Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3989
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3989, 380 aa
1>>>pF1KE3989 380 - 380 aa - 380 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3047+/-0.000883; mu= 16.4439+/- 0.053
mean_var=74.8602+/-14.873, 0's: 0 Z-trim(106.8): 83 B-trim: 153 in 1/50
Lambda= 0.148234
statistics sampled from 9101 (9193) to 9101 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.663), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16
Scan time: 2.280
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11261.1 ADAP2 gene_id:55803|Hs108|chr17 ( 381) 2603 566.2 1.7e-161
CCDS5318.1 ADAP1 gene_id:11033|Hs108|chr7 ( 374) 1553 341.7 6.6e-94
CCDS64577.1 ADAP1 gene_id:11033|Hs108|chr7 ( 385) 1467 323.3 2.3e-88
CCDS64576.1 ADAP1 gene_id:11033|Hs108|chr7 ( 302) 1206 267.4 1.2e-71
CCDS75558.1 ADAP1 gene_id:11033|Hs108|chr7 ( 279) 1098 244.3 1e-64
CCDS451.1 SMAP2 gene_id:64744|Hs108|chr1 ( 429) 333 80.8 2.5e-15
CCDS64459.1 SMAP1 gene_id:60682|Hs108|chr6 ( 436) 325 79.1 8.4e-15
CCDS4973.1 SMAP1 gene_id:60682|Hs108|chr6 ( 440) 325 79.1 8.5e-15
CCDS43478.1 SMAP1 gene_id:60682|Hs108|chr6 ( 467) 314 76.8 4.5e-14
CCDS64802.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 ( 580) 303 74.5 2.7e-13
CCDS43681.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 ( 911) 303 74.6 3.9e-13
CCDS11101.1 ACAP1 gene_id:9744|Hs108|chr17 ( 740) 298 73.5 7e-13
CCDS2514.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 ( 804) 298 73.5 7.4e-13
CCDS33408.1 AGAP1 gene_id:116987|Hs108|chr2 ( 857) 298 73.5 7.8e-13
CCDS33924.1 ACAP2 gene_id:23527|Hs108|chr3 ( 778) 290 71.8 2.4e-12
CCDS19.2 ACAP3 gene_id:116983|Hs108|chr1 ( 834) 288 71.4 3.4e-12
CCDS55592.1 SMAP2 gene_id:64744|Hs108|chr1 ( 399) 280 69.4 6.2e-12
CCDS72763.1 SMAP2 gene_id:64744|Hs108|chr1 ( 424) 280 69.5 6.5e-12
CCDS8951.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12 ( 836) 280 69.7 1.1e-11
CCDS44932.1 AGAP2 gene_id:116986|Hs108|chr12 (1192) 280 69.8 1.5e-11
CCDS73125.1 AGAP9 gene_id:642517|Hs108|chr10 ( 658) 275 68.5 1.9e-11
CCDS7215.1 AGAP4 gene_id:119016|Hs108|chr10 ( 663) 269 67.2 4.7e-11
CCDS44397.1 AGAP6 gene_id:414189|Hs108|chr10 ( 686) 269 67.3 4.8e-11
>>CCDS11261.1 ADAP2 gene_id:55803|Hs108|chr17 (381 aa)
initn: 1852 init1: 1852 opt: 2603 Z-score: 3012.9 bits: 566.2 E(32554): 1.7e-161
Smith-Waterman score: 2603; 99.7% identity (99.7% similar) in 381 aa overlap (1-380:1-381)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGDRERNKKRLLELLRAPDTGNAHCADCGAADPDWASYKLGIFICLNCCGVHRNFPDISR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MGDRERNKKRLLELLRAPDTGNAHCADCGAADPDWASYKLGIFICLNCCGVHRNFPDISR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VKSVRLDFWDDSIVEFMIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCLVLKEQWIRAKYERR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VKSVRLDFWDDSIVEFMIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCLVLKEQWIRAKYERR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 EFMADGETISLPGNREGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKYFTKEQGKSPKAVISI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EFMADGETISLPGNREGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKYFTKEQGKSPKAVISI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 KDLNATFQTEKIGHPHGLQITYRRDGHTRNLFVYHESGKEIVDWFNALRAARLQYLKMAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KDLNATFQTEKIGHPHGLQITYRRDGHTRNLFVYHESGKEIVDWFNALRAARLQYLKMAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KE3 PELPESELVPFLTRNYLKQGFMEKTGPK-KEPFKKRWFALDCHERRLLYYKNPLDAFEQG
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PELPESELVPFLTRNYLKQGFMEKTGPKQKEPFKKRWFALDCHERRLLYYKNPLDAFEQG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 QVFLGNKEQGYEAYEDLPKGIRGNRWKAGLTIVTPERRFVLTCPSEKEQQEWLESLRGVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QVFLGNKEQGYEAYEDLPKGIRGNRWKAGLTIVTPERRFVLTCPSEKEQQEWLESLRGVL
310 320 330 340 350 360
360 370 380
pF1KE3 SSPLTPLNRLTASTESGRSSR
:::::::::::::::::::::
CCDS11 SSPLTPLNRLTASTESGRSSR
370 380
>>CCDS5318.1 ADAP1 gene_id:11033|Hs108|chr7 (374 aa)
initn: 1336 init1: 673 opt: 1553 Z-score: 1799.5 bits: 341.7 E(32554): 6.6e-94
Smith-Waterman score: 1553; 58.5% identity (84.1% similar) in 364 aa overlap (4-365:3-361)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGDRERNKKRLLELLRAPDTGNAHCADCGAADPDWASYKLGIFICLNCCGVHRNFPDISR
.:: .. .::::. : :::.:::::: ::::::: ::.::::.: :.:::.:..:.
CCDS53 MAKER-RRAVLELLQRP--GNARCADCGAPDPDWASYTLGVFICLSCSGIHRNIPQVSK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VKSVRLDFWDDSIVEFMIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCLVLKEQWIRAKYERR
::::::: :... :::: .:: ..:.::..::.::: : .:: .:.::::::::::.
CCDS53 VKSVRLDAWEEAQVEFMASHGNDAARARFESKVPSFYYRPTPSDCQLLREQWIRAKYERQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE3 EFM-ADGETISLPGNREGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKYFTKEQGKSPKAVIS
::. . . : ::::::::::::.::: ::::: ::: ::::.....: ::::..
CCDS53 EFIYPEKQEPYSAGYREGFLWKRGRDNGQFLSRKFVLTEREGALKYFNRNDAKEPKAVMK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 IKDLNATFQTEKIGHPHGLQITYRRDGHTRNLFVYHESGKEIVDWFNALRAARLQYLKMA
:. :::::: :::::::::.:: .:. :::.:.:::.:::::::::::::::..::..:
CCDS53 IEHLNATFQPAKIGHPHGLQVTYLKDNSTRNIFIYHEDGKEIVDWFNALRAARFHYLQVA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 FPELPESELVPFLTRNYLKQGFMEKTGPKK-EPFKKRWFALDCHERRLLYYKNPLDAFEQ
:: ...::: :.:::::.:.:::::::. : :.::::..: .:::.:.:.::::: .
CCDS53 FPGAGDADLVPKLSRNYLKEGYMEKTGPKQTEGFRKRWFTMD--DRRLMYFKDPLDAFAR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 GQVFLGNKEQGYEAYEDLPKGIRGNRWKAGLTIVTPERRFVLTCPSEKEQQEWLESLRGV
:.::.:.::.:: . . .: . .:..: :.:::::.:.:...: .:..:.::. ... .
CCDS53 GEVFIGSKESGYTVLHGFPPSTQGHHWPHGITIVTPDRKFLFACETESDQREWVAAFQKA
300 310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KE3 LSSPLTPLNRLTASTESGRSSR
.. :. :
CCDS53 VDRPMLPQEYAVEAHFKHKP
360 370
>>CCDS64577.1 ADAP1 gene_id:11033|Hs108|chr7 (385 aa)
initn: 1265 init1: 673 opt: 1467 Z-score: 1699.9 bits: 323.3 E(32554): 2.3e-88
Smith-Waterman score: 1467; 57.9% identity (83.3% similar) in 347 aa overlap (25-365:28-372)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MGDRERNKKRLLELLRAPDTGNAHCADCGAA----DPDWASYKLGIFICLNCCGVHR
::. : : ::::::: ::.::::.: :.::
CCDS64 MFQFVFSRVYCINPARRKWKEFEKMLGCAEEGHASLGRDPDWASYTLGVFICLSCSGIHR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 NFPDISRVKSVRLDFWDDSIVEFMIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCLVLKEQWI
:.:..:.::::::: :... :::: .:: ..:.::..::.::: : .:: .:.::::
CCDS64 NIPQVSKVKSVRLDAWEEAQVEFMASHGNDAARARFESKVPSFYYRPTPSDCQLLREQWI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 RAKYERREFM-ADGETISLPGNREGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKYFTKEQGK
::::::.::. . . : ::::::::::::.::: ::::: ::: ::::.....:
CCDS64 RAKYERQEFIYPEKQEPYSAGYREGFLWKRGRDNGQFLSRKFVLTEREGALKYFNRNDAK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 SPKAVISIKDLNATFQTEKIGHPHGLQITYRRDGHTRNLFVYHESGKEIVDWFNALRAAR
::::..:. :::::: :::::::::.:: .:. :::.:.:::.:::::::::::::::
CCDS64 EPKAVMKIEHLNATFQPAKIGHPHGLQVTYLKDNSTRNIFIYHEDGKEIVDWFNALRAAR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 LQYLKMAFPELPESELVPFLTRNYLKQGFMEKTGPKK-EPFKKRWFALDCHERRLLYYKN
..::..::: ...::: :.:::::.:.:::::::. : :.::::..: .:::.:.:.
CCDS64 FHYLQVAFPGAGDADLVPKLSRNYLKEGYMEKTGPKQTEGFRKRWFTMD--DRRLMYFKD
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 PLDAFEQGQVFLGNKEQGYEAYEDLPKGIRGNRWKAGLTIVTPERRFVLTCPSEKEQQEW
::::: .:.::.:.::.:: . . .: . .:..: :.:::::.:.:...: .:..:.::
CCDS64 PLDAFARGEVFIGSKESGYTVLHGFPPSTQGHHWPHGITIVTPDRKFLFACETESDQREW
300 310 320 330 340 350
360 370 380
pF1KE3 LESLRGVLSSPLTPLNRLTASTESGRSSR
. ... ... :. :
CCDS64 VAAFQKAVDRPMLPQEYAVEAHFKHKP
360 370 380
>>CCDS64576.1 ADAP1 gene_id:11033|Hs108|chr7 (302 aa)
initn: 1008 init1: 673 opt: 1206 Z-score: 1399.7 bits: 267.4 E(32554): 1.2e-71
Smith-Waterman score: 1206; 57.0% identity (83.5% similar) in 291 aa overlap (77-365:1-289)
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 NCCGVHRNFPDISRVKSVRLDFWDDSIVEFMIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCL
: .:: ..:.::..::.::: : .::
CCDS64 MASHGNDAARARFESKVPSFYYRPTPSDCQ
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 VLKEQWIRAKYERREFM-ADGETISLPGNREGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKY
.:.::::::::::.::. . . : ::::::::::::.::: ::::: ::: :::
CCDS64 LLREQWIRAKYERQEFIYPEKQEPYSAGYREGFLWKRGRDNGQFLSRKFVLTEREGALKY
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 FTKEQGKSPKAVISIKDLNATFQTEKIGHPHGLQITYRRDGHTRNLFVYHESGKEIVDWF
:.....: ::::..:. :::::: :::::::::.:: .:. :::.:.:::.::::::::
CCDS64 FNRNDAKEPKAVMKIEHLNATFQPAKIGHPHGLQVTYLKDNSTRNIFIYHEDGKEIVDWF
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 NALRAARLQYLKMAFPELPESELVPFLTRNYLKQGFMEKTGPKK-EPFKKRWFALDCHER
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CCDS64 NALRAARFHYLQVAFPGAGDADLVPKLSRNYLKEGYMEKTGPKQTEGFRKRWFTMD--DR
160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 RLLYYKNPLDAFEQGQVFLGNKEQGYEAYEDLPKGIRGNRWKAGLTIVTPERRFVLTCPS
::.:.:.::::: .:.::.:.::.:: . . .: . .:..: :.:::::.:.:...: .
CCDS64 RLMYFKDPLDAFARGEVFIGSKESGYTVLHGFPPSTQGHHWPHGITIVTPDRKFLFACET
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380
pF1KE3 EKEQQEWLESLRGVLSSPLTPLNRLTASTESGRSSR
:..:.::. ... ... :. :
CCDS64 ESDQREWVAAFQKAVDRPMLPQEYAVEAHFKHKP
270 280 290 300
>>CCDS75558.1 ADAP1 gene_id:11033|Hs108|chr7 (279 aa)
initn: 998 init1: 673 opt: 1098 Z-score: 1275.4 bits: 244.3 E(32554): 1e-64
Smith-Waterman score: 1098; 58.2% identity (84.7% similar) in 261 aa overlap (107-365:8-266)
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 MIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCLVLKEQWIRAKYERREFM-ADGETISLPGNR
.:.::::::::::.::. . . : :
CCDS75 MVLASLELLREQWIRAKYERQEFIYPEKQEPYSAGYR
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 EGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKYFTKEQGKSPKAVISIKDLNATFQTEKIGHP
:::::::::::.::: ::::: ::: ::::.....: ::::..:. :::::: :::::
CCDS75 EGFLWKRGRDNGQFLSRKFVLTEREGALKYFNRNDAKEPKAVMKIEHLNATFQPAKIGHP
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 HGLQITYRRDGHTRNLFVYHESGKEIVDWFNALRAARLQYLKMAFPELPESELVPFLTRN
::::.:: .:. :::.:.:::.:::::::::::::::..::..::: ...::: :.::
CCDS75 HGLQVTYLKDNSTRNIFIYHEDGKEIVDWFNALRAARFHYLQVAFPGAGDADLVPKLSRN
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 YLKQGFMEKTGPKK-EPFKKRWFALDCHERRLLYYKNPLDAFEQGQVFLGNKEQGYEAYE
:::.:.:::::::. : :.::::..: .:::.:.:.::::: .:.::.:.::.:: . .
CCDS75 YLKEGYMEKTGPKQTEGFRKRWFTMD--DRRLMYFKDPLDAFARGEVFIGSKESGYTVLH
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 DLPKGIRGNRWKAGLTIVTPERRFVLTCPSEKEQQEWLESLRGVLSSPLTPLNRLTASTE
.: . .:..: :.:::::.:.:...: .:..:.::. ... ... :. :
CCDS75 GFPPSTQGHHWPHGITIVTPDRKFLFACETESDQREWVAAFQKAVDRPMLPQEYAVEAHF
220 230 240 250 260 270
380
pF1KE3 SGRSSR
CCDS75 KHKP
>>CCDS451.1 SMAP2 gene_id:64744|Hs108|chr1 (429 aa)
initn: 314 init1: 166 opt: 333 Z-score: 388.6 bits: 80.8 E(32554): 2.5e-15
Smith-Waterman score: 333; 33.0% identity (57.3% similar) in 185 aa overlap (3-183:8-187)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MGDRERNKKRLLELLRAPDTGNAHCADCGAADPDWASYKLGIFICLNCCGVHRNF
: .: . : .:: : : :::: . : :::...:.:::. : :.:::.
CCDS45 MTGKSVKDVDRYQAVLANLLLEED--NKFCADCQSKGPRWASWNIGVFICIRCAGIHRNL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 P-DISRVKSVRLDFWDDSIVEFMIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCLVLKEQWIR
::::::: :: : . .. : . :: ... .:: .: . :: . . : .::
CCDS45 GVHISRVKSVNLDQWTQEQIQCMQEMGNGKANRLYEAYLPETFRRPQIDPAV---EGFIR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 AKYERREFMADGETISLPGNREGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKYFTKEQ---G
:::....: . :. ... :::: . . . :.. . . . :
CCDS45 DKYEKKKYMDRSLDINAFRKEKDDKWKRGSEPVPEKKLEPVVFEKVKMPQKKEDPQLPRK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 KSPKAVISIKDLNATFQTEKIGHPHGLQITYRRDGHTRNLFVYHESGKEIVDWFNALRAA
.:::.. . ::
CCDS45 SSPKSTAPVMDLLGLDAPVACSIANSKTSNTLEKDLDLLASVPSPSSSGSRKVVGSMPTA
180 190 200 210 220 230
>>CCDS64459.1 SMAP1 gene_id:60682|Hs108|chr6 (436 aa)
initn: 297 init1: 172 opt: 325 Z-score: 379.2 bits: 79.1 E(32554): 8.4e-15
Smith-Waterman score: 325; 36.0% identity (59.6% similar) in 178 aa overlap (5-181:15-182)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MGDRERNKKRLLELLRAPDTGNAHCADCGAADPDWASYKLGIFICLNCCG
:... : .::: : : .:::: : : :::...:.:::. : :
CCDS64 MATRSCREKAQKLNEQHQLILSKLLREED--NKYCADCEAKGPRWASWNIGVFICIRCAG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE3 VHRNFP-DISRVKSVRLDFWDDSIVEFMIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCLVLK
.:::. ::::::: :: : .. : :: ... .:: .: . ::... .
CCDS64 IHRNLGVHISRVKSVNLDQWTAEQIQCMQDMGNTKARLLYEANLPENFRRPQTDQAV---
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 EQWIRAKYERREFMADGETISLPGNREGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKYFTKE
: .:: :::..... : ..:.. :.: :. . . .. :. : : : :.
CCDS64 EFFIRDKYEKKKYY-DKNAIAIT-NKEKEKKKEEKKREKEPEKPAKPLTAEKLQK---KD
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 QGKSPKAVISIKDLNATFQTEKIGHPHGLQITYRRDGHTRNLFVYHESGKEIVDWFNALR
: :: : :
CCDS64 QQLEPKKSTSPKKAAEPTVDLLGLDGPAVAPVTNGNTTVPPLNDDLDIFGPMISNPLPAT
180 190 200 210 220 230
>>CCDS4973.1 SMAP1 gene_id:60682|Hs108|chr6 (440 aa)
initn: 297 init1: 172 opt: 325 Z-score: 379.2 bits: 79.1 E(32554): 8.5e-15
Smith-Waterman score: 325; 36.0% identity (59.6% similar) in 178 aa overlap (5-181:15-182)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MGDRERNKKRLLELLRAPDTGNAHCADCGAADPDWASYKLGIFICLNCCG
:... : .::: : : .:::: : : :::...:.:::. : :
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10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
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.:::. ::::::: :: : .. : :: ... .:: .: . ::... .
CCDS49 IHRNLGVHISRVKSVNLDQWTAEQIQCMQDMGNTKARLLYEANLPENFRRPQTDQAV---
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110 120 130 140 150 160
pF1KE3 EQWIRAKYERREFMADGETISLPGNREGFLWKRGRDNSQFLRRKFVLLAREGLLKYFTKE
: .:: :::..... : ..:.. :.: :. . . .. :. : : : :.
CCDS49 EFFIRDKYEKKKYY-DKNAIAIT-NKEKEKKKEEKKREKEPEKPAKPLTAEKLQK---KD
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170 180 190 200 210 220
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: :: : :
CCDS49 QQLEPKKSTSPKKAAEPTVDLLGLDGPAVAPVTNGNTTVPPLNDDLDIFGPMISNPLPAT
180 190 200 210 220 230
>>CCDS43478.1 SMAP1 gene_id:60682|Hs108|chr6 (467 aa)
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Smith-Waterman score: 314; 39.8% identity (66.4% similar) in 128 aa overlap (5-131:15-136)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MGDRERNKKRLLELLRAPDTGNAHCADCGAADPDWASYKLGIFICLNCCG
:... : .::: : : .:::: : : :::...:.:::. : :
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60 70 80 90 100
pF1KE3 VHRNFP-DISRVKSVRLDFWDDSIVEFMIHNGNLRVKAKFEARVPAFYYIPQANDCLVLK
.:::. ::::::: :: : .. : :: ... .:: .: . ::... .
CCDS43 IHRNLGVHISRVKSVNLDQWTAEQIQCMQDMGNTKARLLYEANLPENFRRPQTDQAV---
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110 120 130 140 150 160
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: .:: :::..... : ..:..
CCDS43 EFFIRDKYEKKKYY-DKNAIAITNISSSDAPLQPLVSSPSLQAAVDKNKLEKEKEKKKEE
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>>CCDS64802.1 AGAP3 gene_id:116988|Hs108|chr7 (580 aa)
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Smith-Waterman score: 303; 38.9% identity (65.5% similar) in 113 aa overlap (21-132:342-453)
10 20 30 40 50
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::. : :: : .::::: .:: ..:..: :
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.::.. .:::.:. :: : .. : :: ... .:. . . : : . : :
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:.:::::::.. :.: . ..:
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]