Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4145
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4145, 578 aa
1>>>pF1KE4145 578 - 578 aa - 578 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7206+/-0.000915; mu= 16.5845+/- 0.055
mean_var=76.5681+/-15.500, 0's: 0 Z-trim(106.4): 162 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.146572
statistics sampled from 8763 (8937) to 8763 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 3.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 3937 842.4 0
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 1199 263.4 5.8e-70
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 ( 600) 848 189.2 1.3e-47
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 798 178.6 1.9e-44
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 798 178.6 1.9e-44
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 781 175.0 2.3e-43
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 769 172.4 1.3e-42
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 768 172.3 1.7e-42
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 766 171.8 2e-42
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 766 171.9 2.4e-42
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 766 171.9 2.6e-42
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 ( 609) 758 170.1 6.9e-42
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 748 168.1 3.6e-41
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 718) 739 166.2 1.3e-40
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 739 166.2 1.3e-40
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2 ( 875) 736 165.6 2.4e-40
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15 ( 589) 723 162.7 1.1e-39
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8 ( 581) 717 161.5 2.7e-39
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 687) 693 156.4 1.1e-37
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 691 156.0 1.4e-37
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 688 155.3 2e-37
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 589) 686 154.9 2.6e-37
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 673 152.2 1.7e-36
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 663 150.0 7.5e-36
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 662 149.8 8.4e-36
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19 ( 624) 649 147.1 6.1e-35
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 646 146.4 8e-35
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 646 146.4 8e-35
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17 ( 608) 639 145.0 2.6e-34
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11 ( 583) 637 144.5 3.4e-34
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 538) 625 142.0 1.8e-33
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16 ( 597) 615 139.9 8.6e-33
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 620) 613 139.5 1.2e-32
CCDS2906.2 KBTBD8 gene_id:84541|Hs108|chr3 ( 601) 588 134.2 4.5e-31
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 571 130.6 5.3e-30
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 571 130.6 5.4e-30
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 496) 565 129.3 1.1e-29
CCDS34614.1 KBTBD2 gene_id:25948|Hs108|chr7 ( 623) 560 128.3 2.8e-29
CCDS8334.1 KBTBD3 gene_id:143879|Hs108|chr11 ( 612) 551 126.4 1e-28
CCDS34478.1 KLHL31 gene_id:401265|Hs108|chr6 ( 634) 551 126.4 1.1e-28
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 516) 540 124.0 4.5e-28
CCDS1368.1 IVNS1ABP gene_id:10625|Hs108|chr1 ( 642) 515 118.8 2.1e-26
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 ( 617) 513 118.3 2.8e-26
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 513 118.3 2.8e-26
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 613) 509 117.5 4.9e-26
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 639) 509 117.5 5.1e-26
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 655) 509 117.5 5.2e-26
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 658) 509 117.5 5.2e-26
CCDS2703.1 KLHL40 gene_id:131377|Hs108|chr3 ( 621) 481 111.6 3e-24
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 473 109.9 9.7e-24
>>CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 (578 aa)
initn: 3937 init1: 3937 opt: 3937 Z-score: 4498.8 bits: 842.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3937; 99.7% identity (100.0% similar) in 578 aa overlap (1-578:1-578)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MVRNVDDLDFHLPSHAQDMLDGLQRLRSQPKLADVTLLVGGRELPCHRSLLALSSPYFHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS46 MVRNVDDLDFHLPSHAQDMLDGLQRLRSQPKLADVTLLVGGRELPCHRGLLALSSPYFHA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 MFAGDFAESFSARVELRDVEPAVVGQLVDFVYTGRLTITQGNVEALTRTAARLHFPSVQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MFAGDFAESFSARVELRDVEPAVVGQLVDFVYTGRLTITQGNVEALTRTAARLHFPSVQK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 VCGRYLQQQLDAANCLGICEFGEQQGLLGVAAKAWAFLRENFEAVAREDEFLQLPRERLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VCGRYLQQQLDAANCLGICEFGEQQGLLGVAAKAWAFLRENFEAVAREDEFLQLPRERLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TCLAGDLLQVQPEQSRLEALMRWVRHDPQARAVHLPELLSLVHLDAVPRPCVQQLLASEP
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TCLAGDLLQVQPEQSRLEALMRWVRHDPQARAAHLPELLSLVHLDAVPRPCVQQLLASEP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LIQESEACRAALSQGHDGAPLALQQKLEEVLVVVGGQALEEEEAGEEPTPGLGNFAFYNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LIQESEACRAALSQGHDGAPLALQQKLEEVLVVVGGQALEEEEAGEEPTPGLGNFAFYNS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 KAKRWMALPDFPDYHKWGFSLAALNNNIYVTGGSRGTKTDTWSTTQAWCFPLKEASWKPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KAKRWMALPDFPDYHKWGFSLAALNNNIYVTGGSRGTKTDTWSTTQAWCFPLKEASWKPV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 APMLKPRTNHASAALNGEIYVIGGTTLDVVEVESYDPYTDSWTPVSPALKYVSNFSAAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APMLKPRTNHASAALNGEIYVIGGTTLDVVEVESYDPYTDSWTPVSPALKYVSNFSAAGC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 RGRLYLVGSSACKYNALALQCYNPVTDAWSVIASPFLPKYLSSPRCAALHGELYLIGDNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RGRLYLVGSSACKYNALALQCYNPVTDAWSVIASPFLPKYLSSPRCAALHGELYLIGDNT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 KKVYVYDPGANLWQKVQSQHSLHENGALVPLGDALYVTGGRWQGMEGDYHVEMEAYDTVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KKVYVYDPGANLWQKVQSQHSLHENGALVPLGDALYVTGGRWQGMEGDYHVEMEAYDTVR
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KE4 DTWTRHGALPRLWLYHGASTVFLDVSKWTQPSGPTQEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DTWTRHGALPRLWLYHGASTVFLDVSKWTQPSGPTQEH
550 560 570
>>CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 (597 aa)
initn: 1165 init1: 388 opt: 1199 Z-score: 1369.6 bits: 263.4 E(32554): 5.8e-70
Smith-Waterman score: 1241; 38.4% identity (63.9% similar) in 571 aa overlap (8-562:10-559)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MVRNVDDLDFHLPSHAQDMLDGLQRLRSQPKLADVTL-LVGGRELPCHRSLLALSSPY
: : :.:: ..: ::..::.. :. :::: .:::..: ::..:: .:::
CCDS30 MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERKFLDVTLEAAGGRDFPAHRAVLAAASPY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 FHAMFAGDFAESFSARVELRDVEPAVVGQLVDFVYTGRLTITQGNVEALTRTAARLHFPS
:.:::::.. :: . ::.:. : : .. :.:: ::::.... :.: : :.: :.::.
CCDS30 FRAMFAGQLRESRAERVRLHGVPPDMLQLLLDFSYTGRVAVSGDNAEPLLRAADLLQFPA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 VQKVCGRYLQQQLDAANCLGICEFGEQQGLLGVAAKAWAFLRENFEAVAREDEFLQLPRE
:...:: .:::::: :::: . .:.: . :.:. : :. .. .. : .. .::
CCDS30 VKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFAEAFSCSGLASAAQRFILRHVGELGAE-QLERLPLA
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 RLVTCLAGDLLQVQPEQSRLEALMRWVRHDPQARAVHLPELLSLVHLDAVPRPCVQQLLA
::. : : : : :.. . .:::: :: ::.: :.:: :.: : : . .
CCDS30 RLLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALRWVRADPPRRAAHWPQLLEAVRLPFVRRFYLLAHVE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE4 SEPLIQESEAC----------RAALSQGHDGAPLALQQK-----LEEVLVVVGGQALEEE
.:::. . : .:: . :: .: .. : :.::.::: . .
CCDS30 AEPLVARCPPCLRLLREARDFQAARYDRHDRGPCPRMRPRPSTGLAEILVLVGGCDQDCD
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 EAGEEPTPGLGNFAFYNSKAKRWMALPDFPDYHKWGFSLAALNNNIYVTGGSRGTKTDTW
: : . :: .. .: : .:::. :.:..::.:.::::::: :..
CCDS30 E--------LVTVDCYNPQTGQWRYLAEFPDHLGGGYSIVALGNDIYVTGGSDGSRL---
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 STTQAWCFPLKEASWKPVAPMLKPRTNHASAALNGEIYVIGGTTLDVVEVESYDPYTDSW
.: . . : :::::: : :.:..:.: .::... . .: :: ::::
CCDS30 -YDCVWRYNSSVNEWAEVAPMLKAREYHSSSVLDGLLYVVAADS-----TERYDHTTDSW
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 TPVSPALKYVSNFSAAGCRGRLYLVGSSACKYNALALQCYNPVTDAWSVIASPFLPKYLS
..: ..: :...:::::: .:: : : .....:::.: :: ::.. :: .
CCDS30 EALQPMTYPMDNCSTTACRGRLYAIGSLAGK-ETMVMQCYDPDTDLWSLVDCGQLPPWSF
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 SPRCAALHGELYLIGDNTKKVYVYDPGANLWQKVQSQHSLHENGALVPLGDALYVTGGRW
.:. :.:.: .:.. :.. .: ::.: : :.:. :....: .:.:. :: :::.::
CCDS30 APKTATLNGLMYFVRDDSAEVDVYNPTRNEWDKIPSMNQVHVGGSLAVLGGKLYVSGGYD
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570
pF1KE4 QGMEGDYHVEMEAYDTVRDTWTRHGALPRLWLYHGASTVFLDVSKWTQPSGPTQEH
. .: . : :::: .:. : ::. ..::. ..:
CCDS30 NTFELSDVV--EAYDPETRAWSVVGRLPEPTFWHGSVSIFRQFMPQTFSGGRGFELDSGS
530 540 550 560 570
CCDS30 DDMDPGRPRPPRDPDELH
580 590
>>CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 (600 aa)
initn: 764 init1: 474 opt: 848 Z-score: 968.4 bits: 189.2 E(32554): 1.3e-47
Smith-Waterman score: 867; 30.5% identity (59.5% similar) in 568 aa overlap (14-561:47-590)
10 20 30 40
pF1KE4 MVRNVDDLDFHLPSHAQDMLDGLQRLRSQPKLADVTLLVGGRE
:::...:. ....:.. ..:: . : :.:
CCDS32 RDSPATKRKVFEMDPKSLTGHEFFDFSSGSSHAENILQIFNEFRDSRLFTDVIICVEGKE
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 LPCHRSLLALSSPYFHAMFAGDFAESFSARVELRDVEPAVVGQLVDFVYTGRLTITQGNV
.::::..:. : ::.::: .: :: ::. . .. ....::::.. :: ::
CCDS32 FPCHRAVLSACSSYFRAMFCNDHRESREMLVEINGILAEAMECFLQYVYTGKVKITTENV
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 EALTRTAARLHFPSVQKVCGRYLQQQLDAANCLGICEFGEQQGLLGVAAKAWAFLRENFE
. : .:.. ... .. .:...:..::: ::::: .:.. ..: . .: : ..::
CCDS32 QYLFETSSLFQISVLRDACAKFLEEQLDPCNCLGIQRFADTHSLKTLFTKCKNFALQTFE
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 AVAREDEFLQLPRERLVTCLAGDLLQVQPEQSRLEALMRWVRHDPQARAVHLPELLSLVH
:....:::.: ...:. . .: : . :. .::.:::: . . : : :::. :.
CCDS32 DVSQHEEFLELDKDELIDYICSDELVIGKEEMVFEAVMRWVYRAVDLRRPLLHELLTHVR
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270
pF1KE4 LDAVPRPCVQQLLASEPLIQESEACRAALSQ-------GHDG-APLALQQK---LEEVLV
: . : . . :::.: : : . :.. .: . .. ::.:
CCDS32 LPLLHPNYFVQTVEVDQLIQNSPECYQLLHEARRYHILGNEMMSPRTRPRRSTGYSEVIV
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 VVGGQALEEEEAGEEPTPGLGNFAFYNSKAKRWMALPDFPDYHKWGFSLAALNNNIYVTG
:::: :..: : :. . .: .: .:.. : ... :: :.: :.:
CCDS32 VVGGC----ERVGGFNLPYT---ECYDPVTGEWKSLAKLPEFTKSEYAVCALRNDILVSG
320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 GSRGTKTDTWSTTQAWCFPLKEASWKPVAPMLKPRTNHASAALNGEIYVIGGTTLD--VV
: ... ..: . . : :: . : : : :.: :..::.:: . .
CCDS32 GRINSR-------DVWIYNSQLNIWIRVASLNKGRWRHKMAVLLGKVYVVGGYDGQNRLS
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440
pF1KE4 EVESYDPYTDSWTPVSPALKYVSNFSAAGCRGRLYLVGS----SACKYNALALQCYNPVT
:: :: ... :: :.: . ::. ....: :.:...:. ..:. . .: :.: :
CCDS32 SVECYDSFSNRWTEVAPLKEAVSSPAVTSCVGKLFVIGGGPDDNTCSDK---VQSYDPET
430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 DAWSVIASPFLPKYLSSPRC---AALHGELYLIGDNTKKVYVYDPGANLWQKVQSQHSLH
..: . :. . : :: ..:.. .:. : :: .: ::: . :..::. : .
CCDS32 NSWLLRAAIPIAK-----RCITAVSLNNLIYVAGGLTKAIYCYDPVEDYWMHVQNTFSRQ
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 ENGALVPLGDALYVTGGRWQGMEGDYHVEMEAYDTVRDTWTRHGALPRLWLYHGASTVFL
:: .. . .:. ::: .. :. . :: . . : .:.:: ::: :.
CCDS32 ENCGMSVCNGKIYILGGRREN--GEATDTILCYDPATSIITGVAAMPRPVSYHGCVTIHR
540 550 560 570 580 590
570
pF1KE4 DVSKWTQPSGPTQEH
CCDS32 YNEKCFKL
600
>>CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 (593 aa)
initn: 809 init1: 513 opt: 798 Z-score: 911.3 bits: 178.6 E(32554): 1.9e-44
Smith-Waterman score: 810; 29.2% identity (61.1% similar) in 558 aa overlap (13-544:36-571)
10 20 30 40
pF1KE4 MVRNVDDLDFHLPSHAQDMLDGLQRLRSQPKLADVTLLVGGR
: : . . ...:::: : :::...
CCDS34 LPPACTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTIVAEDM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 ELPCHRSLLALSSPYFHAMFAGDFAESFSARVELRDVEPAVVGQLVDFVYTGRLTITQGN
:. :: .:: ::::::::.:...:: . ::....:. .. .:.:.:::... .:. :
CCDS34 EISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQVTEEN
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pF1KE4 VEALTRTAARLHFPSVQKVCGRYLQQQLDAANCLGICEFGEQQGLLGVAAKAWAFLRENF
:..: .:. :.. .:.:.: ..:..:: .::::: :..... . :: .. ...:
CCDS34 VQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 EAVAREDEFLQLPRERLVTCLAGDLLQVQPEQSRLEALMRWVRHDPQARAVHLPELLSLV
:. .:::.: :.. . ...: : .. :.. .::.. :: :: ..: . .:. :
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230 240 250 260
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.: .:: . : . : :...: ::. : .. : .:. :
CCDS34 RLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNL
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270 280 290 300 310 320
pF1KE4 EEVLVVVGGQALEEEEAGEEPTPGLGNFAFYNSKAKRWMALPDFPDYHKWGFSLAALNNN
...::::::: : .. . :. : .:: . ..:. . . ... . .
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330 340 350 360 370 380
pF1KE4 IYVTGGSRGT-KTDTWSTTQAWCFPLKEASWKPVAPMLKPRTNHASAALNGEIYVIGGT-
....:: :. .. : .. . :.:. .: :: : :.. ..:.::: .:..::
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. . ::.:. .. : :.: :. ... : :: ::. .: . ...::
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450 460 470 480 490
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: .:. :. :: . :. ..:.. :: .: . :.: :::: .: :..:
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pF1KE4 SQHSLHENGALVPLGDALYVTGGRWQGMEGDYHVE-MEAYDTVRDTWTRHGALPRLWLYH
... ..:... .. :::.:: .:. .. .: :. . : ::
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560 570
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CCDS34 AGVTVIDKPL
590
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10 20 30 40
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: : . . ...:::: : :::...
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pF1KE4 ELPCHRSLLALSSPYFHAMFAGDFAESFSARVELRDVEPAVVGQLVDFVYTGRLTITQGN
:. :: .:: ::::::::.:...:: . ::....:. .. .:.:.:::... .:. :
CCDS54 EISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQVTEEN
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pF1KE4 VEALTRTAARLHFPSVQKVCGRYLQQQLDAANCLGICEFGEQQGLLGVAAKAWAFLRENF
:..: .:. :.. .:.:.: ..:..:: .::::: :..... . :: .. ...:
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:. .:::.: :.. . ...: : .. :.. .::.. :: :: ..: . .:. :
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.: .:: . : . : :...: ::. : .. : .:. :
CCDS54 RLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNL
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270 280 290 300 310 320
pF1KE4 EEVLVVVGGQALEEEEAGEEPTPGLGNFAFYNSKAKRWMALPDFPDYHKWGFSLAALNNN
...::::::: : .. . :. : .:: . ..:. . . ... . .
CCDS54 PKLMVVVGGQA---------PK-AIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRA-GMVYMAGL
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....:: :. .. : .. . :.:. .: :: : :.. ..:.::: .:..::
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pF1KE4 -TLDVVEVESYDPYTDSWTPVSPALKYVSNFSAAGCRGRLYLVGS--SACKYNALALQCY
. . ::.:. .. : :.: :. ... : :: ::. .: . ...::
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: .:. :. :: . :. ..:.. :: .: . :.: :::: .: :..:
CCDS54 NATTNEWTYIAE--MSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVA
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pF1KE4 SQHSLHENGALVPLGDALYVTGGRWQGMEGDYHVE-MEAYDTVRDTWTRHGALPRLWLYH
... ..:... .. :::.:: .:. .. .: :. . : ::
CCDS54 DMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGD----DGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSY
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CCDS54 AGVTVIDKPL
590
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10 20 30 40
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. :: .:: :::: :::.::..:: . ..:..::. ....:.:..::... .:. ::
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: .:::.: ... . ...: : :. :.. .::.. :. .. ..: :. .:. :.
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pF1KE4 LDAVPRPCVQQLLASEPLIQESEACRAALSQGHDGAPLALQQKL---------------E
: .:: . : . : ::.....:. : .. : :.:.:
CCDS41 LPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLP
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270 280 290 300 310 320
pF1KE4 EVLVVVGGQALEEEEAGEEPTPGLGNFAFYNSKAKRWMALPDFPDYH-KWGFSLAALNNN
.:..:::::: : .. . :. . :: . ..:. . . : . : ..
CCDS41 KVMIVVGGQA---------PK-AIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMA--GH
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pF1KE4 IYVTGGSRGT-KTDTWSTTQAWCFPLKEASWKPVAPMLKPRTNHASAALNGEIYVIGGT-
.:..:: :. .. : .. .. .:. .: .: : . :.. ..:.:: .:..::
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pF1KE4 -TLDVVEVESYDPYTDSWTPVSPALKYVSNFSAAGCRGRLYLVGSSACKYNALALQC---
. .. ::.:. :. : :.: :. ... .:.:: ::. :.. . ::
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:::.:. : .:. . :. ..: :.:: : . :.: :::::.: :
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..: ... ..:... .. :::.:: .:. .. .: :. : : ::
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CCDS41 GRSYAGVAVIHKSL
580
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: .::.:: .::::: :.. . . .: :. ...: : .:::.: ...
CCDS58 NCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVC
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. ...: : :. :.. .::.. :. .. ..: :. .:. :.: .:: . : . :
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::.....:. : .. : :.:.: .:..::::::
CCDS58 LIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKVMIVVGGQA-------
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pF1KE4 EEPTPGLGNFAFYNSKAKRWMALPDFPDYH-KWGFSLAALNNNIYVTGGSRGT-KTDTWS
: .. . :. . :: . ..:. . . : . : ...:..:: :. .. : .
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pF1KE4 TTQAWCFPLKEASWKPVAPMLKPRTNHASAALNGEIYVIGGT--TLDVVEVESYDPYTDS
. .. .:. .: .: : . :.. ..:.:: .:..:: . .. ::.:. :.
CCDS58 VYDG----VKD-QWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNE
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pF1KE4 WTPVSPALKYVSNFSAAGCRGRLYLVGSSACKYNALALQC------YNPVTDAWSVIASP
: :.: :. ... .:.:: ::. :.. . :: :::.:. : .:.
CCDS58 WFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGG----YDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVAD-
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pF1KE4 FLPKYLSSPRCAALHGELYLIGDNT-----KKVYVYDPGANLWQKVQSQHSLHENGALVP
. :. ..: :.:: : . :.: :::::.: :..: ... ..:...
CCDS58 -MSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCA
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pF1KE4 LGDALYVTGGRWQGMEGDYHVE-MEAYDTVRDTWTRHGALPRLWLYHGASTVFLDVSKWT
.. :::.:: .:. .. .: :. : : ::
CCDS58 VNGLLYVVGGD----DGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
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570
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pF1KE4 MVRNVDDLDFHLPSHAQDMLDGLQRLRSQPKLADVTLLVGGREL
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CCDS30 PRQARPAAPMEGAVQLLSREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAAKEI
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pF1KE4 PCHRSLLALSSPYFHAMFAGDFAESFSARVELRDVEPAVVGQLVDFVYTGRLTITQGNVE
:. .:: ::::::::.....:: ...: :.:..: .. :::.:.::..... .:::.
CCDS30 RAHKVVLASCSPYFHAMFTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNVQ
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pF1KE4 ALTRTAARLHFPSVQKVCGRYLQQQLDAANCLGICEFGEQQGLLGVAAKAWAFLRENFEA
.: .:. :.. .:. .: ..: .::: .::::: :.. .. . : .. ..:
CCDS30 TLLPAASLLQLNGVRDACCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVD
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pF1KE4 VAREDEFLQLPRERLVTCLAGDLLQVQPEQSRLEALMRWVRHDPQARAVHLPELLSLVHL
::. .::. :: .... ...: :.: :. .:.. ::.:: .:: :.:.:.. :.:
CCDS30 VAKTEEFMLLPLKQVLELVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRL
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pF1KE4 DAVPRPCVQQLLASEPLIQESEACRAAL-----------SQGHDGAPLALQQKLE---EV
. : . . .: :... :. : ..: :. . .. : :
CCDS30 PLLSRDFLLGHVDAESLVRHHPDCKDLLIEALKFHLLPEQRGVLGTSRTRPRRCEGAGPV
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pF1KE4 LVVVGGQALEEEEAGEEPTPGLGNFAFYNSKAKRWMALPDFPDYHKWGFSLAALNNNIYV
: .::: .: . :. :.... :: .. .. .. ..::..: .:.
CCDS30 LFAVGGGSLFAIH---------GDCEAYDTRTDRWHVVASMST-RRARVGVAAVGNRLYA
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pF1KE4 TGGSRGTKTDTWSTTQAWCFPLKEASWKPVAPMLKPRTNHASAALNGEIYVIGG----TT
.:: :: .: .:.... :. . .:.: . : :. . :::.: .: :: .
CCDS30 VGGYDGT-SDL-ATVESYD-PVTN-TWQPEVSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASC
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pF1KE4 LDVVEVESYDPYTDSWTPVSPALKYVSNFSAAGCRGRLYLVGSSACKYNALALQCYNPVT
:. .: ::: : .:: :. .: : :: ::. . . ... :.: .
CCDS30 LN--SAERYDPLTGTWTSVAAMSTRRRYVRVATLDGNLYAVGGYDSSSHLATVEKYEPQV
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pF1KE4 DAWSVIASPFLPKYLSSPRCAALHGELYLIGDNT-----KKVYVYDPGANLWQKVQSQHS
..:: .:: .: . :: :.:.: ::. : : ..: :.: :. :..: ..
CCDS30 NVWSPVAS-MLSRR-SSAGVAVLEGALYVAGGNDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNI
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510 520 530 540 550 560
pF1KE4 LHENGALVPLGDALYVTGGRWQGMEGDYHVE-MEAYDTVRDTWTRHGALPRLWLYHGAST
. . :: . ::..:: .:. .. .: :. . :. . . . ....
CCDS30 RRSTHDLVAMDGWLYAVGGN----DGSSSLNSIEKYNPRTNKWVAASCM--FTRRSSVGV
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570
pF1KE4 VFLDVSKWTQPSGPTQEH
. :.. .. ::.::
CCDS30 AVLELLNFPPPSSPTLSVSSTSL
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>>CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 (568 aa)
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Smith-Waterman score: 766; 28.4% identity (58.7% similar) in 557 aa overlap (10-545:10-550)
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pF1KE4 MVRNVDDLDFHLPSHAQDMLDGLQRLRSQPKLADVTLLVGGRELPCHRSLLALSSPYFHA
:. .::.. . .. . .: :: :..: :..: :: .:. : :: :
CCDS54 MEPCTSDEFFQALNHAEQTFKKMENYLRHKQLCDVILVAGDRRIPAHRLVLSSVSDYFAA
10 20 30 40 50 60
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pF1KE4 MFAGDFAESFSARVELRDVEPAVVGQLVDFVYTGRLTITQGNVEALTRTAARLHFPSVQK
::..: :. . ..... ::: . .:....::::: . . :.: : :: :.. .: .
CCDS54 MFTNDVREARQEEIKMEGVEPNSLWSLIQYAYTGRLELKEDNIECLLSTACLLQLSQVVE
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