Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4085
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4085, 446 aa
1>>>pF1KE4085 446 - 446 aa - 446 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9658+/-0.000697; mu= 12.0921+/- 0.042
mean_var=141.8152+/-28.958, 0's: 0 Z-trim(115.4): 72 B-trim: 410 in 1/53
Lambda= 0.107699
statistics sampled from 15865 (15942) to 15865 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.798), E-opt: 0.2 (0.49), width: 16
Scan time: 3.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8162.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11 ( 446) 3119 495.6 4.2e-140
CCDS13874.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 508) 1384 226.1 6.5e-59
CCDS56227.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 515) 1368 223.6 3.7e-58
CCDS10676.2 TBC1D10B gene_id:26000|Hs108|chr16 ( 808) 1368 223.8 5.2e-58
CCDS58150.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11 ( 310) 1129 186.3 3.8e-47
CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 ( 815) 523 92.5 1.7e-18
CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 810) 505 89.7 1.2e-17
CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 821) 505 89.7 1.2e-17
CCDS9534.2 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 336) 497 88.1 1.5e-17
CCDS66591.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 344) 497 88.1 1.5e-17
CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 794) 492 87.6 4.8e-17
CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 805) 492 87.6 4.8e-17
CCDS47136.1 TBC1D9 gene_id:23158|Hs108|chr4 (1266) 479 85.8 2.8e-16
CCDS4450.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1233) 473 84.8 5.2e-16
CCDS43408.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1250) 473 84.8 5.2e-16
CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9 (1069) 468 84.0 7.9e-16
CCDS59137.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 468) 450 80.9 3e-15
CCDS75865.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 928) 450 81.2 5e-15
CCDS32301.2 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 ( 914) 447 80.7 6.8e-15
CCDS53492.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 828) 446 80.5 7e-15
CCDS45314.1 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 ( 963) 447 80.7 7e-15
CCDS44357.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 845) 446 80.5 7.1e-15
CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22 ( 749) 431 78.1 3.3e-14
CCDS46375.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1140) 432 78.4 4e-14
CCDS82486.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1155) 432 78.4 4.1e-14
CCDS14522.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX (1120) 430 78.1 4.9e-14
CCDS35080.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 917) 421 76.7 1.1e-13
CCDS77009.1 TBC1D3E gene_id:102723859|Hs108|chr17 ( 549) 407 74.3 3.4e-13
CCDS45658.1 TBC1D3 gene_id:729873|Hs108|chr17 ( 549) 400 73.2 7.3e-13
CCDS74045.1 TBC1D3C gene_id:414060|Hs108|chr17 ( 549) 400 73.2 7.3e-13
CCDS74042.1 TBC1D3K gene_id:101060351|Hs108|chr17 ( 549) 400 73.2 7.3e-13
CCDS45653.1 TBC1D3H gene_id:729877|Hs108|chr17 ( 549) 399 73.1 8.1e-13
CCDS74043.1 TBC1D3L gene_id:101060376|Hs108|chr17 ( 549) 399 73.1 8.1e-13
CCDS74040.1 TBC1D3G gene_id:101060321|Hs108|chr17 ( 549) 398 72.9 9.1e-13
CCDS74039.1 TBC1D3I gene_id:102724862|Hs108|chr17 ( 549) 397 72.7 1e-12
CCDS42300.1 TBC1D3B gene_id:414059|Hs108|chr17 ( 549) 396 72.6 1.1e-12
CCDS74044.1 LOC101060389 gene_id:101060389|Hs108|c ( 549) 396 72.6 1.1e-12
CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4 (1168) 394 72.5 2.5e-12
CCDS11069.2 USP6 gene_id:9098|Hs108|chr17 (1406) 375 69.7 2.2e-11
CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1235) 365 68.1 5.8e-11
CCDS66564.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1290) 365 68.1 6e-11
CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1298) 365 68.1 6e-11
>>CCDS8162.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11 (446 aa)
initn: 3119 init1: 3119 opt: 3119 Z-score: 2628.8 bits: 495.6 E(32554): 4.2e-140
Smith-Waterman score: 3119; 100.0% identity (100.0% similar) in 446 aa overlap (1-446:1-446)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAQALGEDLVQPPELQDDSSSLGSDSELSGPGPYRQADRYGFIGGSSAEPGPGHPPADLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MAQALGEDLVQPPELQDDSSSLGSDSELSGPGPYRQADRYGFIGGSSAEPGPGHPPADLI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQCRKGIPSALRARCWPLLCGAHVCQKNSPGTYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQCRKGIPSALRARCWPLLCGAHVCQKNSPGTYQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMFVSPQGHGQQGLLQVLKAYTLYRPEQGYCQAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMFVSPQGHGQQGLLQVLKAYTLYRPEQGYCQAQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GPVAAVLLMHLPPEEAFWCLVQICEVYLPGYYGPHMEAVRLDAEVFMALLRRLLPHVHKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GPVAAVLLMHLPPEEAFWCLVQICEVYLPGYYGPHMEAVRLDAEVFMALLRRLLPHVHKH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 LQQVGVGPLLYLPEWFLCLFARSLPFPTVLRVWDAFLSEGARVLFRVGLTLVRLALGTAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LQQVGVGPLLYLPEWFLCLFARSLPFPTVLRVWDAFLSEGARVLFRVGLTLVRLALGTAE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QRGACPGLLETLGALRAIPPAQLQEEAFMSQVHSVVLSERDLQREIKAQLAQLPDSAPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QRGACPGLLETLGALRAIPPAQLQEEAFMSQVHSVVLSERDLQREIKAQLAQLPDSAPGP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 PPRPQVRLAGAQAIFEAQQLAGVRRGAKPEVPRIVVQPPEEPRPPRRKPQTRGKTFHGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PPRPQVRLAGAQAIFEAQQLAGVRRGAKPEVPRIVVQPPEEPRPPRRKPQTRGKTFHGLL
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KE4 TRARGPPIEGPPRPQRGSTSFLDTRF
::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TRARGPPIEGPPRPQRGSTSFLDTRF
430 440
>>CCDS13874.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 (508 aa)
initn: 1320 init1: 1291 opt: 1384 Z-score: 1171.2 bits: 226.1 E(32554): 6.5e-59
Smith-Waterman score: 1384; 46.6% identity (74.1% similar) in 440 aa overlap (7-436:24-453)
10 20 30 40
pF1KE4 MAQALGEDLVQPPE--LQDDSSSLGSDSELSGPGPYRQADRYG
:.:.: :. :. :::::::: .: . :. :..:
CCDS13 MAKSNGENGPRAPAAGESLSGTRESLAQGPDAATTDELSSLGSDSEANGFAE-RRIDKFG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 FIGGSSAEPGPGHP-PADLIRQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQCRKGIPSALRAR
:: ::.. : . : ...:::: ::..: ..:.: :....::....:.:::: .::.:
CCDS13 FIVGSQGAEGALEEVPLEVLRQRESKWLDMLNNWDKWMAKKHKKIRLRCQKGIPPSLRGR
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 CWPLLCGAHVCQKNSPGTYQELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMFVSPQGHGQQGL
: : :..: ...:: ..:: .::::.:...: ::::::::.:::::: ::::: :
CCDS13 AWQYLSGGKVKLQQNPGKFDELDMSPGDPKWLDVIERDLHRQFPFHEMFVSRGGHGQQDL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 LQVLKAYTLYRPEQGYCQAQGPVAAVLLMHLPPEEAFWCLVQICEVYLPGYYGPHMEAVR
..:::::::::::.::::::.:.:::::::.: :.:::::::::: ::::::. ..::..
CCDS13 FRVLKAYTLYRPEEGYCQAQAPIAAVLLMHMPAEQAFWCLVQICEKYLPGYYSEKLEAIQ
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 LDAEVFMALLRRLLPHVHKHLQQVGVGPLLYLPEWFLCLFARSLPFPTVLRVWDAFLSEG
::.:....::... : .::::.. . ::::. :::.: :.:.::. .:::::: :. ::
CCDS13 LDGEILFSLLQKVSPVAHKHLSRQKIDPLLYMTEWFMCAFSRTLPWSSVLRVWDMFFCEG
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 ARVLFRVGLTLVRLALGTAEQRGACPGLLETLGALRAIPPAQLQEEAFMSQVHSVVLSER
....:::::.:.. :::. :. :: : ::. ::.. : .:: ....: . ..::
CCDS13 VKIIFRVGLVLLKHALGSPEKVKACQGQYETIERLRSLSPKIMQEAFLVQEVVELPVTER
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KE4 DLQREIKAQLAQLPDSAPGPPPRPQVRLAGAQAIFEAQQLAGVRRGAKPEVP--RIVVQP
...:: :: . .. : :: ::.::..:. : : . .: : :. ..
CCDS13 QIEREHLIQLRRWQETRGELQCRSPPRLHGAKAILDAE--PGPRPALQPS-PSIRLPLDA
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KE4 P-----EEPRPPRRKPQTRGKTFHGLLTRARGPPIEGPPRPQRGSTSFLDTRF
: .:.::.. . . : ..: :: .: :: :..
CCDS13 PLPGSKAKPKPPKQAQKEQRKQMKG-----RGQ-LEKPPAPNQAMVVAAAGDACPPQHVP
420 430 440 450 460 470
CCDS13 PKDSAPKDSAPQDLAPQVSAHHRSQESLTSQESEDTYL
480 490 500
>>CCDS56227.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 (515 aa)
initn: 1313 init1: 1228 opt: 1368 Z-score: 1157.6 bits: 223.6 E(32554): 3.7e-58
Smith-Waterman score: 1380; 46.1% identity (72.9% similar) in 447 aa overlap (7-436:24-460)
10 20 30 40
pF1KE4 MAQALGEDLVQPPE--LQDDSSSLGSDSELSGPGPYRQADRYG
:.:.: :. :. :::::::: .: . :. :..:
CCDS56 MAKSNGENGPRAPAAGESLSGTRESLAQGPDAATTDELSSLGSDSEANGFAE-RRIDKFG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KE4 FIGGSSAEPGPGHP--------PADLIRQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQCRKGI
:: ::.. : : : ...:::: ::..: ..:.: :....::....:.:::
CCDS56 FIVGSQGAEGAPCPLLHRLEEVPLEVLRQRESKWLDMLNNWDKWMAKKHKKIRLRCQKGI
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 PSALRARCWPLLCGAHVCQKNSPGTYQELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMFVSPQ
: .::.: : : :..: ...:: ..:: .::::.:...: ::::::::.::::::
CCDS56 PPSLRGRAWQYLSGGKVKLQQNPGKFDELDMSPGDPKWLDVIERDLHRQFPFHEMFVSRG
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 GHGQQGLLQVLKAYTLYRPEQGYCQAQGPVAAVLLMHLPPEEAFWCLVQICEVYLPGYYG
::::: :..:::::::::::.::::::.:.:::::::.: :.:::::::::: ::::::.
CCDS56 GHGQQDLFRVLKAYTLYRPEEGYCQAQAPIAAVLLMHMPAEQAFWCLVQICEKYLPGYYS
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 PHMEAVRLDAEVFMALLRRLLPHVHKHLQQVGVGPLLYLPEWFLCLFARSLPFPTVLRVW
..::..::.:....::... : .::::.. . ::::. :::.: :.:.::. .:::::
CCDS56 EKLEAIQLDGEILFSLLQKVSPVAHKHLSRQKIDPLLYMTEWFMCAFSRTLPWSSVLRVW
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 DAFLSEGARVLFRVGLTLVRLALGTAEQRGACPGLLETLGALRAIPPAQLQEEAFMSQVH
: :. ::....:::::.:.. :::. :. :: : ::. ::.. : .:: ....:
CCDS56 DMFFCEGVKIIFRVGLVLLKHALGSPEKVKACQGQYETIERLRSLSPKIMQEAFLVQEVV
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 SVVLSERDLQREIKAQLAQLPDSAPGPPPRPQVRLAGAQAIFEAQQLAGVRRGAKPEVP-
. ..::...:: :: . .. : :: ::.::..:. : : . .: :
CCDS56 ELPVTERQIEREHLIQLRRWQETRGELQCRSPPRLHGAKAILDAE--PGPRPALQPS-PS
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KE4 -RIVVQPP-----EEPRPPRRKPQTRGKTFHGLLTRARGPPIEGPPRPQRGSTSFLDTRF
:. .. : .:.::.. . . : ..: :: .: :: :..
CCDS56 IRLPLDAPLPGSKAKPKPPKQAQKEQRKQMKG-----RGQ-LEKPPAPNQAMVVAAAGDA
420 430 440 450 460 470
CCDS56 CPPQHVPPKDSAPKDSAPQDLAPQVSAHHRSQESLTSQESEDTYL
480 490 500 510
>>CCDS10676.2 TBC1D10B gene_id:26000|Hs108|chr16 (808 aa)
initn: 1308 init1: 1308 opt: 1368 Z-score: 1155.0 bits: 223.8 E(32554): 5.2e-58
Smith-Waterman score: 1368; 47.1% identity (73.6% similar) in 420 aa overlap (15-431:283-694)
10 20 30 40
pF1KE4 MAQALGEDLVQPPELQDDSSSLGSDSELSGPGPYRQADRYGFIG
: :: ::.:::::..: . :..:.:::.:
CCDS10 GPGISGPRGQAPDTLSYLDSVSLMSGTLESLADDVSSMGSDSEINGLA-LRKTDKYGFLG
260 270 280 290 300 310
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 GSSAEPG-PGHPPADLIRQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQCRKGIPSALRARCWP
::. . . :.:. ::::.::..: :.:.: .:::..:::..:::::::.:::. :
CCDS10 GSQYSGSLESSIPVDVARQRELKWLDMFSNWDKWLSRRFQKVKLRCRKGIPSSLRAKAWQ
320 330 340 350 360 370
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 LLCGAHVCQKNSPGTYQELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMFVSPQGHGQQGLLQV
: ... ...:: ..:: .:::::.:...: .:::::::.::::.. ::::: : ..
CCDS10 YLSNSKELLEQNPGKFEELERAPGDPKWLDVIEKDLHRQFPFHEMFAARGGHGQQDLYRI
380 390 400 410 420 430
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 LKAYTLYRPEQGYCQAQGPVAAVLLMHLPPEEAFWCLVQICEVYLPGYYGPHMEAVRLDA
:::::.:::..::::::.:::::::::.: :.:::::::::. ::::::. .::..::.
CCDS10 LKAYTIYRPDEGYCQAQAPVAAVLLMHMPAEQAFWCLVQICDKYLPGYYSAGLEAIQLDG
440 450 460 470 480 490
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 EVFMALLRRLLPHVHKHLQQVGVGPLLYLPEWFLCLFARSLPFPTVLRVWDAFLSEGARV
:.:.::::: : .:.::.. . :.::. :::.:.:::.::. .:::::: :. ::...
CCDS10 EIFFALLRRASPLAHRHLRRQRIDPVLYMTEWFMCIFARTLPWASVLRVWDMFFCEGVKI
500 510 520 530 540 550
290 300 310 320 330 340
pF1KE4 LFRVGLTLVRLALGTAEQRGACPGLLETLGALRAIPPAQLQEEAFMSQVHSVVLSERDLQ
.:::.:.:.: .::..:. .: :. ::. :: .: .::. .. .: .. ..: ..
CCDS10 IFRVALVLLRHTLGSVEKLRSCQGMYETMEQLRNLPQQCMQEDFLVHEVTNLPVTEALIE
560 570 580 590 600 610
350 360 370 380 390 400
pF1KE4 REIKAQLAQLPDSAPGPPPRPQVRLAGAQAIFEAQQLAGVRRGAKPEVPR--IVVQPPEE
:: ::: . .. ::. :: :..:: : . :: : : .. : .
CCDS10 RENAAQLKKWRETRGELQYRPSRRLHGSRAIHEER-----RRQQPPLGPSSSLLSLPGLK
620 630 640 650 660
410 420 430 440
pF1KE4 PRPPRRKPQTRGKTFHGLLTRARGPPIEGPPRPQRGSTSFLDTRF
: : . . . :: . : ::
CCDS10 SRGSRAAGGAPSPPPP--VRRASAGPAPGPVVTAEGLHPSLPSPTGNSTPLGSSKETRKQ
670 680 690 700 710 720
>>CCDS58150.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11 (310 aa)
initn: 1162 init1: 1129 opt: 1129 Z-score: 959.9 bits: 186.3 E(32554): 3.8e-47
Smith-Waterman score: 1129; 99.4% identity (100.0% similar) in 157 aa overlap (1-157:1-157)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAQALGEDLVQPPELQDDSSSLGSDSELSGPGPYRQADRYGFIGGSSAEPGPGHPPADLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MAQALGEDLVQPPELQDDSSSLGSDSELSGPGPYRQADRYGFIGGSSAEPGPGHPPADLI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQCRKGIPSALRARCWPLLCGAHVCQKNSPGTYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQCRKGIPSALRARCWPLLCGAHVCQKNSPGTYQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 ELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMFVSPQGHGQQGLLQVLKAYTLYRPEQGYCQAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS58 ELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMFVSPQGHGRGSCRCSRPTPCIDRSRATARPRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 GPVAAVLLMHLPPEEAFWCLVQICEVYLPGYYGPHMEAVRLDAEVFMALLRRLLPHVHKH
CCDS58 PWLLCCSCTCPQRRPSGAWCRSVRSTSLGTTGPTWCQSTVPCGADTGAPGAGHCRAARGL
190 200 210 220 230 240
>>CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 (815 aa)
initn: 409 init1: 243 opt: 523 Z-score: 445.4 bits: 92.5 E(32554): 1.7e-18
Smith-Waterman score: 523; 30.6% identity (58.1% similar) in 356 aa overlap (6-352:451-803)
10 20 30
pF1KE4 MAQALGEDLVQPPELQDDSSSLGSDSELSGPGPYR
:. . . :: .:.. . :: ::.
CCDS13 ERFWYFSRKTFTETFFMRLKQSEGKGHTNAGDAIYEVVSLQRESDKEEPVTPTSGGGPMS
430 440 450 460 470 480
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 -QADRYGFIGGSSAEPGPGHPPADLIRQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQCRKGIP
: :. . . : : : .. ..: :. ..:..... : : .. ..:.:
CCDS13 PQDDEAEEESDNELSSGTGDVSKDCPEKILYSWGELLGKWHSNLGARPKGLSTLVKSGVP
490 500 510 520 530 540
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 SALRARCWPLLCGAHVCQKNSPGTYQELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMFVSPQG
::::. : :: : :. :. . : .: ::.:: :: :..: . :
CCDS13 EALRAEVWQLLAG---CHDNQAMLDRYRILITKDSAQESVITRDIHRTFPAHDYFKDTGG
550 560 570 580 590
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 HGQQGLLQVLKAYTLYRPEQGYCQAQGPVAAVLLMHLPPEEAFWCLVQICEVY-LPGYYG
::..: .. :::..: . ::::.:. .:::::.:.: :.:: ::.: : : :
CCDS13 DGQESLYKICKAYSVYDEDIGYCQGQSFLAAVLLLHMPEEQAFCVLVKIMYDYGLRDLYR
600 610 620 630 640 650
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 PHMEAVRLDAEVFMALLRRLLPHVHKHLQQVGVGPLLYLPEWFLCLFARSLPFPTVLRVW
..: .. . :... :: .:.:...... .: .::: ::. ..:. :...
CCDS13 NNFEDLHCKFYQLERLMQEQLPDLHSHFSDLNLEAHMYASQWFLTLFTAKFPLCMVFHII
660 670 680 690 700 710
280 290 300 310 320
pF1KE4 DAFLSEGARVLFRVGLTLVRLA---LGTAEQRGACPGLLETLGA-LRAIPPAQ-LQEEAF
: .: :: ..:.:.:.:.. . : :. .:: . : :: :. :.:.:
CCDS13 DLLLCEGLNIIFHVALALLKTSKEDLLQADFEGALKFFRVQLPKRYRAEENARRLMEQAC
720 730 740 750 760 770
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 MSQVHSVVLS--ERDLQREIKAQLAQLPDSAPGPPPRPQVRLAGAQAIFEAQQLAGVRRG
.: . :. :.. : ..:: :
CCDS13 NIKVPTKKLKKYEKEYQTMRESQLQQEDPMDRYKFVYL
780 790 800 810
>>CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 (810 aa)
initn: 493 init1: 186 opt: 505 Z-score: 430.3 bits: 89.7 E(32554): 1.2e-17
Smith-Waterman score: 505; 29.3% identity (60.2% similar) in 352 aa overlap (2-345:76-414)
10 20 30
pF1KE4 MAQALGEDLVQPPELQDDSSSLGSDSE-LSG
.: .:: .:.... : .::. : .
CCDS30 ASQVASPSTSLHTTSSSTTLSTPALSPSSPSQLSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRS
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 PGPYRQADRYGFIGGSSAEPGPGHPPADLIRQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQCR
. :. . .....::: . .: : . : .....:: . ... :.:: .
CCDS30 VNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEED----SWILWGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVH
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 KGIPSALRARCWPLLCGAHVCQKNSPGTYQELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMFV
:::: .:: : :::.:. .. :.:: . . . . : ::. : .: :..:
CCDS30 KGIPHHFRAIVWQLLCSAQSMPIKDQ--YSELLKMTSPCEKL--IRRDIARTYPEHNFFK
170 180 190 200 210
160 170 180 190 200
pF1KE4 SPQGHGQQGLLQVLKAYTLYRPEQGYCQAQGPVAAVLLMHLPPEEAFWCLVQICEVY-LP
.. ::. :..:.:::.: : ::::... ....:::..: :::: .:.. . : :
CCDS30 EKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVKLMQDYRLR
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 GYYGPHMEAVRLDAEVFMALLRRLLPHVHKHLQQVGVGPLLYLPEWFLCLFARSLPFPTV
. : : . : : .... ::.. :.:. . .: ::: .: ..:.: .
CCDS30 ELFKPSMAELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTSMYASSWFLTIFLTTFPLPIA
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 LRVWDAFLSEGARVLFRVGLTLVRLALGTAEQRGACPGLLETLGALRAIP------PAQL
:..: :.::: ...:::::.:... . : :.:. . ..:: : .:
CCDS30 TRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDM-EGMLQHF--QKVIPHQFDGVPDKL
340 350 360 370 380 390
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 QEEAFMSQVHSVVLSERDLQREIKAQLAQLPDSAPGPPPRPQVRLAGAQAIFEAQQLAGV
. :.. . .: . . :..:
CCDS30 IQAAYQVKYNSKKM--KKLEKEYTTIKTKEMEEQVEIKRLRTENRLLKQRIETLEKHKCS
400 410 420 430 440 450
>>CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 (821 aa)
initn: 493 init1: 186 opt: 505 Z-score: 430.2 bits: 89.7 E(32554): 1.2e-17
Smith-Waterman score: 505; 29.3% identity (60.2% similar) in 352 aa overlap (2-345:76-414)
10 20 30
pF1KE4 MAQALGEDLVQPPELQDDSSSLGSDSE-LSG
.: .:: .:.... : .::. : .
CCDS76 ASQVASPSTSLHTTSSSTTLSTPALSPSSPSQLSPDDLELLAKLEEQNRLLETDSKSLRS
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 PGPYRQADRYGFIGGSSAEPGPGHPPADLIRQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQCR
. :. . .....::: . .: : . : .....:: . ... :.:: .
CCDS76 VNGSRRNSGSSLVSSSSASSNLSHLEED----SWILWGRIVNEWEDVRKKKEKQVKELVH
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 KGIPSALRARCWPLLCGAHVCQKNSPGTYQELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMFV
:::: .:: : :::.:. .. :.:: . . . . : ::. : .: :..:
CCDS76 KGIPHHFRAIVWQLLCSAQSMPIKDQ--YSELLKMTSPCEKL--IRRDIARTYPEHNFFK
170 180 190 200 210
160 170 180 190 200
pF1KE4 SPQGHGQQGLLQVLKAYTLYRPEQGYCQAQGPVAAVLLMHLPPEEAFWCLVQICEVY-LP
.. ::. :..:.:::.: : ::::... ....:::..: :::: .:.. . : :
CCDS76 EKDSLGQEVLFNVMKAYSLVDREVGYCQGSAFIVGLLLMQMPEEEAFCVFVKLMQDYRLR
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 GYYGPHMEAVRLDAEVFMALLRRLLPHVHKHLQQVGVGPLLYLPEWFLCLFARSLPFPTV
. : : . : : .... ::.. :.:. . .: ::: .: ..:.: .
CCDS76 ELFKPSMAELGLCMYQFECMIQEHLPELFVHFQSQSFHTSMYASSWFLTIFLTTFPLPIA
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 LRVWDAFLSEGARVLFRVGLTLVRLALGTAEQRGACPGLLETLGALRAIP------PAQL
:..: :.::: ...:::::.:... . : :.:. . ..:: : .:
CCDS76 TRIFDIFMSEGLEIVFRVGLALLQMNQAELMQLDM-EGMLQHF--QKVIPHQFDGVPDKL
340 350 360 370 380 390
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 QEEAFMSQVHSVVLSERDLQREIKAQLAQLPDSAPGPPPRPQVRLAGAQAIFEAQQLAGV
. :.. . .: . . :..:
CCDS76 IQAAYQVKYNSKKM--KKLEKEYTTIKTKEMEEQVEIKRLRTENRLLKQRIETLEKESAS
400 410 420 430 440 450
>>CCDS9534.2 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 (336 aa)
initn: 509 init1: 299 opt: 497 Z-score: 428.7 bits: 88.1 E(32554): 1.5e-17
Smith-Waterman score: 497; 36.4% identity (61.9% similar) in 236 aa overlap (60-293:39-271)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 GPGPYRQADRYGFIGGSSAEPGPGHPPADLIRQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQC
. .: .:: .. . :: ::
CCDS95 VPRIDPYGFERPEDFDDAAYEKFFSSYLVTLTRRAIKWSRLLQGGGVPRSRT---VKRYV
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 RKGIPSALRARCWPLLCGAHVCQKNSPGTYQELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMF
:::.: ::: : .: ::.. . ..:: :..: .. .:. ..: ::.: :: . :
CCDS95 RKGVPLEHRARVWMVLSGAQAQMDQNPGYYHQLLQGERNPRLEDAIRTDLNRTFPDNVKF
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 VSPQGHG-QQGLLQVLKAYTLYRPEQGYCQAQGPVAAVL-LMHLPPEEAFWCLVQICEVY
. :. : .:: :: . ::::... .:. : :. ::.:: : .
CCDS95 RKTTDPCLQRTLYNVLLAYGHHNQGVGYCQGMNFIAGYLILITNNEEESFWLLDALVGRI
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 LPGYYGPHMEAVRLDAEVFMALLRRLLPHVHKHLQQVGVGPLLYLPEWFLCLFARSLPFP
:: ::.: : ... : ::. :.: :: : ....:: : . .::.:::. ::
CCDS95 LPDYYSPAMLGLKTDQEVLGELVRAKLPAVGALMERLGVLWTLLVSRWFICLFVDILPVE
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 TVLRVWDAFLSEGARVLFRVGLTLVRLALGTAEQRGACPGLLETLGALRAIPPAQLQEEA
::::.:: ...::....:::.:::..
CCDS95 TVLRIWDCLFNEGSKIIFRVALTLIKQHQELILEATSVPDICDKFKQITKGSFVMECHTF
250 260 270 280 290 300
>>CCDS66591.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 (344 aa)
initn: 509 init1: 299 opt: 497 Z-score: 428.6 bits: 88.1 E(32554): 1.5e-17
Smith-Waterman score: 497; 36.4% identity (61.9% similar) in 236 aa overlap (60-293:39-271)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 GPGPYRQADRYGFIGGSSAEPGPGHPPADLIRQREMKWVEMTSHWEKTMSRRYKKVKMQC
. .: .:: .. . :: ::
CCDS66 VPRIDPYGFERPEDFDDAAYEKFFSSYLVTLTRRAIKWSRLLQGGGVPRSRT---VKRYV
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE4 RKGIPSALRARCWPLLCGAHVCQKNSPGTYQELAEAPGDPQWMETIGRDLHRQFPLHEMF
:::.: ::: : .: ::.. . ..:: :..: .. .:. ..: ::.: :: . :
CCDS66 RKGVPLEHRARVWMVLSGAQAQMDQNPGYYHQLLQGERNPRLEDAIRTDLNRTFPDNVKF
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KE4 VSPQGHG-QQGLLQVLKAYTLYRPEQGYCQAQGPVAAVL-LMHLPPEEAFWCLVQICEVY
. :. : .:: :: . ::::... .:. : :. ::.:: : .
CCDS66 RKTTDPCLQRTLYNVLLAYGHHNQGVGYCQGMNFIAGYLILITNNEEESFWLLDALVGRI
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 LPGYYGPHMEAVRLDAEVFMALLRRLLPHVHKHLQQVGVGPLLYLPEWFLCLFARSLPFP
:: ::.: : ... : ::. :.: :: : ....:: : . .::.:::. ::
CCDS66 LPDYYSPAMLGLKTDQEVLGELVRAKLPAVGALMERLGVLWTLLVSRWFICLFVDILPVE
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 TVLRVWDAFLSEGARVLFRVGLTLVRLALGTAEQRGACPGLLETLGALRAIPPAQLQEEA
::::.:: ...::....:::.:::..
CCDS66 TVLRIWDCLFNEGSKIIFRVALTLIKQHQELILEATSVPDICDKFKQITKGSFVMECHTF
250 260 270 280 290 300
446 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 14:47:04 2016 done: Mon Nov 7 14:47:05 2016
Total Scan time: 3.720 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]