FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4169, 621 aa
1>>>pF1KE4169 621 - 621 aa - 621 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5252+/-0.000981; mu= 17.8334+/- 0.059
mean_var=73.9347+/-14.331, 0's: 0 Z-trim(105.1): 154 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.149159
statistics sampled from 8070 (8238) to 8070 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16
Scan time: 3.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2703.1 KLHL40 gene_id:131377|Hs108|chr3 ( 621) 4131 898.8 0
CCDS2234.1 KLHL41 gene_id:10324|Hs108|chr2 ( 606) 1328 295.7 1.2e-79
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 626 144.6 3.5e-34
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 538) 613 141.8 2.3e-33
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19 ( 624) 552 128.7 2.3e-29
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 718) 539 125.9 1.8e-28
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 539 125.9 1.8e-28
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 519 121.5 3e-27
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 519 121.6 3.5e-27
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 519 121.6 3.7e-27
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 513 120.3 8e-27
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 510 119.7 1.4e-26
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 499 117.3 6.1e-26
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 ( 600) 491 115.5 2e-25
CCDS2236.1 KLHL23 gene_id:151230|Hs108|chr2 ( 558) 487 114.7 3.4e-25
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 ( 609) 484 114.0 5.8e-25
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 482 113.6 7.5e-25
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 687) 470 111.1 5.2e-24
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 452 107.2 7.6e-23
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 449 106.5 1e-22
CCDS2906.2 KBTBD8 gene_id:84541|Hs108|chr3 ( 601) 444 105.4 2.2e-22
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8 ( 581) 439 104.3 4.6e-22
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11 ( 583) 428 102.0 2.4e-21
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 426 101.5 3.2e-21
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 426 101.5 3.3e-21
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 420 100.2 7.7e-21
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 420 100.3 7.8e-21
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 418 99.8 1.1e-20
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 417 99.6 1.2e-20
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 417 99.6 1.2e-20
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15 ( 589) 416 99.4 1.4e-20
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 589) 410 98.1 3.5e-20
CCDS34614.1 KBTBD2 gene_id:25948|Hs108|chr7 ( 623) 409 97.9 4.3e-20
CCDS33848.2 KBTBD12 gene_id:166348|Hs108|chr3 ( 623) 407 97.5 5.7e-20
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 404 96.8 8.3e-20
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2 ( 875) 391 94.1 8.2e-19
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16 ( 597) 375 90.6 6.5e-18
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 620) 370 89.5 1.4e-17
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 355 86.3 1.3e-16
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 350 85.2 2.7e-16
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 350 85.2 2.7e-16
CCDS11411.1 KLHL11 gene_id:55175|Hs108|chr17 ( 708) 349 85.0 3.6e-16
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 343 83.7 8.1e-16
CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 553) 336 82.2 2.1e-15
CCDS8334.1 KBTBD3 gene_id:143879|Hs108|chr11 ( 612) 334 81.8 3e-15
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 329 80.6 5.4e-15
CCDS1368.1 IVNS1ABP gene_id:10625|Hs108|chr1 ( 642) 330 80.9 5.7e-15
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 328 80.4 6.3e-15
CCDS9377.1 KBTBD7 gene_id:84078|Hs108|chr13 ( 684) 316 77.9 4.9e-14
CCDS9376.1 KBTBD6 gene_id:89890|Hs108|chr13 ( 674) 315 77.7 5.6e-14
>>CCDS2703.1 KLHL40 gene_id:131377|Hs108|chr3 (621 aa)
initn: 4131 init1: 4131 opt: 4131 Z-score: 4803.0 bits: 898.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4131; 100.0% identity (100.0% similar) in 621 aa overlap (1-621:1-621)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MALGLEQAEEQRLYQQTLLQDGLKDMLDHGKFLDCVVRAGEREFPCHRLVLAACSPYFRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MALGLEQAEEQRLYQQTLLQDGLKDMLDHGKFLDCVVRAGEREFPCHRLVLAACSPYFRA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RFLAEPERAGELHLEEVSPDVVAQVLHYLYTSEIALDEASVQDLFAAAHRFQIPSIFTIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 RFLAEPERAGELHLEEVSPDVVAQVLHYLYTSEIALDEASVQDLFAAAHRFQIPSIFTIC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VSFLQKRLCLSNCLAVFRLGLLLDCARLAVAARDFICAHFTLVARDADFLGLSADELIAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 VSFLQKRLCLSNCLAVFRLGLLLDCARLAVAARDFICAHFTLVARDADFLGLSADELIAI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ISSDGLNVEKEEAVFEAVMRWAGSGDAEAQAERQRALPTVFESVRCRLLPRAFLESRVER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ISSDGLNVEKEEAVFEAVMRWAGSGDAEAQAERQRALPTVFESVRCRLLPRAFLESRVER
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 HPLVRAQPELLRKVQMVKDAHEGRITTLRKKKKGKDGAGAKEADKGTSKAKAEEDEEAER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 HPLVRAQPELLRKVQMVKDAHEGRITTLRKKKKGKDGAGAKEADKGTSKAKAEEDEEAER
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 ILPGILNDTLRFGMFLQDLIFMISEEGAVAYDPAANECYCASLSNQVPKNHVSLVTKENQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ILPGILNDTLRFGMFLQDLIFMISEEGAVAYDPAANECYCASLSNQVPKNHVSLVTKENQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 VFVAGGLFYNEDNKEDPMSAYFLQFDHLDSEWLGMPPLPSPRCLFGLGEALNSIYVVGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 VFVAGGLFYNEDNKEDPMSAYFLQFDHLDSEWLGMPPLPSPRCLFGLGEALNSIYVVGGR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 EIKDGERCLDSVMCYDRLSFKWGESDPLPYVVYGHTVLSHMDLVYVIGGKGSDRKCLNKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 EIKDGERCLDSVMCYDRLSFKWGESDPLPYVVYGHTVLSHMDLVYVIGGKGSDRKCLNKM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 CVYDPKKFEWKELAPMQTARSLFGATVHDGRIIVAAGVTDTGLTSSAEVYSITDNKWAPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 CVYDPKKFEWKELAPMQTARSLFGATVHDGRIIVAAGVTDTGLTSSAEVYSITDNKWAPF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 EAFPQERSSLSLVSLVGTLYAIGGFATLETESGELVPTELNDIWRYNEEEKKWEGVLREI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 EAFPQERSSLSLVSLVGTLYAIGGFATLETESGELVPTELNDIWRYNEEEKKWEGVLREI
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KE4 AYAAGATFLPVRLNVLCLTKM
:::::::::::::::::::::
CCDS27 AYAAGATFLPVRLNVLCLTKM
610 620
>>CCDS2234.1 KLHL41 gene_id:10324|Hs108|chr2 (606 aa)
initn: 2269 init1: 780 opt: 1328 Z-score: 1543.3 bits: 295.7 E(32554): 1.2e-79
Smith-Waterman score: 2246; 51.1% identity (81.4% similar) in 618 aa overlap (6-621:6-606)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MALGLEQAEEQRLYQQTLLQDGLKDMLDHGKFLDCVVRAGEREFPCHRLVLAACSPYFRA
: ::: ::::.:::::::::.::. ::.::...::.. .:::::.:.:::::::
CCDS22 MDSQRELAEELRLYQSTLLQDGLKDLLDEKKFIDCTLKAGDKSLPCHRLILSACSPYFRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE4 RFLAEPERAG--ELHLEEVSPDVVAQVLHYLYTSEIALDEASVQDLFAAAHRFQIPSIFT
::.: ..: :. :..:.: .. ...:::.. : :....:::.:: : ::::::.::
CCDS22 YFLSEIDEAKKKEVVLDNVDPAILDLIIKYLYSASIDLNDGNVQDIFALASRFQIPSVFT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 ICVSFLQKRLCLSNCLAVFRLGLLLDCARLAVAARDFICAHFTLVARDADFLGLSADELI
.:::.::::: .::::..:::::::: :::..::.:. .:. . .. ::. :: .:::
CCDS22 VCVSYLQKRLAPGNCLAILRLGLLLDCPRLAISAREFVSDRFVQICKEEDFMQLSPQELI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 AIISSDGLNVEKEEAVFEAVMRWAGSGDAEAQAERQRALPTVFESVRCRLLPRAFLESRV
..::.:.::::::::::::::.:. . : : .: . : ::. .: ::. . .....:
CCDS22 SVISNDSLNVEKEEAVFEAVMKWVRT-DKE---NRVKNLSEVFDCIRFRLMTEKYFKDHV
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ERHPLVRAQPELLRKVQMVKDAHEGRITTLRKKKKGKDGAGAKEADKGTSKAKAEEDEEA
:. .....:.: .:....::: :.. .:. .: ::: ..: : .::
CCDS22 EKDDIIKSNPDLQKKIKVLKDAFAGKLPE-PSKNAAKTGAGEVNGDVG------DED---
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 ERILPGILNDTLRFGMFLQDLIFMISEEGAVAYDPAANECYCASLSNQVPKNHVSLVTKE
.::: ::: : :::..:::..... .::::::. :::: ..:..:.:.:: :.::..
CCDS22 --LLPGYLNDIPRHGMFVKDLILLVNDTAAVAYDPTENECYLTALAEQIPRNHSSIVTQQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 NQVFVAGGLFYNEDNKEDPMSAYFLQFDHLDSEWLGMPPLPSPRCLFGLGEALNSIYVVG
::..:.:::. .:.::..:...::.:.: . :::.:.::::: ::::::::. ..::::.
CCDS22 NQIYVVGGLYVDEENKDQPLQSYFFQLDSIASEWVGLPPLPSARCLFGLGEVDDKIYVVA
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 GREIKDGERCLDSVMCYDRLSFKWGESDPLPYVVYGHTVLSHMDLVYVIGGKGSDRKCLN
:.... : ::::.::: .. ::.: :: ::::.:.:: ..: .::: .:.:: :
CCDS22 GKDLQT-EASLDSVLCYDPVAAKWNEVKKLPIKVYGHNVISHKGMIYCLGGKTDDKKCTN
410 420 430 440 450 460
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pF1KE4 KMCVYDPKKFEWKELAPMQTARSLFGATVHDGRIIVAAGVTDTGLTSSAEVYSITDNKWA
.. ...::: .::.::::. ::.::..:: :.:..:.:::. ::..:.:....: :::
CCDS22 RVFIFNPKKGDWKDLAPMKIPRSMFGVAVHKGKIVIAGGVTEDGLSASVEAFDLTTNKWD
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 PFEAFPQERSSLSLVSLVGTLYAIGGFATLETESGELVPTELNDIWRYNEEEKKWEGVLR
. :::::::.:::::.:.:::::::: .. :: :..:::.::::.:....:.: :.:.
CCDS22 VMTEFPQERSSISLVSLAGSLYAIGGFAMIQLESKEFAPTEVNDIWKYEDDKKEWAGMLK
530 540 550 560 570 580
600 610 620
pF1KE4 EIAYAAGATFLPVRLNVLCLTKM
:: ::.::. : .:::.. :.:.
CCDS22 EIRYASGASCLATRLNLFKLSKL
590 600
>>CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 (586 aa)
initn: 704 init1: 326 opt: 626 Z-score: 727.1 bits: 144.6 E(32554): 3.5e-34
Smith-Waterman score: 638; 26.2% identity (55.2% similar) in 603 aa overlap (23-618:34-573)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MALGLEQAEEQRLYQQTLLQDGLKDMLDHGKFLDCVVRAGEREFPCHRLVLA
...: . . : .. . ::..: ::.:::
CCDS34 SGVEKSSKKKTEKKLAAREEAKLLAGFMGVMNNMRKQKTLCDVILMVQERKIPAHRVVLA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 ACSPYFRARFLAE--PERAGELHLEEVSPDVVAQVLHYLYTSEIALDEASVQDLFAAAHR
: : .: : .. .. :..:... ::.. :.... ::..:... .::.:. ::..
CCDS34 AASHFFNLMFTTNMLESKSFEVELKDAEPDIIEQLVEFAYTARISVNSNNVQSLLDAANQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 FQIPSIFTICVSFLQKRLCLSNCLAVFRLGLLLDCARLAVAARDFICAHFTLVARDADFL
.:: . .::.::.... ::::.. :. ::: .: ..: ::: ::: : . .::
CCDS34 YQIEPVKKMCVDFLKEQVDASNCLGISVLAECLDCPELKATADDFIHQHFTEVYKTDEFL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GLSADELIAIISSDGLNVEKEEAVFEAVMRWAGSGDAEAQAERQRALPTVFESVRCRLLP
:.. .. ....: :.:. :. :..:..:: . . :: . .. .:: :.
CCDS34 QLDVKRVTHLLNQDTLTVRAEDQVYDAAVRWLKYDEPN----RQPFMVDILAKVRFPLIS
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 RAFLESRVERHPLVRAQPELLRKVQMVKDAHEGRITTLRKKKKGKDGAGAKEADKGTSKA
. :: . :. .::.. .:: :. :: .. . .. . . ... :: ..
CCDS34 KNFLSKTVQAEPLIQDNPECLK---MVISGMRYHLLSPEDREELVDG----------TRP
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 KAEEDEEAERILPGILNDTLRFGMFLQDLIFMISEEGAVAYDPAANECYCASLSNQVPKN
. .. . .. : .. :. : : . .. : . .
CCDS34 RRKKHDYRIALFGGSQPQSCRY--------FN-------PKDYSWTDIRCPFEK----RR
290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KE4 HVSLVTKENQVFVAGG--LFYNEDNKEDPMSAYFLQFDHLDSEWLGMPPLPSPRCLFGLG
.. : .: :.. :: :: . :. : . : :. :: : :.:: ..
CCDS34 DAACVFWDNVVYILGGSQLFPIKR-----MDCYNVVKDSWYSK-LG-P--PTPRDSLAAC
330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 EALNSIYVVGGREIKDGERCLDSVMCYDRLSFKWGESDPLPYVVYGHTVLSHMDLVYVIG
: ..::. :: :. :. : ::: . .: . . .: .. :.:: :
CCDS34 AAEGKIYTSGGSEV--GNSALYLFECYDTRTESWHTKPSMLTQRCSHGMVEANGLIYVCG
380 390 400 410 420 430
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pF1KE4 GK-GSDR--KCLNKMCVYDPKKFEWKELAPMQTARSLFGATVHDGRIIVAAGVTDTGLTS
:. :.. . ::. :::: : :: :: ::. : . .:....: . : .
CCDS34 GSLGNNVSGRVLNSCEVYDPATETWTELCPMIEARKNHGLVFVKDKIFAVGGQNGLGGLD
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560 570 580
pF1KE4 SAEVYSITDNKWAPFEAFPQERSSLSLVSLVGTLYAIGGFATLETESGELVPTELNDIWR
..: :.: :.: .: . ... ... . .:...:: . :.: . : .
CCDS34 NVEYYDIKLNEWKMVSPMPWKGVTVKCAAVGSIVYVLAGFQGV----GRL-----GHILE
500 510 520 530 540
590 600 610 620
pF1KE4 YNEEEKKWEGVLREIAYAAGATFLPVRLNVLCLTKM
:: : :: .: . .: :: ..:.
CCDS34 YNTETDKW------VANSKVRAF-PVTSCLICVVDTCGANEETLET
550 560 570 580
>>CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 (538 aa)
initn: 704 init1: 326 opt: 613 Z-score: 712.5 bits: 141.8 E(32554): 2.3e-33
Smith-Waterman score: 625; 26.7% identity (55.2% similar) in 585 aa overlap (41-618:4-525)
20 30 40 50 60
pF1KE4 QRLYQQTLLQDGLKDMLDHGKFLDCVVRAGEREFPCHRLVLAACSPYFRARFLAE--PER
::..: ::.:::: : .: : .. .
CCDS53 MVQERKIPAHRVVLAAASHFFNLMFTTNMLESK
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AGELHLEEVSPDVVAQVLHYLYTSEIALDEASVQDLFAAAHRFQIPSIFTICVSFLQKRL
. :..:... ::.. :.... ::..:... .::.:. ::...:: . .::.::....
CCDS53 SFEVELKDAEPDIIEQLVEFAYTARISVNSNNVQSLLDAANQYQIEPVKKMCVDFLKEQV
40 50 60 70 80 90
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pF1KE4 CLSNCLAVFRLGLLLDCARLAVAARDFICAHFTLVARDADFLGLSADELIAIISSDGLNV
::::.. :. ::: .: ..: ::: ::: : . .:: :.. .. ....: :.:
CCDS53 DASNCLGISVLAECLDCPELKATADDFIHQHFTEVYKTDEFLQLDVKRVTHLLNQDTLTV
100 110 120 130 140 150
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pF1KE4 EKEEAVFEAVMRWAGSGDAEAQAERQRALPTVFESVRCRLLPRAFLESRVERHPLVRAQP
. :. :..:..:: . .:: . .. .:: :. . :: . :. .::.. .:
CCDS53 RAEDQVYDAAVRWLKYDEP----NRQPFMVDILAKVRFPLISKNFLSKTVQAEPLIQDNP
160 170 180 190 200
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pF1KE4 ELLRKVQMVKDAHEGRITTLRKKKKGKDGAGAKEADKGTSKAKAEEDEEAERILPGILND
: :. :: .. . .. . . ... :: .. . .. . .. : .
CCDS53 ECLK---MVISGMRYHLLSPEDREELVDG----------TRPRRKKHDYRIALFGGSQPQ
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pF1KE4 TLRFGMFLQDLIFMISEEGAVAYDPAANECYCASLSNQVPKNHVSLVTKENQVFVAGG--
. :. : : . .. : . . .. : .: :.. ::
CCDS53 SCRY--------FN-------PKDYSWTDIRCPFEK----RRDAACVFWDNVVYILGGSQ
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:: . :. : . : :. :: : :.:: .. : ..::. :: :. :.
CCDS53 LFPIKR-----MDCYNVVKDSWYSK-LG-P--PTPRDSLAACAAEGKIYTSGGSEV--GN
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: ::: . .: . . .: .. :.:: ::. :.. . ::. ::
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:: : :: :: ::. : . .:....: . : ...: :.: :.: .
CCDS53 DPATETWTELCPMIEARKNHGLVFVKDKIFAVGGQNGLGGLDNVEYYDIKLNEWKMVSPM
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: . ... ... . .:...:: . :.: . : .:: : :: .: .
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.: :: ..:.
CCDS53 KVRAF-PVTSCLICVVDTCGANEETLET
520 530
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10 20 30
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:.:. .: :: :: : :. . :
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40 50 60 70 80
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. : : .: :..:::. :: :.: : .. : . .: . : :. .....
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90 100 110 120 130 140
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::. :.. : : .. .: .:: :. : .:: ..: :: ... .. . :..:
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150 160 170 180 190 200
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::..: :: ::.. .:..:: .:...:: : :::. : ::.: . :. . : :
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210 220 230 240 250 260
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.:. . .....:::. : ::. .... .. : . :.. . . . ..
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270 280 290 300 310 320
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: : :. ..: . . . .: : :. . . : . :..
CCDS12 MPCRAPKVGRLIYTAGGYFRQSLSYLEAYNPSDGTWLRLADLQVPRSGLAGCVVGGLLYA
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330 340 350 360
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. : .: . : .: .:: :: .: ::.:.... . .......::
CCDS12 VGGRNNSPDGNT--DSSALDCYNPMTNQWSPCAPMS--VPRNRIGVGVIDGHIYAVGGSH
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370 380 390 400 410 420
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. .: .. .: .:: . :. . : .:.: : :: . :.:::
CCDS12 GCIHHNSVERYEPER----------DEWHLVAPMLTRR--IGVGVAVLNRLLYAVGGF--
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430 440 450 460 470 480
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:: :.:. :: .: . . : : . .:. :: :.:. ::..
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490 500 510 520 530 540
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:: . : .:::. :: .: :::.::: : .: . .:.: :. . :.
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550 560 570 580 590 600
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. . ::....
CCDS12 RMTSGRSGVGVAVTMEPCRKQIDQQNCTC
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10 20 30 40
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.:.::: .:. ... .: .:: :.: ::::.. .: :..: .:. . ::
CCDS14 SLLAAACLLQLTQVIDVCSNFLIKQLHPSNCLGIRSFGDAQGCTELLNVAHKYTMEHFIE
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: .. .:: : :.:. .. :: .:: ::..:.:.:.:.: :.. .:: : ..
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.: ::: .: . .: . .. : :.. : ... . . . : .:.
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:: :. .: :::. . . . . : .: :.::. . : : . ...:
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. . . ::. ... . .: .. ....: :. ....:: .: : :.
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.. : : : . . .:: :. :..:..::: :: :: :. .: .
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::. :. : : .. ..::.::. . . .: ... :: :::: :. .
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::... :. .. .. :..: ...: :. :.:
CCDS14 APLSVPRDAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKEEVPVNIGRAGACVV
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CCDS14 VVKLP
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10 20 30 40
pF1KE4 MALGLEQAEEQRLYQQTLLQDGLKDMLDHGKFLDCVVRAGEREF
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CCDS14 EDSTARLDTQHSEDMNATRSEEQFHVINHAEQTLRK--MENYLKEKQLCDVLLIAGHLRI
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.:.::: .:. ... .: .:: :.: ::::.. .: :..: .:. . ::
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.: ::: .: . .: . .. : :.. : ... . . . : .:.
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:: :. .: :::. . . . . : .: :.::. . : : . ...:
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. . . ::. ... . .: .. ....: :. ....:: .: : :.
CCDS14 TLNTV--ECFNPVGKIWTVMPPMSTHRHGLGVATLEGPMYAVGG--------HDGWS-YL
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.. : : : . . .:: :. :..:..::: :: :: :. .: .
CCDS14 NTVERWDPEGRQWNYVASMSTPRSTVGVVALNNKLYAIGGR---DGSSCLKSMEYFDPHT
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::. :. : : .. ..::.::. . . .: ... :: :::: :. .
CCDS14 NKWSLCAPMSKRRGGVGVATYNGFLYVVGGHDAPASNHC-SRLSDCVERYDPKGDSWSTV
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CCDS14 APLSVPRDAVAVCPLGDKLYVVGGYDGHTYLNTVESYDAQRNEWKESMQELLQNFYTTQK
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pF1KE4 SLVGTLYAIGGFATLETESGELVPTELNDIWRYNEEEKKWEGVLREIAYAAGATFLPVRL
CCDS14 LKETLGH
720
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CCDS54 MEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRRIPAHRLVLSSVSDYFAA
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CCDS54 MFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIECLLSTACLLQLSQVVE
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pF1KE4 ICVSFLQKRLCLSNCLAVFRLGLLLDCARLAVAARDFICAHFTLVARDADFLGLSADELI
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CCDS54 ACCKFLMKQLHPSNCLGIRSFADAQGCTDLHKVAHNYTMEHFMEVIRNQEFVLLPASEIA
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pF1KE4 AIISSDGLNVEKEEAVFEAVMRWAGSGDAEAQAERQRALPTVFESVRCRLLPRAFLESRV
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CCDS54 KLLASDDMNIPNEETILNALLTWV-RHDLE---QRRKDLSKLLAYIRLPLLAPQFL-ADM
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pF1KE4 ERHPLVRAQPELLRKVQMVKDAH---EGR--ITTLRKK-KKGKDGA----GAKEADKG-T
: . : : . : . .. . : : : . . : : .:. :. :. .. :: :
CCDS54 ENNVLFRDDIECQKLIMEAMKYHLLPERRPMLQSPRTKPRKSTVGTLFAVGGMDSTKGAT
240 250 260 270 280 290
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pF1KE4 SKAKAEEDEEAERILPGILNDTLRFGM-FLQDLIFMIS-EEGAVAYDPAANECY---CAS
: : . . . .. . :.::. :.: ..... ..: . . . ::: .
CCDS54 SIEKYDLRTNMWTPVANMNGRRLQFGVAVLDDKLYVVGGRDGLKTLNTV--ECYNPKTKT
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pF1KE4 LSNQVP----KNHVSLVTKENQVFVAGGL----FYNEDNKEDPMSAYFLQFDHLDSEWLG
: . : .. ..... :. ....:: . : .. ::.. .:
CCDS54 WSVMPPMSTHRHGLGVAVLEGPMYAVGGHDGWSYLNTVERWDPQA----------RQWNF
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. . .:: :.. ...:.:::: :: :: :: :.: . :: . :
CCDS54 VATMSTPRSTVGVAVLSGKLYAVGGR---DGSSCLKSVECFDPHTNKWTLCAQMSKRRGG
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pF1KE4 HTVLSHMDLVYVIGGKGSDRKCLNKM---CV--YDPKKFEWKELAPMQTARSLFGATVHD
: . :.:.:::. . . :.. :: :::: : .: :. .:. :. .
CCDS54 VGVTTWNGLLYAIGGHDAPASNLTSRLSDCVERYDPKTDMWTAVASMSISRDAVGVCLLG
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.. ...: . ...:.:. :.:. . :.. .:..
CCDS54 DKLYAVGGYDGQAYLNTVEAYDPQTNEWTQVAPLCLGRAGACVVTVKL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]