Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3591
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3591, 423 aa
1>>>pF1KE3591 423 - 423 aa - 423 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9333+/-0.00103; mu= 13.9596+/- 0.062
mean_var=82.2027+/-16.453, 0's: 0 Z-trim(105.2): 63 B-trim: 0 in 0/47
Lambda= 0.141459
statistics sampled from 8251 (8312) to 8251 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.255), width: 16
Scan time: 2.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2658.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 ( 423) 2874 596.6 1.5e-170
CCDS32640.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 ( 436) 2372 494.2 1e-139
CCDS54116.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 ( 404) 1548 326.0 4.1e-89
CCDS54560.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 ( 355) 1537 323.7 1.7e-88
CCDS64129.1 FBXL7 gene_id:23194|Hs108|chr5 ( 444) 527 117.6 2.4e-26
CCDS54833.1 FBXL7 gene_id:23194|Hs108|chr5 ( 491) 527 117.7 2.6e-26
CCDS5726.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 ( 735) 468 105.7 1.5e-22
CCDS5041.1 FBXL4 gene_id:26235|Hs108|chr6 ( 621) 378 87.3 4.5e-17
CCDS75649.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 ( 707) 352 82.0 2e-15
CCDS10421.1 FBXL16 gene_id:146330|Hs108|chr16 ( 479) 349 81.3 2.2e-15
CCDS8509.1 FBXL14 gene_id:144699|Hs108|chr12 ( 418) 341 79.7 6e-15
CCDS54886.1 FBXL17 gene_id:64839|Hs108|chr5 ( 701) 340 79.6 1.1e-14
CCDS61089.1 AMN1 gene_id:196394|Hs108|chr12 ( 240) 329 77.1 2.1e-14
CCDS44858.1 AMN1 gene_id:196394|Hs108|chr12 ( 258) 329 77.1 2.2e-14
>>CCDS2658.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 (423 aa)
initn: 2874 init1: 2874 opt: 2874 Z-score: 3175.6 bits: 596.6 E(32554): 1.5e-170
Smith-Waterman score: 2874; 100.0% identity (100.0% similar) in 423 aa overlap (1-423:1-423)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MVFSNNDEGLINKKLPKELLLRIFSFLDIVTLCRCAQISKAWNILALDGSNWQRIDLFNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 MVFSNNDEGLINKKLPKELLLRIFSFLDIVTLCRCAQISKAWNILALDGSNWQRIDLFNF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QTDVEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCIGVGDSSLKTFAQNCRNIEHLNLNGCTKITDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 QTDVEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCIGVGDSSLKTFAQNCRNIEHLNLNGCTKITDS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TCYSLSRFCSKLKHLDLTSCVSITNSSLKGISEGCRNLEYLNLSWCDQITKDGIEALVRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 TCYSLSRFCSKLKHLDLTSCVSITNSSLKGISEGCRNLEYLNLSWCDQITKDGIEALVRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 CRGLKALLLRGCTQLEDEALKHIQNYCHELVSLNLQSCSRITDEGVVQICRGCHRLQALC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 CRGLKALLLRGCTQLEDEALKHIQNYCHELVSLNLQSCSRITDEGVVQICRGCHRLQALC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LSGCSNLTDASLTALGLNCPRLQILEAARCSHLTDAGFTLLARNCHELEKMDLEECILIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 LSGCSNLTDASLTALGLNCPRLQILEAARCSHLTDAGFTLLARNCHELEKMDLEECILIT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 DSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDDGILHLSNSTCGHERLRVLELDNCLLITDVALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 DSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDDGILHLSNSTCGHERLRVLELDNCLLITDVALE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 HLENCRGLERLELYDCQQVTRAGIKRMRAQLPHVKVHAYFAPVTPPTAVAGSGQRLCRCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 HLENCRGLERLELYDCQQVTRAGIKRMRAQLPHVKVHAYFAPVTPPTAVAGSGQRLCRCC
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 VIL
:::
CCDS26 VIL
>>CCDS32640.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 (436 aa)
initn: 2372 init1: 2372 opt: 2372 Z-score: 2621.7 bits: 494.2 E(32554): 1e-139
Smith-Waterman score: 2372; 78.2% identity (94.5% similar) in 422 aa overlap (2-423:15-436)
10 20 30 40
pF1KE3 MVFSNNDEGLINKKLPKELLLRIFSFLDIVTLCRCAQISKAWNILAL
.:::.::..::::::::::::::::::.::::::::.:.:::.:::
CCDS32 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLAL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 DGSNWQRIDLFNFQTDVEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCIGVGDSSLKTFAQNCRNIE
:::::::::::.:: :.::::::::::::::::::::::::.::::..:.::::::::::
CCDS32 DGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 HLNLNGCTKITDSTCYSLSRFCSKLKHLDLTSCVSITNSSLKGISEGCRNLEYLNLSWCD
:::::::: ::.:: :::.:::::.::::.::.:::: :::..:::: :: ::.::::
CCDS32 VLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSLKALSEGCPLLEQLNISWCD
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 QITKDGIEALVRGCRGLKALLLRGCTQLEDEALKHIQNYCHELVSLNLQSCSRITDEGVV
:.:::::.:::::: :::::.:.:::::::::::.: .: :::.::::.: .:::::..
CCDS32 QVTKDGIQALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQITDEGLI
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 QICRGCHRLQALCLSGCSNLTDASLTALGLNCPRLQILEAARCSHLTDAGFTLLARNCHE
::::::.::.:: :::::.::: :.::: :::::.:::.::::.:::.::: :::::::
CCDS32 TICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCHE
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 LEKMDLEECILITDSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDDGILHLSNSTCGHERLRVLE
:::::::::. ::::::::::::::.::.:::::::::::::: ::.:..:.:..:.:.:
CCDS32 LEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIE
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 LDNCLLITDVALEHLENCRGLERLELYDCQQVTRAGIKRMRAQLPHVKVHAYFAPVTPPT
:::: ::::..::::..:..:::.:::::::.:::::::.:..::..::::::::::::
CCDS32 LDNCPLITDASLEHLKSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPP
370 380 390 400 410 420
410 420
pF1KE3 AVAGSGQRLCRCCVIL
.:.:: ::.::::.::
CCDS32 SVGGSRQRFCRCCIIL
430
>>CCDS54116.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 (404 aa)
initn: 2195 init1: 1487 opt: 1548 Z-score: 1713.3 bits: 326.0 E(32554): 4.1e-89
Smith-Waterman score: 2135; 72.5% identity (87.4% similar) in 422 aa overlap (2-423:15-404)
10 20 30 40
pF1KE3 MVFSNNDEGLINKKLPKELLLRIFSFLDIVTLCRCAQISKAWNILAL
.:::.::..::::::::::::::::::.::::::::.:.:::.:::
CCDS54 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLAL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 DGSNWQRIDLFNFQTDVEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCIGVGDSSLKTFAQNCRNIE
:::::::::::.:: :.::::::::::::::::::::::::.::::..:.::::::::::
CCDS54 DGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 HLNLNGCTKITDSTCYSLSRFCSKLKHLDLTSCVSITNSSLKGISEGCRNLEYLNLSWCD
:::::::: ::. ::: :: ::.::::
CCDS54 VLNLNGCTKTTDA--------------------------------EGCPLLEQLNISWCD
130 140
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 QITKDGIEALVRGCRGLKALLLRGCTQLEDEALKHIQNYCHELVSLNLQSCSRITDEGVV
:.:::::.:::::: :::::.:.:::::::::::.: .: :::.::::.: .:::::..
CCDS54 QVTKDGIQALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQITDEGLI
150 160 170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 QICRGCHRLQALCLSGCSNLTDASLTALGLNCPRLQILEAARCSHLTDAGFTLLARNCHE
::::::.::.:: :::::.::: :.::: :::::.:::.::::.:::.::: :::::::
CCDS54 TICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCHE
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 LEKMDLEECILITDSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDDGILHLSNSTCGHERLRVLE
:::::::::. ::::::::::::::.::.:::::::::::::: ::.:..:.:..:.:.:
CCDS54 LEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIE
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 LDNCLLITDVALEHLENCRGLERLELYDCQQVTRAGIKRMRAQLPHVKVHAYFAPVTPPT
:::: ::::..::::..:..:::.:::::::.:::::::.:..::..::::::::::::
CCDS54 LDNCPLITDASLEHLKSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPP
330 340 350 360 370 380
410 420
pF1KE3 AVAGSGQRLCRCCVIL
.:.:: ::.::::.::
CCDS54 SVGGSRQRFCRCCIIL
390 400
>>CCDS54560.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 (355 aa)
initn: 1531 init1: 1531 opt: 1537 Z-score: 1702.1 bits: 323.7 E(32554): 1.7e-88
Smith-Waterman score: 2273; 83.9% identity (83.9% similar) in 423 aa overlap (1-423:1-355)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MVFSNNDEGLINKKLPKELLLRIFSFLDIVTLCRCAQISKAWNILALDGSNWQRIDLFNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MVFSNNDEGLINKKLPKELLLRIFSFLDIVTLCRCAQISKAWNILALDGSNWQRIDLFNF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QTDVEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCIGVGDSSLKTFAQNCRNIEHLNLNGCTKITDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QTDVEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCIGVGDSSLKTFAQNCRNIEHLNLNGCTKITDS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TCYSLSRFCSKLKHLDLTSCVSITNSSLKGISEGCRNLEYLNLSWCDQITKDGIEALVRG
::::::::::::::
CCDS54 TCYSLSRFCSKLKH----------------------------------------------
130
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 CRGLKALLLRGCTQLEDEALKHIQNYCHELVSLNLQSCSRITDEGVVQICRGCHRLQALC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ----------------------IQNYCHELVSLNLQSCSRITDEGVVQICRGCHRLQALC
140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LSGCSNLTDASLTALGLNCPRLQILEAARCSHLTDAGFTLLARNCHELEKMDLEECILIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSGCSNLTDASLTALGLNCPRLQILEAARCSHLTDAGFTLLARNCHELEKMDLEECILIT
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 DSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDDGILHLSNSTCGHERLRVLELDNCLLITDVALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDDGILHLSNSTCGHERLRVLELDNCLLITDVALE
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 HLENCRGLERLELYDCQQVTRAGIKRMRAQLPHVKVHAYFAPVTPPTAVAGSGQRLCRCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HLENCRGLERLELYDCQQVTRAGIKRMRAQLPHVKVHAYFAPVTPPTAVAGSGQRLCRCC
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 VIL
:::
CCDS54 VIL
>>CCDS64129.1 FBXL7 gene_id:23194|Hs108|chr5 (444 aa)
initn: 1129 init1: 335 opt: 527 Z-score: 586.6 bits: 117.6 E(32554): 2.4e-26
Smith-Waterman score: 644; 30.1% identity (65.0% similar) in 369 aa overlap (14-366:69-432)
10 20 30 40
pF1KE3 MVFSNNDEGLINKKLPKELLLRIFSFLDIVTLCRCAQISKAWN
.:: . ...::::: :::::.. . :
CCDS64 AMVHSPPPTRLTHPLIRLASRPQKEQASIDRLPDHSMVQIFSFLPTNQLCRCARVCRRWY
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90
pF1KE3 ILALDGSNWQRIDLFNFQTDVEGRVVENISKR-CGG------FLRKLSLRGCIGVGDSSL
:: : :. : : . .:. :... ...: : .:. ... :: . : .:
CCDS64 NLAWDPRLWRTIRLTGETINVD-RALKVLTRRLCQDTPNVCLMLETVTVSGCRRLTDRGL
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 KTFAQNCRNIEHLNLNGCTKITDSTCYSLSRFCSKLKHLDLTSCVSITNSSL-KGIS---
:.:: : ....:...:: .:.. . ... .: .:.:::...: ..: :: . :
CCDS64 YTIAQCCPELRRLEVSGCYNISNEAVFDVVSLCPNLEHLDVSGCSKVTCISLTREASIKL
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200
pF1KE3 ---EGCR-NLEYLNLSWCDQITKDGIEALVRGCRGLKALLLRGCTQLEDEALKHIQNYCH
.: . ...::... : . .:..... : : : :: :..: ::.:... ::
CCDS64 SPLHGKQISIRYLDMTDCFVLEDEGLHTIAAHCTQLTHLYLRRCVRLTDEGLRYLVIYCA
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 ELVSLNLQSCSRITDEGVVQICRGCHRLQALCLSGCSNLTDASLTALGLNCPRLQILEAA
. :....: ..: :. .: . ::. : .. :. .::... .. : .:. :.:
CCDS64 SIKELSVSDCRFVSDFGLREIAKLESRLRYLSIAHCGRVTDVGIRYVAKYCSKLRYLNAR
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 RCSHLTDAGFTLLARNCHELEKMDLEECILITDSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDD
: .:: : ::.:: .:...:. .: :..:. : :...: .:. :::. :: :: .
CCDS64 GCEGITDHGVEYLAKNCTKLKSLDIGKCPLVSDTGLECLALNCFNLKRLSLKSCESITGQ
340 350 360 370 380 390
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 GILHLSNSTCGHERLRVLELDNCLLITDVALEHLE-NCRGLERLELYDCQQVTRAGIKRM
: :.. ..: :..:....: . .. ::. .. .:.
CCDS64 G-LQIVAANCFD--LQTLNVQDCEVSVE-ALRFVKRHCKRCVIEHTNPAFF
400 410 420 430 440
390 400 410 420
pF1KE3 RAQLPHVKVHAYFAPVTPPTAVAGSGQRLCRCCVIL
>>CCDS54833.1 FBXL7 gene_id:23194|Hs108|chr5 (491 aa)
initn: 1129 init1: 335 opt: 527 Z-score: 586.0 bits: 117.7 E(32554): 2.6e-26
Smith-Waterman score: 644; 30.1% identity (65.0% similar) in 369 aa overlap (14-366:116-479)
10 20 30 40
pF1KE3 MVFSNNDEGLINKKLPKELLLRIFSFLDIVTLCRCAQISKAWN
.:: . ...::::: :::::.. . :
CCDS54 AMVHSPPPTRLTHPLIRLASRPQKEQASIDRLPDHSMVQIFSFLPTNQLCRCARVCRRWY
90 100 110 120 130 140
50 60 70 80 90
pF1KE3 ILALDGSNWQRIDLFNFQTDVEGRVVENISKR-CGG------FLRKLSLRGCIGVGDSSL
:: : :. : : . .:. :... ...: : .:. ... :: . : .:
CCDS54 NLAWDPRLWRTIRLTGETINVD-RALKVLTRRLCQDTPNVCLMLETVTVSGCRRLTDRGL
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 KTFAQNCRNIEHLNLNGCTKITDSTCYSLSRFCSKLKHLDLTSCVSITNSSL-KGIS---
:.:: : ....:...:: .:.. . ... .: .:.:::...: ..: :: . :
CCDS54 YTIAQCCPELRRLEVSGCYNISNEAVFDVVSLCPNLEHLDVSGCSKVTCISLTREASIKL
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200
pF1KE3 ---EGCR-NLEYLNLSWCDQITKDGIEALVRGCRGLKALLLRGCTQLEDEALKHIQNYCH
.: . ...::... : . .:..... : : : :: :..: ::.:... ::
CCDS54 SPLHGKQISIRYLDMTDCFVLEDEGLHTIAAHCTQLTHLYLRRCVRLTDEGLRYLVIYCA
270 280 290 300 310 320
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 ELVSLNLQSCSRITDEGVVQICRGCHRLQALCLSGCSNLTDASLTALGLNCPRLQILEAA
. :....: ..: :. .: . ::. : .. :. .::... .. : .:. :.:
CCDS54 SIKELSVSDCRFVSDFGLREIAKLESRLRYLSIAHCGRVTDVGIRYVAKYCSKLRYLNAR
330 340 350 360 370 380
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 RCSHLTDAGFTLLARNCHELEKMDLEECILITDSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDD
: .:: : ::.:: .:...:. .: :..:. : :...: .:. :::. :: :: .
CCDS54 GCEGITDHGVEYLAKNCTKLKSLDIGKCPLVSDTGLECLALNCFNLKRLSLKSCESITGQ
390 400 410 420 430 440
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 GILHLSNSTCGHERLRVLELDNCLLITDVALEHLE-NCRGLERLELYDCQQVTRAGIKRM
: :.. ..: :..:....: . .. ::. .. .:.
CCDS54 G-LQIVAANCFD--LQTLNVQDCEVSVE-ALRFVKRHCKRCVIEHTNPAFF
450 460 470 480 490
390 400 410 420
pF1KE3 RAQLPHVKVHAYFAPVTPPTAVAGSGQRLCRCCVIL
>>CCDS5726.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 (735 aa)
initn: 502 init1: 260 opt: 468 Z-score: 518.2 bits: 105.7 E(32554): 1.5e-22
Smith-Waterman score: 468; 31.1% identity (67.4% similar) in 267 aa overlap (80-341:428-687)
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 SNWQRIDLFNFQTDVEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCIGVGDSSLKTFAQNCRNIEHL
: .. . : :. ::::.... ... :
CCDS57 SACKLRKIRFEGNKRVTDASFKFIDKNYPNLSHIYMADCKGITDSSLRSLSP-LKQLTVL
400 410 420 430 440 450
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 NLNGCTKITDSTCYSLSRFCS-----KLKHLDLTSCVSITNSSLKGISEGCRNLEYLNLS
:: .:..: : ..:..: . ....:.:..:: ....:. .:: : ::.::.:
CCDS57 NLANCVRIGD---MGLKQFLDGPASMRIRELNLSNCVRLSDASVMKLSERCPNLNYLSLR
460 470 480 490 500 510
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 WCDQITKDGIEALVRGCRGLKALLLRGCTQLEDEALKHIQNYCHELVSLNLQSCSRITDE
:...: .:: .: . .: .. : : :.. .:.: .. . ..: :... : ::::.
CCDS57 NCEHLTAQGIGYIV-NIFSLVSIDLSG-TDISNEGL-NVLSRHKKLKELSVSECYRITDD
520 530 540 550 560 570
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 GVVQICRGCHRLQALCLSGCSNLTDASLTALGLNCPRLQILEAARCSHLTDAGFTLLARN
:. .:.. :. : .: ::.:.: . ::.. : : : : : ..::... .:. .
CCDS57 GIQAFCKSSLILEHLDVSYCSQLSDMIIKALAIYCINLTSLSIAGCPKITDSAMEMLSAK
580 590 600 610 620 630
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 CHELEKMDLEECILITDSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDDGILHLSNSTCGHERLR
:: :. .:. :.:.::. : .:.: : .:. :....: :. . ..:... .:
CCDS57 CHYLHILDISGCVLLTDQILEDLQIGCKQLRILKMQYCTNISKKAAQRMSSKVQQQEYNT
640 650 660 670 680 690
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 VLELDNCLLITDVALEHLENCRGLERLELYDCQQVTRAGIKRMRAQLPHVKVHAYFAPVT
CCDS57 NDPPRWFGYDREGNPVTELDNITSSKGALELTVKKSTYSSEDQAA
700 710 720 730
>--
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Smith-Waterman score: 425; 26.8% identity (65.1% similar) in 272 aa overlap (15-284:158-424)
10 20 30 40
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::.. .:.:: .:.. . :.:...:: .
CCDS57 RAAAEESNFPERSSSEVFLVDETLKCDISLLPERAILQIFFYLSLKDVIICGQVNHAWML
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.. .: :. ::. . .. . . . . .: . .:..:::. . ..... .. ::
CCDS57 MTQLNSLWNAIDFSSVKNVIPDKYIVSTLQRWRLNVLRLNFRGCL-LRPKTFRSVSH-CR
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pF1KE3 NIEHLNLNGCTKITDSTCYSLSRFCSKLKHLDLTSCVSITNSSLKGISEGCRNLEYLNLS
:...::.. : .:: . .:. : . :.: : ..::: ... . . .::. :.:.
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pF1KE3 WCDQITKDGIEALV--RGCRGLKALLLRGCTQLEDEALKHIQNYCHELVSLNLQSCSRIT
.: ..: :.. : ::. : : : ::::. .....: : : .. :.... .:
CCDS57 YCRRFTDKGLQYLNLGNGCHKLIYLDLSGCTQISVQGFRYIANSCTGIMHLTINDMPTLT
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230 240 250 260 270 280
pF1KE3 DEGVVQICRGCHRLQALCLSGCSNLTDASLTALGLNCPRLQILEAARCSHLTDAGFTLLA
:. : . . : :. .: ..: ...: .. ::. : .:. .. ...:::.: ..
CCDS57 DNCVKALVEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALS-AC-KLRKIRFEGNKRVTDASFKFID
370 380 390 400 410 420
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 RNCHELEKMDLEECILITDSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDDGILHLSNSTCGHER
.:
CCDS57 KNYPNLSHIYMADCKGITDSSLRSLSPLKQLTVLNLANCVRIGDMGLKQFLDGPASMRIR
430 440 450 460 470 480
>>CCDS5041.1 FBXL4 gene_id:26235|Hs108|chr6 (621 aa)
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10 20 30 40
pF1KE3 MVFSNNDEGLINKKLPKELLLRIFSFLDIVTLCRCAQISKAWN
::: ::. :.. : . ::: :: : .
CCDS50 AEKDGCGMDSLNKKFSSAVLGEGPNNGYFDKLPYELIQLILNHLTLPDLCRLAQTCKLLS
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: : : : :.: . ::. :.::. . . :
CCDS50 QHCCDP--LQYIHL-NLQP----------------YWAKLD--------DTSLEFLQSRC
320 330 340
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pF1KE3 RNIEHLNLNGCTKITDSTCYSLSRF---C-SKLKHLDLTSCVSITNSS-LKGISEGCRNL
.. :::. . . ..::: : :.: .:.: :: . : . :. ::: : ::
CCDS50 TLVQWLNLSWTGNRGFISVAGFSRFLKVCGSELVRLEL-SCSHFLNETCLEVISEMCPNL
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160 170 180 190 200 210
pF1KE3 EYLNLSWCDQITKDGIEALVRGCRGLKALLLRGCTQLEDEALKHIQNYCHELVSLNLQSC
. :::: ::.. .... ... : .:: :.: :..:. :: : :.: :: :.: ::
CCDS50 QALNLSSCDKLPPQAFNHIAKLC-SLKRLVLYR-TKVEQTALLSILNFCSELQHLSLGSC
410 420 430 440 450 460
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 SRITDEGVVQICRGCHRLQALCLSGCSNLTDASLTALGLNCPRLQILEAARCSHLTDAGF
: : :. ::. .: .: .:. :. ::...:. :.
CCDS50 VMIEDYDVI----------------------ASM--IGAKCKKLRTLDLWRCKNITENGI
470 480 490
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 TLLARNCHELEKMDLEECILITDST--LIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDDGILHLSNS
. :: .: ::..:: : . .:: . .:. . :.:: : :. . . : : .:.
CCDS50 AELASGCPLLEELDLGWCPTLQSSTGCFTRLAHQLPNLQKLFLTANRSVCDTDIDELA--
500 510 520 530 540 550
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pF1KE3 TCGHERLRVLELDNCLLITDVALEHL-ENCRGLERLELYDCQQVTRAGIKRMRAQLPHVK
:. ::. :.. . ... ..:..: :.:. : :.. :.:. .. .. :..:.:
CCDS50 -CNCTRLQQLDILGTRMVSPASLRKLLESCKDLSLLDVSFCSQIDNRAVLELNASFPKVF
560 570 580 590 600 610
400 410 420
pF1KE3 VHAYFAPVTPPTAVAGSGQRLCRCCVIL
.. :
CCDS50 IKKSFTQ
620
>>CCDS75649.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 (707 aa)
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10 20 30 40
pF1KE3 MVFSNNDEGLINKKLPKELLLRIFSFLDIVTLCRCAQISKAWNI
::.. .:.:: .:.. . :.:...:: .
CCDS75 RAAAEESNFPERSSSEVFLVDETLKCDISLLPERAILQIFFYLSLKDVIICGQVNHAWML
130 140 150 160 170 180
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pF1KE3 LALDGSNWQRIDLFNFQTDVEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCIGVGDSSLKTFAQNCR
.. .: :. ::. . .. . . . . .: . .:..:::. . ..... .. ::
CCDS75 MTQLNSLWNAIDFSSVKNVIPDKYIVSTLQRWRLNVLRLNFRGCL-LRPKTFRSVSH-CR
190 200 210 220 230 240
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pF1KE3 NIEHLNLNGCTKITDSTCYSLSRFCSKLKHLDLTSCVSITNSSLKGISEGCRNLEYLNLS
:...::.. : .:: . .:. : . :.:.. ..::: ... . . .::. :.:.
CCDS75 NLQELNVSDCPTFTDESMRHISEGCPGVLCLNLSN-TTITNRTMRLLPRHFHNLQNLSLA
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.: ..: :.. : ::. : : : ::::. .....: : : .. :.... .:
CCDS75 YCRRFTDKGLQYLNLGNGCHKLIYLDLSGCTQISVQGFRYIANSCTGIMHLTINDMPTLT
310 320 330 340 350 360
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:. : . . : :. .: ..: ...: .. ::
CCDS75 DNCVKALVEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSACKLRKIRFEGNKRVTDASFKFIDKN
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pF1KE3 RNCHELEKMDLEECILITDSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDDGILHLSNSTCGHER
CCDS75 YPNLSHIYMADCKGITDSSLRSLSPLKQLTVLNLANCVRIGDMGLKQFLDGPASMRIREL
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>--
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CCDS75 VEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSACKLRKIRFEGNKRVTDASFKFIDKNYPNLSHI
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CCDS75 YMADCKGITDSSLRSLSPL-KQLTVLNLANCVRIGDMGLKQFLDGPASMRIRELNLSNCV
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... .. : . : .:. : ::.: .: ... .: : :::..: : . :..:.
CCDS75 RLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIVNI-FSLVSIDL-SGTDISNEA--
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.:.. :. : .: ::.:.: . ::.. : : : : : ..::... .:. .::
CCDS75 -FCKSSLILEHLDVSYCSQLSDMIIKALAIYCINLTSLSIAGCPKITDSAMEMLSAKCHY
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pF1KE3 LEKMDLEECILITDSTLIQLSIHCPKLQALSLSHCELITDDGILHLSNSTCGHERLRVLE
:. .:. :.:.::. : .:.: : .:. :....: :. . ..:... .:
CCDS75 LHILDISGCVLLTDQILEDLQIGCKQLRILKMQYCTNISKKAAQRMSSKVQQQEYNTNDP
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CCDS75 PRWFGYDREGNPVTELDNITSSKGALELTVKKSTYSSEDQAA
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>>CCDS10421.1 FBXL16 gene_id:146330|Hs108|chr16 (479 aa)
initn: 391 init1: 256 opt: 349 Z-score: 389.8 bits: 81.3 E(32554): 2.2e-15
Smith-Waterman score: 382; 30.6% identity (60.6% similar) in 327 aa overlap (80-396:160-477)
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:. .. :: : .::.: .. : .:
CCDS10 QPKFWAGLTPVLHAKELYNVLPGGEKEFVNLQGFAARGFEGFCLVGVSDLDICEFIDNYA
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.... ..:. : :::. . . . . .:.:..: ..:...: . : . : .
CCDS10 LSKKGVKAMSLKRST-ITDAGLEVMLEQMQGVVRLELSGCNDFTEAGLWS-SLSAR-ITS
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CCDS10 LSVSDCINVADDAIAAISQLLPNLAELSLQA-YHVTDTALAYFTARQGHSTHTLRLLSCW
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.::..:::.. .. : :: :::::..:: .. .. : .:. :. . : ..:: ..
CCDS10 EITNHGVVNVVHSLPNLTALSLSGCSKVTDDGVELVAENLRKLRSLDLSWCPRITDMALE
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CCDS10 YVACDLHRLEELVLDRCVRITDTGLSYLSTMS-SLRSLYLRWCCQVQDFGLKHLL--ALG
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CCDS10 --SLRLLSLAGCPLLTTTGLSGLVQLQELEELELTNCPGATPELFKYFSQHLPRCLVIE
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423 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]