Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3916
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3916, 468 aa
1>>>pF1KE3916 468 - 468 aa - 468 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1917+/-0.000916; mu= 13.3901+/- 0.055
mean_var=77.6599+/-15.703, 0's: 0 Z-trim(106.1): 79 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.145538
statistics sampled from 8708 (8787) to 8708 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16
Scan time: 2.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS59137.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 468) 3094 659.3 2.4e-189
CCDS75865.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 928) 3094 659.4 4.5e-189
CCDS35080.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 ( 917) 2406 514.9 1.4e-145
CCDS45314.1 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 ( 963) 1492 323.0 8.4e-88
CCDS32301.2 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 ( 914) 1344 291.9 1.8e-78
CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22 ( 749) 659 148.1 3e-35
CCDS9534.2 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 336) 565 128.2 1.3e-29
CCDS66591.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 344) 537 122.4 7.6e-28
CCDS56227.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 515) 469 108.1 2.2e-23
CCDS14522.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX (1120) 468 108.0 5.1e-23
CCDS47136.1 TBC1D9 gene_id:23158|Hs108|chr4 (1266) 467 107.9 6.6e-23
CCDS13874.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 ( 508) 461 106.5 6.9e-23
CCDS46375.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1140) 458 105.9 2.2e-22
CCDS82486.1 TBC1D8 gene_id:11138|Hs108|chr2 (1155) 458 106.0 2.2e-22
CCDS4450.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1233) 457 105.8 2.8e-22
CCDS43408.1 TBC1D9B gene_id:23061|Hs108|chr5 (1250) 457 105.8 2.8e-22
CCDS8162.1 TBC1D10C gene_id:374403|Hs108|chr11 ( 446) 450 104.1 3e-22
CCDS10676.2 TBC1D10B gene_id:26000|Hs108|chr16 ( 808) 436 101.3 4e-21
CCDS12188.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 794) 393 92.3 2.1e-18
CCDS54209.1 EVI5L gene_id:115704|Hs108|chr19 ( 805) 393 92.3 2.1e-18
CCDS30774.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 810) 375 88.5 2.9e-17
CCDS76179.1 EVI5 gene_id:7813|Hs108|chr1 ( 821) 375 88.5 2.9e-17
CCDS1314.1 RABGAP1L gene_id:9910|Hs108|chr1 ( 815) 373 88.1 3.9e-17
CCDS53492.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 828) 373 88.1 3.9e-17
CCDS44357.1 USP6NL gene_id:9712|Hs108|chr10 ( 845) 373 88.1 4e-17
CCDS33972.1 TBC1D1 gene_id:23216|Hs108|chr4 (1168) 374 88.3 4.6e-17
CCDS6848.2 RABGAP1 gene_id:23637|Hs108|chr9 (1069) 369 87.3 8.8e-17
CCDS66563.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1235) 366 86.6 1.6e-16
CCDS66564.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1290) 366 86.7 1.6e-16
CCDS41901.1 TBC1D4 gene_id:9882|Hs108|chr13 (1298) 366 86.7 1.6e-16
CCDS73606.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 ( 236) 333 79.5 4.3e-15
CCDS11069.2 USP6 gene_id:9098|Hs108|chr17 (1406) 319 76.8 1.6e-13
CCDS74040.1 TBC1D3G gene_id:101060321|Hs108|chr17 ( 549) 296 71.8 2e-12
CCDS74042.1 TBC1D3K gene_id:101060351|Hs108|chr17 ( 549) 294 71.4 2.7e-12
CCDS45653.1 TBC1D3H gene_id:729877|Hs108|chr17 ( 549) 293 71.2 3.1e-12
CCDS74044.1 LOC101060389 gene_id:101060389|Hs108|c ( 549) 291 70.8 4.1e-12
CCDS74045.1 TBC1D3C gene_id:414060|Hs108|chr17 ( 549) 291 70.8 4.1e-12
CCDS45658.1 TBC1D3 gene_id:729873|Hs108|chr17 ( 549) 291 70.8 4.1e-12
CCDS74043.1 TBC1D3L gene_id:101060376|Hs108|chr17 ( 549) 291 70.8 4.1e-12
CCDS74039.1 TBC1D3I gene_id:102724862|Hs108|chr17 ( 549) 289 70.4 5.5e-12
CCDS77009.1 TBC1D3E gene_id:102723859|Hs108|chr17 ( 549) 287 69.9 7.4e-12
CCDS75104.1 TBC1D14 gene_id:57533|Hs108|chr4 ( 353) 283 69.0 8.9e-12
CCDS14523.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX ( 632) 286 69.8 9.7e-12
CCDS42300.1 TBC1D3B gene_id:414059|Hs108|chr17 ( 549) 285 69.5 9.9e-12
CCDS47006.1 TBC1D14 gene_id:57533|Hs108|chr4 ( 413) 283 69.1 1e-11
CCDS82909.1 TBC1D14 gene_id:57533|Hs108|chr4 ( 465) 283 69.1 1.1e-11
CCDS3394.2 TBC1D14 gene_id:57533|Hs108|chr4 ( 693) 283 69.1 1.6e-11
>>CCDS59137.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 (468 aa)
initn: 3094 init1: 3094 opt: 3094 Z-score: 3512.7 bits: 659.3 E(32554): 2.4e-189
Smith-Waterman score: 3094; 100.0% identity (100.0% similar) in 468 aa overlap (1-468:1-468)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MEAYRTQNCFLNSEIHQVTKIWRKVAEKEKALLTKCAYLQARNCQVESKYLAGLRRLQEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MEAYRTQNCFLNSEIHQVTKIWRKVAEKEKALLTKCAYLQARNCQVESKYLAGLRRLQEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LGDEASECSELLRQLVQEALQWEAGEASSDSIELSPISKYDEYGFLTVPDYEVEDLKLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LGDEASECSELLRQLVQEALQWEAGEASSDSIELSPISKYDEYGFLTVPDYEVEDLKLLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 KIQALESRSHHLLGLEAVDRPLRERWAALGDLVPSAELKQLLRAGVPREHRPRVWRWLVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KIQALESRSHHLLGLEAVDRPLRERWAALGDLVPSAELKQLLRAGVPREHRPRVWRWLVH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 LRVQHLHTPGCYQELLSRGQAREHPAARQIELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LRVQHLHTPGCYQELLSRGQAREHPAARQIELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 AFSWQNPTIGYCQGLNRLAAIALLVLEEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AFSWQNPTIGYCQGLNRLAAIALLVLEEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 RVLQDLLSEKLPRLMAHLGQHHVDLSLVTFNWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RVLQDLLSEKLPRLMAHLGQHHVDLSLVTFNWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTKV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 VFRYALAIFKYNEKEILRLQNGLEIYQYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VFRYALAIFKYNEKEILRLQNGLEIYQYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KE3 LRMVHRERLEAELRELEQLKAEYLERRASRRRAVSEGCASEDEVEGEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LRMVHRERLEAELRELEQLKAEYLERRASRRRAVSEGCASEDEVEGEA
430 440 450 460
>>CCDS75865.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 (928 aa)
initn: 3094 init1: 3094 opt: 3094 Z-score: 3507.9 bits: 659.4 E(32554): 4.5e-189
Smith-Waterman score: 3094; 100.0% identity (100.0% similar) in 468 aa overlap (1-468:461-928)
10 20 30
pF1KE3 MEAYRTQNCFLNSEIHQVTKIWRKVAEKEK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HPPDQSPLRPDAANRDFLSQQGKIEHLKDDMEAYRTQNCFLNSEIHQVTKIWRKVAEKEK
440 450 460 470 480 490
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 ALLTKCAYLQARNCQVESKYLAGLRRLQEALGDEASECSELLRQLVQEALQWEAGEASSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ALLTKCAYLQARNCQVESKYLAGLRRLQEALGDEASECSELLRQLVQEALQWEAGEASSD
500 510 520 530 540 550
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 SIELSPISKYDEYGFLTVPDYEVEDLKLLAKIQALESRSHHLLGLEAVDRPLRERWAALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SIELSPISKYDEYGFLTVPDYEVEDLKLLAKIQALESRSHHLLGLEAVDRPLRERWAALG
560 570 580 590 600 610
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 DLVPSAELKQLLRAGVPREHRPRVWRWLVHLRVQHLHTPGCYQELLSRGQAREHPAARQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DLVPSAELKQLLRAGVPREHRPRVWRWLVHLRVQHLHTPGCYQELLSRGQAREHPAARQI
620 630 640 650 660 670
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 ELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQNPTIGYCQGLNRLAAIALLVLEEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQNPTIGYCQGLNRLAAIALLVLEEEE
680 690 700 710 720 730
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 SAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDLLSEKLPRLMAHLGQHHVDLSLVTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDLLSEKLPRLMAHLGQHHVDLSLVTF
740 750 760 770 780 790
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 NWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTKVVFRYALAIFKYNEKEILRLQNGLEIYQYLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTKVVFRYALAIFKYNEKEILRLQNGLEIYQYLR
800 810 820 830 840 850
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 FFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHRERLEAELRELEQLKAEYLERRASR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHRERLEAELRELEQLKAEYLERRASR
860 870 880 890 900 910
460
pF1KE3 RRAVSEGCASEDEVEGEA
::::::::::::::::::
CCDS75 RRAVSEGCASEDEVEGEA
920
>>CCDS35080.1 TBC1D2 gene_id:55357|Hs108|chr9 (917 aa)
initn: 2402 init1: 2402 opt: 2406 Z-score: 2727.3 bits: 514.9 E(32554): 1.4e-145
Smith-Waterman score: 2995; 97.6% identity (97.6% similar) in 468 aa overlap (1-468:461-917)
10 20 30
pF1KE3 MEAYRTQNCFLNSEIHQVTKIWRKVAEKEK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 HPPDQSPLRPDAANRDFLSQQGKIEHLKDDMEAYRTQNCFLNSEIHQVTKIWRKVAEKEK
440 450 460 470 480 490
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 ALLTKCAYLQARNCQVESKYLAGLRRLQEALGDEASECSELLRQLVQEALQWEAGEASSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ALLTKCAYLQARNCQVESKYLAGLRRLQEALGDEASECSELLRQLVQEALQWEAGEASSD
500 510 520 530 540 550
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 SIELSPISKYDEYGFLTVPDYEVEDLKLLAKIQALESRSHHLLGLEAVDRPLRERWAALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SIELSPISKYDEYGFLTVPDYEVEDLKLLAKIQALESRSHHLLGLEAVDRPLRERWAALG
560 570 580 590 600 610
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 DLVPSAELKQLLRAGVPREHRPRVWRWLVHLRVQHLHTPGCYQELLSRGQAREHPAARQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DLVPSAELKQLLRAGVPREHRPRVWRWLVHLRVQHLHTPGCYQELLSRGQAREHPAARQI
620 630 640 650 660 670
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 ELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQNPTIGYCQGLNRLAAIALLVLEEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQNPTIGYCQGLNRLAAIALLVLEEEE
680 690 700 710 720 730
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 SAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDLLSEKLPRLMAHLGQHHVDLSLVTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDLLSEKLPRLMAHLGQHHVDLSLVTF
740 750 760 770 780 790
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 NWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTKVVFRYALAIFKYNEKEILRLQNGLEIYQYLR
::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS35 NWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTK-----------YNEKEILRLQNGLEIYQYLR
800 810 820 830
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 FFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHRERLEAELRELEQLKAEYLERRASR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHRERLEAELRELEQLKAEYLERRASR
840 850 860 870 880 890
460
pF1KE3 RRAVSEGCASEDEVEGEA
::::::::::::::::::
CCDS35 RRAVSEGCASEDEVEGEA
900 910
>>CCDS45314.1 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 (963 aa)
initn: 1505 init1: 757 opt: 1492 Z-score: 1689.8 bits: 323.0 E(32554): 8.4e-88
Smith-Waterman score: 1492; 49.7% identity (80.5% similar) in 457 aa overlap (1-447:493-946)
10 20 30
pF1KE3 MEAYRTQNCFLNSEIHQVTKIWRKVAEKEK
...:.::: :::.:: ... . :.. ..:.
CCDS45 NGPPPTVAPSSPSVVPVARDQLELDRLKDNLQGYKTQNKFLNKEILELSALRRNAERRER
470 480 490 500 510 520
40 50 60 70 80
pF1KE3 ALLTKCAYLQARNCQVESKYLAGLRRLQEAL-GDEASECSELLRQLVQEALQWEAGEASS
:..: . :.:. ::.::::: :.... . ... . :.. ::...::: :. :
CCDS45 DLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQLLEDALQVESQEQPE
530 540 550 560 570 580
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 DSIELSP--ISKYDEYGFLTVPDYEVEDLKLLAKIQALESRSHHLLGLEAVDRPLR-ERW
... ..: .:.:: ::: :::. . :. ::.::..::. .. .: . :. .. : .
CCDS45 QAF-VKPHLVSEYDIYGFRTVPEDD-EEEKLVAKVRALDLKTLYLTENQEVSTGVKWENY
590 600 610 620 630 640
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 AALG---DLVPSAELKQLLRAGVPREHRPRVWRWLV--HLRVQHLHT-PGCYQELLSRGQ
: ... : :::.:.:::.:.::: .::.: : : : . .: :: .: ::...
CCDS45 FASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTEPGHFQTLLQKAL
650 660 670 680 690 700
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 AREHPAARQIELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQNPTIGYCQGLNRLAA
...::..:::::: ::.:::::..:::: .::: :::::::.:: ::::::::::.:
CCDS45 EKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPDIGYCQGLNRLVA
710 720 730 740 750 760
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 IALLVLEEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDLLSEKLPRLMAHLGQ
.::: ::.:. ::::::.:::..:: ::: .:: .:::::::..::.::::::: .:. :
CCDS45 VALLYLEQED-AFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSEKLPRLHGHFEQ
770 780 790 800 810
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 HHVDLSLVTFNWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTKVVFRYALAIFKYNEKEILRLQ
..:: .:.:::::::::.::..:.::...::.::::: ::.::.:::.:::.:.:::.::
CCDS45 YKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFALALFKYKEEEILKLQ
820 830 840 850 860 870
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 NGLEIYQYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHRERLEAELRELEQLK
... :..:::.::.:: ..:::..:.:.:.::: ..:.:. : : :... :: ::: ..
CCDS45 DSMSIFKYLRYFTRTILDARKLISISFGDLNPFPLRQIRNRRAYHLEKVRLELTELEAIR
880 890 900 910 920 930
450 460
pF1KE3 AEYLERRASRRRAVSEGCASEDEVEGEA
..:..:
CCDS45 EDFLRERDTSPDKGELVSDEEEDT
940 950 960
>>CCDS32301.2 TBC1D2B gene_id:23102|Hs108|chr15 (914 aa)
initn: 1323 init1: 609 opt: 1344 Z-score: 1522.2 bits: 291.9 E(32554): 1.8e-78
Smith-Waterman score: 1344; 50.5% identity (80.5% similar) in 410 aa overlap (1-400:493-899)
10 20 30
pF1KE3 MEAYRTQNCFLNSEIHQVTKIWRKVAEKEK
...:.::: :::.:: ... . :.. ..:.
CCDS32 NGPPPTVAPSSPSVVPVARDQLELDRLKDNLQGYKTQNKFLNKEILELSALRRNAERRER
470 480 490 500 510 520
40 50 60 70 80
pF1KE3 ALLTKCAYLQARNCQVESKYLAGLRRLQEAL-GDEASECSELLRQLVQEALQWEAGEASS
:..: . :.:. ::.::::: :.... . ... . :.. ::...::: :. :
CCDS32 DLMAKYSSLEAKLCQIESKYLILLQEMKTPVCSEDQGPTREVIAQLLEDALQVESQEQPE
530 540 550 560 570 580
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 DSIELSP--ISKYDEYGFLTVPDYEVEDLKLLAKIQALESRSHHLLGLEAVDRPLR-ERW
... ..: .:.:: ::: :::. . :. ::.::..::. .. .: . :. .. : .
CCDS32 QAF-VKPHLVSEYDIYGFRTVPEDDEEE-KLVAKVRALDLKTLYLTENQEVSTGVKWENY
590 600 610 620 630 640
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 AALG---DLVPSAELKQLLRAGVPREHRPRVWRWLV--HLRVQHLHT-PGCYQELLSRGQ
: ... : :::.:.:::.:.::: .::.: : : : . .: :: .: ::...
CCDS32 FASTVNREMMCSPELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTEPGHFQTLLQKAL
650 660 670 680 690 700
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 AREHPAARQIELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQNPTIGYCQGLNRLAA
...::..:::::: ::.:::::..:::: .::: :::::::.:: ::::::::::.:
CCDS32 EKQNPASKQIELDLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPDIGYCQGLNRLVA
710 720 730 740 750 760
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 IALLVLEEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDLLSEKLPRLMAHLGQ
.::: ::.:. ::::::.:::..:: ::: .:: .:::::::..::.::::::: .:. :
CCDS32 VALLYLEQED-AFWCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSEKLPRLHGHFEQ
770 780 790 800 810
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 HHVDLSLVTFNWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTKVVFRYALAIFKYNEKEILRLQ
..:: .:.:::::::::.::..:.::...::.::::: ::.::.:::.:::.:.:::.::
CCDS32 YKVDYTLITFNWFLVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFALALFKYKEEEILKLQ
820 830 840 850 860 870
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 NGLEIYQYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHRERLEAELRELEQLK
... :..:::.::.:: ..:
CCDS32 DSMSIFKYLRYFTRTILDARSGTDAPTTWRKSGWS
880 890 900 910
>>CCDS14002.1 SGSM3 gene_id:27352|Hs108|chr22 (749 aa)
initn: 479 init1: 403 opt: 659 Z-score: 746.3 bits: 148.1 E(32554): 3e-35
Smith-Waterman score: 663; 33.3% identity (61.0% similar) in 415 aa overlap (77-465:22-419)
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 ESKYLAGLRRLQEALGDEASECSELLRQLVQEAL-QWEAGEASSDSIELSPISKYDEYGF
:: : .. : :... :. :::.::
CCDS14 MSGSHTPACGPFSALTPSIWPQEILAKYTQKEESAEQPEFY----YDEFGF
10 20 30 40
110 120 130 140 150
pF1KE3 LTVPDYEVED-LKLLAKIQALESRSHHLLGLEAVDRPLRERWAA---------LGDL---
. . : .:::. .: : : : :: : .:::
CCDS14 RVYKEEGDEPGSSLLANSPLME------------DAPQRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWD
50 60 70 80 90
160 170 180 190 200
pF1KE3 -----VPSAE-LKQLLRAGVPREHRPRVWRWLVHLRVQHLHTPGCYQELLSRGQAREHPA
.: .: :..:. ::.:. ::..: : .. .. :.:... .. : :
CCDS14 KIAVSLPRSEKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMRLSGALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIA
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 ARQIELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQNPTIGYCQGLNRLAAIALLVL
:.::: :: ::.:.: :. : .::::: :..: : :::::: . .:: :: :
CCDS14 AKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFL
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 EEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDLLSEKLPRLMAHLGQHHVDLS
:::. ::: . ::.: ..::.:. .:: . :.:::::. :. . :::: : .: ..::
CCDS14 EEED-AFWMMSAIIEDLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELS
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 LVTFNWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTKVVFRYALAIFKYNEKEILRLQNGLEIY
:.:..:::..::. . ..:::.:: :.:::..:.:. .:.... .:.:... .:. :.
CCDS14 LITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIF
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 QYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHRERLEAELRELEQLK-----A
. : . . . ... :...:. . . .. : : : :. .: .
CCDS14 NTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYLIADQGQLLGAGTLTNLS
340 350 360 370 380 390
450 460
pF1KE3 EYLERRASRRRA-VSEGCASEDEVEGEA
. ..::..::.. .. .::..:
CCDS14 QVVRRRTQRRKSTITALLFGEDDLEALKAKNIKQTELVADLREAILRVARHFQCTDPKNC
400 410 420 430 440 450
>>CCDS9534.2 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 (336 aa)
initn: 347 init1: 242 opt: 565 Z-score: 645.3 bits: 128.2 E(32554): 1.3e-29
Smith-Waterman score: 571; 33.7% identity (61.1% similar) in 347 aa overlap (93-432:5-335)
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DEASECSELLRQLVQEALQWEAGEASSDSIELSPISKYDEYGFLTVPDYEVEDLKLLAKI
: : . . : ::: :. .: :
CCDS95 MQPAERSRVPRIDPYGFERPEDF--DD----AAY
10 20
130 140 150 160 170
pF1KE3 QALESRSHHLLGLEAVDRPLRERWAAL--GDLVP-SAELKQLLRAGVPREHRPRVWRWLV
. . : : .:. .:. : : :: : .:. .: ::: ::: ::: :
CCDS95 EKFFSSYLVTLTRRAI------KWSRLLQGGGVPRSRTVKRYVRKGVPLEHRARVWMVLS
30 40 50 60 70 80
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 HLRVQHLHTPGCYQELLSRGQAREHPAARQ-IELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDK-LRR
..: ..:: :..:: :....: .. :. :::::::.: .: :. .. :
CCDS95 GAQAQMDQNPGYYHQLL---QGERNPRLEDAIRTDLNRTFPDNVKFRKTTDPCLQRTLYN
90 100 110 120 130
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 VLLAFSWQNPTIGYCQGLNRLAAIALLVLEEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQ
::::.. .: .:::::.: .:. .:. ..:: .:: : :.: :.: ::: .. . .
CCDS95 VLLAYGHHNQGVGYCQGMNFIAGYLILITNNEEESFWLLDALVGRILP-DYYSPAMLGLK
140 150 160 170 180 190
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 VDQRVLQDLLSEKLPRLMAHLGQHHVDLSLVTFNWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEG
.::.:: .:. ::: . : . . : .:.. ::. .:.: : . .::.:: .. ::
CCDS95 TDQEVLGELVRAKLPAVGALMERLGVLWTLLVSRWFICLFVDILPVETVLRIWDCLFNEG
200 210 220 230 240 250
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 TKVVFRYALAIFKYNEKEILRLQNGLEIYQYLRFFTKT--ISNSRKLMNIAFNDMNPFRM
.:..:: ::...: ... ::. . .: . .. .:: . . . .:. :.. . . :
CCDS95 SKIIFRVALTLIKQHQELILEATSVPDICDKFKQITKGSFVMECHTFMQKIFSEPGSLSM
260 270 280 290 300 310
420 430 440 450 460
pF1KE3 KQLRQLRMVHRERLEAELRELEQLKAEYLERRASRRRAVSEGCASEDEVEGEA
. .:: : :: :.
CCDS95 ATVAKLRESCRARLLAQG
320 330
>>CCDS66591.1 GRTP1 gene_id:79774|Hs108|chr13 (344 aa)
initn: 347 init1: 242 opt: 537 Z-score: 613.3 bits: 122.4 E(32554): 7.6e-28
Smith-Waterman score: 543; 35.2% identity (62.2% similar) in 307 aa overlap (93-394:5-295)
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DEASECSELLRQLVQEALQWEAGEASSDSIELSPISKYDEYGFLTVPDYEVEDLKLLAKI
: : . . : ::: :.. : :
CCDS66 MQPAERSRVPRIDPYGFERPEDFD--D----AAY
10 20
130 140 150 160 170
pF1KE3 QALESRSHHLLGLEAVDRPLRERWAAL--GDLVP-SAELKQLLRAGVPREHRPRVWRWLV
. . : : .:. .:. : : :: : .:. .: ::: ::: ::: :
CCDS66 EKFFSSYLVTLTRRAI------KWSRLLQGGGVPRSRTVKRYVRKGVPLEHRARVWMVLS
30 40 50 60 70 80
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 HLRVQHLHTPGCYQELLSRGQAREHPAARQ-IELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDK-LRR
..: ..:: :..:: :....: .. :. :::::::.: .: :. .. :
CCDS66 GAQAQMDQNPGYYHQLL---QGERNPRLEDAIRTDLNRTFPDNVKFRKTTDPCLQRTLYN
90 100 110 120 130
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 VLLAFSWQNPTIGYCQGLNRLAAIALLVLEEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQ
::::.. .: .:::::.: .:. .:. ..:: .:: : :.: :.: ::: .. . .
CCDS66 VLLAYGHHNQGVGYCQGMNFIAGYLILITNNEEESFWLLDALVGRILP-DYYSPAMLGLK
140 150 160 170 180 190
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 VDQRVLQDLLSEKLPRLMAHLGQHHVDLSLVTFNWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEG
.::.:: .:. ::: . : . . : .:.. ::. .:.: : . .::.:: .. ::
CCDS66 TDQEVLGELVRAKLPAVGALMERLGVLWTLLVSRWFICLFVDILPVETVLRIWDCLFNEG
200 210 220 230 240 250
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 TKVVFRYALAIFKYNEKEILRLQNGLEIYQYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQ
.:..:: ::...: ... ::. . .: . .. .::
CCDS66 SKIIFRVALTLIKQHQELILEATSVPDICDKFKQITKGSFVMECHTFMQVCGAARGSVPS
260 270 280 290 300 310
420 430 440 450 460
pF1KE3 LRQLRMVHRERLEAELRELEQLKAEYLERRASRRRAVSEGCASEDEVEGEA
CCDS66 QGAPPHLQPGGCSDHPEGAQDGHQWA
320 330 340
>>CCDS56227.1 TBC1D10A gene_id:83874|Hs108|chr22 (515 aa)
initn: 386 init1: 204 opt: 469 Z-score: 533.3 bits: 108.1 E(32554): 2.2e-23
Smith-Waterman score: 469; 29.9% identity (57.5% similar) in 405 aa overlap (62-450:9-393)
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 LLTKCAYLQARNCQVESKYLAGLRRLQEALGDEASECSELLRQLVQEALQWEAGEASSDS
: .: .: : ..:.: :..:
CCDS56 MAKSNGENGPRAPAAGESLSG-TRESLAQGPDAATTD-
10 20 30
100 110 120 130 140
pF1KE3 IELSPISKYDEY-GFLTVPDYEVEDLKLLAKIQALESRSHHLLG-LEAVD-RPLRERWAA
::: ... .: :: . ... . ... :. :. :: :: : . ::.: .
CCDS56 -ELSSLGSDSEANGF---AERRIDKFGFIVGSQGAEGAPCPLLHRLEEVPLEVLRQRESK
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190
pF1KE3 LGDLVPS-----AELKQLLR----AGVPREHRPRVWRWLVHLRVQHLHTPGCYQEL-LSR
:.. . :. .. .: :.: : :.:..: .:. ..:: ..:: .:
CCDS56 WLDMLNNWDKWMAKKHKKIRLRCQKGIPPSLRGRAWQYLSGGKVKLQQNPGKFDELDMSP
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 GQAREHPAARQIELDLNRTFPNNKHFTCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQNPTIGYCQGLNRL
:. . . :: ::.: :: .. :. . . : ::: :.. : ::::. .
CCDS56 GDPKWLDV---IERDLHRQFPFHEMFVSRGGHGQQDLFRVLKAYTLYRPEEGYCQAQAPI
160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 AAIALLVLEEEESAFWCLVAIVETIMPADYYCNTLTASQVDQRVLQDLLSEKLPRLMAHL
::. :. . :. :::::: : : .:. :: . : : :.: ..: .::.. : ::
CCDS56 AAVLLMHMPAEQ-AFWCLVQICEKYLPG-YYSEKLEAIQLDGEILFSLLQKVSPVAHKHL
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 GQHHVDLSLVTFNWFLVVFADSLISNILLRVWDAFLYEGTKVVFRYALAIFKY---NEKE
.....: : .::. .:. .: . .::::: :. ::.:..:: .:...:. . ..
CCDS56 SRQKIDPLLYMTEWFMCAFSRTLPWSSVLRVWDMFFCEGVKIIFRVGLVLLKHALGSPEK
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 ILRLQNGLEIYQYLRFFTKTISNSRKLMNIAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHRERLEAELRE
. :. : . :: : : :.:. :: .. .. . :...::.: .::.
CCDS56 VKACQGQYETIERLR------SLSPKIMQEAFLVQEVVELPVTE--RQIEREHL-IQLRR
330 340 350 360 370
440 450 460
pF1KE3 LEQLKAEYLERRASRRRAVSEGCASEDEVEGEA
.. ..: : :
CCDS56 WQETRGELQCRSPPRLHGAKAILDAEPGPRPALQPSPSIRLPLDAPLPGSKAKPKPPKQA
380 390 400 410 420 430
>>CCDS14522.1 TBC1D8B gene_id:54885|Hs108|chrX (1120 aa)
initn: 378 init1: 139 opt: 468 Z-score: 526.8 bits: 108.0 E(32554): 5.1e-23
Smith-Waterman score: 468; 30.6% identity (62.0% similar) in 324 aa overlap (79-398:403-715)
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 KYLAGLRRLQEALGDEASECSELLRQLVQEALQWEAGEASSDSIELSPISKYDEYGFLTV
:.. :. : : :..:.. ... : . ::
CCDS14 EVKDFEQLVAKLRLRCGAASTQYHDISTELAISSESTEPS-DNFEVQSLTSQRECS-KTV
380 390 400 410 420 430
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 PDYEVEDLKLLAKIQALESRSHHLLGLEAVDRPLRERWAALG---DLVPSAELKQLLRAG
..: : . . : ::. . ..: . .. . .: : .. . . ..:. :
CCDS14 ---NTEALMTVFHPQNLETLNSKMLKEKMKEQSWKILFAECGRGVSMFRTKKTRDLVVRG
440 450 460 470 480
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 VPREHRPRVWRWLVHLRVQHLHT-PGCYQELLSRGQAREHPAARQIELDLNRTFPNNKHF
.:. : ..: : :. . : : : :.. .. . . :...:: :: :..:.. :
CCDS14 IPETLRGELW-MLFSGAVNDMATNPDYYTEVVEQSLGTCNLATEEIERDLRRSLPEHPAF
490 500 510 520 530 540
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 TCPTSSFPDKLRRVLLAFSWQNPTIGYCQGLNRLAAIALLVLEEEESAFWCLVAIVETIM
:. . ::::: :....:: :::::..: :... :: .::: ::: :::. : ..
CCDS14 QSDTGI--SALRRVLTAYAYRNPKIGYCQAMNILTSVLLLYAKEEE-AFWLLVAVCERML
550 560 570 580 590 600
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 PADYYCNTLTASQVDQRVLQDLLSEKLPRLMAHLGQHHVDLSLVTFNWFLVVFADSLISN
: ::. . .. ::: :...:. ..::.: :. . .: :...:::..: . : .
CCDS14 P-DYFNRRIIGALVDQAVFEELIRDHLPQLTEHMTDMTF-FSSVSLSWFLTLFISVLPIE
610 620 630 640 650 660
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 ILLRVWDAFLYEGTKVVFRYALAIFKYNEKEILRLQNGLEIYQYLRFFTKTISNSRKLMN
. : : :.:.: :.... .:::. :: ..: .. : : : ...:
CCDS14 SAVNVVDCFFYDGIKAILQLGLAILDYNLDKLLTCKDDAEAVTALNRFFDNVTNKDSPLP
670 680 690 700 710 720
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 IAFNDMNPFRMKQLRQLRMVHRERLEAELRELEQLKAEYLERRASRRRAVSEGCASEDEV
CCDS14 SNVQQGSNVSDEKTSHTRVDITDLIRESNEKYGNIRYEDIHSMRCRNRLYVIQTLEETTK
730 740 750 760 770 780
468 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 08:59:25 2016 done: Sun Nov 6 08:59:25 2016
Total Scan time: 2.790 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]