Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3972
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3972, 436 aa
1>>>pF1KE3972 436 - 436 aa - 436 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6169+/-0.000898; mu= 15.8235+/- 0.054
mean_var=79.4083+/-16.035, 0's: 0 Z-trim(107.3): 63 B-trim: 46 in 1/47
Lambda= 0.143927
statistics sampled from 9439 (9501) to 9439 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16
Scan time: 2.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32640.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 ( 436) 2974 627.3 9e-180
CCDS2658.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 ( 423) 2372 502.3 3.7e-142
CCDS54116.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 ( 404) 1935 411.5 7.5e-115
CCDS54560.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 ( 355) 1215 262.0 6.8e-70
CCDS47678.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 ( 690) 576 129.5 1e-29
CCDS64129.1 FBXL7 gene_id:23194|Hs108|chr5 ( 444) 520 117.8 2.3e-26
CCDS54833.1 FBXL7 gene_id:23194|Hs108|chr5 ( 491) 520 117.8 2.4e-26
CCDS5726.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 ( 735) 454 104.2 4.5e-22
CCDS10421.1 FBXL16 gene_id:146330|Hs108|chr16 ( 479) 445 102.2 1.2e-21
CCDS75649.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 ( 707) 410 95.0 2.5e-19
CCDS54886.1 FBXL17 gene_id:64839|Hs108|chr5 ( 701) 331 78.6 2.1e-14
CCDS8509.1 FBXL14 gene_id:144699|Hs108|chr12 ( 418) 319 76.0 7.9e-14
CCDS44858.1 AMN1 gene_id:196394|Hs108|chr12 ( 258) 299 71.7 9.5e-13
CCDS61089.1 AMN1 gene_id:196394|Hs108|chr12 ( 240) 298 71.5 1e-12
CCDS5041.1 FBXL4 gene_id:26235|Hs108|chr6 ( 621) 273 66.6 8.1e-11
>>CCDS32640.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 (436 aa)
initn: 2974 init1: 2974 opt: 2974 Z-score: 3340.9 bits: 627.3 E(32554): 9e-180
Smith-Waterman score: 2974; 100.0% identity (100.0% similar) in 436 aa overlap (1-436:1-436)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSLKALSEGCPLLEQLNISWCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSLKALSEGCPLLEQLNISWCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 QVTKDGIQALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQITDEGLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QVTKDGIQALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQITDEGLI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 TICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCHE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 LDNCPLITDASLEHLKSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LDNCPLITDASLEHLKSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPP
370 380 390 400 410 420
430
pF1KE3 SVGGSRQRFCRCCIIL
::::::::::::::::
CCDS32 SVGGSRQRFCRCCIIL
430
>>CCDS2658.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 (423 aa)
initn: 2372 init1: 2372 opt: 2372 Z-score: 2665.6 bits: 502.3 E(32554): 3.7e-142
Smith-Waterman score: 2372; 78.2% identity (94.5% similar) in 422 aa overlap (15-436:2-423)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLAL
.:::.::..::::::::::::::::::.::::::::.:.:::.:::
CCDS26 MVFSNNDEGLINKKLPKELLLRIFSFLDIVTLCRCAQISKAWNILAL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIE
:::::::::::.:: :.::::::::::::::::::::::::.::::..:.::::::::::
CCDS26 DGSNWQRIDLFNFQTDVEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCIGVGDSSLKTFAQNCRNIE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSLKALSEGCPLLEQLNISWCD
:::::::: ::.:: :::.:::::.::::.::.:::: :::..:::: :: ::.::::
CCDS26 HLNLNGCTKITDSTCYSLSRFCSKLKHLDLTSCVSITNSSLKGISEGCRNLEYLNLSWCD
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 QVTKDGIQALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQITDEGLI
:.:::::.:::::: :::::.:.:::::::::::.: .: :::.::::.: .:::::..
CCDS26 QITKDGIEALVRGCRGLKALLLRGCTQLEDEALKHIQNYCHELVSLNLQSCSRITDEGVV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 TICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCHE
::::::.::.:: :::::.::: :.::: :::::.:::.::::.:::.::: :::::::
CCDS26 QICRGCHRLQALCLSGCSNLTDASLTALGLNCPRLQILEAARCSHLTDAGFTLLARNCHE
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIE
:::::::::. ::::::::::::::.::.:::::::::::::: ::.:..:.:..:.:.:
CCDS26 LEKMDLEECILITDSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDDGILHLSNSTCGHERLRVLE
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 LDNCPLITDASLEHLKSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPP
:::: ::::..::::..:..:::.:::::::.:::::::.:..::..::::::::::::
CCDS26 LDNCLLITDVALEHLENCRGLERLELYDCQQVTRAGIKRMRAQLPHVKVHAYFAPVTPPT
350 360 370 380 390 400
430
pF1KE3 SVGGSRQRFCRCCIIL
.:.:: ::.::::.::
CCDS26 AVAGSGQRLCRCCVIL
410 420
>>CCDS54116.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 (404 aa)
initn: 1880 init1: 1880 opt: 1935 Z-score: 2175.5 bits: 411.5 E(32554): 7.5e-115
Smith-Waterman score: 2696; 92.7% identity (92.7% similar) in 436 aa overlap (1-436:1-404)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSLKALSEGCPLLEQLNISWCD
::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS54 VLNLNGCTKTTDA--------------------------------EGCPLLEQLNISWCD
130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 QVTKDGIQALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQITDEGLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QVTKDGIQALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQITDEGLI
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 TICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCHE
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIE
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 LDNCPLITDASLEHLKSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LDNCPLITDASLEHLKSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPP
330 340 350 360 370 380
430
pF1KE3 SVGGSRQRFCRCCIIL
::::::::::::::::
CCDS54 SVGGSRQRFCRCCIIL
390 400
>>CCDS54560.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 (355 aa)
initn: 1340 init1: 1215 opt: 1215 Z-score: 1368.3 bits: 262.0 E(32554): 6.8e-70
Smith-Waterman score: 1863; 65.6% identity (79.6% similar) in 422 aa overlap (15-436:2-355)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLAL
.:::.::..::::::::::::::::::.::::::::.:.:::.:::
CCDS54 MVFSNNDEGLINKKLPKELLLRIFSFLDIVTLCRCAQISKAWNILAL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIE
:::::::::::.:: :.::::::::::::::::::::::::.::::..:.::::::::::
CCDS54 DGSNWQRIDLFNFQTDVEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCIGVGDSSLKTFAQNCRNIE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSLKALSEGCPLLEQLNISWCD
:::::::: ::.:: :::.:::::.:
CCDS54 HLNLNGCTKITDSTCYSLSRFCSKLKH---------------------------------
110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 QVTKDGIQALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQITDEGLI
: .: :::.::::.: .:::::..
CCDS54 -----------------------------------IQNYCHELVSLNLQSCSRITDEGVV
140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 TICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCHE
::::::.::.:: :::::.::: :.::: :::::.:::.::::.:::.::: :::::::
CCDS54 QICRGCHRLQALCLSGCSNLTDASLTALGLNCPRLQILEAARCSHLTDAGFTLLARNCHE
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIE
:::::::::. ::::::::::::::.::.:::::::::::::: ::.:..:.:..:.:.:
CCDS54 LEKMDLEECILITDSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDDGILHLSNSTCGHERLRVLE
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 LDNCPLITDASLEHLKSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPP
:::: ::::..::::..:..:::.:::::::.:::::::.:..::..::::::::::::
CCDS54 LDNCLLITDVALEHLENCRGLERLELYDCQQVTRAGIKRMRAQLPHVKVHAYFAPVTPPT
280 290 300 310 320 330
430
pF1KE3 SVGGSRQRFCRCCIIL
.:.:: ::.::::.::
CCDS54 AVAGSGQRLCRCCVIL
340 350
>>CCDS47678.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 (690 aa)
initn: 480 init1: 141 opt: 576 Z-score: 647.0 bits: 129.5 E(32554): 1e-29
Smith-Waterman score: 576; 29.8% identity (63.3% similar) in 373 aa overlap (28-397:158-523)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNV
::.. .:.:: .:.. . :.::..:: .
CCDS47 RAAAEESNFPERSSSEVFLVDETLKCDISLLPERAILQIFFYLSLKDVIICGQVNHAWML
130 140 150 160 170 180
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 LALDGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCR
.. .: :. ::. . . : . . . .: . .:..:::: . ...:. .. ::
CCDS47 MTQLNSLWNAIDFSSVKNVIPDKYIVSTLQRWRLNVLRLNFRGCL-LRPKTFRSVSH-CR
190 200 210 220 230 240
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 NIEVLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSLKALSEGCPLLEQLNIS
:.. ::.. : :: . .:. : . :.: : :.::: ... : . :..:...
CCDS47 NLQELNVSDCPTFTDESMRHISEGCPGVLCLNL-SNTTITNRTMRLLPRHFHNLQNLSLA
250 260 270 280 290 300
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 WCDQVTKDGIQALV--RGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQIT
.: . : :.: : :: : : :.::::. ....::. : .. :... .:
CCDS47 YCRRFTDKGLQYLNLGNGCHKLIYLDLSGCTQISVQGFRYIANSCTGIMHLTINDMPTLT
310 320 330 340 350 360
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 DEGLITICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLA
:. . .. . : .. :: .: .:.: . ::. : .:: .. ...::..: .
CCDS47 DNCVKALVEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSA-C-KLRKIRFEGNKRVTDASFKFID
370 380 390 400 410 420
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 RNCHELEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQ
.: .: .. . .: ::::.: .:: .: ::.:..: : : :.... .: : .
CCDS47 KNYPNLSHIYMADCKGITDSSLRSLS-PLKQLTVLNLANCVRIGDMGLKQFLDGP-ASMR
430 440 450 460 470 480
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 LEVIELDNCPLITDASLEHL-KSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFA
.. ..:.:: ..:::. .: . : .:. . : .:...: ::
CCDS47 IRELNLSNCVRLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIVNIFSLVSIDLSGT
490 500 510 520 530 540
420 430
pF1KE3 PVTPPPSVGGSRQRFCRCCIIL
CCDS47 DISNEGLNVLSRHKKLKELSVSECYRITDDGIQITDSAMEMLSAKCHYLHILDISGCVLL
550 560 570 580 590 600
>>CCDS64129.1 FBXL7 gene_id:23194|Hs108|chr5 (444 aa)
initn: 710 init1: 330 opt: 520 Z-score: 587.0 bits: 117.8 E(32554): 2.3e-26
Smith-Waterman score: 628; 29.6% identity (63.1% similar) in 385 aa overlap (12-378:55-434)
10 20 30 40
pF1KE3 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLD
:. ....: :.. :: . ...:::::
CCDS64 GSSTSSSSITGETVAMVHSPPPTRLTHPLIRLASRPQKEQASIDR-LPDHSMVQIFSFLP
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90
pF1KE3 VVTLCRCAQVSRAWNVLALDGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKR-CGG------FLR
. :::::.: : : :: : :. : : ... :... ...: : .:.
CCDS64 TNQLCRCARVCRRWYNLAWDPRLWRTIRLTGETINVD-RALKVLTRRLCQDTPNVCLMLE
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 KLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIEVLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCT
... :: . : .: :.:: : ... :...:: . .. . .. ..: .:.:::...:.
CCDS64 TVTVSGCRRLTDRGLYTIAQCCPELRRLEVSGCYNISNEAVFDVVSLCPNLEHLDVSGCS
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200
pF1KE3 SITNMSL--KALSEGCPLL-EQLNISWCDQ----VTKD-GIQALVRGCGGLKALFLKGCT
..: .:: .: . :: .:..: . :. : .: :..... : : :.:. :.
CCDS64 KVTCISLTREASIKLSPLHGKQISIRYLDMTDCFVLEDEGLHTIAAHCTQLTHLYLRRCV
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 QLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQITDEGLITICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILN
.: ::.:.:. .: . :... : ..: :: : . .:. : . :. .::. .
CCDS64 RLTDEGLRYLVIYCASIKELSVSDCRFVSDFGLREIAKLESRLRYLSIAHCGRVTDVGIR
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 ALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCHELEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPR
... : .:: :.. : .:: : ::.:: .:...:. .: ..:. : :...:
CCDS64 YVAKYCSKLRYLNARGCEGITDHGVEYLAKNCTKLKSLDIGKCPLVSDTGLECLALNCFN
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 LQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIELDNCPLITDA---SLEHLKSCHSLER
:. :::. :: :: .:.. .. . : .:.......: . ..: .: : :
CCDS64 LKRLSLKSCESITGQGLQIVAAN-CF--DLQTLNVQDCEVSVEALRFVKRHCKRCVIEHT
390 400 410 420 430
390 400 410 420 430
pF1KE3 IELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPPSVGGSRQRFCRCCIIL
CCDS64 NPAFF
440
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10 20 30 40
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:. ....: :.. :: . ...:::::
CCDS54 GSSTSSSSITGETVAMVHSPPPTRLTHPLIRLASRPQKEQASIDR-LPDHSMVQIFSFLP
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50 60 70 80 90
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. :::::.: : : :: : :. : : ... :... ...: : .:.
CCDS54 TNQLCRCARVCRRWYNLAWDPRLWRTIRLTGETINVD-RALKVLTRRLCQDTPNVCLMLE
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100 110 120 130 140 150
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... :: . : .: :.:: : ... :...:: . .. . .. ..: .:.:::...:.
CCDS54 TVTVSGCRRLTDRGLYTIAQCCPELRRLEVSGCYNISNEAVFDVVSLCPNLEHLDVSGCS
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160 170 180 190 200
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..: .:: .: . :: .:..: . :. : .: :..... : : :.:. :.
CCDS54 KVTCISLTREASIKLSPLHGKQISIRYLDMTDCFVLEDEGLHTIAAHCTQLTHLYLRRCV
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210 220 230 240 250 260
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.: ::.:.:. .: . :... : ..: :: : . .:. : . :. .::. .
CCDS54 RLTDEGLRYLVIYCASIKELSVSDCRFVSDFGLREIAKLESRLRYLSIAHCGRVTDVGIR
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270 280 290 300 310 320
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... : .:: :.. : .:: : ::.:: .:...:. .: ..:. : :...:
CCDS54 YVAKYCSKLRYLNARGCEGITDHGVEYLAKNCTKLKSLDIGKCPLVSDTGLECLALNCFN
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330 340 350 360 370 380
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:. :::. :: :: .:.. .. . : .:.......: . ..: .: : :
CCDS54 LKRLSLKSCESITGQGLQIVAAN-CF--DLQTLNVQDCEVSVEALRFVKRHCKRCVIEHT
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390 400 410 420 430
pF1KE3 IELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPPSVGGSRQRFCRCCIIL
CCDS54 NPAFF
490
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10 20 30 40 50 60
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.:: : :.:.: ... .: . .. ..
CCDS57 LQNLSLAYCRRFTDKGLQYLNLGNGCHKLIYLD---LSGCTQISVQGFRYIANSCTGIMH
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CCDS57 LTINDMPT-LTDNCVKALVEKCSR-ITSLVFTGAPHISDCTFRALSA-CK-LRKIRFEGN
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pF1KE3 TKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSLKALSEGCPL--LEQLNISWCDQVTKD
..:::. ..: .: :. .:.: .::. ::..:: :: : ::.. : ..
CCDS57 KRVTDASFKFIDKNYPNLSHIYMADCKGITDSSLRSLS---PLKQLTVLNLANCVRIGDM
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pF1KE3 GIQALVRGCGGLKA--LFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQITDEGLITIC
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CCDS57 GLKQFLDGPASMRIRELNLSNCVRLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIV
470 480 490 500 510 520
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pF1KE3 RGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCHELEK
. .: :. :: ..:.. ::.:... .:. : :..: ..:: :. .. .. ::.
CCDS57 -NIFSLVSIDLSG-TDISNEGLNVLSRH-KKLKELSVSECYRITDDGIQAFCKSSLILEH
530 540 550 560 570 580
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pF1KE3 MDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIELDN
.:. : :..: . :.:.: : ::.. : :::.... : .. : . :.......
CCDS57 LDVSYCSQLSDMIIKALAIYCINLTSLSIAGCPKITDSAMEML-SAKCHY--LHILDISG
590 600 610 620 630 640
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pF1KE3 CPLITDASLEHLK-SCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPPSV
: :.:: :: :. .:..:. ... : .:.. . .:. ... . . . ::
CCDS57 CVLLTDQILEDLQIGCKQLRILKMQYCTNISKKAAQRMSSKVQQQE----YNTNDPPRWF
650 660 670 680 690
430
pF1KE3 GGSRQRFCRCCIIL
: .:.
CCDS57 GYDREGNPVTELDNITSSKGALELTVKKSTYSSEDQAA
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pF1KE3 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLA
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CCDS10 LAGGPCTPAGGPASALAPGHPAERPPLATDEKILNGLFWYFSACEKCVLAQVCKAWRRVL
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. . : . ... . :. . :. . :. .. :: :: ::.: . : .
CCDS10 YQPKFWAGLTPVLHAKELYN-VLPGGEKEFVN-LQGFAARGFEGFCLVGVSDLDICEFID
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120 130 140 150 160 170
pF1KE3 NC----RNIEVLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSLKALSEGCPL
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CCDS10 NYALSKKGVKAMSLKRSTITDAGLEVMLEQMQGVVR-LELSGCNDFTEAGL--WSSLSAR
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CCDS10 ITSLSVSDCINVADDAIAAISQLLPNLAELSLQA-YHVTDTALAYFTARQGHSTHTLRLL
250 260 270 280 290 300
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CCDS10 SCWEITNHGVVNVVHSLPNLTALSLSGCSKVTDDGVELVAENLRKLRSLDLSWCPRITDM
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CCDS10 ALEYVACDLHRLEELVLDRCVRITDTGLSYLSTMSS-LRSLYLRWCCQVQDFGLKHL---
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CCDS10 -LALGSLRLLSLAGCPLLTTTGLSGLVQLQELEELELTNCPGATPELFKYFSQHLPRCLV
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CCDS10 IE
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30 40 50 60 70 80
pF1KE3 AVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLALDGSNWQRIDLFDFQRDIE-GR
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CCDS75 CPTFTDESMRHISEGCPGVLCLNLSNTTITNRTMRLLPRHFHNLQNLSLAYCRRFTDKGL
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CCDS75 QYLNLGNGCHKLIY-LDLSGCTQISVQGFRYIANSCTGIMHLTINDMPTLTDNCVKALVE
320 330 340 350 360 370
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pF1KE3 FCSKLRHLDLASCTSITNMSLKALSEGCPLLEQLNISWCDQVTKDGIQALVRGCGGLKAL
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CCDS75 KCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALS-ACKL-RKIRFEGNKRVTDASFKFIDKNYPNLSHI
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CCDS75 YMADCKGITDSSLRSLSP-LKQLTVLNLANCVRIGDMGLKQFLDGPASMRIRELNLSNCV
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CCDS75 RLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIVNIFSLVSIDLSGTDISNEAFCKS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]