Result of FASTA (omim) for
pFN21AE4113
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4113, 485 aa
1>>>pF1KE4113 485 - 485 aa - 485 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8380+/-0.000357; mu= 5.1346+/- 0.023
mean_var=235.2072+/-48.148, 0's: 0 Z-trim(121.8): 164 B-trim: 0 in 0/61
Lambda= 0.083627
statistics sampled from 38835 (39007) to 38835 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.743), E-opt: 0.2 (0.457), width: 16
Scan time: 10.650
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016883218 (OMIM: 615566) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 461) 2324 293.0 1.2e-78
NP_001269479 (OMIM: 615566) BTB/POZ domain-contain ( 461) 2324 293.0 1.2e-78
XP_016883217 (OMIM: 615566) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 461) 2324 293.0 1.2e-78
NP_001269480 (OMIM: 615566) BTB/POZ domain-contain ( 461) 2324 293.0 1.2e-78
NP_055777 (OMIM: 615566) BTB/POZ domain-containing ( 522) 2324 293.0 1.4e-78
NP_852108 (OMIM: 615566) BTB/POZ domain-containing ( 565) 2324 293.0 1.4e-78
XP_016883219 (OMIM: 615566) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 371) 2014 255.5 1.9e-67
NP_001269483 (OMIM: 615566) BTB/POZ domain-contain ( 371) 2014 255.5 1.9e-67
NP_001269481 (OMIM: 615566) BTB/POZ domain-contain ( 371) 2014 255.5 1.9e-67
NP_060267 (OMIM: 608531) BTB/POZ domain-containing ( 525) 1357 176.3 1.8e-43
NP_079514 (OMIM: 608530) BTB/POZ domain-containing ( 482) 1305 170.0 1.3e-41
XP_005259650 (OMIM: 608531) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 377) 1093 144.4 5.4e-34
NP_001011885 (OMIM: 608530) BTB/POZ domain-contain ( 385) 998 132.9 1.6e-30
XP_011526429 (OMIM: 608531) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 204) 484 70.7 4.5e-12
XP_016865716 (OMIM: 611237) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 387) 335 52.9 1.9e-06
XP_011512584 (OMIM: 611237) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 387) 335 52.9 1.9e-06
XP_011512583 (OMIM: 611237) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 391) 335 52.9 1.9e-06
XP_011512582 (OMIM: 611237) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 401) 335 52.9 1.9e-06
NP_443125 (OMIM: 611237) BTB/POZ domain-containing ( 612) 335 53.1 2.6e-06
XP_011512581 (OMIM: 611237) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 612) 335 53.1 2.6e-06
NP_001092742 (OMIM: 611237) BTB/POZ domain-contain ( 612) 335 53.1 2.6e-06
NP_006054 (OMIM: 607701,615731) kelch-like protein ( 606) 294 48.1 8e-05
NP_689606 (OMIM: 615340,615348) kelch-like protein ( 621) 282 46.7 0.00022
NP_001165889 (OMIM: 611237) BTB/POZ domain-contain ( 582) 273 45.6 0.00045
XP_016867930 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 303) 260 43.8 0.00083
XP_016867929 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 325) 259 43.7 0.00095
XP_016867928 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 564) 260 44.0 0.0013
NP_001026880 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-li ( 586) 259 43.9 0.0015
XP_011541998 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 258 43.8 0.0016
NP_003624 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex pr ( 589) 258 43.8 0.0016
NP_001243503 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 258 43.8 0.0016
XP_011541999 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 258 43.8 0.0016
NP_001243504 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 258 43.8 0.0016
NP_061334 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-like ( 538) 257 43.6 0.0016
NP_689680 (OMIM: 608778,615081) kelch-like protein ( 608) 258 43.8 0.0016
NP_001316524 (OMIM: 608778,615081) kelch-like prot ( 608) 258 43.8 0.0016
NP_689946 (OMIM: 611237) BTB/POZ domain-containing ( 544) 249 42.7 0.0032
NP_987096 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 248 42.6 0.0039
XP_011526754 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 248 42.6 0.0039
XP_005260230 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 248 42.6 0.0039
NP_036421 (OMIM: 606016) kelch-like ECH-associated ( 624) 248 42.6 0.0039
XP_005260231 (OMIM: 606016) PREDICTED: kelch-like ( 624) 248 42.6 0.0039
NP_065854 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 isof ( 620) 237 41.3 0.0096
NP_001278932 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 620) 237 41.3 0.0096
>>XP_016883218 (OMIM: 615566) PREDICTED: BTB/POZ domain- (461 aa)
initn: 2324 init1: 2324 opt: 2324 Z-score: 1532.7 bits: 293.0 E(85289): 1.2e-78
Smith-Waterman score: 2324; 75.8% identity (89.9% similar) in 455 aa overlap (31-485:7-461)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGNNHQESP
::. :. . . .:: .:
XP_016 MAADIFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNNNLIPAP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GWRCCRPTLRERNALMFNNELMADVHFVVGPPGATRTVPAHKYVLAVGSSVFYAMFYGDL
.:. ::.:::::.::::.:::::::::::::.:. .:.::::::::::::.:::::.:
XP_016 NWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMADVHFVVGPPGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHAMFYGEL
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 AEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLE
:: :.::.:::::::::: .:::.: ::::: ::::::::::::::::: ::.:::::::
XP_016 AEDKDEIRIPDVEPAAFLAMLKYIYCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLE
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQTLEIIVTREA
::: ::::::::::: :::::.::::::::::::::.::.:::::.:: :::: :. ::.
XP_016 TSLSAKNACVLLSQSCLFEEPDLTQRCWEVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRET
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQS
::.:: :::::.:::::.::.:: : .. .:::.:::.::::.:::::.:..::::::::
XP_016 LNAKEIVVFEAALNWAEVECQRQDLALSIENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQS
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 DILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFPLTKRKGLAPQRCHRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSI
.:::.::..:::::::..::.:.: ::::.::::::::: ::::::::::::::::
XP_016 GVLTLNETNDIFLWYTAAKKPELQFVSKARKGLVPQRCHRFQSCAYRSNQWRYRGRCDSI
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 QFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAEYSVKIELKRLGVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEH
:::::.::::::.:::::: :.::::.:::::: ::::.:::.:..:::::::::::::.
XP_016 QFAVDKRVFIAGFGLYGSSCGSAEYSAKIELKRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEY
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 PVQVEQDTFYTASAVLDGSELSYFGQEGMTEVQCGKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE
:::.: :::::::..:::.::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::
XP_016 PVQIEPDTFYTASVILDGNELSYFGQEGMTEVQCGKVTVQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 LIFYA
:::::
XP_016 LIFYA
460
>>NP_001269479 (OMIM: 615566) BTB/POZ domain-containing (461 aa)
initn: 2324 init1: 2324 opt: 2324 Z-score: 1532.7 bits: 293.0 E(85289): 1.2e-78
Smith-Waterman score: 2324; 75.8% identity (89.9% similar) in 455 aa overlap (31-485:7-461)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGNNHQESP
::. :. . . .:: .:
NP_001 MAADIFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNNNLIPAP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GWRCCRPTLRERNALMFNNELMADVHFVVGPPGATRTVPAHKYVLAVGSSVFYAMFYGDL
.:. ::.:::::.::::.:::::::::::::.:. .:.::::::::::::.:::::.:
NP_001 NWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMADVHFVVGPPGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHAMFYGEL
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pF1KE4 AEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLE
:: :.::.:::::::::: .:::.: ::::: ::::::::::::::::: ::.:::::::
NP_001 AEDKDEIRIPDVEPAAFLAMLKYIYCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLE
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pF1KE4 TSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQTLEIIVTREA
::: ::::::::::: :::::.::::::::::::::.::.:::::.:: :::: :. ::.
NP_001 TSLSAKNACVLLSQSCLFEEPDLTQRCWEVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRET
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pF1KE4 LNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQS
::.:: :::::.:::::.::.:: : .. .:::.:::.::::.:::::.:..::::::::
NP_001 LNAKEIVVFEAALNWAEVECQRQDLALSIENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQS
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pF1KE4 DILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFPLTKRKGLAPQRCHRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSI
.:::.::..:::::::..::.:.: ::::.::::::::: ::::::::::::::::
NP_001 GVLTLNETNDIFLWYTAAKKPELQFVSKARKGLVPQRCHRFQSCAYRSNQWRYRGRCDSI
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pF1KE4 QFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAEYSVKIELKRLGVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEH
:::::.::::::.:::::: :.::::.:::::: ::::.:::.:..:::::::::::::.
NP_001 QFAVDKRVFIAGFGLYGSSCGSAEYSAKIELKRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEY
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pF1KE4 PVQVEQDTFYTASAVLDGSELSYFGQEGMTEVQCGKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE
:::.: :::::::..:::.::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::
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pF1KE4 LIFYA
:::::
NP_001 LIFYA
460
>>XP_016883217 (OMIM: 615566) PREDICTED: BTB/POZ domain- (461 aa)
initn: 2324 init1: 2324 opt: 2324 Z-score: 1532.7 bits: 293.0 E(85289): 1.2e-78
Smith-Waterman score: 2324; 75.8% identity (89.9% similar) in 455 aa overlap (31-485:7-461)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGNNHQESP
::. :. . . .:: .:
XP_016 MAADIFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNNNLIPAP
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pF1KE4 GWRCCRPTLRERNALMFNNELMADVHFVVGPPGATRTVPAHKYVLAVGSSVFYAMFYGDL
.:. ::.:::::.::::.:::::::::::::.:. .:.::::::::::::.:::::.:
XP_016 NWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMADVHFVVGPPGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHAMFYGEL
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pF1KE4 AEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLE
:: :.::.:::::::::: .:::.: ::::: ::::::::::::::::: ::.:::::::
XP_016 AEDKDEIRIPDVEPAAFLAMLKYIYCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLE
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pF1KE4 TSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQTLEIIVTREA
::: ::::::::::: :::::.::::::::::::::.::.:::::.:: :::: :. ::.
XP_016 TSLSAKNACVLLSQSCLFEEPDLTQRCWEVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRET
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pF1KE4 LNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQS
::.:: :::::.:::::.::.:: : .. .:::.:::.::::.:::::.:..::::::::
XP_016 LNAKEIVVFEAALNWAEVECQRQDLALSIENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQS
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pF1KE4 DILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFPLTKRKGLAPQRCHRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSI
.:::.::..:::::::..::.:.: ::::.::::::::: ::::::::::::::::
XP_016 GVLTLNETNDIFLWYTAAKKPELQFVSKARKGLVPQRCHRFQSCAYRSNQWRYRGRCDSI
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pF1KE4 QFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAEYSVKIELKRLGVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEH
:::::.::::::.:::::: :.::::.:::::: ::::.:::.:..:::::::::::::.
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pF1KE4 PVQVEQDTFYTASAVLDGSELSYFGQEGMTEVQCGKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE
:::.: :::::::..:::.::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::
XP_016 PVQIEPDTFYTASVILDGNELSYFGQEGMTEVQCGKVTVQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE
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pF1KE4 LIFYA
:::::
XP_016 LIFYA
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>>NP_001269480 (OMIM: 615566) BTB/POZ domain-containing (461 aa)
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pF1KE4 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGNNHQESP
::. :. . . .:: .:
NP_001 MAADIFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNNNLIPAP
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.:. ::.:::::.::::.:::::::::::::.:. .:.::::::::::::.:::::.:
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pF1KE4 AEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLE
:: :.::.:::::::::: .:::.: ::::: ::::::::::::::::: ::.:::::::
NP_001 AEDKDEIRIPDVEPAAFLAMLKYIYCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLE
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pF1KE4 TSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQTLEIIVTREA
::: ::::::::::: :::::.::::::::::::::.::.:::::.:: :::: :. ::.
NP_001 TSLSAKNACVLLSQSCLFEEPDLTQRCWEVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRET
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pF1KE4 LNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQS
::.:: :::::.:::::.::.:: : .. .:::.:::.::::.:::::.:..::::::::
NP_001 LNAKEIVVFEAALNWAEVECQRQDLALSIENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQS
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pF1KE4 DILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFPLTKRKGLAPQRCHRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSI
.:::.::..:::::::..::.:.: ::::.::::::::: ::::::::::::::::
NP_001 GVLTLNETNDIFLWYTAAKKPELQFVSKARKGLVPQRCHRFQSCAYRSNQWRYRGRCDSI
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pF1KE4 QFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAEYSVKIELKRLGVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEH
:::::.::::::.:::::: :.::::.:::::: ::::.:::.:..:::::::::::::.
NP_001 QFAVDKRVFIAGFGLYGSSCGSAEYSAKIELKRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEY
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pF1KE4 PVQVEQDTFYTASAVLDGSELSYFGQEGMTEVQCGKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE
:::.: :::::::..:::.::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::
NP_001 PVQIEPDTFYTASVILDGNELSYFGQEGMTEVQCGKVTVQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 LIFYA
:::::
NP_001 LIFYA
460
>>NP_055777 (OMIM: 615566) BTB/POZ domain-containing pro (522 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGNNHQESP
::. :. . . .:: .:
NP_055 SSSNSSKLPPVCYEIITLKTKKKKMAADIFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNNNLIPAP
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70 80 90 100 110 120
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.:. ::.:::::.::::.:::::::::::::.:. .:.::::::::::::.:::::.:
NP_055 NWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMADVHFVVGPPGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHAMFYGEL
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 AEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLE
:: :.::.:::::::::: .:::.: ::::: ::::::::::::::::: ::.:::::::
NP_055 AEDKDEIRIPDVEPAAFLAMLKYIYCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLE
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190 200 210 220 230 240
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::: ::::::::::: :::::.::::::::::::::.::.:::::.:: :::: :. ::.
NP_055 TSLSAKNACVLLSQSCLFEEPDLTQRCWEVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRET
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250 260 270 280 290 300
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::.:: :::::.:::::.::.:: : .. .:::.:::.::::.:::::.:..::::::::
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.:::.::..:::::::..::.:.: ::::.::::::::: ::::::::::::::::
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:::::.::::::.:::::: :.::::.:::::: ::::.:::.:..:::::::::::::.
NP_055 QFAVDKRVFIAGFGLYGSSCGSAEYSAKIELKRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEY
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430 440 450 460 470 480
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:::.: :::::::..:::.::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::
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pF1KE4 LIFYA
:::::
NP_055 LIFYA
520
>>NP_852108 (OMIM: 615566) BTB/POZ domain-containing pro (565 aa)
initn: 2324 init1: 2324 opt: 2324 Z-score: 1531.6 bits: 293.0 E(85289): 1.4e-78
Smith-Waterman score: 2324; 75.8% identity (89.9% similar) in 455 aa overlap (31-485:111-565)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGNNHQESP
::. :. . . .:: .:
NP_852 SSSNSSKLPPVCYEIITLKTKKKKMAADIFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNNNLIPAP
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pF1KE4 GWRCCRPTLRERNALMFNNELMADVHFVVGPPGATRTVPAHKYVLAVGSSVFYAMFYGDL
.:. ::.:::::.::::.:::::::::::::.:. .:.::::::::::::.:::::.:
NP_852 NWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMADVHFVVGPPGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHAMFYGEL
150 160 170 180 190 200
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 AEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLE
:: :.::.:::::::::: .:::.: ::::: ::::::::::::::::: ::.:::::::
NP_852 AEDKDEIRIPDVEPAAFLAMLKYIYCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLE
210 220 230 240 250 260
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQTLEIIVTREA
::: ::::::::::: :::::.::::::::::::::.::.:::::.:: :::: :. ::.
NP_852 TSLSAKNACVLLSQSCLFEEPDLTQRCWEVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRET
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pF1KE4 LNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQS
::.:: :::::.:::::.::.:: : .. .:::.:::.::::.:::::.:..::::::::
NP_852 LNAKEIVVFEAALNWAEVECQRQDLALSIENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQS
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pF1KE4 DILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFPLTKRKGLAPQRCHRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSI
.:::.::..:::::::..::.:.: ::::.::::::::: ::::::::::::::::
NP_852 GVLTLNETNDIFLWYTAAKKPELQFVSKARKGLVPQRCHRFQSCAYRSNQWRYRGRCDSI
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370 380 390 400 410 420
pF1KE4 QFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAEYSVKIELKRLGVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEH
:::::.::::::.:::::: :.::::.:::::: ::::.:::.:..:::::::::::::.
NP_852 QFAVDKRVFIAGFGLYGSSCGSAEYSAKIELKRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEY
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430 440 450 460 470 480
pF1KE4 PVQVEQDTFYTASAVLDGSELSYFGQEGMTEVQCGKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE
:::.: :::::::..:::.::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::
NP_852 PVQIEPDTFYTASVILDGNELSYFGQEGMTEVQCGKVTVQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 LIFYA
:::::
NP_852 LIFYA
>>XP_016883219 (OMIM: 615566) PREDICTED: BTB/POZ domain- (371 aa)
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pF1KE4 VHFVVGPPGATRTVPAHKYVLAVGSSVFYAMFYGDLAEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYM
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pF1KE4 YSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLETSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELT
: ::::: ::::::::::::::::: ::.:::::::::: ::::::::::: :::::.::
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pF1KE4 QRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQTLEIIVTREALNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQG
::::::::::::.::.:::::.:: :::: :. ::.::.:: :::::.:::::.::.::
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pF1KE4 LPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQSDILTLEETHSIFLWYTATNKPRLD
: .. .:::.:::.::::.:::::.:..:::::::: .:::.::..:::::::..::.:.
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pF1KE4 FPLTKRKGLAPQRCHRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSIQFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAE
: ::::.::::::::: :::::::::::::::::::::.::::::.:::::: :.::
XP_016 FVSKARKGLVPQRCHRFQSCAYRSNQWRYRGRCDSIQFAVDKRVFIAGFGLYGSSCGSAE
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pF1KE4 YSVKIELKRLGVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEHPVQVEQDTFYTASAVLDGSELSYF
::.:::::: ::::.:::.:..:::::::::::::.:::.: :::::::..:::.:::::
XP_016 YSAKIELKRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEYPVQIEPDTFYTASVILDGNELSYF
280 290 300 310 320 330
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pF1KE4 GQEGMTEVQCGKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA
:::::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GQEGMTEVQCGKVTVQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA
340 350 360 370
>>NP_001269483 (OMIM: 615566) BTB/POZ domain-containing (371 aa)
initn: 2014 init1: 2014 opt: 2014 Z-score: 1331.9 bits: 255.5 E(85289): 1.9e-67
Smith-Waterman score: 2014; 80.6% identity (93.5% similar) in 371 aa overlap (115-485:1-371)
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 VHFVVGPPGATRTVPAHKYVLAVGSSVFYAMFYGDLAEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYM
::::.::: :.::.:::::::::: .:::.
NP_001 MFYGELAEDKDEIRIPDVEPAAFLAMLKYI
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 YSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLETSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELT
: ::::: ::::::::::::::::: ::.:::::::::: ::::::::::: :::::.::
NP_001 YCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLETSLSAKNACVLLSQSCLFEEPDLT
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::::::::::::.::.:::::.:: :::: :. ::.::.:: :::::.:::::.::.::
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pF1KE4 LPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQSDILTLEETHSIFLWYTATNKPRLD
: .. .:::.:::.::::.:::::.:..:::::::: .:::.::..:::::::..::.:.
NP_001 LALSIENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQSGVLTLNETNDIFLWYTAAKKPELQ
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pF1KE4 FPLTKRKGLAPQRCHRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSIQFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAE
: ::::.::::::::: :::::::::::::::::::::.::::::.:::::: :.::
NP_001 FVSKARKGLVPQRCHRFQSCAYRSNQWRYRGRCDSIQFAVDKRVFIAGFGLYGSSCGSAE
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pF1KE4 YSVKIELKRLGVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEHPVQVEQDTFYTASAVLDGSELSYF
::.:::::: ::::.:::.:..:::::::::::::.:::.: :::::::..:::.:::::
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pF1KE4 GQEGMTEVQCGKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA
:::::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GQEGMTEVQCGKVTVQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA
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>>NP_001269481 (OMIM: 615566) BTB/POZ domain-containing (371 aa)
initn: 2014 init1: 2014 opt: 2014 Z-score: 1331.9 bits: 255.5 E(85289): 1.9e-67
Smith-Waterman score: 2014; 80.6% identity (93.5% similar) in 371 aa overlap (115-485:1-371)
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 VHFVVGPPGATRTVPAHKYVLAVGSSVFYAMFYGDLAEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYM
::::.::: :.::.:::::::::: .:::.
NP_001 MFYGELAEDKDEIRIPDVEPAAFLAMLKYI
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 YSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLETSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELT
: ::::: ::::::::::::::::: ::.:::::::::: ::::::::::: :::::.::
NP_001 YCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLETSLSAKNACVLLSQSCLFEEPDLT
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::::::::::::.::.:::::.:: :::: :. ::.::.:: :::::.:::::.::.::
NP_001 QRCWEVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRETLNAKEIVVFEAALNWAEVECQRQD
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pF1KE4 LPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQSDILTLEETHSIFLWYTATNKPRLD
: .. .:::.:::.::::.:::::.:..:::::::: .:::.::..:::::::..::.:.
NP_001 LALSIENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQSGVLTLNETNDIFLWYTAAKKPELQ
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: ::::.::::::::: :::::::::::::::::::::.::::::.:::::: :.::
NP_001 FVSKARKGLVPQRCHRFQSCAYRSNQWRYRGRCDSIQFAVDKRVFIAGFGLYGSSCGSAE
220 230 240 250 260 270
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pF1KE4 YSVKIELKRLGVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEHPVQVEQDTFYTASAVLDGSELSYF
::.:::::: ::::.:::.:..:::::::::::::.:::.: :::::::..:::.:::::
NP_001 YSAKIELKRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEYPVQIEPDTFYTASVILDGNELSYF
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pF1KE4 GQEGMTEVQCGKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA
:::::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GQEGMTEVQCGKVTVQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA
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>>NP_060267 (OMIM: 608531) BTB/POZ domain-containing pro (525 aa)
initn: 1264 init1: 978 opt: 1357 Z-score: 901.5 bits: 176.3 E(85289): 1.8e-43
Smith-Waterman score: 1372; 45.1% identity (72.3% similar) in 501 aa overlap (8-484:28-524)
10 20 30 40
pF1KE4 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAP
:.. ::: : .::.::.. :. . :. :
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::: :. . : .. : .:: :. .::..:: :..::::.. :::
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:.:: ... .:::..::::::.:: ::: : .: ...::..::::::::: :::..::
NP_060 FLVGKGLSSQRIPAHRFVLAVGSAVFDAMFNGGMATTSTEIELPDVEPAAFLALLKFLYS
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pF1KE4 DEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLETSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQR
::... .::..:::.:::: :::: ::.::. .:.: :: .::.:.:::.::.:..
NP_060 DEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLKKNLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASL
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pF1KE4 CWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQTLEIIVTREALNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLP
: : :: .. :. .::: .:: .:: .. :..:. .:. .:.::. :.::::.:: :
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pF1KE4 ITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQSDILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFP
.::.:.:.:::.:: :.:.: ::.:::: : ::: ::. .:. :.:: .:.. :::..:
NP_060 VTPENRRKVLGKALGLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILVDREVVSLFLHFTVNPKPRVEFI
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pF1KE4 LTKRKGLAPQRC--HRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSIQFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAE
: : ..: .:::. : : : : : :.:.:..:.:..:.::::: : ..
NP_060 DRPRCCLRGKECSINRFQQVESR---WGYSGTSDRIRFSVNKRIFVVGFGLYGSIHGPTD
370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 YSVKIELKRL--GVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEHPVQVEQDTFYTASAVLDGSELS
:.:.:.. . ..::.:: : : :::..:: : :..::.: .. ::: :.: : . :
NP_060 YQVNIQIIHTDSNTVLGQNDTGFSCDGSASTFRVMFKEPVEVLPNVNYTACATLKGPD-S
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480
pF1KE4 YFGQEGMTEVQC------GKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA
..: .:. .: .:. : : .. ..:::.:. :::::.:::
NP_060 HYGTKGLRKVTHESPTTGAKTCFTFCYAAGNNNGTSVEDGQIPEVIFYT
480 490 500 510 520
485 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 04:11:14 2016 done: Sun Nov 6 04:11:16 2016
Total Scan time: 10.650 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]