Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3928
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3928, 396 aa
1>>>pF1KE3928 396 - 396 aa - 396 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4922+/-0.00095; mu= 15.7754+/- 0.056
mean_var=65.9016+/-13.283, 0's: 0 Z-trim(105.0): 37 B-trim: 380 in 1/48
Lambda= 0.157989
statistics sampled from 8143 (8177) to 8143 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.633), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16
Scan time: 2.780
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS72996.1 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1 ( 396) 2657 614.6 4.9e-176
CCDS35134.1 DENND1A gene_id:57706|Hs108|chr9 ( 559) 1839 428.2 8.9e-120
CCDS35133.1 DENND1A gene_id:57706|Hs108|chr9 (1009) 1839 428.3 1.5e-119
CCDS41452.2 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1 ( 426) 1693 394.9 7.3e-110
CCDS72997.1 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1 ( 775) 1609 375.9 7.1e-104
CCDS77225.1 DENND1C gene_id:79958|Hs108|chr19 ( 757) 999 236.8 5e-62
CCDS45938.1 DENND1C gene_id:79958|Hs108|chr19 ( 801) 999 236.8 5.2e-62
CCDS7792.1 ST5 gene_id:6764|Hs108|chr11 ( 717) 374 94.4 3.6e-19
CCDS7791.1 ST5 gene_id:6764|Hs108|chr11 (1137) 374 94.4 5.4e-19
CCDS60219.1 DENND2D gene_id:79961|Hs108|chr1 ( 468) 367 92.7 7.6e-19
CCDS831.1 DENND2D gene_id:79961|Hs108|chr1 ( 471) 367 92.7 7.6e-19
CCDS43659.1 DENND2A gene_id:27147|Hs108|chr7 (1009) 347 88.3 3.5e-17
CCDS875.1 DENND2C gene_id:163259|Hs108|chr1 ( 871) 343 87.3 5.8e-17
CCDS58018.1 DENND2C gene_id:163259|Hs108|chr1 ( 928) 343 87.3 6.1e-17
CCDS6491.3 DENND4C gene_id:55667|Hs108|chr9 (1909) 306 79.0 3.9e-14
CCDS83349.1 DENND4C gene_id:55667|Hs108|chr9 (1958) 306 79.1 4e-14
CCDS58119.1 DENND5A gene_id:23258|Hs108|chr11 (1241) 283 73.7 1e-12
CCDS31423.1 DENND5A gene_id:23258|Hs108|chr11 (1287) 283 73.7 1.1e-12
CCDS44857.1 DENND5B gene_id:160518|Hs108|chr12 (1274) 261 68.7 3.4e-11
CCDS76542.1 DENND5B gene_id:160518|Hs108|chr12 (1309) 261 68.7 3.5e-11
>>CCDS72996.1 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1 (396 aa)
initn: 2657 init1: 2657 opt: 2657 Z-score: 3273.9 bits: 614.6 E(32554): 4.9e-176
Smith-Waterman score: 2657; 99.7% identity (99.7% similar) in 396 aa overlap (1-396:1-396)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MAAAPREEKRWPQPVFSNPVVLWKFPEDFGDQEILQSVPKFCFPFDVERVSQNQVGQHFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MAAAPREEKRWPQPVFSNPVVLWKFPEDFGDQEILQSVPKFCFPFDVERVSQNQVGQHFT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 FVLTDIESKQRFGFCRLTSGGTICLCILSYLPWFEVYYKLLNTLADYLAKELENDLNETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 FVLTDIESKQRFGFCRLTSGGTICLCILSYLPWFEVYYKLLNTLADYLAKELENDLNETL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RSLYNHPVPKANTPVNLSVHSYFIAPDVTGLPTIPESRNLTEYFVAVDVNNMLQLYASML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RSLYNHPVPKANTPVNLSVHSYFIAPDVTGLPTIPESRNLTEYFVAVDVNNMLQLYASML
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 HERRIVIISSKLSTLTACIHGSAALLYPMYWQHIYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 HERRIVIISSKLSTLTACIHGSAALLYPMYWQHIYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LIERVKNKSLEDVVMLNVDTNTLESPFSDLNNLPSDVVSALKNKLKKQSTATGDGVARAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LIERVKNKSLEDVVMLNVDTNTLESPFSDLNNLPSDVVSALKNKLKKQSTATGDGVARAF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LRAQAALFGYYRDALRYKPGEPITFCEESFVKHRSSVMKQFLETAINLQLFKQFIDGRLA
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LRAQAALFGSYRDALRYKPGEPITFCEESFVKHRSSVMKQFLETAINLQLFKQFIDGRLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KE3 KLNAGRGFSDVFEEEITSGGFCGGKDKLQYDYPFSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KLNAGRGFSDVFEEEITSGGFCGGKDKLQYDYPFSQ
370 380 390
>>CCDS35134.1 DENND1A gene_id:57706|Hs108|chr9 (559 aa)
initn: 1814 init1: 1606 opt: 1839 Z-score: 2263.9 bits: 428.2 E(32554): 8.9e-120
Smith-Waterman score: 1839; 70.6% identity (90.5% similar) in 378 aa overlap (16-392:28-404)
10 20 30 40
pF1KE3 MAAAPREEKRWPQPVFSNPVVLWKFPEDFGDQEILQSVPKFCFPFDVE
.:.: : .::::..:::.::.. :::::: :.
CCDS35 MGSRIKQNPETTFEVYVEVAYPRTGGTLSDPEVQRQFPEDYSDQEVLQTLTKFCFPFYVD
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 RVSQNQVGQHFTFVLTDIESKQRFGFCRLTSGGTICLCILSYLPWFEVYYKLLNTLADYL
.. .::::.::::::::.::::::::::.::. :.:::::::::::.::::: ::::
CCDS35 SLTVSQVGQNFTFVLTDIDSKQRFGFCRLSSGAKSCFCILSYLPWFEVFYKLLNILADYT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 AKELENDLNETLRSLYNHPVPKANTPVNLSVHSYFIAPDVTGLPTIPESRNLTEYFVAVD
.:. ::. :: :..:.. :.: .. :.::::::: .::. ::.:::.:::::::::::
CCDS35 TKRQENQWNELLETLHKLPIPDPGVSVHLSVHSYFTVPDTRELPSIPENRNLTEYFVAVD
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 VNNMLQLYASMLHERRIVIISSKLSTLTACIHGSAALLYPMYWQHIYIPVLPPHLLDYCC
:::::.::::::.::::.:: :::::::::::::::.::::::::.::::::::::::::
CCDS35 VNNMLHLYASMLYERRILIICSKLSTLTACIHGSAAMLYPMYWQHVYIPVLPPHLLDYCC
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 APMPYLIGIHSSLIERVKNKSLEDVVMLNVDTNTLESPFSDLNNLPSDVVSALKNKLKKQ
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CCDS35 APMPYLIGIHLSLMEKVRNMALDDVVILNVDTNTLETPFDDLQSLPNDVISSLKNRLKKV
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 STATGDGVARAFLRAQAALFGYYRDALRYKPGEPITFCEESFVKH-RSSVMKQFLETAIN
::.::::::::::.::::.:: ::.::. .: ::::::::.::.: ::..:.:::..: .
CCDS35 STTTGDGVARAFLKAQAAFFGSYRNALKIEPEEPITFCEEAFVSHYRSGAMRQFLQNATQ
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
pF1KE3 LQLFKQFIDGRLAKLNAGRGFSDVFEEEITSGGFCGGKDKLQYDYPFSQ
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CCDS35 LQLFKQFIDGRLDLLNSGEGFSDVFEEEINMGEY-AGSDKLYHQWLSTVRKGSGAILNTV
370 380 390 400 410
CCDS35 KTKANPAMKTVYKFAKDHAKMGIKEVKNRLKQKDIAENGCAPTPEEQLPKTAPSPLVEAK
420 430 440 450 460 470
>>CCDS35133.1 DENND1A gene_id:57706|Hs108|chr9 (1009 aa)
initn: 1814 init1: 1606 opt: 1839 Z-score: 2259.9 bits: 428.3 E(32554): 1.5e-119
Smith-Waterman score: 1839; 70.6% identity (90.5% similar) in 378 aa overlap (16-392:28-404)
10 20 30 40
pF1KE3 MAAAPREEKRWPQPVFSNPVVLWKFPEDFGDQEILQSVPKFCFPFDVE
.:.: : .::::..:::.::.. :::::: :.
CCDS35 MGSRIKQNPETTFEVYVEVAYPRTGGTLSDPEVQRQFPEDYSDQEVLQTLTKFCFPFYVD
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 RVSQNQVGQHFTFVLTDIESKQRFGFCRLTSGGTICLCILSYLPWFEVYYKLLNTLADYL
.. .::::.::::::::.::::::::::.::. :.:::::::::::.::::: ::::
CCDS35 SLTVSQVGQNFTFVLTDIDSKQRFGFCRLSSGAKSCFCILSYLPWFEVFYKLLNILADYT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 AKELENDLNETLRSLYNHPVPKANTPVNLSVHSYFIAPDVTGLPTIPESRNLTEYFVAVD
.:. ::. :: :..:.. :.: .. :.::::::: .::. ::.:::.:::::::::::
CCDS35 TKRQENQWNELLETLHKLPIPDPGVSVHLSVHSYFTVPDTRELPSIPENRNLTEYFVAVD
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 VNNMLQLYASMLHERRIVIISSKLSTLTACIHGSAALLYPMYWQHIYIPVLPPHLLDYCC
:::::.::::::.::::.:: :::::::::::::::.::::::::.::::::::::::::
CCDS35 VNNMLHLYASMLYERRILIICSKLSTLTACIHGSAAMLYPMYWQHVYIPVLPPHLLDYCC
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 APMPYLIGIHSSLIERVKNKSLEDVVMLNVDTNTLESPFSDLNNLPSDVVSALKNKLKKQ
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CCDS35 APMPYLIGIHLSLMEKVRNMALDDVVILNVDTNTLETPFDDLQSLPNDVISSLKNRLKKV
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 STATGDGVARAFLRAQAALFGYYRDALRYKPGEPITFCEESFVKH-RSSVMKQFLETAIN
::.::::::::::.::::.:: ::.::. .: ::::::::.::.: ::..:.:::..: .
CCDS35 STTTGDGVARAFLKAQAAFFGSYRNALKIEPEEPITFCEEAFVSHYRSGAMRQFLQNATQ
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
pF1KE3 LQLFKQFIDGRLAKLNAGRGFSDVFEEEITSGGFCGGKDKLQYDYPFSQ
:::::::::::: ::.:.::::::::::. : . .:.::: ...
CCDS35 LQLFKQFIDGRLDLLNSGEGFSDVFEEEINMGEY-AGSDKLYHQWLSTVRKGSGAILNTV
370 380 390 400 410
CCDS35 KTKANPAMKTVYKFAKDHAKMGIKEVKNRLKQKDIAENGCAPTPEEQLPKTAPSPLVEAK
420 430 440 450 460 470
>>CCDS41452.2 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1 (426 aa)
initn: 2513 init1: 1693 opt: 1693 Z-score: 2085.9 bits: 394.9 E(32554): 7.3e-110
Smith-Waterman score: 2478; 94.5% identity (94.7% similar) in 399 aa overlap (18-396:28-426)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MAAAPREEKRWPQPVFSNPVVLWKFPEDFGDQEILQSVPKFCFPFDVERV
.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MDCRTKANPDRTFDLVLKVKCHASENEDPVVLWKFPEDFGDQEILQSVPKFCFPFDVERV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 SQNQVGQHFTFVLTDIESKQRFGFCRLTSGGTICLCILSYLPWFEVYYKLLNTLADYLAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SQNQVGQHFTFVLTDIESKQRFGFCRLTSGGTICLCILSYLPWFEVYYKLLNTLADYLAK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150
pF1KE3 ELENDLNETLRSLYNHPVPKANTPVNLSV--------------------HSYFIAPDVTG
::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS41 ELENDLNETLRSLYNHPVPKANTPVNLSVNQEIFIACEQVLKDQPALVPHSYFIAPDVTG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 LPTIPESRNLTEYFVAVDVNNMLQLYASMLHERRIVIISSKLSTLTACIHGSAALLYPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LPTIPESRNLTEYFVAVDVNNMLQLYASMLHERRIVIISSKLSTLTACIHGSAALLYPMY
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 WQHIYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHSSLIERVKNKSLEDVVMLNVDTNTLESPFSDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 WQHIYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHSSLIERVKNKSLEDVVMLNVDTNTLESPFSDL
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 NNLPSDVVSALKNKLKKQSTATGDGVARAFLRAQAALFGYYRDALRYKPGEPITFCEESF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS41 NNLPSDVVSALKNKLKKQSTATGDGVARAFLRAQAALFGSYRDALRYKPGEPITFCEESF
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 VKHRSSVMKQFLETAINLQLFKQFIDGRLAKLNAGRGFSDVFEEEITSGGFCGGKDKLQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VKHRSSVMKQFLETAINLQLFKQFIDGRLAKLNAGRGFSDVFEEEITSGGFCGGKDKLQY
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 DYPFSQ
::::::
CCDS41 DYPFSQ
>>CCDS72997.1 DENND1B gene_id:163486|Hs108|chr1 (775 aa)
initn: 2453 init1: 1609 opt: 1609 Z-score: 1978.4 bits: 375.9 E(32554): 7.1e-104
Smith-Waterman score: 2394; 93.6% identity (94.4% similar) in 390 aa overlap (18-387:28-417)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MAAAPREEKRWPQPVFSNPVVLWKFPEDFGDQEILQSVPKFCFPFDVERV
.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MDCRTKANPDRTFDLVLKVKCHASENEDPVVLWKFPEDFGDQEILQSVPKFCFPFDVERV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 SQNQVGQHFTFVLTDIESKQRFGFCRLTSGGTICLCILSYLPWFEVYYKLLNTLADYLAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SQNQVGQHFTFVLTDIESKQRFGFCRLTSGGTICLCILSYLPWFEVYYKLLNTLADYLAK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150
pF1KE3 ELENDLNETLRSLYNHPVPKANTPVNLSV--------------------HSYFIAPDVTG
::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS72 ELENDLNETLRSLYNHPVPKANTPVNLSVNQEIFIACEQVLKDQPALVPHSYFIAPDVTG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 LPTIPESRNLTEYFVAVDVNNMLQLYASMLHERRIVIISSKLSTLTACIHGSAALLYPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LPTIPESRNLTEYFVAVDVNNMLQLYASMLHERRIVIISSKLSTLTACIHGSAALLYPMY
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 WQHIYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHSSLIERVKNKSLEDVVMLNVDTNTLESPFSDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 WQHIYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHSSLIERVKNKSLEDVVMLNVDTNTLESPFSDL
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 NNLPSDVVSALKNKLKKQSTATGDGVARAFLRAQAALFGYYRDALRYKPGEPITFCEESF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS72 NNLPSDVVSALKNKLKKQSTATGDGVARAFLRAQAALFGSYRDALRYKPGEPITFCEESF
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 VKHRSSVMKQFLETAINLQLFKQFIDGRLAKLNAGRGFSDVFEEEITSGGFCGGKDKLQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .
CCDS72 VKHRSSVMKQFLETAINLQLFKQFIDGRLAKLNAGRGFSDVFEEEITSGGFCGGNPRSYQ
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 DYPFSQ
CCDS72 QWVHTVKKGGALFNTAMTKATPAVRTAYKFAKNHAKLGLKEVKSKLKHKENEEDYGTCSS
430 440 450 460 470 480
>>CCDS77225.1 DENND1C gene_id:79958|Hs108|chr19 (757 aa)
initn: 1354 init1: 824 opt: 999 Z-score: 1227.1 bits: 236.8 E(32554): 5e-62
Smith-Waterman score: 1338; 54.4% identity (77.5% similar) in 373 aa overlap (35-384:1-373)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 PREEKRWPQPVFSNPVVLWKFPEDFGDQEILQSVPKFCFPFDVERVSQNQVGQHFTFVLT
.: :::::::::::: . . :::::.::
CCDS77 MQMVPKFCFPFDVEREPPSPAVQHFTFALT
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DIESKQRFGFCRLTSGGTICLCILSYLPWFEVYYKLLNTLADYLAKELENDLNETLRSLY
:. ...::::::: .: ::::::.::::::.::::::..: ::.. .. .: :..:.
CCDS77 DLAGNRRFGFCRLRAGTQSCLCILSHLPWFEVFYKLLNTVGDLLAQDQVTEAEELLQNLF
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160
pF1KE3 NHPV--PKANTPVNLSVH--------------------SYFIAPDVTGLPTIPESRNLTE
.. . :.:.. ..:. : :.::: ::.:::.:::::
CCDS77 QQSLSGPQASVGLELGSGVTVSSGQGIPPPTRGNSKPLSCFVAPDSGRLPSIPENRNLTE
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 YFVAVDVNNMLQLYASMLHERRIVIISSKLSTLTACIHGSAALLYPMYWQHIYIPVLPPH
::: .:.. :.:..: :::... .:::::::.:.:.: :::::: :.:. ::.::::
CCDS77 LVVAVTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYPMRWEHVLIPTLPPH
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 LLDYCCAPMPYLIGIHSSLIERVKNKSLEDVVMLNVDTNTLESPFSDLNNLPSDVVSALK
::::::::::::::.:.:: :::..:.:::::.::::.::::. :.:.. :: :::: :.
CCDS77 LLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVREKALEDVVVLNVDANTLETTFNDVQALPPDVVSLLR
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 NKLKKQSTATGDGVARAFLRAQAALFGYYRDALRYKPGEPITFCEESFVKHRSSV-MKQF
.:.: . : :.::.: ::.::: ::: ::::: .::.:.:: :: :. .. .. .. :
CCDS77 LRLRKVALAPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEEVFLAQKPGAPLQAF
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390
pF1KE3 LETAINLQLFKQFIDGRLAKLNAGRGFSDVFEEEITSGGFCGGKDKLQYDYPFSQ
. :..::::::::..:: ::: :.:::: ::.:::. : .:
CCDS77 HRRAVHLQLFKQFIEARLEKLNKGEGFSDQFEQEITGCGASSGALRSYQLWADNLKKGGG
340 350 360 370 380 390
CCDS77 ALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGVQSLLMYKDGDSVLQRGGSLRAPALPSRSDRLQ
400 410 420 430 440 450
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10 20 30 40 50
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60 70 80 90 100 110
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CCDS45 PPSPAVQHFTFALTDLAGNRRFGFCRLRAGTQSCLCILSHLPWFEVFYKLLNTVGDLLAQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140
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CCDS45 DQVTEAEELLQNLFQQSLSGPQASVGLELGSGVTVSSGQGIPPPTRGNSKPLSCFVAPDS
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
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CCDS45 GRLPSIPENRNLTELVVAVTDENIVGLFAALLAERRVLLTASKLSTLTSCVHASCALLYP
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
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CCDS45 MRWEHVLIPTLPPHLLDYCCAPMPYLIGVHASLAERVREKALEDVVVLNVDANTLETTFN
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 DLNNLPSDVVSALKNKLKKQSTATGDGVARAFLRAQAALFGYYRDALRYKPGEPITFCEE
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CCDS45 DVQALPPDVVSLLRLRLRKVALAPGEGVSRLFLKAQALLFGGYRDALVCSPGQPVTFSEE
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 SFVKHRSSV-MKQFLETAINLQLFKQFIDGRLAKLNAGRGFSDVFEEEITSGGFCGGKDK
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CCDS45 VFLAQKPGAPLQAFHRRAVHLQLFKQFIEARLEKLNKGEGFSDQFEQEITGCGASSGALR
370 380 390 400 410 420
390
pF1KE3 LQYDYPFSQ
CCDS45 SYQLWADNLKKGGGALLHSVKAKTQPAVKNMYRSAKSGLKGVQSLLMYKDGDSVLQRGGS
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10 20 30
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CCDS77 EERLKAIPQFCFPDAKDWLPVSEYS-SETFSFMLTGEDGSRRFGYCRRLLPSGKGPRLPE
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pF1KE3 --CILSYLPWFEVYYKLLNTLADYLAKELENDL-NETLRSLYNHPVPKANTPVNLSVHSY
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CCDS77 VYCVISRLGCFGLFSKVLDEVERR--RGISAALVYPFMRSLMESPFPAPGKTIKVKTFLP
380 390 400 410 420 430
150 160 170 180 190
pF1KE3 FIAPDVTGLPTIPESR----NLTEYFVAVDVNNMLQLYASMLHERRIVIISSKLSTLTAC
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CCDS77 GAGNEVLELRRPMDSRLEHVDFECLFTCLSVRQLIRIFASLLLERRVIFVADKLSTLSSC
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pF1KE3 IHGSAALLYPMYWQHIYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHSSLIERVKNKSLEDVVMLNV
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CCDS77 SHAVVALLYPFSWQHTFIPVLPASMIDIVCCPTPFLVGLLSSSLPKLKELPVEEALMVNL
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260 270 280 290 300
pF1KE3 DTNTLESPFSDLNNL-PSDVVSAL------KNKLKKQST--------ATGDG-VARAFLR
.. . ..: ..: : . .:: ::.: .:.. : .: :...:.:
CCDS77 GSDRFIRQMDDEDTLLPRKLQAALEQALERKNELISQDSDSDSDDECNTLNGLVSEVFIR
560 570 580 590 600 610
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pF1KE3 AQAALFGYYRDALRYKPGEPITFCEESFVKHRSS-VMKQFLETAINLQLFKQFIDGRLAK
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CCDS77 FFVETVGHYSLFLTQSEKGERAFQREAFRKSVASKSIRRFLEVFMESQMFAGFIQDRELR
620 630 640 650 660 670
370 380 390
pF1KE3 LNAGRGFSDVFEEEITSGGFCGGKDKLQYDYPFSQ
..: .::...
CCDS77 KCRAKG---LFEQRVEQYLEELPDTEQSGMNKFLRGLGNKMKFLHKKN
680 690 700 710
>>CCDS7791.1 ST5 gene_id:6764|Hs108|chr11 (1137 aa)
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10 20 30
pF1KE3 MAAAPREEKRWPQPVFSNPVVLWKFPE-DFGDQEI---
:. :. : : ..::. : ...
CCDS77 KRAPSYRTLELELLEWQERELFEYFVVVSLKKKPSRNTYLPEVSYQFPKLDRPTKQMREA
680 690 700 710 720 730
40 50 60 70 80
pF1KE3 ---LQSVPKFCFP--FDVERVSQNQVGQHFTFVLTDIESKQRFGFCR--LTSGGTICL--
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CCDS77 EERLKAIPQFCFPDAKDWLPVSEYS-SETFSFMLTGEDGSRRFGYCRRLLPSGKGPRLPE
740 750 760 770 780 790
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pF1KE3 --CILSYLPWFEVYYKLLNTLADYLAKELENDL-NETLRSLYNHPVPKANTPVNLSVHSY
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CCDS77 VYCVISRLGCFGLFSKVLDEVERR--RGISAALVYPFMRSLMESPFPAPGKTIKVKTFLP
800 810 820 830 840 850
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pF1KE3 FIAPDVTGLPTIPESR----NLTEYFVAVDVNNMLQLYASMLHERRIVIISSKLSTLTAC
. .: : .:: .. :. ..: ......::.: :::......:::::..:
CCDS77 GAGNEVLELRRPMDSRLEHVDFECLFTCLSVRQLIRIFASLLLERRVIFVADKLSTLSSC
860 870 880 890 900 910
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 IHGSAALLYPMYWQHIYIPVLPPHLLDYCCAPMPYLIGIHSSLIERVKNKSLEDVVMLNV
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CCDS77 SHAVVALLYPFSWQHTFIPVLPASMIDIVCCPTPFLVGLLSSSLPKLKELPVEEALMVNL
920 930 940 950 960 970
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pF1KE3 DTNTLESPFSDLNNL-PSDVVSAL------KNKLKKQST--------ATGDG-VARAFLR
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CCDS77 GSDRFIRQMDDEDTLLPRKLQAALEQALERKNELISQDSDSDSDDECNTLNGLVSEVFIR
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pF1KE3 AQAALFGYYRDALRYKPGEPITFCEESFVKHRSS-VMKQFLETAINLQLFKQFIDGRLAK
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CCDS77 FFVETVGHYSLFLTQSEKGERAFQREAFRKSVASKSIRRFLEVFMESQMFAGFIQDRELR
1040 1050 1060 1070 1080 1090
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CCDS77 KCRAKG---LFEQRVEQYLEELPDTEQSGMNKFLRGLGNKMKFLHKKN
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pF1KE3 MAAAPREEKRWPQPVFSNPVVLWKFP--EDF--GDQE----ILQSVPK
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CCDS60 SLPNFAGGQHFFEYLLVVSLKKKRSEDDYEPIITYQFPKRENLLRGQQEEEERLLKAIPL
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90
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CCDS60 FCFPDGNEWASLTEYPRETFSFVLTNVDGSRKIGYCRRLLPAGPGPRLPKVYCIISCIGC
100 110 120 130 140 150
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160 170 180 190 200
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CCDS60 ISLTRPLDSHLEHVDFSSLLHCLSFEQILQIFASAVLERKIIFLAEGLSTLSQCIHAAAA
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CCDS60 LLYPFSWAHTYIPVVPESLLATVCCPTPFMVGVQMRFQQEVMDSPMEEVLLVNLCEGTFL
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CCDS60 MSVGDEKDILPPKLQDDILDSLGQGINELKTAEQINEHVSGPFVQFFVKIVGHYASYIKR
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CCDS60 EANGQGHFQERSFCKALTSKTNRRFVKKFVKTQLFSLFIQEAEKSKNPPAGY---FQQKI
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CCDS60 LEYEEQKKQKKPREKTVK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]