Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3918
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3918, 607 aa
1>>>pF1KE3918 607 - 607 aa - 607 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7353+/-0.000728; mu= 12.9739+/- 0.044
mean_var=94.3276+/-19.081, 0's: 0 Z-trim(111.1): 16 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.132055
statistics sampled from 12093 (12103) to 12093 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.72), E-opt: 0.2 (0.372), width: 16
Scan time: 4.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10833.2 ELMO3 gene_id:79767|Hs108|chr16 ( 773) 4028 777.5 0
CCDS5449.1 ELMO1 gene_id:9844|Hs108|chr7 ( 727) 2125 414.9 1.8e-115
CCDS82623.1 ELMO2 gene_id:63916|Hs108|chr20 ( 632) 2092 408.6 1.2e-113
CCDS13398.1 ELMO2 gene_id:63916|Hs108|chr20 ( 720) 2092 408.6 1.4e-113
CCDS5450.1 ELMO1 gene_id:9844|Hs108|chr7 ( 247) 1011 202.5 5.3e-52
>>CCDS10833.2 ELMO3 gene_id:79767|Hs108|chr16 (773 aa)
initn: 4028 init1: 4028 opt: 4028 Z-score: 4145.6 bits: 777.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4028; 100.0% identity (100.0% similar) in 607 aa overlap (1-607:167-773)
10 20 30
pF1KE3 MIFAREVISRNGLQILGTIIEDGDDLGEVL
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CCDS10 EAEQLLGGLQSNSPEGRREALRRLVPLASDMIFAREVISRNGLQILGTIIEDGDDLGEVL
140 150 160 170 180 190
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 ALSLRAFSELMEHGVVSWETLSIPFVRKVVCYVNMNLMDASVPPLALGLLESVTLSSPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ALSLRAFSELMEHGVVSWETLSIPFVRKVVCYVNMNLMDASVPPLALGLLESVTLSSPAL
200 210 220 230 240 250
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 GQLVKSEVPLDRLLVHLQVMNQQLQTKAMALLTALLQGASPVERKHMLDYLWQRNLRQFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GQLVKSEVPLDRLLVHLQVMNQQLQTKAMALLTALLQGASPVERKHMLDYLWQRNLRQFI
260 270 280 290 300 310
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 YKNIIHSAAPMGDEMAHHLYVLQALMLGLLEPRMRTPLDPYSQEQREQLQVLRQAAFEVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YKNIIHSAAPMGDEMAHHLYVLQALMLGLLEPRMRTPLDPYSQEQREQLQVLRQAAFEVE
320 330 340 350 360 370
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 GESSGAGLSADRRRSLCAREFRKLGFSNSNPAQDLERVPPGLLALDNMLYFSRNAPSAYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GESSGAGLSADRRRSLCAREFRKLGFSNSNPAQDLERVPPGLLALDNMLYFSRNAPSAYS
380 390 400 410 420 430
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 RFVLENSSREDKHECPFARGSIQLTVLLCELLRVGEPCSETAQDFSPMFFGQDQSFHELF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RFVLENSSREDKHECPFARGSIQLTVLLCELLRVGEPCSETAQDFSPMFFGQDQSFHELF
440 450 460 470 480 490
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 CVGIQLLNKTWKEMRATQEDFDKVMQVVREQLARTLALKPTSLELFRTKVNALTYGEVLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CVGIQLLNKTWKEMRATQEDFDKVMQVVREQLARTLALKPTSLELFRTKVNALTYGEVLR
500 510 520 530 540 550
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 LRQTERLHQEGTLAPPILELREKLKPELMGLIRQQRLLRLCEGTLFRKISSRRRQDKLWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LRQTERLHQEGTLAPPILELREKLKPELMGLIRQQRLLRLCEGTLFRKISSRRRQDKLWF
560 570 580 590 600 610
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 CCLSPNHKLLQYGDMEEGASPPTLESLPEQLPVADMRALLTGKDCPHVREKGSGKQNKDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 CCLSPNHKLLQYGDMEEGASPPTLESLPEQLPVADMRALLTGKDCPHVREKGSGKQNKDL
620 630 640 650 660 670
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 YELAFSISYDRGEEEAYLNFIAPSKREFYLWTDGLSALLGSPMGSEQTRLDLEQLLTMET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YELAFSISYDRGEEEAYLNFIAPSKREFYLWTDGLSALLGSPMGSEQTRLDLEQLLTMET
680 690 700 710 720 730
580 590 600
pF1KE3 KLRLLELENVPIPERPPPVPPPPTNFNFCYDCSIAEP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KLRLLELENVPIPERPPPVPPPPTNFNFCYDCSIAEP
740 750 760 770
>>CCDS5449.1 ELMO1 gene_id:9844|Hs108|chr7 (727 aa)
initn: 2158 init1: 1045 opt: 2125 Z-score: 2186.6 bits: 414.9 E(32554): 1.8e-115
Smith-Waterman score: 2150; 51.9% identity (80.2% similar) in 617 aa overlap (3-603:116-727)
10 20
pF1KE3 MIFAREVISRNGLQILGTIIEDGDD-------
::.: :. .:...: ..:.: .
CCDS54 QQLHERIQSSSMDAKLEALKDLASLSRDVTFAQEFINLDGISLLTQMVESGTERYQKLQK
90 100 110 120 130 140
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 -----LGEVLALSLRAFSELMEHGVVSWETLSIPFVRKVVCYVNMNLMDASVPPLALGLL
.:..:...: :: :::.::.:::.:.:. :..:.. .:: . .: :. .:..:
CCDS54 IMKPCFGDMLSFTLTAFVELMDHGIVSWDTFSVAFIKKIASFVNKSAIDISILQRSLAIL
150 160 170 180 190 200
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 ESVTLSSPALGQLVKSEVPLDRLLVHLQVMNQQLQTKAMALLTALLQGASPVERKHMLDY
::..:.: : : : .:. . .:. ::: .:..:: ..:...::. : .:..: .
CCDS54 ESMVLNSHDLYQKVAQEITIGQLIPHLQGSDQEIQTYTIAVINALFLKAPDERRQEMANI
210 220 230 240 250 260
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 LWQRNLRQFIYKNIIHSAAPMGDEMAHHLYVLQALMLGLLEPRMRTPLDPYSQEQREQLQ
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CCDS54 LAQKQLRSIILTHVIRAQRAINNEMAHQLYVLQVLTFNLLEDRMMTKMDPQDQAQRDIIF
270 280 290 300 310 320
210 220 230 240 250
pF1KE3 VLRQAAFEVEGESSGAGLSADRRRSLCAREFRKLGFSNS-NPAQDLERVPPGLLALDNML
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CCDS54 ELRRIAFDAESEPNNSSGSMEKRKSMYTRDYKKLGFINHVNPAMDFTQTPPGMLALDNML
330 340 350 360 370 380
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 YFSRNAPSAYSRFVLENSSREDKHECPFARGSIQLTVLLCELLRVGEPCSETAQDFSPMF
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CCDS54 YFAKHHQDAYIRIVLENSSREDKHECPFGRSSIELTKMLCEILKVGELPSETCNDFHPMF
390 400 410 420 430 440
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 FGQDQSFHELFCVGIQLLNKTWKEMRATQEDFDKVMQVVREQLARTLALKPTSLELFRTK
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CCDS54 FTHDRSFEEFFCICIQLLNKTWKEMRATSEDFNKVMQVVKEQVMRALTTKPSSLDQFKSK
450 460 470 480 490 500
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 VNALTYGEVLRLRQTERLHQEGTLAPPILELREKLKPELMGLIRQQRLLRLCEGTLFRKI
.. :.: :.:..::.::..:: . :::::.::..::.. ::.:::: :: ::: :::.
CCDS54 LQNLSYTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILELKEKIQPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKL
510 520 530 540 550 560
440 450 460 470 480 490
pF1KE3 SSRRRQDKLWFCCLSPNHKLLQYGDMEE---GASPPTLESLPEQLPVADMRALLTGKDCP
..::::::.:.: ::::::.:.:::.:: : : .:: ..:::::..:..::::::
CCDS54 NARRRQDKFWYCRLSPNHKVLHYGDLEESPQGEVPH--DSLQDKLPVADIKAVVTGKDCP
570 580 590 600 610 620
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 HVREKGSGKQNKDLYELAFSISYDRGEEEAYLNFIAPSKREFYLWTDGLSALLGSPMGSE
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CCDS54 HMKEKGALKQNKEVLELAFSILYDSNCQ---LNFIAPDKHEYCIWTDGLNALLGKDMMSD
630 640 650 660 670 680
560 570 580 590 600
pF1KE3 QTRLDLEQLLTMETKLRLLELENVPIPERPPPVPPPPTNFNFCYDCSIAEP
:: ::. ::.:: :::::.:::. ::. :::.: :.:..: :::.
CCDS54 LTRNDLDTLLSMEIKLRLLDLENIQIPDAPPPIPKEPSNYDFVYDCN
690 700 710 720
>>CCDS82623.1 ELMO2 gene_id:63916|Hs108|chr20 (632 aa)
initn: 1728 init1: 985 opt: 2092 Z-score: 2153.6 bits: 408.6 E(32554): 1.2e-113
Smith-Waterman score: 2092; 51.4% identity (80.7% similar) in 605 aa overlap (3-600:28-629)
10 20 30
pF1KE3 MIFAREVISRNGLQILGTIIEDGDDL----GEVLA
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CCDS82 MERTQSSNMETRLDAMKELAKLSADVTFATEFINMDGIIVLTRLVESGTKLLSHYSEMLA
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 LSLRAFSELMEHGVVSWETLSIPFVRKVVCYVNMNLMDASVPPLALGLLESVTLSSPALG
..: :: :::.::.:::. .:: :..... ::.. ..:.:. .:..:::..:.: .:
CCDS82 FTLTAFLELMDHGIVSWDMVSITFIKQIAGYVSQPMVDVSILQRSLAILESMVLNSQSLY
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 QLVKSEVPLDRLLVHLQVMNQQLQTKAMALLTALLQGASPVERKHMLDYLWQRNLRQFIY
: . :. . .:. :::: ::..:: :.::..::. : .:. : . . :..::..:
CCDS82 QKIAEEITVGQLISHLQVSNQEIQTYAIALINALFLKAPEDKRQDMANAFAQKHLRSIIL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 KNIIHSAAPMGDEMAHHLYVLQALMLGLLEPRMRTPLDPYSQEQREQLQVLRQAAFEVEG
...:.. :. ::::.:::::.: ..::: :: : .:: .: ::. . ::. ::..:.
CCDS82 NHVIRGNRPIKTEMAHQLYVLQVLTFNLLEERMMTKMDPNDQAQRDIIFELRRIAFDAES
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KE3 ESSGA-GLSADRRRSLCAREFRKLGFSNS-NPAQDLERVPPGLLALDNMLYFSRNAPSAY
. :.: : ....:... ..... :::.: :::.:. ..:::.::::::::... ..:
CCDS82 DPSNAPGSGTEKRKAMYTKDYKMLGFTNHINPAMDFTQTPPGMLALDNMLYLAKVHQDTY
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 SRFVLENSSREDKHECPFARGSIQLTVLLCELLRVGEPCSETAQDFSPMFFGQDQSFHEL
:.:::::::::::::::.:..:.:: .:::.:.::: .: .:. :::: .:..:.::
CCDS82 IRIVLENSSREDKHECPFGRSAIELTKMLCEILQVGELPNEGRNDYHPMFFTHDRAFEEL
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 FCVGIQLLNKTWKEMRATQEDFDKVMQVVREQLARTLALKPTSLELFRTKVNALTYGEVL
: . :::::::::::::: :::.:::::::::..:.: ::.::. :..:. .:.:.:.:
CCDS82 FGICIQLLNKTWKEMRATAEDFNKVMQVVREQITRALPSKPNSLDQFKSKLRSLSYSEIL
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 RLRQTERLHQEGTLAPPILELREKLKPELMGLIRQQRLLRLCEGTLFRKISSRRRQDKLW
::::.::. :. .:::.:::::..::.. ::.:::: :::::. ::::..::::...:
CCDS82 RLRQSERMSQDDFQSPPIVELREKIQPEILELIKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQERFW
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 FCCLSPNHKLLQYGDMEEGASPP-TLESLPEQLPVADMRALLTGKDCPHVREKGSGKQNK
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CCDS82 YCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGEVTFESLQEKIPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALKQNK
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 DLYELAFSISYDRGEEEAYLNFIAPSKREFYLWTDGLSALLGSPMGSEQTRLDLEQLLTM
.. :::::: :: : ::::::.: :. .: ::::::::. :.:: :. ::. ::.:
CCDS82 EVLELAFSILYDPDET---LNFIAPNKYEYCIWIDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTLLSM
550 560 570 580 590
570 580 590 600
pF1KE3 ETKLRLLELENVPIPERPPPVPPPPTNFNFCYDCSIAEP
: :::::.:::. ::: :::.: :....: :
CCDS82 EMKLRLLDLENIQIPEAPPPIPKEPSSYDFVYHYG
600 610 620 630
>>CCDS13398.1 ELMO2 gene_id:63916|Hs108|chr20 (720 aa)
initn: 1728 init1: 985 opt: 2092 Z-score: 2152.7 bits: 408.6 E(32554): 1.4e-113
Smith-Waterman score: 2092; 51.4% identity (80.7% similar) in 605 aa overlap (3-600:116-717)
10 20
pF1KE3 MIFAREVISRNGLQILGTIIEDGDDL----GE
:: : :. .:. .: ..:.: : .:
CCDS13 RQLMERTQSSNMETRLDAMKELAKLSADVTFATEFINMDGIIVLTRLVESGTKLLSHYSE
90 100 110 120 130 140
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 VLALSLRAFSELMEHGVVSWETLSIPFVRKVVCYVNMNLMDASVPPLALGLLESVTLSSP
.::..: :: :::.::.:::. .:: :..... ::.. ..:.:. .:..:::..:.:
CCDS13 MLAFTLTAFLELMDHGIVSWDMVSITFIKQIAGYVSQPMVDVSILQRSLAILESMVLNSQ
150 160 170 180 190 200
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 ALGQLVKSEVPLDRLLVHLQVMNQQLQTKAMALLTALLQGASPVERKHMLDYLWQRNLRQ
.: : . :. . .:. :::: ::..:: :.::..::. : .:. : . . :..::.
CCDS13 SLYQKIAEEITVGQLISHLQVSNQEIQTYAIALINALFLKAPEDKRQDMANAFAQKHLRS
210 220 230 240 250 260
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 FIYKNIIHSAAPMGDEMAHHLYVLQALMLGLLEPRMRTPLDPYSQEQREQLQVLRQAAFE
.: ...:.. :. ::::.:::::.: ..::: :: : .:: .: ::. . ::. ::.
CCDS13 IILNHVIRGNRPIKTEMAHQLYVLQVLTFNLLEERMMTKMDPNDQAQRDIIFELRRIAFD
270 280 290 300 310 320
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 VEGESSGA-GLSADRRRSLCAREFRKLGFSNS-NPAQDLERVPPGLLALDNMLYFSRNAP
.:.. :.: : ....:... ..... :::.: :::.:. ..:::.::::::::...
CCDS13 AESDPSNAPGSGTEKRKAMYTKDYKMLGFTNHINPAMDFTQTPPGMLALDNMLYLAKVHQ
330 340 350 360 370 380
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 SAYSRFVLENSSREDKHECPFARGSIQLTVLLCELLRVGEPCSETAQDFSPMFFGQDQSF
..: :.:::::::::::::::.:..:.:: .:::.:.::: .: .:. :::: .:..:
CCDS13 DTYIRIVLENSSREDKHECPFGRSAIELTKMLCEILQVGELPNEGRNDYHPMFFTHDRAF
390 400 410 420 430 440
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 HELFCVGIQLLNKTWKEMRATQEDFDKVMQVVREQLARTLALKPTSLELFRTKVNALTYG
.::: . :::::::::::::: :::.:::::::::..:.: ::.::. :..:. .:.:.
CCDS13 EELFGICIQLLNKTWKEMRATAEDFNKVMQVVREQITRALPSKPNSLDQFKSKLRSLSYS
450 460 470 480 490 500
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 EVLRLRQTERLHQEGTLAPPILELREKLKPELMGLIRQQRLLRLCEGTLFRKISSRRRQD
:.:::::.::. :. .:::.:::::..::.. ::.:::: :::::. ::::..::::.
CCDS13 EILRLRQSERMSQDDFQSPPIVELREKIQPEILELIKQQRLNRLCEGSSFRKIGNRRRQE
510 520 530 540 550 560
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 KLWFCCLSPNHKLLQYGDMEEGASPP-TLESLPEQLPVADMRALLTGKDCPHVREKGSGK
..:.: :. :::.:.:::.... . :.::: :..::::..:..:::::::..::.. :
CCDS13 RFWYCRLALNHKVLHYGDLDDNPQGEVTFESLQEKIPVADIKAIVTGKDCPHMKEKSALK
570 580 590 600 610 620
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 QNKDLYELAFSISYDRGEEEAYLNFIAPSKREFYLWTDGLSALLGSPMGSEQTRLDLEQL
:::.. :::::: :: : ::::::.: :. .: ::::::::. :.:: :. ::. :
CCDS13 QNKEVLELAFSILYDPDET---LNFIAPNKYEYCIWIDGLSALLGKDMSSELTKSDLDTL
630 640 650 660 670 680
570 580 590 600
pF1KE3 LTMETKLRLLELENVPIPERPPPVPPPPTNFNFCYDCSIAEP
:.:: :::::.:::. ::: :::.: :....: :
CCDS13 LSMEMKLRLLDLENIQIPEAPPPIPKEPSSYDFVYHYG
690 700 710 720
>>CCDS5450.1 ELMO1 gene_id:9844|Hs108|chr7 (247 aa)
initn: 1045 init1: 486 opt: 1011 Z-score: 1047.1 bits: 202.5 E(32554): 5.3e-52
Smith-Waterman score: 1011; 57.9% identity (82.9% similar) in 252 aa overlap (355-603:1-247)
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 SFHELFCVGIQLLNKTWKEMRATQEDFDKVMQVVREQLARTLALKPTSLELFRTKVNALT
::::.::. :.:. ::.::. :..:.. :.
CCDS54 MQVVKEQVMRALTTKPSSLDQFKSKLQNLS
10 20 30
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 YGEVLRLRQTERLHQEGTLAPPILELREKLKPELMGLIRQQRLLRLCEGTLFRKISSRRR
: :.:..::.::..:: . :::::.::..::.. ::.:::: :: ::: :::...:::
CCDS54 YTEILKIRQSERMNQEDFQSRPILELKEKIQPEILELIKQQRLNRLVEGTCFRKLNARRR
40 50 60 70 80 90
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 QDKLWFCCLSPNHKLLQYGDMEE---GASPPTLESLPEQLPVADMRALLTGKDCPHVREK
:::.:.: ::::::.:.:::.:: : : .:: ..:::::..:..:::::::..::
CCDS54 QDKFWYCRLSPNHKVLHYGDLEESPQGEVPH--DSLQDKLPVADIKAVVTGKDCPHMKEK
100 110 120 130 140
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 GSGKQNKDLYELAFSISYDRGEEEAYLNFIAPSKREFYLWTDGLSALLGSPMGSEQTRLD
:. ::::.. :::::: :: . . ::::::.:.:. .:::::.::::. : :. :: :
CCDS54 GALKQNKEVLELAFSILYDSNCQ---LNFIAPDKHEYCIWTDGLNALLGKDMMSDLTRND
150 160 170 180 190 200
570 580 590 600
pF1KE3 LEQLLTMETKLRLLELENVPIPERPPPVPPPPTNFNFCYDCSIAEP
:. ::.:: :::::.:::. ::. :::.: :.:..: :::.
CCDS54 LDTLLSMEIKLRLLDLENIQIPDAPPPIPKEPSNYDFVYDCN
210 220 230 240
607 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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