSEIALDEASVQDLFAAAHR
: : .: : .. .. :..:... ::.. :.... ::..:... .::.:. ::..
NP_001 AASHFFNLMFTTNMLESKSFEVELKDAEPDIIEQLVEFAYTARISVNSNNVQSLLDAANQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 FQIPSIFTICVSFLQKRLCLSNCLAVFRLGLLLDCARLAVAARDFICAHFTLVARDADFL
.:: . .::.::.... ::::.. :. ::: .: ..: ::: ::: : . .::
NP_001 YQIEPVKKMCVDFLKEQVDASNCLGISVLAECLDCPELKATADDFIHQHFTEVYKTDEFL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GLSADELIAIISSDGLNVEKEEAVFEAVMRWAGSGDAEAQAERQRALPTVFESVRCRLLP
:.. .. ....: :.:. :. :..:..:: . . :: . .. .:: :.
NP_001 QLDVKRVTHLLNQDTLTVRAEDQVYDAAVRWLKYDEPN----RQPFMVDILAKVRFPLIS
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 RAFLESRVERHPLVRAQPELLRKVQMVKDAHEGRITTLRKKKKGKDGAGAKEADKGTSKA
. :: . :. .::.. .:: :. :: .. . .. . . ... :: ..
NP_001 KNFLSKTVQAEPLIQDNPECLK---MVISGMRYHLLSPEDREELVDG----------TRP
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 KAEEDEEAERILPGILNDTLRFGMFLQDLIFMISEEGAVAYDPAANECYCASLSNQVPKN
. .. . .. : .. :. : : . .. : . .
NP_001 RRKKHDYRIALFGGSQPQSCRY--------FN-------PKDYSWTDIRCPFEK----RR
290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KE4 HVSLVTKENQVFVAGG--LFYNEDNKEDPMSAYFLQFDHLDSEWLGMPPLPSPRCLFGLG
.. : .: :.. :: :: . :. : . : :. :: : :.:: ..
NP_001 DAACVFWDNVVYILGGSQLFPIKR-----MDCYNVVKDSWYSK-LG-P--PTPRDSLAAC
330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 EALNSIYVVGGREIKDGERCLDSVMCYDRLSFKWGESDPLPYVVYGHTVLSHMDLVYVIG
: ..::. :: :. :. : ::: . .: . . .: .. :.:: :
NP_001 AAEGKIYTSGGSEV--GNSALYLFECYDTRTESWHTKPSMLTQRCSHGMVEANGLIYVCG
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 GK-GSDR--KCLNKMCVYDPKKFEWKELAPMQTARSLFGATVHDGRIIVAAGVTDTGLTS
:. :.. . ::. :::: : :: :: ::. : . .:....: . : .
NP_001 GSLGNNVSGRVLNSCEVYDPATETWTELCPMIEARKNHGLVFVKDKIFAVGGQNGLGGLD
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 SAEVYSITDNKWAPFEAFPQERSSLSLVSLVGTLYAIGGFATLETESGELVPTELNDIWR
..: :.: :.: .: . ... ... . .:...:: . :.: . : .
NP_001 NVEYYDIKLNEWKMVSPMPWKGVTVKCAAVGSIVYVLAGFQGV----GRL-----GHILE
500 510 520 530 540
590 600 610 620
pF1KE4 YNEEEKKWEGVLREIAYAAGATFLPVRLNVLCLTKM
:: : :: .: . .: :: ..:.
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: .. . ::..: ::.:::: : .: :
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.. .. :..:... ::.. :.... ::..:... .::.:. ::...:: . .::
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.::.... ::::.. :. ::: .: ..: ::: ::: : . .:: :.. .. ..
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..: :.:. :. :..:..:: . .:: . .. .:: :. . :: . :. .
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::.. .:: :. :: .. . .. . . ... :: .. . .. . .
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::. :::: : :: :: ::. : . .:....: . : ...: :.: :.
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: .: . ... ... . .:...:: . :.: . : .:: : ::
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:: : :: :: ::. : . .:....: . : ...: :.: :.: .
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520 530
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40 50 60 70 80
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]