Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3562
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3562, 450 aa
1>>>pF1KE3562 450 - 450 aa - 450 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9146+/-0.000489; mu= 16.7076+/- 0.030
mean_var=169.7624+/-36.705, 0's: 0 Z-trim(114.2): 235 B-trim: 1102 in 1/51
Lambda= 0.098436
statistics sampled from 23686 (23966) to 23686 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 8.640
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065091 (OMIM: 606124) tripartite motif-containi ( 452) 1218 185.8 2.1e-46
NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein liga ( 475) 686 110.2 1.2e-23
NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein liga ( 468) 622 101.1 6.4e-21
XP_016857901 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 467) 616 100.3 1.2e-20
XP_011542513 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 450) 580 95.2 3.9e-19
NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 488) 580 95.2 4.1e-19
XP_016873516 (OMIM: 606124) PREDICTED: tripartite ( 375) 478 80.6 8.1e-15
NP_001003827 (OMIM: 605684) tripartite motif-conta ( 488) 476 80.4 1.1e-14
NP_067629 (OMIM: 605684) tripartite motif-containi ( 488) 476 80.4 1.1e-14
NP_001128327 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 343) 397 69.0 2.2e-11
XP_006711842 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 397 69.2 2.7e-11
NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein liga ( 477) 397 69.2 2.7e-11
XP_011542512 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 397 69.2 2.7e-11
XP_011542511 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 397 69.2 2.7e-11
NP_001020111 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 477) 397 69.2 2.7e-11
XP_016873951 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 300) 394 68.5 2.8e-11
XP_005253241 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 326) 394 68.5 2.9e-11
NP_149084 (OMIM: 608487) tripartite motif-containi ( 326) 394 68.5 2.9e-11
NP_149083 (OMIM: 608487) tripartite motif-containi ( 347) 394 68.6 3e-11
XP_005253240 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 493) 394 68.8 3.7e-11
NP_149023 (OMIM: 608487) tripartite motif-containi ( 493) 394 68.8 3.7e-11
NP_006501 (OMIM: 602165) zinc finger protein RFP [ ( 513) 391 68.4 5.1e-11
NP_003440 (OMIM: 600830) tripartite motif-containi ( 539) 383 67.3 1.1e-10
XP_005249434 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 383 67.3 1.1e-10
XP_005249433 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 383 67.3 1.1e-10
XP_005249432 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 383 67.3 1.1e-10
NP_001229712 (OMIM: 600830) tripartite motif-conta ( 539) 383 67.3 1.1e-10
XP_006715243 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 383 67.3 1.1e-10
XP_005249431 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 383 67.3 1.1e-10
XP_005249435 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 539) 383 67.3 1.1e-10
XP_016856908 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 262) 378 66.1 1.2e-10
XP_016856907 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 262) 378 66.1 1.2e-10
XP_006718421 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 265) 376 65.9 1.5e-10
XP_016873952 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 265) 376 65.9 1.5e-10
XP_016873950 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 310) 376 66.0 1.7e-10
XP_011518728 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 310) 376 66.0 1.7e-10
XP_016866752 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 462) 373 65.8 2.8e-10
XP_011513161 (OMIM: 600830) PREDICTED: tripartite ( 462) 373 65.8 2.8e-10
XP_016873949 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 314) 367 64.7 4.1e-10
XP_011518729 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 271) 365 64.3 4.5e-10
NP_477514 (OMIM: 607564) tripartite motif-containi ( 488) 366 64.8 5.8e-10
NP_001003818 (OMIM: 607564) tripartite motif-conta ( 516) 366 64.8 6e-10
NP_067076 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 518) 366 64.8 6e-10
NP_439893 (OMIM: 605701) tripartite motif-containi ( 395) 362 64.1 7.6e-10
NP_006769 (OMIM: 605701) tripartite motif-containi ( 481) 362 64.2 8.5e-10
NP_569074 (OMIM: 605684) tripartite motif-containi ( 270) 346 61.6 2.9e-09
NP_001291425 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein l ( 262) 337 60.3 7e-09
XP_011512567 (OMIM: 609316) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 421) 336 60.5 1e-08
NP_008959 (OMIM: 609316) E3 ubiquitin-protein liga ( 425) 336 60.5 1e-08
NP_001268379 (OMIM: 612548) E3 ubiquitin-protein l ( 486) 335 60.4 1.2e-08
>>NP_065091 (OMIM: 606124) tripartite motif-containing p (452 aa)
initn: 1212 init1: 966 opt: 1218 Z-score: 954.1 bits: 185.8 E(85289): 2.1e-46
Smith-Waterman score: 1218; 43.3% identity (69.0% similar) in 448 aa overlap (1-446:1-448)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ
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NP_065 MNSGILQVFQGELICPLCMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPFLVQCSECTKSTE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR
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NP_065 QINLKTNIHLKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSSQE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 HATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVFINLRSMMIS
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NP_065 HRYHRHRPIEWAAEEHREKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKDYVNLRLEAIR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 AEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEMSCKA
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NP_065 AEYQKMPAFHHEEEKHNLEMLKKKGKEIFHRLHLSKAKMAHRMEILRGMYEELNEMCHKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNHK
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NP_065 DVELLQAFGDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEANNDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCRE
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NP_065 FLYEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSFLAWGVQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE3 AWTKRN-DMRLDSE-GIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIV
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NP_065 YRKEKNQNEKIDGKAGLFLLGCVKNDIQCSLFTTSPLMLQYIPKPTSRVGLFLDCEAKTV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450
pF1KE3 SFVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK
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NP_065 SFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF
430 440 450
>>NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein ligase T (475 aa)
initn: 536 init1: 197 opt: 686 Z-score: 545.6 bits: 110.2 E(85289): 1.2e-23
Smith-Waterman score: 686; 31.0% identity (59.0% similar) in 461 aa overlap (1-448:1-449)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MASAITQCST-SELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREIS
:::: :.:: :: : ...::.: ::: ::. :. . . . :::::
NP_003 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECISQVGKG--GGSVCPVCR---
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 QQMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLI-----CRRHQEIKNLICETDRSLLCFL
: .. . . ..:. ... ..:. : : : : .:.:: : . ::..
NP_003 -QRFLLKNLRPNRQLANMVNNLK-EISQEAREGTQGERCAVHGERLHLFCEKDGKALCWV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 CSQSPRHATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNII-GTWEVFIN
:.:: .: : .:: . :..:: . . . ..::. ..:. : : . :. ..
NP_003 CAQSRKHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGEL-RRKQELAEKLEVEIAIKRADWKKTVE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 LRSMMISAEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKL
.. : ::. . ..: ::::.... : .. : .. : ......:... :.:. .:
NP_003 TQKSRIHAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQALQELISEL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 KEMSCKADVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQL-SAWTITGVSERLNFFRVYITLD
. .. ..: :.. :..:.: : . ..:.: :. . :... : :.::::
NP_003 DRRCHSSALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPELRSVCHVPGLKKMLRTCAVHITLD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE3 RKICSNHKLLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSW----GAQILSSGKHYWEVDVK
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NP_003 PDTANPWLILSEDRR--QVRLGDTQQSI-PGNEERFDSYPMVLGAQHFHSGKHYWEVDVT
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 DSCNWVIGLCREAWTKRNDMRLDSEGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLG
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NP_003 GKEAWDLGVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEA-GTYPQTPLHLQVPPCQVG
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KE3 VFLDYECGIVSFVNVA-QSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK
.::::: :.::: :.. ..::: :: : :::::. :
NP_003 IFLDYEAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAPLTLCPLNIG
410 420 430 440 450 460
NP_003 SQGSTDY
470
>>NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein ligase T (468 aa)
initn: 306 init1: 206 opt: 622 Z-score: 496.5 bits: 101.1 E(85289): 6.4e-21
Smith-Waterman score: 622; 28.6% identity (55.9% similar) in 444 aa overlap (12-444:13-441)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREIS
: ::.:: ::.:::: ::: :: :. : . : :: :::.:
NP_660 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 QQMYFK-RIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQS
: .. .:. . : : . .. .: :.: .: . ::: : .:
NP_660 PQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSPVPQG---VCPAHREPLAAFCGDELRLLCAACERS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 PRHATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQ--RNLNRETNIIGTWEVFINLRS
.: .:. ..: : . :: ... . :. : . :: .. :. ... .
NP_660 GEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVL--WQKMVESQR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 MMISAEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEM
. . .:. .. . : ::::. .. : .: .. .:... ....... : :. .: :
NP_660 QNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAEL-EG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SCKAD-VNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQL-SAWTITGVSERLNFFRVYITLDRK
:. ..: ::. :...: . ..: :. : .: .. . :. : : :: .:::
NP_660 RCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE3 ICSNHKLLFEDLRHLQ-----CSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKD
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NP_660 TANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGP----CVLGQERFTSGRHYWEVEVGD
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 SCNWVIGLCREAWTKRNDMRLDS-EGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLG
.:..:.::: .... .:.. .:...:. : . : . .:: : .:
NP_660 RTSWALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFLGSYYNSSERALAPLRD-----PPRRVG
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KE3 VFLDYECGIVSFVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK
.::::: : .:: .....::. : : :::.
NP_660 IFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPTPMTICRPKGGSGDTL
410 420 430 440 450 460
NP_660 APQ
>>XP_016857901 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (467 aa)
initn: 420 init1: 206 opt: 616 Z-score: 492.0 bits: 100.3 E(85289): 1.2e-20
Smith-Waterman score: 616; 28.8% identity (55.9% similar) in 444 aa overlap (12-444:13-440)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREIS
: ::.:: ::.:::: ::: :: :. : . : :: :::.:
XP_016 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQPEGPYACPECRELS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 QQMYFK-RIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQS
: .. .:. . : : . .. .: :.: .: . ::: : .:
XP_016 PQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSPVPQG---VCPAHREPLAAFCGDELRLLCAACERS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 PRHATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQ--RNLNRETNIIGTWEVFINLRS
.: .:. ..: : . :: ... . :. : . :: .. :.. . :.
XP_016 GEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCVL--WQMVESQRQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 MMISAEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEM
... :. .. . : ::::. .. : .: .. .:... ....... : :. .: :
XP_016 NVLG-EFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHLAELIAEL-EG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SCKAD-VNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQL-SAWTITGVSERLNFFRVYITLDRK
:. ..: ::. :...: . ..: :. : .: .. . :. : : :: .:::
XP_016 RCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMELRTVCRVPGLVETLRRFRGDVTLDPD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE3 ICSNHKLLFEDLRHLQ-----CSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKD
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XP_016 TANPELILSEDRRSVQRGDLRQALPDSPERFDPGP----CVLGQERFTSGRHYWEVEVGD
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 SCNWVIGLCREAWTKRNDMRLDS-EGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLG
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XP_016 RTSWALGVCRENVNRKEKGELSAGNGFWILVFLGSYYNSSERALAPLRD-----PPRRVG
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KE3 VFLDYECGIVSFVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK
.::::: : .:: .....::. : : :::.
XP_016 IFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPLSSSPTPMTICRPKGGSGDTL
410 420 430 440 450 460
XP_016 APQ
>>XP_011542513 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (450 aa)
initn: 417 init1: 142 opt: 580 Z-score: 464.5 bits: 95.2 E(85289): 3.9e-19
Smith-Waterman score: 580; 26.1% identity (57.4% similar) in 437 aa overlap (30-449:4-433)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNC---------
::: :: :. : :: . .
XP_011 MTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSFP
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 CPVCREISQQMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLL
:: :::.: : : .. .. . . : . . . . . .:..:.: .:.:. :.: .
XP_011 CPECREMSPQ----RNLLPNRLLTKVAEMAQQHPGLQKQDLCQEHHEPLKLFCQKDQSPI
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 CFLCSQSPRHATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVF
: .: .: .: :. ..:: . :. :: .:. . .. .. :: . .. :.
XP_011 CVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQGK
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 INLRSMMISAEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYE
.. : : :. :. :: ::::. ...: : . ..:..: . . ..: :. .
XP_011 VKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELLLL
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280
pF1KE3 KLKEMSCKADVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVY---
.:.: : .. ... ::. . ..:.. . . :. : : :. : ... .: .
XP_011 QLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPE-VAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLED
220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 ITLDRKICSNHKLLFEDL--RHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEV-
.. : . ::.:. :.: : . . . . . : . : .:::.:::::
XP_011 VVPDATSAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAFSSGRHYWEVG
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 -DVKDSCNWVIGLCREAWTKRNDM-RLDSEGIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRP
.. . :..:.::. .... . . .:.... : ..: ::. : : .. .:
XP_011 MNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSA--LTPVMLMEP
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450
pF1KE3 QGWLGVFLDYECGIVSFVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK
. .:.:::.: : ::: .:...: . .. . : ::.::.: :.
XP_011 PSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQMVISTVTMW
390 400 410 420 430 440
XP_011 VKG
450
>>NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein ligase T (488 aa)
initn: 561 init1: 317 opt: 580 Z-score: 464.1 bits: 95.2 E(85289): 4.1e-19
Smith-Waterman score: 580; 25.6% identity (55.8% similar) in 450 aa overlap (12-448:26-468)
10 20 30 40
pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDT
: .::.: .:: .:: : ::: ::. :. :::
NP_742 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 LTPNCCPVCREISQQMYFK--RIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLIC
:::::. :. .. : . . .. ..: .. . .. : .:.: .:.:
NP_742 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESL--CPQHHEALSLFC
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 ETDRSLLCFLCSQSPRHATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNI
:. .:..:. : : .: .: . :..:: .. . .: :. : . : .
NP_742 YEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 IGTWEVFINLRSMMISAEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGI
: . ... : ..: :. .. . : ::.: . : .: . :.:.:... :..:
NP_742 PGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLREN---AAHLGD
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 LLREMYEKLKEM--SC-KADVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSER
:.. . :. .: .. .. .:. ..... : .. :. .: . .
NP_742 KRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQY
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE3 LNFFRVY------ITLDRKICSNHKLLFEDLRHLQ-CSLDDTDMSCNPTS-TQYTSSWGA
. . .. .::: . . .: :: . .. :. .: : : ..
NP_742 FALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLAT
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 QILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCREAWTKRNDMRLDSEGIFLLLCLKVDDHFSLFSTS
. ..::.:::::.: :. .:..:.::.. ...... : . . : :... .:.
NP_742 EGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAA-TTT
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 PLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIVSFVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK
:. : .: .:.::::: : .:: ::.. : : .: . : : :.. :
NP_742 PFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTF-TDTFTEKLWPLFYPGIRAGR
420 430 440 450 460 470
NP_742 KNAAPLTIRPPTDWE
480
>>XP_016873516 (OMIM: 606124) PREDICTED: tripartite moti (375 aa)
initn: 979 init1: 441 opt: 478 Z-score: 387.0 bits: 80.6 E(85289): 8.1e-15
Smith-Waterman score: 877; 36.2% identity (56.7% similar) in 448 aa overlap (1-446:1-371)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNCCPVCREISQ
: :.: : .:: : .: .:. ::::: ::: :: ::. : :.: : : . ..
XP_016 MNSGILQVFQGELICPLCMNYFIDPVTIDCGHSFCRPCFYLNWQDIPFLVQCSECTKSTE
10 20 30 40 50 60
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pF1KE3 QMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSLLCFLCSQSPR
:. .: : .:.. .:. . :: .: :.: :...::.::::::.:::.: .
XP_016 QINLKTNIHLKKMASLARKVSLWLFLSSEEQMCGTHRETKKIFCEVDRSLLCLLCSSSQE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 HATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEVFINLRSMMIS
: :.: . : : .:.::: .:.:.:.: .:.:::: ::. :..:
XP_016 HRYHRHRPIEWAAEEHREKLLQKMQSLWEKACENHRNLNVETTRTRCWKAF---------
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 AEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMYEKLKEMSCKA
XP_016 ------------------------------------------------------------
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYITLDRKICSNHK
::...:.: . : ::::.::.::: :::. .::: :::.::: .. .:
XP_016 --------GDILHRSESVLLHMPQPLNPELSAGPITGLRDRLNQFRVHITLHHEEANNDI
180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDSCNWVIGLCRE
.:.: :: . . : :. .. . .::.: ..:::.:::: : :: ::..:.:
XP_016 FLYEILRSMCIGCDHQDVPYFTATPRSFLAWGVQTFTSGKYYWEVHVGDSWNWAFGVCNM
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410
pF1KE3 AWTKRN-DMRLDSE-GIFLLLCLKVDDHFSLFSTSPLLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIV
..: . ..:.. :.::: :.: : . :::.::::. .:::.: . .:.::: : :
XP_016 YRKEKNQNEKIDGKAGLFLLGCVKNDIQCSLFTTSPLMLQYIPKPTSRVGLFLDCEAKTV
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450
pF1KE3 SFVNVAQSSLICSFLSRIFYFPLRPFICHGSK
:::.: ::::: .. . : ::::..:
XP_016 SFVDVNQSSLIYTIPNCSFSPPLRPIFCCIHF
350 360 370
>>NP_001003827 (OMIM: 605684) tripartite motif-containin (488 aa)
initn: 583 init1: 259 opt: 476 Z-score: 384.3 bits: 80.4 E(85289): 1.1e-14
Smith-Waterman score: 568; 26.7% identity (58.5% similar) in 487 aa overlap (1-444:1-471)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTP----NCCPVC-
::: : :.:: :: . ::.:... ::: .: :. . ....: . ::::
NP_001 MASKILLNVQEEVTCPICLELLTEPLSLDCGHSLCRACITVSNKEAVTSMGGKSSCPVCG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 -----REISQQMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSL
.... .... :. :.: . .. .. .: .: : :.:. ::..
NP_001 ISYSFEHLQANQHLANIVERLKEVKLSPDN------GKKRDLCDHHGEKLLLFCKEDRKV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE3 LCFLCSQSPRHATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLN---RETNIIGT
.:.:: .: .: :. .:.:. . ..:: .: . ::.... ..:. :: . .
NP_001 ICWLCERSQEHRGHHTVLTEEVFKECQEKLQAVLKRL-KKEEEEAEKLEADIREEKT--S
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 WEVFINLRSMMISAEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLR
:. .. . . :..:. .. . : .:::.... : .: . .... ... ..... :.:
NP_001 WKYQVQTERQRIQTEFDQLRSILNNEEQRELQRLEEEEKKTLDKFAEAEDELVQQKQLVR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 EMYEKLKEMSCKADVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQL-SAWTITGVSERLNFFR
:. .. : . ..: ::.. .:: .:. :: :. :. .: ... .:. :..::
NP_001 ELISDVECRSQWSTMELLQDMSGIMKWSEIWRLKKPKMVSKKLKTVFHAPDLSRMLQMFR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE3 ---------VYITLDRKICSNHKLLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILS
: .::. . . .: :: :.. .. : . . :.: .:
NP_001 ELTAVRCYWVDVTLNSVNLNLNLVLSEDQRQV------ISVPIWPFQCYNYGVLGSQYFS
300 310 320 330 340
340 350 360 370 380
pF1KE3 SGKHYWEVDVKDSCNWVIGL-CREAWTK-----------RNDMRLDSEGIF--LLLCLKV
::::::::::. . :..:. :: .... :... . .: .. :.
NP_001 SGKHYWEVDVSKKTAWILGVYCR-TYSRHMKYVVRRCANRQNLYTKYRPLFGYWVIGLQN
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430
pF1KE3 DDHFSLF----STSP-LLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIVSFVNV-AQSSLICSFLSRIF
....: :..: .: . : .::::::: ::::: :: ...::: .: . :
NP_001 KCKYGVFEESLSSDPEVLTLSMAVPPCRVGVFLDYEAGIVSFFNVTSHGSLIYKFSKCCF
410 420 430 440 450 460
440 450
pF1KE3 YFPLRPFICHGSK
:. :.
NP_001 SQPVYPYFNPWNCPAPMTLCPPSS
470 480
>>NP_067629 (OMIM: 605684) tripartite motif-containing p (488 aa)
initn: 583 init1: 259 opt: 476 Z-score: 384.3 bits: 80.4 E(85289): 1.1e-14
Smith-Waterman score: 568; 26.7% identity (58.5% similar) in 487 aa overlap (1-444:1-471)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTP----NCCPVC-
::: : :.:: :: . ::.:... ::: .: :. . ....: . ::::
NP_067 MASKILLNVQEEVTCPICLELLTEPLSLDCGHSLCRACITVSNKEAVTSMGGKSSCPVCG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 -----REISQQMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSL
.... .... :. :.: . .. .. .: .: : :.:. ::..
NP_067 ISYSFEHLQANQHLANIVERLKEVKLSPDN------GKKRDLCDHHGEKLLLFCKEDRKV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE3 LCFLCSQSPRHATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLN---RETNIIGT
.:.:: .: .: :. .:.:. . ..:: .: . ::.... ..:. :: . .
NP_067 ICWLCERSQEHRGHHTVLTEEVFKECQEKLQAVLKRL-KKEEEEAEKLEADIREEKT--S
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 WEVFINLRSMMISAEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLR
:. .. . . :..:. .. . : .:::.... : .: . .... ... ..... :.:
NP_067 WKYQVQTERQRIQTEFDQLRSILNNEEQRELQRLEEEEKKTLDKFAEAEDELVQQKQLVR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 EMYEKLKEMSCKADVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQL-SAWTITGVSERLNFFR
:. .. : . ..: ::.. .:: .:. :: :. :. .: ... .:. :..::
NP_067 ELISDVECRSQWSTMELLQDMSGIMKWSEIWRLKKPKMVSKKLKTVFHAPDLSRMLQMFR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE3 ---------VYITLDRKICSNHKLLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILS
: .::. . . .: :: :.. .. : . . :.: .:
NP_067 ELTAVRCYWVDVTLNSVNLNLNLVLSEDQRQV------ISVPIWPFQCYNYGVLGSQYFS
300 310 320 330 340
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pF1KE3 SGKHYWEVDVKDSCNWVIGL-CREAWTK-----------RNDMRLDSEGIF--LLLCLKV
::::::::::. . :..:. :: .... :... . .: .. :.
NP_067 SGKHYWEVDVSKKTAWILGVYCR-TYSRHMKYVVRRCANRQNLYTKYRPLFGYWVIGLQN
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430
pF1KE3 DDHFSLF----STSP-LLPHYIPRPQGWLGVFLDYECGIVSFVNV-AQSSLICSFLSRIF
....: :..: .: . : .::::::: ::::: :: ...::: .: . :
NP_067 KCKYGVFEESLSSDPEVLTLSMAVPPCRVGVFLDYEAGIVSFFNVTSHGSLIYKFSKCCF
410 420 430 440 450 460
440 450
pF1KE3 YFPLRPFICHGSK
:. :.
NP_067 SQPVYPYFNPWNCPAPMTLCPPSS
470 480
>>NP_001128327 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein ligas (343 aa)
initn: 364 init1: 170 opt: 397 Z-score: 325.3 bits: 69.0 E(85289): 2.2e-11
Smith-Waterman score: 426; 27.5% identity (57.5% similar) in 287 aa overlap (12-289:13-294)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MASAITQCSTSELTCSICTDYLTDPVTICCGHRFCSPCLCLLWEDTLTPNC--------
: ::::: ::.:::: ::: :: :. : :: . .
NP_001 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 -CPVCREISQQMYFKRIIFAEKQVIPTRESVPCQLSSSAMLICRRHQEIKNLICETDRSL
:: :::.: : : .. .. . . : . . . . . .:..:.: .:.:. :.:
NP_001 PCPECREMSPQ----RNLLPNRLLTKVAEMAQQHPGLQKQDLCQEHHEPLKLFCQKDQSP
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 LCFLCSQSPRHATHKHYMTREADEYYRKKLLIQMKSIWKKKQKNQRNLNRETNIIGTWEV
.: .: .: .: :. ..:: . :. :: .:. . .. .. :: . .. :.
NP_001 ICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNLQAREEQSLAEWQG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 FINLRSMMISAEYPKVCQYLREEEQKHVESLAREGRIIFQQLKRSQTRMAKMGILLREMY
.. : : :. :. :: ::::. ...: : . ..:..: . . ..: :. .
NP_001 KVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLELLL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 EKLKEMSCKADVNLPQDLGDVMKRNEFLRLAMPQPVNPQLSAWTITGVSERLNFFRVYIT
.:.: : .. ... ::. . ..:.. . . :. : : :. : ... .: ..
NP_001 LQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPE-VAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGFLG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 LDRKICSNHKLLFEDLRHLQCSLDDTDMSCNPTSTQYTSSWGAQILSSGKHYWEVDVKDS
NP_001 KWAPRARTSDPGSLGDAPLYPLASEATNGGGSTSALPGDGHWLFTVPS
300 310 320 330 340
450 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 16:31:22 2016 done: Mon Nov 7 16:31:24 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]