FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3580, 999 aa
1>>>pF1KE3580 999 - 999 aa - 999 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3949+/-0.00102; mu= 18.1399+/- 0.061
mean_var=183.0820+/-38.117, 0's: 0 Z-trim(110.3): 204 B-trim: 23 in 1/51
Lambda= 0.094788
statistics sampled from 11283 (11514) to 11283 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.354), width: 16
Scan time: 4.780
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS53263.1 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 (1056) 6832 948.0 0
CCDS41224.2 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 (1070) 6604 916.9 0
CCDS53261.1 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 (1066) 6558 910.6 0
CCDS53262.1 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 (1005) 4786 668.2 2.3e-191
CCDS53264.1 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 ( 753) 3659 513.9 4.7e-145
CCDS11871.1 MIB1 gene_id:57534|Hs108|chr18 (1006) 1674 242.7 2.9e-63
CCDS54802.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1250) 456 76.2 4.6e-13
CCDS34060.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1429) 456 76.3 5e-13
CCDS46769.1 ANKRD28 gene_id:23243|Hs108|chr3 (1053) 425 71.9 7.8e-12
CCDS43842.1 DAPK1 gene_id:1612|Hs108|chr9 (1430) 425 72.1 9.4e-12
>>CCDS53263.1 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 (1056 aa)
initn: 6832 init1: 6832 opt: 6832 Z-score: 5061.0 bits: 948.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6832; 99.7% identity (99.9% similar) in 999 aa overlap (1-999:58-1056)
10 20 30
pF1KE3 MGWKPSEARGQSQSFQASGLQPRSLKAARR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CPVAQEGLGARSRPRVAPRSLARCGPSSRLMGWKPSEARGQSQSFQASGLQPRSLKAARR
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 ATGRPDRSRAAPPNMDPDPQAGVQVGMRVVRGVDWKWGQQDGGEGGVGTVVELGRHGSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ATGRPDRSRAAPPNMDPDPQAGVQVGMRVVRGVDWKWGQQDGGEGGVGTVVELGRHGSPS
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 TPDRTVVVQWDQGTRTNYRAGYQGAHDLLLYDNAQIGVRHPNIICDCCKKHGLRGMRWKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TPDRTVVVQWDQGTRTNYRAGYQGAHDLLLYDNAQIGVRHPNIICDCCKKHGLRGMRWKC
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 RVCLDYDLCTQCYMHNKHELAHAFDRYETAHSRPVTLSPRQGLPRIPLRGIFQGAKVVRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RVCLDYDLCTQCYMHNKHELAHAFDRYETAHSRPVTLSPRQGLPRIPLRGIFQGAKVVRG
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 PDWEWGSQDGGEGKPGRVVDIRGWDVETGRSVASVTWADGTTNVYRVGYKGKVDLKCVGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS53 PDWEWGSQDGGEGKPGRVVDIRGWDVETGRSVASVTWADGTTNVYRVGHKGKVDLKCVGE
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 AAGGFYYKDHLPRLGKPAELQRRVSADSQPFQHGDKVKCLLDTDVLREMQEGHGGWNPRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AAGGFYYKDHLPRLGKPAELQRRVSADSQPFQHGDKVKCLLDTDVLREMQEGHGGWNPRM
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 AEFIGQTGTVHRITDRGDVRVQFNHETRWTFHPGALTKHHSFWVGDVVRVIGDLDTVKRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AEFIGQTGTVHRITDRGDVRVQFNHETRWTFHPGALTKHHSFWVGDVVRVIGDLDTVKRL
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 QAGHGEWTDDMAPALGRVGKVVKVFGDGNLRVAVAGQRWTFSPSCLVAYRPEEDANLDVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QAGHGEWTDDMAPALGRVGKVVKVFGDGNLRVAVAGQRWTFSPSCLVAYRPEEDANLDVA
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 ERARENKSSLSVALDKLRAQKSDPEHPGRLVVEVALGNAARALGLLRRRPEQVDTKNQGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS53 ERARENKSSLSVALDKLRAQKSDPEHPGRLVVEVALGNAARALDLLRRRPEQVDTKNQGR
510 520 530 540 550 560
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 TALQVAAYLGQVELIRLLLQARAGVDLPDDEGNTALHYAALGNQPEATRVLLSAGCRADA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TALQVAAYLGQVELIRLLLQARAGVDLPDDEGNTALHYAALGNQPEATRVLLSAGCRADA
570 580 590 600 610 620
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 INSTQSTALHVAVQRGFLEVVRALCERGCDVNLPDAHSDTPLHSAISAGTGAGGIVEVLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS53 INSTQSTALHVAVQRGFLEVVRALCERGCDVNLPDAHSDTPLHSAISAGTGASGIVEVLT
630 640 650 660 670 680
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 EVPNIDVTATNSQGFTLLHHASLKGHALAVRKILARARQLVDAKKEDGFTALHLAALNNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EVPNIDVTATNSQGFTLLHHASLKGHALAVRKILARARQLVDAKKEDGFTALHLAALNNH
690 700 710 720 730 740
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 REVAQILIREGRCDVNVRNRKLQSPLHLAVQQAHVGLVPLLVDAGCSVNAEDEEGDTALH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 REVAQILIREGRCDVNVRNRKLQSPLHLAVQQAHVGLVPLLVDAGCSVNAEDEEGDTALH
750 760 770 780 790 800
760 770 780 790 800 810
pF1KE3 VALQRHQLLPLVADGAGGDPGPLQLLSRLQASGLPGSAELTVGAAVACFLALEGADVSYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VALQRHQLLPLVADGAGGDPGPLQLLSRLQASGLPGSAELTVGAAVACFLALEGADVSYT
810 820 830 840 850 860
820 830 840 850 860 870
pF1KE3 NHRGRSPLDLAAEGRVLKALQGCAQRFRERQAGGGAAPGPRQTLGTPNTVTNLHVGAAPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NHRGRSPLDLAAEGRVLKALQGCAQRFRERQAGGGAAPGPRQTLGTPNTVTNLHVGAAPG
870 880 890 900 910 920
880 890 900 910 920 930
pF1KE3 PEAAECLVCSELALLVLFSPCQHRTVCEECARRMKKCIRCQVVVSKKLRPDGSEVASAAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PEAAECLVCSELALLVLFSPCQHRTVCEECARRMKKCIRCQVVVSKKLRPDGSEVASAAP
930 940 950 960 970 980
940 950 960 970 980 990
pF1KE3 APGPPRQLVEELQSRYRQMEERITCPICIDSHIRLVFQCGHGACAPCGSALSACPICRQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 APGPPRQLVEELQSRYRQMEERITCPICIDSHIRLVFQCGHGACAPCGSALSACPICRQP
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE3 IRDRIQIFV
:::::::::
CCDS53 IRDRIQIFV
1050
>>CCDS41224.2 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 (1070 aa)
initn: 6586 init1: 6586 opt: 6604 Z-score: 4892.5 bits: 916.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6794; 98.3% identity (98.5% similar) in 1013 aa overlap (1-999:58-1070)
10 20 30
pF1KE3 MGWKPSEARGQSQSFQASGLQPRSLKAARR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CPVAQEGLGARSRPRVAPRSLARCGPSSRLMGWKPSEARGQSQSFQASGLQPRSLKAARR
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70
pF1KE3 ATGRPDRSRAA--------------PPNMDPDPQAGVQVGMRVVRGVDWKWGQQDGGEGG
::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ATGRPDRSRAARPTMDPSAHRSRAAPPNMDPDPQAGVQVGMRVVRGVDWKWGQQDGGEGG
90 100 110 120 130 140
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 VGTVVELGRHGSPSTPDRTVVVQWDQGTRTNYRAGYQGAHDLLLYDNAQIGVRHPNIICD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VGTVVELGRHGSPSTPDRTVVVQWDQGTRTNYRAGYQGAHDLLLYDNAQIGVRHPNIICD
150 160 170 180 190 200
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 CCKKHGLRGMRWKCRVCLDYDLCTQCYMHNKHELAHAFDRYETAHSRPVTLSPRQGLPRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CCKKHGLRGMRWKCRVCLDYDLCTQCYMHNKHELAHAFDRYETAHSRPVTLSPRQGLPRI
210 220 230 240 250 260
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 PLRGIFQGAKVVRGPDWEWGSQDGGEGKPGRVVDIRGWDVETGRSVASVTWADGTTNVYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PLRGIFQGAKVVRGPDWEWGSQDGGEGKPGRVVDIRGWDVETGRSVASVTWADGTTNVYR
270 280 290 300 310 320
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 VGYKGKVDLKCVGEAAGGFYYKDHLPRLGKPAELQRRVSADSQPFQHGDKVKCLLDTDVL
::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VGHKGKVDLKCVGEAAGGFYYKDHLPRLGKPAELQRRVSADSQPFQHGDKVKCLLDTDVL
330 340 350 360 370 380
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 REMQEGHGGWNPRMAEFIGQTGTVHRITDRGDVRVQFNHETRWTFHPGALTKHHSFWVGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 REMQEGHGGWNPRMAEFIGQTGTVHRITDRGDVRVQFNHETRWTFHPGALTKHHSFWVGD
390 400 410 420 430 440
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 VVRVIGDLDTVKRLQAGHGEWTDDMAPALGRVGKVVKVFGDGNLRVAVAGQRWTFSPSCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VVRVIGDLDTVKRLQAGHGEWTDDMAPALGRVGKVVKVFGDGNLRVAVAGQRWTFSPSCL
450 460 470 480 490 500
440 450 460 470 480 490
pF1KE3 VAYRPEEDANLDVAERARENKSSLSVALDKLRAQKSDPEHPGRLVVEVALGNAARALGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS41 VAYRPEEDANLDVAERARENKSSLSVALDKLRAQKSDPEHPGRLVVEVALGNAARALDLL
510 520 530 540 550 560
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 RRRPEQVDTKNQGRTALQVAAYLGQVELIRLLLQARAGVDLPDDEGNTALHYAALGNQPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RRRPEQVDTKNQGRTALQVAAYLGQVELIRLLLQARAGVDLPDDEGNTALHYAALGNQPE
570 580 590 600 610 620
560 570 580 590 600 610
pF1KE3 ATRVLLSAGCRADAINSTQSTALHVAVQRGFLEVVRALCERGCDVNLPDAHSDTPLHSAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ATRVLLSAGCRADAINSTQSTALHVAVQRGFLEVVRALCERGCDVNLPDAHSDTPLHSAI
630 640 650 660 670 680
620 630 640 650 660 670
pF1KE3 SAGTGAGGIVEVLTEVPNIDVTATNSQGFTLLHHASLKGHALAVRKILARARQLVDAKKE
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SAGTGASGIVEVLTEVPNIDVTATNSQGFTLLHHASLKGHALAVRKILARARQLVDAKKE
690 700 710 720 730 740
680 690 700 710 720 730
pF1KE3 DGFTALHLAALNNHREVAQILIREGRCDVNVRNRKLQSPLHLAVQQAHVGLVPLLVDAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DGFTALHLAALNNHREVAQILIREGRCDVNVRNRKLQSPLHLAVQQAHVGLVPLLVDAGC
750 760 770 780 790 800
740 750 760 770 780 790
pF1KE3 SVNAEDEEGDTALHVALQRHQLLPLVADGAGGDPGPLQLLSRLQASGLPGSAELTVGAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SVNAEDEEGDTALHVALQRHQLLPLVADGAGGDPGPLQLLSRLQASGLPGSAELTVGAAV
810 820 830 840 850 860
800 810 820 830 840 850
pF1KE3 ACFLALEGADVSYTNHRGRSPLDLAAEGRVLKALQGCAQRFRERQAGGGAAPGPRQTLGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ACFLALEGADVSYTNHRGRSPLDLAAEGRVLKALQGCAQRFRERQAGGGAAPGPRQTLGT
870 880 890 900 910 920
860 870 880 890 900 910
pF1KE3 PNTVTNLHVGAAPGPEAAECLVCSELALLVLFSPCQHRTVCEECARRMKKCIRCQVVVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PNTVTNLHVGAAPGPEAAECLVCSELALLVLFSPCQHRTVCEECARRMKKCIRCQVVVSK
930 940 950 960 970 980
920 930 940 950 960 970
pF1KE3 KLRPDGSEVASAAPAPGPPRQLVEELQSRYRQMEERITCPICIDSHIRLVFQCGHGACAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KLRPDGSEVASAAPAPGPPRQLVEELQSRYRQMEERITCPICIDSHIRLVFQCGHGACAP
990 1000 1010 1020 1030 1040
980 990
pF1KE3 CGSALSACPICRQPIRDRIQIFV
:::::::::::::::::::::::
CCDS41 CGSALSACPICRQPIRDRIQIFV
1050 1060 1070
>>CCDS53261.1 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 (1066 aa)
initn: 4839 init1: 4420 opt: 6558 Z-score: 4858.5 bits: 910.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6748; 97.9% identity (98.1% similar) in 1013 aa overlap (1-999:58-1066)
10 20 30
pF1KE3 MGWKPSEARGQSQSFQASGLQPRSLKAARR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CPVAQEGLGARSRPRVAPRSLARCGPSSRLMGWKPSEARGQSQSFQASGLQPRSLKAARR
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70
pF1KE3 ATGRPDRSRAA--------------PPNMDPDPQAGVQVGMRVVRGVDWKWGQQDGGEGG
::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ATGRPDRSRAARPTMDPSAHRSRAAPPNMDPDPQAGVQVGMRVVRGVDWKWGQQDGGEGG
90 100 110 120 130 140
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 VGTVVELGRHGSPSTPDRTVVVQWDQGTRTNYRAGYQGAHDLLLYDNAQIGVRHPNIICD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VGTVVELGRHGSPSTPDRTVVVQWDQGTRTNYRAGYQGAHDLLLYDNAQIGVRHPNIICD
150 160 170 180 190 200
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 CCKKHGLRGMRWKCRVCLDYDLCTQCYMHNKHELAHAFDRYETAHSRPVTLSPRQGLPRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CCKKHGLRGMRWKCRVCLDYDLCTQCYMHNKHELAHAFDRYETAHSRPVTLSPRQGLPRI
210 220 230 240 250 260
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 PLRGIFQGAKVVRGPDWEWGSQDGGEGKPGRVVDIRGWDVETGRSVASVTWADGTTNVYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PLRGIFQGAKVVRGPDWEWGSQDGGEGKPGRVVDIRGWDVETGRSVASVTWADGTTNVYR
270 280 290 300 310 320
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 VGYKGKVDLKCVGEAAGGFYYKDHLPRLGKPAELQRRVSADSQPFQHGDKVKCLLDTDVL
::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VGHKGKVDLKCVGEAAGGFYYKDHLPRLGKPAELQRRVSADSQPFQHGDKVKCLLDTDVL
330 340 350 360 370 380
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 REMQEGHGGWNPRMAEFIGQTGTVHRITDRGDVRVQFNHETRWTFHPGALTKHHSFWVGD
:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 REMQEGHGGWNPRMAE----TGTVHRITDRGDVRVQFNHETRWTFHPGALTKHHSFWVGD
390 400 410 420 430 440
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 VVRVIGDLDTVKRLQAGHGEWTDDMAPALGRVGKVVKVFGDGNLRVAVAGQRWTFSPSCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VVRVIGDLDTVKRLQAGHGEWTDDMAPALGRVGKVVKVFGDGNLRVAVAGQRWTFSPSCL
450 460 470 480 490 500
440 450 460 470 480 490
pF1KE3 VAYRPEEDANLDVAERARENKSSLSVALDKLRAQKSDPEHPGRLVVEVALGNAARALGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS53 VAYRPEEDANLDVAERARENKSSLSVALDKLRAQKSDPEHPGRLVVEVALGNAARALDLL
510 520 530 540 550 560
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 RRRPEQVDTKNQGRTALQVAAYLGQVELIRLLLQARAGVDLPDDEGNTALHYAALGNQPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RRRPEQVDTKNQGRTALQVAAYLGQVELIRLLLQARAGVDLPDDEGNTALHYAALGNQPE
570 580 590 600 610 620
560 570 580 590 600 610
pF1KE3 ATRVLLSAGCRADAINSTQSTALHVAVQRGFLEVVRALCERGCDVNLPDAHSDTPLHSAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ATRVLLSAGCRADAINSTQSTALHVAVQRGFLEVVRALCERGCDVNLPDAHSDTPLHSAI
630 640 650 660 670 680
620 630 640 650 660 670
pF1KE3 SAGTGAGGIVEVLTEVPNIDVTATNSQGFTLLHHASLKGHALAVRKILARARQLVDAKKE
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SAGTGASGIVEVLTEVPNIDVTATNSQGFTLLHHASLKGHALAVRKILARARQLVDAKKE
690 700 710 720 730 740
680 690 700 710 720 730
pF1KE3 DGFTALHLAALNNHREVAQILIREGRCDVNVRNRKLQSPLHLAVQQAHVGLVPLLVDAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DGFTALHLAALNNHREVAQILIREGRCDVNVRNRKLQSPLHLAVQQAHVGLVPLLVDAGC
750 760 770 780 790 800
740 750 760 770 780 790
pF1KE3 SVNAEDEEGDTALHVALQRHQLLPLVADGAGGDPGPLQLLSRLQASGLPGSAELTVGAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SVNAEDEEGDTALHVALQRHQLLPLVADGAGGDPGPLQLLSRLQASGLPGSAELTVGAAV
810 820 830 840 850 860
800 810 820 830 840 850
pF1KE3 ACFLALEGADVSYTNHRGRSPLDLAAEGRVLKALQGCAQRFRERQAGGGAAPGPRQTLGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ACFLALEGADVSYTNHRGRSPLDLAAEGRVLKALQGCAQRFRERQAGGGAAPGPRQTLGT
870 880 890 900 910 920
860 870 880 890 900 910
pF1KE3 PNTVTNLHVGAAPGPEAAECLVCSELALLVLFSPCQHRTVCEECARRMKKCIRCQVVVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PNTVTNLHVGAAPGPEAAECLVCSELALLVLFSPCQHRTVCEECARRMKKCIRCQVVVSK
930 940 950 960 970 980
920 930 940 950 960 970
pF1KE3 KLRPDGSEVASAAPAPGPPRQLVEELQSRYRQMEERITCPICIDSHIRLVFQCGHGACAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KLRPDGSEVASAAPAPGPPRQLVEELQSRYRQMEERITCPICIDSHIRLVFQCGHGACAP
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980 990
pF1KE3 CGSALSACPICRQPIRDRIQIFV
:::::::::::::::::::::::
CCDS53 CGSALSACPICRQPIRDRIQIFV
1050 1060
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10 20 30
pF1KE3 MGWKPSEARGQSQSFQASGLQPRSLKAARR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CPVAQEGLGARSRPRVAPRSLARCGPSSRLMGWKPSEARGQSQSFQASGLQPRSLKAARR
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40 50 60 70
pF1KE3 ATGRPDRSRAA--------------PPNMDPDPQAGVQVGMRVVRGVDWKWGQQDGGEGG
::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ATGRPDRSRAARPTMDPSAHRSRAAPPNMDPDPQAGVQVGMRVVRGVDWKWGQQDGGEGG
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80 90 100 110 120 130
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VGTVVELGRHGSPSTPDRTVVVQWDQGTRTNYRAGYQGAHDLLLYDNAQIGVRHPNIICD
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140 150 160 170 180 190
pF1KE3 CCKKHGLRGMRWKCRVCLDYDLCTQCYMHNKHELAHAFDRYETAHSRPVTLSPRQGLPRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CCKKHGLRGMRWKCRVCLDYDLCTQCYMHNKHELAHAFDRYETAHSRPVTLSPRQGLPRI
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200 210 220 230 240 250
pF1KE3 PLRGIFQGAKVVRGPDWEWGSQDGGEGKPGRVVDIRGWDVETGRSVASVTWADGTTNVYR
::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PLRGIFQGAKVVRGPDWEWGSQDG------------------------------------
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260 270 280 290 300 310
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:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 -----------------------------KPAELQRRVSADSQPFQHGDKVKCLLDTDVL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 REMQEGHGGWNPRMAEFIGQTGTVHRITDRGDVRVQFNHETRWTFHPGALTKHHSFWVGD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VVRVIGDLDTVKRLQAGHGEWTDDMAPALGRVGKVVKVFGDGNLRVAVAGQRWTFSPSCL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS53 VAYRPEEDANLDVAERARENKSSLSVALDKLRAQKSDPEHPGRLVVEVALGNAARALDLL
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500 510 520 530 540 550
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RRRPEQVDTKNQGRTALQVAAYLGQVELIRLLLQARAGVDLPDDEGNTALHYAALGNQPE
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560 570 580 590 600 610
pF1KE3 ATRVLLSAGCRADAINSTQSTALHVAVQRGFLEVVRALCERGCDVNLPDAHSDTPLHSAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ATRVLLSAGCRADAINSTQSTALHVAVQRGFLEVVRALCERGCDVNLPDAHSDTPLHSAI
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pF1KE3 SAGTGAGGIVEVLTEVPNIDVTATNSQGFTLLHHASLKGHALAVRKILARARQLVDAKKE
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SAGTGASGIVEVLTEVPNIDVTATNSQGFTLLHHASLKGHALAVRKILARARQLVDAKKE
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680 690 700 710 720 730
pF1KE3 DGFTALHLAALNNHREVAQILIREGRCDVNVRNRKLQSPLHLAVQQAHVGLVPLLVDAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DGFTALHLAALNNHREVAQILIREGRCDVNVRNRKLQSPLHLAVQQAHVGLVPLLVDAGC
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740 750 760 770 780 790
pF1KE3 SVNAEDEEGDTALHVALQRHQLLPLVADGAGGDPGPLQLLSRLQASGLPGSAELTVGAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SVNAEDEEGDTALHVALQRHQLLPLVADGAGGDPGPLQLLSRLQASGLPGSAELTVGAAV
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800 810 820 830 840 850
pF1KE3 ACFLALEGADVSYTNHRGRSPLDLAAEGRVLKALQGCAQRFRERQAGGGAAPGPRQTLGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ACFLALEGADVSYTNHRGRSPLDLAAEGRVLKALQGCAQRFRERQAGGGAAPGPRQTLGT
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860 870 880 890 900 910
pF1KE3 PNTVTNLHVGAAPGPEAAECLVCSELALLVLFSPCQHRTVCEECARRMKKCIRCQVVVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PNTVTNLHVGAAPGPEAAECLVCSELALLVLFSPCQHRTVCEECARRMKKCIRCQVVVSK
870 880 890 900 910 920
920 930 940 950 960 970
pF1KE3 KLRPDGSEVASAAPAPGPPRQLVEELQSRYRQMEERITCPICIDSHIRLVFQCGHGACAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KLRPDGSEVASAAPAPGPPRQLVEELQSRYRQMEERITCPICIDSHIRLVFQCGHGACAP
930 940 950 960 970 980
980 990
pF1KE3 CGSALSACPICRQPIRDRIQIFV
:::::::::::::::::::::::
CCDS53 CGSALSACPICRQPIRDRIQIFV
990 1000
>>CCDS53264.1 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 (753 aa)
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::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MDPDPQAGVQVGMRVVRGVDWKWGQQDGGE
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pF1KE3 GGVGTVVELGRHGSPSTPDRTVVVQWDQGTRTNYRAGYQGAHDLLLYDNAQIGVRHPNII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GGVGTVVELGRHGSPSTPDRTVVVQWDQGTRTNYRAGYQGAHDLLLYDNAQIGVRHPNII
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pF1KE3 CDCCKKHGLRGMRWKCRVCLDYDLCTQCYMHNKHELAHAFDRYETAHSRPVTLSPRQGLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CDCCKKHGLRGMRWKCRVCLDYDLCTQCYMHNKHELAHAFDRYETAHSRPVTLSPRQGLP
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pF1KE3 RIPLRGIFQGAKVVRGPDWEWGSQDGGEGKPGRVVDIRGWDVETGRSVASVTWADGTTNV
::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RIPLRGIFQGAKVVRGPDWEWGSQDG----------------------------------
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260 270 280 290 300 310
pF1KE3 YRVGYKGKVDLKCVGEAAGGFYYKDHLPRLGKPAELQRRVSADSQPFQHGDKVKCLLDTD
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 -------------------------------KPAELQRRVSADSQPFQHGDKVKCLLDTD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VLREMQEGHGGWNPRMAEFIGQTGTVHRITDRGDVRVQFNHETRWTFHPGALTKHHSFWV
210 220 230 240 250 260
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pF1KE3 GDVVRVIGDLDTVKRLQAGHGEWTDDMAPALGRVGKVVKVFGDGNLRVAVAGQRWTFSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GDVVRVIGDLDTVKRLQAGHGEWTDDMAPALGRVGKVVKVFGDGNLRVAVAGQRWTFSPS
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pF1KE3 CLVAYRPEEDANLDVAERARENKSSLSVALDKLRAQKSDPEHPGRLVVEVALGNAARALG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CLVAYRPEEDANLDVAERARENKSSLSVALDKLRAQKSDPEHPGRLVVEVALGNAARALD
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pF1KE3 LLRRRPEQVDTKNQGRTALQVAAYLGQVELIRLLLQARAGVDLPDDEGNTALHYAALGNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LLRRRPEQVDTKNQGRTALQVAAYLGQVELIRLLLQARAGVDLPDDEGNTALHYAALGNQ
390 400 410 420 430 440
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pF1KE3 PEATRVLLSAGCRADAINSTQSTALHVAVQRGFLEVVRALCERGCDVNLPDAHSDTPLHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PEATRVLLSAGCRADAINSTQSTALHVAVQRGFLEVVRALCERGCDVNLPDAHSDTPLHS
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pF1KE3 AISAGTGAGGIVEVLTEVPNIDVTATNSQGFTLLHHASLKGHALAVRKILARARQLVDAK
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AISAGTGASGIVEVLTEVPNIDVTATNSQGFTLLHHASLKGHALAVRKILARARQLVDAK
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pF1KE3 KEDGFTALHLAALNNHREVAQILIREGRCDVNVRNRKLQSPLHLAVQQAHVGLVPLLVDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KEDGFTALHLAALNNHREVAQILIREGRCDVNVRNRKLQSPLHLAVQQAHVGLVPLLVDA
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740 750 760 770 780 790
pF1KE3 GCSVNAEDEEGDTALHVALQRHQLLPLVADGAGGDPGPLQLLSRLQASGLPGSAELTVGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GCSVNAEDEEGDTALHVALQRHQLLPLVADGAGGDPGPLQLLSRLQASGLPGSAELTVGA
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pF1KE3 AVACFLALEGADVSYTNHRGRSPLDLAAEGRVLKALQGCAQRFRERQAGGGA--APGPRQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: : . .:: ::
CCDS53 AVACFLALEGADVSYTNHRGRSPLDLAAEGRVLKALQGCAQRFRVRAQDEEVHQVPGGRQ
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860 870 880 890 900 910
pF1KE3 TLGTPNTVTNLHVGAAPGPEAAECLVCSELALLVLFSPCQHRTVCEECARRMKKCIRCQV
.:
CCDS53 QETAPRRL
750
>>CCDS11871.1 MIB1 gene_id:57534|Hs108|chr18 (1006 aa)
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pF1KE3 LKAARRATGRPDRSRAAPPNMDPDPQAGVQVGMRVVRGVDWKWGQQDGGEGGVGTVVELG
:: ::::: :::::.:::::: ::::
CCDS11 MSNSRNNRVMVEGVGARVVRGPDWKWGKQDGGEGHVGTVR---
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 RHGSPSTPDRTVVVQWDQGTRTNYRAGYQGAHDLLLYDNAQIGVRHPNIICDCCKKHGLR
: .:...::: ::.:: .::: . ::.:: . :.: :..: . .:: :... .
CCDS11 ---SFESPEEVVVV-WDNGTAANYRCS--GAYDLRILDSAPTGIKHDGTMCDTCRQQPII
50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 GMRWKCRVCLDYDLCTQCYMHNKHELAHAFDRYETAHSRPVTLSPRQGLPRIPLRGIFQG
:.:::: : .::::: :: .::.: : : : : :. : : :. .: :::: :
CCDS11 GIRWKCAECTNYDLCTVCYHGDKHHLRHRFYRITTPGSERVLLESRRKSKKITARGIFAG
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 AKVVRGPDWEWGSQDGGEGKPGRVVDIRGWDVETGRSVASVTWADGTTNVYRVGYKGKVD
:.:::: ::.: .::::.:. :.:..:. :.. . .:.: : : .:. :.::::..: :
CCDS11 ARVVRGVDWQWEDQDGGNGRRGKVTEIQDWSASSPHSAAYVLWDNGAKNLYRVGFEGMSD
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 LKCVGEAAGGFYYKDHLPRLGKPAELQRRVSADSQP--FQHGDKVKCLLDTDVLREMQEG
:::: .: :: .:.:: : ::. ... .: .: :: :. :: .... .:.:
CCDS11 LKCVQDAKGGSFYRDHCPVLGEQ-------NGNRNPGGLQIGDLVNIDLDLEIVQSLQHG
220 230 240 250 260
330 340 350 360 370
pF1KE3 HGGWNPRMAEFIGQTGTVHRITDRGDVRVQFNHETRWTFHPGALTKHH------------
::::. : : . :::: : . :. ::. .::::.:..::: .
CCDS11 HGGWTDGMFETLTTTGTVCGIDEDHDIVVQYPSGNRWTFNPAVLTKANIVRSGDAAQGAE
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420
pF1KE3 ----SFWVGDVVRVIGDLDTVKRLQAGHGEWTDDMAPALGRVGKVVKVFGDGNLRVAVAG
.: :::.:.: ::. .: :: :::::.. : :.::.::.: ....:..:.: : :
CCDS11 GGTSQFQVGDLVQVCYDLERIKLLQRGHGEWAEAMLPTLGKVGRVQQIYSDSDLKVEVCG
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 QRWTFSPSCLVAYRPEEDANLDVAERARENKSSLSVALDKLRAQKSDPEHPGRLVVEVAL
::..:. : .:. ... . : :.: : :: . . . .:: .:
CCDS11 TSWTYNPA---AVSKVASAGSAISNASGERLSQL---LKKLFETQESGDLNEELVKAAAN
390 400 410 420 430 440
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pF1KE3 GNAARALGLLRRRPEQVDTKNQGRTALQVAAYLGQVELIRLLLQARAGVDLPDDEGNTAL
:..:.. ::.: .:. . :.::.:.:. :.:....:::. . :. : .:. :.
CCDS11 GDVAKVEDLLKRPDVDVNGQCAGHTAMQAASQNGHVDILKLLLKQNVDVEAEDKDGDRAV
450 460 470 480 490 500
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pF1KE3 HYAALGNQPEATRVLLSAGCRADAINSTQSTALHVAVQRGFLEVVRALCERGCDVNLPDA
:.::.:.. . .:: .. .: :. ..: ::.::..: :.::..: . :: .: :.
CCDS11 HHAAFGDEGAVIEVLHRGSADLNARNKRRQTPLHIAVNKGHLQVVKTLLDFGCHPSLQDS
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 HSDTPLHSAISAGTGAGGIVEVLTEVPNIDVTATNSQGFTLLHHASLKGHALAVRKILAR
..:::::.::: :. :: :. . ::: ::..::. ::::.:.:. :.: .:..
CCDS11 EGDTPLHDAISKKRD--DILAVLLEA-GADVTITNNNGFNALHHAALRGNPSAMRVLLSK
570 580 590 600 610
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pF1KE3 ARQ--LVDAKKEDGFTALHLAALNNHREVAQILIREGRCDVNVRNRKLQSPLHLAVQQAH
. .:: ::.::.::::::::::: :::..:...: .....: . :. :::::.. :
CCDS11 LPRPWIVDEKKDDGYTALHLAALNNHVEVAELLVHQGNANLDIQNVNQQTALHLAVERQH
620 630 640 650 660 670
730 740 750 760 770
pF1KE3 VGLVPLLVDAGCSVNAEDEEGDTALHVALQRHQLLPL--VAD-------GAGGDPGPLQL
. .: ::: :: ... .:..::: :: ::..: : : . : :. .:. :
CCDS11 TQIVRLLVRAGAKLDIQDKDGDTPLHEALRHHTLSQLRQLQDMQDVGKVDAAWEPSKNTL
680 690 700 710 720 730
780 790 800 810 820 830
pF1KE3 LSRLQASGLPGSAELTVGAAVACFLALEGADVSYTNHRGRSPLDLAAEGRVLKALQGCAQ
. : ..: :: .:..::::: .:::.: :..:.::::: . . ::: :
CCDS11 IMGLGTQG----AEKKSAASIACFLAANGADLSIRNKKGQSPLDLCPDPNLCKALAKC--
740 750 760 770 780 790
840 850 860 870
pF1KE3 RFRERQAG--GGAAPG----PRQTLGTPNTVTNLHVGAAPGP------------------
.:. .: :. .:. .:: . .... . ::
CCDS11 -HKEKVSGQVGSRSPSMISNDSETLEECMVCSDMKRDTLFGPCGHIATCSLCSPRVKKCL
800 810 820 830 840 850
880 890 900 910
pF1KE3 ----------EAAECLVCSELALLVLFSPCQHRTVCEECARRMKKCIRCQVVVSKKL---
. ::.:::. :::.:: : .::.:: ::::..:..:: ...
CCDS11 ICKEQVQSRTKIEECVVCSDKKAAVLFQPCGHMCACENCANLMKKCVQCRAVVERRVPFI
860 870 880 890 900 910
920 930 940 950 960
pF1KE3 -------RPDGSEVASAAPAPGPPRQL--------VEELQSRYRQMEERITCPICIDSHI
:... :.. : .. :..::.. ....:. ::.:.:
CCDS11 MCCGGKSSEDATDDISSGNIPVLQKDKDNTNVNADVQKLQQQLQDIKEQTMCPVCLDRLK
920 930 940 950 960 970
970 980 990
pF1KE3 RLVFQCGHGACAPCGSALSACPICRQPIRDRIQIFV
..: ::::
CCDS11 NMIFLCGHGTCQLCGDRMSECPICRKAIERRILLY
980 990 1000
>>CCDS54802.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1250 aa)
initn: 215 init1: 215 opt: 456 Z-score: 348.0 bits: 76.2 E(32554): 4.6e-13
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pF1KE3 FYYKDHLPRLGKPAELQRRVSADSQPFQHGDKVKCLLDTDVLREMQEGHGGWNPRMAEFI
: :. :.. . :....:: .:
CCDS54 RTLLDNGASVNQCDSNGRTLLANAAYSGSLDVVNLLVSRGADLEIEDAHGHTPLTLAARQ
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340 350 360 370 380
pF1KE3 GQTGTVHRITDRGDVRVQFNHETRWTFHPGALTKHHSFWVGDV----VRV-IGDLDTVKR
:.: .:. . : . .. . . :: .: :. :. . :.: .: :.
CCDS54 GHTKVVNCLIGCG-ANINHTDQDGWTALRSAAWGGHTEVVSALLYAGVKVDCADADSRTA
410 420 430 440 450 460
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 LQAGHGEWTDDMAPALGRVGKVVKVFGDGNLRVAVAGQRWTFSPSCLVAYRPEEDANLDV
:.:. .:.. : . : :. .:.. :.:. . . .. .: . .. : .:
CCDS54 LRAAAWGGHEDIVLNLLQHGAEVNK-ADNEGRTALIAAAY-MGHREIVEHLLDHGA--EV
470 480 490 500 510 520
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 AERARENKSSLSVALDKLRAQKSDPEHPGRLVVEVALGNAARALGLLRRRPEQVDTKNQ-
.. .....:::: : : .. :.:. ...:: : .:: ..
CCDS54 NHEDVDGRTALSVAA---------------LCVPASKGHAS-VVSLLIDRGAEVDHCDKD
530 540 550 560
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 GRTALQVAAYLGQVELIRLLLQARAGVDLPDDEGNTALHYAALGNQPEATRVLLSAGCRA
: : : :::: :.:... :::.. : :: :..: : : :: .. .. .:: : .
CCDS54 GMTPLLVAAYEGHVDVVDLLLEGGADVDHTDNNGRTPLLAAASMGHASVVNTLLFWGAAV
570 580 590 600 610 620
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 DAINSTQSTALHVAVQRGFLEVVRALCERGCDVNLPDAHSDTPLHSAISAGTGAGGIVEV
:.:.: :.: .: .: .::::.: .:: : : : . :::: : : : : :.
CCDS54 DSIDSEGRTVLSIASAQGNVEVVRTLLDRGLDENHRDDAGWTPLHMA--AFEGHRLICEA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]