Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3537
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3537, 506 aa
1>>>pF1KE3537 506 - 506 aa - 506 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4664+/-0.000929; mu= 18.8238+/- 0.056
mean_var=97.1049+/-18.687, 0's: 0 Z-trim(108.1): 34 B-trim: 5 in 1/50
Lambda= 0.130153
statistics sampled from 9939 (9966) to 9939 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16
Scan time: 3.230
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44713.1 KDM4E gene_id:390245|Hs108|chr11 ( 506) 3523 672.1 4e-193
CCDS8302.1 KDM4D gene_id:55693|Hs108|chr11 ( 523) 2191 422.0 8e-118
CCDS12138.1 KDM4B gene_id:23030|Hs108|chr19 (1096) 1804 349.6 1e-95
CCDS55286.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 ( 813) 1691 328.3 2e-89
CCDS55285.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 ( 835) 1691 328.3 2e-89
CCDS6471.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (1056) 1691 328.4 2.4e-89
CCDS491.1 KDM4A gene_id:9682|Hs108|chr1 (1064) 1645 319.8 9.6e-87
CCDS78379.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 ( 151) 596 122.0 4.7e-28
CCDS55555.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY (1570) 516 107.9 8.3e-23
CCDS41736.1 KDM5A gene_id:5927|Hs108|chr12 (1690) 493 103.7 1.7e-21
CCDS55554.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY (1482) 492 103.4 1.8e-21
CCDS14794.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY (1539) 492 103.4 1.9e-21
CCDS55417.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX (1379) 491 103.2 2e-21
CCDS65269.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX (1559) 491 103.2 2.1e-21
CCDS14351.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX (1560) 491 103.2 2.1e-21
CCDS30974.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1 (1544) 450 95.5 4.4e-19
CCDS81417.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1 (1580) 450 95.6 4.5e-19
>>CCDS44713.1 KDM4E gene_id:390245|Hs108|chr11 (506 aa)
initn: 3523 init1: 3523 opt: 3523 Z-score: 3580.7 bits: 672.1 E(32554): 4e-193
Smith-Waterman score: 3523; 99.8% identity (100.0% similar) in 506 aa overlap (1-506:1-506)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MKSVHSSPQNTSHTIMTFYPTMEEFADFNTYVAYMESQGAHQAGLAKVIPPKEWKARQMY
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CCDS44 MKSVHSSPQNTSHTIMTFYPTMEEFADFNTYVAYMESQGAHQAGLAKVIPPKEWKARQMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DDIEDILIATPLQQVTSGQGGVFTQYHKKKKAMRVGQYRRLANSKKYQTPPHRNFADLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS44 DDIEDILIATPLQQVTSGQGGVFTQYHKKKKAMRVGQYRRLANSKKYQTPPHQNFADLEQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RYWKSHPGNPPIYGADISGSLFEESTKQWNLGHLGTILDLLEQECGVVIEGVNTPYLYFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RYWKSHPGNPPIYGADISGSLFEESTKQWNLGHLGTILDLLEQECGVVIEGVNTPYLYFG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 MWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKTWYVVPPEHGQHLERLARELFPDISRGCEAFLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKTWYVVPPEHGQHLERLARELFPDISRGCEAFLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 HKVALISPTVLKENGIPFNCMTQEAGEFMVTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRWIDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HKVALISPTVLKENGIPFNCMTQEAGEFMVTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRWIDY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 GKMASQCSCGESTVTFSMDPFVRIVQPESYELWKHRQDLAIVEHTEPRVAESQELSNWRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GKMASQCSCGESTVTFSMDPFVRIVQPESYELWKHRQDLAIVEHTEPRVAESQELSNWRD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 DIVLRRAALGLRLLPNLTAQCPTQPVSSGHCYNPKGCGTDAVPGSAFQSSAYHTQTQSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DIVLRRAALGLRLLPNLTAQCPTQPVSSGHCYNPKGCGTDAVPGSAFQSSAYHTQTQSLT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 LGMSARVLLPSTGSWGSGRGRGRGQGQGRGCSRGRGHGCCTRELGTEEPTVQPASKRRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LGMSARVLLPSTGSWGSGRGRGRGQGQGRGCSRGRGHGCCTRELGTEEPTVQPASKRRLL
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE3 MGTRSRAQGHRPQLPLANDLMTNLSL
::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MGTRSRAQGHRPQLPLANDLMTNLSL
490 500
>>CCDS8302.1 KDM4D gene_id:55693|Hs108|chr11 (523 aa)
initn: 2255 init1: 2117 opt: 2191 Z-score: 2228.8 bits: 422.0 E(32554): 8e-118
Smith-Waterman score: 2213; 67.4% identity (79.9% similar) in 512 aa overlap (1-499:4-494)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MKSVHSSPQNTSHTIMTFYPTMEEFADFNTYVAYMESQGAHQAGLAKVIPPKEWKAR
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CCDS83 METMKSKANCAQNPNCNIMIFHPTKEEFNDFDKYIAYMESQGAHRAGLAKIIPPKEWKAR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 QMYDDIEDILIATPLQQVTSGQGGVFTQYHKKKKAMRVGQYRRLANSKKYQTPPHRNFAD
. ::.: .::::::::::.::..::::::::::::: ::.::.::::::::::::.:: :
CCDS83 ETYDNISEILIATPLQQVASGRAGVFTQYHKKKKAMTVGEYRHLANSKKYQTPPHQNFED
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 LEQRYWKSHPGNPPIYGADISGSLFEESTKQWNLGHLGTILDLLEQECGVVIEGVNTPYL
::..:::.. : ::::::::::::.:.:::::::::::: ::::.::::::::::::::
CCDS83 LERKYWKNRIYNSPIYGADISGSLFDENTKQWNLGHLGTIQDLLEKECGVVIEGVNTPYL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 YFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKTWYVVPPEHGQHLERLARELFPDISRGCEA
:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::: :::: :
CCDS83 YFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHLGEPKTWYVVPPEHGQRLERLARELFPGSSRGCGA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 FLRHKVALISPTVLKENGIPFNCMTQEAGEFMVTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRW
:::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 FLRHKVALISPTVLKENGIPFNRITQEAGEFMVTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRW
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 IDYGKMASQCSCGESTVTFSMDPFVRIVQPESYELWKHRQDLAIVEHTEPRVAESQELSN
::::::::::::::. :::::: ::::.::: :.:::. :: :.:.: :::: :::::.
CCDS83 IDYGKMASQCSCGEARVTFSMDAFVRILQPERYDLWKRGQDRAVVDHMEPRVPASQELST
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KE3 WRDDIVLRRAALGLRLLPNLTAQCPTQPVS--SGHCYNPKGCGT----DAVPGSAFQ--S
.. . :::::::: ::. :. :.. :: . :.. .:: :.: : .
CCDS83 QKEVQLPRRAALGLRQLPSHWARHSPWPMAARSGTRCHTLVCSSLPRRSAVSGTATQPRA
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 SAYHTQ-----TQSLTLGMSARVLLPSTGSWGSGRGRGRGQGQGRGCSRGRGHGCCTREL
.: :.. : : : : ::... ::.: ::::: ..:
CCDS83 AAVHSSKKPSSTPSSTPGPSAQIIHPSNGR----RGRGRPP----------------QKL
430 440 450 460
470 480 490 500
pF1KE3 GTEEPTVQPASKRRLLMGTRSRAQGHRPQLPLANDLMTNLSL
..: :.: .:: :: :: :.: .:. :: .:
CCDS83 RAQELTLQTPAKRPLLAGTTCTASGPEPE-PLPEDGALMDKPVPLSPGLQHPVKASGCSW
470 480 490 500 510
CCDS83 APVP
520
>>CCDS12138.1 KDM4B gene_id:23030|Hs108|chr19 (1096 aa)
initn: 1793 init1: 1793 opt: 1804 Z-score: 1832.0 bits: 349.6 E(32554): 1e-95
Smith-Waterman score: 1804; 63.3% identity (82.7% similar) in 411 aa overlap (1-411:1-404)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MKSVHSSPQNTSHTIMTFYPTMEEFADFNTYVAYMESQGAHQAGLAKVIPPKEWKARQMY
: : . :: : :::: :::::: ::: ::::.::::::.:::::.::::::: :: :
CCDS12 MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPRQTY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DDIEDILIATPLQQVTSGQGGVFTQYHKKKKAMRVGQYRRLANSKKYQTPPHRNFADLEQ
:::.:..: .:.:::..::.:.::::. .:::: ::.:::::::.:: :: :..: :::.
CCDS12 DDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RYWKSHPGNPPIYGADISGSLFEESTKQWNLGHLGTILDLLEQECGVVIEGVNTPYLYFG
.:::. :::::::::::..... :::.: : ::::..:.:::..::::::::::::
CCDS12 KYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYLYFG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 MWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKTWYVVPPEHGQHLERLARELFPDISRGCEAFLR
:::::::::::::::::::::::::::.::..:::::..::::: .:: :.::.::::
CCDS12 MWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDAFLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 HKVALISPTVLKENGIPFNCMTQEAGEFMVTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRWIDY
::..:::: .::. ::::. .::::::::.::::::::::::::::::. :::: :::::
CCDS12 HKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWIDY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 GKMASQCSCGESTVTFSMDPFVRIVQPESYELWKHRQDLAIVEHTEPRVAESQELSNWRD
::.:.::.: .. : .::: ::::.::: :::::. .::....::.: . : :::.:
CCDS12 GKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSSWSA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 DIVLRRAALGLRLLPNLTAQCPTQPVSSGHCYNPKGCGTDAVPGSAFQSSAYHTQTQSLT
. ::.: .:: . . .:: .. . .:: : ... :.:. :
CCDS12 S----RASLKAKLL-RRSHRKRSQP-KKPKPEDPKFPG-EGTAGAALLEEAGGSVKEEAG
370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 LGMSARVLLPSTGSWGSGRGRGRGQGQGRGCSRGRGHGCCTRELGTEEPTVQPASKRRLL
CCDS12 PEVDPEEEEEEPQPLPHGREAEGAEEDGRGKLRPTKAKSERKKKSFGLLPPQLPPPPAHF
420 430 440 450 460 470
>>CCDS55286.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (813 aa)
initn: 1691 init1: 1691 opt: 1691 Z-score: 1719.0 bits: 328.3 E(32554): 2e-89
Smith-Waterman score: 1691; 64.8% identity (86.6% similar) in 352 aa overlap (7-358:8-359)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MKSVHSSPQNTSHTIMTFYPTMEEFADFNTYVAYMESQGAHQAGLAKVIPPKEWKARQM
:: : : :::: :.:::: .:: :.:::::.:::.::::::::::::: ::
CCDS55 MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 YDDIEDILIATPLQQVTSGQGGVFTQYHKKKKAMRVGQYRRLANSKKYQTPPHRNFADLE
::::...:: .:.::...::.:.::::. .:::: : ..:.:::: :: :: . .. :::
CCDS55 YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 QRYWKSHPGNPPIYGADISGSLFEESTKQWNLGHLGTILDLLEQECGVVIEGVNTPYLYF
..:::. :::::::.::...:.. .::...:.:.::..:.:::. :::::::::::
CCDS55 RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKTWYVVPPEHGQHLERLARELFPDISRGCEAFL
::::::::::::::::::::::::::::.::..:::::..:::::. .::. :.::.:::
CCDS55 GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 RHKVALISPTVLKENGIPFNCMTQEAGEFMVTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRWID
:::..::::.:::. ::::. .::::::::.::::::::::::::::::. :::: ::::
CCDS55 RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 YGKMASQCSCGESTVTFSMDPFVRIVQPESYELWKHRQDLAIVEHTEPRVAESQELSNWR
:::.:. :.: .. : .::: ::: ::. :.:::. .:. ..::.: : . :.. :
CCDS55 YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 DDIVLRRAALGLRLLPNLTAQCPTQPVSSGHCYNPKGCGTDAVPGSAFQSSAYHTQTQSL
CCDS55 QRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEEEVSDEVDGAEVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAV
370 380 390 400 410 420
>>CCDS55285.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (835 aa)
initn: 1691 init1: 1691 opt: 1691 Z-score: 1718.8 bits: 328.3 E(32554): 2e-89
Smith-Waterman score: 1691; 64.8% identity (86.6% similar) in 352 aa overlap (7-358:30-381)
10 20 30
pF1KE3 MKSVHSSPQNTSHTIMTFYPTMEEFADFNTYVAYMES
:: : : :::: :.:::: .:: :.:::::
CCDS55 MKHYGLPWKRTEEAAADTALTIMEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMES
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 QGAHQAGLAKVIPPKEWKARQMYDDIEDILIATPLQQVTSGQGGVFTQYHKKKKAMRVGQ
.:::.::::::::::::: :: ::::...:: .:.::...::.:.::::. .:::: : .
CCDS55 KGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQCYDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKE
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 YRRLANSKKYQTPPHRNFADLEQRYWKSHPGNPPIYGADISGSLFEESTKQWNLGHLGTI
.:.:::: :: :: . .. :::..:::. :::::::.::...:.. .::...:.:.
CCDS55 FRQLANSGKYCTPRYLDYEDLERKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTV
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 LDLLEQECGVVIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKTWYVVPPEHG
::..:.:::. :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::..:::::
CCDS55 LDVVEEECGISIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHG
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 QHLERLARELFPDISRGCEAFLRHKVALISPTVLKENGIPFNCMTQEAGEFMVTFPYGYH
..:::::. .::. :.::.::::::..::::.:::. ::::. .::::::::.:::::::
CCDS55 KRLERLAQGFFPSSSQGCDAFLRHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYH
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 AGFNHGFNCAEAINFATPRWIDYGKMASQCSCGESTVTFSMDPFVRIVQPESYELWKHRQ
:::::::::::. :::: :::::::.:. :.: .. : .::: ::: ::. :.:::. .
CCDS55 AGFNHGFNCAESTNFATVRWIDYGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGK
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 DLAIVEHTEPRVAESQELSNWRDDIVLRRAALGLRLLPNLTAQCPTQPVSSGHCYNPKGC
:. ..::.: : . :.. :
CCDS55 DIYTIDHTKPTPASTPEVKAWLQRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEEEVSDEVDGA
370 380 390 400 410 420
>>CCDS6471.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (1056 aa)
initn: 1691 init1: 1691 opt: 1691 Z-score: 1717.5 bits: 328.4 E(32554): 2.4e-89
Smith-Waterman score: 1691; 64.8% identity (86.6% similar) in 352 aa overlap (7-358:8-359)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MKSVHSSPQNTSHTIMTFYPTMEEFADFNTYVAYMESQGAHQAGLAKVIPPKEWKARQM
:: : : :::: :.:::: .:: :.:::::.:::.::::::::::::: ::
CCDS64 MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 YDDIEDILIATPLQQVTSGQGGVFTQYHKKKKAMRVGQYRRLANSKKYQTPPHRNFADLE
::::...:: .:.::...::.:.::::. .:::: : ..:.:::: :: :: . .. :::
CCDS64 YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 QRYWKSHPGNPPIYGADISGSLFEESTKQWNLGHLGTILDLLEQECGVVIEGVNTPYLYF
..:::. :::::::.::...:.. .::...:.:.::..:.:::. :::::::::::
CCDS64 RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKTWYVVPPEHGQHLERLARELFPDISRGCEAFL
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CCDS64 GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 RHKVALISPTVLKENGIPFNCMTQEAGEFMVTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRWID
:::..::::.:::. ::::. .::::::::.::::::::::::::::::. :::: ::::
CCDS64 RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 YGKMASQCSCGESTVTFSMDPFVRIVQPESYELWKHRQDLAIVEHTEPRVAESQELSNWR
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CCDS64 YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 DDIVLRRAALGLRLLPNLTAQCPTQPVSSGHCYNPKGCGTDAVPGSAFQSSAYHTQTQSL
CCDS64 QRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEEEVSDEVDGAEVPNPDSVTDDLKVSEKSEAAV
370 380 390 400 410 420
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10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MKSVHSSPQNTSHTIMTFYPTMEEFADFNTYVAYMESQGAHQAGLAKVIPPKEWKARQMY
: : : ::::::::::: .:. :.::.::::::.::::::.:::::: : :
CCDS49 MASESETLNPSARIMTFYPTMEEFRNFSRYIAYIESQGAHRAGLAKVVPPKEWKPRASY
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CCDS49 DDIDDLVIPAPIQQLVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVREFRKIANSDKYCTPRYSEFEELER
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pF1KE3 RYWKSHPGNPPIYGADISGSLFEESTKQWNLGHLGTILDLLEQECGVVIEGVNTPYLYFG
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CCDS49 KYWKNLTFNPPIYGADVNGTLYEKHVDEWNIGRLRTILDLVEKESGITIEGVNTPYLYFG
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CCDS49 MWKTSFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYSVPPEHGKRLERLAKGFFPGSAQSCEAFLR
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pF1KE3 HKVALISPTVLKENGIPFNCMTQEAGEFMVTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRWIDY
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CCDS49 HKMTLISPLMLKKYGIPFDKVTQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATRRWIEY
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310 320 330 340 350 360
pF1KE3 GKMASQCSCGESTVTFSMDPFVRIVQPESYELWKHRQDLAIVEHTEPRVAESQELSNWRD
::.: ::: .. : .::: ::: ::: :.::: .: ....:: :
CCDS49 GKQAVLCSCRKDMVKISMDVFVRKFQPERYKLWKAGKDNTVIDHTLPTPEAAEFLKESEL
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370 380 390 400 410 420
pF1KE3 DIVLRRAALGLRLLPNLTAQCPTQPVSSGHCYNPKGCGTDAVPGSAFQSSAYHTQTQSLT
CCDS49 PPRAGNEEECPEEDMEGVEDGEEGDLKTSLAKHRIGTKRHRVCLEIPQEVSQSELFPKED
360 370 380 390 400 410
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10 20 30 40 50
pF1KE3 MKSVHSSPQNTSHTIMTFYPTMEEFADFNTYVAYMESQGAHQAGLAKVIPPKEWKARQM
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CCDS78 MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
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pF1KE3 YDDIEDILIATPLQQVTSGQGGVFTQYHKKKKAMRVGQYRRLANSKKYQTPPHRNFADLE
::::...:: .:.::...::.:.::::. .:::: : ..:.:::: :: :: . .. :::
CCDS78 YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
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120 130 140 150 160 170
pF1KE3 QRYWKSHPGNPPIYGADISGSLFEESTKQWNLGHLGTILDLLEQECGVVIEGVNTPYLYF
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CCDS78 RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEVHSYLQ
130 140 150
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CCDS55 KQNLSPEEKRQSLTVLTRLISSFWAQAVLPPWPP----KVLG-LQEYATSGWNLN----V
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CCDS55 MPVLDQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVP
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pF1KE3 PEHGQHLERLARELFPDISRGCEAFLRHKVALISPTVLKENGIPFNCMTQEAGEFMVTFP
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CCDS55 SLAAEHLEEVMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFP
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pF1KE3 YGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRWIDYGKMASQCSCGESTV----TFSMDPFV-RIVQ-P
.::.:::.:.: :::.:: : :. :. :: . .:: . .. ... :
CCDS55 RAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGR---QCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFP
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:. .: .::.. : : . :: : .. . .. . : :::. ::
CCDS55 ETLDL-----NLAVAVHKEMFIM-VQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIK
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pF1KE3 --PTQPVSSGHCYN-PKGCGTDAVPGSAFQSSAYHTQTQSLTLGMSARVLLPSTGSWGSG
: .:. ::. : :
CCDS55 CKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAES
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: : .. . :.. .: .. : :
CCDS41 IPPLPDVPKGDWRCPKCVAEECSKPREAFGFEQAVREYTLQSFGEMADNFKSDYFNMPVH
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CCDS41 MVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVIVEYGADISSKDFGSGFPVKDGRRKILPEEEEYALSGW
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CCDS41 NLNNMPVLEQSVLAHINVDISGMKVPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTW
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CCDS41 YGVPSHAAEQLEEVMRELAPELFESQPDLLHQLVTIMNPNVLMEHGVPVYRTNQCAGEFV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]