Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3811
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3811, 419 aa
1>>>pF1KE3811 419 - 419 aa - 419 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0341+/-0.00101; mu= 13.6794+/- 0.060
mean_var=88.7138+/-18.052, 0's: 0 Z-trim(106.5): 104 B-trim: 347 in 1/49
Lambda= 0.136169
statistics sampled from 8923 (9045) to 8923 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.648), E-opt: 0.2 (0.278), width: 16
Scan time: 2.170
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4451.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 ( 419) 2807 561.7 4.7e-160
CCDS64340.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 ( 384) 2575 516.1 2.3e-146
CCDS34065.1 RNF150 gene_id:57484|Hs108|chr4 ( 438) 1228 251.5 1.2e-66
CCDS2051.1 RNF149 gene_id:284996|Hs108|chr2 ( 400) 888 184.7 1.4e-46
CCDS14521.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX ( 428) 837 174.7 1.5e-43
CCDS14520.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX ( 402) 788 165.0 1.1e-40
CCDS47692.1 RNF148 gene_id:378925|Hs108|chr7 ( 305) 609 129.8 3.5e-30
CCDS5784.1 RNF133 gene_id:168433|Hs108|chr7 ( 376) 589 125.9 6.3e-29
CCDS56225.1 ZNRF3 gene_id:84133|Hs108|chr22 ( 936) 330 75.3 2.8e-13
CCDS42999.1 ZNRF3 gene_id:84133|Hs108|chr22 ( 836) 309 71.1 4.4e-12
>>CCDS4451.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 (419 aa)
initn: 2807 init1: 2807 opt: 2807 Z-score: 2987.0 bits: 561.7 E(32554): 4.7e-160
Smith-Waterman score: 2807; 100.0% identity (100.0% similar) in 419 aa overlap (1-419:1-419)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSCAGRAGPARLAALALLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAPLTFRIDRGR
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CCDS44 MSCAGRAGPARLAALALLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAPLTFRIDRGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLGCDPQTRFFVPPNIKQWIALLQRGNCTFKEKIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLGCDPQTRFFVPPNIKQWIALLQRGNCTFKEKIS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RAAFHNAVAVVIYNNKSKEEPVTMTHPGTGDIIAVMITELRGKDILSYLEKNISVQMTIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RAAFHNAVAVVIYNNKSKEEPVTMTHPGTGDIIAVMITELRGKDILSYLEKNISVQMTIA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIRYTNARDRNQRRLGDAAKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIRYTNARDRNQRRLGDAAKK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 AISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCKHVFHKSCVDPWLSEHCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCKHVFHKSCVDPWLSEHCT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 CPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSALGDLAGDNSLGLEPLRTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 CPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSALGDLAGDNSLGLEPLRTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE3 GISPLPQDGELTPRTGEINIAVTKEWFIIASFGLLSALTLCYMIIRATASLNANEVEWF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GISPLPQDGELTPRTGEINIAVTKEWFIIASFGLLSALTLCYMIIRATASLNANEVEWF
370 380 390 400 410
>>CCDS64340.1 RNF130 gene_id:55819|Hs108|chr5 (384 aa)
initn: 2596 init1: 2575 opt: 2575 Z-score: 2741.2 bits: 516.1 E(32554): 2.3e-146
Smith-Waterman score: 2575; 99.7% identity (100.0% similar) in 384 aa overlap (1-384:1-384)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSCAGRAGPARLAALALLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAPLTFRIDRGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MSCAGRAGPARLAALALLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAPLTFRIDRGR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLGCDPQTRFFVPPNIKQWIALLQRGNCTFKEKIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 YGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLGCDPQTRFFVPPNIKQWIALLQRGNCTFKEKIS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RAAFHNAVAVVIYNNKSKEEPVTMTHPGTGDIIAVMITELRGKDILSYLEKNISVQMTIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RAAFHNAVAVVIYNNKSKEEPVTMTHPGTGDIIAVMITELRGKDILSYLEKNISVQMTIA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIRYTNARDRNQRRLGDAAKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIRYTNARDRNQRRLGDAAKK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 AISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCKHVFHKSCVDPWLSEHCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCKHVFHKSCVDPWLSEHCT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 CPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSALGDLAGDNSLGLEPLRTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 CPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSALGDLAGDNSLGLEPLRTS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE3 GISPLPQDGELTPRTGEINIAVTKEWFIIASFGLLSALTLCYMIIRATASLNANEVEWF
:::::::::::::::::::::::.
CCDS64 GISPLPQDGELTPRTGEINIAVTR
370 380
>>CCDS34065.1 RNF150 gene_id:57484|Hs108|chr4 (438 aa)
initn: 1199 init1: 918 opt: 1228 Z-score: 1310.3 bits: 251.5 E(32554): 1.2e-66
Smith-Waterman score: 1261; 54.1% identity (75.0% similar) in 368 aa overlap (32-385:37-401)
10 20 30 40 50
pF1KE3 SCAGRAGPARLAALALLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEP----------GRGAP
.:.:::..:.: :: : ::
CCDS34 QACCSLALSTWLLSFCFVHLLCLDFTVAEKEEWYTAFVNITYAEPAPDPGAGAAGGGGAE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 L-TFRIDRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLGCDPQTRFFVPPNIKQWIALLQR
: : . . :::: ::: ..::.:. : :.:.:::.:.: .: :.::::. .
CCDS34 LHTEKTECGRYGEHSPKQDARGEVVMASSAH---DRLACDPNTKFAAPTRGKNWIALIPK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KE3 GNCTFKEKISRAAFHNAVAVVIYNNKSK-EEPVTMTHPGTGDIIAVMITELRGKDILSYL
::::...:: : ..:: ::::.: :. .: .:: : :. ::.:.:: : .::.:.: :
CCDS34 GNCTYRDKIRNAFLQNASAVVIFNVGSNTNETITMPHAGVEDIVAIMIPEPKGKEIVSLL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 EKNISVQMTIAVGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIRYTNARDR
:.::.: : :..::: : :: :.:::::::::::::: :::.::.::..::.:::::
CCDS34 ERNITVTMYITIGTRNLQKYVSRTSVVFVSISFIVLMIISLAWLVFYYIQRFRYANARDR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 NQRRLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCKHVFHKS
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CCDS34 NQRRLGDAAKKAISKLQIRTIKKGDKETESDFDNCAVCIEGYKPNDVVRILPCRHLFHKS
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 CVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSALGDLA-G
:::::: .: ::::::.:::::::: :: : :.. :.: .:. .. .: . .
CCDS34 CVDPWLLDHRTCPMCKMNILKALGIPPNADCMDDLPTDFEGSLGGPPTNQITGASDTTVN
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 DNSLGLEP-LRTSGISPLPQDGELTPRTGEINIAVTKEWFIIASFGLLSALTLCYMIIRA
..:. :.: .:: : . :: . :. :.. .....:
CCDS34 ESSVTLDPAVRTVGALQVVQDTDPIPQEGDVIFTTNSEQEPAVSSDSDISLIMAMEVGLS
370 380 390 400 410 420
410
pF1KE3 TASLNANEVEWF
CCDS34 DVELSTDQDCEEVKS
430
>>CCDS2051.1 RNF149 gene_id:284996|Hs108|chr2 (400 aa)
initn: 580 init1: 436 opt: 888 Z-score: 949.9 bits: 184.7 E(32554): 1.4e-46
Smith-Waterman score: 888; 41.7% identity (66.0% similar) in 379 aa overlap (5-377:11-381)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MSCAGRAGPARLAALALLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAPLTF
: : :: ::: : :. : . . :...:..:. .: . .
CCDS20 MAWRRREASVGARGVLALALLALALCV--PG-ARGRALEWFSAVVNIEYVDPQTNLTVWS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 RIDRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLGCDPQTRFFVP-PNIK---QWIALLQR
. ::.: .::: ..: : .: : : :: :.:::::: :. . :.::. :
CCDS20 VSESGRFGDSSPKEGAHGLVGVPWAPGG--DLEGCAPDTRFFVPEPGGRGAAPWVALVAR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE3 GNCTFKEKISRAAFHNAVAVVIYNNKSKEE-PVTMTHPGTGDIIAVMITELRGKDILSYL
:.::::.:. :: .:: :::.::.. . . :.: :::.:...::. .:..:: .
CCDS20 GGCTFKDKVLVAARRNASAVVLYNEERYGNITLPMSHAGTGNIVVIMISYPKGREILELV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 EKNISVQMTIAVGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIRYTNARDR
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CCDS20 QKGIPVTMTIGVGTRHVQEFISGQSVVFVAIAFITMMIISLAWLIFYYIQRFLYTGSQIG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 NQRRLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCKHVFHKS
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CCDS20 SQSHRKET-KKVIGQLLLHTVKHGEKGIDVDAENCAVCIENFKVKDIIRILPCKHIFHRI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 CVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSALGDLAGD
:.:::: .: :::::::...:::: . .... : :.: :: : :
CCDS20 CIDPWLLDHRTCPMCKLDVIKALGYWGEPGDVQEMPAPESPPGRDPAANLSLALPD--DD
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 NSLGLEPLRTSGISPLPQ-DGELTPRTGEINIAVTKEWFIIASFGLLSALTLCYMIIRAT
.: : .: :: : . .::
CCDS20 GSDDSSPPSASPAESEPQCDPSFKGDAGENTALLEAGRSDSRHGGPIS
360 370 380 390 400
>>CCDS14521.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX (428 aa)
initn: 760 init1: 507 opt: 837 Z-score: 895.3 bits: 174.7 E(32554): 1.5e-43
Smith-Waterman score: 837; 44.4% identity (69.4% similar) in 324 aa overlap (1-314:9-327)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MSCAGRAGPARLAALALLTCSLWP-ARADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAP
.:: : : .:: : .: .: : : .. ... .:: .::. . : :.
CCDS14 MGPPPGAGVSCRGGCGFSRLLAWCFLL-ALSPQAPGSRGAEAVWTAYLNVSWRVPHTGVN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE3 LTFR--IDRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLGCDPQTRFFVPP----NIK-QW
: ..: :: ::: : : ::.: :. . .:.:.: : :: ... .:
CCDS14 RTVWELSEEGVYGQDSPLEPVAG-VLVPPDGPGALN--ACNPHTNFTVPTVWGSTVQVSW
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 IALLQRGN-CTFKEKISRAAFHNAVAVVIYN-NKSKEEPVTMTHPGTGDIIAVMITELRG
.::.:::. ::: .:: : ..: ..::.: ...: . :.:::. ::.:.:: .:.:
CCDS14 LALIQRGGGCTFADKIHLAYERGASGAVIFNFPGTRNEVIPMSHPGAVDIVAIMIGNLKG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 KDILSYLEKNISVQMTIAVGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKIR
::. ....:.: :.: :: . : .. :. :::.::... . ...::: ...:
CCDS14 TKILQSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPW-VNHYSIFFVSVSFFIITAATVGYFIFYSARRLR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 YTNARDRNQRRLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPC
. :..:.::.: :::::..: ::.:.:::: :: : :::::: :: ::.:::: :
CCDS14 NARAQSRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAVCIELYKPNDLVRILTC
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 KHVFHKSCVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSA
.:.:::.:::::: :: :::::: .:::::::
CCDS14 NHIFHKTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQVPVSNEISNSASSHEE
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 LGDLAGDNSLGLEPLRTSGISPLPQDGELTPRTGEINIAVTKEWFIIASFGLLSALTLCY
CCDS14 DNRSETASSGYASVQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVAVDVIPHVDNPTFEEDE
360 370 380 390 400 410
>>CCDS14520.1 RNF128 gene_id:79589|Hs108|chrX (402 aa)
initn: 612 init1: 577 opt: 788 Z-score: 843.7 bits: 165.0 E(32554): 1.1e-40
Smith-Waterman score: 788; 49.2% identity (73.3% similar) in 258 aa overlap (59-314:52-301)
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 NASQEYYTALINVTVQEPGRGAPLTFRIDRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLG
: ::: :: :.. : : : .. .
CCDS14 ITASFSMSAYVTVTYYNETSNYTAIETCECGVYGLASPVANAMGVVGIP----KNNNYQA
30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 CDPQTRFFVPPNIKQ-WIALLQRGNCTFKEKISRAAFHNAVAVVIYNN-KSKEEPVTMTH
:: .:.: : :. ::::..::::::.:::. :. .:: :::::: .. .. . :..
CCDS14 CDHNTEF---SNTKKPWIALIERGNCTFSEKIQTAGRRNADAVVIYNAPETGNQTIQMAN
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 PGTGDIIAVMITELRGKDILSYLEKNISVQMTIAVGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLM
:. ::.:.:: .:.: ::. ....:.: :.: :: . : .. :. :::.::...
CCDS14 FGAVDIVAIMIGNLKGTKILQSIQRGIQVTMVIEVGKKHGPW-VNHYSIFFVSVSFFIIT
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 IISSAWLIFYFIQKIRYTNARDRNQRRLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAV
. ...::: ...: . :..:.::.: :::::..: ::.:.:::: :: : :::
CCDS14 AATVGYFIFYSARRLRNARAQSRKQRQLKADAKKAIGRLQLRTLKQGDKEIGPDGDSCAV
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 CIESYKQNDVVRILPCKHVFHKSCVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAF
::: :: ::.:::: :.:.:::.:::::: :: :::::: .:::::::
CCDS14 CIELYKPNDLVRILTCNHIFHKTCVDPWLLEHRTCPMCKCDILKALGIEVDVEDGSVSLQ
260 270 280 290 300 310
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 DMERLTRTQAVNRRSALGDLAGDNSLGLEPLRTSGISPLPQDGELTPRTGEINIAVTKEW
CCDS14 VPVSNEISNSASSHEEDNRSETASSGYASVQGTDEPPLEEHVQSTNESLQLVNHEANSVA
320 330 340 350 360 370
>>CCDS47692.1 RNF148 gene_id:378925|Hs108|chr7 (305 aa)
initn: 554 init1: 338 opt: 609 Z-score: 655.4 bits: 129.8 E(32554): 3.5e-30
Smith-Waterman score: 636; 37.6% identity (64.0% similar) in 311 aa overlap (7-310:16-304)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MSCAGRAGPARLAALALLTCSLWPARADNASQEYYTALINVTVQEPGRGAP
.: ::. . ::. .: :. .. .:: .:.: : :
CCDS47 MSFLRITPSTHSSVSSGLLRLSIFLLLS---FP---DSNGKAIWTAHLNITFQV---GNE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 LTFRI-DRGRYGLDSPKAEVRGQVLAPLPLHGVADHLGCDPQTRFFVPPNIKQWIALLQR
.: .. . : .: :: .: : : : .: .. .: : : : : . .:.::..:
CCDS47 ITSELGESGVFGNHSPLERVSGVVALP---EGWNQN-ACHPLTNFSRPKQADSWLALIER
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KE3 GNCTFKEKISRAAFHNAVAVVIYNNKSKEEPV-TMTHPGTGDIIAVMITELRGKDILSYL
:.::: .::. :: ..: .:.::: .. : :.: :: .:.::::..:.: .:: .
CCDS47 GGCTFTHKINVAAEKGANGVIIYNYQGTGSKVFPMSHQGTENIVAVMISNLKGMEILHSI
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 EKNISVQMTIAVGTRMPPKNFSRGSLVFVSISFIVLMIISSAWLIFYFIQKI-----RYT
.:.. : . : :: :: . .:: .. :. . .: . ..... . :
CCDS47 QKGVYVTVIIEVG-RM--------HMQWVSHYIMYLFTFLAATIAYFYLDCVWRLTPRVP
170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 NARDRNQRRLGDAAKKAISKLTTRTVKKGDKETDPDFDHCAVCIESYKQNDVVRILPCKH
:. : . .. .::::..: :..:.::.: : . :.:.::...:: .:::::: :::
CCDS47 NSFTRRRSQIKTDVKKAIDQLQLRVLKEGDEELDLNEDNCVVCFDTYKPQDVVRILTCKH
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 VFHKSCVDPWLSEHCTCPMCKLNILKALGIVPNLPCTDNVAFDMERLTRTQAVNRRSALG
:::.:.:::: : :::::: .:::
CCDS47 FFHKACIDPWLLAHRTCPMCKCDILKT
280 290 300
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. : .: .: .: : .. : .: ..
CCDS57 SQNCCRASVVWMAYMNISFHVGNHVLSELGETGVFGRSSTLKRVAGVIVPP---EGKIQN
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CCDS57 HQAFEDVVVVMIGNLKGTEIFHLIKKGVLITAVVEVG---------RKHIIWMNHYLVSF
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... . :..::: :... . ..: .:: ......: :.::.::.: .:. :
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CCDS57 SCVICFERYKPNDIVRILTCKHFFHKNCIDPWILPHGTCPICKCDILKVLGIQVVVENGT
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50 60 70 80 90 100
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: . : :. ::.. . ..:... :: :. .. . .. .:
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110 120 130 140 150 160
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170 180 190 200 210
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: : .. . :: .. .: . :.: . :. : .:... :.:. .. :.
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220 230 240 250 260
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::. . :..:. .. : .:. :. :: . .:: .: .. . .
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240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
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::.:.:.: ... .:..:: : ::..:::::: .: ::: :. ::.. : :. :...
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300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
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CCDS56 SNLSRGRQQRVTLPVHYP---GRVHRTNAIPAYPTRTSMDSHGNPVTLLTMDRHGEQSLY
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390 400 410
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CCDS56 SPQTPAYIRSYPPLHLDHSLAAHRCGLEHRAYSPAHPFRRPKLSGRSFSKAACFSQYETM
410 420 430 440 450 460
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20 30 40 50 60 70
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80 90 100 110 120
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130 140 150 160 170
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180 190 200 210 220 230
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]