Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3945
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3945, 606 aa
1>>>pF1KE3945 606 - 606 aa - 606 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6533+/-0.000456; mu= 17.5552+/- 0.028
mean_var=91.2909+/-19.954, 0's: 0 Z-trim(110.2): 262 B-trim: 797 in 1/51
Lambda= 0.134233
statistics sampled from 18139 (18469) to 18139 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 10.060
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006054 (OMIM: 607701,615731) kelch-like protein ( 606) 4004 786.5 0
NP_689606 (OMIM: 615340,615348) kelch-like protein ( 621) 1328 268.3 5.5e-71
XP_016862147 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 673 141.5 8.5e-33
XP_016862143 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 673 141.5 8.5e-33
XP_016862144 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 673 141.5 8.5e-33
XP_016862145 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 673 141.5 8.5e-33
XP_016862139 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 673 141.5 8.5e-33
XP_016862140 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 673 141.5 8.5e-33
XP_016862141 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 673 141.5 8.5e-33
XP_016862142 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 673 141.5 8.5e-33
XP_016862146 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 625) 673 141.5 8.5e-33
XP_016867929 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 325) 503 108.3 4.2e-23
NP_001026880 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-li ( 586) 503 108.5 6.6e-23
NP_115894 (OMIM: 616607) kelch repeat and BTB doma ( 601) 503 108.5 6.7e-23
XP_016867930 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 303) 496 106.9 1e-22
XP_016867928 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 564) 496 107.1 1.6e-22
NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718) 495 107.0 2.2e-22
NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720) 495 107.0 2.2e-22
NP_061334 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-like ( 538) 484 104.8 7.9e-22
NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 483 104.6 9.4e-22
NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 483 104.7 1.1e-21
NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 483 104.7 1.2e-21
XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 483 104.7 1.2e-21
XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 483 104.7 1.2e-21
XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 483 104.7 1.2e-21
XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 483 104.7 1.2e-21
XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 789) 483 104.7 1.2e-21
XP_011512001 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 483 104.7 1.2e-21
XP_016863763 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 483 104.7 1.2e-21
XP_016863762 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 483 104.7 1.2e-21
XP_011511240 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 477 103.5 2.2e-21
XP_016862148 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 477 103.5 2.2e-21
XP_005247612 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 477 103.5 2.2e-21
XP_005247613 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 477 103.5 2.2e-21
XP_005247611 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 477 103.5 2.2e-21
XP_005247610 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 477 103.5 2.2e-21
XP_016862149 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 477 103.5 2.2e-21
NP_060114 (OMIM: 611295) kelch-like protein 24 [Ho ( 600) 477 103.5 2.2e-21
XP_005247609 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 477 103.5 2.2e-21
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 475 103.1 2.7e-21
XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 575) 475 103.1 2.8e-21
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 475 103.1 2.8e-21
NP_065917 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 isof ( 748) 475 103.2 3.4e-21
NP_001316524 (OMIM: 608778,615081) kelch-like prot ( 608) 472 102.5 4.3e-21
NP_689680 (OMIM: 608778,615081) kelch-like protein ( 608) 472 102.5 4.3e-21
XP_011511576 (OMIM: 614214) PREDICTED: kelch-like ( 327) 461 100.2 1.2e-20
XP_016863164 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 415) 462 100.5 1.2e-20
NP_569713 (OMIM: 614214) kelch-like protein 6 [Hom ( 621) 463 100.8 1.5e-20
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 462 100.6 1.5e-20
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 462 100.6 1.6e-20
>>NP_006054 (OMIM: 607701,615731) kelch-like protein 41 (606 aa)
initn: 4004 init1: 4004 opt: 4004 Z-score: 4196.3 bits: 786.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4004; 100.0% identity (100.0% similar) in 606 aa overlap (1-606:1-606)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDSQRELAEELRLYQSTLLQDGLKDLLDEKKFIDCTLKAGDKSLPCHRLILSACSPYFRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MDSQRELAEELRLYQSTLLQDGLKDLLDEKKFIDCTLKAGDKSLPCHRLILSACSPYFRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YFLSEIDEAKKKEVVLDNVDPAILDLIIKYLYSASIDLNDGNVQDIFALASRFQIPSVFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 YFLSEIDEAKKKEVVLDNVDPAILDLIIKYLYSASIDLNDGNVQDIFALASRFQIPSVFT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VCVSYLQKRLAPGNCLAILRLGLLLDCPRLAISAREFVSDRFVQICKEEDFMQLSPQELI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VCVSYLQKRLAPGNCLAILRLGLLLDCPRLAISAREFVSDRFVQICKEEDFMQLSPQELI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 SVISNDSLNVEKEEAVFEAVMKWVRTDKENRVKNLSEVFDCIRFRLMTEKYFKDHVEKDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SVISNDSLNVEKEEAVFEAVMKWVRTDKENRVKNLSEVFDCIRFRLMTEKYFKDHVEKDD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 IIKSNPDLQKKIKVLKDAFAGKLPEPSKNAAKTGAGEVNGDVGDEDLLPGYLNDIPRHGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 IIKSNPDLQKKIKVLKDAFAGKLPEPSKNAAKTGAGEVNGDVGDEDLLPGYLNDIPRHGM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 FVKDLILLVNDTAAVAYDPTENECYLTALAEQIPRNHSSIVTQQNQIYVVGGLYVDEENK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 FVKDLILLVNDTAAVAYDPTENECYLTALAEQIPRNHSSIVTQQNQIYVVGGLYVDEENK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 DQPLQSYFFQLDSIASEWVGLPPLPSARCLFGLGEVDDKIYVVAGKDLQTEASLDSVLCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DQPLQSYFFQLDSIASEWVGLPPLPSARCLFGLGEVDDKIYVVAGKDLQTEASLDSVLCY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 DPVAAKWNEVKKLPIKVYGHNVISHKGMIYCLGGKTDDKKCTNRVFIFNPKKGDWKDLAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DPVAAKWNEVKKLPIKVYGHNVISHKGMIYCLGGKTDDKKCTNRVFIFNPKKGDWKDLAP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 MKIPRSMFGVAVHKGKIVIAGGVTEDGLSASVEAFDLTTNKWDVMTEFPQERSSISLVSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MKIPRSMFGVAVHKGKIVIAGGVTEDGLSASVEAFDLTTNKWDVMTEFPQERSSISLVSL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 AGSLYAIGGFAMIQLESKEFAPTEVNDIWKYEDDKKEWAGMLKEIRYASGASCLATRLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AGSLYAIGGFAMIQLESKEFAPTEVNDIWKYEDDKKEWAGMLKEIRYASGASCLATRLNL
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 FKLSKL
::::::
NP_006 FKLSKL
>>NP_689606 (OMIM: 615340,615348) kelch-like protein 40 (621 aa)
initn: 2269 init1: 780 opt: 1328 Z-score: 1395.4 bits: 268.3 E(85289): 5.5e-71
Smith-Waterman score: 2246; 51.1% identity (81.4% similar) in 618 aa overlap (6-606:6-621)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDSQRELAEELRLYQSTLLQDGLKDLLDEKKFIDCTLKAGDKSLPCHRLILSACSPYFRE
: ::: ::::.:::::::::.::. ::.::...::.. .:::::.:.:::::::
NP_689 MALGLEQAEEQRLYQQTLLQDGLKDMLDHGKFLDCVVRAGEREFPCHRLVLAACSPYFRA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YFLSEIDEAKKKEVVLDNVDPAILDLIIKYLYSASIDLNDGNVQDIFALASRFQIPSVFT
::.: ..: :. :..:.: .. ...:::.. : :....:::.:: : ::::::.::
NP_689 RFLAEPERAG--ELHLEEVSPDVVAQVLHYLYTSEIALDEASVQDLFAAAHRFQIPSIFT
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VCVSYLQKRLAPGNCLAILRLGLLLDCPRLAISAREFVSDRFVQICKEEDFMQLSPQELI
.:::.::::: .::::..:::::::: :::..::.:. .:. . .. ::. :: .:::
NP_689 ICVSFLQKRLCLSNCLAVFRLGLLLDCARLAVAARDFICAHFTLVARDADFLGLSADELI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE3 SVISNDSLNVEKEEAVFEAVMKWVRT-DKE---NRVKNLSEVFDCIRFRLMTEKYFKDHV
..::.:.::::::::::::::.:. . : : .: . : ::. .: ::. . .....:
NP_689 AIISSDGLNVEKEEAVFEAVMRWAGSGDAEAQAERQRALPTVFESVRCRLLPRAFLESRV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE3 EKDDIIKSNPDLQKKIKVLKDAFAGKLPE-PSKNAAKTGAGEVNGDVG------DED---
:. .....:.: .:....::: :.. .:. .: ::: ..: : .::
NP_689 ERHPLVRAQPELLRKVQMVKDAHEGRITTLRKKKKGKDGAGAKEADKGTSKAKAEEDEEA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 --LLPGYLNDIPRHGMFVKDLILLVNDTAAVAYDPTENECYLTALAEQIPRNHSSIVTQQ
.::: ::: : :::..:::..... .::::::. :::: ..:..:.:.:: :.::..
NP_689 ERILPGILNDTLRFGMFLQDLIFMISEEGAVAYDPAANECYCASLSNQVPKNHVSLVTKE
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 NQIYVVGGLYVDEENKDQPLQSYFFQLDSIASEWVGLPPLPSARCLFGLGEVDDKIYVVA
::..:.:::. .:.::..:...::.:.: . :::.:.::::: ::::::::. ..::::.
NP_689 NQVFVAGGLFYNEDNKEDPMSAYFLQFDHLDSEWLGMPPLPSPRCLFGLGEALNSIYVVG
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 GKDLQT-EASLDSVLCYDPVAAKWNEVKKLPIKVYGHNVISHKGMIYCLGGKTDDKKCTN
:.... : ::::.::: .. ::.: :: ::::.:.:: ..: .::: .:.:: :
NP_689 GREIKDGERCLDSVMCYDRLSFKWGESDPLPYVVYGHTVLSHMDLVYVIGGKGSDRKCLN
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 RVFIFNPKKGDWKDLAPMKIPRSMFGVAVHKGKIVIAGGVTEDGLSASVEAFDLTTNKWD
.. ...::: .::.::::. ::.::..:: :.:..:.:::. ::..:.:....: :::
NP_689 KMCVYDPKKFEWKELAPMQTARSLFGATVHDGRIIVAAGVTDTGLTSSAEVYSITDNKWA
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 VMTEFPQERSSISLVSLAGSLYAIGGFAMIQLESKEFAPTEVNDIWKYEDDKKEWAGMLK
. :::::::.:::::.:.:::::::: .. :: :..:::.::::.:....:.: :.:.
NP_689 PFEAFPQERSSLSLVSLVGTLYAIGGFATLETESGELVPTELNDIWRYNEEEKKWEGVLR
540 550 560 570 580 590
590 600
pF1KE3 EIRYASGASCLATRLNLFKLSKL
:: ::.::. : .:::.. :.:.
NP_689 EIAYAAGATFLPVRLNVLCLTKM
600 610 620
>>XP_016862147 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like prot (625 aa)
initn: 742 init1: 452 opt: 673 Z-score: 709.8 bits: 141.5 E(85289): 8.5e-33
Smith-Waterman score: 686; 27.5% identity (57.8% similar) in 545 aa overlap (23-549:56-576)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MDSQRELAEELRLYQSTLLQDGLKDLLDEKKFIDCTLKAGDKSLPCHRLILS
.... : . : : . . : .:::: .::
XP_016 VFEMDPKSLTGHEFFDFSSGSSHAENILQIFNEFRDSRLFTDVIICVEGKEFPCHRAVLS
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 ACSPYFREYFLSEIDEAKKKEVVLDNVDPAILDLIIKYLYSASIDLNDGNVQDIFALASR
::: ::: .: .. :... : .... .. ...:.:.... .. ::: .: .:
XP_016 ACSSYFRAMFCNDHRESREMLVEINGILAEAMECFLQYVYTGKVKITTENVQYLFETSSL
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 FQIPSVFTVCVSYLQKRLAPGNCLAILRLGLLLDCPRLAISAREFVSDRFVQICKEEDFM
::: . .:...:...: : :::.: :.. . : . ..:. . : .. ..:.:.
XP_016 FQISVLRDACAKFLEEQLDPCNCLGIQRFADTHSLKTLFTKCKNFALQTFEDVSQHEEFL
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 QLSPQELISVISNDSLNVEKEEAVFEAVMKWVRTDKENRVKNLSEVFDCIRFRLMTEKYF
.:. .:::. : .: : . ::: ::::::.:: . : : :.. .:. :. .::
XP_016 ELDKDELIDYICSDELVIGKEEMVFEAVMRWVYRAVDLRRPLLHELLTHVRLPLLHPNYF
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280
pF1KE3 KDHVEKDDIIKSNPDLQ------KKIKVLKDAFAGKLPEPSKNAAKTGAGEVNGDVGDED
. :: :..:...:. .. ..: . . . .: .. :: .:: :: .
XP_016 VQTVEVDQLIQNSPECYQLLHEARRYHILGNEMMSPRTRPRRS---TGYSEVIVVVGGCE
270 280 290 300 310 320
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 LLPGYLNDIPRHGMFVKDLILLVNDTAAVAYDPTENECYLTALAEQIPRNHSSIVTQQNQ
. :. ..: . : . . : . :..: . :: ..: . . : ...
XP_016 RVGGF--NLPYTECY--DPVTGEWKSLAKLPEFTKSEYAVCALRNDILVSGGRINSRDVW
330 340 350 360 370
350 360 370 380 390
pF1KE3 IY---VVGGLYVDEENKDQP-------LQSYFFQLDSIASEWVGLPPLPSARCLFGLGEV
:: . . : :: . : . :.. . ... : : .:. : :.
XP_016 IYNSQLNIWIRVASLNKGRWRHKMAVLLGKGFLKTSILGQSWWLTPVIPA------LWEA
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 DDKIYVVAGKDLQTEASLDSVLCYDPVAAKWNEVKKLPIKVYGHNVISHKGMIYCLGGKT
:.:::.: : :.. :.:: ::: . .:.:: : : . : : : .. .::
XP_016 --KVYVVGGYDGQNR--LSSVECYDSFSNRWTEVAPLKEAVSSPAVTSCVGKLFVIGGGP
440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 DDKKCTNRVFIFNPKKGDWKDLAPMKIPRSMFGVAVHKGKIVIAGGVTEDGLSASVEAFD
::. :...: ..:. ..: : . : . . .. .. : .:::.:. .. .:
XP_016 DDNTCSDKVQSYDPETNSWLLRAAIPIAKRCITAVSLNNLIYVAGGLTK-----AIYCYD
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 LTTNKW-DVMTEFP-QERSSISLVSLAGSLYAIGGFAMIQLESKEFAPTEVNDIWKYEDD
. . : :.. : :: ..:. . :..: .::
XP_016 PVEDYWMHVQNTFSRQENCGMSVCN--GKIYILGGRRENGEATDTILCYDPATSIITGVA
550 560 570 580 590 600
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606 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 08:42:40 2016 done: Sun Nov 6 08:42:42 2016
Total Scan time: 10.060 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]