Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4073
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4073, 382 aa
1>>>pF1KE4073 382 - 382 aa - 382 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0801+/-0.000827; mu= 8.4859+/- 0.050
mean_var=248.1836+/-50.219, 0's: 0 Z-trim(117.3): 931 B-trim: 178 in 1/51
Lambda= 0.081412
statistics sampled from 17085 (18073) to 17085 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.823), E-opt: 0.2 (0.555), width: 16
Scan time: 3.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42634.1 ZNF787 gene_id:126208|Hs108|chr19 ( 382) 2749 335.1 6.4e-92
CCDS64999.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 590) 796 105.9 9.7e-23
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CCDS64996.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 ( 697) 796 106.0 1.1e-22
CCDS82339.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 598) 769 102.7 8.8e-22
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CCDS82337.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 641) 769 102.8 9.2e-22
CCDS12502.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 659) 769 102.8 9.4e-22
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 744 100.0 8.6e-21
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CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 695 94.1 4e-19
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CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17 ( 522) 684 92.7 8.1e-19
CCDS13812.1 ZNF70 gene_id:7621|Hs108|chr22 ( 446) 682 92.4 8.6e-19
CCDS73997.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 511) 681 92.3 1e-18
CCDS11172.1 ZNF286A gene_id:57335|Hs108|chr17 ( 521) 681 92.3 1e-18
CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 676 92.0 2.2e-18
CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 913) 676 92.0 2.3e-18
CCDS43677.1 REPIN1 gene_id:29803|Hs108|chr7 ( 567) 671 91.2 2.5e-18
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 669 90.8 2.5e-18
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 671 91.2 2.5e-18
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 667 90.5 2.6e-18
CCDS47745.1 REPIN1 gene_id:29803|Hs108|chr7 ( 624) 671 91.3 2.6e-18
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 671 91.3 2.7e-18
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 672 91.5 2.7e-18
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 667 90.6 3e-18
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 667 90.7 3.1e-18
CCDS12974.1 ZNF8 gene_id:7554|Hs108|chr19 ( 575) 668 90.9 3.2e-18
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 672 91.6 3.2e-18
CCDS5899.1 ZNF467 gene_id:168544|Hs108|chr7 ( 595) 668 90.9 3.3e-18
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 667 90.7 3.4e-18
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 667 90.7 3.4e-18
CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9 ( 744) 668 91.0 3.8e-18
CCDS45460.1 ZNF771 gene_id:51333|Hs108|chr16 ( 317) 660 89.6 4.1e-18
CCDS7211.1 ZNF22 gene_id:7570|Hs108|chr10 ( 224) 657 89.1 4.2e-18
CCDS83401.1 ZNF883 gene_id:169834|Hs108|chr9 ( 379) 661 89.8 4.3e-18
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 661 90.1 5.9e-18
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 661 90.1 5.9e-18
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 661 90.1 6.2e-18
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 661 90.1 6.2e-18
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 661 90.1 6.3e-18
CCDS12954.1 ZNF416 gene_id:55659|Hs108|chr19 ( 594) 655 89.3 9.4e-18
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 656 89.6 9.8e-18
CCDS32383.1 ZNF500 gene_id:26048|Hs108|chr16 ( 480) 652 88.9 1e-17
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 654 89.3 1.1e-17
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 654 89.3 1.1e-17
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 654 89.3 1.1e-17
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 465) 650 88.6 1.2e-17
>>CCDS42634.1 ZNF787 gene_id:126208|Hs108|chr19 (382 aa)
initn: 2749 init1: 2749 opt: 2749 Z-score: 1763.7 bits: 335.1 E(32554): 6.4e-92
Smith-Waterman score: 2749; 100.0% identity (100.0% similar) in 382 aa overlap (1-382:1-382)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MELREEAWSPGPLDSEDQQMASHENPVDILIMDDDDVPSWPPTKLSPPQSAPPAGPPPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MELREEAWSPGPLDSEDQQMASHENPVDILIMDDDDVPSWPPTKLSPPQSAPPAGPPPRP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 RPPAPYICNECGKSFSHWSKLTRHQRTHTGERPNACADCGKTFSQSSHLVQHRRIHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RPPAPYICNECGKSFSHWSKLTRHQRTHTGERPNACADCGKTFSQSSHLVQHRRIHTGEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 PYACLECGKRFSWSSNLMQHQRIHTGEKPYTCPDCGRSFTQSKSLAKHRRSHSGLKPFVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PYACLECGKRFSWSSNLMQHQRIHTGEKPYTCPDCGRSFTQSKSLAKHRRSHSGLKPFVC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 PRCGRGFSQPKSLARHLRLHPELSGPGVAAKVLAASVRRAKGPEEAVAADGEIAIPVGDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PRCGRGFSQPKSLARHLRLHPELSGPGVAAKVLAASVRRAKGPEEAVAADGEIAIPVGDG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 EGIIVVGAPGEGAAAAAAMAGAGAKAAGPRSRRAPAPKPYVCLECGKGFGHGAGLLAHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EGIIVVGAPGEGAAAAAAMAGAGAKAAGPRSRRAPAPKPYVCLECGKGFGHGAGLLAHQR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 AQHGDGLGAAGGEEPAHICVECGEGFVQGAALRRHKKIHAVGAPSVCSSCGQSYYRAGGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AQHGDGLGAAGGEEPAHICVECGEGFVQGAALRRHKKIHAVGAPSVCSSCGQSYYRAGGE
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE4 EEDDDDEAAGGRCPECRGGEGR
::::::::::::::::::::::
CCDS42 EEDDDDEAAGGRCPECRGGEGR
370 380
>>CCDS64999.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 (590 aa)
initn: 1148 init1: 629 opt: 796 Z-score: 521.8 bits: 105.9 E(32554): 9.7e-23
Smith-Waterman score: 796; 40.5% identity (65.1% similar) in 301 aa overlap (65-354:153-438)
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 DDVPSWPPTKLSPPQSAPPAGPPPRPRPPAPYICNECGKSFSHWSKLTRHQRTHTGERPN
:: : :::: : :.:..::: ::::.:
CCDS64 TQKISRCQECQKKLSDCLQGKHTNNCHGEKPYECAECGKVFRLCSQLNQHQRIHTGEKPF
130 140 150 160 170 180
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 ACADCGKTFSQSSHLVQHRRIHTGEKPYACLECGKRFSWSSNLMQHQRIHTGEKPYTCPD
:..:::.: ::.:.::.::::::::: : :::: :. ::.:..::::::::.:: : .
CCDS64 KCTECGKAFRLSSKLIQHQRIHTGEKPYRCEECGKAFGQSSSLIHHQRIHTGERPYGCRE
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 CGRSFTQSKSLAKHRRSHSGLKPFVCPRCGRGFSQPKSLARHLRLHPELSGPGVAAKVLA
::..:.:...:..:.:.:.: .:. : .::..::: ..::.: :.: : :..:
CCDS64 CGKAFSQQSQLVRHQRTHTGERPYPCKECGKAFSQSSTLAQHQRMHT-----GEKAQILK
250 260 270 280 290
220 230 240 250 260
pF1KE4 ASV-------RRAKGPEEAVAAD--GEIA--IPVGDGEGIIVVGAPGEGAAAAAAMAGAG
:: .: .. :. : :. : . . .: .: . : .
CCDS64 ASDSPSLVAHQRIHAVEKPFKCDECGKAFRWISRLSQHQLIHTGEKPYKCNKCTKAFGCS
300 310 320 330 340 350
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 AKAAGPRSRRAPAPKPYVCLECGKGFGHGAGLLAHQRAQHGDGLGAAGGEEPAHICVECG
.. ..: . ::. : :::::: .:. :. ::: . : :.: ..: .::
CCDS64 SRLIR-HQRTHTGEKPFKCDECGKGFVQGSHLIQHQRIHTG--------EKP-YVCNDCG
360 370 380 390 400
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 EGFVQGAALRRHKKIHAVGAPSVCSSCGQSYYRAGGEEEDDDDEAAGGRCPECRGGEGR
..: :...: :..:: : : .::...
CCDS64 KAFSQSSSLIYHQRIHKGEKPYECLQCGKAFSMSTQLTIHQRVHTGERPYKCNECGKAFS
410 420 430 440 450 460
CCDS64 QNSTLFQHQIIHAGVKPYECSECGKAFSRSSYLIEHQRIHTRAQWFYEYGNALEGSTFVS
470 480 490 500 510 520
>>CCDS6435.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 (686 aa)
initn: 1148 init1: 629 opt: 796 Z-score: 521.0 bits: 106.0 E(32554): 1.1e-22
Smith-Waterman score: 796; 40.5% identity (65.1% similar) in 301 aa overlap (65-354:249-534)
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 DDVPSWPPTKLSPPQSAPPAGPPPRPRPPAPYICNECGKSFSHWSKLTRHQRTHTGERPN
:: : :::: : :.:..::: ::::.:
CCDS64 TQKISRCQECQKKLSDCLQGKHTNNCHGEKPYECAECGKVFRLCSQLNQHQRIHTGEKPF
220 230 240 250 260 270
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 ACADCGKTFSQSSHLVQHRRIHTGEKPYACLECGKRFSWSSNLMQHQRIHTGEKPYTCPD
:..:::.: ::.:.::.::::::::: : :::: :. ::.:..::::::::.:: : .
CCDS64 KCTECGKAFRLSSKLIQHQRIHTGEKPYRCEECGKAFGQSSSLIHHQRIHTGERPYGCRE
280 290 300 310 320 330
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 CGRSFTQSKSLAKHRRSHSGLKPFVCPRCGRGFSQPKSLARHLRLHPELSGPGVAAKVLA
::..:.:...:..:.:.:.: .:. : .::..::: ..::.: :.: : :..:
CCDS64 CGKAFSQQSQLVRHQRTHTGERPYPCKECGKAFSQSSTLAQHQRMHT-----GEKAQILK
340 350 360 370 380 390
220 230 240 250 260
pF1KE4 ASV-------RRAKGPEEAVAAD--GEIA--IPVGDGEGIIVVGAPGEGAAAAAAMAGAG
:: .: .. :. : :. : . . .: .: . : .
CCDS64 ASDSPSLVAHQRIHAVEKPFKCDECGKAFRWISRLSQHQLIHTGEKPYKCNKCTKAFGCS
400 410 420 430 440 450
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 AKAAGPRSRRAPAPKPYVCLECGKGFGHGAGLLAHQRAQHGDGLGAAGGEEPAHICVECG
.. ..: . ::. : :::::: .:. :. ::: . : :.: ..: .::
CCDS64 SRLIR-HQRTHTGEKPFKCDECGKGFVQGSHLIQHQRIHTG--------EKP-YVCNDCG
460 470 480 490 500
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 EGFVQGAALRRHKKIHAVGAPSVCSSCGQSYYRAGGEEEDDDDEAAGGRCPECRGGEGR
..: :...: :..:: : : .::...
CCDS64 KAFSQSSSLIYHQRIHKGEKPYECLQCGKAFSMSTQLTIHQRVHTGERPYKCNECGKAFS
510 520 530 540 550 560
CCDS64 QNSTLFQHQIIHAGVKPYECSECGKAFSRSSYLIEHQRIHTRAQWFYEYGNALEGSTFVS
570 580 590 600 610 620
>>CCDS64996.1 ZNF7 gene_id:7553|Hs108|chr8 (697 aa)
initn: 1148 init1: 629 opt: 796 Z-score: 520.9 bits: 106.0 E(32554): 1.1e-22
Smith-Waterman score: 796; 40.5% identity (65.1% similar) in 301 aa overlap (65-354:260-545)
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 DDVPSWPPTKLSPPQSAPPAGPPPRPRPPAPYICNECGKSFSHWSKLTRHQRTHTGERPN
:: : :::: : :.:..::: ::::.:
CCDS64 TQKISRCQECQKKLSDCLQGKHTNNCHGEKPYECAECGKVFRLCSQLNQHQRIHTGEKPF
230 240 250 260 270 280
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 ACADCGKTFSQSSHLVQHRRIHTGEKPYACLECGKRFSWSSNLMQHQRIHTGEKPYTCPD
:..:::.: ::.:.::.::::::::: : :::: :. ::.:..::::::::.:: : .
CCDS64 KCTECGKAFRLSSKLIQHQRIHTGEKPYRCEECGKAFGQSSSLIHHQRIHTGERPYGCRE
290 300 310 320 330 340
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 CGRSFTQSKSLAKHRRSHSGLKPFVCPRCGRGFSQPKSLARHLRLHPELSGPGVAAKVLA
::..:.:...:..:.:.:.: .:. : .::..::: ..::.: :.: : :..:
CCDS64 CGKAFSQQSQLVRHQRTHTGERPYPCKECGKAFSQSSTLAQHQRMHT-----GEKAQILK
350 360 370 380 390 400
220 230 240 250 260
pF1KE4 ASV-------RRAKGPEEAVAAD--GEIA--IPVGDGEGIIVVGAPGEGAAAAAAMAGAG
:: .: .. :. : :. : . . .: .: . : .
CCDS64 ASDSPSLVAHQRIHAVEKPFKCDECGKAFRWISRLSQHQLIHTGEKPYKCNKCTKAFGCS
410 420 430 440 450 460
270 280 290 300 310 320
pF1KE4 AKAAGPRSRRAPAPKPYVCLECGKGFGHGAGLLAHQRAQHGDGLGAAGGEEPAHICVECG
.. ..: . ::. : :::::: .:. :. ::: . : :.: ..: .::
CCDS64 SRLIR-HQRTHTGEKPFKCDECGKGFVQGSHLIQHQRIHTG--------EKP-YVCNDCG
470 480 490 500 510
330 340 350 360 370 380
pF1KE4 EGFVQGAALRRHKKIHAVGAPSVCSSCGQSYYRAGGEEEDDDDEAAGGRCPECRGGEGR
..: :...: :..:: : : .::...
CCDS64 KAFSQSSSLIYHQRIHKGEKPYECLQCGKAFSMSTQLTIHQRVHTGERPYKCNECGKAFS
520 530 540 550 560 570
CCDS64 QNSTLFQHQIIHAGVKPYECSECGKAFSRSSYLIEHQRIHTRAQWFYEYGNALEGSTFVS
580 590 600 610 620 630
>>CCDS82339.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 (598 aa)
initn: 2853 init1: 637 opt: 769 Z-score: 504.5 bits: 102.7 E(32554): 8.8e-22
Smith-Waterman score: 786; 40.8% identity (63.7% similar) in 292 aa overlap (65-356:323-585)
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 DDVPSWPPTKLSPPQSAPPAGPPPRPRPPAPYICNECGKSFSHWSKLTRHQRTHTGERPN
::.: :::..: . :.:.::.:::.::.:
CCDS82 LKPYVCKECGQSFSLKSNLITHQRAHTGEKPYVCRECGRGFRQHSHLVRHKRTHSGEKPY
300 310 320 330 340 350
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 ACADCGKTFSQSSHLVQHRRIHTGEKPYACLECGKRFSWSSNLMQHQRIHTGEKPYTCPD
: .: . :::.:::..: : :::::::.: :::..:::.::: ::: :.: :::.: .
CCDS82 ICRECEQGFSQKSHLIRHLRTHTGEKPYVCTECGRHFSWKSNLKTHQRTHSGVKPYVCLE
360 370 380 390 400 410
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 CGRSFTQSKSLAKHRRSHSGLKPFVCPRCGRGFSQPKSLARHLRLHPELSGPGVAAKVLA
::. :. ...: ::.:::.: ::::: .:::::.. ..:. : : : :: .
CCDS82 CGQCFSLKSNLNKHQRSHTGEKPFVCTECGRGFTRKSTLSTHQRTH---SGE---KPFVC
420 430 440 450 460
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 ASVRRAKGPEEAVAADGEIAIPVGDGEGIIVVGAPGEGAAAAAAMAGAGAKAAGPRSRRA
: :. . . .. . . . .:: .. :. . : .::
CCDS82 AECGRGFNDKSTLISHQR----THSGEKPFMCRECGRRFRQKPNLF---------RHKRA
470 480 490 500 510
280 290 300 310 320 330
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. .:: :::.:: :. ::::. :::. : :.: :::.:: . . : :
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520 530 540 550 560
340 350 360 370 380
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:.. :. : .: .::... :
CCDS82 HQRTHSGEKPYICRKCGRGFSRKSNLIRHQRTHSG
570 580 590
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::.: :::..: . :.:.::.:::.::.:
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:.. :. : .: .::... :
CCDS82 HQRTHSGEKPYICRKCGRGFSRKSNLIRHQRTHSG
610 620 630 640
>>CCDS82337.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 (641 aa)
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40 50 60 70 80 90
pF1KE4 DDVPSWPPTKLSPPQSAPPAGPPPRPRPPAPYICNECGKSFSHWSKLTRHQRTHTGERPN
::.: :::..: . :.:.::.:::.::.:
CCDS82 LKPYVCKECGQSFSLKSNLITHQRAHTGEKPYVCRECGRGFRQHSHLVRHKRTHSGEKPY
340 350 360 370 380 390
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 ACADCGKTFSQSSHLVQHRRIHTGEKPYACLECGKRFSWSSNLMQHQRIHTGEKPYTCPD
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CCDS82 ICRECEQGFSQKSHLIRHLRTHTGEKPYVCTECGRHFSWKSNLKTHQRTHSGVKPYVCLE
400 410 420 430 440 450
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 CGRSFTQSKSLAKHRRSHSGLKPFVCPRCGRGFSQPKSLARHLRLHPELSGPGVAAKVLA
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CCDS82 CGQCFSLKSNLNKHQRSHTGEKPFVCTECGRGFTRKSTLSTHQRTH---SGE---KPFVC
460 470 480 490 500
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 ASVRRAKGPEEAVAADGEIAIPVGDGEGIIVVGAPGEGAAAAAAMAGAGAKAAGPRSRRA
: :. . . .. . . . .:: .. :. . : .::
CCDS82 AECGRGFNDKSTLISHQR----THSGEKPFMCRECGRRFRQKPNLF---------RHKRA
510 520 530 540 550
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 PAPKPYVCLECGKGFGHGAGLLAHQRAQHGDGLGAAGGEEPAHICVECGEGFVQGAALRR
. .:: :::.:: :. ::::. :::. : :.: :::.:: . . : :
CCDS82 HSGA-FVCRECGQGFCAKLTLIKHQRAH-------AGGK-P-HVCRECGQGFSRQSHLIR
560 570 580 590 600
340 350 360 370 380
pF1KE4 HKKIHAVGAPSVCSSCGQSYYRAGGEEEDDDDEAAGGRCPECRGGEGR
:.. :. : .: .::... :
CCDS82 HQRTHSGEKPYICRKCGRGFSRKSNLIRHQRTHSG
610 620 630 640
>>CCDS12502.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 (659 aa)
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40 50 60 70 80 90
pF1KE4 DDVPSWPPTKLSPPQSAPPAGPPPRPRPPAPYICNECGKSFSHWSKLTRHQRTHTGERPN
::.: :::..: . :.:.::.:::.::.:
CCDS12 LKPYVCKECGQSFSLKSNLITHQRAHTGEKPYVCRECGRGFRQHSHLVRHKRTHSGEKPY
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100 110 120 130 140 150
pF1KE4 ACADCGKTFSQSSHLVQHRRIHTGEKPYACLECGKRFSWSSNLMQHQRIHTGEKPYTCPD
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CCDS12 ICRECEQGFSQKSHLIRHLRTHTGEKPYVCTECGRHFSWKSNLKTHQRTHSGVKPYVCLE
420 430 440 450 460 470
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 CGRSFTQSKSLAKHRRSHSGLKPFVCPRCGRGFSQPKSLARHLRLHPELSGPGVAAKVLA
::. :. ...: ::.:::.: ::::: .:::::.. ..:. : : : :: .
CCDS12 CGQCFSLKSNLNKHQRSHTGEKPFVCTECGRGFTRKSTLSTHQRTH---SGE---KPFVC
480 490 500 510 520
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 ASVRRAKGPEEAVAADGEIAIPVGDGEGIIVVGAPGEGAAAAAAMAGAGAKAAGPRSRRA
: :. . . .. . . . .:: .. :. . : .::
CCDS12 AECGRGFNDKSTLISHQR----THSGEKPFMCRECGRRFRQKPNLF---------RHKRA
530 540 550 560 570
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 PAPKPYVCLECGKGFGHGAGLLAHQRAQHGDGLGAAGGEEPAHICVECGEGFVQGAALRR
. .:: :::.:: :. ::::. :::. : :.: :::.:: . . : :
CCDS12 HSGA-FVCRECGQGFCAKLTLIKHQRAH-------AGGK-P-HVCRECGQGFSRQSHLIR
580 590 600 610 620
340 350 360 370 380
pF1KE4 HKKIHAVGAPSVCSSCGQSYYRAGGEEEDDDDEAAGGRCPECRGGEGR
:.. :. : .: .::... :
CCDS12 HQRTHSGEKPYICRKCGRGFSRKSNLIRHQRTHSG
630 640 650
>>CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 (869 aa)
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10 20 30
pF1KE4 MELREEAWSPGPLDSEDQQMASHENPVDIL
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CCDS45 EEESPRQESSGEEIIMGDPAQSPESKDSTEMSLERSSQDPSVPQNPPTPLG-HSNPLDHQ
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40 50 60
pF1KE4 IMDDDDVP---------------SWPPTKLSPPQSAP--PAGPPP-----RPRPPA---P
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CCDS45 IPLDPPAPEVVPTPSDWTKACEASWQWGALTTWNSPPVVPANEPSLRELVQGRPAGAEKP
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pF1KE4 YICNECGKSFSHWSKLTRHQRTHTGERPNACADCGKTFSQSSHLVQHRRIHTGEKPYACL
:::::::::::.:::: :::: :::::::.:..:::.:.::::::::.: ::::::: :
CCDS45 YICNECGKSFSQWSKLLRHQRIHTGERPNTCSECGKSFTQSSHLVQHQRTHTGEKPYKCP
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pF1KE4 ECGKRFSWSSNLMQHQRIHTGEKPYTCPDCGRSFTQSKSLAKHRRSHSGLKPFVC-----
.::: :::::::.:::: ::::::: : .: ..:::: .: ::.:::.: ::. :
CCDS45 DCGKCFSWSSNLVQHQRTHTGEKPYKCTECEKAFTQSTNLIKHQRSHTGEKPYKCGECRR
210 220 230 240 250 260
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pF1KE4 -----------------------PRCGRGFSQPKSLARHLRLH----P----ELSGPGVA
:.::. :.: ..: .: ..: : : . .
CCDS45 AFYRSSDLIQHQATHTGEKPYKCPECGKRFGQNHNLLKHQKIHAGEKPYRCTECGKSFIQ
270 280 290 300 310 320
210 220 230 240 250 260
pF1KE4 AKVLAASVRRAKG--PEEAVAADGEIAIPVGDGEGII------VVGAPGEGAAAAAAMAG
.. :. : : : : . : . : . .: . : . . . ...
CCDS45 SSELTQHQRTHTGEKPYECL----ECGKSFGHSSTLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKTFTL
330 340 350 360 370 380
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pF1KE4 AGAKAAGPRSRRAPAPKPYVCLECGKGFGHGAGLLAHQRAQHGDGLGAAGGEEPAHICVE
... :.. . .:: : ::::.:. ...:. ::: ..: :.: .::..
CCDS45 SATLLRHQRTHTG--ERPYKCPECGKSFSVSSNLINHQRIHRG--------ERP-YICAD
390 400 410 420 430
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pF1KE4 CGEGFVQGAALRRHKKIHAVGAPSVCSSCGQSYYRAGG--EEEDDDDEAAGGRCPECRGG
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CCDS45 CGKSFIMSSTLIRHQRIHTGEKPYKCSDCGKSFIRSSHLIQHRRTHTGEKPYKCPECGKS
440 450 460 470 480 490
380
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CCDS45 FSQSSNLITHVRTHMDENLFVCSDCGKAFLEAHELEQHRVIHERGKTPARRAQGDSLLGL
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>>CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 (470 aa)
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CCDS23 IRYHICSHCGKAFSQISDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPY
140 150 160 170 180 190
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CCDS23 DCNECGKSFGRSSHLIQHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEE
200 210 220 230 240 250
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CCDS23 CGKSFSRSSHLAQHQRTHTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKN
260 270 280 290 300 310
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pF1KE4 VAAKVLAASVRRAKGPEEAVAAD--GEIAIPVG---DGEGIIVVGAPGEGAAAAAAMAGA
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CCDS23 FSQNSDLVRHRRAHTGEKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRS
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CCDS23 SHLITHQKIHTGE--KPYECNECWRSFGERSDLIKHQRTH--------TGEKPYE-CVQC
380 390 400 410 420
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]