FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3567, 1107 aa
1>>>pF1KE3567 1107 - 1107 aa - 1107 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9016+/-0.00105; mu= 9.2254+/- 0.064
mean_var=110.7282+/-21.867, 0's: 0 Z-trim(105.8): 33 B-trim: 51 in 1/50
Lambda= 0.121884
statistics sampled from 8592 (8617) to 8592 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16
Scan time: 3.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2632.1 KCNH8 gene_id:131096|Hs108|chr3 (1107) 7246 1285.8 0
CCDS11420.1 KCNH4 gene_id:23415|Hs108|chr17 (1017) 3154 566.2 1.3e-160
CCDS9756.1 KCNH5 gene_id:27133|Hs108|chr14 ( 988) 1795 327.2 1.1e-88
CCDS2219.1 KCNH7 gene_id:90134|Hs108|chr2 (1196) 1693 309.3 3.3e-83
CCDS45122.1 KCNH5 gene_id:27133|Hs108|chr14 ( 611) 1623 297.0 8.8e-80
CCDS5910.1 KCNH2 gene_id:3757|Hs108|chr7 (1159) 1627 297.7 1e-79
CCDS5911.1 KCNH2 gene_id:3757|Hs108|chr7 ( 819) 1620 296.5 1.7e-79
CCDS11638.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17 ( 994) 1620 296.5 2e-79
CCDS62290.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17 ( 958) 1605 293.8 1.2e-78
CCDS31015.1 KCNH1 gene_id:3756|Hs108|chr1 ( 962) 1588 290.8 9.7e-78
CCDS8786.1 KCNH3 gene_id:23416|Hs108|chr12 (1083) 1336 246.5 2.4e-64
CCDS2220.1 KCNH7 gene_id:90134|Hs108|chr2 ( 732) 1153 214.3 7.9e-55
CCDS1496.1 KCNH1 gene_id:3756|Hs108|chr1 ( 989) 1043 195.0 7e-49
CCDS11639.1 KCNH6 gene_id:81033|Hs108|chr17 ( 905) 860 162.8 3.1e-39
CCDS3952.1 HCN1 gene_id:348980|Hs108|chr5 ( 890) 573 112.4 4.8e-24
CCDS10248.1 HCN4 gene_id:10021|Hs108|chr15 (1203) 547 107.8 1.5e-22
CCDS12035.1 HCN2 gene_id:610|Hs108|chr19 ( 889) 524 103.7 1.9e-21
CCDS1108.1 HCN3 gene_id:57657|Hs108|chr1 ( 774) 510 101.3 9.1e-21
CCDS43226.1 CNGA1 gene_id:1259|Hs108|chr4 ( 690) 400 81.9 5.4e-15
CCDS47050.1 CNGA1 gene_id:1259|Hs108|chr4 ( 759) 400 81.9 5.9e-15
CCDS31408.1 CNGA4 gene_id:1262|Hs108|chr11 ( 575) 347 72.6 2.9e-12
>>CCDS2632.1 KCNH8 gene_id:131096|Hs108|chr3 (1107 aa)
initn: 7246 init1: 7246 opt: 7246 Z-score: 6885.0 bits: 1285.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7246; 100.0% identity (100.0% similar) in 1107 aa overlap (1-1107:1-1107)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPVMKGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFILANAQVAKGFPIVYCSDGFCELAGFARTEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 MPVMKGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFILANAQVAKGFPIVYCSDGFCELAGFARTEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 MQKSCSCKFLFGVETNEQLMLQIEKSLEEKTEFKGEIMFYKKNGSPFWCLLDIVPIKNEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 MQKSCSCKFLFGVETNEQLMLQIEKSLEEKTEFKGEIMFYKKNGSPFWCLLDIVPIKNEK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 GDVVLFLASFKDITDTKVKITPEDKKEDKVKGRSRAGTHFDSARRRSRAVLYHISGHLQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 GDVVLFLASFKDITDTKVKITPEDKKEDKVKGRSRAGTHFDSARRRSRAVLYHISGHLQR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 REKNKLKINNNVFVDKPAFPEYKVSDAKKSKFILLHFSTFKAGWDWLILLATFYVAVTVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 REKNKLKINNNVFVDKPAFPEYKVSDAKKSKFILLHFSTFKAGWDWLILLATFYVAVTVP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 YNVCFIGNDDLSTTRSTTVSDIAVEILFIIDIILNFRTTYVSKSGQVIFEARSICIHYVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 YNVCFIGNDDLSTTRSTTVSDIAVEILFIIDIILNFRTTYVSKSGQVIFEARSICIHYVT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 TWFIIDLIAALPFDLLYAFNVTVVSLVHLLKTVRLLRLLRLLQKLDRYSQHSTIVLTLLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 TWFIIDLIAALPFDLLYAFNVTVVSLVHLLKTVRLLRLLRLLQKLDRYSQHSTIVLTLLM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SMFALLAHWMACIWYVIGKMEREDNSLLKWEVGWLHELGKRLESPYYGNNTLGGPSIRSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 SMFALLAHWMACIWYVIGKMEREDNSLLKWEVGWLHELGKRLESPYYGNNTLGGPSIRSA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 YIAALYFTLSSLTSVGFGNVSANTDAEKIFSICTMLIGALMHALVFGNVTAIIQRMYSRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 YIAALYFTLSSLTSVGFGNVSANTDAEKIFSICTMLIGALMHALVFGNVTAIIQRMYSRW
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 SLYHTRTKDLKDFIRVHHLPQQLKQRMLEYFQTTWSVNNGIDSNELLKDFPDELRSDITM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 SLYHTRTKDLKDFIRVHHLPQQLKQRMLEYFQTTWSVNNGIDSNELLKDFPDELRSDITM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 HLNKEILQLSLFECASRGCLRSLSLHIKTSFCAPGEYLLRQGDALQAIYFVCSGSMEVLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 HLNKEILQLSLFECASRGCLRSLSLHIKTSFCAPGEYLLRQGDALQAIYFVCSGSMEVLK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 DSMVLAILGKGDLIGANLSIKDQVIKTNADVKALTYCDLQCIILKGLFEVLDLYPEYAHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 DSMVLAILGKGDLIGANLSIKDQVIKTNADVKALTYCDLQCIILKGLFEVLDLYPEYAHK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 FVEDIQHDLTYNLREGHESDVISRLSNKSMVSQSEPKGNGNINKRLPSIVEDEEEEEEGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 FVEDIQHDLTYNLREGHESDVISRLSNKSMVSQSEPKGNGNINKRLPSIVEDEEEEEEGE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 EEEAVSLSPICTRGSSSRNKKVGSNKAYLGLSLKQLASGTVPFHSPIRVSRSNSPKTKQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 EEEAVSLSPICTRGSSSRNKKVGSNKAYLGLSLKQLASGTVPFHSPIRVSRSNSPKTKQE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 IDPPNHNKRKEKNLKLQLSTLNNAGPPDLSPRIVDGIEDGNSSEESQTFDFGSERIRSEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 IDPPNHNKRKEKNLKLQLSTLNNAGPPDLSPRIVDGIEDGNSSEESQTFDFGSERIRSEP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 RISPPLGDPEIGAAVLFIKAEETKQQINKLNSEVTTLTQEVSQLGKDMRNVIQLLENVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 RISPPLGDPEIGAAVLFIKAEETKQQINKLNSEVTTLTQEVSQLGKDMRNVIQLLENVLS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 PQQPSRFCSLHSTSVCPSRESLQTRTSWSAHQPCLHLQTGGAAYTQAQLCSSNITSDIWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 PQQPSRFCSLHSTSVCPSRESLQTRTSWSAHQPCLHLQTGGAAYTQAQLCSSNITSDIWS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 VDPSSVGSSPQRTGAHEQNPADSELYHSPSLDYSPSHYQVVQEGHLQFLRCISPHSDSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 VDPSSVGSSPQRTGAHEQNPADSELYHSPSLDYSPSHYQVVQEGHLQFLRCISPHSDSTL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 TPLQSISATLSSSVCSSSETSLHLVLPSRSEEGSFSQGTVSSFSLENLPGSWNQEGMASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 TPLQSISATLSSSVCSSSETSLHLVLPSRSEEGSFSQGTVSSFSLENLPGSWNQEGMASA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100
pF1KE3 STKPLENLPLEVVTSTAEVKDNKAINV
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 STKPLENLPLEVVTSTAEVKDNKAINV
1090 1100
>>CCDS11420.1 KCNH4 gene_id:23415|Hs108|chr17 (1017 aa)
initn: 2424 init1: 1459 opt: 3154 Z-score: 2996.9 bits: 566.2 E(32554): 1.3e-160
Smith-Waterman score: 3549; 57.8% identity (76.4% similar) in 1015 aa overlap (1-991:1-1004)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPVMKGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFILANAQVAKGFPIVYCSDGFCELAGFARTEV
:::::::::::::::::::::::::::::.::::: ..::::::::::::::.:..::::
CCDS11 MPVMKGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFLLANAQGTRGFPIVYCSDGFCELTGYGRTEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 MQKSCSCKFLFGVETNEQLMLQIEKSLEEKTEFKGEIMFYKKNGSPFWCLLDIVPIKNEK
:::.:::.::.: ::.: . ...:.:: . : ..:: ::.:.:: ::::::..:::::
CCDS11 MQKTCSCRFLYGPETSEPALQRLHKALEGHQEHRAEICFYRKDGSAFWCLLDMMPIKNEM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE3 GDVVLFLASFKDITDTKVK-ITPE----DKKEDKVKGRSRAGTHFDSARRRSRAVLYHIS
:.::::: ::::::.. . :. :..... :: : .: :::::::.::....
CCDS11 GEVVLFLFSFKDITQSGSPGLGPQGGRGDSNHENSLGRRGATWKFRSARRRSRTVLHRLT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GHLQRREKNKLKINNNVFVDKPAFPEYKVSDAKKSKFILLHFSTFKAGWDWLILLATFYV
::. :: .. .: ::::: ::. :::::... :. .:::.:. :: :: :::::::::
CCDS11 GHFGRRGQGGMKANNNVFEPKPSVPEYKVASVGGSRCLLLHYSVSKAIWDGLILLATFYV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 AVTVPYNVCFIGNDDLS-TTRSTTVSDIAVEILFIIDIILNFRTTYVSKSGQVIFEARSI
:::::::::: :.:: :.: : :::::::.:::.::::::::::::.::::: :::
CCDS11 AVTVPYNVCFSGDDDTPITSRHTLVSDIAVEMLFILDIILNFRTTYVSQSGQVISAPRSI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 CIHYVTTWFIIDLIAALPFDLLYAFNVTVVSLVHLLKTVRLLRLLRLLQKLDRYSQHSTI
.::..:::.::::::::::::: ::.::.:::::::::::::::::::::.:::: :..
CCDS11 GLHYLATWFFIDLIAALPFDLLYIFNITVTSLVHLLKTVRLLRLLRLLQKLERYSQCSAV
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 VLTLLMSMFALLAHWMACIWYVIGKMEREDNSLLKWEVGWLHELGKRLESPYYGNNTLGG
:::::::.::::::::::::::::. : : :. : :..::::::::::: :: :...::
CCDS11 VLTLLMSVFALLAHWMACIWYVIGRREMEANDPLLWDIGWLHELGKRLEVPYV-NGSVGG
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 PSIRSAYIAALYFTLSSLTSVGFGNVSANTDAEKIFSICTMLIGALMHALVFGNVTAIIQ
:: ::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS11 PSRRSAYIAALYFTLSSLTSVGFGNVCANTDAEKIFSICTMLIGALMHAVVFGNVTAIIQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 RMYSRWSLYHTRTKDLKDFIRVHHLPQQLKQRMLEYFQTTWSVNNGIDSNELLKDFPDEL
::::: ::::.: ::::::::::.::. :::::::::::::.::.:::.::::.::::::
CCDS11 RMYSRRSLYHSRMKDLKDFIRVHRLPRPLKQRMLEYFQTTWAVNSGIDANELLRDFPDEL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 RSDITMHLNKEILQLSLFECASRGCLRSLSLHIKTSFCAPGEYLLRQGDALQAIYFVCSG
:.::.::::.::::: :: :::::::.::::::::::::::::::.:::::: :.::::
CCDS11 RADIAMHLNREILQLPLFGAASRGCLRALSLHIKTSFCAPGEYLLRRGDALQAHYYVCSG
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640
pF1KE3 SMEVLKDSMVLAILGKGDLIGANLSIKDQ----------VIKTNADVKALTYCDLQCIIL
:.:::.:.::::::::::::::.. : :.::.::::::::: :: .
CCDS11 SLEVLRDNMVLAILGKGDLIGADIPEPGQEPGLGADPNFVLKTSADVKALTYCGLQQLSS
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 KGLFEVLDLYPEYAHKFVEDIQHDLTYNLREGHESDVISRLSNKSMVSQ--SEPKGNGNI
.:: ::: :::::. : . .:::.:::.: ... .::.: . .:: :: :...
CCDS11 RGLAEVLRLYPEYGAAFRAGLPRDLTFNLRQGSDTSGLSRFSRSPRLSQPRSESLGSSS-
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE3 NKRLPSIVEDEEEEEEGEEEEAVSLSPICTRGSSSRNKKVGSNKAYLGLSLKQLASG-TV
.: ::::.: : : : . :. . : . :: . :: : ... .
CCDS11 DKTLPSITEAESGAEPGGGPRPR--RPLLLPNLSPARPR-GSLVSLLGEELPPFSALVSS
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KE3 PFHSP-IRVSRSNSPKTKQEIDPPNHNKRKEKNLKLQLSTLNNAGPPDLSPRIVDGIEDG
: :: . . ... .. . :: . . : .: . :.. :::::::::::::::.
CCDS11 PSLSPSLSPALAGQGHSASPHGPP-RCSAAWKPPQLLIPPLGTFGPPDLSPRIVDGIEDS
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870
pF1KE3 NSSEESQTFDFGSERIRSEPRI-SPPLG---DPEIGAAVLFIKAEETKQQINKLNSEVTT
.:. :. .: :. . .:: .:: : .::... .:::.:... .::.:..
CCDS11 GSTAEAPSFRFSRRPELPRPRSQAPPTGTRPSPELAS-----EAEEVKEKVCRLNQEISR
840 850 860 870 880
880 890 900 910 920 930
pF1KE3 LTQEVSQLGKDMRNVIQLLENVLSPQQPSRFCSLHSTSVCPSRESLQTRTSWSAHQPCLH
:.::::::....:... ::. :.: . ::. . : : :.
CCDS11 LNQEVSQLSRELRHIMGLLQARLGPPGHPAGSAWTPDPPCPQLRPPCLSPCASRPPPSLQ
890 900 910 920 930 940
940 950 960 970 980 990
pF1KE3 LQTGGAAYTQAQLCSSNITSDIWSVDPSSVGSSPQRTGAHEQNPADSELYHSPSLDYSPS
: . .. :.. . . . . .. :: . :.. .:. .:::
CCDS11 DTTLAEVHCPASVGTMETGTALLDLRPSILPPYPSEPDPLGPSPVPEASPPTPSLLRHSF
950 960 970 980 990 1000
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 HYQVVQEGHLQFLRCISPHSDSTLTPLQSISATLSSSVCSSSETSLHLVLPSRSEEGSFS
CCDS11 QSRSDTFH
1010
>>CCDS9756.1 KCNH5 gene_id:27133|Hs108|chr14 (988 aa)
initn: 891 init1: 525 opt: 1795 Z-score: 1705.6 bits: 327.2 E(32554): 1.1e-88
Smith-Waterman score: 1795; 37.9% identity (70.6% similar) in 812 aa overlap (1-792:1-785)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MPVMK-GLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFILANAQVAKGFPIVYCSDGFCELAGFARTE
:: : ::.:::::::..:. : ...:.:.:.:::.. .:.:: .::::.:.:. :..
CCDS97 MPGGKRGLVAPQNTFLENIVRR--SSESSFLLGNAQIVD-WPVVYSNDGFCKLSGYHRAD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 VMQKSCSCKFLFGVETNEQLMLQIEKSLEEKTEFKGEIMFYKKNGSPFWCLLDIVPIKNE
::::: .:.:..: :... . ........ :...:::: .: : ..:.::.::
CCDS97 VMQKSSTCSFMYGELTDKKTIEKVRQTFDNYESNCFEVLLYKKNRTPVWFYMQIAPIRNE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 KGDVVLFLASFKDITDTKVKITPEDKKEDKVKGRSRAGTHFDSARRRSRAVLYHISGHLQ
. ::::: .::::: : : :: :..:: .. . .. : ::.:: ... .
CCDS97 HEKVVLFLCTFKDITLFKQPI--ED---DSTKGWTKFA-RLTRALTNSRSVLQQLTPMNK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 RREKNKL-KINNNVFVDKPAFPEYKVSDAKKSKFILLHFSTFKAGWDWLILLATFYVAVT
. .: .. . . . . .:.:: : :.::. .::. :::.::. :::.:.
CCDS97 TEVVHKHSRLAEVLQLGSDILPQYKQEAPKTPPHIILHYCAFKTTWDWVILILTFYTAIM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 VPYNVCFIGNDDLSTTRSTTVSDIAVEILFIIDIILNFRTTYVSKSGQVIFEARSICIHY
::::: : ... . . : : .:...:..::.:::.::.:. .:.:: . . : ..:
CCDS97 VPYNVSFKTKQN---NIAWLVLDSVVDVIFLVDIVLNFHTTFVGPGGEVISDPKLIRMNY
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 VTTWFIIDLIAALPFDLLYAF-NVT--VVSLVHLLKTVRLLRLLRLLQKLDRYSQHSTIV
. :::.:::.. ::.:.. :: :: . :: ::.:::::: :. .:::.: .... :
CCDS97 LKTWFVIDLLSCLPYDIINAFENVDEGISSLFSSLKVVRLLRLGRVARKLDHYLEYGAAV
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 LTLLMSMFALLAHWMACIWYVIGKMEREDNSLLKWEV-GWLHELGKRLESPYYGNNTLG-
:.::. .:.:.:::.::::: :: .: :. .. .::..:. . .:: :.. :
CCDS97 LVLLVCVFGLVAHWLACIWYSIGDYEVIDEVTNTIQIDSWLYQLALSIGTPYRYNTSAGI
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 ---GPSIRSAYIAALYFTLSSLTSVGFGNVSANTDAEKIFSICTMLIGALMHALVFGNVT
::: : :...::::..:::..::::.. .::.::.::. :..:.:..: .:::::
CCDS97 WEGGPSKDSLYVSSLYFTMTSLTTIGFGNIAPTTDVEKMFSVAMMMVGSLLYATIFGNVT
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pF1KE3 AIIQRMYSRWSLYHTRTKDLKDFIRVHHLPQQLKQRMLEYFQTTWSVNNGIDSNELLKDF
.:.:.::. . :: ....::......:. :..:...:. .:::...:::....:.
CCDS97 TIFQQMYANTNRYHEMLNNVRDFLKLYQVPKGLSERVMDYIVSTWSMSKGIDTEKVLSIC
470 480 490 500 510 520
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pF1KE3 PDELRSDITMHLNKEIL-QLSLFECASRGCLRSLSLHIKTSFCAPGEYLLRQGDALQAIY
: ..:.:: .:::.... . :. :: ::::.:.....: ::::. . . :....:.
CCDS97 PKDMRADICVHLNRKVFNEHPAFRLASDGCLRALAVEFQTIHCAPGDLIYHAGESVDALC
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CCDS97 FVVSGSLEVIQDDEVVAILGKGDVFGDIFWKETTLAHACANVRALTYCDLHIIKREALLK
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CCDS97 VLDFYTAFANSFSRNLT--LTCNLRKRIIFRKISDVKKEEEERLRQKNEVTLSIPVDHP-
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. : . .. ...: ...: :.:. ::. .: : . : :. . :
CCDS97 VRKLFQKFKQQKELRNQGS-----------TQGDPERNQLQVESRSLQNGASITGTSVVT
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: .::..: . ::.. . :.. . :
CCDS97 VSQITPIQTSLAYV-KTSESLKQNNRDAMELKPNGGADQKCLKVNSPIRMKNGNGKGWLR
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CCDS97 LKNNMGAHEEKKEDWNNVTKAESMGLLSEDPKSSDSENSVTKNPLRKTDSCDSGITKSDL
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. . .. . . :..: :.: . :
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CCDS45 IWEGGPSKDSLYVSSLYFTMTSLTTIGFGNIAPTTDVEKMFSVAMMMVGSLLYATIFGNV
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CCDS45 TTIFQQMYANTNRYHEMLNNVRDFLKLYQVPKGLSERVMDYIVSTWSMSKGIDTEKVLSI
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CCDS59 IRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNAVLKGFPECLQADICLHLNRSLLQHCKPF
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CCDS59 RGATKGCLRALAMKFKTTHAPPGDTLVHAGDLLTALYFISRGSIEILRGDVVVAILGKND
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CCDS59 TPGPGPTSTSPLLPVSPLPTL-TLDSLSQVSQFMACEELPPGAPELPQEGPTRRLSLPGQ
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CCDS59 LGALTSQPLHRHGSDPGS
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10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPVMKGLLAPQNTFLDTIATRFDGTHSNFILANAQVAKGFPIVYCSDGFCELAGFARTEV
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CCDS59 MPVRRGHVAPQNTFLDTIIRKFEGQSRKFIIANARV-ENCAVIYCNDGFCELCGYSRAEV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 MQKSCSCKFLFGVETNEQLMLQIEKSLEEKTEFKGEIMFYKKNGSPFWCLLDIVPIKNEK
::. :.: :: : .:... :: ..: : : :: ::.:.:: : ::.:.::.:::
CCDS59 MQRPCTCDFLHGPRTQRRAAAQIAQALLGAEERKVEIAFYRKDGSCFLCLVDVVPVKNED
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130 140 150 160 170 180
pF1KE3 GDVVLFLASFKDITDTKVKITPEDKKEDKVKGRSRAGTHFDSARRRSRAVLYHISGHLQR
: :..:. .:. . . . .:
CCDS59 GAVIMFILNFEVVMEKDMVGSPAHDTNHRGPPTSWLAPGRAKTFRLKLPALLALTARESS
120 130 140 150 160 170
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:...: . . . ..:. . ..::::.
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210 220 230 240 250
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. . .. .::.: ::: ::::::: ..:.:: .::.. :. .. .:
CCDS59 QAPRIHRWTILHYSPFKAVWDWLILLLVIYTAVFTPYSAAFLLKETEEGPPATECGYACQ
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pF1KE3 --TVSDIAVEILFIIDIILNFRTTYVSKSGQVIFEARSICIHYVTTWFIIDLIAALPFDL
.: :. :.:.::.::..:::::::. . .:. . : .:: ::.::..::.::::
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: :. :. ::::.:::::.:. .::::::.... :: ::: :::.:::.:::::
CCDS59 LI-FGSGSEELIGLLKTARLLRLVRVARKLDRYSEYGAAVLFLLMCTFALIAHWLACIWY
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.::.::. . ..::::.:: .. .:: ... ::::::.. :..:::::.::::::
CCDS59 AIGNMEQPH---MDSRIGWLHNLGDQIGKPY-NSSGLGGPSIKDKYVTALYFTFSSLTSV
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:::::: ::..:::::::.::::.::.: .::::.:::::.:: . :::. ...:::
CCDS59 GFGNVSPNTNSEKIFSICVMLIGSLMYASIFGNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVREFIR
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pF1KE3 VHHLPQQLKQRMLEYFQTTWSVNNGIDSNELLKDFPDELRSDITMHLNKEILQ-LSLFEC
:..:. :.::. :::: .:: .:::: : .:: ::. :..:: .:::. .:: . :.
CCDS59 FHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNAVLKGFPECLQADICLHLNRSLLQHCKPFRG
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:..::::.:....::. ::. :.. :: : :.::. ::.:.:. ..:.:::::.:..
CCDS59 ATKGCLRALAMKFKTTHAPPGDTLVHAGDLLTALYFISRGSIEILRGDVVVAILGKNDIF
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: :.. . :.:.::.:::::::. : :.::::.:::.. .: ... .:.:::
CCDS59 GEPLNLYARPGKSNGDVRALTYCDLHKIHRDDLLEVLDMYPEFSDHFWSSLE--ITFNLR
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pF1KE3 EGHESDVISRLSNKSMVSQSEPKGNGNINKRLPSIVE--DEEEEEEGEEEEAVSLSPI-C
....: : : : . :: :. . :.. :. : :. .:.:
CCDS59 ---DTNMIP----GSPGSTELEGGFSRQRKRKLSFRRRTDKDTEQPG---EVSALGPGRA
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pF1KE3 TRGSSSRNKKVG--SNKAYLGLSLKQLASGTVPFHS--PIRVSRSNSPKTKQEIDPPNHN
: :::.. : ... : : . . : .: :.:. .::. : ::. .
CCDS59 GAGPSSRGRPGGPWGESPSSGPSSPESSEDEGPGRSSSPLRLVPFSSPRPPGE--PPGGE
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pF1KE3 KRKEKNLKLQLSTLNNAGPPDLSPRIVD--GIEDGNSSEESQTFDFGSERIRSEPRISP-
: : . . .: . : . : : . .: . . . : ::
CCDS59 PLMEDCEKSSDTCNPLSGAFSGVSNIFSFWGDSRGRQYQELPRCPAPTPSLLNIPLSSPG
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pF1KE3 --PLGDPEIGAAVLFIKAEETKQQINKLNSEVTTLTQEVSQL-GKDMRNVIQLLENVLSP
: :: : . . ..:.:.:...... : :: ..: : : .:
CCDS59 RRPRGDVES-------RLDALQRQLNRLETRLSADMATVLQLLQRQMTLVPPAYSAVTTP
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pF1KE3 QQ-PSRFCSLHSTSVCPSRESLQTRTSWSAHQPCLHLQTGGAAYTQAQLCSSNITSDIWS
:. : .: :. .:.. .. : . : .: :. :
CCDS59 GPGPTSTSPLLPVSPLPTL-TLDSLSQVSQFMACEELPPGAPELPQEGPTRRLSLPGQLG
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pF1KE3 VDPSSVGSSPQRTGAHEQNPADSELYHSPSLDYSPSHYQVVQEGHLQFLRCISPHSDSTL
CCDS59 ALTSQPLHRHGSDPGS
810
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CCDS11 MPVRRGHVAPQNTYLDTIIRKFEGQSRKFLIANAQM-ENCAIIYCNDGFCELFGYSRVEV
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CCDS11 MQQPCTCDFLTGPNTPSSAVSRLAQALLGAEECKVDILYYRKDASSFRCLVDVVPVKNED
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CCDS11 GAVIMFILNFEDLAQLLAKCSSRSLSQRLLSQSFLGSEGSHGRPGGPGPGTGRGKYRTIS
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160 170 180 190 200
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210 220 230 240 250
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. . .. .::.: ::: ::::::: ..:.:: .::.. :. .:. . :..
CCDS11 QAPRIHRWTILHYSPFKAVWDWLILLLVIYTAVFTPYSAAFLLSDQDESRRGACSYTCSP
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260 270 280 290 300 310
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:: :. :.:.:..::..:::::::. . .:. . : : .:: ::.::..::.:::::
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320 330 340 350 360 370
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: . ...:. ::::.:::::.:. .::::::.... :: ::: :::.:::.:::
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380 390 400 410 420 430
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::.::..:: :. ..::: :: .: . : :.. .:::... :..:::::.::::
CCDS11 WYAIGNVERP---YLEHKIGWLDSLGVQLGKRYNGSDPASGPSVQDKYVTALYFTFSSLT
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440 450 460 470 480 490
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:: :..:. :.::. :::: .:: .:::: : .:: ::. :..:: .::.. .:: :
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560 570 580 590 600 610
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:..::::.:....::. ::. :.. ::.:...::. ::.:.:.:..:.:::::.:
CCDS11 SGAGKGCLRALAVKFKTTHAPPGDTLVHLGDVLSTLYFISRGSIEILRDDVVVAILGKND
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620 630 640 650 660 670
pF1KE3 LIGANLSIKDQVIKTNADVKALTYCDLQCIILKGLFEVLDLYPEYAHKFVEDIQHDLTYN
..: .:.. : :..:::.:::::::. : :.::::.:: .:..: . ..:.:
CCDS11 IFGEPVSLHAQPGKSSADVRALTYCDLHKIQRADLLEVLDMYPAFAESFWSKL--EVTFN
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680 690 700 710 720
pF1KE3 LREG----HESDVISRLSNKSM---VSQSEPKGNGNINKRLPSIVEDEEEEEEGEEEEAV
::.. : : . :. . .:... . ... ..:: . : .. ..
CCDS11 LRDAAGGLHSSPRQAPGSQDHQGFFLSDNQSGSPHELGPQFPS--KGYSLLGPGSQN-SM
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730 740 750 760 770 780
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. .: :. : . .. . : :: .: . : ::: .::. . : .
CCDS11 GAGP-CAPGHPDAAPPLSISDAS-GL-WPELLQEMPPRHSP------QSPQEDPDCWPLK
780 790 800 810 820
790 800 810 820 830
pF1KE3 HNKRKEKNLKLQLSTLNNAGPPDLSPRIVDGIE----DGNSS---EESQTFDFGSERIRS
..: :. :. :.. :.. ::: ::.. .. .:..: : . :.. : :
CCDS11 LGSRLEQ-LQAQMNRLESRVSSDLS-RILQLLQKPMPQGHASYILEAPASNDLALVPIAS
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840 850 860 870 880
pF1KE3 E-----PRIS----PPLGDPEIGAAVLFIKAEETKQQINKLNSEVTTLTQEVSQLGKDMR
: ::. :: : :
CCDS11 ETTSPGPRLPQGFLPPAQTPSYGDLDDCSPKHRNSSPRMPHLAVATDKTLAPSSEQEQPE
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CCDS62 MPVRRGHVAPQNTYLDTIIRKFEGQSRKFLIANAQM-ENCAIIYCNDGFCELFGYSRVEV
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pF1KE3 MQKSCSCKFLFGVETNEQLMLQIEKSLEEKTEFKGEIMFYKKNGSPFWCLLDIVPIKNEK
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CCDS62 MQQPCTCDFLTGPNTPSSAVSRLAQALLGAEECKVDILYYRKDASSFRCLVDVVPVKNED
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pF1KE3 GDVVLFLASFKDITDTKVKIT----------------------PEDKKEDKVKGRSRAGT
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CCDS62 GAVIMFILNFEDLAQLLAKCSSRSLSQRLLSQSFLGSEGSHGRPGGPGPGTGRGKYRTIS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
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CCDS62 QIPQFTLNFVEFNLEKHRSSSTTEIEIIAPHKVVERTQNVTEKVTQVLSLGADVLPEYKL
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pF1KE3 SDAKKSKFILLHFSTFKAGWDWLILLATFYVAVTVPYNVCFIGNDDLSTTRST-------
. . .. .::.: ::: ::::::: ..:.:: .::.. :. .:. . :..
CCDS62 QAPRIHRWTILHYSPFKAVWDWLILLLVIYTAVFTPYSAAFLLSDQDESRRGACSYTCSP
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260 270 280 290 300 310
pF1KE3 -TVSDIAVEILFIIDIILNFRTTYVSKSGQVIFEARSICIHYVTTWFIIDLIAALPFDLL
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CCDS62 LTVVDLIVDIMFVVDIVINFRTTYVNTNDEVVSHPRRIAVHYFKGWFLIDMVAAIPFDLL
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320 330 340 350 360 370
pF1KE3 YAFNV---TVVSLVHLLKTVRLLRLLRLLQKLDRYSQHSTIVLTLLMSMFALLAHWMACI
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CCDS62 I-FRTGSDETTTLIGLLKTARLLRLVRVARKLDRYSEYGAAVLFLLMCTFALIAHWLACI
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440 450 460 470 480 490
pF1KE3 SVGFGNVSANTDAEKIFSICTMLIGALMHALVFGNVTAIIQRMYSRWSLYHTRTKDLKDF
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CCDS62 SVGFGNVSPNTNSEKVFSICVMLIGSLMYASIFGNVSAIIQRLYSGTARYHTQMLRVKEF
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pF1KE3 IRVHHLPQQLKQRMLEYFQTTWSVNNGIDSNELLKDFPDELRSDITMHLNKEILQ-LSLF
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CCDS62 IRFHQIPNPLRQRLEEYFQHAWSYTNGIDMNAVLKGFPECLQADICLHLHRALLQHCPAF
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pF1KE3 ECASRGCLRSLSLHIKTSFCAPGEYLLRQGDALQAIYFVCSGSMEVLKDSMVLAILGKGD
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CCDS62 SGAGKGCLRALAVKFKTTHAPPGDTLVHLGDVLSTLYFISRGSIEILRDDVVVAILGKND
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pF1KE3 LIGANLSIKDQVIKTNADVKALTYCDLQCIILKGLFEVLDLYPEYAHKFVEDIQHDLTYN
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CCDS62 IFGEPVSLHAQPGKSSADVRALTYCDLHKIQRADLLEVLDMYPAFAESFWSKLE--VTFN
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680 690 700 710 720 730
pF1KE3 LREGHESDVISRLSNKSMVSQSEPKGNGNINKRLPSIVEDEEEEEEGEEEEAVSLSPICT
::.
CCDS62 LRDAAGGLHSSPRQAPGSQDHQGFFLSDNQSDAAPPLSISDASGLWPELLQEMPPRHSPQ
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CCDS31 MTMAGGRRGLVAPQNTFLENIVRRSNDT--NFVLGNAQIVD-WPIVYSNDGFCKLSGYHR
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pF1KE3 TEVMQKSCSCKFLFGVETNEQLMLQIEKSLEEKTEFKGEIMFYKKNGSPFWCLLDIVPIK
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CCDS31 AEVMQKSSTCSFMYGELTDKDTIEKVRQTFENYEMNSFEILMYKKNRTPVWFFVKIAPIR
60 70 80 90 100 110
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CCDS31 NEQDKVVLFLCTFSDITAFKQPI--ED---DSCKGWGKFA-RLTRALTSSRGVLQQLAPS
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pF1KE3 LQRREK--NKLKINNNVFVDKPAFPEYKVSDAKKSKFILLHFSTFKAGWDWLILLATFYV
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CCDS31 VQKGENVHKHSRLAEVLQLGSDILPQYKQEAPKTPPHIILHYCVFKTTWDWIILILTFYT
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CCDS31 AILVPYNVSFKTRQN---NVAWLVVDSIVDVIFLVDIVLNFHTTFVGPAGEVISDPKLIR
240 250 260 270 280
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pF1KE3 IHYVTTWFIIDLIAALPFDLLYAF-NVT--VVSLVHLLKTVRLLRLLRLLQKLDRYSQHS
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