Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4049
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4049, 278 aa
1>>>pF1KE4049 278 - 278 aa - 278 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2393+/-0.00113; mu= 9.7062+/- 0.067
mean_var=118.5248+/-24.321, 0's: 0 Z-trim(106.0): 225 B-trim: 64 in 1/50
Lambda= 0.117807
statistics sampled from 8457 (8732) to 8457 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.268), width: 16
Scan time: 2.160
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7070.1 ASB13 gene_id:79754|Hs108|chr10 ( 278) 1871 329.3 1.8e-90
CCDS3827.1 ASB5 gene_id:140458|Hs108|chr4 ( 329) 696 129.7 2.7e-30
CCDS35208.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX ( 294) 694 129.3 3.1e-30
CCDS35209.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX ( 302) 674 125.9 3.4e-29
CCDS14164.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX ( 323) 674 126.0 3.5e-29
CCDS14163.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX ( 262) 605 114.2 1e-25
CCDS56596.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX ( 306) 530 101.5 7.9e-22
CCDS55372.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX ( 252) 352 71.1 8.8e-13
CCDS54802.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1250) 361 73.3 9.9e-13
CCDS34060.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1429) 361 73.3 1.1e-12
CCDS54796.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1863) 354 72.2 3e-12
CCDS43261.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1872) 354 72.2 3e-12
CCDS3702.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (3957) 354 72.5 5.2e-12
CCDS55712.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1861) 348 71.2 6.1e-12
CCDS55711.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1868) 348 71.2 6.1e-12
CCDS7258.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (4377) 348 71.6 1.1e-11
CCDS5774.1 CTTNBP2 gene_id:83992|Hs108|chr7 (1663) 339 69.7 1.6e-11
CCDS44734.1 ANKK1 gene_id:255239|Hs108|chr11 ( 765) 331 68.0 2.4e-11
>>CCDS7070.1 ASB13 gene_id:79754|Hs108|chr10 (278 aa)
initn: 1871 init1: 1871 opt: 1871 Z-score: 1737.7 bits: 329.3 E(32554): 1.8e-90
Smith-Waterman score: 1871; 100.0% identity (100.0% similar) in 278 aa overlap (1-278:1-278)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MEPRAADGCFLGDVGFWVERTPVHEAAQRGESLQLQQLIESGACVNQVTVDSITPLHAAS
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CCDS70 MEPRAADGCFLGDVGFWVERTPVHEAAQRGESLQLQQLIESGACVNQVTVDSITPLHAAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 LQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDACASGSIECVKLLLSYGAKVNPPLYTASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDACASGSIECVKLLLSYGAKVNPPLYTASP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 LHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTPLHVACAREHLDCVKVLLNAGANVNAAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTPLHVACAREHLDCVKVLLNAGANVNAAK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 LHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDNRGKKPSDYTWSSSAPAKCFEYYEKTPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDNRGKKPSDYTWSSSAPAKCFEYYEKTPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KE4 TLSQLCRVNLRKATGVRGLEKIAKLNIPPRLIDYLSYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 TLSQLCRVNLRKATGVRGLEKIAKLNIPPRLIDYLSYN
250 260 270
>>CCDS3827.1 ASB5 gene_id:140458|Hs108|chr4 (329 aa)
initn: 947 init1: 621 opt: 696 Z-score: 657.4 bits: 129.7 E(32554): 2.7e-30
Smith-Waterman score: 696; 41.8% identity (70.7% similar) in 263 aa overlap (15-277:66-328)
10 20 30 40
pF1KE4 MEPRAADGCFLGDVGFWVERTPVHEAAQRGESLQLQQLIESGAC
: :..:.:.::::..:. : :. :. .:
CCDS38 AILSHFYIVKGNRKEAARIAAEFYGVTQGQGSWADRSPLHEAASQGRLLALRTLLSQGYN
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 VNQVTVDSITPLHAASLQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDACASGSIECVKLL
:: ::.: .:::: : : .. :.. :: :::.:.: .::: ::: .::..:: :..::
CCDS38 VNAVTLDHVTPLHEACLGDHVACARTLLEAGANVNAITIDGVTPLFNACSQGSPSCAELL
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 LSYGAKVNPPLYTASPLHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTPLHVACAREHLD
: ::::.. :: ::: .: ::. .::. : ... . :.::::.::: ...
CCDS38 LEYGAKAQLESCLPSPTHEAASKGHHECLDILISWGIDVDQEIPHLGTPLYVACMSQQFH
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 CVKVLLNAGANVNAAKLHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDNRGKKPSDYTWS
:. :: :::.:. .: .: :: ::. ........:.:::..: :.... .: : . :
CCDS38 CIWKLLYAGADVQKGKYWDTPLHAAAQQSSTEIVNLLLEFGADINAKNTELLRPIDVATS
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270
pF1KE4 SSAPAKCFEYYEKTPLTLSQLCRVNLRKATGVRGLEKIAKLNIPPRLIDYLSYN
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CCDS38 SSMVERILLQHEATPSSLYQLCRLCIRSYIGKPRLHLIPQLQLPTLLKNFLQYR
280 290 300 310 320
>>CCDS35208.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX (294 aa)
initn: 971 init1: 577 opt: 694 Z-score: 656.2 bits: 129.3 E(32554): 3.1e-30
Smith-Waterman score: 694; 42.3% identity (70.0% similar) in 267 aa overlap (10-275:29-291)
10 20 30 40
pF1KE4 MEPRAADGCFLGD-VGFWVERTPVHEAAQRGESLQLQQLIE
..:: :. : .:.:::: .:..:.:..::
CCDS35 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDW---SPMHEAAIHGHQLSLRNLIS
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 SGACVNQVTVDSITPLHAASLQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDACASGSIEC
.: :: .:.: ..::: : : :. ::..:: ::::.. . : ::: .::.::: .:
CCDS35 QGWAVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDC
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 VKLLLSYGAKVNPPLYTASPLHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTPLHVACAR
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CCDS35 VNLLLQHGASVQPESDLASPIHEAARRGHVECVNSLIAYGGNIDHKISHLGTPLYLACEN
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 EHLDCVKVLLNAGANVNAAKLHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDNRGKKPSD
.. ::: ::..::.:: .: ... :: .:.. . .: .:..::.. :.. .::.: .
CCDS35 QQRACVKKLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE4 YTWSSSAPAKCFEYYEKTPLTLSQLCRVNLRKATGVRGLEKIAKLNIPPRLIDYLSYN
. : :. : : : .: ::::. .:: :.. .::.:: .: : ..:
CCDS35 LVPPESPLAQLFLEREGPP-SLMQLCRLRIRKCFGIQQHHKITKLVLPEDLKQFLLHL
240 250 260 270 280 290
>>CCDS35209.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX (302 aa)
initn: 785 init1: 548 opt: 674 Z-score: 637.7 bits: 125.9 E(32554): 3.4e-29
Smith-Waterman score: 674; 40.3% identity (69.8% similar) in 268 aa overlap (10-277:37-301)
10 20 30
pF1KE4 MEPRAADGCFLGDVGFWVERTPVHEAAQRGESLQLQQLI
: :: :..:.:.:::: .:. : :. ::
CCDS35 ENEKNCEVSERIRRSGPWKEISFGDYICHTFQGDC--WADRSPLHEAAAQGRLLALKTLI
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 ESGACVNQVTVDSITPLHAASLQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDACASGSIE
.:. :: ::.. .. :: : : :.. :.. :: ::.:.. .. :.::: .:: :::
CCDS35 AQGVNVNLVTINRVSSLHEACLGGHVACAKALLENGAHVNGVTVHGATPLFNACCSGSAA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 CVKLLLSYGAKVNPPLYTASPLHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTPLHVACA
::..:: .:::.. .. :::.::: : ::...:. ..:.. . ..::::.:::.
CCDS35 CVNVLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTPLYVACT
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 REHLDCVKVLLNAGANVNAAKLHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDNRGKKPS
...:::: ::. ::.:. .. .: :: ::. .::..:..: ..:.:. :. .::.
CCDS35 YQRVDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNAQGKSAL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 DYTWSSSAPAKCFEYYEKTPLTLSQLCRVNLRKATGVRGLEKIAKLNIPPRLIDYLSYN
: . .:. . . : : .::::::. .:: : . : ::..: : .: :
CCDS35 DLAAPKSSVEQALLLREGPP-ALSQLCRLCVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLERFLLYQ
250 260 270 280 290 300
>>CCDS14164.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX (323 aa)
initn: 785 init1: 548 opt: 674 Z-score: 637.3 bits: 126.0 E(32554): 3.5e-29
Smith-Waterman score: 674; 39.4% identity (69.0% similar) in 274 aa overlap (4-277:50-322)
10 20 30
pF1KE4 MEPRAADGCFLGDVGFWVERTPVHEAAQRGESL
: :. . : :..:.:.:::: .:. :
CCDS14 TFFFFKLLIKVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIYGGISDCWADRSPLHEAAAQGRLL
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 QLQQLIESGACVNQVTVDSITPLHAASLQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDAC
:. :: .:. :: ::.. .. :: : : :.. :.. :: ::.:.. .. :.::: .::
CCDS14 ALKTLIAQGVNVNLVTINRVSSLHEACLGGHVACAKALLENGAHVNGVTVHGATPLFNAC
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 ASGSIECVKLLLSYGAKVNPPLYTASPLHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTP
::: ::..:: .:::.. .. :::.::: : ::...:. ..:.. . ..:::
CCDS14 CSGSAACVNVLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTP
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 LHVACAREHLDCVKVLLNAGANVNAAKLHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDN
:.:::. ...:::: ::. ::.:. .. .: :: ::. .::..:..: ..:.:. :.
CCDS14 LYVACTYQRVDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNA
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 RGKKPSDYTWSSSAPAKCFEYYEKTPLTLSQLCRVNLRKATGVRGLEKIAKLNIPPRLID
.::. : . .:. . . : : .::::::. .:: : . : ::..: :
CCDS14 QGKSALDLAAPKSSVEQALLLREGPP-ALSQLCRLCVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLER
260 270 280 290 300 310
pF1KE4 YLSYN
.: :
CCDS14 FLLYQ
320
>>CCDS14163.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX (262 aa)
initn: 894 init1: 577 opt: 605 Z-score: 575.1 bits: 114.2 E(32554): 1e-25
Smith-Waterman score: 605; 42.2% identity (70.3% similar) in 232 aa overlap (10-240:29-257)
10 20 30 40
pF1KE4 MEPRAADGCFLGD-VGFWVERTPVHEAAQRGESLQLQQLIE
..:: :. : .:.:::: .:..:.:..::
CCDS14 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDW---SPMHEAAIHGHQLSLRNLIS
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 SGACVNQVTVDSITPLHAASLQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDACASGSIEC
.: :: .:.: ..::: : : :. ::..:: ::::.. . : ::: .::.::: .:
CCDS14 QGWAVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDC
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 VKLLLSYGAKVNPPLYTASPLHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTPLHVACAR
:.:::..::.:.: :::.::: : ::: :: :.:.. . :.::::..::
CCDS14 VNLLLQHGASVQPESDLASPIHEAARRGHVECVNSLIAYGGNIDHKISHLGTPLYLACEN
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 EHLDCVKVLLNAGANVNAAKLHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDNRGKKPSD
.. ::: ::..::.:: .: ... :: .:.. . .: .:..::.. :.. .::.: .
CCDS14 QQRACVKKLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE4 YTWSSSAPAKCFEYYEKTPLTLSQLCRVNLRKATGVRGLEKIAKLNIPPRLIDYLSYN
. : :. : : . :
CCDS14 LVPPESPLAQLFLEREGASLPKPKP
240 250 260
>>CCDS56596.1 ASB11 gene_id:140456|Hs108|chrX (306 aa)
initn: 791 init1: 421 opt: 530 Z-score: 505.4 bits: 101.5 E(32554): 7.9e-22
Smith-Waterman score: 584; 37.2% identity (65.0% similar) in 274 aa overlap (4-277:50-305)
10 20 30
pF1KE4 MEPRAADGCFLGDVGFWVERTPVHEAAQRGESL
: :. . : :..:.:.:::: .:. :
CCDS56 TFFFFKLLIKVFLALLTHFYIVKGNRKEAARIAEEIYGGISDCWADRSPLHEAAAQGRLL
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 QLQQLIESGACVNQVTVDSITPLHAASLQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDAC
:. :: . :: : :.. :.. :: ::.:.. .. :.::: .::
CCDS56 ALKTLI-AQAC----------------LGGHVACAKALLENGAHVNGVTVHGATPLFNAC
80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 ASGSIECVKLLLSYGAKVNPPLYTASPLHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTP
::: ::..:: .:::.. .. :::.::: : ::...:. ..:.. . ..:::
CCDS56 CSGSAACVNVLLEFGAKAQLEVHLASPIHEAVKRGHRECMEILLANNVNIDHEVPQLGTP
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 LHVACAREHLDCVKVLLNAGANVNAAKLHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDN
:.:::. ...:::: ::. ::.:. .. .: :: ::. .::..:..: ..:.:. :.
CCDS56 LYVACTYQRVDCVKKLLELGASVDHGQWLDTPLHAAARQSNVEVIHLLTDYGANLKRRNA
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 RGKKPSDYTWSSSAPAKCFEYYEKTPLTLSQLCRVNLRKATGVRGLEKIAKLNIPPRLID
.::. : . .:. . . : : .::::::. .:: : . : ::..: :
CCDS56 QGKSALDLAAPKSSVEQALLLREGPP-ALSQLCRLCVRKCLGRACHQAIHKLHLPEPLER
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 YLSYN
.: :
CCDS56 FLLYQ
>>CCDS55372.1 ASB9 gene_id:140462|Hs108|chrX (252 aa)
initn: 699 init1: 345 opt: 352 Z-score: 343.0 bits: 71.1 E(32554): 8.8e-13
Smith-Waterman score: 542; 39.7% identity (68.1% similar) in 232 aa overlap (10-240:29-247)
10 20 30 40
pF1KE4 MEPRAADGCFLGD-VGFWVERTPVHEAAQRGESLQLQQLIE
..:: :. : .:.:::: .:..:.:..::
CCDS55 MDGKQGGMDGSKPAGPRDFPGIRLLSNPLMGDAVSDW---SPMHEAAIHGHQLSLRNLIS
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE4 SGACVNQVTVDSITPLHAASLQGQARCVQLLLAAGAQVDARNIDGSTPLCDACASGSIEC
.: :: .:.: ..::: : : :. ::..:: ::::.. . : ::: .::.::: .:
CCDS55 QGWAVNIITADHVSPLHEACLGGHLSCVKILLKHGAQVNGVTADWHTPLFNACVSGSWDC
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 VKLLLSYGAKVNPPLYTASPLHEACMSGSSECVRLLIDVGANLEAHDCHFGTPLHVACAR
:.:::..::.:.: :::.::: . :.:.. . :.::::..::
CCDS55 VNLLLQHGASVQPESDLASPIHEAARRA----------YGGNIDHKISHLGTPLYLACEN
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 EHLDCVKVLLNAGANVNAAKLHETALHHAAKVKNVDLIEMLIEFGGNIYARDNRGKKPSD
.. ::: ::..::.:: .: ... :: .:.. . .: .:..::.. :.. .::.: .
CCDS55 QQRACVKKLLESGADVNQGKGQDSPLHAVARTASEELACLLMDFGADTQAKNAEGKRPVE
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270
pF1KE4 YTWSSSAPAKCFEYYEKTPLTLSQLCRVNLRKATGVRGLEKIAKLNIPPRLIDYLSYN
. : :. : : . :
CCDS55 LVPPESPLAQLFLEREGASLPKPKP
230 240 250
>>CCDS54802.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1250 aa)
initn: 288 init1: 209 opt: 361 Z-score: 342.1 bits: 73.3 E(32554): 9.9e-13
Smith-Waterman score: 361; 35.5% identity (61.7% similar) in 214 aa overlap (4-215:657-866)
10 20 30
pF1KE4 MEPRAADGCFLGDVGFWVERTPVHEAAQRGESL
:. : :.: : ::.: :: .:. :
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