Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3610
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3610, 364 aa
1>>>pF1KE3610 364 - 364 aa - 364 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1711+/-0.000804; mu= 16.8400+/- 0.048
mean_var=60.0870+/-11.877, 0's: 0 Z-trim(107.0): 35 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.165457
statistics sampled from 9301 (9336) to 9301 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.287), width: 16
Scan time: 2.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8581.1 GDF3 gene_id:9573|Hs108|chr12 ( 364) 2512 608.0 4.1e-174
CCDS42526.1 GDF1 gene_id:2657|Hs108|chr19 ( 372) 524 133.4 3e-31
CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 ( 396) 522 133.0 4.4e-31
CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14 ( 408) 460 118.2 1.3e-26
CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6 ( 513) 444 114.4 2.2e-25
CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20 ( 431) 423 109.4 6.1e-24
CCDS437.1 BMP8A gene_id:353500|Hs108|chr1 ( 402) 422 109.1 6.8e-24
CCDS444.1 BMP8B gene_id:656|Hs108|chr1 ( 402) 421 108.9 8.1e-24
CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6 ( 454) 421 108.9 8.9e-24
CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20 ( 501) 410 106.3 6e-23
CCDS34926.1 GDF6 gene_id:392255|Hs108|chr8 ( 455) 384 100.1 4.1e-21
CCDS5464.1 INHBA gene_id:3624|Hs108|chr7 ( 426) 380 99.1 7.5e-21
CCDS1701.1 GDF7 gene_id:151449|Hs108|chr2 ( 450) 367 96.0 6.7e-20
CCDS2132.1 INHBB gene_id:3625|Hs108|chr2 ( 407) 351 92.2 8.7e-19
CCDS3588.1 BMP3 gene_id:651|Hs108|chr4 ( 472) 350 92.0 1.2e-18
CCDS73117.1 GDF10 gene_id:2662|Hs108|chr10 ( 478) 338 89.1 8.6e-18
CCDS7304.1 NODAL gene_id:4838|Hs108|chr10 ( 347) 334 88.1 1.3e-17
CCDS73118.1 GDF2 gene_id:2658|Hs108|chr10 ( 429) 333 87.9 1.8e-17
CCDS1890.1 BMP10 gene_id:27302|Hs108|chr2 ( 424) 325 86.0 6.7e-17
CCDS14334.1 BMP15 gene_id:9210|Hs108|chrX ( 392) 316 83.8 2.8e-16
CCDS8939.1 INHBE gene_id:83729|Hs108|chr12 ( 350) 305 81.1 1.5e-15
CCDS8938.1 INHBC gene_id:3626|Hs108|chr12 ( 352) 298 79.5 5e-15
CCDS2303.1 MSTN gene_id:2660|Hs108|chr2 ( 375) 289 77.3 2.3e-14
CCDS75299.1 GDF9 gene_id:2661|Hs108|chr5 ( 366) 273 73.5 3.2e-13
CCDS4162.1 GDF9 gene_id:2661|Hs108|chr5 ( 454) 273 73.6 3.9e-13
CCDS8891.1 GDF11 gene_id:10220|Hs108|chr12 ( 407) 270 72.8 5.8e-13
CCDS9846.1 TGFB3 gene_id:7043|Hs108|chr14 ( 412) 242 66.1 6e-11
CCDS33031.1 TGFB1 gene_id:7040|Hs108|chr19 ( 390) 241 65.9 6.7e-11
>>CCDS8581.1 GDF3 gene_id:9573|Hs108|chr12 (364 aa)
initn: 2512 init1: 2512 opt: 2512 Z-score: 3239.3 bits: 608.0 E(32554): 4.1e-174
Smith-Waterman score: 2512; 99.7% identity (99.7% similar) in 364 aa overlap (1-364:1-364)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MLRFLPDLAFSFLLILALGQAVQFQEYVFLQFLGLDKAPSPQKFQPVPYILKKIFQDREA
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CCDS85 MLRFLPDLAFSFLLILALGQAVQFQEYVFLQFLGLDKAPSPQKFQPVPYILKKIFQDREA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 AATTGVSRDLCYVKELGVRGNVLRFLPDQGFFLYPKKISQASSCLQKLLYFNLSAIKERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 AATTGVSRDLCYVKELGVRGNVLRFLPDQGFFLYPKKISQASSCLQKLLYFNLSAIKERE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 QLTLAQLGLDLGPNSYYNLGPELELALFLVQEPHVWGQTTPKPGKMFVLRSVPWPQGAVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 QLTLAQLGLDLGPNSYYNLGPELELALFLVQEPHVWGQTTPKPGKMFVLRSVPWPQGAVH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 FNLLDVAKDWNDNPRKNFGLFLEILVKEDRDSRVNFQPEDTCARLRCSLHASLLVVTLNP
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CCDS85 FNLLDVAKDWNDNPRKNFGLFLEILVKEDRDSGVNFQPEDTCARLRCSLHASLLVVTLNP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DQCHPSRKRRAAIPVPKLSCKNLCHRHQLFINFRDLGWHKWIIAPKGFMANYCHGECPFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 DQCHPSRKRRAAIPVPKLSCKNLCHRHQLFINFRDLGWHKWIIAPKGFMANYCHGECPFS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LTISLNSSNYAFMQALMHAVDPEIPQAVCIPTKLSPISMLYQDNNDNVILRHYEDMVVDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS85 LTISLNSSNYAFMQALMHAVDPEIPQAVCIPTKLSPISMLYQDNNDNVILRHYEDMVVDE
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 CGCG
::::
CCDS85 CGCG
>>CCDS42526.1 GDF1 gene_id:2657|Hs108|chr19 (372 aa)
initn: 595 init1: 222 opt: 524 Z-score: 674.5 bits: 133.4 E(32554): 3e-31
Smith-Waterman score: 701; 36.8% identity (62.6% similar) in 356 aa overlap (29-363:39-371)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MLRFLPDLAFSFLLILALGQAVQFQEYVFLQFLGL-DKAPSPQKFQPVPYILKKIFQD
.:: ::: :. . ...::: .. ..:.
CCDS42 CGHHLLLLLALLLPSLPLTRAPVPPGPAAALLQALGLRDEPQGAPRLRPVPPVMWRLFRR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE3 REAAATT--------GVSRDLCYVKELGVRGNVLRFLPDQGFFLYPKKISQASS----CL
:. : ::. . :.:.:::: ::..: .::.: : . :. .: :
CCDS42 RDPQETRSGSRRTSPGVTLQPCHVEELGVAGNIVRHIPDRG---APTRASEPASAAGHCP
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 QKLLYFNLSAIKEREQLTLAQLGLDLGPNSYYNLGPELELALFLVQEPHVWGQTTPKPGK
. . :.:::.. :. . :.: : .. . .:: : ..: . : ::
CCDS42 EWTVVFDLSAVEPAERPSRARLELRFAAAA--AAAPEGGWELSVAQAGQGAGAD---PGP
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 MFVLRSVPWPQGAVHFNLLDVAKDWNDNPRKNFGLFLEILVKEDRDSRVNFQPEDTCARL
... . :: :. .:: .: : : .: : . .. . .::::
CCDS42 VLLRQLVPALGPPVRAELLGAA--WARNASWPRSLRLALALRP--------RAPAACARL
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 RCSLHASLLVVTLNPDQCHP-SRKRRAAIPVPKLSCKNLCHRHQLFINFRDLGWHKWIIA
.::::.:::.: ::: .: :: : :: . . :. ..:...::..:::.:.::
CCDS42 A---EASLLLVTLDPRLCHPLARPRRDAEPVLGGGPGGACRARRLYVSFREVGWHRWVIA
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE3 PKGFMANYCHGECPFSLTISLNSS----NYAFMQALMHAVDP---EIPQAVCIPTKLSPI
:.::.::::.:.: . ...: ... :.: ..:::::. : ..: :.:..::::
CCDS42 PRGFLANYCQGQCALPVALSGSGGPPALNHAVLRALMHAAAPGAADLP--CCVPARLSPI
290 300 310 320 330 340
340 350 360
pF1KE3 SMLYQDNNDNVILRHYEDMVVDECGCG
:.:. ::.:::.::.:::::::::::
CCDS42 SVLFFDNSDNVVLRQYEDMVVDECGCR
350 360 370
>>CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 (396 aa)
initn: 485 init1: 462 opt: 522 Z-score: 671.5 bits: 133.0 E(32554): 4.4e-31
Smith-Waterman score: 567; 31.1% identity (61.7% similar) in 360 aa overlap (26-363:54-395)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MLRFLPDLAFSFLLILALGQAVQFQEYVFLQFLGLDKAPSPQKFQPVPYILKKIF
: .:...:: . :.:.. :: . ..
CCDS13 LVPELGRRKFAAASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLLSMFGLKQRPTPSRDAVVPPYMLDLY
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 QDREAAATTGVSRDLCYVKELGVRGNVLR-FLPDQGFFLYPKKISQASSCLQKLLYFNLS
:. .. : ... . :.:..: : .... ... ..:. . ..::::
CCDS13 --RRHSGQPGSPAPDHRLERAASRANTVRSFHHEESL----EELPETSGKTTRRFFFNLS
90 100 110 120 130
120 130 140 150 160
pF1KE3 AIKEREQLTLAQLGL------D-LGPNSYYNLGPELELALFLVQEPHVWGQTTPKPGKMF
.: .: .: :.: . : :: :: .. .. .. . .: . .. : ...
CCDS13 SIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNSSFHH----RINIYEIIKPATANSKFPVT-RLL
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210
pF1KE3 VLRSVPWPQGAVHFNLLDVAKD---WNDNPRKNFGLFLEILVKEDRD---------SRVN
: : :.: ... .::. :. . . : :. .:. :... ::
CCDS13 DTRLV--NQNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHGFVVEVAHLEEKQGVSKRHVRISRSL
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 FQPEDTCARLRCSLHASLLVVTLNPDQCHP--SRKRRAAIPVPKLSCKNLCHRHQLFINF
: : . ...: :::. . . :: .:..: : . :. :.:: :...:
CCDS13 HQDEHSWSQIR-----PLLVTFGHDGKGHPLHKREKRQAKHKQRKRLKSSCKRHPLYVDF
260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 RDLGWHKWIIAPKGFMANYCHGECPFSLTISLNSSNYAFMQALMHAVDPEIPQAVCIPTK
:.::. ::.:: :. : :::::::: :. :::.:.:..:.:...:. .::.: :.::.
CCDS13 SDVGWNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSKIPKACCVPTE
310 320 330 340 350 360
340 350 360
pF1KE3 LSPISMLYQDNNDNVILRHYEDMVVDECGCG
:: ::::: :.:..:.:..:.::::. :::
CCDS13 LSAISMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEGCGCR
370 380 390
>>CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14 (408 aa)
initn: 494 init1: 445 opt: 460 Z-score: 591.3 bits: 118.2 E(32554): 1.3e-26
Smith-Waterman score: 551; 31.8% identity (61.1% similar) in 365 aa overlap (26-363:58-407)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MLRFLPDLAFSFLLILALGQAVQFQEYVFLQFLGLDKAPSPQKFQPVPYILKKIF
: ..::..:: . :.:.: .: .. ..
CCDS97 PETGKKKVAEIQGHAGGRRSGQSHELLRDFEATLLQMFGLRRRPQPSKSAVIPDYMRDLY
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 --QDREAAATTGVSRDLCYVKELGVRGNVLRFLPDQGFFLYPKKISQASSCLQKLLYFNL
:. : : : : .. . :.:..: . . . :. :. ..: :::
CCDS97 RLQSGEEEEEQIHSTGLEYPERPASRANTVRSFHHEEHLENIPGTSENSAF--RFL-FNL
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160
pF1KE3 SAIKEREQLTLAQLGL-----DLGPNSYYNLGPELELALFLVQEPHVWGQTTPKPGKMF-
:.: : : .. :.: : : ::. .. : . .. .. :..: . ::...
CCDS97 SSIPENEVISSAELRLFREQVDQGPD--WERGFH-RINIYEVMKP----PAEVVPGHLIT
150 160 170 180 190
170 180 190 200 210
pF1KE3 -VLRSVPWPQGAVHFNLLDVAKD---WNDNPRKNFGLFLEIL------VKEDRDSRVNFQ
.: . ....... .::. :. . . :.:: .:. ... . :.. .
CCDS97 RLLDTRLVHHNVTRWETFDVSPAVLRWTREKQPNYGLAIEVTHLHQTRTHQGQHVRISRS
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260
pF1KE3 -PEDTC--ARLRCSLHASLLVVTLNPDQCHPSRKRRAAIPVPKLSC-----KNL-CHRHQ
:. . :.:: :::. . . : .:: : :: :: :.::.
CCDS97 LPQGSGNWAQLR-----PLLVTFGHDGRGHALTRRRRAKRSPKHHSQRARKKNKNCRRHS
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 LFINFRDLGWHKWIIAPKGFMANYCHGECPFSLTISLNSSNYAFMQALMHAVDPEIPQAV
:...: :.::. ::.:: :..: ::::.::: :. :::.:.:..:.:...:. ::.:
CCDS97 LYVDFSDVGWNDWIVAPPGYQAFYCHGDCPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSSIPKAC
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360
pF1KE3 CIPTKLSPISMLYQDNNDNVILRHYEDMVVDECGCG
:.::.:: ::::: :. :.:.:..:..:::. :::
CCDS97 CVPTELSAISMLYLDEYDKVVLKNYQEMVVEGCGCR
380 390 400
>>CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6 (513 aa)
initn: 442 init1: 284 opt: 444 Z-score: 569.2 bits: 114.4 E(32554): 2.2e-25
Smith-Waterman score: 498; 29.9% identity (57.5% similar) in 358 aa overlap (36-363:164-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 PDLAFSFLLILALGQAVQFQEYVFLQFLGLDKAPSPQKFQPVPYILKKIFQDREAAATTG
. : : :. :: : . . . : .:
CCDS45 LFMLDLYNALSADNDEDGASEGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHPLNRKSLLAPGSG
140 150 160 170 180 190
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 V--SRDLCYVKELGVRGNVLRFLPDQGFFLYPKKISQASSCLQKLLYFNLSAIKEREQLT
. : ... . ... . .. : :..: . .: . :::: : : : .:
CCDS45 SGGASPLTSAQDSAFLNDADMVMSFVNLVEYDKEFSPRQRH-HKEFKFNLSQIPEGEVVT
200 210 220 230 240 250
130 140 150 160 170
pF1KE3 LAQLGL--DLGPNSYYNLGPELELALFLVQEPHVWGQTTPKPGKMFVLRS-VPWP--QGA
:.. . : .:. : ::.. .: . . . .:.: . : : .:
CCDS45 AAEFRIYKDCVMGSFKN-------QTFLISIYQVLQEHQHRDSDLFLLDTRVVWASEEGW
260 270 280 290 300
180 190 200 210 220
pF1KE3 VHFNLLDVAKDWNDNPRKNFGLFLEILVKED------------RDSRVNFQPEDTCARLR
..:.. ... : .:..:.:: : ..... ::. . :: : ..
CCDS45 LEFDITATSNLWVVTPQHNMGLQLSVVTRDGVHVHPRAAGLVGRDGPYDKQPF-MVAFFK
310 320 330 340 350 360
230 240 250 260 270
pF1KE3 CSLHASLLVVTLNPDQCHPSRKRRA-AIPVPKLSC---------KNLCHRHQLFINFRDL
: . . . . . ::.: . . : ..: :. :..:.:...:.::
CCDS45 VSEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQSQDVARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVSFQDL
370 380 390 400 410 420
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 GWHKWIIAPKGFMANYCHGECPFSLTISLNSSNYAFMQALMHAVDPE-IPQAVCIPTKLS
::. :::::::. :::: ::: : :. .:..:.:..:.:.: ..:: .:. : ::::.
CCDS45 GWQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKLN
430 440 450 460 470 480
340 350 360
pF1KE3 PISMLYQDNNDNVILRHYEDMVVDECGCG
::.:: :.:.::::..:..::: :::
CCDS45 AISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH
490 500 510
>>CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20 (431 aa)
initn: 456 init1: 273 opt: 423 Z-score: 543.2 bits: 109.4 E(32554): 6.1e-24
Smith-Waterman score: 465; 28.0% identity (57.1% similar) in 382 aa overlap (30-363:59-430)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MLRFLPDLAFSFLLILALGQAVQFQEYVFLQFLGLDKAPSPQ---KFQPVPYILKKIFQ
:..::: . : :. : . .:... ...
CCDS13 ADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQREILSILGLPHRPRPHLQGKHNSAPMFMLDLYN
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100
pF1KE3 D---REAAATTGVSRDLCYVKELGVRGNVLRFLPDQGFFLYPKKISQASSCLQ-------
.:... : . . : ....: : : :. :. . . . ..
CCDS13 AMAVEEGGGPGGQGFSYPYKAVFSTQGPPLASLQDSHFLTDADMVMSFVNLVEHDKEFFH
90 100 110 120 130 140
110 120 130 140 150
pF1KE3 -----KLLYFNLSAIKEREQLTLAQLGL--DLGPNSYYNLGPELELALFLVQEPHVWGQT
. . :.:: : : : .: :.. . : . . : ...... : . :. :.
CCDS13 PRYHHREFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDYIRERFDN--ETFRISVYQVLQEHL-GRE
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 TPKPGKMFVLRSVP-WP--QGAVHFNLLDVAKDWNDNPRKNFGLFLEILVKEDRDSR-VN
. .:.: : : .: . :.. ... : :::.:.:: : . : :.. .:
CCDS13 S----DLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPRHNLGLQLSV---ETLDGQSIN
210 220 230 240 250
220 230 240 250 260
pF1KE3 FQPEDTCARLRCSLHASLLVVTLNPDQCH-------PSRKR---RAAIPVPK--LSCKNL
. .: . . ..:. .. . : :..: :. : . : :.
CCDS13 PKLAGLIGRHGPQNKQPFMVAFFKATEVHFRSIRSTGSKQRSQNRSKTPKNQEALRMANV
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310
pF1KE3 -----------CHRHQLFINFRDLGWHKWIIAPKGFMANYCHGECPFSLTISLNSSNYAF
:..:.:...::::::. :::::.:. : ::.::: : :. .:..:.:.
CCDS13 AENSSSDQRQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCEGECAFPLNSYMNATNHAI
320 330 340 350 360 370
320 330 340 350 360
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.:.:.: ..:: .:. : ::.:. ::.:: :...::::..:..::: :::
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CCDS44 KRHKDLGLRLYVET-EDGHS-VDPGLAGLLGQ-RAPRSQQPFVVTFFRASPSPIRTPRAV
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260 270 280
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CCDS44 RPLRRRQPKKSNELPQANRLPGIFDDVHGSHGRQVCRRHELYVSFQDLGWLDWVIAPQGY
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290 300 310 320 330 340
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CCDS44 SAYYCEGECSFPLDSCMNATNHAILQSLVHLMMPDAVPKACCAPTKLSATSVLYYDSSNN
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CCDS44 VILRKHRNMVVKACGCH
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CCDS49 RFEN--ETIKISIYQIIKEY-----TNRDADLFLLDTRKAQALDVGWLVFDITVTSNHWV
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::..:.:: : . . :. :. :.. . ..:: ...
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. : .. : . .: ... . : :. :..:.:...::::::. :::::.:. :
CCDS49 RKNQNRNKSSSHQDSSRMSSVGDYNTSEQKQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAF
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364 residues in 1 query sequences
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start: Sun Nov 6 22:28:10 2016 done: Sun Nov 6 22:28:10 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]