Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3919
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3919, 707 aa
1>>>pF1KE3919 707 - 707 aa - 707 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9957+/-0.00134; mu= 16.3573+/- 0.080
mean_var=82.3550+/-16.649, 0's: 0 Z-trim(101.1): 63 B-trim: 34 in 1/50
Lambda= 0.141328
statistics sampled from 6319 (6369) to 6319 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.539), E-opt: 0.2 (0.196), width: 16
Scan time: 3.190
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS75649.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 ( 707) 4710 971.1 0
CCDS5726.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 ( 735) 3808 787.2 0
CCDS47678.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 ( 690) 3676 760.3 0
CCDS32640.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 ( 436) 410 94.3 4.3e-19
CCDS54116.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 ( 404) 353 82.6 1.3e-15
CCDS2658.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 ( 423) 352 82.4 1.5e-15
CCDS64129.1 FBXL7 gene_id:23194|Hs108|chr5 ( 444) 324 76.7 8.2e-14
CCDS54833.1 FBXL7 gene_id:23194|Hs108|chr5 ( 491) 324 76.7 8.9e-14
>>CCDS75649.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 (707 aa)
initn: 4710 init1: 4710 opt: 4710 Z-score: 5191.4 bits: 971.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4710; 99.7% identity (99.9% similar) in 707 aa overlap (1-707:1-707)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MTPELMIKACSFYTGHLVKTHFCTWRDIARTNENVVLAEKMNRAVTCYNFRLQKSVFHHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MTPELMIKACSFYTGHLVKTHFCTWRDIARTNENVVLAEKMNRAVTCYNFRLQKSVFHHW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 HSYMEDQKEKLKNMLLRIQQIIYCHKLTIILTKWRNTARHKSKKKEDELILKHELQLKKW
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HSYMEDQKEKLKNILLRIQQIIYCHKLTIILTKWRNTARHKSKKKEDELILKHELQLKKW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 KNRLILKRAAAEESNFPERSSSEVFLVDETLKCDISLLPERAILQIFFYLSLKDVIICGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 KNRLILKRAAAEESNFPERSSSEVFLVDETLKCDISLLPERAILQIFFYLSLKDVIICGQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VNHAWMLMTQLNSLWNAIDFSSVKNVIPDKYIVSTLQRWRLNVLRLNFRGCLLRPKTFRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VNHAWMLMTQLNSLWNAIDFSSVKNVIPDKYIVSTLQRWRLNVLRLNFRGCLLRPKTFRS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VSHCRNLQELNVSDCPTFTDESMRHISEGCPGVLCLNLSNTTITNRTMRLLPRHFHNLQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VSHCRNLQELNVSDCPTFTDESMRHISEGCPGVLCLNLSNTTITNRTMRLLPRHFHNLQN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LSLAYCRRFTDKGLQYLNLGNGCHKLIYLDLSGCTQISVQGFRYIANSCTGIMHLTINDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LSLAYCRRFTDKGLQYLNLGNGCHKLIYLDLSGCTQISVQGFRYIANSCTGIMHLTINDM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 PTLTDNCVKALVEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSACKLRKIRFEGNKRVTDASFKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PTLTDNCVKALVEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSACKLRKIRFEGNKRVTDASFKF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 IDKNYPNLSHIYMADCKGITDSSLRSLSPLKQLTVLNLANCVRIGDMGLKQFLDGPASMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IDKNYPNLSHIYMADCKGITDSSLRSLSPLKQLTVLNLANCVRIGDMGLKQFLDGPASMR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 IRELNLSNCVRLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIVNIFSLVSIDLSGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IRELNLSNCVRLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIVNIFSLVSIDLSGT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 DISNEAFCKSSLILEHLDVSYCSQLSDMIIKALAIYCINLTSLSIAGCPKITDSAMEMLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DISNEAFCKSSLILEHLDVSYCSQLSDMIIKALAIYCINLTSLSIAGCPKITDSAMEMLS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 AKCHYLHILDISGCVLLTDQILEDLQIGCKQLRILKMQYCTNISKKAAQRMSSKVQQQEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AKCHYLHILDISGCVLLTDQILEDLQIGCKQLRILKMQYCTNISKKAAQRMSSKVQQQEY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KE3 NTNGPPRWFGYDREGNPVTELDNITSSKGALELTVKKSTYSSEDQAA
::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NTNDPPRWFGYDREGNPVTELDNITSSKGALELTVKKSTYSSEDQAA
670 680 690 700
>>CCDS5726.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 (735 aa)
initn: 3725 init1: 3656 opt: 3808 Z-score: 4197.3 bits: 787.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4644; 95.9% identity (96.1% similar) in 735 aa overlap (1-707:1-735)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MTPELMIKACSFYTGHLVKTHFCTWRDIARTNENVVLAEKMNRAVTCYNFRLQKSVFHHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MTPELMIKACSFYTGHLVKTHFCTWRDIARTNENVVLAEKMNRAVTCYNFRLQKSVFHHW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 HSYMEDQKEKLKNMLLRIQQIIYCHKLTIILTKWRNTARHKSKKKEDELILKHELQLKKW
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 HSYMEDQKEKLKNILLRIQQIIYCHKLTIILTKWRNTARHKSKKKEDELILKHELQLKKW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 KNRLILKRAAAEESNFPERSSSEVFLVDETLKCDISLLPERAILQIFFYLSLKDVIICGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KNRLILKRAAAEESNFPERSSSEVFLVDETLKCDISLLPERAILQIFFYLSLKDVIICGQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VNHAWMLMTQLNSLWNAIDFSSVKNVIPDKYIVSTLQRWRLNVLRLNFRGCLLRPKTFRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VNHAWMLMTQLNSLWNAIDFSSVKNVIPDKYIVSTLQRWRLNVLRLNFRGCLLRPKTFRS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VSHCRNLQELNVSDCPTFTDESMRHISEGCPGVLCLNLSNTTITNRTMRLLPRHFHNLQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 VSHCRNLQELNVSDCPTFTDESMRHISEGCPGVLCLNLSNTTITNRTMRLLPRHFHNLQN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LSLAYCRRFTDKGLQYLNLGNGCHKLIYLDLSGCTQISVQGFRYIANSCTGIMHLTINDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LSLAYCRRFTDKGLQYLNLGNGCHKLIYLDLSGCTQISVQGFRYIANSCTGIMHLTINDM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 PTLTDNCVKALVEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSACKLRKIRFEGNKRVTDASFKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 PTLTDNCVKALVEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSACKLRKIRFEGNKRVTDASFKF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 IDKNYPNLSHIYMADCKGITDSSLRSLSPLKQLTVLNLANCVRIGDMGLKQFLDGPASMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 IDKNYPNLSHIYMADCKGITDSSLRSLSPLKQLTVLNLANCVRIGDMGLKQFLDGPASMR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 IRELNLSNCVRLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIVNIFSLVSIDLSGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 IRELNLSNCVRLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIVNIFSLVSIDLSGT
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KE3 DISNE----------------------------AFCKSSLILEHLDVSYCSQLSDMIIKA
::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 DISNEGLNVLSRHKKLKELSVSECYRITDDGIQAFCKSSLILEHLDVSYCSQLSDMIIKA
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 LAIYCINLTSLSIAGCPKITDSAMEMLSAKCHYLHILDISGCVLLTDQILEDLQIGCKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LAIYCINLTSLSIAGCPKITDSAMEMLSAKCHYLHILDISGCVLLTDQILEDLQIGCKQL
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 RILKMQYCTNISKKAAQRMSSKVQQQEYNTNGPPRWFGYDREGNPVTELDNITSSKGALE
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 RILKMQYCTNISKKAAQRMSSKVQQQEYNTNDPPRWFGYDREGNPVTELDNITSSKGALE
670 680 690 700 710 720
700
pF1KE3 LTVKKSTYSSEDQAA
:::::::::::::::
CCDS57 LTVKKSTYSSEDQAA
730
>>CCDS47678.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 (690 aa)
initn: 4473 init1: 3656 opt: 3676 Z-score: 4052.2 bits: 760.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4387; 94.2% identity (95.6% similar) in 709 aa overlap (1-707:1-690)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MTPELMIKACSFYTGHLVKTHFCTWRDIARTNENVVLAEKMNRAVTCYNFRLQKSVFHHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MTPELMIKACSFYTGHLVKTHFCTWRDIARTNENVVLAEKMNRAVTCYNFRLQKSVFHHW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 HSYMEDQKEKLKNMLLRIQQIIYCHKLTIILTKWRNTARHKSKKKEDELILKHELQLKKW
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HSYMEDQKEKLKNILLRIQQIIYCHKLTIILTKWRNTARHKSKKKEDELILKHELQLKKW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 KNRLILKRAAAEESNFPERSSSEVFLVDETLKCDISLLPERAILQIFFYLSLKDVIICGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KNRLILKRAAAEESNFPERSSSEVFLVDETLKCDISLLPERAILQIFFYLSLKDVIICGQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VNHAWMLMTQLNSLWNAIDFSSVKNVIPDKYIVSTLQRWRLNVLRLNFRGCLLRPKTFRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VNHAWMLMTQLNSLWNAIDFSSVKNVIPDKYIVSTLQRWRLNVLRLNFRGCLLRPKTFRS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VSHCRNLQELNVSDCPTFTDESMRHISEGCPGVLCLNLSNTTITNRTMRLLPRHFHNLQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VSHCRNLQELNVSDCPTFTDESMRHISEGCPGVLCLNLSNTTITNRTMRLLPRHFHNLQN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LSLAYCRRFTDKGLQYLNLGNGCHKLIYLDLSGCTQISVQGFRYIANSCTGIMHLTINDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSLAYCRRFTDKGLQYLNLGNGCHKLIYLDLSGCTQISVQGFRYIANSCTGIMHLTINDM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 PTLTDNCVKALVEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSACKLRKIRFEGNKRVTDASFKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PTLTDNCVKALVEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSACKLRKIRFEGNKRVTDASFKF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 IDKNYPNLSHIYMADCKGITDSSLRSLSPLKQLTVLNLANCVRIGDMGLKQFLDGPASMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IDKNYPNLSHIYMADCKGITDSSLRSLSPLKQLTVLNLANCVRIGDMGLKQFLDGPASMR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 IRELNLSNCVRLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIVNIFSLVSIDLSGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IRELNLSNCVRLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIVNIFSLVSIDLSGT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE3 DISNEAFCKSSL--ILEHLDVSYCSQLSDMIIKALAIYCINLTSLSIAGCPKITDSAMEM
:::::.. : :..:.:: : ...: :. ::::::::
CCDS47 DISNEGLNVLSRHKKLKELSVSECYRITDDGIQ-------------------ITDSAMEM
550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 LSAKCHYLHILDISGCVLLTDQILEDLQIGCKQLRILKMQYCTNISKKAAQRMSSKVQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSAKCHYLHILDISGCVLLTDQILEDLQIGCKQLRILKMQYCTNISKKAAQRMSSKVQQQ
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700
pF1KE3 EYNTNGPPRWFGYDREGNPVTELDNITSSKGALELTVKKSTYSSEDQAA
::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EYNTNDPPRWFGYDREGNPVTELDNITSSKGALELTVKKSTYSSEDQAA
650 660 670 680 690
>>CCDS32640.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 (436 aa)
initn: 761 init1: 226 opt: 410 Z-score: 456.3 bits: 94.3 E(32554): 4.3e-19
Smith-Waterman score: 576; 29.8% identity (63.3% similar) in 373 aa overlap (158-523:28-397)
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RAAAEESNFPERSSSEVFLVDETLKCDISLLPERAILQIFFYLSLKDVIICGQVNHAWML
::.. .:.:: .:.. . :.::..:: .
CCDS32 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNV
10 20 30 40 50
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 MTQLNSLWNAIDFSSVKNVIPDKYIVSTLQRWRLNVLRLNFRGCL-LRPKTFRSVSH-CR
.. .: :. ::. . . : . . . .: . .:..:::: . ...:. .. ::
CCDS32 LALDGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCR
60 70 80 90 100 110
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NLQELNVSDCPTFTDESMRHISEGCPGVLCLNL-SNTTITNRTMRLLPRHFHNLQNLSLA
:.. ::.. : :: . .:. : . :.: : :.::: ... : . :..:...
CCDS32 NIEVLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSLKALSEGCPLLEQLNIS
120 130 140 150 160 170
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 YCRRFTDKGLQYLNLGNGCHKLIYLDLSGCTQISVQGFRYIANSCTGIMHLTINDMPTLT
.: . : :.: : :: : : :.::::. ....::. : .. :... .:
CCDS32 WCDQVTKDGIQ--ALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQIT
180 190 200 210 220 230
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 DNCVKALVEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSA-C-KLRKIRFEGNKRVTDASFKFID
:. . .. . : .. :: .: .:.: . ::. : .:: .. ...::..: .
CCDS32 DEGLITICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLA
240 250 260 270 280 290
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 KNYPNLSHIYMADCKGITDSSLRSLS-PLKQLTVLNLANCVRIGDMGLKQFLDGP-ASMR
.: .: .. . .: ::::.: .:: .: ::.:..: : : :.... .: : .
CCDS32 RNCHELEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQ
300 310 320 330 340 350
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 IRELNLSNCVRLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIVNIFSLVSIDLSGT
.. ..:.:: ..:::. .: . : .:. . : .:...: ::
CCDS32 LEVIELDNCPLITDASLEHL-KSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFA
360 370 380 390 400 410
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 DISNEAFCKSSLILEHLDVSYCSQLSDMIIKALAIYCINLTSLSIAGCPKITDSAMEMLS
CCDS32 PVTPPPSVGGSRQRFCRCCIIL
420 430
>>CCDS54116.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 (404 aa)
initn: 750 init1: 226 opt: 353 Z-score: 394.0 bits: 82.6 E(32554): 1.3e-15
Smith-Waterman score: 497; 28.2% identity (59.4% similar) in 372 aa overlap (158-523:28-365)
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RAAAEESNFPERSSSEVFLVDETLKCDISLLPERAILQIFFYLSLKDVIICGQVNHAWML
::.. .:.:: .:.. . :.::..:: .
CCDS54 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNV
10 20 30 40 50
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 MTQLNSLWNAIDFSSVKNVIPDKYIVSTLQRWRLNVLRLNFRGCL-LRPKTFRSVSH-CR
.. .: :. ::. . . : . . . .: . .:..:::: . ...:. .. ::
CCDS54 LALDGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCR
60 70 80 90 100 110
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NLQELNVSDCPTFTDESMRHISEGCPGVLCLNLSNTTITNRTMRLLPRHFHNLQNLSLAY
:.. ::.. : :: .:::: :..:....
CCDS54 NIEVLNLNGCTKTTD------AEGCPL-------------------------LEQLNISW
120 130 140
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 CRRFTDKGLQYLNLGNGCHKLIYLDLSGCTQISVQGFRYIANSCTGIMHLTINDMPTLTD
: . : :.: : :: : : :.::::. ....::. : .. :... .::
CCDS54 CDQVTKDGIQ--ALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQITD
150 160 170 180 190 200
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 NCVKALVEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSA-C-KLRKIRFEGNKRVTDASFKFIDK
. . .. . : .. :: .: .:.: . ::. : .:: .. ...::..: . .
CCDS54 EGLITICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLAR
210 220 230 240 250 260
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 NYPNLSHIYMADCKGITDSSLRSLS-PLKQLTVLNLANCVRIGDMGLKQFLDGP-ASMRI
: .: .. . .: ::::.: .:: .: ::.:..: : : :.... .: : ..
CCDS54 NCHELEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQL
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490 500 510 520 530 540
pF1KE3 RELNLSNCVRLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIVNIFSLVSIDLSGTD
. ..:.:: ..:::. .: . : .:. . : .:...: ::
CCDS54 EVIELDNCPLITDASLEHL-KSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAP
330 340 350 360 370 380
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 ISNEAFCKSSLILEHLDVSYCSQLSDMIIKALAIYCINLTSLSIAGCPKITDSAMEMLSA
CCDS54 VTPPPSVGGSRQRFCRCCIIL
390 400
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CCDS26 LALDGSNWQRIDLFNFQTDVEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCIGVGDSSLKTFAQNCR
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310 320 330 340 350 360
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170 180 190 200 210 220
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CCDS26 DEGVVQICRGCHRLQALCLSGCSNLTDASLTALGLNCPRLQILEAARCSHLTDAGFTLLA
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CCDS26 RNCHELEKMDLEECILITDSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDDGILHLSNSTCGHER
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CCDS26 LRVLELDNCLLITDVALEHL-ENCRGLERLELYDCQQVTRAGIKRMRAQLPHVKVHAYFA
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CCDS64 CRRWYNLAWDPRLWRTIRLTG-ETINVDR-ALKVLTR----------RLCQDTPNV----
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: :. ..:: : .::... :.. :: . : :.:: .. . .. : :
CCDS64 --CLMLETVTVSGCRRLTDRGLYTIAQCCPELRRLEVSGCYNISNEAVFD-VVSLCP---
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300 310 320 330 340
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::..:... : . : .: ..:. : : :::.. : . .:.. :: :
CCDS64 -NLEHLDVSGCSKVTCISLTREASIKLSPLHGKQISIRYLDMTDCFVLEDEGLHTIAAHC
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pF1KE3 TGIMHLTINDMPTLTDNCVKALVEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSACKLRKIRFEG
: . :: . :::. .. :: :. : : .::: :
CCDS64 TQLTHLYLRRCVRLTDEGLRYLVIYCASIKEL------SVSDCRF---------------
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. ..: . ... :....: .::... :. : ::. :::..:: .:.::. ..
CCDS64 V-EYL-AKNCTKLKSLDIGKCPLVSDTGLECLALNCFNLKRLSLKSCESITGQGLQIVAA
350 360 370 380 390 400
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pF1KE3 NIFSLVSIDLSGTDISNEAF------CKSSLILEHLDVSYCSQLSDMIIKALAIYCINLT
: :.: ..... ..: ::. :: ..:: . ..
CCDS64 NCFDLQTLNVQDCEVSVEALRFVKRHCKRC-VIEHTNPAFF
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. .:. ::.....::: .: ... :..:
CCDS54 TGETVAMVHSPPPTRLTHPLIRLASRPQKEQASIDRLPDHSMVQIFSFLPTNQLCRCARV
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pF1KE3 NHAWMLMTQLNSLWNAIDFSSVKNVIPDKYIVSTLQRWRLNVLRLNFRGCLLRPKTFRSV
. :. .. :: .: ... ... :. ...: : : : :..
CCDS54 CRRWYNLAWDPRLWRTIRLTG-ETINVDR-ALKVLTR----------RLCQDTPNV----
150 160 170 180
250 260 270 280 290
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CCDS54 --CLMLETVTVSGCRRLTDRGLYTIAQCCPELRRLEVSGCYNISNEAVFD-VVSLCP---
190 200 210 220 230
300 310 320 330 340
pF1KE3 HNLQNLSLAYCRRFTDKGLQY---LNLGNGCHKLI---YLDLSGCTQISVQGFRYIANSC
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CCDS54 -NLEHLDVSGCSKVTCISLTREASIKLSPLHGKQISIRYLDMTDCFVLEDEGLHTIAAHC
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 TGIMHLTINDMPTLTDNCVKALVEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSACKLRKIRFEG
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CCDS54 TQLTHLYLRRCVRLTDEGLRYLVIYCASIKEL------SVSDCRF---------------
300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
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CCDS54 ---VSDFGLREIAKLESRLRYLSIAHCGRVTDVGIRYVAKYCSKLRYLNARGCEGITDHG
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 LKQFLDGPASMRIRELNLSNCVRLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIV-
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CCDS54 V-EYL-AKNCTKLKSLDIGKCPLVSDTGLECLALNCFNLKRLSLKSCESITGQGLQIVAA
400 410 420 430 440 450
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]