FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4152, 587 aa
1>>>pF1KE4152 587 - 587 aa - 587 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3643+/-0.00128; mu= 13.3089+/- 0.076
mean_var=114.0049+/-24.185, 0's: 0 Z-trim(103.7): 242 B-trim: 94 in 2/49
Lambda= 0.120119
statistics sampled from 7269 (7557) to 7269 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.601), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16
Scan time: 2.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46856.2 ASB14 gene_id:142686|Hs108|chr3 ( 587) 3927 692.5 3.8e-199
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CCDS1846.1 ASB3 gene_id:51130|Hs108|chr2 ( 518) 544 106.2 1e-22
CCDS54361.1 ASB3 gene_id:100302652|Hs108|chr2 ( 556) 544 106.3 1.1e-22
CCDS1847.1 ASB3 gene_id:51130|Hs108|chr2 ( 445) 469 93.2 7.6e-19
CCDS46769.1 ANKRD28 gene_id:23243|Hs108|chr3 (1053) 472 94.0 1e-18
CCDS6121.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1880) 466 93.1 3.3e-18
CCDS6119.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1881) 466 93.1 3.3e-18
CCDS47849.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1897) 466 93.2 3.3e-18
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CCDS55711.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1868) 432 87.3 1.9e-16
CCDS7258.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (4377) 432 87.5 3.7e-16
CCDS44734.1 ANKK1 gene_id:255239|Hs108|chr11 ( 765) 396 80.7 7.4e-15
CCDS54796.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1863) 390 80.0 3e-14
CCDS43261.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1872) 390 80.0 3e-14
CCDS3702.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (3957) 390 80.2 5.3e-14
CCDS74619.1 ANKRD44 gene_id:91526|Hs108|chr2 ( 993) 360 74.6 6.8e-13
CCDS74908.1 ANKRD28 gene_id:23243|Hs108|chr3 ( 899) 359 74.4 7.1e-13
CCDS33355.2 ANKRD44 gene_id:91526|Hs108|chr2 ( 367) 347 72.0 1.5e-12
CCDS77164.1 ANKRD29 gene_id:147463|Hs108|chr18 ( 268) 344 71.3 1.7e-12
CCDS11879.1 ANKRD29 gene_id:147463|Hs108|chr18 ( 301) 344 71.4 1.9e-12
CCDS44920.1 ANKRD52 gene_id:283373|Hs108|chr12 (1076) 349 72.7 2.7e-12
CCDS42650.1 KIDINS220 gene_id:57498|Hs108|chr2 (1771) 350 73.0 3.5e-12
CCDS7050.2 EHMT1 gene_id:79813|Hs108|chr9 (1298) 343 71.7 6.4e-12
CCDS34003.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2352) 346 72.4 7.1e-12
CCDS68721.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2490) 346 72.4 7.4e-12
CCDS34004.1 ANKRD17 gene_id:26057|Hs108|chr4 (2603) 346 72.5 7.6e-12
CCDS6746.1 INVS gene_id:27130|Hs108|chr9 (1065) 340 71.1 7.9e-12
CCDS43372.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 ( 616) 336 70.2 8.4e-12
CCDS43371.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 ( 627) 336 70.2 8.6e-12
CCDS4225.1 ANKHD1 gene_id:54882|Hs108|chr5 (2542) 339 71.2 1.7e-11
CCDS4224.1 EIF4EBP3 gene_id:404734|Hs108|chr5 (2617) 339 71.3 1.8e-11
CCDS34908.1 TRPA1 gene_id:8989|Hs108|chr8 (1119) 332 69.8 2.2e-11
CCDS13675.1 RIPK4 gene_id:54101|Hs108|chr21 ( 784) 324 68.2 4.3e-11
CCDS54802.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1250) 325 68.6 5.4e-11
CCDS34060.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1429) 325 68.6 6e-11
>>CCDS46856.2 ASB14 gene_id:142686|Hs108|chr3 (587 aa)
initn: 3927 init1: 3927 opt: 3927 Z-score: 3688.8 bits: 692.5 E(32554): 3.8e-199
Smith-Waterman score: 3927; 100.0% identity (100.0% similar) in 587 aa overlap (1-587:1-587)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDNYTSDEDIDEDFDTQLIIQQSLQDIYKPGTAQHAPKDESLHSFLSADYKKIVETIEKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MDNYTSDEDIDEDFDTQLIIQQSLQDIYKPGTAQHAPKDESLHSFLSADYKKIVETIEKG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 KEDALSHLTKYHSAFGEADEIGWIPLHKAAVQLNRKILEITLSASDPSLWEQTTHNGETP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KEDALSHLTKYHSAFGEADEIGWIPLHKAAVQLNRKILEITLSASDPSLWEQTTHNGETP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LFLAVSSCLLENATFLLLNGCNPNAKNFEGNSPLLAAVLRDCYDMAALLINYGADVNLRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LFLAVSSCLLENATFLLLNGCNPNAKNFEGNSPLLAAVLRDCYDMAALLINYGADVNLRC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ANERTALHEAAKLGREDMVKLMLVSGAHPDPQSTYGFTPLALAAQSGHTEIMEMLLRKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ANERTALHEAAKLGREDMVKLMLVSGAHPDPQSTYGFTPLALAAQSGHTEIMEMLLRKGA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 NAHGQASDSSSILLEAASGGNPDAVALLLEYGADANIPKNSGHLPIHVAADRGHLLALKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NAHGQASDSSSILLEAASGGNPDAVALLLEYGADANIPKNSGHLPIHVAADRGHLLALKI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LIPVTDLAAIKQSGISPVHCAAAGAHPQCLELLIQAGFDVNFMLDQRINKHYDDHRKSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LIPVTDLAAIKQSGISPVHCAAAGAHPQCLELLIQAGFDVNFMLDQRINKHYDDHRKSAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 YFAVSNSDLSSVKLLLSAGALPNQDPVNCLQIALRMGNYELISLLLRHGANVNYFCRVNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YFAVSNSDLSSVKLLLSAGALPNQDPVNCLQIALRMGNYELISLLLRHGANVNYFCRVNP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 LHFPSALQYTLKDEVMLRMLLNYGYDTERCFDCPHGDKVHPSYTVEGWTSTVIKDTKFCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LHFPSALQYTLKDEVMLRMLLNYGYDTERCFDCPHGDKVHPSYTVEGWTSTVIKDTKFCE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 VITLSWLQHLSGKVVRVMLDYVDQVRICSKLKAVLQKQGIWSEIHFILTNPRSLKHLCRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VITLSWLQHLSGKVVRVMLDYVDQVRICSKLKAVLQKQGIWSEIHFILTNPRSLKHLCRL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KE4 KIRKCMGRLHLRCPVFMSFLPLPNRLKAYVLYKEYDLYGQGIFTGTW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KIRKCMGRLHLRCPVFMSFLPLPNRLKAYVLYKEYDLYGQGIFTGTW
550 560 570 580
>>CCDS34742.1 ASB15 gene_id:142685|Hs108|chr7 (588 aa)
initn: 1696 init1: 1255 opt: 1484 Z-score: 1400.8 bits: 269.2 E(32554): 1.1e-71
Smith-Waterman score: 1912; 50.9% identity (77.1% similar) in 584 aa overlap (6-580:3-583)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MDNYTSDEDIDEDFDTQLIIQQSLQDIYKPGTAQHAPKDESLHSFLSADYKKIVETIEKG
...: ::: :. :: :.:. . . . :. :::. .:.::.:..:
CCDS34 MDTNDDPDEDHLTSYDIQLSIQESIEASKTALCPER---FVPLSAQNRKLVEAIKQG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 KEDALSHLTKYHSAFGEADEIGWIPLHKAAVQLNRKILEITLSASDPSLWEQTTHNGETP
. :.. .::. :. :::: ::.:::.:.:: ..::::.:.:: .::: : .::::
CCDS34 HIPELQEYVKYKYAMDEADEKGWFPLHEAVVQPIQQILEIVLDASYKTLWEFKTCDGETP
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LFLAVSSCLLENATFLLLNGCNPNAKNFEGNSPLLAAVLRDCYDMAALLINYGADVNLRC
: :::.. :.::. :: .: ::.:: .:..::: :: . :::.. ::....... :
CCDS34 LTLAVKAGLVENVRTLLEKGVWPNTKNDKGETPLLIAVKKGSYDMVSTLIKHNTSLDQPC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 ANERTALHEAAKLGREDMVKLMLVSGAHPDPQSTYGFTPLALAAQSGHTEIMEMLLRKGA
... .:.::::: ::.:.: :.: :.. .. .: :::..::. :: ...: :..::.
CCDS34 VKRWSAMHEAAKQGRKDIVALLLKHGGNVHLRDGFGVTPLGVAAEYGHCDVLEHLIHKGG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 NAHGQASDSSSILLEAASGGNPDAVALLLEYGADANIPKNSGHLPIHVAADRGHLLALKI
.. . :.:..:.:.:::.::::: ..::::::...:.:. .:::::: :: .:: ::::
CCDS34 DVLALADDGASVLFEAAGGGNPDCISLLLEYGGSGNVPNRAGHLPIHRAAYEGHYLALKY
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LIPVTDLAAIKQSGISPVHCAAAGAHPQCLELLIQAGFDVNFMLDQRINKHYDDHRKSAL
:::::. ::..::..:.: :: : . :::::::. ::::: .: ..:.. :::.::.::
CCDS34 LIPVTSKNAIRKSGLTPIHSAADGQNAQCLELLIENGFDVNTLLADHISQSYDDERKTAL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KE4 YFAVSNSDLSSVKLLLSAGALPNQDPVNCLQIALRMGNYELISLLLRHGANVN-YFCRVN
::.:::.:. ...::.::: :: ::.::: .:.: .:::.. ::: :::::: :: .::
CCDS34 YFGVSNNDVHCTEVLLAAGADPNLDPLNCLLVAVRANNYEIVRLLLSHGANVNCYFMHVN
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 PLHFPSALQYTLKDEVMLRMLLNYGYDTERCFDCPHGDKVHPSYT--------VEGWTST
.:::..::.:.::::::.::: ::..: :::: ::: :.. . ::::
CCDS34 DTRFPSVIQYALNDEVMLRLLLNNGYQVEMCFDCMHGDIFGNSFVWSEIQEEVLPGWTSC
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 VIKDTKFCEVITLSWLQHLSGKVVRVMLDYVDQVRICSKLKAVLQKQGIWSEIHFILTNP
::::. ::: ::. :..:: :.:.::..::.: : .:.:::..:. : : ::. :: ::
CCDS34 VIKDNPFCEFITVPWMKHLVGRVTRVLIDYMDYVPLCAKLKSALEVQREWPEIRQILENP
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540 550 560 570 580
pF1KE4 RSLKHLCRLKIRKCMGRLHLRCPVFMSFLPLPNRLKAYVLYKEYDLYGQGIFTGTW
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CCDS34 CSLKHLCRLKIRRLMGLQKLCQPASVEKLPLPPAIQRYILFKEYDLYGQELKLT
540 550 560 570 580
>>CCDS9915.1 ASB2 gene_id:51676|Hs108|chr14 (587 aa)
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Smith-Waterman score: 1133; 34.2% identity (66.3% similar) in 564 aa overlap (17-573:39-584)
10 20 30 40
pF1KE4 MDNYTSDEDIDEDFDTQLIIQQSLQDIYKPGTAQHAPKDESLHSFL
: ..:. ....: :.: :: :
CCDS99 YFSLFHSCSAPSRSTAPPESSPARAPMGLFQGVMQKYSSSLFK--TSQLAPADP------
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 SADYKKIVETIEKGKEDALSHLTKYHSAFGEADEIGWIPLHKAAVQLNRKILEITLSASD
....:. : :.::. . : . ..: .. ::.:::.:: . :.. :. .
CCDS99 ------LIKAIKDGDEEALKTMIKEGKNLAEPNKEGWLPLHEAAYYGQVGCLKV-LQRAY
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 PSLWEQTTHNGETPLFLAVSSCLLENATFLLLNGCNPNAKNFEGNSPLLAAVLRDCYDMA
:. .: : . :: ..::. :. :: : .:. .: ..:: : : . .
CCDS99 PGTIDQRTLQEETAVYLATCRGHLDCLLSLLQAGAEPDISNKSRETPLYKACERKNAEAV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 ALLINYGADVNLRCANERTALHEAAKLGREDMVKLMLVSGAHPDPQSTYGFTPLALAAQS
.:....::.: :: :::::... . ....... .::. . ...::.::: .::::
CCDS99 KILVQHNADTNHRCNRGWTALHESVSRNDLEVMQILVSGGAKVESKNAYGITPLFVAAQS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 GHTEIMEMLLRKGANAHGQASDSSSILLEAASGGNPDAVALLLEYGADANIPKNSGHLPI
:. : ...: . ::. . ::::..: : :: .. . ..: .:: ::::: ...: ::.
CCDS99 GQLEALRFLAKYGADINTQASDNASALYEACKNEHEEVVEFLLSQGADANKTNKDGLLPL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 HVAADRGHLLALKILIPVTDLAAIKQSGISPVHCAAAGAHPQCLELLIQAGFDVNFMLDQ
:.:. .:. ...:.:::. . :..::.::.: :: : . :: :..: :::: :
CCDS99 HIASKKGNYRIVQMLLPVTSRTRIRRSGVSPLHLAAERNHDEVLEALLSARFDVNTPLAP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 RINKHYDDHRKSALYFAVSNSDLSSVKLLLSAGALPNQDPVNCLQIALRMGNYELISLLL
. . :.:.:.::::::: :... ...:::. :: ::.: .. : .:.: : . ..:::
CCDS99 ERARLYEDRRSSALYFAVVNNNVYATELLLQHGADPNRDVISPLLVAIRHGCLRTMQLLL
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 RHGANVNYFCRVNPLHFPSALQYTLKDEVMLRMLLNYGYDTERCFDCPHGDKVHPSYTVE
::::.. . ..: ::.......: .:..:.. : : : ::.: .:. ::
CCDS99 DHGANIDAYIATHPTAFPATIMFAMKCLSLLKFLMDLGCDGEPCFSCLYGNGPHPPAPQP
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510
pF1KE4 G--WTSTVIKD-----TKFCEVITLSWLQHLSGKVVRVMLDYVDQVRICSKLKAVLQKQG
. .... : ..::: .. ... .: .. :.:::: .:..::.:: ...
CCDS99 SSRFNDAPAADKEPSVVQFCEFVSAPEVSRWAGPIIDVLLDYVGNVQLCSRLKEHIDSFE
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 IWSEIHFILTNPRSLKHLCRLKIRKCMGRLHLRCPVFMSFLPLPNRLKAYVLYKEYDLYG
:. :. :: : :::::..:: .:. ... ... ::::.:: :. :.
CCDS99 DWAVIKEKAEPPRPLAHLCRLRVRKAIGKYRIK---LLDTLPLPGRLIRYLKYENTQ
540 550 560 570 580
580
pF1KE4 QGIFTGTW
>>CCDS55940.1 ASB2 gene_id:51676|Hs108|chr14 (635 aa)
initn: 1096 init1: 819 opt: 1125 Z-score: 1064.1 bits: 207.0 E(32554): 6e-53
Smith-Waterman score: 1133; 34.2% identity (66.3% similar) in 564 aa overlap (17-573:87-632)
10 20 30 40
pF1KE4 MDNYTSDEDIDEDFDTQLIIQQSLQDIYKPGTAQHAPKDESLHSFL
: ..:. ....: :.: :: :
CCDS55 TNRQPAHFYPWTRSTAPPESSPARAPMGLFQGVMQKYSSSLFK--TSQLAPADP------
60 70 80 90 100
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 SADYKKIVETIEKGKEDALSHLTKYHSAFGEADEIGWIPLHKAAVQLNRKILEITLSASD
....:. : :.::. . : . ..: .. ::.:::.:: . :.. :. .
CCDS55 ------LIKAIKDGDEEALKTMIKEGKNLAEPNKEGWLPLHEAAYYGQVGCLKV-LQRAY
110 120 130 140 150 160
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 PSLWEQTTHNGETPLFLAVSSCLLENATFLLLNGCNPNAKNFEGNSPLLAAVLRDCYDMA
:. .: : . :: ..::. :. :: : .:. .: ..:: : : . .
CCDS55 PGTIDQRTLQEETAVYLATCRGHLDCLLSLLQAGAEPDISNKSRETPLYKACERKNAEAV
170 180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 ALLINYGADVNLRCANERTALHEAAKLGREDMVKLMLVSGAHPDPQSTYGFTPLALAAQS
.:....::.: :: :::::... . ....... .::. . ...::.::: .::::
CCDS55 KILVQHNADTNHRCNRGWTALHESVSRNDLEVMQILVSGGAKVESKNAYGITPLFVAAQS
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 GHTEIMEMLLRKGANAHGQASDSSSILLEAASGGNPDAVALLLEYGADANIPKNSGHLPI
:. : ...: . ::. . ::::..: : :: .. . ..: .:: ::::: ...: ::.
CCDS55 GQLEALRFLAKYGADINTQASDNASALYEACKNEHEEVVEFLLSQGADANKTNKDGLLPL
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 HVAADRGHLLALKILIPVTDLAAIKQSGISPVHCAAAGAHPQCLELLIQAGFDVNFMLDQ
:.:. .:. ...:.:::. . :..::.::.: :: : . :: :..: :::: :
CCDS55 HIASKKGNYRIVQMLLPVTSRTRIRRSGVSPLHLAAERNHDEVLEALLSARFDVNTPLAP
350 360 370 380 390 400
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 RINKHYDDHRKSALYFAVSNSDLSSVKLLLSAGALPNQDPVNCLQIALRMGNYELISLLL
. . :.:.:.::::::: :... ...:::. :: ::.: .. : .:.: : . ..:::
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410 420 430 440 450 460
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470 480 490 500 510
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. .... : ..::: .. ... .: .. :.:::: .:..::.:: ...
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CCDS61 NPNLATTAGHTPLHIAAREGHVETVLALLEKEASQACMTKKGFTPLHVAAKYGKVRVAEL
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CCDS61 LLER--------DAHPNAAGKNGL-TPLHVAVHHNNLDIVKLLLPRGGSPHSPAWNGYTP
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CCDS61 LHIAAKQNQVEVARSLLQYGGSANAESVQGVTPLHLAAQEGHAEMVALLLSKQANGNLGN
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pF1KE4 ERCFDCPHGDKVHPSYTVEGWTSTVIKDTKFCEVITLSWLQHLSGKVVRVMLDYVDQVRI
CCDS61 KSGLTPLHLVAQEGHVPVADVLIKHGVMVDATTRMGYTPLHVASHYGNIKLVKFLLQHQA
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CCDS61 HLDCVRLLLQY-DAEI-DDITLDHLTPLHVAAHCGHHRVAKVLLDKGAKPNSRALNGFTP
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CCDS61 VKVETPLHMAARAGHTEVAKYLLQNKAKVNAKAKDDQTPLHCAARIGHTNMVKLLLENNA
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