FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3954, 616 aa
1>>>pF1KE3954 616 - 616 aa - 616 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2644+/-0.000443; mu= 19.6519+/- 0.027
mean_var=94.8038+/-21.626, 0's: 0 Z-trim(110.3): 367 B-trim: 912 in 1/48
Lambda= 0.131723
statistics sampled from 18207 (18635) to 18207 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.573), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16
Scan time: 10.390
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_061335 (OMIM: 611201) kelch-like protein 9 [Hom ( 617) 1483 293.2 1.7e-78
NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 613) 1462 289.2 2.8e-77
NP_001161773 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 1462 289.2 2.8e-77
NP_001161774 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 1462 289.2 2.8e-77
XP_016885439 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 639) 1462 289.2 2.8e-77
NP_001161772 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 649) 1462 289.3 2.9e-77
XP_011529713 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 655) 1462 289.3 2.9e-77
NP_277030 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 iso ( 655) 1462 289.3 2.9e-77
NP_001161771 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 658) 1462 289.3 2.9e-77
XP_011529711 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 1462 289.3 2.9e-77
XP_011529712 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 1462 289.3 2.9e-77
XP_005249164 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 1089 218.4 6.2e-56
XP_016866347 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 1089 218.4 6.2e-56
NP_001003760 (OMIM: 610749) kelch-like protein 31 ( 634) 1089 218.4 6.2e-56
NP_065856 (OMIM: 613772) kelch-like protein 14 [Ho ( 628) 813 165.9 3.8e-40
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 787 160.9 1.1e-38
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 787 160.9 1.1e-38
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 779 159.4 3e-38
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 761 156.0 3.6e-37
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 742 152.4 4.1e-36
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 735 151.0 1e-35
NP_001154994 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 505) 717 147.6 1e-34
XP_016863165 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 505) 717 147.6 1e-34
XP_006724581 (OMIM: 300980,300982) PREDICTED: kelc ( 604) 713 146.9 1.9e-34
NP_085127 (OMIM: 300980,300982) kelch-like protein ( 604) 713 146.9 1.9e-34
NP_005888 (OMIM: 147485) actin-binding protein IPP ( 584) 710 146.3 2.8e-34
XP_016863164 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 415) 695 143.3 1.6e-33
NP_001138821 (OMIM: 147485) actin-binding protein ( 582) 694 143.3 2.3e-33
NP_001244124 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 505) 671 138.8 4.3e-32
NP_001317953 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 496) 670 138.6 4.8e-32
XP_011529878 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 496) 670 138.6 4.8e-32
NP_065854 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 isof ( 620) 654 135.7 4.6e-31
NP_001278932 (OMIM: 611967) kelch-like protein 8 i ( 620) 654 135.7 4.6e-31
XP_016856699 (OMIM: 147485) PREDICTED: actin-bindi ( 531) 645 133.9 1.4e-30
NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568) 623 129.8 2.6e-29
NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 606) 623 129.8 2.7e-29
XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 623) 623 129.8 2.8e-29
NP_001317952 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 427) 592 123.7 1.3e-27
XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 576 120.7 1.1e-26
XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 576 120.8 1.2e-26
NP_001316524 (OMIM: 608778,615081) kelch-like prot ( 608) 576 120.9 1.3e-26
NP_689680 (OMIM: 608778,615081) kelch-like protein ( 608) 576 120.9 1.3e-26
XP_006710686 (OMIM: 147485) PREDICTED: actin-bindi ( 440) 545 114.8 6.3e-25
XP_005270896 (OMIM: 147485) PREDICTED: actin-bindi ( 465) 545 114.8 6.5e-25
XP_011539696 (OMIM: 147485) PREDICTED: actin-bindi ( 465) 545 114.8 6.5e-25
NP_001243504 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 540 114.0 1.5e-24
NP_003624 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex pr ( 589) 540 114.0 1.5e-24
XP_011541998 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 540 114.0 1.5e-24
XP_011541999 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 540 114.0 1.5e-24
NP_001243503 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 540 114.0 1.5e-24
>>NP_061335 (OMIM: 611201) kelch-like protein 9 [Homo sa (617 aa)
initn: 1417 init1: 411 opt: 1483 Z-score: 1530.0 bits: 293.2 E(85289): 1.7e-78
Smith-Waterman score: 1483; 38.6% identity (71.5% similar) in 594 aa overlap (12-601:17-599)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MMEGSRQTRVSRPYKISESSKVYRWADHSSTVLQRLNEQRLRGLFCDVVLV-ADE
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NP_061 MKVSLGNGEMGVSAHLQPCKAG-TTRFFTSNTHSSVVLQGFDQLRIEGLLCDVTLVPGDG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 QRV-PAHRNLLAVCSDYFNSMFTIGMREAFQKEVELIGASYIGLKAVVDFLYGGELVLDG
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NP_061 DEIFPVHRAMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVNKVGLKKIIDFIYTAKLSLNM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 GNIDYVLETAHLLQIWTVVDFCCEYLEQEVSEDNYLYLQELASIYSLKRLDAFIDGFILN
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NP_061 DNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVSLDNCVEVGRIANTYNLIEVDKYVNNFILK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 HFGTLSFTPDFLQNVSMQKLCVYLSSSEVQRECEHDLLQAALQWLTQQPEREAHARQVLE
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NP_061 NFPALLSTGEFLK-LPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKAACRWLRLEDPRMDYAAKLMK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 NIHFPLIPKNDLLHRVKPAVCSLLPKEANCEGFIEEAVRYHNNLAAQPVMQTKRTALRTN
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NP_061 NIRFPLMTPQDLINYVQTV--DFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 QERLLFVGGEVSERCLELSDDTCYLDAKSEQWVKETPLPARRSHHCVAVLGGFIFIAGGS
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NP_061 STHLVTLGG-VLRQQLVVSKELRMYDERAQEWRSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQ
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 FSRDNGGDAASNLLYRYDPRCKQWIKVASMNQRRVDFYLASIEDMLVAIGGRNENGALSS
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NP_061 SNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGHLYAVGGRSAAGELAT
360 370 380 390 400 410
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pF1KE3 VETYSPKTDSWSYVAGLPRFTYGHAGTIYKDFVYISGG--HDYQIGPYRKNLLCYDHRTD
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NP_061 VECYNPRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYISGGITHD----TFQNELMCFDPDTD
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 VWEERRPMTTARGWHSMCSLGDSIYSIGGSDDNIESMERFDVLGVEAYSPQCNQWTRVAP
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NP_061 KWMQKAPMTTVRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTS-DYDDVLSCEYYSPTLDQWTPIAA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 LLHANSESGVAVWEGRIYILGGYSWENTAFSKTVQVYDREADKWSRGVDLPKAIAGGSAC
.:...:. ::::.:..::..:::::.: . . :: :: : :.: . :::....: ::
NP_061 MLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPEKDEWHKVFDLPESLGGIRAC
540 550 560 570 580 590
600 610
pF1KE3 VCALEPRPEDKKKKGKGKRHQDRGQ
. .. : ::.
NP_061 TLTVFP-PEENPGSPSRESPLSAPSDHS
600 610
>>NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isof (613 aa)
initn: 1387 init1: 417 opt: 1462 Z-score: 1508.5 bits: 289.2 E(85289): 2.8e-77
Smith-Waterman score: 1462; 38.1% identity (70.8% similar) in 586 aa overlap (20-601:24-599)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MMEGSRQTRVSRPYKISESSKVYRWADHSSTVLQRLNEQRLRGLFCDVVLVADE--
.... :::.::: ... ::.::.:::.:. .
NP_001 MKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTD
10 20 30 40 50 60
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pF1KE3 QRVPAHRNLLAVCSDYFNSMFTIGMREAFQKEVELIGASYIGLKAVVDFLYGGELVLDGG
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NP_001 DAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMD
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pF1KE3 NIDYVLETAHLLQIWTVVDFCCEYLEQEVSEDNYLYLQELASIYSLKRLDAFIDGFILNH
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NP_001 NLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKN
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pF1KE3 FGTLSFTPDFLQNVSMQKLCVYLSSSEVQRECEHDLLQAALQWLTQQPEREAHARQVLEN
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NP_001 FPALLSTGEFLK-LPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKN
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pF1KE3 IHFPLIPKNDLLHRVKPAVCSLLPKEANCEGFIEEAVRYHNNLAAQPVMQTKRTALRTNQ
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NP_001 IRFPLMTPQELINYVQTV--DFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDT
240 250 260 270 280 290
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pF1KE3 ERLLFVGGEVSERCLELSDDTCYLDAKSEQWVKETPLPARRSHHCVAVLGGFIFIAGGSF
.:. .:: : .. : .: . . : :...: . .:. : : .: .::.:.:....::.
NP_001 THLVTLGG-VLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQS
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pF1KE3 SRDNGGDAASNLLYRYDPRCKQWIKVASMNQRRVDFYLASIEDMLVAIGGRNENGALSSV
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NP_001 NYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTV
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pF1KE3 ETYSPKTDSWSYVAGLPRFTYGHAGTIYKDFVYISGG--HDYQIGPYRKNLLCYDHRTDV
: :.:.:. :.::: . . ::::::.: .::::: :: ..:.:.:.: ::
NP_001 ECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHD----TFQKELMCFDPDTDK
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pF1KE3 WEERRPMTTARGWHSMCSLGDSIYSIGGSDDNIESMERFDVLGVEAYSPQCNQWTRVAPL
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NP_001 WIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTS-DYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAAM
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pF1KE3 LHANSESGVAVWEGRIYILGGYSWENTAFSKTVQVYDREADKWSRGVDLPKAIAGGSACV
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NP_001 LRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVFDLPESLGGIRACT
540 550 560 570 580 590
600 610
pF1KE3 CALEPRPEDKKKKGKGKRHQDRGQ
.. : ::.
NP_001 LTVFP-PEETTPSPSRESPLSAP
600 610
>>NP_001161773 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isof (639 aa)
initn: 1387 init1: 417 opt: 1462 Z-score: 1508.3 bits: 289.2 E(85289): 2.8e-77
Smith-Waterman score: 1462; 38.1% identity (70.8% similar) in 586 aa overlap (20-601:50-625)
10 20 30 40
pF1KE3 MMEGSRQTRVSRPYKISESSKVYRWADHSSTVLQRLNEQRLRGLFCDVV
.... :::.::: ... ::.::.:::.
NP_001 VEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVT
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 LVADE--QRVPAHRNLLAVCSDYFNSMFTIGMREAFQKEVELIGASYIGLKAVVDFLYGG
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NP_001 LMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTA
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 ELVLDGGNIDYVLETAHLLQIWTVVDFCCEYLEQEVSEDNYLYLQELASIYSLKRLDAFI
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NP_001 KLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYV
140 150 160 170 180 190
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pF1KE3 DGFILNHFGTLSFTPDFLQNVSMQKLCVYLSSSEVQRECEHDLLQAALQWLTQQPEREAH
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NP_001 NSFVLKNFPALLSTGEFLK-LPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPRMDF
200 210 220 230 240 250
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pF1KE3 ARQVLENIHFPLIPKNDLLHRVKPAVCSLLPKEANCEGFIEEAVRYHNNLAAQPVMQTKR
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NP_001 AAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTV--DFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDR
260 270 280 290 300 310
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pF1KE3 TALRTNQERLLFVGGEVSERCLELSDDTCYLDAKSEQWVKETPLPARRSHHCVAVLGGFI
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NP_001 TAIRSDTTHLVTLGG-VLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFL
320 330 340 350 360 370
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pF1KE3 FIAGGSFSRDNGGDAASNLLYRYDPRCKQWIKVASMNQRRVDFYLASIEDMLVAIGGRNE
...::. . :. : .: . ..:.::: ..:..:::.:..:. :.:.... .: :.::::
NP_001 YVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNA
380 390 400 410 420 430
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 NGALSSVETYSPKTDSWSYVAGLPRFTYGHAGTIYKDFVYISGG--HDYQIGPYRKNLLC
: : .:: :.:.:. :.::: . . ::::::.: .::::: :: ..:.:.:
NP_001 AGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHD----TFQKELMC
440 450 460 470 480 490
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 YDHRTDVWEERRPMTTARGWHSMCSLGDSIYSIGGSDDNIESMERFDVLGVEAYSPQCNQ
.: :: : .. ::::.:: : ::..:. .: :::. : . :::. : ::: .:
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XP_011 WTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVFDLPESL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]