FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4049, 278 aa 1>>>pF1KE4049 278 - 278 aa - 278 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2393+/-0.00113; mu= 9.7062+/- 0.067 mean_var=118.5248+/-24.321, 0's: 0 Z-trim(106.0): 225 B-trim: 64 in 1/50 Lambda= 0.117807 statistics sampled from 8457 (8732) to 8457 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.268), width: 16 Scan time: 2.160 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7070.1 ASB13 gene_id:79754|Hs108|chr10 ( 278) 1871 329.3 1.8e-90 CCDS3827.1 ASB5 gene_id:140458|Hs108|chr4 ( 329) 696 129.7 2.7e-30 CCDS35208.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX ( 294) 694 129.3 3.1e-30 CCDS35209.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX ( 302) 674 125.9 3.4e-29 CCDS14164.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX ( 323) 674 126.0 3.5e-29 CCDS14163.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX ( 262) 605 114.2 1e-25 CCDS56596.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX ( 306) 530 101.5 7.9e-22 CCDS55372.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX ( 252) 352 71.1 8.8e-13 CCDS54802.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1250) 361 73.3 9.9e-13 CCDS34060.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1429) 361 73.3 1.1e-12 CCDS54796.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1863) 354 72.2 3e-12 CCDS43261.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1872) 354 72.2 3e-12 CCDS3702.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (3957) 354 72.5 5.2e-12 CCDS55712.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1861) 348 71.2 6.1e-12 CCDS55711.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1868) 348 71.2 6.1e-12 CCDS7258.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (4377) 348 71.6 1.1e-11 CCDS5774.1 CTTNBP2 gene_id:83992|Hs108|chr7 (1663) 339 69.7 1.6e-11 CCDS44734.1 ANKK1 gene_id:255239|Hs108|chr11 ( 765) 331 68.0 2.4e-11 >>CCDS7070.1 ASB13 gene_id:79754|Hs108|chr10 (278 aa) initn: 1871 init1: 1871 opt: 1871 Z-score: 1737.7 bits: 329.3 E(32554): 1.8e-90 Smith-Waterman score: 1871; 100.0% identity (100.0% similar) in 278 aa overlap (1-278:1-278) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MEPRAADGCFLGDVGFWVERTPVHEAAQRGESLQLQQLIESGACVNQVTVDSITPLHAAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 MEPRAADGCFLGDVGFWVERTPVHEAAQRGESLQLQQLIESGACVNQVTVDSITPLHAAS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 LQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDACASGSIECVKLLLSYGAKVNPPLYTASP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 LQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDACASGSIECVKLLLSYGAKVNPPLYTASP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 LHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTPLHVACAREHLDCVKVLLNAGANVNAAK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 LHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTPLHVACAREHLDCVKVLLNAGANVNAAK 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 LHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDNRGKKPSDYTWSSSAPAKCFEYYEKTPL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 LHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDNRGKKPSDYTWSSSAPAKCFEYYEKTPL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 TLSQLCRVNLRKATGVRGLEKIAKLNIPPRLIDYLSYN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS70 TLSQLCRVNLRKATGVRGLEKIAKLNIPPRLIDYLSYN 250 260 270 >>CCDS3827.1 ASB5 gene_id:140458|Hs108|chr4 (329 aa) initn: 947 init1: 621 opt: 696 Z-score: 657.4 bits: 129.7 E(32554): 2.7e-30 Smith-Waterman score: 696; 41.8% identity (70.7% similar) in 263 aa overlap (15-277:66-328) 10 20 30 40 pF1KE4 MEPRAADGCFLGDVGFWVERTPVHEAAQRGESLQLQQLIESGAC : :..:.:.::::..:. : :. :. .: CCDS38 AILSHFYIVKGNRKEAARIAAEFYGVTQGQGSWADRSPLHEAASQGRLLALRTLLSQGYN 40 50 60 70 80 90 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 VNQVTVDSITPLHAASLQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDACASGSIECVKLL :: ::.: .:::: : : .. :.. :: :::.:.: .::: ::: .::..:: :..:: CCDS38 VNAVTLDHVTPLHEACLGDHVACARTLLEAGANVNAITIDGVTPLFNACSQGSPSCAELL 100 110 120 130 140 150 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 LSYGAKVNPPLYTASPLHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTPLHVACAREHLD : ::::.. :: ::: .: ::. .::. : ... . :.::::.::: ... 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CCDS35 YQRVDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNAQGKSAL 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 DYTWSSSAPAKCFEYYEKTPLTLSQLCRVNLRKATGVRGLEKIAKLNIPPRLIDYLSYN : . .:. . . : : .::::::. .:: : . : ::..: : .: : CCDS35 DLAAPKSSVEQALLLREGPP-ALSQLCRLCVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLERFLLYQ 250 260 270 280 290 300 >>CCDS14164.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX (323 aa) initn: 785 init1: 548 opt: 674 Z-score: 637.3 bits: 126.0 E(32554): 3.5e-29 Smith-Waterman score: 674; 39.4% identity (69.0% similar) in 274 aa overlap (4-277:50-322) 10 20 30 pF1KE4 MEPRAADGCFLGDVGFWVERTPVHEAAQRGESL : :. . : :..:.:.:::: .:. : CCDS14 TFFFFKLLIKVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIYGGISDCWADRSPLHEAAAQGRLL 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 QLQQLIESGACVNQVTVDSITPLHAASLQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDAC :. :: .:. :: ::.. .. :: : : :.. :.. :: ::.:.. .. :.::: .:: CCDS14 ALKTLIAQGVNVNLVTINRVSSLHEACLGGHVACAKALLENGAHVNGVTVHGATPLFNAC 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 ASGSIECVKLLLSYGAKVNPPLYTASPLHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTP ::: ::..:: .:::.. .. :::.::: : ::...:. ..:.. . ..::: CCDS14 CSGSAACVNVLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTP 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 LHVACAREHLDCVKVLLNAGANVNAAKLHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDN :.:::. ...:::: ::. ::.:. .. .: :: ::. .::..:..: ..:.:. :. CCDS14 LYVACTYQRVDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNA 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 RGKKPSDYTWSSSAPAKCFEYYEKTPLTLSQLCRVNLRKATGVRGLEKIAKLNIPPRLID .::. : . .:. . . : : .::::::. .:: : . : ::..: : CCDS14 QGKSALDLAAPKSSVEQALLLREGPP-ALSQLCRLCVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLER 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 YLSYN .: : CCDS14 FLLYQ 320 >>CCDS14163.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX (262 aa) initn: 894 init1: 577 opt: 605 Z-score: 575.1 bits: 114.2 E(32554): 1e-25 Smith-Waterman score: 605; 42.2% identity (70.3% similar) in 232 aa overlap (10-240:29-257) 10 20 30 40 pF1KE4 MEPRAADGCFLGD-VGFWVERTPVHEAAQRGESLQLQQLIE ..:: :. : .:.:::: .:..:.:..:: CCDS14 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDW---SPMHEAAIHGHQLSLRNLIS 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 SGACVNQVTVDSITPLHAASLQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDACASGSIEC .: :: .:.: ..::: : : :. ::..:: ::::.. . : ::: .::.::: .: CCDS14 QGWAVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDC 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 VKLLLSYGAKVNPPLYTASPLHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTPLHVACAR :.:::..::.:.: :::.::: : ::: :: :.:.. . :.::::..:: CCDS14 VNLLLQHGASVQPESDLASPIHEAARRGHVECVNSLIAYGGNIDHKISHLGTPLYLACEN 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 EHLDCVKVLLNAGANVNAAKLHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDNRGKKPSD .. ::: ::..::.:: .: ... :: .:.. . .: .:..::.. :.. .::.: . CCDS14 QQRACVKKLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVE 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KE4 YTWSSSAPAKCFEYYEKTPLTLSQLCRVNLRKATGVRGLEKIAKLNIPPRLIDYLSYN . : :. : : . : CCDS14 LVPPESPLAQLFLEREGASLPKPKP 240 250 260 >>CCDS56596.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX (306 aa) initn: 791 init1: 421 opt: 530 Z-score: 505.4 bits: 101.5 E(32554): 7.9e-22 Smith-Waterman score: 584; 37.2% identity (65.0% similar) in 274 aa overlap (4-277:50-305) 10 20 30 pF1KE4 MEPRAADGCFLGDVGFWVERTPVHEAAQRGESL : :. . : :..:.:.:::: .:. : CCDS56 TFFFFKLLIKVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIYGGISDCWADRSPLHEAAAQGRLL 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 QLQQLIESGACVNQVTVDSITPLHAASLQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDAC :. :: . :: : :.. :.. :: ::.:.. .. :.::: .:: CCDS56 ALKTLI-AQAC----------------LGGHVACAKALLENGAHVNGVTVHGATPLFNAC 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 ASGSIECVKLLLSYGAKVNPPLYTASPLHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTP ::: ::..:: .:::.. .. :::.::: : ::...:. ..:.. . ..::: CCDS56 CSGSAACVNVLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTP 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 LHVACAREHLDCVKVLLNAGANVNAAKLHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDN :.:::. ...:::: ::. ::.:. .. .: :: ::. .::..:..: ..:.:. :. CCDS56 LYVACTYQRVDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNA 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 RGKKPSDYTWSSSAPAKCFEYYEKTPLTLSQLCRVNLRKATGVRGLEKIAKLNIPPRLID .::. : . .:. . . : : .::::::. .:: : . : ::..: : CCDS56 QGKSALDLAAPKSSVEQALLLREGPP-ALSQLCRLCVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLER 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 YLSYN .: : CCDS56 FLLYQ >>CCDS55372.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX (252 aa) initn: 699 init1: 345 opt: 352 Z-score: 343.0 bits: 71.1 E(32554): 8.8e-13 Smith-Waterman score: 542; 39.7% identity (68.1% similar) in 232 aa overlap (10-240:29-247) 10 20 30 40 pF1KE4 MEPRAADGCFLGD-VGFWVERTPVHEAAQRGESLQLQQLIE ..:: :. : .:.:::: .:..:.:..:: CCDS55 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDW---SPMHEAAIHGHQLSLRNLIS 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 SGACVNQVTVDSITPLHAASLQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDACASGSIEC .: :: .:.: ..::: : : :. ::..:: ::::.. . : ::: .::.::: .: CCDS55 QGWAVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDC 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 VKLLLSYGAKVNPPLYTASPLHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTPLHVACAR :.:::..::.:.: :::.::: . :.:.. . :.::::..:: CCDS55 VNLLLQHGASVQPESDLASPIHEAARRA----------YGGNIDHKISHLGTPLYLACEN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 EHLDCVKVLLNAGANVNAAKLHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDNRGKKPSD .. ::: ::..::.:: .: ... :: .:.. . .: .:..::.. :.. .::.: . CCDS55 QQRACVKKLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVE 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 YTWSSSAPAKCFEYYEKTPLTLSQLCRVNLRKATGVRGLEKIAKLNIPPRLIDYLSYN . : :. : : . : CCDS55 LVPPESPLAQLFLEREGASLPKPKP 230 240 250 >>CCDS54802.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1250 aa) initn: 288 init1: 209 opt: 361 Z-score: 342.1 bits: 73.3 E(32554): 9.9e-13 Smith-Waterman score: 361; 35.5% identity (61.7% similar) in 214 aa overlap (4-215:657-866) 10 20 30 pF1KE4 MEPRAADGCFLGDVGFWVERTPVHEAAQRGESL :. : :.: : ::.: :: .:. : CCDS54 AVDSIDSEGRTVLSIASAQGNVEVVRTLLDRGLDENHRDDAG-W---TPLHMAAFEGHRL 630 640 650 660 670 680 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 QLQQLIESGACVNQVTVDSITPLHAASLQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDAC . :::.:: .:.. :. :. :: .:. :::.:: ...: :. :: . : : CCDS54 ICEALIEQGARTNEIDNDGRIPFILASQEGHYDCVQILLENKSNIDQRGYDGRNALRVAA 690 700 710 720 730 740 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 ASGSIECVKLLLSYGAKVNPPLYTASP-LHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGT : . :.::.:.:: :: . : :. . .. .. ... :::.:: : . : CCDS54 LEGHRDIVELLFSHGADVNCKDADGRPTLYILALENQLTMAEYFLENGANVEASDAEGRT 750 760 770 780 790 800 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 PLHVACAREHLDCVKVLLNAGANVNAA-KLHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYAR :::.: . :.. :.::. :.:::: . ...::. :: .: ....::: :. . 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