Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3595
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3595, 354 aa
1>>>pF1KE3595 354 - 354 aa - 354 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8877+/-0.00096; mu= 19.6588+/- 0.059
mean_var=71.3356+/-13.939, 0's: 0 Z-trim(104.8): 46 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.151852
statistics sampled from 8050 (8095) to 8050 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.249), width: 16
Scan time: 2.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS803.1 GNAT2 gene_id:2780|Hs108|chr1 ( 354) 2328 519.2 2.1e-147
CCDS47625.1 GNAT3 gene_id:346562|Hs108|chr7 ( 354) 1940 434.2 8e-122
CCDS2812.1 GNAT1 gene_id:2779|Hs108|chr3 ( 350) 1937 433.5 1.3e-121
CCDS2813.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 355) 1690 379.4 2.5e-105
CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1 ( 354) 1688 379.0 3.3e-105
CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 ( 354) 1678 376.8 1.5e-104
CCDS54587.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 318) 1554 349.6 2.1e-96
CCDS63642.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 339) 1554 349.6 2.2e-96
CCDS63644.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 303) 1475 332.3 3.3e-91
CCDS59061.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 ( 302) 1473 331.8 4.5e-91
CCDS10756.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 ( 354) 1454 327.7 9.1e-90
CCDS10757.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 ( 354) 1427 321.8 5.5e-88
CCDS13804.1 GNAZ gene_id:2781|Hs108|chr22 ( 355) 1373 310.0 2e-84
CCDS6658.1 GNAQ gene_id:2776|Hs108|chr9 ( 359) 1110 252.4 4.4e-67
CCDS6657.1 GNA14 gene_id:9630|Hs108|chr9 ( 355) 1088 247.5 1.2e-65
CCDS12103.1 GNA11 gene_id:2767|Hs108|chr19 ( 359) 1068 243.2 2.6e-64
CCDS5335.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 381) 916 209.9 2.9e-54
CCDS11661.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17 ( 377) 865 198.7 6.6e-51
CCDS12104.1 GNA15 gene_id:2769|Hs108|chr19 ( 374) 864 198.5 7.7e-51
CCDS11852.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 381) 831 191.3 1.2e-48
CCDS42892.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 379) 825 189.9 2.9e-48
CCDS46624.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 380) 818 188.4 8.4e-48
CCDS11851.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 458) 816 188.0 1.3e-47
CCDS64584.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 322) 712 165.1 7.2e-41
CCDS62302.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17 ( 282) 666 155.0 7.1e-38
CCDS13472.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 394) 653 152.3 6.5e-37
CCDS46623.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 395) 651 151.8 8.9e-37
CCDS46622.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 (1037) 653 152.6 1.3e-36
CCDS64583.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 305) 626 146.3 3.3e-35
CCDS58614.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 174) 349 85.4 4e-17
>>CCDS803.1 GNAT2 gene_id:2780|Hs108|chr1 (354 aa)
initn: 2328 init1: 2328 opt: 2328 Z-score: 2759.9 bits: 519.2 E(32554): 2.1e-147
Smith-Waterman score: 2328; 100.0% identity (100.0% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGSGASAEDKELAKRSKELEKKLQEDADKEAKTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG
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CCDS80 MGSGASAEDKELAKRSKELEKKLQEDADKEAKTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YSPEECLEFKAIIYGNVLQSILAIIRAMTTLGIDYAEPSCADDGRQLNNLADSIEEGTMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 YSPEECLEFKAIIYGNVLQSILAIIRAMTTLGIDYAEPSCADDGRQLNNLADSIEEGTMP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PELVEVIRRLWKDGGVQACFERAAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 PELVEVIRRLWKDGGVQACFERAAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 TTGIIETKFSVKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 TTGIIETKFSVKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDEV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NRMHESLHLFNSICNHKFFAATSIVLFLNKKDLFEEKIKKVHLSICFPEYDGNNSYDDAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 NRMHESLHLFNSICNHKFFAATSIVLFLNKKDLFEEKIKKVHLSICFPEYDGNNSYDDAG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE3 NYIKSQFLDLNMRKDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 NYIKSQFLDLNMRKDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
310 320 330 340 350
>>CCDS47625.1 GNAT3 gene_id:346562|Hs108|chr7 (354 aa)
initn: 1940 init1: 1940 opt: 1940 Z-score: 2300.5 bits: 434.2 E(32554): 8e-122
Smith-Waterman score: 1940; 80.2% identity (94.6% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGSGASAEDKELAKRSKELEKKLQEDADKEAKTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG
:::: :.:.:: :::::::::::::::...:.:::::::::::::::::::::::::..:
CCDS47 MGSGISSESKESAKRSKELEKKLQEDAERDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHKNG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YSPEECLEFKAIIYGNVLQSILAIIRAMTTLGIDYAEPSCADDGRQLNNLADSIEEGTMP
:: .::.::::.::.:.:::::::..:::::::::..: :.: ::: .:...:.: :
CCDS47 YSEQECMEFKAVIYSNTLQSILAIVKAMTTLGIDYVNPRSAEDQRQLYAMANTLEDGGMT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PELVEVIRRLWKDGGVQACFERAAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRVK
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CCDS47 PQLAEVIKRLWRDPGIQACFERASEYQLNDSAAYYLNDLDRITASGYVPNEQDVLHSRVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 TTGIIETKFSVKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDEV
:::::::.:: :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS47 TTGIIETQFSFKDLHFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDEEV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NRMHESLHLFNSICNHKFFAATSIVLFLNKKDLFEEKIKKVHLSICFPEYDGNNSYDDAG
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CCDS47 NRMHESLHLFNSICNHKYFSTTSIVLFLNKKDIFQEKVTKVHLSICFPEYTGPNTFEDAG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE3 NYIKSQFLDLNMRKDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
::::.::::::..:. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NYIKNQFLDLNLKKEDKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
310 320 330 340 350
>>CCDS2812.1 GNAT1 gene_id:2779|Hs108|chr3 (350 aa)
initn: 1908 init1: 1908 opt: 1937 Z-score: 2297.1 bits: 433.5 E(32554): 1.3e-121
Smith-Waterman score: 1937; 81.9% identity (94.6% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-350)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGSGASAEDKELAKRSKELEKKLQEDADKEAKTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG
::.:::::.:. :.::::::.:::.:.:.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 MGAGASAEEKH----SRELEKKLKEDAEKDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YSPEECLEFKAIIYGNVLQSILAIIRAMTTLGIDYAEPSCADDGRQLNNLADSIEEGTMP
:: :::::: ::::::.:::::::.::::::.:.:.. . ::.:.: ..::.:::::::
CCDS28 YSLEECLEFIAIIYGNTLQSILAIVRAMTTLNIQYGDSARQDDARKLMHMADTIEEGTMP
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PELVEVIRRLWKDGGVQACFERAAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRVK
:. ..:.:::::.:.:::::::.::::::::.:::..:::.. : :.:.::::::::::
CCDS28 KEMSDIIQRLWKDSGIQACFERASEYQLNDSAGYYLSDLERLVTPGYVPTEQDVLRSRVK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 TTGIIETKFSVKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDEV
:::::::.:: :::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS28 TTGIIETQFSFKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFIAALSAYDMVLVEDDEV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NRMHESLHLFNSICNHKFFAATSIVLFLNKKDLFEEKIKKVHLSICFPEYDGNNSYDDAG
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CCDS28 NRMHESLHLFNSICNHRYFATTSIVLFLNKKDVFFEKIKKAHLSICFPDYDGPNTYEDAG
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE3 NYIKSQFLDLNMRKDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
:::: :::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 NYIKVQFLELNMRRDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
300 310 320 330 340 350
>>CCDS2813.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 (355 aa)
initn: 1671 init1: 1206 opt: 1690 Z-score: 2004.5 bits: 379.4 E(32554): 2.5e-105
Smith-Waterman score: 1690; 69.9% identity (90.1% similar) in 355 aa overlap (1-354:1-355)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGSGASAEDKELAKRSKELEKKLQEDADKEAKTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG
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CCDS28 MGCTVSAEDKAAAERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE3 YSPEECLEFKAIIYGNVLQSILAIIRAMTTLGIDYAEPSCADDGRQLNNLADSIEE-GTM
:: ::: ...:..:.:..:::.::..:: .: ::.:.:: :::.::: :. . :: :..
CCDS28 YSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 PPELVEVIRRLWKDGGVQACFERAAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRV
: .: :::::: : :::::: :. ::::::::.::::.::::.. .:.:..:::::.::
CCDS28 PDDLSGVIRRLWADHGVQACFGRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 KTTGIIETKFSVKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDE
:::::.::.:. :::.:.:::::::::::::::::::::: ::::.::::::.::.::.:
CCDS28 KTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 VNRMHESLHLFNSICNHKFFAATSIVLFLNKKDLFEEKIKKVHLSICFPEYDGNNSYDDA
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CCDS28 MNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 GNYIKSQFLDLNMRKDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
..::.:.: ::: :::.::::.:.::::::.::.::::::::.:::.::::::::
CCDS28 ASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
310 320 330 340 350
>>CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1 (354 aa)
initn: 1688 init1: 1688 opt: 1688 Z-score: 2002.2 bits: 379.0 E(32554): 3.3e-105
Smith-Waterman score: 1688; 69.5% identity (89.8% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGSGASAEDKELAKRSKELEKKLQEDADKEAKTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG
:: ::::: ..::: ....:.::..: :: ::::::::::::::::::::::::.::
CCDS80 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YSPEECLEFKAIIYGNVLQSILAIIRAMTTLGIDYAEPSCADDGRQLNNLADSIEEGTMP
:: .:: ..:...:.:..:::.:::::: : ::..: . :::.::: :: : :::.:
CCDS80 YSEDECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PELVEVIRRLWKDGGVQACFERAAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRVK
:::. ::.:::.:::::::: :. :::::::::::::.:.::.. .:.:..:::::.:::
CCDS80 PELAGVIKRLWRDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 TTGIIETKFSVKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDEV
::::.::.:. ::: :.:::::::::::::::::::::: ::::.::: ::.::.::.:.
CCDS80 TTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NRMHESLHLFNSICNHKFFAATSIVLFLNKKDLFEEKIKKVHLSICFPEYDGNNSYDDAG
::::::..::.::::.:.:. :::.::::::::::::::. :.::.::: :.:.:..:.
CCDS80 NRMHESMKLFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE3 NYIKSQFLDLNMRKDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
::. :: ::: :::.::::.:.::::::.::.::::::::.:::.:::.:::.
CCDS80 AYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY
310 320 330 340 350
>>CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 (354 aa)
initn: 1678 init1: 1678 opt: 1678 Z-score: 1990.3 bits: 376.8 E(32554): 1.5e-104
Smith-Waterman score: 1678; 69.5% identity (89.8% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGSGASAEDKELAKRSKELEKKLQEDADKEAKTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG
:: ::::: ..::: ....:.::..: :. ::::::::::::::::::::::::. :
CCDS55 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YSPEECLEFKAIIYGNVLQSILAIIRAMTTLGIDYAEPSCADDGRQLNNLADSIEEGTMP
:: ::: ..::..:.:..:::.:::::: : ::... . :::.::: :: . ::: :
CCDS55 YSEEECKQYKAVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGAAEEGFMT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 PELVEVIRRLWKDGGVQACFERAAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRVK
::. ::.:::::.::::::.:. ::::::::.::::.:.::..:.:.:..:::::.:::
CCDS55 AELAGVIKRLWKDSGVQACFNRSREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTRVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 TTGIIETKFSVKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDEV
::::.::.:. :::.:.:::::::::::::::::::::: ::::.::: ::.::.::.:.
CCDS55 TTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 NRMHESLHLFNSICNHKFFAATSIVLFLNKKDLFEEKIKKVHLSICFPEYDGNNSYDDAG
::::::..::.::::.:.:. :::.::::::::::::::: :.::.::: :.:.:..:.
CCDS55 NRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE3 NYIKSQFLDLNMRKDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
::. :: ::: :::.::::.:.::::::.::.::::::::.:::.::::::::
CCDS55 AYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
310 320 330 340 350
>>CCDS54587.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 (318 aa)
initn: 1535 init1: 1206 opt: 1554 Z-score: 1844.1 bits: 349.6 E(32554): 2.1e-96
Smith-Waterman score: 1554; 71.2% identity (91.1% similar) in 316 aa overlap (40-354:3-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 KELAKRSKELEKKLQEDADKEAKTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDGYSPEECLEF
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CCDS54 MRGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQY
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70 80 90 100 110 120
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CCDS54 RAVVYSNTIQSIMAIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVLPDDLSGVIR
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pF1KE3 RLWKDGGVQACFERAAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRVKTTGIIETK
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CCDS54 RLWADHGVQACFGRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETH
100 110 120 130 140 150
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pF1KE3 FSVKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDEVNRMHESLH
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CCDS54 FTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMK
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LFNSICNHKFFAATSIVLFLNKKDLFEEKIKKVHLSICFPEYDGNNSYDDAGNYIKSQFL
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CCDS54 LFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFE
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
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CCDS54 DLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
280 290 300 310
>>CCDS63642.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 (339 aa)
initn: 1535 init1: 1206 opt: 1554 Z-score: 1843.8 bits: 349.6 E(32554): 2.2e-96
Smith-Waterman score: 1554; 71.2% identity (91.1% similar) in 316 aa overlap (40-354:24-339)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 KELAKRSKELEKKLQEDADKEAKTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDGYSPEECLEF
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CCDS63 MTEGVKTLGWTKQKGGCHWGRSEGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 KAIIYGNVLQSILAIIRAMTTLGIDYAEPSCADDGRQLNNLADSIEE-GTMPPELVEVIR
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CCDS63 RAVVYSNTIQSIMAIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVLPDDLSGVIR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RLWKDGGVQACFERAAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRVKTTGIIETK
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CCDS63 RLWADHGVQACFGRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 FSVKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDEVNRMHESLH
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CCDS63 FTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LFNSICNHKFFAATSIVLFLNKKDLFEEKIKKVHLSICFPEYDGNNSYDDAGNYIKSQFL
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CCDS63 LFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFE
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pF1KE3 DLNMRKDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
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CCDS63 DLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
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>>CCDS63644.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 (303 aa)
initn: 1456 init1: 1206 opt: 1475 Z-score: 1750.9 bits: 332.3 E(32554): 3.3e-91
Smith-Waterman score: 1475; 70.0% identity (90.8% similar) in 303 aa overlap (53-354:1-303)
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 LQEDADKEAKTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDGYSPEECLEFKAIIYGNVLQSIL
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CCDS63 MKIIHEDGYSEEECRQYRAVVYSNTIQSIM
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90 100 110 120 130 140
pF1KE3 AIIRAMTTLGIDYAEPSCADDGRQLNNLADSIEE-GTMPPELVEVIRRLWKDGGVQACFE
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CCDS63 AIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVLPDDLSGVIRRLWADHGVQACFG
40 50 60 70 80 90
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pF1KE3 RAAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRVKTTGIIETKFSVKDLNFRMFDV
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CCDS63 RSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDV
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pF1KE3 GGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDEVNRMHESLHLFNSICNHKFFAA
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CCDS63 GGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTD
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 TSIVLFLNKKDLFEEKIKKVHLSICFPEYDGNNSYDDAGNYIKSQFLDLNMRKDVKEIYS
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CCDS63 TSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYT
220 230 240 250 260 270
330 340 350
pF1KE3 HMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
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CCDS63 HFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
280 290 300
>>CCDS59061.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 (302 aa)
initn: 1473 init1: 1473 opt: 1473 Z-score: 1748.5 bits: 331.8 E(32554): 4.5e-91
Smith-Waterman score: 1473; 70.2% identity (90.7% similar) in 302 aa overlap (53-354:1-302)
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 LQEDADKEAKTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDGYSPEECLEFKAIIYGNVLQSIL
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CCDS59 MKIIHEAGYSEEECKQYKAVVYSNTIQSII
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 AIIRAMTTLGIDYAEPSCADDGRQLNNLADSIEEGTMPPELVEVIRRLWKDGGVQACFER
:::::: : ::... . :::.::: :: . ::: : ::. ::.:::::.::::::.:
CCDS59 AIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGAAEEGFMTAELAGVIKRLWKDSGVQACFNR
40 50 60 70 80 90
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pF1KE3 AAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRVKTTGIIETKFSVKDLNFRMFDVG
. ::::::::.::::.:.::..:.:.:..:::::.:::::::.::.:. :::.:.:::::
CCDS59 SREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVG
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 GQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDEVNRMHESLHLFNSICNHKFFAAT
::::::::::::::::: ::::.::: ::.::.::.:.::::::..::.::::.:.:. :
CCDS59 GQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDT
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 SIVLFLNKKDLFEEKIKKVHLSICFPEYDGNNSYDDAGNYIKSQFLDLNMRKDVKEIYSH
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CCDS59 SIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTH
220 230 240 250 260 270
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CCDS59 FTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
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354 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]