Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3655
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3655, 1012 aa
1>>>pF1KE3655 1012 - 1012 aa - 1012 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1780+/-0.000376; mu= 23.0803+/- 0.024
mean_var=82.1827+/-17.172, 0's: 0 Z-trim(113.6): 65 B-trim: 31 in 1/52
Lambda= 0.141476
statistics sampled from 22913 (22978) to 22913 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.269), width: 16
Scan time: 13.100
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003326 (OMIM: 191325) ubiquitin-like modifier-a (1012) 6817 1402.1 0
XP_006713384 (OMIM: 191325) PREDICTED: ubiquitin-l (1005) 6419 1320.8 0
XP_011532374 (OMIM: 191325) PREDICTED: ubiquitin-l ( 796) 5415 1115.8 0
XP_005265487 (OMIM: 191325) PREDICTED: ubiquitin-l ( 987) 4671 964.0 0
XP_011532372 (OMIM: 191325) PREDICTED: ubiquitin-l ( 960) 3582 741.8 4.2e-213
XP_011532373 (OMIM: 191325) PREDICTED: ubiquitin-l ( 910) 3210 665.8 2.9e-190
NP_695012 (OMIM: 301830,314370) ubiquitin-like mod (1058) 2975 617.9 9e-176
XP_016885269 (OMIM: 301830,314370) PREDICTED: ubiq (1058) 2975 617.9 9e-176
NP_003325 (OMIM: 301830,314370) ubiquitin-like mod (1058) 2975 617.9 9e-176
XP_016885270 (OMIM: 301830,314370) PREDICTED: ubiq (1058) 2975 617.9 9e-176
XP_005272706 (OMIM: 301830,314370) PREDICTED: ubiq (1064) 2975 617.9 9e-176
XP_016885268 (OMIM: 301830,314370) PREDICTED: ubiq (1064) 2975 617.9 9e-176
XP_011542256 (OMIM: 301830,314370) PREDICTED: ubiq (1072) 2975 617.9 9.1e-176
XP_016885267 (OMIM: 301830,314370) PREDICTED: ubiq (1086) 2975 617.9 9.2e-176
XP_016885266 (OMIM: 301830,314370) PREDICTED: ubiq (1109) 2975 617.9 9.3e-176
XP_016863848 (OMIM: 611361) PREDICTED: ubiquitin-l (1009) 1692 356.0 5.9e-97
NP_060697 (OMIM: 611361) ubiquitin-like modifier-a (1052) 1692 356.0 6.1e-97
NP_001139186 (OMIM: 613294) SUMO-activating enzyme ( 266) 362 84.0 1.2e-15
XP_006723028 (OMIM: 613294) PREDICTED: SUMO-activa ( 281) 362 84.1 1.2e-15
NP_001139185 (OMIM: 613294) SUMO-activating enzyme ( 299) 362 84.1 1.3e-15
NP_005491 (OMIM: 613294) SUMO-activating enzyme su ( 346) 362 84.1 1.4e-15
XP_016881624 (OMIM: 613294) PREDICTED: SUMO-activa ( 349) 362 84.1 1.4e-15
XP_006723026 (OMIM: 613294) PREDICTED: SUMO-activa ( 378) 362 84.2 1.5e-15
NP_937838 (OMIM: 603172) NEDD8-activating enzyme E ( 449) 354 82.6 5.3e-15
NP_003959 (OMIM: 603172) NEDD8-activating enzyme E ( 463) 354 82.6 5.4e-15
XP_011532513 (OMIM: 603172) PREDICTED: NEDD8-activ ( 422) 287 68.9 6.6e-11
XP_011532512 (OMIM: 603172) PREDICTED: NEDD8-activ ( 436) 287 68.9 6.7e-11
NP_055299 (OMIM: 609277) adenylyltransferase and s ( 460) 247 60.8 2e-08
NP_003896 (OMIM: 603385) NEDD8-activating enzyme E ( 534) 223 55.9 6.7e-07
XP_016881625 (OMIM: 613294) PREDICTED: SUMO-activa ( 282) 200 51.0 1.1e-05
NP_001273429 (OMIM: 603385) NEDD8-activating enzym ( 537) 189 49.0 8.2e-05
XP_011524606 (OMIM: 613295) PREDICTED: SUMO-activa ( 700) 180 47.3 0.00036
NP_001018169 (OMIM: 603385) NEDD8-activating enzym ( 528) 178 46.7 0.00039
XP_016881623 (OMIM: 613295) PREDICTED: SUMO-activa ( 608) 178 46.8 0.00043
XP_006723025 (OMIM: 613295) PREDICTED: SUMO-activa ( 612) 178 46.8 0.00043
NP_005490 (OMIM: 613295) SUMO-activating enzyme su ( 640) 178 46.8 0.00044
XP_005258461 (OMIM: 613295) PREDICTED: SUMO-activa ( 752) 178 46.9 0.0005
>>NP_003326 (OMIM: 191325) ubiquitin-like modifier-activ (1012 aa)
initn: 6817 init1: 6817 opt: 6817 Z-score: 7515.0 bits: 1402.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6817; 100.0% identity (100.0% similar) in 1012 aa overlap (1-1012:1-1012)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDALDASKLLDEELYSRQLYVLGSPAMQRIQGARVLVSGLQGLGAEVAKNLVLMGVGSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MDALDASKLLDEELYSRQLYVLGSPAMQRIQGARVLVSGLQGLGAEVAKNLVLMGVGSLT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LHDPHPTCWSDLAAQFLLSEQDLERSRAEASQELLAQLNRAVQVVVHTGDITEDLLLDFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LHDPHPTCWSDLAAQFLLSEQDLERSRAEASQELLAQLNRAVQVVVHTGDITEDLLLDFQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VVVLTAAKLEEQLKVGTLCHKHGVCFLAADTRGLVGQLFCDFGEDFTVQDPTEAEPLTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VVVLTAAKLEEQLKVGTLCHKHGVCFLAADTRGLVGQLFCDFGEDFTVQDPTEAEPLTAA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 IQHISQGSPGILTLRKGANTHYFRDGDLVTFSGIEGMVELNDCDPRSIHVREDGSLEIGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 IQHISQGSPGILTLRKGANTHYFRDGDLVTFSGIEGMVELNDCDPRSIHVREDGSLEIGD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 TTTFSRYLRGGAITEVKRPKTVRHKSLDTALLQPHVVAQSSQEVHHAHCLHQAFCALHKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TTTFSRYLRGGAITEVKRPKTVRHKSLDTALLQPHVVAQSSQEVHHAHCLHQAFCALHKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 QHLHGRPPQPWDPVDAETVVGLARDLEPLKRTEEEPLEEPLDEALVRTVALSSAGVLSPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QHLHGRPPQPWDPVDAETVVGLARDLEPLKRTEEEPLEEPLDEALVRTVALSSAGVLSPM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 VAMLGAVAAQEVLKAISRKFMPLDQWLYFDALDCLPEDGELLPSPEDCALRGSRYDGQIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VAMLGAVAAQEVLKAISRKFMPLDQWLYFDALDCLPEDGELLPSPEDCALRGSRYDGQIA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 VFGAGFQEKLRRQHYLLVGAGAIGCELLKVFALVGLGAGNSGGLTVVDMDHIERSNLSRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VFGAGFQEKLRRQHYLLVGAGAIGCELLKVFALVGLGAGNSGGLTVVDMDHIERSNLSRQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 FLFRSQDVGRPKAEVAAAAARGLNPDLQVIPLTYPLDPTTEHIYGDNFFSRVDGVAAALD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 FLFRSQDVGRPKAEVAAAAARGLNPDLQVIPLTYPLDPTTEHIYGDNFFSRVDGVAAALD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 SFQARRYVAARCTHYLKPLLEAGTSGTWGSATVFMPHVTEAYRAPASAAASEDAPYPVCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SFQARRYVAARCTHYLKPLLEAGTSGTWGSATVFMPHVTEAYRAPASAAASEDAPYPVCT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 VRYFPSTAEHTLQWARHEFEELFRLSAETINHHQQAHTSLADMDEPQTLTLLKPVLGVLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VRYFPSTAEHTLQWARHEFEELFRLSAETINHHQQAHTSLADMDEPQTLTLLKPVLGVLR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 VRPQNWQDCVAWALGHWKLCFHYGIKQLLRHFPPNKVLEDGTPFWSGPKQCPQPLEFDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VRPQNWQDCVAWALGHWKLCFHYGIKQLLRHFPPNKVLEDGTPFWSGPKQCPQPLEFDTN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 QDTHLLYVLAAANLYAQMHGLPGSQDWTALRELLKLLPQPDPQQMAPIFASNLELASASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QDTHLLYVLAAANLYAQMHGLPGSQDWTALRELLKLLPQPDPQQMAPIFASNLELASASA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 EFGPEQQKELNKALEVWSVGPPLKPLMFEKDDDSNFHVDFVVAAASLRCQNYGIPPVNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EFGPEQQKELNKALEVWSVGPPLKPLMFEKDDDSNFHVDFVVAAASLRCQNYGIPPVNRA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 QSKRIVGQIIPAIATTTAAVAGLLGLELYKVVSGPRPRSAFRHSYLHLAENYLIRYMPFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QSKRIVGQIIPAIATTTAAVAGLLGLELYKVVSGPRPRSAFRHSYLHLAENYLIRYMPFA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 PAIQTFHHLKWTSWDRLKVPAGQPERTLESLLAHLQEQHGLRVRILLHGSALLYAAGWSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PAIQTFHHLKWTSWDRLKVPAGQPERTLESLLAHLQEQHGLRVRILLHGSALLYAAGWSP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010
pF1KE3 EKQAQHLPLRVTELVQQLTGQAPAPGQRVLVLELSCEGDDEDTAFPPLHYEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EKQAQHLPLRVTELVQQLTGQAPAPGQRVLVLELSCEGDDEDTAFPPLHYEL
970 980 990 1000 1010
>>XP_006713384 (OMIM: 191325) PREDICTED: ubiquitin-like (1005 aa)
initn: 6435 init1: 3239 opt: 6419 Z-score: 7076.0 bits: 1320.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6426; 95.2% identity (96.7% similar) in 1017 aa overlap (1-1012:1-1005)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDALDASKLLDEELYSRQLYVLGSPAMQRIQGARVLVSGLQGLGAEVAKNLVLMGVGSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MDALDASKLLDEELYSRQLYVLGSPAMQRIQGARVLVSGLQGLGAEVAKNLVLMGVGSLT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LHDPHPTCWSDLAAQFLLSEQDLERSRAEASQELLAQLNRAVQVVVHTGDITEDLLLDFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LHDPHPTCWSDLAAQFLLSEQDLERSRAEASQELLAQLNRAVQVVVHTGDITEDLLLDFQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VVVLTAAKLEEQLKVGTLCHKHGVCFLAADTRGLVGQLFCDFGEDFTVQDPTEAEPLTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VVVLTAAKLEEQLKVGTLCHKHGVCFLAADTRGLVGQLFCDFGEDFTVQDPTEAEPLTAA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 IQHISQGSPGILTLRKGANTHYFRDGDLVTFSGIEGMVELNDCDPRSIHVREDGSLEIGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 IQHISQGSPGILTLRKGANTHYFRDGDLVTFSGIEGMVELNDCDPRSIHVREDGSLEIGD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 TTTFSRYLRGGAITEVKRPKTVRHKSLDTALLQPHVVAQSSQEVHHAHCLHQAFCALHKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TTTFSRYLRGGAITEVKRPKTVRHKSLDTALLQPHVVAQSSQEVHHAHCLHQAFCALHKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 QHLHGRPPQPWDPVDAETVVGLARDLEPLKRTEEEPLEEPLDEALVRTVALSSAGVLSPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QHLHGRPPQPWDPVDAETVVGLARDLEPLKRTEEEPLEEPLDEALVRTVALSSAGVLSPM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 VAMLGAVAAQEVLKAISRKFMPLDQWLYFDALDCLPEDGELLPSPEDCALRGSRYDGQIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VAMLGAVAAQEVLKAISRKFMPLDQWLYFDALDCLPEDGELLPSPEDCALRGSRYDGQIA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 VFGAGFQEKLRRQHYLLVGAGAIGCELLKVFALVGLGAGNSGGLTVVDMDHIERSNLSRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VFGAGFQEKLRRQHYLLVGAGAIGCELLKVFALVGLGAGNSGGLTVVDMDHIERSNLSRQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE3 FLFRSQDVGRPKAEVAAAAARGLNPDLQVIPLTYPLDPTTEHIYGDNFFSRVDGVA--AA
::::::::: :.: . : . :: :.. :.:. :: ...: . ..
XP_006 FLFRSQDVG-----VSADPS----PH-SCIPDRPPIQLPTQHL--PAFFPETQGRGGCSS
490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 LDSFQAR---RYVAARCTHYLKPLLEAGTSGTWGSATVFMPHVTEAYRAPASAAASEDAP
. . : ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 CPGPEPRLTGRYVAARCTHYLKPLLEAGTSGTWGSATVFMPHVTEAYRAPASAAASEDAP
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 YPVCTVRYFPSTAEHTLQWARHEFEELFRLSAETINHHQQAHTSLADMDEPQTLTLLKPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YPVCTVRYFPSTAEHTLQWARHEFEELFRLSAETINHHQQAHTSLADMDEPQTLTLLKPV
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 LGVLRVRPQNWQDCVAWALGHWKLCFHYGIKQLLRHFPPNKVLEDGTPFWSGPKQCPQPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LGVLRVRPQNWQDCVAWALGHWKLCFHYGIKQLLRHFPPNKVLEDGTPFWSGPKQCPQPL
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KE3 EFDTNQDTHLLYVLAAANLYAQMHGLPGSQDWTALRELLKLLPQPDPQQMAPIFASNLEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EFDTNQDTHLLYVLAAANLYAQMHGLPGSQDWTALRELLKLLPQPDPQQMAPIFASNLEL
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KE3 ASASAEFGPEQQKELNKALEVWSVGPPLKPLMFEKDDDSNFHVDFVVAAASLRCQNYGIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ASASAEFGPEQQKELNKALEVWSVGPPLKPLMFEKDDDSNFHVDFVVAAASLRCQNYGIP
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KE3 PVNRAQSKRIVGQIIPAIATTTAAVAGLLGLELYKVVSGPRPRSAFRHSYLHLAENYLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PVNRAQSKRIVGQIIPAIATTTAAVAGLLGLELYKVVSGPRPRSAFRHSYLHLAENYLIR
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KE3 YMPFAPAIQTFHHLKWTSWDRLKVPAGQPERTLESLLAHLQEQHGLRVRILLHGSALLYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YMPFAPAIQTFHHLKWTSWDRLKVPAGQPERTLESLLAHLQEQHGLRVRILLHGSALLYA
890 900 910 920 930 940
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE3 AGWSPEKQAQHLPLRVTELVQQLTGQAPAPGQRVLVLELSCEGDDEDTAFPPLHYEL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AGWSPEKQAQHLPLRVTELVQQLTGQAPAPGQRVLVLELSCEGDDEDTAFPPLHYEL
950 960 970 980 990 1000
>>XP_011532374 (OMIM: 191325) PREDICTED: ubiquitin-like (796 aa)
initn: 5415 init1: 5415 opt: 5415 Z-score: 5969.8 bits: 1115.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5415; 100.0% identity (100.0% similar) in 796 aa overlap (217-1012:1-796)
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 GSPGILTLRKGANTHYFRDGDLVTFSGIEGMVELNDCDPRSIHVREDGSLEIGDTTTFSR
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MVELNDCDPRSIHVREDGSLEIGDTTTFSR
10 20 30
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 YLRGGAITEVKRPKTVRHKSLDTALLQPHVVAQSSQEVHHAHCLHQAFCALHKFQHLHGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YLRGGAITEVKRPKTVRHKSLDTALLQPHVVAQSSQEVHHAHCLHQAFCALHKFQHLHGR
40 50 60 70 80 90
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 PPQPWDPVDAETVVGLARDLEPLKRTEEEPLEEPLDEALVRTVALSSAGVLSPMVAMLGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PPQPWDPVDAETVVGLARDLEPLKRTEEEPLEEPLDEALVRTVALSSAGVLSPMVAMLGA
100 110 120 130 140 150
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 VAAQEVLKAISRKFMPLDQWLYFDALDCLPEDGELLPSPEDCALRGSRYDGQIAVFGAGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VAAQEVLKAISRKFMPLDQWLYFDALDCLPEDGELLPSPEDCALRGSRYDGQIAVFGAGF
160 170 180 190 200 210
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 QEKLRRQHYLLVGAGAIGCELLKVFALVGLGAGNSGGLTVVDMDHIERSNLSRQFLFRSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QEKLRRQHYLLVGAGAIGCELLKVFALVGLGAGNSGGLTVVDMDHIERSNLSRQFLFRSQ
220 230 240 250 260 270
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 DVGRPKAEVAAAAARGLNPDLQVIPLTYPLDPTTEHIYGDNFFSRVDGVAAALDSFQARR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DVGRPKAEVAAAAARGLNPDLQVIPLTYPLDPTTEHIYGDNFFSRVDGVAAALDSFQARR
280 290 300 310 320 330
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 YVAARCTHYLKPLLEAGTSGTWGSATVFMPHVTEAYRAPASAAASEDAPYPVCTVRYFPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YVAARCTHYLKPLLEAGTSGTWGSATVFMPHVTEAYRAPASAAASEDAPYPVCTVRYFPS
340 350 360 370 380 390
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pF1KE3 TAEHTLQWARHEFEELFRLSAETINHHQQAHTSLADMDEPQTLTLLKPVLGVLRVRPQNW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TAEHTLQWARHEFEELFRLSAETINHHQQAHTSLADMDEPQTLTLLKPVLGVLRVRPQNW
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pF1KE3 QDCVAWALGHWKLCFHYGIKQLLRHFPPNKVLEDGTPFWSGPKQCPQPLEFDTNQDTHLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QDCVAWALGHWKLCFHYGIKQLLRHFPPNKVLEDGTPFWSGPKQCPQPLEFDTNQDTHLL
460 470 480 490 500 510
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pF1KE3 YVLAAANLYAQMHGLPGSQDWTALRELLKLLPQPDPQQMAPIFASNLELASASAEFGPEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YVLAAANLYAQMHGLPGSQDWTALRELLKLLPQPDPQQMAPIFASNLELASASAEFGPEQ
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790 800 810 820 830 840
pF1KE3 QKELNKALEVWSVGPPLKPLMFEKDDDSNFHVDFVVAAASLRCQNYGIPPVNRAQSKRIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QKELNKALEVWSVGPPLKPLMFEKDDDSNFHVDFVVAAASLRCQNYGIPPVNRAQSKRIV
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850 860 870 880 890 900
pF1KE3 GQIIPAIATTTAAVAGLLGLELYKVVSGPRPRSAFRHSYLHLAENYLIRYMPFAPAIQTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GQIIPAIATTTAAVAGLLGLELYKVVSGPRPRSAFRHSYLHLAENYLIRYMPFAPAIQTF
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pF1KE3 HHLKWTSWDRLKVPAGQPERTLESLLAHLQEQHGLRVRILLHGSALLYAAGWSPEKQAQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HHLKWTSWDRLKVPAGQPERTLESLLAHLQEQHGLRVRILLHGSALLYAAGWSPEKQAQH
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970 980 990 1000 1010
pF1KE3 LPLRVTELVQQLTGQAPAPGQRVLVLELSCEGDDEDTAFPPLHYEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPLRVTELVQQLTGQAPAPGQRVLVLELSCEGDDEDTAFPPLHYEL
760 770 780 790
>>XP_005265487 (OMIM: 191325) PREDICTED: ubiquitin-like (987 aa)
initn: 4671 init1: 4671 opt: 4671 Z-score: 5147.9 bits: 964.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6565; 97.5% identity (97.5% similar) in 1012 aa overlap (1-1012:1-987)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDALDASKLLDEELYSRQLYVLGSPAMQRIQGARVLVSGLQGLGAEVAKNLVLMGVGSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MDALDASKLLDEELYSRQLYVLGSPAMQRIQGARVLVSGLQGLGAEVAKNLVLMGVGSLT
10 20 30 40 50 60
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pF1KE3 LHDPHPTCWSDLAAQFLLSEQDLERSRAEASQELLAQLNRAVQVVVHTGDITEDLLLDFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LHDPHPTCWSDLAAQFLLSEQDLERSRAEASQELLAQLNRAVQVVVHTGDITEDLLLDFQ
70 80 90 100 110 120
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pF1KE3 VVVLTAAKLEEQLKVGTLCHKHGVCFLAADTRGLVGQLFCDFGEDFTVQDPTEAEPLTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VVVLTAAKLEEQLKVGTLCHKHGVCFLAADTRGLVGQLFCDFGEDFTVQDPTEAEPLTAA
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pF1KE3 IQHISQGSPGILTLRKGANTHYFRDGDLVTFSGIEGMVELNDCDPRSIHVREDGSLEIGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IQHISQGSPGILTLRKGANTHYFRDGDLVTFSGIEGMVELNDCDPRSIHVREDGSLEIGD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 TTTFSRYLRGGAITEVKRPKTVRHKSLDTALLQPHVVAQSSQEVHHAHCLHQAFCALHKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TTTFSRYLRGGAITEVKRPKTVRHKSLDTALLQPHVVAQSSQEVHHAHCLHQAFCALHKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 QHLHGRPPQPWDPVDAETVVGLARDLEPLKRTEEEPLEEPLDEALVRTVALSSAGVLSPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QHLHGRPPQPWDPVDAETVVGLARDLEPLKRTEEEPLEEPLDEALVRTVALSSAGVLSPM
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pF1KE3 VAMLGAVAAQEVLKAISRKFMPLDQWLYFDALDCLPEDGELLPSPEDCALRGSRYDGQIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VAMLGAVAAQEVLKAISRKFMPLDQWLYFDALDCLPEDGELLPSPEDCALRGSRYDGQIA
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pF1KE3 VFGAGFQEKLRRQHYLLVGAGAIGCELLKVFALVGLGAGNSGGLTVVDMDHIERSNLSRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VFGAGFQEKLRRQHYLLVGAGAIGCELLKVFALVGLGAGNSGGLTVVDMDHIERSNLSRQ
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pF1KE3 FLFRSQDVGRPKAEVAAAAARGLNPDLQVIPLTYPLDPTTEHIYGDNFFSRVDGVAAALD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FLFRSQDVGRPKAEVAAAAARGLNPDLQVIPLTYPLDPTTEHIYGDNFFSRVDGVAAALD
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pF1KE3 SFQARRYVAARCTHYLKPLLEAGTSGTWGSATVFMPHVTEAYRAPASAAASEDAPYPVCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SFQARRYVAARCTHYLKPLLEAGTSGTWGSATVFMPHVTEAYRAPASAAASEDAPYPVCT
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pF1KE3 VRYFPSTAEHTLQWARHEFEELFRLSAETINHHQQAHTSLADMDEPQTLTLLKPVLGVLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VRYFPSTAEHTLQWARHEFEELFRLSAETINHHQQAHTSLADMDEPQTLTLLKPVLGVLR
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pF1KE3 VRPQNWQDCVAWALGHWKLCFHYGIKQLLRHFPPNKVLEDGTPFWSGPKQCPQPLEFDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VRPQNWQDCVAWALGHWKLCFHYGIKQLLRHFPPNK------------------------
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pF1KE3 QDTHLLYVLAAANLYAQMHGLPGSQDWTALRELLKLLPQPDPQQMAPIFASNLELASASA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 -DTHLLYVLAAANLYAQMHGLPGSQDWTALRELLKLLPQPDPQQMAPIFASNLELASASA
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pF1KE3 EFGPEQQKELNKALEVWSVGPPLKPLMFEKDDDSNFHVDFVVAAASLRCQNYGIPPVNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EFGPEQQKELNKALEVWSVGPPLKPLMFEKDDDSNFHVDFVVAAASLRCQNYGIPPVNRA
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pF1KE3 QSKRIVGQIIPAIATTTAAVAGLLGLELYKVVSGPRPRSAFRHSYLHLAENYLIRYMPFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QSKRIVGQIIPAIATTTAAVAGLLGLELYKVVSGPRPRSAFRHSYLHLAENYLIRYMPFA
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pF1KE3 PAIQTFHHLKWTSWDRLKVPAGQPERTLESLLAHLQEQHGLRVRILLHGSALLYAAGWSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PAIQTFHHLKWTSWDRLKVPAGQPERTLESLLAHLQEQHGLRVRILLHGSALLYAAGWSP
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pF1KE3 EKQAQHLPLRVTELVQQLTGQAPAPGQRVLVLELSCEGDDEDTAFPPLHYEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EKQAQHLPLRVTELVQQLTGQAPAPGQRVLVLELSCEGDDEDTAFPPLHYEL
940 950 960 970 980
>>XP_011532372 (OMIM: 191325) PREDICTED: ubiquitin-like (960 aa)
initn: 6466 init1: 3578 opt: 3582 Z-score: 3946.8 bits: 741.8 E(85289): 4.2e-213
Smith-Waterman score: 6366; 94.9% identity (94.9% similar) in 1012 aa overlap (1-1012:1-960)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDALDASKLLDEELYSRQLYVLGSPAMQRIQGARVLVSGLQGLGAEVAKNLVLMGVGSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MDALDASKLLDEELYSRQLYVLGSPAMQRIQGARVLVSGLQGLGAEVAKNLVLMGVGSLT
10 20 30 40 50 60
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pF1KE3 LHDPHPTCWSDLAAQFLLSEQDLERSRAEASQELLAQLNRAVQVVVHTGDITEDLLLDFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LHDPHPTCWSDLAAQFLLSEQDLERSRAEASQELLAQLNRAVQVVVHTGDITEDLLLDFQ
70 80 90 100 110 120
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pF1KE3 VVVLTAAKLEEQLKVGTLCHKHGVCFLAADTRGLVGQLFCDFGEDFTVQDPTEAEPLTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VVVLTAAKLEEQLKVGTLCHKHGVCFLAADTRGLVGQLFCDFGEDFTVQDPTEAEPLTAA
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pF1KE3 IQHISQGSPGILTLRKGANTHYFRDGDLVTFSGIEGMVELNDCDPRSIHVREDGSLEIGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IQHISQGSPGILTLRKGANTHYFRDGDLVTFSGIEGMVELNDCDPRSIHVREDGSLEIGD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 TTTFSRYLRGGAITEVKRPKTVRHKSLDTALLQPHVVAQSSQEVHHAHCLHQAFCALHKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTTFSRYLRGGAITEVKRPKTVRHKSLDTALLQPHVVAQSSQEVHHAHCLHQAFCALHKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 QHLHGRPPQPWDPVDAETVVGLARDLEPLKRTEEEPLEEPLDEALVRTVALSSAGVLSPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QHLHGRPPQPWDPVDAETVVGLARDLEPLKRTEEEPLEEPLDEALVRTVALSSAGVLSPM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 VAMLGAVAAQEVLKAISRKFMPLDQWLYFDALDCLPEDGELLPSPEDCALRGSRYDGQIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VAMLGAVAAQEVLKAISRKFMPLDQWLYFDALDCLPEDGELLPSPEDCALRGSRYDGQIA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 VFGAGFQEKLRRQHYLLVGAGAIGCELLKVFALVGLGAGNSGGLTVVDMDHIERSNLSRQ
:::::::::::::::::
XP_011 VFGAGFQEKLRRQHYLL-------------------------------------------
430
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pF1KE3 FLFRSQDVGRPKAEVAAAAARGLNPDLQVIPLTYPLDPTTEHIYGDNFFSRVDGVAAALD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ---------RPKAEVAAAAARGLNPDLQVIPLTYPLDPTTEHIYGDNFFSRVDGVAAALD
440 450 460 470 480
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 SFQARRYVAARCTHYLKPLLEAGTSGTWGSATVFMPHVTEAYRAPASAAASEDAPYPVCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SFQARRYVAARCTHYLKPLLEAGTSGTWGSATVFMPHVTEAYRAPASAAASEDAPYPVCT
490 500 510 520 530 540
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 VRYFPSTAEHTLQWARHEFEELFRLSAETINHHQQAHTSLADMDEPQTLTLLKPVLGVLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VRYFPSTAEHTLQWARHEFEELFRLSAETINHHQQAHTSLADMDEPQTLTLLKPVLGVLR
550 560 570 580 590 600
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 VRPQNWQDCVAWALGHWKLCFHYGIKQLLRHFPPNKVLEDGTPFWSGPKQCPQPLEFDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VRPQNWQDCVAWALGHWKLCFHYGIKQLLRHFPPNKVLEDGTPFWSGPKQCPQPLEFDTN
610 620 630 640 650 660
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 QDTHLLYVLAAANLYAQMHGLPGSQDWTALRELLKLLPQPDPQQMAPIFASNLELASASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QDTHLLYVLAAANLYAQMHGLPGSQDWTALRELLKLLPQPDPQQMAPIFASNLELASASA
670 680 690 700 710 720
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pF1KE3 EFGPEQQKELNKALEVWSVGPPLKPLMFEKDDDSNFHVDFVVAAASLRCQNYGIPPVNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EFGPEQQKELNKALEVWSVGPPLKPLMFEKDDDSNFHVDFVVAAASLRCQNYGIPPVNRA
730 740 750 760 770 780
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 QSKRIVGQIIPAIATTTAAVAGLLGLELYKVVSGPRPRSAFRHSYLHLAENYLIRYMPFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QSKRIVGQIIPAIATTTAAVAGLLGLELYKVVSGPRPRSAFRHSYLHLAENYLIRYMPFA
790 800 810 820 830 840
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 PAIQTFHHLKWTSWDRLKVPAGQPERTLESLLAHLQEQHGLRVRILLHGSALLYAAGWSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PAIQTFHHLKWTSWDRLKVPAGQPERTLESLLAHLQEQHGLRVRILLHGSALLYAAGWSP
850 860 870 880 890 900
970 980 990 1000 1010
pF1KE3 EKQAQHLPLRVTELVQQLTGQAPAPGQRVLVLELSCEGDDEDTAFPPLHYEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EKQAQHLPLRVTELVQQLTGQAPAPGQRVLVLELSCEGDDEDTAFPPLHYEL
910 920 930 940 950 960
>>XP_011532373 (OMIM: 191325) PREDICTED: ubiquitin-like (910 aa)
initn: 6103 init1: 3210 opt: 3210 Z-score: 3536.8 bits: 665.8 E(85289): 2.9e-190
Smith-Waterman score: 5900; 89.6% identity (89.6% similar) in 1012 aa overlap (1-1012:1-910)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MDALDASKLLDEELYSRQLYVLGSPAMQRIQGARVLVSGLQGLGAEVAKNLVLMGVGSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MDALDASKLLDEELYSRQLYVLGSPAMQRIQGARVLVSGLQGLGAEVAKNLVLMGVGSLT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LHDPHPTCWSDLAAQFLLSEQDLERSRAEASQELLAQLNRAVQVVVHTGDITEDLLLDFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LHDPHPTCWSDLAAQFLLSEQDLERSRAEASQELLAQLNRAVQVVVHTGDITEDLLLDFQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 VVVLTAAKLEEQLKVGTLCHKHGVCFLAADTRGLVGQLFCDFGEDFTVQDPTEAEPLTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VVVLTAAKLEEQLKVGTLCHKHGVCFLAADTRGLVGQLFCDFGEDFTVQDPTEAEPLTAA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 IQHISQGSPGILTLRKGANTHYFRDGDLVTFSGIEGMVELNDCDPRSIHVREDGSLEIGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IQHISQGSPGILTLRKGANTHYFRDGDLVTFSGIEGMVELNDCDPRSIHVREDGSLEIGD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 TTTFSRYLRGGAITEVKRPKTVRHKSLDTALLQPHVVAQSSQEVHHAHCLHQAFCALHKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TTTFSRYLRGGAITEVKRPKTVRHKSLDTALLQPHVVAQSSQEVHHAHCLHQAFCALHKF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 QHLHGRPPQPWDPVDAETVVGLARDLEPLKRTEEEPLEEPLDEALVRTVALSSAGVLSPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QHLHGRPPQPWDPVDAETVVGLARDLEPLKRTEEEPLEEPLDEALVRTVALSSAGVLSPM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 VAMLGAVAAQEVLKAISRKFMPLDQWLYFDALDCLPEDGELLPSPEDCALRGSRYDGQIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VAMLGAVAAQEVLKAISRKFMPLDQWLYFDALDCLPEDGELLPSPEDCALRGSRYDGQIA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 VFGAGFQEKLRRQHYLLVGAGAIGCELLKVFALVGLGAGNSGGLTVVDMDHIERSNLSRQ
::::::::::::::::::
XP_011 VFGAGFQEKLRRQHYLLVP-----------------------------------------
430
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 FLFRSQDVGRPKAEVAAAAARGLNPDLQVIPLTYPLDPTTEHIYGDNFFSRVDGVAAALD
::
XP_011 --------GR--------------------------------------------------
440
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 SFQARRYVAARCTHYLKPLLEAGTSGTWGSATVFMPHVTEAYRAPASAAASEDAPYPVCT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ---WWRYVAARCTHYLKPLLEAGTSGTWGSATVFMPHVTEAYRAPASAAASEDAPYPVCT
450 460 470 480 490
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 VRYFPSTAEHTLQWARHEFEELFRLSAETINHHQQAHTSLADMDEPQTLTLLKPVLGVLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VRYFPSTAEHTLQWARHEFEELFRLSAETINHHQQAHTSLADMDEPQTLTLLKPVLGVLR
500 510 520 530 540 550
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 VRPQNWQDCVAWALGHWKLCFHYGIKQLLRHFPPNKVLEDGTPFWSGPKQCPQPLEFDTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VRPQNWQDCVAWALGHWKLCFHYGIKQLLRHFPPNKVLEDGTPFWSGPKQCPQPLEFDTN
560 570 580 590 600 610
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 QDTHLLYVLAAANLYAQMHGLPGSQDWTALRELLKLLPQPDPQQMAPIFASNLELASASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QDTHLLYVLAAANLYAQMHGLPGSQDWTALRELLKLLPQPDPQQMAPIFASNLELASASA
620 630 640 650 660 670
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 EFGPEQQKELNKALEVWSVGPPLKPLMFEKDDDSNFHVDFVVAAASLRCQNYGIPPVNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EFGPEQQKELNKALEVWSVGPPLKPLMFEKDDDSNFHVDFVVAAASLRCQNYGIPPVNRA
680 690 700 710 720 730
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 QSKRIVGQIIPAIATTTAAVAGLLGLELYKVVSGPRPRSAFRHSYLHLAENYLIRYMPFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QSKRIVGQIIPAIATTTAAVAGLLGLELYKVVSGPRPRSAFRHSYLHLAENYLIRYMPFA
740 750 760 770 780 790
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 PAIQTFHHLKWTSWDRLKVPAGQPERTLESLLAHLQEQHGLRVRILLHGSALLYAAGWSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PAIQTFHHLKWTSWDRLKVPAGQPERTLESLLAHLQEQHGLRVRILLHGSALLYAAGWSP
800 810 820 830 840 850
970 980 990 1000 1010
pF1KE3 EKQAQHLPLRVTELVQQLTGQAPAPGQRVLVLELSCEGDDEDTAFPPLHYEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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