Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4128
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4128, 526 aa
1>>>pF1KE4128 526 - 526 aa - 526 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3784+/-0.000779; mu= 17.9817+/- 0.047
mean_var=76.5271+/-15.652, 0's: 0 Z-trim(108.8): 94 B-trim: 53 in 1/49
Lambda= 0.146611
statistics sampled from 10348 (10471) to 10348 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.322), width: 16
Scan time: 3.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 3519 753.9 9.9e-218
CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 945 209.5 7.2e-54
CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 878 195.3 1.2e-49
CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 733 164.6 2.3e-40
CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 688 155.1 1.8e-37
CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 686 154.7 2.3e-37
CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 642 145.4 1.4e-34
CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 628 142.4 1.1e-33
CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 629 142.7 1.1e-33
CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 622 141.2 2.7e-33
CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 618 140.4 5.8e-33
CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 614 139.5 8.8e-33
CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 610 138.6 1.5e-32
CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 610 138.7 2e-32
CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 570 130.1 4.9e-30
CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 512 118.0 3.3e-26
CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 495 114.4 4.1e-25
CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 490 113.3 8.4e-25
CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 490 113.3 8.6e-25
CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 480 111.1 3.2e-24
CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 447 104.2 3.9e-22
CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 443 103.5 1.1e-21
CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 419 98.4 3.5e-20
CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 400 94.2 3.9e-19
CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 400 94.2 4e-19
CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 626) 398 93.9 6e-19
CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 635) 398 93.9 6.1e-19
CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 558) 362 86.2 1.1e-16
CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 583) 362 86.2 1.1e-16
CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 613) 362 86.2 1.2e-16
CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 618) 362 86.2 1.2e-16
CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 629) 362 86.2 1.2e-16
CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 638) 362 86.2 1.2e-16
CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs108|chr19 ( 757) 297 72.5 1.9e-12
CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 511) 286 70.1 6.9e-12
CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 585) 286 70.1 7.7e-12
CCDS55625.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 356) 271 66.8 4.7e-11
>>CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 (526 aa)
initn: 3519 init1: 3519 opt: 3519 Z-score: 4022.4 bits: 753.9 E(32554): 9.9e-218
Smith-Waterman score: 3519; 99.8% identity (100.0% similar) in 526 aa overlap (1-526:1-526)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MLMLLVRGTHYENLRSKVVLPTPLGGRSTETFVSEFPGPDTGIRWRRSDEALRVNVGGVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MLMLLVRGTHYENLRSKVVLPTPLGGRSTETFVSEFPGPDTGIRWRRSDEALRVNVGGVR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RQLSARALARFPGTRLGRLQAAASEEQARRLCDDYDEAAREFYFDRHPGFFLSLLHFYRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RQLSARALARFPGTRLGRLQAAASEEQARRLCDDYDEAAREFYFDRHPGFFLSLLHFYRT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 GHLHVLDELCVFAFGQEADYWGLGENALAACCRARYLERRLTQPHAWDEDSDTPSSVDPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GHLHVLDELCVFAFGQEADYWGLGENALAACCRARYLERRLTQPHAWDEDSDTPSSVDPC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 PDEISDVQRELARYGAARCGRLRRRLWLTMENPGYSLPSKLFSCVSISVVLASIAAMCIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PDEISDVQRELARYGAARCGRLRRRLWLTMENPGYSLPSKLFSCVSISVVLASIAAMCIH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SLPEYQAREAAAAVAAVAAGRSPEGVRDDPVLRRLEYFCIAWFSFEVSSRLLLAPSTRNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SLPEYQAREAAAAVAAVAAGRSPEGVRDDPVLRRLEYFCIAWFSFEVSSRLLLAPSTRNF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 FCHPLNLIDIVSVLPFYLTLLAGVALGDQGGKEFGHLGKVVQVFRLMRIFRVLKLARHST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FCHPLNLIDIVSVLPFYLTLLAGVALGDQGGKEFGHLGKVVQVFRLMRIFRVLKLARHST
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 GLRSLGATLKHSYREVGILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKEEDVGFNTIPACWWWGTVSMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GLRSLGATLKHSYREVGILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKEEDVGFNTIPACWWWGTVSMT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 TVGYGDVVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSNHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TVGYGDVVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSNHQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE4 EFEDLLSSVDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EFEDLLSSIDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY
490 500 510 520
>>CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 (477 aa)
initn: 1536 init1: 752 opt: 945 Z-score: 1080.6 bits: 209.5 E(32554): 7.2e-54
Smith-Waterman score: 1562; 51.5% identity (77.5% similar) in 472 aa overlap (49-519:16-469)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 VLPTPLGGRSTETFVSEFPGPDTGIRWRRSDEALRVNVGGVRRQLSARALARFPGTRLGR
: .:.:::: .:.: ...: ::: :::::
CCDS62 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGR
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 LQAAASEEQARRLCDDYDEAAREFYFDRHPGFFLSLLHFYRTGHLHVLDELCVFAFGQEA
: :.: .::::::.. :::::::.: .: .::::.::.:::. :::::.:.::
CCDS62 LLLCHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEI
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 DYWGLGENALAACCRARYLERRLT-QPHAWDEDSDTPSSVDPCPDEISDVQRELARYGAA
.:::..: . .:: : :.. . . :::.:: :... ::: . ... .
CCDS62 EYWGINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSF-DEILAFYNDASKFDGQ
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 RCGRLRRRLWLTMENPGYSLPSKLFSCVSISVVLASIAAMCIHSLPEYQAREAAAAVAAV
: .::.:::...:::::. :..:: .:: ::..:: .::..:::..: .. .
CCDS62 PLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQG-----
170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 AAGRSPEGVRDDPVLRRLEYFCIAWFSFEVSSRLLLAPSTRNFFCHPLNLIDIVSVLPFY
.: : .:: .. .:.: ::::.::. .:. .::. .:: . :::::..:..:::
CCDS62 ----NP-G--EDPRFEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFY
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 LTLLAGVALGDQGGKEFGHLGKVVQVFRLMRIFRVLKLARHSTGLRSLGATLKHSYREVG
.::...... .. ...::.:.::.:::::::.::::::::::::::::::.::.:::
CCDS62 ITLVVNLVV--ESTPTLANLGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVG
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 ILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKEEDVGFNTIPACWWWGTVSMTTVGYGDVVPVTVAGKLA
.:::::.::.:.:: :::: ::::. :. ::::::::.:::::::::::::: :.::::.
CCDS62 LLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEGLATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLT
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 ASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSNHQEFEDLLSSVDGVSEASL
::.:::.:::::.::::.::::::::::::: ::.:.:. . : : .. : .:. .
CCDS62 ASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCD---FGDGMKEVPSVNLRDY
400 410 420 430 440
500 510 520
pF1KE4 ETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY
. . : .. ... ..:::
CCDS62 YAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR
450 460 470
>>CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (436 aa)
initn: 751 init1: 239 opt: 878 Z-score: 1004.6 bits: 195.3 E(32554): 1.2e-49
Smith-Waterman score: 878; 35.5% identity (64.8% similar) in 454 aa overlap (46-482:5-434)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 SKVVLPTPLGGRSTETFVSEFPGPDTGIRWRRSDEALRVNVGGVRRQLSARALARFPGTR
: . .. .::::.: .:: . : :: :
CCDS18 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRR
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 LGRLQAAASEEQARRLCDDYDEAAREFYFDRHPGFFLSLLHFYRT-GHLHVLDELCVFAF
..::.. ::... ..:::::. :..:::: : .: . : :.:. ..: ..:
CCDS18 VSRLHGCRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSF
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 GQEADYWGLGENALAACCRARYLERRLTQPHAWDEDSDTPSSVDPCPDEISDVQRELARY
.: :::: : :: .::: :. ::: . . :: . . :. ::
CCDS18 YNEMIYWGLEGAHLEYCC-----QRRLD-----DRMSDTYTFYS--ADEPGVLGRDEARP
100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 GAARCGRLRR---RLWLTMENPGYSLPSKLFSCVSISVVLASIAAMCIHSLPEYQAREAA
:.:. . :: :. :.:.: :: ..... ::. :..:....: .::.. :.::
CCDS18 GGAEAAPSRRWLERMRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDW--RNAA
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300
pF1KE4 A--------AVAAVAAGRSPEGVRDDPVLRRLEYFCIAWFSFEVSSRLLLAPSTRNFFCH
: . ... :: : :. .: .::.::. : :.... . .: .
CCDS18 ADNRSLDDRSRYSAGPGREPSGI--------IEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKR
210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 PLNLIDIVSVLPFYLTLLAGVALGDQGGKEFGHLGKVVQVFRLMRIFRVLKLARHSTGLR
:::.::.... :.:...: : :... .. . : ...:.:.:::: :.::::: ::.
CCDS18 PLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGENS--QLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQ
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410
pF1KE4 SLGATLKHSYREVGILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKEEDV-----GFNTIPACWWWGTVS
.:: :::. :::. .::... :....::... :. :. :..::: :: .:
CCDS18 TLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIIS
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 MTTVGYGDVVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSN
::::::::. :.:: :.. .. :...::...:::::.:...: . :.. : : :
CCDS18 MTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSL
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520
pF1KE4 HQEFEDLLSSVDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY
::
CCDS18 STEFLN
>>CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 (495 aa)
initn: 778 init1: 251 opt: 733 Z-score: 838.0 bits: 164.6 E(32554): 2.3e-40
Smith-Waterman score: 810; 31.6% identity (63.4% similar) in 500 aa overlap (22-506:2-456)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MLMLLVRGTHYENLRSKVVLPTPLGGRSTETFVSEFPG-PDTGIRWRRSD-------EAL
: ..:.... .: :: :. : :..: : .
CCDS85 MTVMSGENVDE-ASAAPGHPQDGSYPRQADHDDHECCERV
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 RVNVGGVRRQLSARALARFPGTRLGRLQAAASEEQARRLCDDYDEAAREFYFDRHPGFFL
.:..:.: . . ..::.::.: :: ... : .: :..:::. :
CCDS85 VINISGLRFETQLKTLAQFPNTLLGN-----PKKRMRY----FDPLRNEYFFDRNRPSFD
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 SLLHFYRTG-HLHVLDELCVFAFGQEADYWGLGENALAACCRARYLERRLTQPHAWDEDS
..:..:..: .:. .. . :..: .. :::.:. ... . ... ..
CCDS85 AILYYYQSGGRLRRPVNVPLDMFSEEIKFYELGEEAM----------EKFREDEGFIKEE
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 DTPSSVDPCPDEISDVQRELARYGAARCGRLRRRLWLTMENPGYSLPSKLFSCVSISVVL
. : :.. . .:..:: .: : : :..... ::. :.:
CCDS85 ERP-----LPEK-----------------EYQRQVWLLFEYPESSGPARVIAIVSVMVIL
150 160 170
240 250 260 270 280
pF1KE4 ASIAAMCIHSLPEYQA-REAAAAVAAVAAGRS--PEGVRDDPVLRRLEYFCIAWFSFEVS
::. .:...::: . .. ...: . .. :: . .: .:: :::::.
CCDS85 ISIVIFCLETLPELKDDKDFTGTVHRIDNTTVIYNSNIFTDPFFI-VETLCIIWFSFELV
180 190 200 210 220 230
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 SRLLLAPSTRNFFCHPLNLIDIVSVLPFYLTLLAGVAL--GDQGGKEFGHLGKVVQVFRL
:.. :: .:: . .:.::::...:...:: . .: :.: :.. :. ...:.::
CCDS85 VRFFACPSKTDFFKNIMNFIDIVAIIPYFITLGTEIAEQEGNQKGEQATSLA-ILRVIRL
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 MRIFRVLKLARHSTGLRSLGATLKHSYREVGILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKEE-DVGF
.:.::..::.::: ::. :: ::: :.::.:.:...: .:: .::...: :: :: . :
CCDS85 VRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEAEEAESHF
300 310 320 330 340 350
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 NTIPACWWWGTVSMTTVGYGDVVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYR
..:: .::..::::::::::. :::..::...: : ..:.:..:::. .: ..:..::.
CCDS85 SSIPDAFWWAVVSMTTVGYGDMYPVTIGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYH
360 370 380 390 400 410
470 480 490 500 510 520
pF1KE4 RQKALEAAVRNSNHQEFEDLLSSVDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQM
:. : .. : .: :. : ..: :. .:
CCDS85 RETEGEEQAQ-LLHVSSPNLASDSDLSRRSSSTMSKSEYMEIEEDMNNSIAHYRQVNIRT
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 Y
CCDS85 ANCTTANQNCVNKSKLLTDV
480 490
>>CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 (511 aa)
initn: 677 init1: 357 opt: 688 Z-score: 786.4 bits: 155.1 E(32554): 1.8e-37
Smith-Waterman score: 765; 29.7% identity (63.7% similar) in 474 aa overlap (37-504:74-501)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 RGTHYENLRSKVVLPTPLGGRSTETFVSEFPGPDTGIRWRRSDEALRVNVGGVRRQLSAR
:::. . .... . .:..:.: . . :
CCDS82 SSFSNGKILISESTNHETAFSKLPGDYADPPGPEP-VVLNEGNQRVIINIAGLRFETQLR
50 60 70 80 90 100
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 ALARFPGTRLGRLQAAASEEQARRLCDDYDEAAREFYFDRHPGFFLSLLHFYRTG-HLHV
.:..:: : :: .. .:. . .: :..:::. : ..:..:..: ...
CCDS82 TLSQFPETLLG--------DREKRM-QFFDSMRNEYFFDRNRPSFDGILYYYQSGGKIRR
110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LDELCVFAFGQEADYWGLGENALAACCRARYLERRLTQPHAWDEDSDTPSSVDPCPDEIS
.. . :..: ... :: .:. .. . ... .: : .. : :
CCDS82 PANVPIDIFADEISFYELGSEAMD----------QFREDEGFIKD---PETLLPTND---
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190 200 210 220 230 240
pF1KE4 DVQRELARYGAARCGRLRRRLWLTMENPGYSLPSKLFSCVSISVVLASIAAMCIHSLPEY
..:..:: .: : : .. . ::. ::. ::. .:...:::.
CCDS82 ----------------IHRQFWLLFEYPESSSAARAVAVVSVLVVVISITIFCLETLPEF
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pF1KE4 QAREAAAAVAAVAAGRSP----EGVRDDPVLRRLEYFCIAWFSFEVSSRLLLAPSTRNFF
. . .: . : . . :: . .: ::.::.::. :... :: .::
CCDS82 REDRELKVVRDPNLNMSKTVLSQTMFTDPFFM-VESTCIVWFTFELVLRFVVCPSKTDFF
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pF1KE4 CHPLNLIDIVSVLPFYLTLLAGVALGDQGGKEFGHLGKVVQVFRLMRIFRVLKLARHSTG
. .:.:::.:..:.. ::.. .. . . . . .....::.:.::..::.::: :
CCDS82 RNIMNIIDIISIIPYFATLITELVQETEPSAQQNMSLAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LRSLGATLKHSYREVGILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKEE-DVGFNTIPACWWWGTVSMT
:. :: ::: :.::.:.:...: .:: .::...: :: .: . :..:: .::..:.::
CCDS82 LQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEVDEPESHFSSIPDGFWWAVVTMT
370 380 390 400 410 420
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pF1KE4 TVGYGDVVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSNHQ
::::::. :.: .::.... : ..:.:..:::. .: ..:..::.:. : ...
CCDS82 TVGYGDMCPTTPGGKIVGTLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRET--ENEEKQNIPG
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pF1KE4 EFEDLLSSVDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY
:.: .:.:: : .: .. .:.
CCDS82 EIERILNSV-GSRMGSTDSLNKTNGGCSTEKSRK
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...: .:: . : . .: :: : .. . . ::
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::: : :: .::. :: ::::.: : :. . .:::: . . :..::
CCDS63 VGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVVASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFD
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pF1KE4 RHPGFFLSLLHFYRTGHLHVLDELCVFAFGQEADYWGLGENALAACCRARYLERR-LTQP
: : .::.::::.:::...::...: :: .:::. : .. .::: ::..:. :..
CCDS63 RSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKELSET
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pF1KE4 HAWDEDSDTPSSVDPCPDEISDVQRELARYGAARCGRLRRRLWLTMENPGYSLPSKLFSC
. .:.. :. :. . : .. . : .:..:: .:.:: : ...:.
CCDS63 LDFKKDTE---------DQESQHESE-QDFSQGPCPTVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGV
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.:: :..:: : . : : .. . : .:. ::: ::.::.
CCDS63 ISIIFVVVSIINMALMS----------AELSWL----------DLQLLEILEYVCISWFT
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pF1KE4 FEVSSRLLLAPSTRNFFCHPLNLIDIVSVLPFYLTLLAGVALGDQGGKEFGHLGKVVQVF
: :.: . . :. . :.::....::::.:::. :.: .:. ..:..:::.
CCDS63 GEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITLLVESLSGSQTTQELENVGRIVQVL
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::.: .:.:::.:::::::::: :. . :.:::.:::.:.::.:.:: : : ::. :.
CCDS63 RLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFSTVEYFAEQSIPDT
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pF1KE4 GFNTIPACWWWGTVSMTTVGYGDVVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHF
:...: :::.:.:::::::::. : :..::..: :::.::::.::::.:: ..::
CCDS63 TFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLALPIAIINDRFSAC
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pF1KE4 YRRQKALEAAVRNSNHQEFEDLLSSVDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHP
: : :::::
CCDS63 YFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSIMEMLRLKGRERASTRSSG
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: .:::..: . .:: :: ::. .. . ::. : :. : .: : ..:: ..
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. : :.::...:. ::::.: : .::.. :.:::::::.:::.::. :.:
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. .: :::::. .: :::::. :.. :: :: ..:. .:::.::.::..:
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:: :: .: .. .... ..:::::..:::::::.:::::::.:::::::::.:::.:
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::.:::.:.::.:.:: . :..::.. .. ...:: ::::.:.:::::::::. :::.::
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:: :: ::. :::::::::::::::::..:..:: ..
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. ::: ::.: ::..:::: : ..:..:..: .:. .. . .: .:.
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..::: ::: : : :: : : : .: : : . ::
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.::: .: : : ..... ::. :.:.::...:...::... :.... .::.
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::: : . .:: . .: .:: :::::. :::. :: :: .
CCDS12 AAGPFPAPLNGSSQMPGNPPRLPFNDPFFV-VETLCICWFSFELLVRLLVCPSKAIFFKN
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.::::.:..::....: :. :. : : :.. :. ...:.::.:.::..::.::: :
CCDS12 VMNLIDFVAILPYFVAL--GTELARQRGVGQQAMSLA-ILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKG
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:. :: ::. :.::.:.:...: .:: .::...: :: .. : :..:: .::..:.::
CCDS12 LQILGQTLRASMRELGLLIFFLFIGVVLFSSAVYFAEVDRVDSHFTSIPESFWWAVVTMT
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pF1KE4 TVGYGDVVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSNHQ
::::::..::::.::...: : ..:.:...::. .: ..::.::.:. : :
CCDS12 TVGYGDMAPVTVGGKIVGSLCAIAGVLTISLPVPVIVSNFSYFYHRETEGEEAGMFSHVD
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pF1KE4 EFEDLLSSVDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY
CCDS12 MQPCGPLEGKANGGLVDGEVPELPPPLWAPPGKHLVTEV
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: . .:..:.: . . ..: .:: : ::
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80 90 100 110 120 130
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. ::. .: :..:::. : ..:..:..: ... .. . :..:
CCDS82 ------DPKRRM-RYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRIRRPVNVPIDIFSEEI
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.. :::.:. .. : :: . . .: : :
CCDS82 RFYQLGEEAME-----KFRE---------DEGF------------LREEERPLPRRD---
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..:..:: .: : : :.. .. ::. :.: ::. .:...:::.. .. : ..
CCDS82 ---FQRQVWLLFEYPESSGPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDEKDYPASTSQD
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::: : : : .:: . .: .:: :::::. :.. :: .: . .:::
CCDS82 SFEAAGNSTSGSRAGASSFSDPFFV-VETLCIIWFSFELLVRFFACPSKATFSRNIMNLI
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pF1KE4 DIVSVLPFYLTLLAGVALGD-QGGKEFGHLGKVVQVFRLMRIFRVLKLARHSTGLRSLGA
:::...:...:: :. :.. ::. . . ...:.::.:.::..::.::: ::. ::
CCDS82 DIVAIIPYFITL--GTELAERQGNGQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQ
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CCDS82 TLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADDPTSGFSSIPDAFWWAVVTMTTVGYGD
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pF1KE4 VVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSNHQEFEDLL
. :::..::...: : ..:.:..:::. .: ..:..::.:. : . . . :
CCDS82 MHPVTIGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQSQYMHVGSCQHLS
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pF1KE4 SSVDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY
::.. . .: ... :.
CCDS82 SSAEELRKARSNSTLSKSEYMVIEEGGMNHSAFPQTPFKTGNSTATCTTNNNPNSCVNIK
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pF1KE4 LPTPLGGRSTETFVSEFPGPDTGIRWRRSDEALRVNVGGVRRQLSARALARFPGTRLGRL
: . .:..:.: . . ..::.:: : ::
CCDS82 VATGDPADEAAALPGHPQDTYDPEADHECCERVVINISGLRFETQLKTLAQFPETLLG--
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. .:. .: :..:::. : ..:..:..: .:. .. . :..:
CCDS82 ------DPKKRM-RYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRLRRPVNVPLDIFSEEI
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.. :::.:. : . . .:. : :..
CCDS82 RFYELGEEAMEMF--------REDEGYIKEEER-------PLPEN---------------
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CCDS82 --EFQRQVWLLFEYPESSGPARIIAIVSVMVILISIVSFCLETLPIFRDENEDMHGSGVT
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. . : : .. :: . .: .:: ::::: :.. :: .:: . .:.:::
CCDS82 FHTYSNSTIGYQQSTSFTDPFFI-VETLCIIWFSFEFLVRFFACPSKAGFFTNIMNIIDI
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:...:...:: :: : :.. :. ...:.::.:.::..::.::: ::. ::
CCDS82 VAIIPYFITLGTELAEKPEDAQQGQQAMSLA-ILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQ
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::: :.::.:.:...: .:: .::...: :: .: . : .:: .::..::::::::::
CCDS82 TLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADERESQFPSIPDAFWWAVVSMTTVGYGD
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.::.:..::...: : ..:.:..:::. .: ..:..::.:. : .. .. ..
CCDS82 MVPTTIGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGE------EQAQYLQVT
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pF1KE4 SSVDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY
: : .:. :: .: ..: .: :
CCDS82 SCPKIPSSPDLKKSRSASTISKSDYMEIQEGVNNSNEDFREENLKTANCTLANTNYVNIT
440 450 460 470 480 490
526 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 01:52:16 2016 done: Sun Nov 6 01:52:16 2016
Total Scan time: 3.440 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]