Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4092
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4092, 466 aa
1>>>pF1KE4092 466 - 466 aa - 466 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6835+/-0.000724; mu= 11.2780+/- 0.044
mean_var=78.7764+/-15.839, 0's: 0 Z-trim(109.6): 70 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.144503
statistics sampled from 10901 (10972) to 10901 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.337), width: 16
Scan time: 3.170
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4452.1 RASGEF1C gene_id:255426|Hs108|chr5 ( 466) 3129 661.5 5.1e-190
CCDS75152.1 RASGEF1B gene_id:153020|Hs108|chr4 ( 472) 2099 446.8 2.3e-125
CCDS34022.1 RASGEF1B gene_id:153020|Hs108|chr4 ( 473) 2087 444.3 1.3e-124
CCDS75151.1 RASGEF1B gene_id:153020|Hs108|chr4 ( 431) 1786 381.5 9.1e-106
CCDS7202.2 RASGEF1A gene_id:221002|Hs108|chr10 ( 481) 1653 353.8 2.2e-97
CCDS60517.1 RASGEF1A gene_id:221002|Hs108|chr10 ( 489) 1653 353.8 2.3e-97
CCDS43277.1 RAPGEF2 gene_id:9693|Hs108|chr4 (1499) 350 82.2 4e-15
CCDS54898.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1391) 318 75.6 3.8e-13
CCDS54899.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1504) 318 75.6 4.1e-13
CCDS54901.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1509) 318 75.6 4.1e-13
CCDS34225.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1601) 318 75.6 4.3e-13
CCDS54900.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1609) 318 75.6 4.3e-13
CCDS42065.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 ( 489) 307 73.2 6.7e-13
CCDS45320.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1257) 307 73.3 1.7e-12
CCDS10309.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1273) 307 73.3 1.7e-12
CCDS4052.1 RASGRF2 gene_id:5924|Hs108|chr5 (1237) 293 70.3 1.2e-11
CCDS74604.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 791) 282 68.0 4e-11
CCDS63061.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 840) 282 68.0 4.2e-11
CCDS63060.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 858) 282 68.0 4.3e-11
CCDS42776.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 867) 282 68.0 4.3e-11
CCDS42775.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 (1011) 282 68.0 5e-11
>>CCDS4452.1 RASGEF1C gene_id:255426|Hs108|chr5 (466 aa)
initn: 3129 init1: 3129 opt: 3129 Z-score: 3524.9 bits: 661.5 E(32554): 5.1e-190
Smith-Waterman score: 3129; 100.0% identity (100.0% similar) in 466 aa overlap (1-466:1-466)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPQTLSASDMVTPGSLSPPPTEPTDGEQAGQPLLDGAPSSASLETLIQHLVPTADYYPEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MPQTLSASDMVTPGSLSPPPTEPTDGEQAGQPLLDGAPSSASLETLIQHLVPTADYYPEK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQLLAEWTET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQLLAEWTET
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 FPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDEAYRKRMHQLLQALHQKLAALRQGPEGLVGADKPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDEAYRKRMHQLLQALHQKLAALRQGPEGLVGADKPI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 SYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDPLASTKPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDPLASTKPC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 FSDKTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNIGNFNSLMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FSDKTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNIGNFNSLMA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 IISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHRSLTAHSSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHRSLTAHSSRE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 KIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQVECPFEQDAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQVECPFEQDAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KE4 ITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT
430 440 450 460
>>CCDS75152.1 RASGEF1B gene_id:153020|Hs108|chr4 (472 aa)
initn: 2103 init1: 1278 opt: 2099 Z-score: 2364.3 bits: 446.8 E(32554): 2.3e-125
Smith-Waterman score: 2099; 68.0% identity (85.4% similar) in 472 aa overlap (1-465:1-471)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPQTLSASDMVTPGSLSPPPTEPTDGEQAGQPLLDGAPSSASLETLIQHLVPTADYYPEK
:::: : : .. . . .. .: :. :.:::.:::::::..::::..
CCDS75 MPQTPPFSAMFDSSGYNRNLYQSAEDSCGGLYYHDNNLLSGSLEALIQHLVPNVDYYPDR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQLLAEWTET
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CCDS75 TYIFTFLLSSRLFMHPYELMAKVCHLCVEHQRLSDPDSDKNQMRKIAPKILQLLTEWTET
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE4 FPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDEAYRKRMHQLLQALHQKLAALRQGPEGLV-----G
:: ::..: . .:::.. ::: .:.::: ..:..: : .::::: : : :. .
CCDS75 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEETYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISSTS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 ADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDPLA
.:. .::: ::.:... ::.:::::::::::.::::: .:::::::::::.::::
CCDS75 TDRLTVLKTKPQ-SIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPLD
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 STKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNIG
. : :.:. :: ::::::.::::: ::::::::::.:::.::..::.::::::::::::
CCDS75 NDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNIG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 NFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHRSL
:::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::::::..:: ::::::::::.:::
CCDS75 NFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRSL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 TAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQVEC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.:::::::
CCDS75 TAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVEC
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE4 PFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT
:::.: .: .:: :.:.::::.:::::::::.:::. ::.:::.::::.::.
CCDS75 PFERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV
420 430 440 450 460 470
>>CCDS34022.1 RASGEF1B gene_id:153020|Hs108|chr4 (473 aa)
initn: 2027 init1: 1278 opt: 2087 Z-score: 2350.8 bits: 444.3 E(32554): 1.3e-124
Smith-Waterman score: 2087; 67.9% identity (85.2% similar) in 473 aa overlap (1-465:1-472)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPQTLSASDMVTPGSLSPPPTEPTDGEQAGQPLLDGAPSSASLETLIQHLVPTADYYPEK
:::: : : .. . . .. .: :. :.:::.:::::::..::::..
CCDS34 MPQTPPFSAMFDSSGYNRNLYQSAEDSCGGLYYHDNNLLSGSLEALIQHLVPNVDYYPDR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQLLAEWTET
.::::::::::::..: ::.:.:::::.:.:.:. : :: ..::..::.::::.:::::
CCDS34 TYIFTFLLSSRLFMHPYELMAKVCHLCVEHQRLSDPDSDKNQMRKIAPKILQLLTEWTET
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE4 FPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDE-AYRKRMHQLLQALHQKLAALRQGPEGLV-----
:: ::..: . .:::.. ::: .: .::: ..:..: : .::::: : : :.
CCDS34 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEEQTYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISST
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 GADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDPL
..:. .::: ::.:... ::.:::::::::::.::::: .:::::::::::.::::
CCDS34 STDRLTVLKTKPQ-SIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPL
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 ASTKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNI
. : :.:. :: ::::::.::::: ::::::::::.:::.::..::.:::::::::::
CCDS34 DNDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 GNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHRS
::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::::::..:: ::::::::::.::
CCDS34 GNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 LTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.::::::
CCDS34 LTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE4 CPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT
::::.: .: .:: :.:.::::.:::::::::.:::. ::.:::.::::.::.
CCDS34 CPFERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV
420 430 440 450 460 470
>>CCDS75151.1 RASGEF1B gene_id:153020|Hs108|chr4 (431 aa)
initn: 1894 init1: 1278 opt: 1786 Z-score: 2012.4 bits: 381.5 E(32554): 9.1e-106
Smith-Waterman score: 1812; 62.3% identity (77.8% similar) in 472 aa overlap (1-465:1-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MPQTLSASDMVTPGSLSPPPTEPTDGEQAGQPLLDGAPSSASLETLIQHLVPTADYYPEK
:::: : : .. . . .. .: :. :.:::.:::::::..::::..
CCDS75 MPQTPPFSAMFDSSGYNRNLYQSAEDSCGGLYYHDNNLLSGSLEALIQHLVPNVDYYPDN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQLLAEWTET
..::..::.::::.:::::
CCDS75 -----------------------------------------QMRKIAPKILQLLTEWTET
70
130 140 150 160 170
pF1KE4 FPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDEAYRKRMHQLLQALHQKLAALRQGPEGLV-----G
:: ::..: . .:::.. ::: .:.::: ..:..: : .::::: : : :. .
CCDS75 FPYDFRDERMMRNLKDLAHRIASGEETYRKNVQQMMQCLIRKLAALSQYEEVLAKISSTS
80 90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 ADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFVQAFVNKDPLA
.:. .::: ::.:... ::.:::::::::::.::::: .:::::::::::.::::
CCDS75 TDRLTVLKTKPQ-SIQRDIITVCNDPYTLAQQLTHIELERLNYIGPEEFVQAFVQKDPLD
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 STKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFIDVARECFNIG
. : :.:. :: ::::::.::::: ::::::::::.:::.::..::.::::::::::::
CCDS75 NDKSCYSERKKTRNLEAYVEWFNRLSYLVATEICMPVKKKHRARMIEYFIDVARECFNIG
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE4 NFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRTALRGAAHRSL
:::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::::::..:: ::::::::::.:::
CCDS75 NFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVKTAKFDILEHQMDPSSNFYNYRTALRGAAQRSL
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE4 TAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVGEFITWKQVEC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::.:::::::
CCDS75 TAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFWELAKQVSEFMTWKQVEC
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460
pF1KE4 PFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSILGKT
:::.: .: .:: :.:.::::.:::::::::.:::. ::.:::.::::.::.
CCDS75 PFERDRKILQYLLTVPVFSEDALYLASYESEGPENHIEKDRWKSLRSSLLGRV
380 390 400 410 420 430
>>CCDS7202.2 RASGEF1A gene_id:221002|Hs108|chr10 (481 aa)
initn: 1610 init1: 1043 opt: 1653 Z-score: 1861.7 bits: 353.8 E(32554): 2.2e-97
Smith-Waterman score: 1674; 53.9% identity (80.1% similar) in 482 aa overlap (1-465:1-480)
10 20 30 40 50
pF1KE4 MPQT-LSASDMVTP---GSLSPPPTEPTDGEQAGQPLL---DGAPSSASLETLIQHLVPT
:::: . :... : :...: : : .:. : :: :.:::.:..:::::
CCDS72 MPQTSVVFSSILGPSCSGQVQPGMGERGGGAGGGSGDLIFQDGHLISGSLEALMEHLVPT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 ADYYPEKAYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRKFGPKLLQL
.::::...::::::::::.:. :..::::: ..:.::.: . .::....:. :..::
CCDS72 VDYYPDRTYIFTFLLSSRVFMPPHDLLARVGQICVEQKQQLEAGPEKAKLKSFSAKIVQL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KE4 LAEWTETFPRDFQEESTIGHLKDVVGRIAPCDE---AYRKRMHQLLQALHQKLAA---LR
: ::::.:: :::.:.....:: .. :.. ::: . .: . :. :.: .::: :.
CCDS72 LKEWTEAFPYDFQDEKAMAELKAITHRVTQCDEENGTVKKAIAQMTQSLLLSLAARSQLQ
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 QGPEGLV--GADKPISYRTKPPASIHRELLGVCSDPYTLAQQLTHVELERLRHIGPEEFV
. : : ..:: .:::::. ....:::: :: .:::::::.::.:. : ::...
CCDS72 ELREKLRPPAVDKGPILKTKPPAA-QKDILGVCCDPLVLAQQLTHIELDRVSSIYPEDLM
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 QAFVNKDPLASTKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQRAQVIEFFI
: . : : . . : .: :: .:::: .::: : .:::::.: .:::.:....::::
CCDS72 QIVSHMDSLDNHR-CRGDLTKTYSLEAYDNWFNCLSMLVATEVCRVVKKKHRTRMLEFFI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 DVARECFNIGNFNSLMAIISGMNMSPVSRLKKTWAKVRTAKFFILEHQMDPTGNFCNYRT
::::::::::::::.::::::::.:::.::::::.::.:::: .:::.:::..:::::::
CCDS72 DVARECFNIGNFNSMMAIISGMNLSPVARLKKTWSKVKTAKFDVLEHHMDPSSNFCNYRT
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 ALRGAAHRSLTAHSSREKIVIPFFSLLIKDIYFLNEGCANRLPNGHVNFEKFLELAKQVG
::.::..:: :.::::::::: :.:..::::::.. .:.:::::.::.:: :...:.
CCDS72 ALQGATQRSQMANSSREKIVIPVFNLFVKDIYFLHKIHTNHLPNGHINFKKFWEISRQIH
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE4 EFITWKQVECPFEQDASITHYLYTAPIFSEDGLYLASYESESPENQTEKERWKALRSSIL
::.:: :::::::.: .: :: ::::.::..:..::.:::.:::. ::. ::.::...:
CCDS72 EFMTWTQVECPFEKDKKIQSYLLTAPIYSEEALFVASFESEGPENHMEKDSWKTLRTTLL
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 GKT
..
CCDS72 NRA
480
>>CCDS60517.1 RASGEF1A gene_id:221002|Hs108|chr10 (489 aa)
initn: 1610 init1: 1043 opt: 1653 Z-score: 1861.6 bits: 353.8 E(32554): 2.3e-97
Smith-Waterman score: 1674; 53.9% identity (80.1% similar) in 482 aa overlap (1-465:9-488)
10 20 30 40
pF1KE4 MPQT-LSASDMVTP---GSLSPPPTEPTDGEQAGQPLL---DGAPSSASLET
:::: . :... : :...: : : .:. : :: :.:::.
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50 60 70 80 90 100
pF1KE4 LIQHLVPTADYYPEKAYIFTFLLSSRLFIEPRELLARVCHLCIEQQQLDKPVLDKARVRK
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CCDS60 LMEHLVPTVDYYPDRTYIFTFLLSSRVFMPPHDLLARVGQICVEQKQQLEAGPEKAKLKS
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CCDS60 FSAKIVQLLKEWTEAFPYDFQDEKAMAELKAITHRVTQCDEENGTVKKAIAQMTQSLLLS
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170 180 190 200 210
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::: :.. : : ..:: .:::::. ....:::: :: .:::::::.::.:.
CCDS60 LAARSQLQELREKLRPPAVDKGPILKTKPPAA-QKDILGVCCDPLVLAQQLTHIELDRVS
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pF1KE4 HIGPEEFVQAFVNKDPLASTKPCFSD--KTSNLEAYVKWFNRLCYLVATEICMPAKKKQR
: ::...: . : : . . : .: :: .:::: .::: : .:::::.: .:::.:
CCDS60 SIYPEDLMQIVSHMDSLDNHR-CRGDLTKTYSLEAYDNWFNCLSMLVATEVCRVVKKKHR
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....::::::::::::::::::.::::::::.:::.::::::.::.:::: .:::.:::.
CCDS60 TRMLEFFIDVARECFNIGNFNSMMAIISGMNLSPVARLKKTWSKVKTAKFDVLEHHMDPS
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:...:. ::.:: :::::::.: .: :: ::::.::..:..::.:::.:::. ::. :
CCDS60 WEISRQIHEFMTWTQVECPFEKDKKIQSYLLTAPIYSEEALFVASFESEGPENHMEKDSW
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460
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CCDS60 KTLRTTLLNRA
480
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CCDS54 LFK----LNSKTGNTHLKRFEDIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRE
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CCDS54 CKNFNSMFAIISGLNLASVARLRGTWEKL-PSKYE--KHLQDLQDIFDPSRNM---AKYR
950 960 970 980 990 1000
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]