Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4125
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4125, 513 aa
1>>>pF1KE4125 513 - 513 aa - 513 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4573+/-0.000885; mu= 17.4985+/- 0.053
mean_var=79.8927+/-15.843, 0's: 0 Z-trim(107.3): 74 B-trim: 69 in 1/49
Lambda= 0.143490
statistics sampled from 9435 (9512) to 9435 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16
Scan time: 2.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 3431 720.2 1.4e-207
CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 1882 399.5 4.6e-111
CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 1286 276.1 5.9e-74
CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 1116 240.9 2.2e-63
CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 983 213.4 4.2e-55
CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 965 209.7 6.2e-54
CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 960 208.6 1.2e-53
CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 926 201.7 1.8e-51
CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 820 179.9 1.1e-44
CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 816 179.0 1.8e-44
CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 625 139.4 1.2e-32
CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 615 137.3 4.7e-32
CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 611 136.4 7.2e-32
CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 605 135.2 1.7e-31
CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 605 135.2 1.9e-31
CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 599 133.9 3.7e-31
CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 594 132.9 8.4e-31
CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 573 128.6 1.8e-29
CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 570 127.9 2.6e-29
CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 447 102.5 1.2e-21
CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 558) 397 92.2 1.7e-18
CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 583) 397 92.2 1.8e-18
CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 613) 397 92.2 1.8e-18
CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 618) 397 92.2 1.8e-18
CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 629) 397 92.2 1.9e-18
CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 638) 397 92.2 1.9e-18
CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 386 89.9 9e-18
CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 385 89.7 1.1e-17
CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 384 89.5 1.2e-17
CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 384 89.5 1.2e-17
CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 357 83.8 4.8e-16
CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 511) 309 73.9 4.8e-13
CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 585) 309 73.9 5.4e-13
CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs108|chr19 ( 757) 287 69.5 1.5e-11
>>CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 (513 aa)
initn: 3431 init1: 3431 opt: 3431 Z-score: 3840.5 bits: 720.2 E(32554): 1.4e-207
Smith-Waterman score: 3431; 100.0% identity (100.0% similar) in 513 aa overlap (1-513:1-513)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MTLLPGDNSDYDYSALSCTSDASFHPAFLPQRQAIKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MTLLPGDNSDYDYSALSCTSDASFHPAFLPQRQAIKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKACTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKACTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 PGAFGTILTFLRAGKLRLLREMCALSFQEELLYWGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PGAFGTILTFLRAGKLRLLREMCALSFQEELLYWGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 EREEEDDALDSEGRDSEGPAEGEGRLGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EREEEDDALDSEGRDSEGPAEGEGRLGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 AVNLSVSTLPSLREEEEQGHCSQMCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVNLSVSTLPSLREEEEQGHCSQMCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 LTLIDLVAILPYYITLLVDGAAAGRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LTLIDLVAILPYYITLLVDGAAAGRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 LGLQTLGLTARRCTREFGLLLLFLCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LGLQTLGLTARRCTREFGLLLLFLCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 TMTTVGYGDMVPRSTPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TMTTVGYGDMVPRSTPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFR
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KE4 RAQFLIKTKSQLSVSQDSDILFGSASSDTRDNN
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RAQFLIKTKSQLSVSQDSDILFGSASSDTRDNN
490 500 510
>>CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 (519 aa)
initn: 1909 init1: 1305 opt: 1882 Z-score: 2107.4 bits: 399.5 E(32554): 4.6e-111
Smith-Waterman score: 1882; 63.0% identity (84.9% similar) in 449 aa overlap (34-480:35-474)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 LPGDNSDYDYSALSCTSDASFHPAFLPQRQAIKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRR
.::: .:::.... : .: : ..
CCDS10 SRDGGLHPRHHHYGSHSPWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDA-----SPVDLKK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKACTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGA
.:.::::: .: :::.:::.:::.::..:. : ....:...::::: .::::::.:.:
CCDS10 EILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 FGTILTFLRAGKLRLLREMCALSFQEELLYWGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMVERE
::.:..:: :::: ::.::::::::::: :::: : ::. :: :. :.:.::. :... .
CCDS10 FGVIVSFLAAGKLVLLQEMCALSFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 EEDDALDSEGRDSEGPAEGEGRLGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVN
.:: . . :... :: .: : :: :::.::: :.::::::::::::.:::..:::.
CCDS10 RED--VLRQQRETRRPASHSSRWGLCMNRLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LSVSTLPSLREEEEQGHCSQMCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTL
: :::.:.:: ::.::.::. :. .::::..::.:::::: ::..:: .: :...::..
CCDS10 LCVSTMPDLRAEEDQGECSRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IDLVAILPYYITLLV--DGAAAGRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSL
::..:: :::..: : . :.: : .:.:::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IDILAISPYYVSLAVSEEPPEDGER-P-SGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 GLQTLGLTARRCTREFGLLLLFLCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVIT
::::::::.:::::::::::::: :::.::.::.:: :.: . ::::::: ::::.:.
CCDS10 GLQTLGLTVRRCTREFGLLLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIIS
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 MTTVGYGDMVPRSTPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRR
:::::::::::::.:::.:::::::::::.::::.::::::::.::::::.:::... :
CCDS10 MTTVGYGDMVPRSVPGQMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARL
420 430 440 450 460 470
490 500 510
pF1KE4 AQFLIKTKSQLSVSQDSDILFGSASSDTRDNN
CCDS10 RHLQNTGPASECELLDPHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM
480 490 500 510
>>CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 (466 aa)
initn: 1714 init1: 763 opt: 1286 Z-score: 1441.3 bits: 276.1 E(32554): 5.9e-74
Smith-Waterman score: 1730; 58.5% identity (79.0% similar) in 467 aa overlap (51-513:2-456)
30 40 50 60 70
pF1KE4 DASFHPAFLPQRQAIKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPED----RRRRIIINVGGIKYSL
:: :.: : :..:::::: . :
CCDS12 MEP-WPCSPGGGGGTRARHVIINVGGCRVRL
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 PWTTLDEFPLTRLGQLKACTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRAGKL
:..: . ::.:: .:.:: . ::.: :::::::. .::::::.: :: .:...::::::
CCDS12 AWAALARCPLARLERLRACRGHDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKL
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 RLLREMCALSFQEELLYWGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDS
:::: :::.:..:: :::: : .:. :: :: .. :: :: : : : .: .
CCDS12 RLLRGPCALAFRDELAYWGIDEARLERCCLRRLRRREEEAAEARAGPTERGAQGSPAR-A
100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 EGPAEGEGRLGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEE
:: .::: : :::::.:. ::::: ::.:::.:: ::.::::.: .::.:..: ::
CCDS12 LGP---RGRLQRGRRRLRDVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEE
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 EQGHCSQMCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITL
:.:.:: :...:..:.:::.:::.::::: .:: :: ::::.::..::..:.::.:..:
CCDS12 ERGECSPKCRSLFVLETVCVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSL
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KE4 LVDGAAAGRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTRE
:. : ::: :: :.. :...:::::.:::::.:::::::::::::..:::: :::.::
CCDS12 LL-GLAAG---PG-GTKLLERAGLVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCARE
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KE4 FGLLLLFLCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTP
:::::::::::.::::::... : :.. .:.:.:: ::::::.::::::::::::: :
CCDS12 FGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLP
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 GQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQ
::::::::::::::::::::::::::::::: :::..:.:. . . . . ....
CCDS12 GQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATE
390 400 410 420 430 440
500 510
pF1KE4 DSDILFGSASSDTRDNN
::. : :. :..
CCDS12 DSSQ--GPDSAGLADDSADALWVRAGR
450 460
>>CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (436 aa)
initn: 939 init1: 318 opt: 1116 Z-score: 1251.5 bits: 240.9 E(32554): 2.2e-63
Smith-Waterman score: 1116; 42.0% identity (71.6% similar) in 426 aa overlap (65-476:11-425)
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 IKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKA
...:::: .::: : .::: :...:..
CCDS18 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHG
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 CTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRA-GKLRLLREMCALSFQEELLY
: . :.:.:::::: ::.::::. ::: :: ..:. ::::. .:: ::: .:..:
CCDS18 CRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIY
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 WGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDSEGPAEGEGRLGRC-MRR
::. ::. ::.:: ... . . .: .: ::: :. .:. .: ..:
CCDS18 WGLEGAHLEYCCQRRLDDRMSD-TYTFYSADEPGVL---GRDEARPGGAEAAPSRRWLER
110 120 130 140 150
220 230 240 250 260
pF1KE4 LRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEEEQGHC----SQMCHN-
.: :.: :.: ....: .::.:: :. : : .::::. :. ... :.. .
CCDS18 MRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRYSAGP
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 ----VFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVDGAAA
:.:..:.:::. : ..:.: . .: :.. ::..:::.:: ::::..:. . .
CCDS18 GREPSGIIEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMT-VFT
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 GRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGLLLLF
:. :: :...:..::::: .::..:..:::: .:::::::: .:: ::. .::.:
CCDS18 GE------NSQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVF
280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 LCVAIALFAPLLYVIENEM---ADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVV
.:::.:.:. : ..:. . ... .:::::: ::..:.::::::::: : ..::...
CCDS18 ICVAMAIFSALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRIL
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 ALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSDI
. ..:::.:.:.:.: :.:.: . : ::: .. :
CCDS18 GGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN
390 400 410 420 430
510
pF1KE4 LFGSASSDTRDNN
>>CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (425 aa)
initn: 1104 init1: 265 opt: 983 Z-score: 1102.8 bits: 213.4 E(32554): 4.2e-55
Smith-Waterman score: 1136; 42.7% identity (72.7% similar) in 417 aa overlap (65-476:11-414)
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 IKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKA
...:::: .::: : .::: :...:..
CCDS42 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHG
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 CTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRA-GKLRLLREMCALSFQEELLY
: . :.:.:::::: ::.::::. ::: :: ..:. ::::. .:: ::: .:..:
CCDS42 CRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIY
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 WGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDSEGPAEGEGRLGRC-MRR
::. ::. ::.:: ... . . .: .: ::: :. .:. .: ..:
CCDS42 WGLEGAHLEYCCQRRLDDRMSD-TYTFYSADEPGVL---GRDEARPGGAEAAPSRRWLER
110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 LRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEEEQGHCSQMCHNVFIVE
.: :.: :.: ....: .::.:: :. : : .::::. :. ... .. :.:
CCDS42 MRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNR--SLDDRSRIIE
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pF1KE4 SVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVDGAAAGRRKPGAGN
..:.:::. : ..:.: . .: :.. ::..:::.:: ::::..:. . .:. :
CCDS42 AICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMT-VFTGE------N
220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 SYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGLLLLFLCVAIALFA
: :...:..::::: .::..:..:::: .:::::::: .:: ::. .::.:.:::.:.:.
CCDS42 SQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIFS
270 280 290 300 310 320
400 410 420 430 440
pF1KE4 PLLYVIENEM---ADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVVALSSILSGI
: ..:. . ... .:::::: ::..:.::::::::: : ..::.... ..:::
CCDS42 ALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGI
330 340 350 360 370 380
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pF1KE4 LLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSDILFGSASSDT
.:.:.:.: :.:.: . : ::: .. :
CCDS42 VLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN
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30 40 50 60 70 80
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.: . .. . .::::.: :. .:: .::
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pF1KE4 TRLGQLKACTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRAGKLRLLREMCALS
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CCDS16 TRLGKLLTCHSEEAILELCDDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFS
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: .:. :::: : .:.::. :: .. :: : ... .: . :: ..: : :
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:.:. ... .: : : .:..: :. : .. : . : .. ...:. :.
CCDS16 FDTLRFGQLRKKIWIRMENPAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNED--GE
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pF1KE4 CSQMCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVDG
.. . :: .:..::. :. .:: :: . : ..::..::.:.:.:.: :: ::
CCDS16 VDDPV--LEGVEIACIAWFTGELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVD-
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pF1KE4 AAAGRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGLL
: ... ....: :...:: .::. ...:::::.::..:: : :. .: :::
CCDS16 -----TKEEESED-IENMGKVVQILRLMRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLL
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pF1KE4 LLFLCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVV
:::: :.:..:. :.: .:.. : .:::: :.:::.:.:::::::: : . :...
CCDS16 LLFLSVGISIFSVLIYSVEKDDHTSS-LTSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLI
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: . :. :::..:.:.: ::. ::. : . :
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510
pF1KE4 LFGSASSDTRDNN
CCDS16 RMHTFITSLSSVGIVVSDPDSTDASSIEDNEDICNTTSLENCTAK
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CCDS62 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW
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:: : .:.::. : .:.: :.:. :. :.:. : . .. .:
CCDS62 GINEFFIDSCCSYSYHGRKVEP-----EQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDG
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. :: :.: .. : .. ..::. ::.: : . ... ...::... . ::. ..
CCDS62 QPLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGE
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CCDS62 D-PRFEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVE
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. : .: .: : .::: .::. ...::::: ::..:: : . .: :::::.
CCDS62 ST--PTLAN-----LGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLY
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: :.:..:. . :.::.: .. ...::::.:::...::::::::.:: .: :...: .
CCDS62 LSVGISIFSVVAYTIEKE--ENEGLATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASA
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pF1KE4 SILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSDILFG
::.:::....:.: ::. ::. : . ::
CCDS62 CILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVK
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: :: ::::.: . :. . :..::::. .:.::::.:..: . .: .: : .:
CCDS64 LAGFPKTRLGRLATSTSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLD
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150 160 170 180 190 200
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CCDS64 GLCPRRFLEELGYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRA-QAQVEEAEELF
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. : ::: ...:.: :.. .:... : :: :..: :...:. .... ::.
CCDS64 RDMRFYGPQRRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGE
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270 280 290 300 310
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. . .. :: .:.:.:.::.:::: ..:. : :: :.:.::::::: :. ::..
CCDS64 GGPDLRPILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLE
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320 330 340 350 360 370
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.. .. : . . ::: ::::.: .::. ...::::: ::...:.: :.: .. :
CCDS64 CFTGEGHQRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGC
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pF1KE4 LLLFLCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQV
::::. ..: :. .: .:... : .::.:: .:::.....::::::: :.. :.
CCDS64 LLLFIAMGIFTFSAAVYSVEHDVP-STNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRF
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440 450 460 470 480 490
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:. : ::.: ..:.. ... :: : .:: : . .:: . .. : . .. ..
CCDS64 FAFLCIAFGIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKA-YEYTTIRRERGEVNFM-QRARKKIAE
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500 510
pF1KE4 ILFGSASSDT-RDNN
:.:: . : :..:
CCDS64 CLLGSNPQLTPRQEN
540
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:... . : :::..: ::::.:. :.. ...:.:::::... ::.::::.:::: .::.:
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CCDS62 YRTGKLHMMEEMCALSFGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAET-MRE
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::.. .. . : ..: :..:.:.:.. .:..: .:.::...... ::..:::
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:.: .: :. . :. : ::.::..::..:.:::....:.:. :...::..:::.
CCDS62 ELQETDEFGQLNDNRQLAH----VEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLL
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::::::.:... . . . ...: :....: .::: ...::::: :::.::
CCDS62 AILPYYVTIFLTESNKSVLQ-------FQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLG
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.: :: :.:::.::: ..: .:. :.. :.. :. .:::::: .:::.::::::::
CCDS62 FTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKD-EDATKFTSIPASFWWATITMTTVGY
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pF1KE4 GDMVPRSTPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIK
::. :.. :..:. ..:.:..:.:. : ..::. : : :. ::... :: . : .
CCDS62 GDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFYKEQKR-QEKAIKRR-EALER
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.: . :.
CCDS62 AKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSET
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CCDS13 MPAGMTKHGS--RSTSSLPP--EPMEIVRSKA
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::. .::::. . . : :::..: ::::.:. :.. :..:.:::::.. ::.::::.
CCDS13 CSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRH
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CCDS13 PGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEEL
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pF1KE4 EREEEDDALDSEGRDSEGPAEGEGRLGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVT
.:: : . ::.. .. .: : ..: :..:.:.:.. .:..: .:..:....
CCDS13 KREAET-LREREGEEFDNTCCAEKR-----KKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLS
150 160 170 180 190 200
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CCDS13 TIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAH----VEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFF
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CCDS13 KGPLNAIDLLAILPYYVTIFLT-------ESNKSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLA
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CCDS13 RHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKD-EDDTKFKSIPASFWW
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pF1KE4 AVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERV
:.::::::::::. :.. :..:. ..:.:..:.:. : ..::. : : :. ::..
CCDS13 ATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFYKEQKR-QEKA
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pF1KE4 MFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSDILFGSASSDTRDNN
. :: . : ..: . :.
CCDS13 IKRR-EALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDKVQDNHLSPNKW
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513 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 01:52:54 2016 done: Sun Nov 6 01:52:55 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]