Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3691
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3691, 655 aa
1>>>pF1KE3691 655 - 655 aa - 655 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8325+/-0.000976; mu= 16.2394+/- 0.058
mean_var=70.8446+/-14.437, 0's: 0 Z-trim(103.8): 172 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.152377
statistics sampled from 7397 (7584) to 7397 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16
Scan time: 2.870
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 655) 4429 983.4 0
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 639) 4200 933.1 0
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 658) 4200 933.1 0
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 613) 4142 920.3 0
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 ( 617) 3911 869.5 0
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 ( 615) 1630 368.1 2.1e-101
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 616) 1462 331.1 2.7e-90
CCDS34478.1 KLHL31 gene_id:401265|Hs108|chr6 ( 634) 1314 298.6 1.7e-80
CCDS32813.1 KLHL14 gene_id:57565|Hs108|chr18 ( 628) 1188 270.9 3.7e-72
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 1177 268.5 2e-71
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 1040 238.4 2.6e-62
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 1040 238.4 2.7e-62
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 1034 237.0 5.3e-62
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 977 224.5 3.8e-58
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 964 221.7 2.3e-57
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 959 220.6 4.9e-57
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 718) 944 217.3 5.9e-56
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 944 217.3 5.9e-56
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 941 216.6 9.7e-56
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 923 212.6 1.2e-54
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 918 211.6 2.6e-54
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 918 211.6 2.6e-54
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 909 209.6 1e-53
CCDS35217.1 KLHL15 gene_id:80311|Hs108|chrX ( 604) 907 209.1 1.4e-53
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 555) 901 207.8 3.3e-53
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 687) 888 205.0 2.9e-52
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 883 203.9 5.8e-52
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 882 203.6 6.1e-52
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17 ( 608) 868 200.6 5.5e-51
CCDS69155.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 551) 836 193.5 6.6e-49
CCDS69154.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 584) 836 193.5 6.9e-49
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 789 183.2 9.4e-46
CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 ( 553) 771 179.2 1.3e-44
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 620) 713 166.5 1e-40
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 ( 600) 707 165.2 2.4e-40
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 695 162.5 1.5e-39
CCDS53882.1 KLHL33 gene_id:123103|Hs108|chr14 ( 533) 694 162.3 1.6e-39
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 680 159.2 1.4e-38
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16 ( 597) 679 159.0 1.7e-38
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8 ( 581) 643 151.1 4.1e-36
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 639 150.2 7.5e-36
CCDS14199.1 KLHL34 gene_id:257240|Hs108|chrX ( 644) 633 148.9 2e-35
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 538) 600 141.6 2.7e-33
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 ( 597) 583 137.9 3.9e-32
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11 ( 583) 581 137.5 5.2e-32
CCDS34614.1 KBTBD2 gene_id:25948|Hs108|chr7 ( 623) 558 132.4 1.8e-30
CCDS5038.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 620) 555 131.8 2.9e-30
CCDS77937.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4 ( 544) 542 128.9 1.9e-29
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 509 121.6 3e-27
CCDS8334.1 KBTBD3 gene_id:143879|Hs108|chr11 ( 612) 503 120.3 7.8e-27
>>CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (655 aa)
initn: 4429 init1: 4429 opt: 4429 Z-score: 5259.1 bits: 983.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4429; 100.0% identity (100.0% similar) in 655 aa overlap (1-655:1-655)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPLKWKTSSPAIWKFPVPVLKTSRSTPLSPAYISLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MPLKWKTSSPAIWKFPVPVLKTSRSTPLSPAYISLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 SKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 AMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 DFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 AFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 FMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLRQQLVVSKELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLRQQLVVSKELR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 MYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 WMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 WMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 HAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 GGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KE3 CMVEIVQKYDPDKDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CMVEIVQKYDPDKDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
610 620 630 640 650
>>CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (639 aa)
initn: 4200 init1: 4200 opt: 4200 Z-score: 4987.2 bits: 933.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4200; 100.0% identity (100.0% similar) in 622 aa overlap (34-655:18-639)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 KWKTSSPAIWKFPVPVLKTSRSTPLSPAYISLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MDHLHRGELVAAILRNRSLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKA
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 GPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFC
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 KVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMR
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 TDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYD
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 EKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQ
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 VASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAG
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 TVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGN
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 HFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMV
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650
pF1KE3 EIVQKYDPDKDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EIVQKYDPDKDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
590 600 610 620 630
>>CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (658 aa)
initn: 4200 init1: 4200 opt: 4200 Z-score: 4987.0 bits: 933.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4200; 100.0% identity (100.0% similar) in 622 aa overlap (34-655:37-658)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 KWKTSSPAIWKFPVPVLKTSRSTPLSPAYISLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LREKWAYWRRRQLSLKQADFKDIFKKSTSGSLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 GPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 KVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 TDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 EKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 VASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 TVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TVYGGVMYISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 HFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HFRGTSDYDDVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KE3 EIVQKYDPDKDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EIVQKYDPDKDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
610 620 630 640 650
>>CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX (613 aa)
initn: 4142 init1: 4142 opt: 4142 Z-score: 4918.6 bits: 920.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4142; 100.0% identity (100.0% similar) in 613 aa overlap (43-655:1-613)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 WKFPVPVLKTSRSTPLSPAYISLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSN
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 THSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 THSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDL
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 MCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVT
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 LDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHC
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 TELELFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TELELFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLL
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 LEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKSL
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 APMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 APMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRT
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KE3 FFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYI
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 SGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYD
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KE3 DVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPD
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650
pF1KE3 KDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
580 590 600 610
>>CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 (617 aa)
initn: 3911 init1: 3911 opt: 3911 Z-score: 4644.1 bits: 869.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3911; 92.8% identity (98.2% similar) in 613 aa overlap (43-655:1-613)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 WKFPVPVLKTSRSTPLSPAYISLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSN
::.:::..:::.:.::: ::: ::.::::
CCDS65 MKVSLGNGEMGVSAHLQPCKAGTTRFFTSN
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 THSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDL
::::::::::::::.:::::::::.::: :. :::::.::::::::::::::::::::::
CCDS65 THSSVVLQGFDQLRIEGLLCDVTLVPGDGDEIFPVHRAMMASASDYFKAMFTGGMKEQDL
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 MCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVT
::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS65 MCIKLHGVNKVGLKKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVS
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 LDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHC
:::::::::::::::: :::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LDNCVEVGRIANTYNLIEVDKYVNNFILKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHC
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 TELELFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLL
::::::::.:::::::.::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS65 TELELFKAACRWLRLEDPRMDYAAKLMKNIRFPLMTPQDLINYVQTVDFMRTDNTCVNLL
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 LEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDEKAHEWKSL
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:.::.::
CCDS65 LEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDSTHLVTLGGVLRQQLVVSKELRMYDERAQEWRSL
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 APMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 APMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRT
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KE3 FFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYI
:::::::::.:::::::.::::: :::::::: :::.:::::::::::::::::::.:::
CCDS65 FFHLSALKGHLYAVGGRSAAGELATVECYNPRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYI
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 SGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYD
::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::..::::::::::::::::
CCDS65 SGGITHDTFQNELMCFDPDTDKWMQKAPMTTVRGLHCMCTVGDKLYVIGGNHFRGTSDYD
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KE3 DVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPD
:::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS65 DVLSCEYYSPTLDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPE
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650
pF1KE3 KDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
:::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::
CCDS65 KDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEENPGSPSRESPLSAPSDHS
580 590 600 610
>>CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19 (615 aa)
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Smith-Waterman score: 1630; 43.0% identity (73.1% similar) in 584 aa overlap (60-638:30-609)
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 PAYISLVEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTR-IFTSNTHSSVVLQGFDQLRLE
..: : . :.. .::. .:::. :: .
CCDS12 MAESGGSSGGAGGGGAFGAGPGPERPNSTADKNGALKCTFSAPSHSTSLLQGLATLRAQ
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 GLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKI
: : ::.: . .:::.:.:..:. ::::.:::::::.: . :.:.::: :::.:
CCDS12 GQLLDVVLTIN--REAFPAHKVVLAACSDYFRAMFTGGMREASQDVIELKGVSARGLRHI
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 IDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNL
::: :.:...:..: .::.: :: :::.:::...:. :: .......:...:..:.:..:
CCDS12 IDFAYSAEVTLDLDCVQDVLGAAVFLQMLPVVELCEEFLKAAMSVETCLNIGQMATTFSL
120 130 140 150 160 170
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 TEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLE
. . . :..:....: . .::.::.:::.: :.:: :. :.:..::.:. :::. .
CCDS12 ASLRESVDAFTFRHFLQIAEEEDFLRLPLERLVFFLQSNRLQSCAEIDLFRAAVRWLQHD
180 190 200 210 220 230
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 EPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVM
: :.... .:::::: .::.. :::.:.: : : . :::: :::..:. : :
CCDS12 PARRPRASHVLCHIRFPLMQSSELVDSVQTLDIMVEDVLCRQYLLEAFNYQVLPFRQHEM
240 250 260 270 280 290
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 QSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLR---QQLVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIA
:: :::.:::. :::.::. .. : :: .. . :.... :. :.. . .:
CCDS12 QSPRTAVRSDVPSLVTFGGTPYTDSDRSVSSKVYQLPEPGARHFRELTEMEVGCSHTCVA
300 310 320 330 340 350
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 VIGNFLYVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYA
:. ::.::.::: .:. :::. .:.::. :.:... ...:.: :.:..: :..::
CCDS12 VLDNFVYVAGGQHLQYRSGEGAVDACYRYDPHLNRWLRLQAMQESRIQFQLNVLCGMVYA
360 370 380 390 400 410
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 VGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHDTFQKE-
.:::: :: : .:: : :: ::: :. .... .::::.. :: .::::: .. .:.
CCDS12 TGGRNRAGSLASVERYCPRRNEWGYACSLKRRTWGHAGAASGGRLYISGGYGISVEDKKA
420 430 440 450 460 470
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 LMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDYDDVLSCEYYSPIL
: :.:: .:.: ::::. : :: : .: :.:..:: . .: ::. ::: :
CCDS12 LHCYDPVADQWEFKAPMSEPRVLHAMVGAGGRIYALGGRMDHVDRCFD-VLAVEYYVPET
480 490 500 510 520 530
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 DQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVFDLPE
:::: .. : :::..: ..: :::.::::.: .. ::: :. : :::.. . .::
CCDS12 DQWTSVSPMRAGQSEAGCCLLERKIYIVGGYNWRLNNVTGIVQVYNTDTDEWERDLHFPE
540 550 560 570 580 590
630 640 650
pF1KE3 SLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
:..:: ::. ...:
CCDS12 SFAGI-ACAPVLLPRAGTRR
600 610
>>CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16 (616 aa)
initn: 1387 init1: 417 opt: 1462 Z-score: 1734.5 bits: 331.1 E(32554): 2.7e-90
Smith-Waterman score: 1462; 37.9% identity (70.8% similar) in 586 aa overlap (66-641:20-601)
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 VEEEDQHMKLSLGGSEMGLSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSSVVLQGFDQLRLEGLLCDVT
.... :::.::: ... ::.::.:::.
CCDS10 MMEGSRQTRVSRPYKISESSKVYRWADHSSTVLQRLNEQRLRGLFCDVV
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 LMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIKLHGVSKVGLRKIIDFIYTA
:. .. :.:: ..: ::::..::: ::.: ..: :.: .::. ..::.: .
CCDS10 LVAD--EQRVPAHRNLLAVCSDYFNSMFTIGMREAFQKEVELIGASYIGLKAVVDFLYGG
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 KLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNCVEVGRIANTYNLTEVDKYV
.: :. :.. .::.: .::: :.::: .: . :. :: . . ..:. :.: ..: ..
CCDS10 ELVLDGGNIDYVLETAHLLQIWTVVDFCCEYLEQEVSEDNYLYLQELASIYSLKRLDAFI
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 NSFVLKNFPALLSTGEFLK-LPFERLAFVLSSNSLKHCTELELFKATCRWLRLEEPRMDF
..:.:..: .: : .::. . ...: :::. ... : .:..:. .:: . :
CCDS10 DGFILNHFGTLSFTPDFLQNVSMQKLCVYLSSSEVQRECEHDLLQAALQWLTQQPEREAH
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 AAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTV--DFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDR
: ....::.:::. ..:.. :. . ... . .: ... :: :. :::::. :
CCDS10 ARQVLENIHFPLIPKNDLLHRVKPAVCSLLPKEANCEGFIEEAVRYHNNLAAQPVMQTKR
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 TAIRSDTTHLVTLGGVLRQQ-LVVSKELRMYDEKAHEWKSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFL
::.:.. .:. .:: . .. : .: . . : :...: . .:. : : .: .::.:.:.
CCDS10 TALRTNQERLLFVGGEVSERCLELSDDTCYLDAKSEQWVKETPLPARRSHHCVAVLGGFI
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 YVVGGQSNYDTKGKTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGYLYAVGGRNA
...::. . :. : .: . ..:.::: ..:..:::.:..:. :.:.... .: :.::::
CCDS10 FIAGGSFSRDNGGDAASNLLYRYDPRCKQWIKVASMNQRRVDFYLASIEDMLVAIGGRNE
350 360 370 380 390 400
460 470 480 490 500
pF1KE3 AGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMYISGGITHD----TFQKELMC
: : .:: :.:.:. :.::: . . ::::::.: .::::: :: ..:.:.:
CCDS10 NGALSSVETYSPKTDSWSYVAGLPRFTYGHAGTIYKDFVYISGG--HDYQIGPYRKNLLC
410 420 430 440 450 460
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 FDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTS-DYDDVLSCEYYSPILDQ
.: :: : .. ::::.:: : ::..:. .: :::. : . :::. : ::: .:
CCDS10 YDHRTDVWEERRPMTTARGWHSMCSLGDSIYSIGGSDDNIESMERFDVLGVEAYSPQCNQ
470 480 490 500 510 520
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 WTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDPDKDEWHKVFDLPESL
:: .: .:...:. ::::.:..::..:::::.: . . :: :: . :.: . :::...
CCDS10 WTRVAPLLHANSESGVAVWEGRIYILGGYSWENTAFSKTVQVYDREADKWSRGVDLPKAI
530 540 550 560 570 580
630 640 650
pF1KE3 GGIRACTLTVFP-PEETTPSPSRESPLSAP
.: ::. .. : ::.
CCDS10 AGGSACVCALEPRPEDKKKKGKGKRHQDRGQ
590 600 610
>>CCDS34478.1 KLHL31 gene_id:401265|Hs108|chr6 (634 aa)
initn: 1429 init1: 615 opt: 1314 Z-score: 1558.5 bits: 298.6 E(32554): 1.7e-80
Smith-Waterman score: 1315; 34.6% identity (67.7% similar) in 613 aa overlap (48-654:39-629)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 PVLKTSRSTPLSPAYISLVEEEDQHMKLSLGGSEMG-LSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSS
::. .. .::.: ... ::.
CCDS34 KKNKGDINEMTIIVEDSPLNKLNALNGLLEGGNGLSCISSELTDASYGPN----------
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 VVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIK
.:.:....: :..::: :. : .: ::. .::: :.:: .. :. ... .
CCDS34 -LLEGLSKMRQENFLCD--LVIGTKTKSFDVHKSVMASCSEYFYNILK---KDPSIQRVD
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 LHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNC
:. .: .:: .: . ::.::.:.. .. . . :: .::: .. .:. ::: ....::
CCDS34 LNDISPLGLATVIAYAYTGKLTLSLYTIGSIISAAVYLQIHTLVKMCSDFLIREMSVENC
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 VEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELE
. : ::.::.: .. ...:. :: . . .:.:: ::.. .: ...:. .:.
CCDS34 MYVVNIAETYSLKNAKAAAQKFIRDNFLEFAESDQFMKLTFEQINELLIDDDLQLPSEIV
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 LFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEAS
:. . .::.... :. .:: :..:::: .. :.:.::::.: : : : ::..:
CCDS34 AFQIAMKWLEFDQKRVKYAADLLSNIRFGTISAQDLVNYVQSVPRMMQDADCHRLLVDAM
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 NYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSDTTHLVTLGGVLRQQLV---VSKELRMYDEKAHEWKSLA
::...:: : ..:: :: ::. :::.:: : :. .:... .: . . :..:.
CCDS34 NYHLLPYHQNTLQSRRTRIRGGCRVLVTVGG--RPGLTEKSLSRDI-LYRDPENGWSKLT
300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 PMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVGGQSNYDTKG--KTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKR
: : ... .::. .::::.::... :... : ::.. :.:::.: :...::.:.::
CCDS34 EMPAKSFNQCVAVMDGFLYVAGGEDQNDARNQAKHAVSNFCRYDPRFNTWIHLASMNQKR
350 360 370 380 390 400
440 450 460 470 480 490
pF1KE3 TFFHLSALKGYLYAVGGRNAAGELPTVECYNPRTNEWTYVAKMSEPHYGHAGTVYGGVMY
: : ::...: .::.::::: : : ..::: : ::.: . . . ::..: : .
CCDS34 THFSLSVFNGLVYAAGGRNAEGSLASLECYVPSTNQWQPKTPLEVARCCHASAVADGRVL
410 420 430 440 450 460
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 ISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDY
..:: ..... . .:: .:.: . ..: :: :: :...:.::.::... ..
CCDS34 VTGGYIANAYSRSVCAYDPASDSWQELPNLSTPRGWHCAVTLSDRVYVMGGSQLGPRGER
470 480 490 500 510 520
560 570 580 590 600 610
pF1KE3 DDVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDP
:::. : ::: ::. : . : : .::...... :.:::.. ... . . .: ..:
CCDS34 VDVLTVECYSPATGQWSYAAPLQVGVSTAGVSALHGRAYLVGGWNEGEKKYKKCIQCFSP
530 540 550 560 570 580
620 630 640 650
pF1KE3 DKDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP
. .:: . .:::. :. :::.. :...: :: : .:.
CCDS34 ELNEWTEDDELPEATVGVSCCTLSM--PNNVT-RESRASSVSSVPVSI
590 600 610 620 630
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CCDS32 ILPSCVPYNK
620
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CCDS13 EGRHIEA---HRILLAASCDYFRGMFAGGLKEMEQEEVLIHGVSYNAMCQILHFIYTSEL
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CCDS13 ELSLSNVQETLVAACQLQIPEIIHFCCDFLMSWVDEENILDVYRLAELFDLSRLTEQLDT
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CCDS13 LHEPPKLLETVRFPLMEAEVLQRLHDKLDPSPLRDTVASALM----YHRNESLQPSLQSP
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655 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 06:18:33 2016 done: Sun Nov 6 06:18:34 2016
Total Scan time: 2.870 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]