Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3632
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3632, 314 aa
1>>>pF1KE3632 314 - 314 aa - 314 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1601+/-0.00101; mu= 15.9579+/- 0.060
mean_var=57.7787+/-12.053, 0's: 0 Z-trim(102.9): 23 B-trim: 131 in 1/49
Lambda= 0.168729
statistics sampled from 7137 (7153) to 7137 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.572), E-opt: 0.2 (0.22), width: 16
Scan time: 1.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4992.1 ELOVL4 gene_id:6785|Hs108|chr6 ( 314) 2178 538.7 2.2e-153
CCDS4518.1 ELOVL2 gene_id:54898|Hs108|chr6 ( 296) 890 225.1 5.1e-59
CCDS4951.1 ELOVL5 gene_id:60481|Hs108|chr6 ( 299) 845 214.2 1e-55
CCDS34164.1 ELOVL7 gene_id:79993|Hs108|chr5 ( 281) 821 208.3 5.5e-54
CCDS78013.1 ELOVL7 gene_id:79993|Hs108|chr5 ( 268) 804 204.2 9.4e-53
CCDS485.1 ELOVL1 gene_id:64834|Hs108|chr1 ( 279) 751 191.3 7.4e-49
CCDS56433.1 ELOVL5 gene_id:60481|Hs108|chr6 ( 326) 614 158.0 9.3e-39
CCDS75470.1 ELOVL5 gene_id:60481|Hs108|chr6 ( 262) 534 138.5 5.6e-33
CCDS57987.1 ELOVL1 gene_id:64834|Hs108|chr1 ( 252) 494 128.7 4.6e-30
CCDS7531.1 ELOVL3 gene_id:83401|Hs108|chr10 ( 270) 307 83.2 2.5e-16
CCDS3690.1 ELOVL6 gene_id:79071|Hs108|chr4 ( 265) 295 80.3 1.8e-15
>>CCDS4992.1 ELOVL4 gene_id:6785|Hs108|chr6 (314 aa)
initn: 2178 init1: 2178 opt: 2178 Z-score: 2867.1 bits: 538.7 E(32554): 2.2e-153
Smith-Waterman score: 2178; 99.7% identity (100.0% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-314)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGLLDSEPGSVLNVVSTALNDTVEFYRWTWSIADKRVENWPLMRSPWPTLSISTLYLLFV
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CCDS49 MGLLDSEPGSVLNVVSTALNDTVEFYRWTWSIADKRVENWPLMQSPWPTLSISTLYLLFV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 WLGPKWMKDREPFQMRLVLIIYNFGMVLLNLFIFRELFMGSYNAGYSYICQSVDYSNNVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 WLGPKWMKDREPFQMRLVLIIYNFGMVLLNLFIFRELFMGSYNAGYSYICQSVDYSNNVH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 EVRIAAALWWYFVSKGVEYLDTVFFILRKKNNQVSFLHVYHHCTMFTLWWIGIKWVAGGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 EVRIAAALWWYFVSKGVEYLDTVFFILRKKNNQVSFLHVYHHCTMFTLWWIGIKWVAGGQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 AFFGAQLNSFIHVIMYSYYGLTAFGPWIQKYLWWKRYLTMLQLIQFHVTIGHTALSLYTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 AFFGAQLNSFIHVIMYSYYGLTAFGPWIQKYLWWKRYLTMLQLIQFHVTIGHTALSLYTD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 CPFPKWMHWALIAYAISFIFLFLNFYIRTYKEPKKPKAGKTAMNGISANGVSKSEKQLMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 CPFPKWMHWALIAYAISFIFLFLNFYIRTYKEPKKPKAGKTAMNGISANGVSKSEKQLMI
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE3 ENGKKQKNGKAKGD
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CCDS49 ENGKKQKNGKAKGD
310
>>CCDS4518.1 ELOVL2 gene_id:54898|Hs108|chr6 (296 aa)
initn: 674 init1: 438 opt: 890 Z-score: 1173.1 bits: 225.1 E(32554): 5.1e-59
Smith-Waterman score: 898; 44.4% identity (74.4% similar) in 293 aa overlap (18-297:6-296)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MGLLDSEPGSVLNVVSTALNDTVE-FYRWTWSIADKRVENWPLMRSPWPTLSISTLYLLF
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CCDS45 MEHLKAFDDEINAFLDNMFGPRDSRVRGWFMLDSYLPTFFLTVMYLLS
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 VWLGPKWMKDREPFQMRLVLIIYNFGMVLLNLFIFRELFMGSYNAGYSYICQSVDYSNNV
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CCDS45 IWLGNKYMKNRPALSLRGILTLYNLGITLLSAYMLAELILSTWEGGYNLQCQDLT-SAGE
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 HEVRIAAALWWYFVSKGVEYLDTVFFILRKKNNQVSFLHVYHHCTMFTLWWIGIKWVAGG
..:.: .::::. ::.::.:::.::.::::..:..::::::: .::..:: ..:. :
CCDS45 ADIRVAKVLWWYYFSKSVEFLDTIFFVLRKKTSQITFLHVYHHASMFNIWWCVLNWIPCG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 QAFFGAQLNSFIHVIMYSYYGLTAFGPWIQKYLWWKRYLTMLQLIQFHVTIGHTALSLYT
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CCDS45 QSFFGPTLNSFIHILMYSYYGLSVF-PSMHKYLWWKKYLTQAQLVQFVLTITHTMSAVVK
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KE3 DCPFPKWMHWALIAYAISFIFLFLNFYIRTY-KEPKK-----PKAGKTAMNGIS------
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CCDS45 PCGFPFGCLIFQSSYMLTLVILFLNFYVQTYRKKPMKKDMQEPPAGKEVKNGFSKAYFTA
230 240 250 260 270 280
290 300 310
pF1KE3 ANGVSKSEKQLMIENGKKQKNGKAKGD
:::: ... :
CCDS45 ANGVMNKKAQ
290
>>CCDS4951.1 ELOVL5 gene_id:60481|Hs108|chr6 (299 aa)
initn: 861 init1: 377 opt: 845 Z-score: 1113.8 bits: 214.2 E(32554): 1e-55
Smith-Waterman score: 845; 44.6% identity (75.4% similar) in 280 aa overlap (34-307:20-294)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 LDSEPGSVLNVVSTALNDTVEFYRWTWSIADKRVENWPLMRSPWPTLSISTLYLLFVWLG
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CCDS49 MEHFDASLSTYFKALLGPRDTRVKGWFLLDNYIPTFICSVIYLLIVWLG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PKWMKDREPFQMRLVLIIYNFGMVLLNLFIFRELFMGSYNAGYSYICQSVDYSNNVHEVR
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CCDS49 PKYMRNKQPFSCRGILVVYNLGLTLLSLYMFCELVTGVWEGKYNFFCQGTRTAGE-SDMK
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 IAAALWWYFVSKGVEYLDTVFFILRKKNNQVSFLHVYHHCTMFTLWWIGIKWVAGGQAFF
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CCDS49 IIRVLWWYYFSKLIEFMDTFFFILRKNNHQITVLHVYHHASMLNIWWFVMNWVPCGHSYF
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 GAQLNSFIHVIMYSYYGLTAFGPWIQKYLWWKRYLTMLQLIQFHVTIGHTALSLYTDCPF
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CCDS49 GATLNSFIHVLMYSYYGLSSV-PSMRPYLWWKKYITQGQLLQFVLTIIQTSCGVIWPCTF
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KE3 P-KWMHWALIAYAISFIFLFLNFYIRTYKEP---KKPKAGKTAMNGISA--NGVSKSEKQ
: :... :.: ::.: :: ::::.::.. .. : .:: : :: ..: .
CCDS49 PLGWLYFQ-IGYMISLIALFTNFYIQTYNKKGASRRKDHLKDHQNGSMAAVNGHTNSFSP
230 240 250 260 270 280
300 310
pF1KE3 LMIENGKKQKNGKAKGD
: ::. : .
CCDS49 L--ENNVKPRKLRKD
290
>>CCDS34164.1 ELOVL7 gene_id:79993|Hs108|chr5 (281 aa)
initn: 832 init1: 710 opt: 821 Z-score: 1082.6 bits: 208.3 E(32554): 5.5e-54
Smith-Waterman score: 821; 45.8% identity (71.1% similar) in 273 aa overlap (22-289:10-278)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MGLLDSEPGSVLNVVSTALNDTVEFY-RWTWSIADKRVENWPLMRSPWPTLSISTLYLLF
::..: : . :: :::.: :: :: : . .:. :
CCDS34 MAFSDLTSRTVHLYDNWIKD-ADPRVEDWLLMSSPLPQTILLGFYVYF
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 VW-LGPKWMKDREPFQMRLVLIIYNFGMVLLNLFIFRELFMGSYNAGYSYICQSVDYSNN
: :::: :..:.::... ..: ::: .::..... :. :.... :::. :. :::: .
CCDS34 VTSLGPKLMENRKPFELKKAMITYNFFIVLFSVYMCYEFVMSGWGIGYSFRCDIVDYSRS
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 VHEVRIAAALWWYFVSKGVEYLDTVFFILRKKNNQVSFLHVYHHCTMFTLWWIGIKWVAG
.:.: . : :. :: .: :::.::.:::::.::.::::.:: : ::.:.:..::
CCDS34 PTALRMARTCWLYYFSKFIELLDTIFFVLRKKNSQVTFLHVFHHTIMPWTWWFGVKFAAG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GQAFFGAQLNSFIHVIMYSYYGLTAFGPWIQKYLWWKRYLTMLQLIQFHVTIGHTALSLY
: . : : ::. .::.:::::::.:.:: :::::::.::: :::.:: .. : . ..
CCDS34 GLGTFHALLNTAVHVVMYSYYGLSALGPAYQKYLWWKKYLTSLQLVQFVIVAIHISQFFF
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 T-DCP--FPKWMHWALIAYAISFIFLFLNFYIRTYKEPKKPKAGKTAMNGISANGVSKSE
:: :: . ...:.. :..:::.:. :.: : . ::. :: :
CCDS34 MEDCKYQFPVFAC-IIMSYSFMFLLLFLHFWYRAY--TKGQRLPKTVKNGTCKNKDN
230 240 250 260 270 280
300 310
pF1KE3 KQLMIENGKKQKNGKAKGD
>>CCDS78013.1 ELOVL7 gene_id:79993|Hs108|chr5 (268 aa)
initn: 817 init1: 710 opt: 804 Z-score: 1060.6 bits: 204.2 E(32554): 9.4e-53
Smith-Waterman score: 804; 46.1% identity (71.7% similar) in 258 aa overlap (36-289:11-265)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 SEPGSVLNVVSTALNDTVEFYRWTWSIADKRVENWPLMRSPWPTLSISTLYLLFVW-LGP
:::.: :: :: : . .:. :: :::
CCDS78 MEKPINILYPRVEDWLLMSSPLPQTILLGFYVYFVTSLGP
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 KWMKDREPFQMRLVLIIYNFGMVLLNLFIFRELFMGSYNAGYSYICQSVDYSNNVHEVRI
: :..:.::... ..: ::: .::..... :. :.... :::. :. :::: . .:.
CCDS78 KLMENRKPFELKKAMITYNFFIVLFSVYMCYEFVMSGWGIGYSFRCDIVDYSRSPTALRM
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 AAALWWYFVSKGVEYLDTVFFILRKKNNQVSFLHVYHHCTMFTLWWIGIKWVAGGQAFFG
: . : :. :: .: :::.::.:::::.::.::::.:: : ::.:.:..::: . :
CCDS78 ARTCWLYYFSKFIELLDTIFFVLRKKNSQVTFLHVFHHTIMPWTWWFGVKFAAGGLGTFH
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 AQLNSFIHVIMYSYYGLTAFGPWIQKYLWWKRYLTMLQLIQFHVTIGHTALSLYT-DCP-
: ::. .::.:::::::.:.:: :::::::.::: :::.:: .. : . .. ::
CCDS78 ALLNTAVHVVMYSYYGLSALGPAYQKYLWWKKYLTSLQLVQFVIVAIHISQFFFMEDCKY
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 -FPKWMHWALIAYAISFIFLFLNFYIRTYKEPKKPKAGKTAMNGISANGVSKSEKQLMIE
:: . ...:.. :..:::.:. :.: : . ::. :: :
CCDS78 QFPVFAC-IIMSYSFMFLLLFLHFWYRAYT--KGQRLPKTVKNGTCKNKDN
230 240 250 260
310
pF1KE3 NGKKQKNGKAKGD
>>CCDS485.1 ELOVL1 gene_id:64834|Hs108|chr1 (279 aa)
initn: 683 init1: 618 opt: 751 Z-score: 990.6 bits: 191.3 E(32554): 7.4e-49
Smith-Waterman score: 751; 41.8% identity (71.4% similar) in 280 aa overlap (19-293:1-275)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGLLDSEPGSVLNVVSTALNDTVEFYRWTWSIADKRVENWPLMRSPWPTLSISTLYLLFV
.. .:..:. . . :: :....::: :: :: :. ::
CCDS48 MEAVVNLYQEVMKHADPRIQGYPLMGSPLLMTSILLTYVYFV
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE3 W-LGPKWMKDREPFQMRLVLIIYNFGMVLLNLFIFRELFMGSYNAGYSYICQSVDYSNNV
:::. : .:.:::.: .:.:::..: :.:.: :..:... . :.. :. :::::.
CCDS48 LSLGPRIMANRKPFQLRGFMIVYNFSLVALSLYIVYEFLMSGWLSTYTWRCDPVDYSNSP
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 HEVRIAAALWWYFVSKGVEYLDTVFFILRKKNNQVSFLHVYHHCTMFTLWWIGIKWVAGG
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CCDS48 EALRMVRVAWLFLFSKFIELMDTVIFILRKKDGQVTFLHVFHHSVLPWSWWWGVKIAPGG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 QAFFGAQLNSFIHVIMYSYYGLTAFGPWIQKYLWWKRYLTMLQLIQFHVTIGHTALSLY-
.. : :..:: .::::: ::::.:::: : :::::...: .::::: .. : . .
CCDS48 MGSFHAMINSSVHVIMYLYYGLSAFGPVAQPYLWWKKHMTAIQLIQFVLVSLHISQYYFM
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 TDC--PFPKWMHWALIAYAISFIFLFLNFYIRTYKEPKK-PKAGKTAMNGISANGVSKSE
..: .: .: . :. :..:: ::. ..: . :. :.: . .:: : :..:
CCDS48 SSCNYQYPVIIHLIWM-YGTIFFMLFSNFWYHSYTKGKRLPRALQ--QNG--APGIAKVK
230 240 250 260 270
300 310
pF1KE3 KQLMIENGKKQKNGKAKGD
CCDS48 AN
>>CCDS56433.1 ELOVL5 gene_id:60481|Hs108|chr6 (326 aa)
initn: 795 init1: 377 opt: 614 Z-score: 809.3 bits: 158.0 E(32554): 9.3e-39
Smith-Waterman score: 782; 41.0% identity (69.1% similar) in 307 aa overlap (34-307:20-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 LDSEPGSVLNVVSTALNDTVEFYRWTWSIADKRVENWPLMRSPWPTLSISTLYLLFVWLG
: ::..: :. . ::. :..:::.::::
CCDS56 MEHFDASLSTYFKALLGPRDTRVKGWFLLDNYIPTFICSVIYLLIVWLG
10 20 30 40
70 80 90
pF1KE3 PKWMKDREPFQMRLVLIIYNFGMVLLNLFIF----RE-----------------------
::.:....::. : .:..::.:..::.:..: ::
CCDS56 PKYMRNKQPFSCRGILVVYNLGLTLLSLYMFCESKREQPRRSACASRTDPSTQQQLPENR
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 LFMGSYNAGYSYICQSVDYSNNVHEVRIAAALWWYFVSKGVEYLDTVFFILRKKNNQVSF
: : ... :...::.. ... ...: .::::. :: .:..:: ::::::.:.:..
CCDS56 LVTGVWEGKYNFFCQGTRTAGE-SDMKIIRVLWWYYFSKLIEFMDTFFFILRKNNHQITV
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 LHVYHHCTMFTLWWIGIKWVAGGQAFFGAQLNSFIHVIMYSYYGLTAFGPWIQKYLWWKR
:::::: .:...::. ..:: :...::: :::::::.:::::::.. : .. :::::.
CCDS56 LHVYHHASMLNIWWFVMNWVPCGHSYFGATLNSFIHVLMYSYYGLSSV-PSMRPYLWWKK
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 YLTMLQLIQFHVTIGHTALSLYTDCPFP-KWMHWALIAYAISFIFLFLNFYIRTYKEP--
:.:. ::.:: .:: .:. .. : :: :... :.: ::.: :: ::::.::..
CCDS56 YITQGQLLQFVLTIIQTSCGVIWPCTFPLGWLYFQ-IGYMISLIALFTNFYIQTYNKKGA
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310
pF1KE3 -KKPKAGKTAMNGISA--NGVSKSEKQLMIENGKKQKNGKAKGD
.. : .:: : :: ..: . : ::. : .
CCDS56 SRRKDHLKDHQNGSMAAVNGHTNSFSPL--ENNVKPRKLRKD
290 300 310 320
>>CCDS75470.1 ELOVL5 gene_id:60481|Hs108|chr6 (262 aa)
initn: 555 init1: 290 opt: 534 Z-score: 705.5 bits: 138.5 E(32554): 5.6e-33
Smith-Waterman score: 534; 40.4% identity (74.3% similar) in 183 aa overlap (34-211:20-199)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 LDSEPGSVLNVVSTALNDTVEFYRWTWSIADKRVENWPLMRSPWPTLSISTLYLLFVWLG
: ::..: :. . ::. :..:::.::::
CCDS75 MEHFDASLSTYFKALLGPRDTRVKGWFLLDNYIPTFICSVIYLLIVWLG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PKWMKDREPFQMRLVLIIYNFGMVLLNLFIFRELFMGSYNAGYSYICQSVDYSNNVHEVR
::.:....::. : .:..::.:..::.:..: :: : ... :...::.. . . ...
CCDS75 PKYMRNKQPFSCRGILVVYNLGLTLLSLYMFCELVTGVWEGKYNFFCQGT-RTAGESDMK
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 IAAALWWYFVSKGVEYLDTVFFILRKKNNQVSFLHVYHHCTMFTLWWIGIKWVAGGQAFF
: .::::. :: .:..:: ::::::.:.:.. :::::: .:...::. ..:: :..
CCDS75 IIRVLWWYYFSKLIEFMDTFFFILRKNNHQITVLHVYHHASMLNIWWFVMNWVPCGHSSV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE3 GA-----QLNSFIHVIMYSYYGLTAFGPWIQKYLWWKRYLTMLQLIQFHVTIGHTALSLY
: :: . . : . :. :..: ::. .
CCDS75 CADNHPDQLRGHLAVHIPSW--LVVFPDWIHDFPDCSLHKLLHSDLQQERGLPKERPPEG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 TDCPFPKWMHWALIAYAISFIFLFLNFYIRTYKEPKKPKAGKTAMNGISANGVSKSEKQL
CCDS75 PPEWVHGCCEWTHQQLFTPGKQCEAKEAAEGLKSKN
230 240 250 260
>>CCDS57987.1 ELOVL1 gene_id:64834|Hs108|chr1 (252 aa)
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.. .:..:. . . :: :....::: :: :: :. ::
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:::. : .:.:::.: .:.:::..: :.:.: :.
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.. : :..:: .::::: ::::.:::: : :::::...: .::::: .. : . .
CCDS57 MGSFHAMINSSVHVIMYLYYGLSAFGPVAQPYLWWKKHMTAIQLIQFVLVSLHISQYYFM
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..: .: .: . :. :..:: ::. ..: . :. :.: . .:: : :..:
CCDS57 SSCNYQYPVIIHLIWM-YGTIFFMLFSNFWYHSYTKGKRLPRALQ--QNG--APGIAKVK
200 210 220 230 240 250
300 310
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CCDS57 AN
>>CCDS7531.1 ELOVL3 gene_id:83401|Hs108|chr10 (270 aa)
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10 20 30 40 50
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:: .:. . : . : : : :... : : . :. .::..
CCDS75 MVTAMNVSHEVNQLFQPYNFELS-KDMR----PFFEEYWATSFPIALIYLVL
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. .: ..::.:. :... ::...: ....... ... ::. ..: . :.: .
CCDS75 IAVGQNYMKERKGFNLQGPLILWSFCLAIFSILGAVRMWGIMGTVLLTGGLK---QTVCF
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: . . . : ...:: .: ::.:.::::. . :.: ::: :... .: :
CCDS75 INFIDNSTVKFWSWVFLLSKVIELGDTAFIILRKR--PLIFIHWYHHSTVLVYTSFGYKN
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CCDS75 KVPAGGWF-VTMNFGVHAIMYTYYTLKAANVKPPKML--PMLITSLQILQMFVGAIVSIL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]