Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3721
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3721, 413 aa
1>>>pF1KE3721 413 - 413 aa - 413 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7202+/-0.000365; mu= 20.2217+/- 0.023
mean_var=66.1332+/-13.797, 0's: 0 Z-trim(113.6): 55 B-trim: 1047 in 1/50
Lambda= 0.157712
statistics sampled from 23030 (23085) to 23030 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.646), E-opt: 0.2 (0.271), width: 16
Scan time: 6.830
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_011537884 (OMIM: 611573) PREDICTED: phosphatidy ( 413) 2937 677.3 1.9e-194
NP_671512 (OMIM: 611573) phosphatidylcholine:ceram ( 413) 2937 677.3 1.9e-194
XP_005269732 (OMIM: 611573) PREDICTED: phosphatidy ( 413) 2937 677.3 1.9e-194
XP_011537885 (OMIM: 611573) PREDICTED: phosphatidy ( 413) 2937 677.3 1.9e-194
NP_689834 (OMIM: 611574) phosphatidylcholine:ceram ( 365) 1546 360.7 3.3e-99
XP_011530004 (OMIM: 611574) PREDICTED: phosphatidy ( 365) 1546 360.7 3.3e-99
XP_011530002 (OMIM: 611574) PREDICTED: phosphatidy ( 365) 1546 360.7 3.3e-99
XP_016863328 (OMIM: 611574) PREDICTED: phosphatidy ( 365) 1546 360.7 3.3e-99
NP_001129729 (OMIM: 611574) phosphatidylcholine:ce ( 365) 1546 360.7 3.3e-99
NP_001129730 (OMIM: 611574) phosphatidylcholine:ce ( 365) 1546 360.7 3.3e-99
XP_016863329 (OMIM: 611574) PREDICTED: phosphatidy ( 365) 1546 360.7 3.3e-99
XP_011530001 (OMIM: 611574) PREDICTED: phosphatidy ( 365) 1546 360.7 3.3e-99
XP_011530003 (OMIM: 611574) PREDICTED: phosphatidy ( 365) 1546 360.7 3.3e-99
XP_011530000 (OMIM: 611574) PREDICTED: phosphatidy ( 365) 1546 360.7 3.3e-99
XP_011537886 (OMIM: 611573) PREDICTED: phosphatidy ( 225) 1456 340.1 3.3e-93
XP_016863330 (OMIM: 611574) PREDICTED: phosphatidy ( 242) 1002 236.8 4.4e-62
XP_011537614 (OMIM: 611575) PREDICTED: sphingomyel ( 415) 890 211.5 3.1e-54
XP_016871228 (OMIM: 611575) PREDICTED: sphingomyel ( 415) 890 211.5 3.1e-54
NP_001167627 (OMIM: 611575) sphingomyelin synthase ( 415) 890 211.5 3.1e-54
XP_005269598 (OMIM: 611575) PREDICTED: sphingomyel ( 415) 890 211.5 3.1e-54
XP_016871227 (OMIM: 611575) PREDICTED: sphingomyel ( 429) 890 211.5 3.1e-54
XP_011537613 (OMIM: 611575) PREDICTED: sphingomyel ( 478) 890 211.6 3.4e-54
NP_653261 (OMIM: 611575) sphingomyelin synthase-re ( 326) 559 136.1 1.2e-31
>>XP_011537884 (OMIM: 611573) PREDICTED: phosphatidylcho (413 aa)
initn: 2937 init1: 2937 opt: 2937 Z-score: 3611.9 bits: 677.3 E(85289): 1.9e-194
Smith-Waterman score: 2937; 100.0% identity (100.0% similar) in 413 aa overlap (1-413:1-413)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCEPLEHFTGQDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCEPLEHFTGQDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LDMIETLKMEHHLEAHKNGHANGHLNIGVDIPTPDGSFSIKIKPNGMPNGYRKEMIKIPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDMIETLKMEHHLEAHKNGHANGHLNIGVDIPTPDGSFSIKIKPNGMPNGYRKEMIKIPM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PELERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PELERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 QWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKSIISRRFFCIVGTLYLYRCITMYVTTLPVPGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKSIISRRFFCIVGTLYLYRCITMYVTTLPVPGM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 HFNCSPKLFGDWEAQLRRIMKLIAGGGLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HFNCSPKLFGDWEAQLRRIMKLIAGGGLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 PRRLWWYHWICWLLSVVGIFCILLAHDHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PRRLWWYHWICWLLSVVGIFCILLAHDHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEAS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE3 QMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVPRSYHWPFPWPVVHLSRQVKYSRLVNDT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVPRSYHWPFPWPVVHLSRQVKYSRLVNDT
370 380 390 400 410
>>NP_671512 (OMIM: 611573) phosphatidylcholine:ceramide (413 aa)
initn: 2937 init1: 2937 opt: 2937 Z-score: 3611.9 bits: 677.3 E(85289): 1.9e-194
Smith-Waterman score: 2937; 100.0% identity (100.0% similar) in 413 aa overlap (1-413:1-413)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCEPLEHFTGQDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 MKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCEPLEHFTGQDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LDMIETLKMEHHLEAHKNGHANGHLNIGVDIPTPDGSFSIKIKPNGMPNGYRKEMIKIPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 LDMIETLKMEHHLEAHKNGHANGHLNIGVDIPTPDGSFSIKIKPNGMPNGYRKEMIKIPM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PELERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 PELERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 QWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKSIISRRFFCIVGTLYLYRCITMYVTTLPVPGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 QWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKSIISRRFFCIVGTLYLYRCITMYVTTLPVPGM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 HFNCSPKLFGDWEAQLRRIMKLIAGGGLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 HFNCSPKLFGDWEAQLRRIMKLIAGGGLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 PRRLWWYHWICWLLSVVGIFCILLAHDHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 PRRLWWYHWICWLLSVVGIFCILLAHDHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEAS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE3 QMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVPRSYHWPFPWPVVHLSRQVKYSRLVNDT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_671 QMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVPRSYHWPFPWPVVHLSRQVKYSRLVNDT
370 380 390 400 410
>>XP_005269732 (OMIM: 611573) PREDICTED: phosphatidylcho (413 aa)
initn: 2937 init1: 2937 opt: 2937 Z-score: 3611.9 bits: 677.3 E(85289): 1.9e-194
Smith-Waterman score: 2937; 100.0% identity (100.0% similar) in 413 aa overlap (1-413:1-413)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCEPLEHFTGQDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCEPLEHFTGQDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LDMIETLKMEHHLEAHKNGHANGHLNIGVDIPTPDGSFSIKIKPNGMPNGYRKEMIKIPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LDMIETLKMEHHLEAHKNGHANGHLNIGVDIPTPDGSFSIKIKPNGMPNGYRKEMIKIPM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PELERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PELERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 QWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKSIISRRFFCIVGTLYLYRCITMYVTTLPVPGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKSIISRRFFCIVGTLYLYRCITMYVTTLPVPGM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 HFNCSPKLFGDWEAQLRRIMKLIAGGGLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HFNCSPKLFGDWEAQLRRIMKLIAGGGLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 PRRLWWYHWICWLLSVVGIFCILLAHDHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PRRLWWYHWICWLLSVVGIFCILLAHDHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEAS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE3 QMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVPRSYHWPFPWPVVHLSRQVKYSRLVNDT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVPRSYHWPFPWPVVHLSRQVKYSRLVNDT
370 380 390 400 410
>>XP_011537885 (OMIM: 611573) PREDICTED: phosphatidylcho (413 aa)
initn: 2937 init1: 2937 opt: 2937 Z-score: 3611.9 bits: 677.3 E(85289): 1.9e-194
Smith-Waterman score: 2937; 100.0% identity (100.0% similar) in 413 aa overlap (1-413:1-413)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCEPLEHFTGQDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MKEVVYWSPKKVADWLLENAMPEYCEPLEHFTGQDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LDMIETLKMEHHLEAHKNGHANGHLNIGVDIPTPDGSFSIKIKPNGMPNGYRKEMIKIPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDMIETLKMEHHLEAHKNGHANGHLNIGVDIPTPDGSFSIKIKPNGMPNGYRKEMIKIPM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PELERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PELERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCFVLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 QWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKSIISRRFFCIVGTLYLYRCITMYVTTLPVPGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLKYKSIISRRFFCIVGTLYLYRCITMYVTTLPVPGM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 HFNCSPKLFGDWEAQLRRIMKLIAGGGLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HFNCSPKLFGDWEAQLRRIMKLIAGGGLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 PRRLWWYHWICWLLSVVGIFCILLAHDHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PRRLWWYHWICWLLSVVGIFCILLAHDHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEAS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE3 QMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVPRSYHWPFPWPVVHLSRQVKYSRLVNDT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVPRSYHWPFPWPVVHLSRQVKYSRLVNDT
370 380 390 400 410
>>NP_689834 (OMIM: 611574) phosphatidylcholine:ceramide (365 aa)
initn: 1520 init1: 1480 opt: 1546 Z-score: 1902.2 bits: 360.7 E(85289): 3.3e-99
Smith-Waterman score: 1546; 60.7% identity (83.1% similar) in 354 aa overlap (61-409:1-354)
40 50 60 70 80
pF1KE3 FTGQDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRLLDMIETLKMEHHLEAHKNGHANGHLNIG--
.:.::: :.:.::: . . .: . .
NP_689 MDIIETAKLEEHLENQPSDPTNTYARPAEP
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 VDIPTPDGSFSIKIKPNGMPNGYRK--EMIKIPMPELERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCF
:. . .:. . : .:. .: .: ..:.: :: :...:.:: :: .::.::. .
NP_689 VEEENKNGNGKPKSLSSGLRKGTKKYPDYIQIAMPTESRNKFPLEWWKTGIAFIYAVFNL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 VLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRVQWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLK
:::::::.::::::::::..::::: :::...::.::::. ::::.::::::. :::.:.
NP_689 VLTTVMITVVHERVPPKELSPPLPDKFFDYIDRVKWAFSVSEINGIILVGLWITQWLFLR
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 YKSIISRRFFCIVGTLYLYRCITMYVTTLPVPGMHFNCSPKLFGDWEAQLRRIMKLIAGG
::::..::: :.:::::::::::::::::::::::.:.::: :: .:...::..::.::
NP_689 YKSIVGRRFCFIIGTLYLYRCITMYVTTLPVPGMHFQCAPKLNGDSQAKVQRILRLISGG
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 GLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYSPRRLWWYHWICWLLSVVGIFCILLAH
:::::::: .:::.:.::::: ::::::::::::::..:::: ::::::..::.:::.::
NP_689 GLSITGSHILCGDFLFSGHTVTLTLTYLFIKEYSPRHFWWYHLICWLLSAAGIICILVAH
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 DHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEASQMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVP
.:::.::..:::::::::::::.:::.. :: .:: :.:.:.::. : .::::::: .:
NP_689 EHYTIDVIIAYYITTRLFWWYHSMANEKNLKVSSQTNFLSRAWWFPIFYFFEKNVQGSIP
280 290 300 310 320 330
390 400 410
pF1KE3 RSYHWPFPWPV-VHLSRQVKYSRLVNDT
. ::. :: : ::::.
NP_689 CCFSWPLSWPPGCFKSSCKKYSRVQKIGEDNEKST
340 350 360
>>XP_011530004 (OMIM: 611574) PREDICTED: phosphatidylcho (365 aa)
initn: 1520 init1: 1480 opt: 1546 Z-score: 1902.2 bits: 360.7 E(85289): 3.3e-99
Smith-Waterman score: 1546; 60.7% identity (83.1% similar) in 354 aa overlap (61-409:1-354)
40 50 60 70 80
pF1KE3 FTGQDLINLTQEDFKKPPLCRVSSDNGQRLLDMIETLKMEHHLEAHKNGHANGHLNIG--
.:.::: :.:.::: . . .: . .
XP_011 MDIIETAKLEEHLENQPSDPTNTYARPAEP
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 VDIPTPDGSFSIKIKPNGMPNGYRK--EMIKIPMPELERSQYPMEWGKTFLAFLYALSCF
:. . .:. . : .:. .: .: ..:.: :: :...:.:: :: .::.::. .
XP_011 VEEENKNGNGKPKSLSSGLRKGTKKYPDYIQIAMPTESRNKFPLEWWKTGIAFIYAVFNL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 VLTTVMISVVHERVPPKEVQPPLPDTFFDHFNRVQWAFSICEINGMILVGLWLIQWLLLK
:::::::.::::::::::..::::: :::...::.::::. ::::.::::::. :::.:.
XP_011 VLTTVMITVVHERVPPKELSPPLPDKFFDYIDRVKWAFSVSEINGIILVGLWITQWLFLR
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 YKSIISRRFFCIVGTLYLYRCITMYVTTLPVPGMHFNCSPKLFGDWEAQLRRIMKLIAGG
::::..::: :.:::::::::::::::::::::::.:.::: :: .:...::..::.::
XP_011 YKSIVGRRFCFIIGTLYLYRCITMYVTTLPVPGMHFQCAPKLNGDSQAKVQRILRLISGG
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 GLSITGSHNMCGDYLYSGHTVMLTLTYLFIKEYSPRRLWWYHWICWLLSVVGIFCILLAH
:::::::: .:::.:.::::: ::::::::::::::..:::: ::::::..::.:::.::
XP_011 GLSITGSHILCGDFLFSGHTVTLTLTYLFIKEYSPRHFWWYHLICWLLSAAGIICILVAH
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 DHYTVDVVVAYYITTRLFWWYHTMANQQVLKEASQMNLLARVWWYRPFQYFEKNVQGIVP
.:::.::..:::::::::::::.:::.. :: .:: :.:.:.::. : .::::::: .:
XP_011 EHYTIDVIIAYYITTRLFWWYHSMANEKNLKVSSQTNFLSRAWWFPIFYFFEKNVQGSIP
280 290 300 310 320 330
390 400 410
pF1KE3 RSYHWPFPWPV-VHLSRQVKYSRLVNDT
. ::. :: : ::::.
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NP_001 EHYTIDVIIAYYITTRLFWWYHSMANEKNLKVSSQTNFLSRAWWFPIFYFFEKNVQGSIP
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