Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3807
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3807, 333 aa
1>>>pF1KE3807 333 - 333 aa - 333 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7584+/-0.00141; mu= 13.8257+/- 0.083
mean_var=109.9426+/-30.466, 0's: 0 Z-trim(100.5): 280 B-trim: 770 in 2/47
Lambda= 0.122318
statistics sampled from 5781 (6125) to 5781 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.51), E-opt: 0.2 (0.188), width: 16
Scan time: 1.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS73628.1 GPR33 gene_id:2856|Hs108|chr14 ( 333) 2165 393.7 1.1e-109
CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 371) 724 139.5 4.2e-33
CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 ( 373) 724 139.5 4.2e-33
CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19 ( 351) 643 125.2 8.1e-29
CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19 ( 353) 633 123.4 2.7e-28
CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 ( 350) 625 122.0 7.3e-28
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 571 112.5 5.4e-25
CCDS7994.1 PTGDR2 gene_id:11251|Hs108|chr11 ( 395) 538 106.7 3.3e-23
CCDS12801.1 GPR32 gene_id:2854|Hs108|chr19 ( 356) 523 104.0 1.9e-22
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 454 91.8 9.2e-19
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 435 88.5 9.7e-18
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 434 88.3 1.1e-17
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 434 88.3 1.1e-17
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 434 88.3 1.1e-17
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 434 88.3 1.1e-17
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 434 88.3 1.1e-17
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 434 88.3 1.1e-17
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 434 88.3 1.2e-17
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 434 88.3 1.2e-17
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 434 88.4 1.2e-17
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 434 88.4 1.3e-17
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 423 86.3 3.9e-17
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 411 84.3 1.8e-16
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 404 82.9 3.7e-16
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 398 81.8 7.5e-16
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 399 82.1 7.8e-16
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 394 81.2 1.4e-15
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 387 80.0 3.3e-15
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 387 80.0 3.4e-15
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 387 80.0 3.5e-15
CCDS8588.1 C3AR1 gene_id:719|Hs108|chr12 ( 482) 387 80.1 4e-15
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 383 79.3 5.5e-15
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 359 75.0 1e-13
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 352 73.8 2.2e-13
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 351 73.6 2.6e-13
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 352 73.9 2.6e-13
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 348 73.1 3.8e-13
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 348 73.1 4e-13
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 344 72.4 6.2e-13
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 341 71.9 9.1e-13
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 341 71.9 9.3e-13
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 335 70.8 1.9e-12
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 335 70.8 1.9e-12
CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 291) 333 70.4 2.1e-12
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 334 70.6 2.1e-12
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 328 69.5 4.2e-12
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 326 69.2 5.8e-12
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 325 69.0 6.4e-12
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 325 69.1 6.9e-12
CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3 ( 358) 321 68.3 1e-11
>>CCDS73628.1 GPR33 gene_id:2856|Hs108|chr14 (333 aa)
initn: 2165 init1: 2165 opt: 2165 Z-score: 2082.7 bits: 393.7 E(32554): 1.1e-109
Smith-Waterman score: 2165; 100.0% identity (100.0% similar) in 333 aa overlap (1-333:1-333)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDLINSTDYLINASTLVRNSTQFLAPASKMIIALSLYISSIIGTITNGLYLWVLRFKMKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MDLINSTDYLINASTLVRNSTQFLAPASKMIIALSLYISSIIGTITNGLYLWVLRFKMKQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TVNTLLFFHLILSYFISTMILPFMATSQLQDNHWNFGTALCKVFNGTLSLGMFTSVFFLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TVNTLLFFHLILSYFISTMILPFMATSQLQDNHWNFGTALCKVFNGTLSLGMFTSVFFLS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 AIGLDRYLLTLHPVWSQQHRTPRWASSIVLGVWISAAALSIPYLIFRETHHDRKGKVTCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AIGLDRYLLTLHPVWSQQHRTPRWASSIVLGVWISAAALSIPYLIFRETHHDRKGKVTCQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NNYAVSTNWESKEMQASRQWIHVACFISRFLLGFLLPFFIIIFCYERVASKVKERSLFKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 NNYAVSTNWESKEMQASRQWIHVACFISRFLLGFLLPFFIIIFCYERVASKVKERSLFKS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SKPFKVMMTAIISFFVCWMPYHIHQGLLLTTNQSLLLELTLILTVLTTSFNTIFSPTLYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SKPFKVMMTAIISFFVCWMPYHIHQGLLLTTNQSLLLELTLILTVLTTSFNTIFSPTLYL
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE3 FVGENFKKVFKKSILALFESTFSEDSSVERTQT
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FVGENFKKVFKKSILALFESTFSEDSSVERTQT
310 320 330
>>CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 (371 aa)
initn: 712 init1: 372 opt: 724 Z-score: 707.8 bits: 139.5 E(32554): 4.2e-33
Smith-Waterman score: 724; 36.8% identity (68.4% similar) in 326 aa overlap (8-326:18-340)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MDLINSTDYLINASTLVRNSTQFLAPASKMIIALSLYISSIIGTITNGLY
::: .. ..... . . : ........ : ..: . :::
CCDS41 MEDEDYNTSISYGDEYPDYL-DSIVVLEDLSPLEARVTRIFLVVVYSIVCFLGILGNGLV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 LWVLRFKMKQTVNTLLFFHLILSYFISTMILPFMATSQLQDNHWNFGTALCKVFNGTLSL
. . ::::.::: . :..: .. :. ...::. : .: :: ::::.::. : :
CCDS41 IIIATFKMKKTVNMVWFLNLAVADFLFNVFLPIHITYAAMDYHWVFGTAMCKISNFLLIH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 GMFTSVFFLSAIGLDRYLLTLHPVWSQQHRTPRWASSIVLGVWISAAALSIPYLIFRETH
.::::::.:. :. :: . .: :::::.::. : : . .:. : :: : :.::.:
CCDS41 NMFTSVFLLTIISSDRCISVLLPVWSQNHRSVRLAYMACMVIWVLAFFLSSPSLVFRDTA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE3 HDRKGKVTCQNNYAVST----NWESK-EMQASRQWIHVACFISRFLLGFLLPFFIIIFCY
. .::..: ::...:: .: .. .:. :.. ..::: :::.: .:: ::
CCDS41 -NLHGKISCFNNFSLSTPGSSSWPTHSQMDPVGYSRHMVVTVTRFLCGFLVPVLIITACY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 ERVASKVKERSLFKSSKPFKVMMTAIISFFVCWMPYHIHQGLLL--TTNQSLLLELTLIL
.. :... : :..::::...: ::.::.:: ::: . : : :. . .. : : :
CCDS41 LTIVCKLQRNRLAKTKKPFKIIVTIIITFFLCWCPYHTLNLLELHHTAMPGSVFSLGLPL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE3 TVLTTSFNTIFSPTLYLFVGENFKKVFKKSILALFESTFSEDSSVERTQT
.. . :. ..: ::.:.:..::: :: .... . ...:::.
CCDS41 ATALAIANSCMNPILYVFMGQDFKK-FKVALFSRLVNALSEDTGHSSYPSHRSFTKMSSM
300 310 320 330 340 350
CCDS41 NERTSMNERETGML
360 370
>>CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12 (373 aa)
initn: 712 init1: 372 opt: 724 Z-score: 707.8 bits: 139.5 E(32554): 4.2e-33
Smith-Waterman score: 724; 36.8% identity (68.4% similar) in 326 aa overlap (8-326:20-342)
10 20 30 40
pF1KE3 MDLINSTDYLINASTLVRNSTQFLAPASKMIIALSLYISSIIGTITNG
::: .. ..... . . : ........ : ..: . ::
CCDS44 MRMEDEDYNTSISYGDEYPDYL-DSIVVLEDLSPLEARVTRIFLVVVYSIVCFLGILGNG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 LYLWVLRFKMKQTVNTLLFFHLILSYFISTMILPFMATSQLQDNHWNFGTALCKVFNGTL
: . . ::::.::: . :..: .. :. ...::. : .: :: ::::.::. : :
CCDS44 LVIIIATFKMKKTVNMVWFLNLAVADFLFNVFLPIHITYAAMDYHWVFGTAMCKISNFLL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 SLGMFTSVFFLSAIGLDRYLLTLHPVWSQQHRTPRWASSIVLGVWISAAALSIPYLIFRE
.::::::.:. :. :: . .: :::::.::. : : . .:. : :: : :.::.
CCDS44 IHNMFTSVFLLTIISSDRCISVLLPVWSQNHRSVRLAYMACMVIWVLAFFLSSPSLVFRD
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 THHDRKGKVTCQNNYAVST----NWESK-EMQASRQWIHVACFISRFLLGFLLPFFIIIF
: . .::..: ::...:: .: .. .:. :.. ..::: :::.: .::
CCDS44 TA-NLHGKISCFNNFSLSTPGSSSWPTHSQMDPVGYSRHMVVTVTRFLCGFLVPVLIITA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 CYERVASKVKERSLFKSSKPFKVMMTAIISFFVCWMPYHIHQGLLL--TTNQSLLLELTL
:: .. :... : :..::::...: ::.::.:: ::: . : : :. . .. : :
CCDS44 CYLTIVCKLQRNRLAKTKKPFKIIVTIIITFFLCWCPYHTLNLLELHHTAMPGSVFSLGL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE3 ILTVLTTSFNTIFSPTLYLFVGENFKKVFKKSILALFESTFSEDSSVERTQT
:.. . :. ..: ::.:.:..::: :: .... . ...:::.
CCDS44 PLATALAIANSCMNPILYVFMGQDFKK-FKVALFSRLVNALSEDTGHSSYPSHRSFTKMS
300 310 320 330 340 350
CCDS44 SMNERTSMNERETGML
360 370
>>CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19 (351 aa)
initn: 629 init1: 347 opt: 643 Z-score: 630.9 bits: 125.2 E(32554): 8.1e-29
Smith-Waterman score: 643; 33.0% identity (69.9% similar) in 306 aa overlap (29-327:26-330)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDLINSTDYLINASTLVRNSTQFLAPASKMIIALSLYISSIIGTITNGLYLWVLRFKMKQ
... . : .. ..:.. ::: .:: :.: .
CCDS12 METNFSTPLNEYEEVSYESAGYTVLRILPLVVLGVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 TVNTLLFFHLILSYFISTMILPFMATSQLQDNHWNFGTALCKVFNGTLSLGMFTSVFFLS
::.:. ...: :. : : :::. .:. . ..: :: :::... ......: :::...
CCDS12 TVTTICYLNLALADFSFTATLPFLIVSMAMGEKWPFGWFLCKLIHIVVDINLFGSVFLIG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 AIGLDRYLLTLHPVWSQQHRTPRWASSIVLGVWISAAALSIPYLIFRETHHDRKGKVTCQ
:.::: . .:::::.:.::: : ....: :: : .:..: ..: : .: . :
CCDS12 FIALDRCICVLHPVWAQNHRTVSLAMKVIVGPWILALVLTLPVFLFLTTVTIPNGDTYCT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NNYAVSTNWESKEMQASRQWIHVACFISRFLLGFLLPFFIIIFCYERVASKVKERSLFKS
:.: . ...... . .: : ::..:: ::. :. .:: .:.:.......::
CCDS12 FNFASWGGTPEERLKVAITML-TARGIIRFVIGFSLPMSIVAICYGLIAAKIHKKGMIKS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KE3 SKPFKVMMTAIISFFVCWMPYHIHQGLLLTTNQSLLL----ELTLILTVLTTS---FNTI
:.:..:. ... :::.::.:... : . . .:. .. ::. :.: ::.
CCDS12 SRPLRVLTAVVASFFICWFPFQLVALLGTVWLKEMLFYGKYKIIDILVNPTSSLAFFNSC
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE3 FSPTLYLFVGENFKKVFKKSILALFESTFSEDSSVERTQT
..: ::.:::..:.. . .:. . .: ..::::.
CCDS12 LNPMLYVFVGQDFRERLIHSLPTSLERALSEDSAPTNDTAANSASPPAETELQAM
300 310 320 330 340 350
>>CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19 (353 aa)
initn: 624 init1: 382 opt: 633 Z-score: 621.3 bits: 123.4 E(32554): 2.7e-28
Smith-Waterman score: 633; 33.0% identity (67.6% similar) in 312 aa overlap (26-324:19-327)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MDLINSTDYLINASTLVRNSTQFLAPASKMII-ALSLYISSI---IGTITNGLYLWVLRF
::.. .. .:: . .. .:.. ::: .:: :
CCDS12 METNFSIPLNETEEVLPEPAGHTVLWIFSLLVHGVTFVFGVLGNGLVIWVAGF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 KMKQTVNTLLFFHLILSYFISTMILPFMATSQLQDNHWNFGTALCKVFNGTLSLGMFTSV
.: .::::. ...: :. : . :::: .: . ..: ::. :::. . .....:.::
CCDS12 RMTRTVNTICYLNLALADFSFSAILPFRMVSVAMREKWPFGSFLCKLVHVMIDINLFVSV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 FFLSAIGLDRYLLTLHPVWSQQHRTPRWASSIVLGVWISAAALSIPYLIFRETHHDRKGK
.... :.::: . .:::.:.:.::: :. .. :.:: . .:..: .:: : .:
CCDS12 YLITIIALDRCICVLHPAWAQNHRTMSLAKRVMTGLWIFTIVLTLPNFIFWTTISTTNGD
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 VTCQNNYAVSTNWESKEMQASRQWIHVA--CFISRFLLGFLLPFFIIIFCYERVASKVKE
. : :.: : . .. .: .: .: .:..:: .:. :: :: .:.:...
CCDS12 TYCIFNFAF---WGDTAVERLNVFITMAKVFLILHFIIGFSVPMSIITVCYGIIAAKIHR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE3 RSLFKSSKPFKVMMTAIISFFVCWMPYHIHQGLLLTTNQSLLL----ELTLILTVLTTS-
..:::.:..:. ... :::.::.::.. :. . . .:: .. :.: :.:
CCDS12 NHMIKSSRPLRVFAAVVASFFICWFPYELIGILMAVWLKEMLLNGKYKIILVLINPTSSL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE3 --FNTIFSPTLYLFVGENFKKVFKKSILALFESTFSEDSSVERTQT
::. ..: ::.:.:.::.. . .:. . .: ...:
CCDS12 AFFNSCLNPILYVFMGRNFQERLIRSLPTSLERALTEVPDSAQTSNTDTTSASPPEETEL
300 310 320 330 340 350
CCDS12 QAM
>>CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19 (350 aa)
initn: 637 init1: 389 opt: 625 Z-score: 613.7 bits: 122.0 E(32554): 7.3e-28
Smith-Waterman score: 625; 32.1% identity (67.2% similar) in 305 aa overlap (30-327:27-329)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDLINSTDYLINASTLVRNSTQFLAPASKMIIALSLYISSIIGTITNGLYLWVLRFKMKQ
.: : . .. ..:.. ::: .:: :.: .
CCDS12 METNSSLPTNISGGTPAVSAGYLFLDIITYLVFAVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTH
10 20 30 40 50
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CCDS12 LNPMLYVFMGQDFRERLIHALPASLERALTEDSTQTSDTATNSTLPSAEVELQAK
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CCDS23 VISLDHYIHLIHPVLSHRHRTLKNSLIVIIFIWLLASLIGGPALYFRDTV-EFNNHTLCY
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CCDS23 ILYVLISKKFQARFRSSVAEILKYTLWEVSCSGTVSEQLRNSETKNLCLLETAQ
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CCDS79 LHLALSDLLASASLPFFTYFLAVGHSWELGTTFCKLHSSIFFLNMFASGFLLSAISLDRC
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CCDS79 LQVVRPVWAQNHRTVAAAHKVCLVLWALAVLNTVPYFVFRDTISRLDGRIMCYYNVLLLN
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CCDS79 PGPDRDATCNSRQ---VALAVSKFLLAFLVPLAIIASSHAAVSLRLQHRGRRRPGRFVRL
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CCDS79 CPDMLRKLRRSLRTVLESVLVDDSELGGAGSSRRRRTSSTARSASPLALCSRPEEPRGPA
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CCDS12 MNGVSEGTRGCSDRQPGVLTRDRSCSRKMNSSGCLSEEVGSLRPLTVVILSASI----VV
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CCDS12 GVLGNGLVLWMTVFRMARTVSTVCFFHLALADFMLSLSLP-IAMYYIVSRQWLLGEWACK
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CCDS12 LYITFVFLSYFASNCLLVFISVDRCISVLYPVWALNHRTVQRASWLAFGVWLLAAALCSA
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CCDS12 LSSCPRGNAPRE
350
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CCDS11 MDMADEPLNGSHTWLSIPFDLNGSVVSTNTSNQTEPYYDLTSNAVLTFIYFVVCIIGLCG
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CCDS11 YAGLRSNQWGRSSC------TINWPGE----SGAW-YTGFIIYTFILGFLVPLTIICLCY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]