Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3891
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3891, 343 aa
1>>>pF1KE3891 343 - 343 aa - 343 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7510+/-0.00109; mu= 9.3561+/- 0.065
mean_var=88.4249+/-17.191, 0's: 0 Z-trim(103.8): 27 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.136391
statistics sampled from 7679 (7691) to 7679 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 1.220
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS1181.1 AIM2 gene_id:9447|Hs109|chr1 ( 343) 2159 435.0 4.3e-122
CCDS58039.1 IFI16 gene_id:3428|Hs109|chr1 ( 729) 649 138.0 2.4e-32
CCDS1177.1 MNDA gene_id:4332|Hs109|chr1 ( 407) 581 124.5 1.5e-28
CCDS1180.3 IFI16 gene_id:3428|Hs109|chr1 ( 729) 529 114.4 3.1e-25
CCDS30908.1 PYHIN1 gene_id:149628|Hs109|chr1 ( 452) 517 112.0 1e-24
CCDS30907.1 PYHIN1 gene_id:149628|Hs109|chr1 ( 461) 517 112.0 1e-24
CCDS1179.1 PYHIN1 gene_id:149628|Hs109|chr1 ( 483) 517 112.0 1.1e-24
CCDS1178.1 PYHIN1 gene_id:149628|Hs109|chr1 ( 492) 517 112.0 1.1e-24
>>CCDS1181.1 AIM2 gene_id:9447|Hs109|chr1 (343 aa)
initn: 2159 init1: 2159 opt: 2159 Z-score: 2305.6 bits: 435.0 E(33420): 4.3e-122
Smith-Waterman score: 2159; 100.0% identity (100.0% similar) in 343 aa overlap (1-343:1-343)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MESKYKEILLLTGLDNITDEELDRFKFFLSDEFNIATGKLHTANRIQVATLMIQNAGAVS
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CCDS11 MESKYKEILLLTGLDNITDEELDRFKFFLSDEFNIATGKLHTANRIQVATLMIQNAGAVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 AVMKTIRIFQKLNYMLLAKRLQEEKEKVDKQYKSVTKPKPLSQAEMSPAASAAIRNDVAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AVMKTIRIFQKLNYMLLAKRLQEEKEKVDKQYKSVTKPKPLSQAEMSPAASAAIRNDVAK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 QRAAPKVSPHVKPEQKQMVAQQESIREGFQKRCLPVMVLKAKKPFTFETQEGKQEMFHAT
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CCDS11 QRAAPKVSPHVKPEQKQMVAQQESIREGFQKRCLPVMVLKAKKPFTFETQEGKQEMFHAT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VATEKEFFFVKVFNTLLKDKFIPKRIIIIARYYRHSGFLEVNSASRVLDAESDQKVNVPL
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CCDS11 VATEKEFFFVKVFNTLLKDKFIPKRIIIIARYYRHSGFLEVNSASRVLDAESDQKVNVPL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NIIRKAGETPKINTLQTQPLGTIVNGLFVVQKVTEKKKNILFDLSDNTGKMEVLGVRNED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NIIRKAGETPKINTLQTQPLGTIVNGLFVVQKVTEKKKNILFDLSDNTGKMEVLGVRNED
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE3 TMKCKEGDKVRLTFFTLSKNGEKLQLTSGVHSTIKVIKAKKKT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TMKCKEGDKVRLTFFTLSKNGEKLQLTSGVHSTIKVIKAKKKT
310 320 330 340
>>CCDS58039.1 IFI16 gene_id:3428|Hs109|chr1 (729 aa)
initn: 679 init1: 437 opt: 649 Z-score: 694.4 bits: 138.0 E(33420): 2.4e-32
Smith-Waterman score: 649; 37.1% identity (69.0% similar) in 345 aa overlap (1-343:1-336)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MESKYKEILLLTGLDNITDEELDRFKFFLSDEFNIATGKLHTANRIQVATLMIQNAGAVS
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CCDS58 MGKKYKNIVLLKGLEVINDYHFRMVKSLLSNDLKLNLKMREEYDKIQIADLMEEKFRGDA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE3 AVMKTIRIFQKLNYML-LAKRLQEEKEKVDKQYKSVTKPKPLSQAEMSPAASAAIRNDVA
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CCDS58 GLGKLIKIFEDIPTLEDLAETLKKEKLKVKGPALSRKRKKEVDATSPAPSTSSTVKTEGA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 KQRAAPKVSPHVKPEQKQMVAQQESIREGFQKRCLPVMVLKAKKPFTFETQEGKQE-MFH
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CCDS58 E--ATPGAQ-NPKTVAKCQVTPRRNV---LQKRPVIVKVLSTTKPFEYETPEMEKKIMFH
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 ATVATEKEFFFVKVFNTLLKDKFIPKRIIIIARYYRHSGFLEVNSASRVLDAESDQKVNV
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CCDS58 ATVATQTQFFHVKVLNTSLKEKFNGKKIIIISDYLEYDSLLEVNEESTVSEAGPNQTFEV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 PLNIIRKAGETPKINTLQTQPLGTIVNGLFVVQKVTEKKKNILFDLSDNTGKMEVLGVRN
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CCDS58 PNKIINRAKETLKIDILHKQASGNIVYGVFMLHKKTVNQKTTIYEIQDDRGKMDVVGTGQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE3 EDTMKCKEGDKVRLTFFTLSKNGEKLQLTSGVHSTIKVIKAKKKT
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CCDS58 CHNIPCEEGDKLQLFCFRLRKKNQMSKLISEMHSFIQI---KKKTNPRNNDPKSMKLPQE
300 310 320 330 340 350
CCDS58 QRQLPYPSEASTTFPESHLRTPQMPPTTPSSSFFTKKSEDTISKMNDFMRMQILKEGSHF
360 370 380 390 400 410
>--
initn: 537 init1: 429 opt: 553 Z-score: 592.3 bits: 119.1 E(33420): 1.2e-26
Smith-Waterman score: 553; 42.0% identity (69.4% similar) in 245 aa overlap (98-341:468-709)
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 IFQKLNYMLLAKRLQEEKEKVDKQYKSVTKPKPLSQAEMSPAASAAIRNDVAKQRAAPKV
: :. .. ..:: : .. . . .
CCDS58 SSFLTTKSEDTISKMNDFMRMQILKEGSHFPGPF-MTSIGPAESHPHTPQMPPSTPSSSF
440 450 460 470 480 490
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 SPHVKPEQKQMVAQQESIREGFQKRCLPVMVLKAKKPFTFETQEGKQEMFHATVATEKEF
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CCDS58 LTTLKPRLKTE-PEEVSIEDSAQSDLKEVMVLNATESFVYEPKEQKK-MFHATVATENEV
500 510 520 530 540 550
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 FFVKVFNTLLKDKFIPKRIIIIARYYRHSGFLEVNSASRVLDAESDQKVNVPLNIIRKAG
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CCDS58 FRVKVFNIDLKEKFTPKKIIAIANYVCRNGFLEVYPFTLVADVNADRNMEIPKGLIRSAS
560 570 580 590 600 610
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ETPKINTLQTQPLGTIVNGLFVVQKVTEKKKNILFDLSDNTGKMEVLGVRNEDTMKCKEG
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CCDS58 VTPKINQLCSQTKGSFVNGVFEVHKKNVRGEFTYYEIQDNTGKMEVVVHGRLTTINCEEG
620 630 640 650 660 670
310 320 330 340
pF1KE3 DKVRLTFFTLS-KNGEKLQLTSGVHSTIKVIKAKKKT
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CCDS58 DKLKLTCFELAPKSGNTGELRSVIHSHIKVIKTRKNKKDILNPDSSMETSPDFFF
680 690 700 710 720
>>CCDS1177.1 MNDA gene_id:4332|Hs109|chr1 (407 aa)
initn: 483 init1: 316 opt: 581 Z-score: 626.2 bits: 124.5 E(33420): 1.5e-28
Smith-Waterman score: 581; 34.6% identity (65.2% similar) in 353 aa overlap (1-341:52-398)
10 20 30
pF1KE3 MESKYKEILLLTGLDNITDEELDRFKFFLS
::.:.. . : : ... ... .: ...
CCDS11 FTSIKSLLAYDLGLTTKMQEEYNRIKITDLMEKKFQGVACLDKLIELA-KDMPSLKNLVN
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80
pF1KE3 D---EFNIATGKLHTANRIQVATLMIQNAGAVSAVMKTIRIFQKLNYMLLAKRLQEEKEK
. : . .. :..: .. : . ...: ..: : : .::. .. .:.:
CCDS11 NLRKEKSKVAKKIKTQEKAPVKKINQEEVG-LAAPAPTAR--NKLTSEARGRIPVAQKRK
90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 VDKQYKSVTKPKPLSQAEMSP------AASAAIRNDVAKQRAAPKVS-PHVKPEQKQMVA
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CCDS11 TPNKEKTEAKRNKVSQEQSKPPGPSGASTSAAVDHPPLPQTSSSTPSNTSFTPNQETQAQ
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190
pF1KE3 QQESIREGF-QKRCLPVMVLKAKKPFTFETQE-GKQEMFHATVATEKEFFFVKVFNTLLK
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CCDS11 RQVDARRNVPQNDPVTVVVLKATAPFKYESPENGKSTMFHATVASKTQYFHVKVFDINLK
200 210 220 230 240 250
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 DKFIPKRIIIIARYYRHSGFLEVNSASRVLDAESDQKVNVPLNIIRKAGETPKINTLQTQ
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CCDS11 EKFVRKKVITISDYSECKGVMEIKEASSVSDF--NQNFEVPNRIIEIANKTPKISQLYKQ
260 270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 PLGTIVNGLFVVQKVTEKKKNILFDLSDNTGKMEVLGVRNEDTMKCKEGDKVRLTFFTLS
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CCDS11 ASGTMVYGLFMLQKKSVHKKNTIYEIQDNTGSMDVVGSGKWHNIKCEKGDKLRLFCLQLR
320 330 340 350 360 370
320 330 340
pF1KE3 KNGEKLQLTSGVHSTIKVIKAKKKT
.::.:. : :: ::::::::
CCDS11 TVDRKLKLVCGSHSFIKVIKAKKNKEGPMNVN
380 390 400
>>CCDS1180.3 IFI16 gene_id:3428|Hs109|chr1 (729 aa)
initn: 673 init1: 437 opt: 529 Z-score: 566.7 bits: 114.4 E(33420): 3.1e-25
Smith-Waterman score: 553; 42.0% identity (69.4% similar) in 245 aa overlap (98-341:468-709)
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 IFQKLNYMLLAKRLQEEKEKVDKQYKSVTKPKPLSQAEMSPAASAAIRNDVAKQRAAPKV
: :. .. ..:: : .. . . .
CCDS11 SSFFTKKSEDTISKMNDFMRMQILKEGSHFPGPF-MTSIGPAESHPHTPQMPPSTPSSSF
440 450 460 470 480 490
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 SPHVKPEQKQMVAQQESIREGFQKRCLPVMVLKAKKPFTFETQEGKQEMFHATVATEKEF
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CCDS11 LTTLKPRLKTE-PEEVSIEDSAQSDLKEVMVLNATESFVYEPKEQKK-MFHATVATENEV
500 510 520 530 540 550
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 FFVKVFNTLLKDKFIPKRIIIIARYYRHSGFLEVNSASRVLDAESDQKVNVPLNIIRKAG
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CCDS11 FRVKVFNIDLKEKFTPKKIIAIANYVCRNGFLEVYPFTLVADVNADRNMEIPKGLIRSAS
560 570 580 590 600 610
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ETPKINTLQTQPLGTIVNGLFVVQKVTEKKKNILFDLSDNTGKMEVLGVRNEDTMKCKEG
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CCDS11 VTPKINQLCSQTKGSFVNGVFEVHKKNVRGEFTYYEIQDNTGKMEVVVHGRLTTINCEEG
620 630 640 650 660 670
310 320 330 340
pF1KE3 DKVRLTFFTLS-KNGEKLQLTSGVHSTIKVIKAKKKT
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CCDS11 DKLKLTCFELAPKSGNTGELRSVIHSHIKVIKTRKNKKDILNPDSSMETSPDFFF
680 690 700 710 720
>--
initn: 683 init1: 437 opt: 538 Z-score: 576.3 bits: 116.1 E(33420): 9.1e-26
Smith-Waterman score: 538; 39.4% identity (69.1% similar) in 269 aa overlap (84-343:127-392)
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 QNAGAVSAVMKTIRIFQKLNYMLLAKRLQEEKEKVDKQYKSVTKPKPLSQAEMSPAASAA
.:.: . . :. : . .:. . .: . :.
CCDS11 KRKKEVDATSPAPSTSSTVKTEGAEATPGAQKRKKSTKEKAGPKGSKVSEEQTQPPSPAG
100 110 120 130 140 150
120 130 140 150 160
pF1KE3 IRNDVAKQRA-APKVSPHVKP-----EQKQMVAQ-QESIREG-FQKRCLPVMVLKAKKPF
..: :. .::.: . : :. . ::. : . :.. .::: . : ::.. :::
CCDS11 AGMSTAMGRSPSPKTSLSAPPNSSSTENPKTVAKCQVTPRRNVLQKRPVIVKVLSTTKPF
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 TFETQEGKQE-MFHATVATEKEFFFVKVFNTLLKDKFIPKRIIIIARYYRHSGFLEVNSA
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CCDS11 EYETPEMEKKIMFHATVATQTQFFHVKVLNTSLKEKFNGKKIIIISDYLEYDSLLEVNEE
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 SRVLDAESDQKVNVPLNIIRKAGETPKINTLQTQPLGTIVNGLFVVQKVTEKKKNILFDL
: : .: .: .:: .:: .: :: ::. :. : :.:: :.:...: : ..:. ....
CCDS11 STVSEAGPNQTFEVPNKIINRAKETLKIDILHKQASGNIVYGVFMLHKKTVNQKTTIYEI
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 SDNTGKMEVLGVRNEDTMKCKEGDKVRLTFFTLSKNGEKLQLTSGVHSTIKVIKAKKKT
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CCDS11 QDDRGKMDVVGTGQCHNIPCEEGDKLQLFCFRLRKKNQMSKLISEMHSFIQI---KKKTN
340 350 360 370 380 390
CCDS11 PRNNDPKSMKLPQEQRQLPYPSEASTTFPESHLRTPQMPPTTPSSSFFTKKSEDTISKMN
400 410 420 430 440 450
>>CCDS30908.1 PYHIN1 gene_id:149628|Hs109|chr1 (452 aa)
initn: 619 init1: 449 opt: 517 Z-score: 557.4 bits: 112.0 E(33420): 1e-24
Smith-Waterman score: 536; 38.2% identity (67.8% similar) in 267 aa overlap (81-338:125-391)
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 LMIQNAGAVSAVMKTIRIFQKLNYMLLAKRLQEEKEKVDKQYKSVTKPKPLSQAEMSPAA
: .:.: .. .. :: . .:. . :.
CCDS30 SKKTKQKEVYPATPACTPSNRLTAKGAEETLGPQKRKKPSEEETGTKRSKMSKEQTRPSC
100 110 120 130 140 150
120 130 140 150 160
pF1KE3 SAAIRNDVAKQRAAP-KVSPHVKP-----EQKQMVAQQESI--REGFQKRCLPVMVLKAK
::. ...: :. : ..: . : :. . .:.... .. :.. . .:::.:
CCDS30 SAGASTSTAMGRSPPPQTSSSAPPNTSSTESLKPLANRHATASKNIFREDPIIAMVLNAT
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 KPFTFETQEGKQE-MFHATVATEKEFFFVKVFNTLLKDKFIPKRIIIIARYYRHSGFLEV
: : .:..:..:. ::::::::. .:: :::.: :: ::: ::::::. : .....:::
CCDS30 KVFKYESSENEQRRMFHATVATQTQFFHVKVLNINLKRKFIKKRIIIISNYSKRNSLLEV
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 NSASRVLDAESDQKVNVPLNIIRKAGETPKINTLQTQPLGTIVNGLFVVQKVTEKKKNIL
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CCDS30 NEASSVSEAGPDQTFEVPKDIIRRAKKIPKINILHKQTSGYIVYGLFMLHTKIVNRKTTI
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 FDLSDNTGKMEVLGVRNEDTMKCKEGDKVRLTFFTLSKNGEKLQLTSGVHSTIKVIKAKK
....:.::.: :.: . .. :..:::.:: : : : . .: : .:: :.. :
CCDS30 YEIQDKTGSMAVVGKGECHNIPCEKGDKLRLFCFRLRKRENMSKLMSEMHSFIQIQKNTN
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 KT
CCDS30 QRSHDSRSMALPQEQSQHPKPSEASTTLPESHLKTPQMPPTTPSSSSFTKVTKDKDIK
400 410 420 430 440 450
>>CCDS30907.1 PYHIN1 gene_id:149628|Hs109|chr1 (461 aa)
initn: 567 init1: 449 opt: 517 Z-score: 557.3 bits: 112.0 E(33420): 1e-24
Smith-Waterman score: 536; 38.2% identity (67.8% similar) in 267 aa overlap (81-338:134-400)
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 LMIQNAGAVSAVMKTIRIFQKLNYMLLAKRLQEEKEKVDKQYKSVTKPKPLSQAEMSPAA
: .:.: .. .. :: . .:. . :.
CCDS30 SKKTKQKEVYPATPACTPSNRLTAKGAEETLGPQKRKKPSEEETGTKRSKMSKEQTRPSC
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160
pF1KE3 SAAIRNDVAKQRAAP-KVSPHVKP-----EQKQMVAQQESI--REGFQKRCLPVMVLKAK
::. ...: :. : ..: . : :. . .:.... .. :.. . .:::.:
CCDS30 SAGASTSTAMGRSPPPQTSSSAPPNTSSTESLKPLANRHATASKNIFREDPIIAMVLNAT
170 180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 KPFTFETQEGKQE-MFHATVATEKEFFFVKVFNTLLKDKFIPKRIIIIARYYRHSGFLEV
: : .:..:..:. ::::::::. .:: :::.: :: ::: ::::::. : .....:::
CCDS30 KVFKYESSENEQRRMFHATVATQTQFFHVKVLNINLKRKFIKKRIIIISNYSKRNSLLEV
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 NSASRVLDAESDQKVNVPLNIIRKAGETPKINTLQTQPLGTIVNGLFVVQKVTEKKKNIL
: :: : .: :: .:: .:::.: . :::: :. : : :: :::... ..:. .
CCDS30 NEASSVSEAGPDQTFEVPKDIIRRAKKIPKINILHKQTSGYIVYGLFMLHTKIVNRKTTI
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330 340
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