Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3907
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3907, 421 aa
1>>>pF1KE3907 421 - 421 aa - 421 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4163+/-0.000475; mu= 6.0095+/- 0.029
mean_var=145.6912+/-32.082, 0's: 0 Z-trim(112.9): 260 B-trim: 114 in 2/52
Lambda= 0.106257
statistics sampled from 21774 (22077) to 21774 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16
Scan time: 9.060
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011509226 (OMIM: 605991) PREDICTED: ephexin-1 i ( 433) 978 162.4 2.1e-39
XP_011509227 (OMIM: 605991) PREDICTED: ephexin-1 i ( 433) 978 162.4 2.1e-39
NP_001107562 (OMIM: 605991) ephexin-1 isoform 2 [H ( 618) 978 162.5 2.7e-39
XP_011509225 (OMIM: 605991) PREDICTED: ephexin-1 i ( 710) 978 162.5 3.1e-39
NP_062824 (OMIM: 605991) ephexin-1 isoform 1 [Homo ( 710) 978 162.5 3.1e-39
XP_011539008 (OMIM: 612496) PREDICTED: rho guanine ( 802) 843 141.9 5.7e-33
NP_694945 (OMIM: 612496) rho guanine nucleotide ex ( 802) 843 141.9 5.7e-33
NP_005426 (OMIM: 600888) rho guanine nucleotide ex (1597) 835 140.8 2.3e-32
NP_079290 (OMIM: 608504) rho guanine nucleotide ex ( 841) 649 112.1 5.3e-24
NP_776089 (OMIM: 608504) rho guanine nucleotide ex ( 841) 649 112.1 5.3e-24
XP_011522039 (OMIM: 608504) PREDICTED: rho guanine ( 439) 399 73.6 1.1e-12
XP_011522037 (OMIM: 608504) PREDICTED: rho guanine ( 856) 399 73.8 1.9e-12
XP_011522036 (OMIM: 608504) PREDICTED: rho guanine ( 856) 399 73.8 1.9e-12
XP_011522038 (OMIM: 608504) PREDICTED: rho guanine ( 792) 395 73.2 2.7e-12
NP_062541 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform 3 [ (1670) 320 61.9 1.4e-08
NP_006268 (OMIM: 604464) intersectin-2 isoform 1 [ (1697) 320 61.9 1.4e-08
XP_016883926 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1185) 305 59.5 5.2e-08
XP_016883925 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1608) 305 59.6 6.6e-08
XP_016883924 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1613) 305 59.6 6.7e-08
XP_016883923 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1645) 305 59.6 6.8e-08
XP_016883922 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1650) 305 59.6 6.8e-08
XP_016883919 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1679) 305 59.6 6.9e-08
XP_016883918 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1684) 305 59.6 6.9e-08
NP_001317939 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform (1716) 305 59.6 7e-08
XP_016883917 (OMIM: 602442) PREDICTED: intersectin (1721) 305 59.6 7e-08
NP_003015 (OMIM: 602442) intersectin-1 isoform ITS (1721) 305 59.6 7e-08
NP_945328 (OMIM: 601855) rho guanine nucleotide ex ( 879) 253 51.4 1e-05
NP_004697 (OMIM: 601855) rho guanine nucleotide ex ( 912) 253 51.4 1.1e-05
NP_945353 (OMIM: 601855) rho guanine nucleotide ex ( 927) 253 51.5 1.1e-05
XP_005259447 (OMIM: 601855) PREDICTED: rho guanine ( 981) 253 51.5 1.1e-05
XP_011525770 (OMIM: 601855) PREDICTED: rho guanine ( 985) 253 51.5 1.1e-05
XP_005259443 (OMIM: 601855) PREDICTED: rho guanine (1041) 253 51.5 1.2e-05
NP_004454 (OMIM: 300546,305400) FYVE, RhoGEF and P ( 961) 246 50.4 2.3e-05
XP_016872911 (OMIM: 604763) PREDICTED: rho guanine (1401) 247 50.7 2.8e-05
XP_016872910 (OMIM: 604763) PREDICTED: rho guanine (1441) 247 50.7 2.9e-05
XP_011541022 (OMIM: 604763) PREDICTED: rho guanine (1441) 247 50.7 2.9e-05
NP_001288013 (OMIM: 604763) rho guanine nucleotide (1441) 247 50.7 2.9e-05
XP_016872909 (OMIM: 604763) PREDICTED: rho guanine (1485) 247 50.7 3e-05
XP_006718868 (OMIM: 604763) PREDICTED: rho guanine (1519) 247 50.7 3e-05
NP_001185594 (OMIM: 604763) rho guanine nucleotide (1525) 247 50.7 3e-05
NP_056128 (OMIM: 604763) rho guanine nucleotide ex (1544) 247 50.7 3.1e-05
XP_005263745 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483) 234 48.3 4.9e-05
XP_011509578 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483) 234 48.3 4.9e-05
XP_011509579 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483) 234 48.3 4.9e-05
XP_005263746 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483) 234 48.3 4.9e-05
XP_016884867 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 362) 231 47.8 5.3e-05
XP_016884865 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 375) 231 47.8 5.5e-05
NP_065871 (OMIM: 606905) phosphatidylinositol 3,4, (1659) 242 49.9 5.5e-05
XP_005263744 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 567) 234 48.4 5.5e-05
XP_016884869 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 305) 229 47.4 5.8e-05
>>XP_011509226 (OMIM: 605991) PREDICTED: ephexin-1 isofo (433 aa)
initn: 928 init1: 574 opt: 978 Z-score: 828.5 bits: 162.4 E(85289): 2.1e-39
Smith-Waterman score: 978; 37.8% identity (70.7% similar) in 426 aa overlap (1-420:1-415)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRATVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQ
:::..::: :: .::..:: .:......: . : : ::::.::::..:.::. .::.
XP_011 MFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENERIRKILHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 RHKAQVLVEDISDILEEHAEKYFHPYIAYCSNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERR
: . .... :. ::. ..: .: ::.: ::..::.:: ..:.. .::::: . ..:
XP_011 RMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYITYVSNQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLCLKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEG
: : :::. ::::::.::.::: ::.... ... .::: .: : : . .:. ::::
XP_011 PKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNILKRVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE3 AHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISASRWLLKRGELFLVEETGLFRKIASRPTC--
...: : ::: ... ...: :.::.:.:: ::::::.::: . : . ..
XP_011 VRKMSRTEQMISIQKKMEF-KIKSVPIISHSRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHE
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 -YLFLFNDVLVATKKKSEESYMVQDYAQMNHIQVEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHPFQV
:::::::.:: .. ..:.: : : . ..::..: ...... . : .
XP_011 IYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRGLLRVEELE----------DQGQTLANVFIL
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 TLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRARWIVALTHSER-QWQGLSSKG-DLPQVEITKAFFAK
::.:.. :. .:...: :. ::...:. ..: .. ...:. : :::. .. . :.
XP_011 RLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSLAPNRRTKFVSFTSRLLDCPQVQCVHPYVAQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 QADEVTLQQADVVLVLQQ-EDGWLYGERLRDGETGWFPEDFARFITSRVAVEGNVRRMER
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XP_011 QPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFR
350 360 370 380 390 400
420
pF1KE3 LRVETDV
.. :
XP_011 VHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
410 420 430
>>XP_011509227 (OMIM: 605991) PREDICTED: ephexin-1 isofo (433 aa)
initn: 928 init1: 574 opt: 978 Z-score: 828.5 bits: 162.4 E(85289): 2.1e-39
Smith-Waterman score: 978; 37.8% identity (70.7% similar) in 426 aa overlap (1-420:1-415)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRATVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQ
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XP_011 MFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENERIRKILHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 RHKAQVLVEDISDILEEHAEKYFHPYIAYCSNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERR
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XP_011 RMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYITYVSNQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLCLKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEG
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XP_011 PKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNILKRVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE3 AHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISASRWLLKRGELFLVEETGLFRKIASRPTC--
...: : ::: ... ...: :.::.:.:: ::::::.::: . : . ..
XP_011 VRKMSRTEQMISIQKKMEF-KIKSVPIISHSRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHE
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 -YLFLFNDVLVATKKKSEESYMVQDYAQMNHIQVEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHPFQV
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XP_011 IYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRGLLRVEELE----------DQGQTLANVFIL
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 TLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRARWIVALTHSER-QWQGLSSKG-DLPQVEITKAFFAK
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XP_011 RLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSLAPNRRTKFVSFTSRLLDCPQVQCVHPYVAQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 QADEVTLQQADVVLVLQQ-EDGWLYGERLRDGETGWFPEDFARFITSRVAVEGNVRRMER
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XP_011 QPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFR
350 360 370 380 390 400
420
pF1KE3 LRVETDV
.. :
XP_011 VHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
410 420 430
>>NP_001107562 (OMIM: 605991) ephexin-1 isoform 2 [Homo (618 aa)
initn: 928 init1: 574 opt: 978 Z-score: 826.3 bits: 162.5 E(85289): 2.7e-39
Smith-Waterman score: 978; 37.8% identity (70.7% similar) in 426 aa overlap (1-420:186-600)
10 20 30
pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRA
:::..::: :: .::..:: .:......:
NP_001 RFNLWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENERIRK
160 170 180 190 200 210
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 TVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKYFHPYIAYC
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NP_001 ILHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYITYV
220 230 240 250 260 270
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 SNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLC
::..::.:: ..:.. .::::: . ..: : : :::. ::::::.::.::: ::....
NP_001 SNQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNIL
280 290 300 310 320 330
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 LKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISA
... .::: .: : : . .:. ::::...: : ::: ... ...: :.::.:.::
NP_001 KRVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEF-KIKSVPIISH
340 350 360 370 380 390
220 230 240 250 260
pF1KE3 SRWLLKRGELFLVEETGLFRKIASRPTC---YLFLFNDVLVATKKKSEESYMVQDYAQMN
::::::.::: . : . .. :::::::.:: .. ..:.: : : .
NP_001 SRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRG
400 410 420 430 440 450
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 HIQVEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRARWIVAL
..::..: ...... . : . ::.:.. :. .:...: :. ::...:
NP_001 LLRVEELE----------DQGQTLANVFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSL
460 470 480 490 500
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 THSER-QWQGLSSKG-DLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVLQQ-EDGWLYGERLR
. ..: .. ...:. : :::. .. . :.: ::.::. ::.. .:.. .:::..::::.
NP_001 APNRRTKFVSFTSRLLDCPQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLH
510 520 530 540 550 560
390 400 410 420
pF1KE3 DGETGWFPEDFARFITSRVAVEGNVRRMERLRVETDV
: : :::: .... : . :... :.. :
NP_001 DQERGWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
570 580 590 600 610
>>XP_011509225 (OMIM: 605991) PREDICTED: ephexin-1 isofo (710 aa)
initn: 928 init1: 574 opt: 978 Z-score: 825.5 bits: 162.5 E(85289): 3.1e-39
Smith-Waterman score: 978; 37.8% identity (70.7% similar) in 426 aa overlap (1-420:278-692)
10 20 30
pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRA
:::..::: :: .::..:: .:......:
XP_011 RFNLWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENERIRK
250 260 270 280 290 300
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 TVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKYFHPYIAYC
. : : ::::.::::..:.::. .::.: . .... :. ::. ..: .: ::.:
XP_011 ILHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYITYV
310 320 330 340 350 360
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 SNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLC
::..::.:: ..:.. .::::: . ..: : : :::. ::::::.::.::: ::....
XP_011 SNQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNIL
370 380 390 400 410 420
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 LKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISA
... .::: .: : : . .:. ::::...: : ::: ... ...: :.::.:.::
XP_011 KRVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEF-KIKSVPIISH
430 440 450 460 470 480
220 230 240 250 260
pF1KE3 SRWLLKRGELFLVEETGLFRKIASRPTC---YLFLFNDVLVATKKKSEESYMVQDYAQMN
::::::.::: . : . .. :::::::.:: .. ..:.: : : .
XP_011 SRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRG
490 500 510 520 530 540
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 HIQVEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRARWIVAL
..::..: ...... . : . ::.:.. :. .:...: :. ::...:
XP_011 LLRVEELE----------DQGQTLANVFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSL
550 560 570 580 590
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 THSER-QWQGLSSKG-DLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVLQQ-EDGWLYGERLR
. ..: .. ...:. : :::. .. . :.: ::.::. ::.. .:.. .:::..::::.
XP_011 APNRRTKFVSFTSRLLDCPQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLH
600 610 620 630 640 650
390 400 410 420
pF1KE3 DGETGWFPEDFARFITSRVAVEGNVRRMERLRVETDV
: : :::: .... : . :... :.. :
XP_011 DQERGWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
660 670 680 690 700 710
>>NP_062824 (OMIM: 605991) ephexin-1 isoform 1 [Homo sap (710 aa)
initn: 928 init1: 574 opt: 978 Z-score: 825.5 bits: 162.5 E(85289): 3.1e-39
Smith-Waterman score: 978; 37.8% identity (70.7% similar) in 426 aa overlap (1-420:278-692)
10 20 30
pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRA
:::..::: :: .::..:: .:......:
NP_062 RFNLWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENERIRK
250 260 270 280 290 300
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 TVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKYFHPYIAYC
. : : ::::.::::..:.::. .::.: . .... :. ::. ..: .: ::.:
NP_062 ILHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYITYV
310 320 330 340 350 360
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 SNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLC
::..::.:: ..:.. .::::: . ..: : : :::. ::::::.::.::: ::....
NP_062 SNQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNIL
370 380 390 400 410 420
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pF1KE3 LKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISA
... .::: .: : : . .:. ::::...: : ::: ... ...: :.::.:.::
NP_062 KRVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEF-KIKSVPIISH
430 440 450 460 470 480
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pF1KE3 SRWLLKRGELFLVEETGLFRKIASRPTC---YLFLFNDVLVATKKKSEESYMVQDYAQMN
::::::.::: . : . .. :::::::.:: .. ..:.: : : .
NP_062 SRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRG
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pF1KE3 HIQVEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRARWIVAL
..::..: ...... . : . ::.:.. :. .:...: :. ::...:
NP_062 LLRVEELE----------DQGQTLANVFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSL
550 560 570 580 590
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pF1KE3 THSER-QWQGLSSKG-DLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVLQQ-EDGWLYGERLR
. ..: .. ...:. : :::. .. . :.: ::.::. ::.. .:.. .:::..::::.
NP_062 APNRRTKFVSFTSRLLDCPQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLH
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pF1KE3 DGETGWFPEDFARFITSRVAVEGNVRRMERLRVETDV
: : :::: .... : . :... :.. :
NP_062 DQERGWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
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>>XP_011539008 (OMIM: 612496) PREDICTED: rho guanine nuc (802 aa)
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Smith-Waterman score: 843; 36.8% identity (65.3% similar) in 427 aa overlap (2-419:382-794)
10 20 30
pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRAT
::..::: :: ::::. : .:: : ::
XP_011 FSLWQDIPDVRGSGVLATLSLRDCKLQEAKFELITSEASYIHSLSVAVGHFLGSAELSEC
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pF1KE3 VTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKYFHPYIAYCS
. .... :::.. .: ..:.::..::::: .:.:: .. :.. .: . . :. : .
XP_011 LGAQDKQWLFSKLPEVKSTSERFLQDLEQRLEADVLRFSVCDVVLDHCPAFRRVYLPYVT
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pF1KE3 NEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLCL
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XP_011 NQAYQERTYQRLLLENPRFPGILARLEESPVCQRLPLTSFLILPFQRITRLKMLVENILK
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pF1KE3 KTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISAS
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XP_011 RTAQGSEDEDMATKAFNALKELVQECNASVQSMKRTEELIHLSKKIHFEG-KIFPLISQA
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220 230 240 250 260
pF1KE3 RWLLKRGELFLVEETGLFR------KIASRPTCYLFLFNDVLVATKKKSEESYMVQDYAQ
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XP_011 RWLVRHGE--LVELAPLPAAPPAKLKLSSK-AVYLHLFNDCLLLSRRKELGKFAVFVHAK
600 610 620 630 640
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pF1KE3 MNHIQVEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRARWIV
: ..::. . . .:: : : . :: ... ..:.:: . . :.. :::
XP_011 MAELQVRDLSLKLQGIPG---------HVFLLQLL-HGQHMKHQFLLRARTESEKQRWIS
650 660 670 680 690
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pF1KE3 ALTHSERQW-QGLSSKG-DLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLV-LQQEDGWLYGER
:: : : . . :.: : :::. .... : . ::.::...:.. : :::: : :
XP_011 ALCPSSPQEDKEVISEGEDCPQVQCVRTYKALHPDELTLEKTDILSVRTWTSDGWLEGVR
700 710 720 730 740 750
390 400 410 420
pF1KE3 LRDGETGWFPEDFARFITSRVAVEGNVRRMERLRVETDV
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XP_011 LADGEKGWVPQAYVEEISSLSARLRNLRENKRVTSATSKLGEAPV
760 770 780 790 800
>>NP_694945 (OMIM: 612496) rho guanine nucleotide exchan (802 aa)
initn: 837 init1: 494 opt: 843 Z-score: 712.9 bits: 141.9 E(85289): 5.7e-33
Smith-Waterman score: 843; 36.8% identity (65.3% similar) in 427 aa overlap (2-419:382-794)
10 20 30
pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRAT
::..::: :: ::::. : .:: : ::
NP_694 FSLWQDIPDVRGSGVLATLSLRDCKLQEAKFELITSEASYIHSLSVAVGHFLGSAELSEC
360 370 380 390 400 410
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 VTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKYFHPYIAYCS
. .... :::.. .: ..:.::..::::: .:.:: .. :.. .: . . :. : .
NP_694 LGAQDKQWLFSKLPEVKSTSERFLQDLEQRLEADVLRFSVCDVVLDHCPAFRRVYLPYVT
420 430 440 450 460 470
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 NEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLCL
:..::.:: :.:. : : : ..:. :.: ::. ::::::.::.::: .:....
NP_694 NQAYQERTYQRLLLENPRFPGILARLEESPVCQRLPLTSFLILPFQRITRLKMLVENILK
480 490 500 510 520 530
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 KTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISAS
.: :: :..:..:...::..:: ... :.: :.. : .. : : .:::: .
NP_694 RTAQGSEDEDMATKAFNALKELVQECNASVQSMKRTEELIHLSKKIHFEG-KIFPLISQA
540 550 560 570 580 590
220 230 240 250 260
pF1KE3 RWLLKRGELFLVEETGLFR------KIASRPTCYLFLFNDVLVATKKKSEESYMVQDYAQ
:::...:: ::: . : :..:. . :: :::: :. ...: .. : .:.
NP_694 RWLVRHGE--LVELAPLPAAPPAKLKLSSK-AVYLHLFNDCLLLSRRKELGKFAVFVHAK
600 610 620 630 640
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 MNHIQVEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRARWIV
: ..::. . . .:: : : . :: ... ..:.:: . . :.. :::
NP_694 MAELQVRDLSLKLQGIPG---------HVFLLQLL-HGQHMKHQFLLRARTESEKQRWIS
650 660 670 680 690
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 ALTHSERQW-QGLSSKG-DLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLV-LQQEDGWLYGER
:: : : . . :.: : :::. .... : . ::.::...:.. : :::: : :
NP_694 ALCPSSPQEDKEVISEGEDCPQVQCVRTYKALHPDELTLEKTDILSVRTWTSDGWLEGVR
700 710 720 730 740 750
390 400 410 420
pF1KE3 LRDGETGWFPEDFARFITSRVAVEGNVRRMERLRVETDV
: ::: :: :. ... :.: : :.:. .:. :
NP_694 LADGEKGWVPQAYVEEISSLSARLRNLRENKRVTSATSKLGEAPV
760 770 780 790 800
>>NP_005426 (OMIM: 600888) rho guanine nucleotide exchan (1597 aa)
initn: 812 init1: 509 opt: 835 Z-score: 702.0 bits: 140.8 E(85289): 2.3e-32
Smith-Waterman score: 944; 38.2% identity (68.2% similar) in 421 aa overlap (2-416:1180-1586)
10 20 30
pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRAT
::...:: :: .::.: :..: : ::::
NP_005 GSLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEVKFELIVSEASYLRSLNIAVDHFQLSTSLRAT
1150 1160 1170 1180 1190 1200
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 VTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKYFHPYIAYCS
....::. ::: . :: .: :. :::. . ... .. :.. .:: . . :. : .
NP_005 LSNQEHQWLFSRLQDVRDVSATFLSDLEENFENNIFSFQVCDVVLNHAPDFRRVYLPYVT
1210 1220 1230 1240 1250 1260
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 NEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLCL
:..::.::.:.:..::. :::.:...: :.: : . ::::::.::.::: ::....
NP_005 NQTYQERTFQSLMNSNSNFREVLEKLESDPVCQRLSLKSFLILPFQRITRLKLLLQNILK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 KTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISAS
.:: : . :..: .:. .:.:.::.... :.: :.. : ...: . : .:::: :
NP_005 RTQPGSSEEAEATKAHHALEQLIRDCNNNVQSMRRTEELIYLSQKIEF-ECKIFPLISQS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KE3 RWLLKRGELFLVEET---GLFRKIASRPTCYLFLFNDVLVATKKKSEESYMVQDYAQMNH
:::.: ::: .: . :: ::. .::. .: :::: :. .. . ..: :.: ..
NP_005 RWLVKSGELTALEFSASPGLRRKLNTRPV-HLHLFNDCLLLSRPREGSRFLVFDHAPFSS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
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pF1KE3 IQVEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHP--FQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRARWIVA
:. :: :. : : :: :.. : .:..: : ..:. ... :.. ::: :
NP_005 IRGEK---CEMKLHG--------PHKNLFRLFLRQNTQGAQAEFLFRTETQSEKLRWISA
1450 1460 1470 1480 1490
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pF1KE3 LTHSERQWQGLSSKGDLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVLQQE-DGWLYGERLRD
:. :. : . :::. .:. .. ::..:..::::.: :: :::: : :: :
NP_005 LAMP-REELDLLECYNSPQVQCLRAYKPRENDELALEKADVVMVTQQSSDGWLEGVRLSD
1500 1510 1520 1530 1540 1550
390 400 410 420
pF1KE3 GETGWFPEDFARFITSRVAVEGNVRRMERLRVETDV
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NP_005 GERGWFPVQQVEFISNPEVRAQNLKEAHRVKTAKLQLVEQQA
1560 1570 1580 1590
>>NP_079290 (OMIM: 608504) rho guanine nucleotide exchan (841 aa)
initn: 704 init1: 564 opt: 649 Z-score: 551.9 bits: 112.1 E(85289): 5.3e-24
Smith-Waterman score: 718; 38.3% identity (65.9% similar) in 334 aa overlap (1-327:422-739)
10 20 30
pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRA
.::..::: :: .:: .:.. :. :. ::
NP_079 RNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQESLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRD
400 410 420 430 440 450
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 TVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKYFHPYIAYC
:.: .:: ::::. : :.:.::. : .: ... . :. :... :: : :. :
NP_079 TLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLLSRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYV
460 470 480 490 500 510
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 SNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLC
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NP_079 RNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQSLPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNIL
520 530 540 550 560 570
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 LKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISA
.:. : : . :..:: :.::....:. . ::.. :.. : .: : :::.:::.:
NP_079 RQTEEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSW
580 590 600 610 620 630
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pF1KE3 SRWLLKRGELFLVEETGLFRK---IASRPT----CYLFLFNDVLVATKKKSEESYMVQDY
:: : .::: : : : .:::: : :.::.:.:. :. :: . .: ::
NP_079 SRRLEFQGEL---TELGCRRGGVLFASRPRFTPLC-LLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDY
640 650 660 670 680
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pF1KE3 AQMNHIQVEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRARW
:. . .:.... : :.: : :...:: : .:: . ::...: :: ::
NP_079 AHRSLVQAQQV-----PDPSG-------PPTFRLSLLSNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRW
690 700 710 720 730
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pF1KE3 IVALTHSERQWQGLSSKGDLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVLQQEDGWLYGERL
. :.
NP_079 LGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSESSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLK
740 750 760 770 780 790
>>NP_776089 (OMIM: 608504) rho guanine nucleotide exchan (841 aa)
initn: 704 init1: 564 opt: 649 Z-score: 551.9 bits: 112.1 E(85289): 5.3e-24
Smith-Waterman score: 718; 38.3% identity (65.9% similar) in 334 aa overlap (1-327:422-739)
10 20 30
pF1KE3 MFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRA
.::..::: :: .:: .:.. :. :. ::
NP_776 RNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQESLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRD
400 410 420 430 440 450
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 TVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKYFHPYIAYC
:.: .:: ::::. : :.:.::. : .: ... . :. :... :: : :. :
NP_776 TLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLLSRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYV
460 470 480 490 500 510
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 SNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLC
:. ::..: ..:...:. : ::... : : ::. :::.::.::.::: .:....
NP_776 RNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQSLPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNIL
520 530 540 550 560 570
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 LKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISA
.:. : : . :..:: :.::....:. . ::.. :.. : .: : :::.:::.:
NP_776 RQTEEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSW
580 590 600 610 620 630
220 230 240 250 260
pF1KE3 SRWLLKRGELFLVEETGLFRK---IASRPT----CYLFLFNDVLVATKKKSEESYMVQDY
:: : .::: : : : .:::: : :.::.:.:. :. :: . .: ::
NP_776 SRRLEFQGEL---TELGCRRGGVLFASRPRFTPLC-LLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDY
640 650 660 670 680
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 AQMNHIQVEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRARW
:. . .:.... : :.: : :...:: : .:: . ::...: :: ::
NP_776 AHRSLVQAQQV-----PDPSG-------PPTFRLSLLSNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRW
690 700 710 720 730
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 IVALTHSERQWQGLSSKGDLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVLQQEDGWLYGERL
. :.
NP_776 LGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSESSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLK
740 750 760 770 780 790
421 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]