Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3522
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3522, 712 aa
1>>>pF1KE3522 712 - 712 aa - 712 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5649+/-0.00101; mu= 13.4012+/- 0.060
mean_var=86.2483+/-17.207, 0's: 0 Z-trim(106.3): 54 B-trim: 509 in 1/48
Lambda= 0.138102
statistics sampled from 8840 (8894) to 8840 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.273), width: 16
Scan time: 3.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9053.1 USP44 gene_id:84101|Hs108|chr12 ( 712) 4847 976.1 0
CCDS69111.1 USP49 gene_id:25862|Hs108|chr6 ( 688) 2010 410.9 3.3e-114
CCDS4861.1 USP49 gene_id:25862|Hs108|chr6 ( 640) 1796 368.2 2.1e-101
CCDS58370.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 ( 476) 602 130.3 6.7e-30
CCDS32265.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 ( 520) 602 130.3 7.2e-30
CCDS14370.1 USP51 gene_id:158880|Hs108|chrX ( 711) 478 105.6 2.6e-22
CCDS42285.1 USP22 gene_id:23326|Hs108|chr17 ( 525) 315 73.1 1.2e-12
CCDS65260.1 USP27X gene_id:389856|Hs108|chrX ( 438) 310 72.1 2e-12
>>CCDS9053.1 USP44 gene_id:84101|Hs108|chr12 (712 aa)
initn: 4847 init1: 4847 opt: 4847 Z-score: 5218.4 bits: 976.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4847; 99.9% identity (100.0% similar) in 712 aa overlap (1-712:1-712)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MLAMDTCKHVGQLQLAQDHSSLNPQKWHCVDCNTTESIWACLSCSHVACGRYIEEHALKH
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CCDS90 MLAMDTCKHVGQLQLAQDHSSLNPQKWHCVDCNTTESIWACLSCSHVACGRYIEEHALKH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 FQESSHPVALEVNEMYVFCYLCDDYVLNDNATGDLKLLRRTLSAIKSQNYHCTTRSGRFL
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 FQESSHPVALEVNEMYVFCYLCDDYVLNDNTTGDLKLLRRTLSAIKSQNYHCTTRSGRFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RSMGTGDDSYFLHDGAQSLLQSEDQLYTALWHRRRILMGKIFRTWFEQSPIGRKKQEEPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 RSMGTGDDSYFLHDGAQSLLQSEDQLYTALWHRRRILMGKIFRTWFEQSPIGRKKQEEPF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 QEKIVVKREVKKRRQELEYQVKAELESMPPRKSLRLQGLAQSTIIEIVSVQVPAQTPASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 QEKIVVKREVKKRRQELEYQVKAELESMPPRKSLRLQGLAQSTIIEIVSVQVPAQTPASP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 AKDKVLSTSENEISQKVSDSSVKRRPIVTPGVTGLRNLGNTCYMNSVLQVLSHLLIFRQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 AKDKVLSTSENEISQKVSDSSVKRRPIVTPGVTGLRNLGNTCYMNSVLQVLSHLLIFRQC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 FLKLDLNQWLAMTASEKTRSCKHPPVTDTVVYQMNECQEKDTGFVCSRQSSLSSGLSGGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 FLKLDLNQWLAMTASEKTRSCKHPPVTDTVVYQMNECQEKDTGFVCSRQSSLSSGLSGGA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SKGRKMELIQPKEPTSQYISLCHELHTLFQVMWSGKWALVSPFAMLHSVWRLIPAFRGYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 SKGRKMELIQPKEPTSQYISLCHELHTLFQVMWSGKWALVSPFAMLHSVWRLIPAFRGYA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 QQDAQEFLCELLDKIQRELETTGTSLPALIPTSQRKLIKQVLNVVNNIFHGQLLSQVTCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 QQDAQEFLCELLDKIQRELETTGTSLPALIPTSQRKLIKQVLNVVNNIFHGQLLSQVTCL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 ACDNKSNTIEPFWDLSLEFPERYQCSGKDIASQPCLVTEMLAKFTETEALEGKIYVCDQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 ACDNKSNTIEPFWDLSLEFPERYQCSGKDIASQPCLVTEMLAKFTETEALEGKIYVCDQC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 NSKRRRFSSKPVVLTEAQKQLMICHLPQVLRLHLKRFRWSGRNNREKIGVHVGFEEILNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 NSKRRRFSSKPVVLTEAQKQLMICHLPQVLRLHLKRFRWSGRNNREKIGVHVGFEEILNM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 EPYCCRETLKSLRPECFIYDLSAVVMHHGKGFGSGHYTAYCYNSEGGFWVHCNDSKLSMC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 EPYCCRETLKSLRPECFIYDLSAVVMHHGKGFGSGHYTAYCYNSEGGFWVHCNDSKLSMC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KE3 TMDEVCKAQAYILFYTQRVTENGHSKLLPPELLLGSQHPNEDADTSSNEILS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 TMDEVCKAQAYILFYTQRVTENGHSKLLPPELLLGSQHPNEDADTSSNEILS
670 680 690 700 710
>>CCDS69111.1 USP49 gene_id:25862|Hs108|chr6 (688 aa)
initn: 2753 init1: 958 opt: 2010 Z-score: 2163.8 bits: 410.9 E(32554): 3.3e-114
Smith-Waterman score: 2796; 59.5% identity (79.1% similar) in 709 aa overlap (4-702:1-680)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MLAMDTCKHVGQLQLAQDHSSLNPQKWHCVDCNTTESIWACLSCSHVACGRYIEEHALKH
:: :::::.:.:::::: :::::: :..: ::::.::::.:::::::::::.:::::
CCDS69 MDRCKHVGRLRLAQDHSILNPQKWCCLECATTESVWACLKCSHVACGRYIEDHALKH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 FQESSHPVALEVNEMYVFCYLCDDYVLNDNATGDLKLLRRTLSAIKSQNYHCTTRSGRFL
:.:..::.:.:: ..::::::: ::::::: ::::::: .: :...:. .: :: :
CCDS69 FEETGHPLAMEVRDLYVFCYLCKDYVLNDNPEGDLKLLRSSLLAVRGQKQDTPVRRGRTL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RSMGTGDDSYFLHDGAQSLLQSEDQLYTALWHRRRILMGKIFRTWFEQSPIGRKKQEEPF
:::..:.: . : :.. :. ::::.::. :... .: :::.: :. : :.
CCDS69 RSMASGEDVVL----PQRAPQGQPQMLTALWYRRQRLLARTLRLWFEKSSRGQAKLEQRR
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE3 QEKIVVKR--EVKKRRQELEYQVKAELESMPPRKSLRLQGLAQSTIIEIVSVQVPAQTPA
::. . .. :...::.:.. .. :: : ::::: :: ...: ..
CCDS69 QEEALERKKEEARRRRREVKRRLLEELASTPPRKSARLL------------LHTPRDAGP
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SPAKDKVLSTSENEISQKVSDSSVK--RRPIVTPGVTGLRNLGNTCYMNSVLQVLSHLLI
. .. .: : :..: ...: :.: ..:::::::::::::::::.:::::::
CCDS69 AASRPAALPT-----SRRVPAATLKLRRQPAMAPGVTGLRNLGNTCYMNSILQVLSHLQK
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 FRQCFLKLD---LNQWLAMTASEKTRSCKHPPVTDTVVYQMNECQEKDTGFVCSRQSSLS
::.:::.:: .. . ... ::. .: :.. . ... ..: . .: :..
CCDS69 FRECFLNLDPSKTEHLFPKATNGKTQLSGKP--TNSSATELS--LRNDRAEACEREGFC-
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 SGLSGGASKGRKMELIQPKEPTSQYISLCHELHTLFQVMWSGKWALVSPFAMLHSVWRLI
.: :: .:..:::: :::.:..::::.::::::.:::::::::::::::::::: ::
CCDS69 --WNGRASISRSLELIQNKEPSSKHISLCRELHTLFRVMWSGKWALVSPFAMLHSVWSLI
340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 PAFRGYAQQDAQEFLCELLDKIQRELETTGTSLPALIPTSQRKLIKQVLNVVNNIFHGQL
:::::: :::::::::::: :.:.:::. ::. ::: ::::: ::::.:::.::::::
CCDS69 PAFRGYDQQDAQEFLCELLHKVQQELESEGTTRRILIPFSQRKLTKQVLKVVNTIFHGQL
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 LSQVTCLACDNKSNTIEPFWDLSLEFPERYQCSGKD---IASQPCLVTEMLAKFTETEAL
::::::..:. :::::::::::::::::::.: : . . ::.:::::::::::::
CCDS69 LSQVTCISCNYKSNTIEPFWDLSLEFPERYHCIEKGFVPLNQTECLLTEMLAKFTETEAL
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 EGKIYVCDQCNSKRRRFSSKPVVLTEAQKQLMICHLPQVLRLHLKRFRWSGRNNREKIGV
::.::.:::::::::. . ::.::.::.::::: .::::::::::::::::::.::::::
CCDS69 EGRIYACDQCNSKRRKSNPKPLVLSEARKQLMIYRLPQVLRLHLKRFRWSGRNHREKIGV
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 HVGFEEILNMEPYCCRETLKSLRPECFIYDLSAVVMHHGKGFGSGHYTAYCYNSEGGFWV
:: :...:.:::::::. :.:: : : :::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS69 HVVFDQVLTMEPYCCRDMLSSLDKETFAYDLSAVVMHHGKGFGSGHYTAYCYNTEGGFWV
570 580 590 600 610 620
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 HCNDSKLSMCTMDEVCKAQAYILFYTQRVTENGHSKLLPPELLLGSQHPNEDADTSSNEI
:::::::..:...::::.:::::::::: : .:.... .: : :.:
CCDS69 HCNDSKLNVCSVEEVCKTQAYILFYTQR-TVQGNARISETHLQAQVQSSNNDEGRPQTFS
630 640 650 660 670 680
pF1KE3 LS
>>CCDS4861.1 USP49 gene_id:25862|Hs108|chr6 (640 aa)
initn: 2554 init1: 803 opt: 1796 Z-score: 1933.9 bits: 368.2 E(32554): 2.1e-101
Smith-Waterman score: 2582; 59.8% identity (79.1% similar) in 654 aa overlap (4-647:1-626)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MLAMDTCKHVGQLQLAQDHSSLNPQKWHCVDCNTTESIWACLSCSHVACGRYIEEHALKH
:: :::::.:.:::::: :::::: :..: ::::.::::.:::::::::::.:::::
CCDS48 MDRCKHVGRLRLAQDHSILNPQKWCCLECATTESVWACLKCSHVACGRYIEDHALKH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 FQESSHPVALEVNEMYVFCYLCDDYVLNDNATGDLKLLRRTLSAIKSQNYHCTTRSGRFL
:.:..::.:.:: ..::::::: ::::::: ::::::: .: :...:. .: :: :
CCDS48 FEETGHPLAMEVRDLYVFCYLCKDYVLNDNPEGDLKLLRSSLLAVRGQKQDTPVRRGRTL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RSMGTGDDSYFLHDGAQSLLQSEDQLYTALWHRRRILMGKIFRTWFEQSPIGRKKQEEPF
:::..:.: . : :.. :. ::::.::. :... .: :::.: :. : :.
CCDS48 RSMASGEDVVL----PQRAPQGQPQMLTALWYRRQRLLARTLRLWFEKSSRGQAKLEQRR
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE3 QEKIVVKR--EVKKRRQELEYQVKAELESMPPRKSLRLQGLAQSTIIEIVSVQVPAQTPA
::. . .. :...::.:.. .. :: : ::::: :: ...: ..
CCDS48 QEEALERKKEEARRRRREVKRRLLEELASTPPRKSARLL------------LHTPRDAGP
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SPAKDKVLSTSENEISQKVSDSSVK--RRPIVTPGVTGLRNLGNTCYMNSVLQVLSHLLI
. .. .: : :..: ...: :.: ..:::::::::::::::::.:::::::
CCDS48 AASRPAALPT-----SRRVPAATLKLRRQPAMAPGVTGLRNLGNTCYMNSILQVLSHLQK
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 FRQCFLKLD---LNQWLAMTASEKTRSCKHPPVTDTVVYQMNECQEKDTGFVCSRQSSLS
::.:::.:: .. . ... ::. .: :.. . ... ..: . .: :..
CCDS48 FRECFLNLDPSKTEHLFPKATNGKTQLSGKP--TNSSATELS--LRNDRAEACEREGFC-
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 SGLSGGASKGRKMELIQPKEPTSQYISLCHELHTLFQVMWSGKWALVSPFAMLHSVWRLI
.: :: .:..:::: :::.:..::::.::::::.:::::::::::::::::::: ::
CCDS48 --WNGRASISRSLELIQNKEPSSKHISLCRELHTLFRVMWSGKWALVSPFAMLHSVWSLI
340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 PAFRGYAQQDAQEFLCELLDKIQRELETTGTSLPALIPTSQRKLIKQVLNVVNNIFHGQL
:::::: :::::::::::: :.:.:::. ::. ::: ::::: ::::.:::.::::::
CCDS48 PAFRGYDQQDAQEFLCELLHKVQQELESEGTTRRILIPFSQRKLTKQVLKVVNTIFHGQL
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 LSQVTCLACDNKSNTIEPFWDLSLEFPERYQCSGKD---IASQPCLVTEMLAKFTETEAL
::::::..:. :::::::::::::::::::.: : . . ::.:::::::::::::
CCDS48 LSQVTCISCNYKSNTIEPFWDLSLEFPERYHCIEKGFVPLNQTECLLTEMLAKFTETEAL
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 EGKIYVCDQCNSKRRRFSSKPVVLTEAQKQLMICHLPQVLRLHLKRFRWSGRNNREKIGV
::.::.:::::::::. . ::.::.::.::::: .::::::::::::::::::.::::::
CCDS48 EGRIYACDQCNSKRRKSNPKPLVLSEARKQLMIYRLPQVLRLHLKRFRWSGRNHREKIGV
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 HVGFEEILNMEPYCCRETLKSLRPECFIYDLSAVVMHHGKGFGSGHYTAYCYNSEGGFWV
:: :...:.:::::::. :.:: : : :::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS48 HVVFDQVLTMEPYCCRDMLSSLDKETFAYDLSAVVMHHGKGFGSGHYTAYCYNTEGGACA
570 580 590 600 610 620
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 HCNDSKLSMCTMDEVCKAQAYILFYTQRVTENGHSKLLPPELLLGSQHPNEDADTSSNEI
CCDS48 LLCGVGDTERG
630 640
>>CCDS58370.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 (476 aa)
initn: 650 init1: 191 opt: 602 Z-score: 650.3 bits: 130.3 E(32554): 6.7e-30
Smith-Waterman score: 710; 32.2% identity (58.5% similar) in 482 aa overlap (218-687:65-476)
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 REVKKRRQELEYQVKAELESMPPRKSLRLQGLAQSTIIEIVSVQVPAQTPASPAKDKVLS
::.:.. .. ... : : : :.:
CCDS58 NKSPWVCLTCSSVHCGSYRCDDFVVNDTKLGLVQKVREHLQNLENSAFTADRHKKRKLLE
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 TSE-NEISQKVSDSSVKRRPIVTPGVTGLRNLGNTCYMNSVLQVLSHLLIFRQCFLKLDL
.: : ::. :. .. .::::::::::.::..:: ::.. : :..:
CCDS58 NSTLNSKLLKVNGST------TAICATGLRNLGNTCFMNAILQSLSNIEQF-CCYFK---
100 110 120 130 140
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 NQWLAMTASEKTRSCKHPPVTDTVVYQMNECQEKDTGFVCSRQSSLSSGLSGGASKGRKM
. : : : .: . ::.
CCDS58 ---------------ELPAVE----------------------------LRNGKTAGRR-
150 160
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 ELIQPKEPTSQYISLCHELHTLFQVMWSGKWALVSPFAMLHSVWRLIPAFRGYAQQDAQE
. . .. .:: .:.. . ..:.:. . :: .... ::...: :::: ::::.:
CCDS58 -TYHTRSQGDNNVSLVEEFRKTLCALWQGSQTAFSPESLFYVVWKIMPNFRGYQQQDAHE
170 180 190 200 210
430 440 450 460 470
pF1KE3 FLCELLDKIQRELET--TGTSLPALIP------TSQRKLIKQVLNVVNNIFHGQLLSQVT
:. :::... ::. .:.: :.. .:.. :. . .::. :: : : ..:.
CCDS58 FMRYLLDHLHLELQGGFNGVSRSAILQENSTLSASNKCCINGASTVVTAIFGGILQNEVN
220 230 240 250 260 270
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 CLACDNKSNTIEPFWDLSLEFPERYQCS-GKDIASQP-CLVTEMLAKFTETEAL-EGKIY
:: : ..: ..:: ::::..: ... . .:. . : : . . : .::. : : : ..:
CCDS58 CLICGTESRKFDPFLDLSLDIPSQFRSKRSKNQENGPVCSLRDCLRSFTDLEELDETELY
280 290 300 310 320 330
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 VCDQCNSKRRRFSSKPVVLTEAQKQLMICHLPQVLRLHLKRFRWSGRNNREKIGVHVGFE
.: .:..:.. . :.. : .::.:: ::::::.:.. :.:. ..: :
CCDS58 MCHKCKKKQK-----------STKKFWIQKLPKVLCLHLKRFHWTAYL-RNKVDTYVEFP
340 350 360 370 380
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 EILNMEPYCCRETLKSLRPECFIYDLSAVVMHHGKGFGSGHYTAYCYNSEGGFWVHCNDS
. ... : .. :: .:::.:::.:::.: :::::::: .. : : : :::
CCDS58 -LRGLDMKCYLLEPENSGPESCLYDLAAVVVHHGSGVGSGHYTAY--ATHEGRWFHFNDS
390 400 410 420 430 440
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 KLSMCTMDEVCKAQAYILFYTQRVTENGHSKLLPPELLLGSQHPNEDADTSSNEILS
... . : ::.::::::... .. : .::
CCDS58 TVTLTDEETVVKAKAYILFYVEHQAKAGSDKL
450 460 470
>>CCDS32265.1 USP3 gene_id:9960|Hs108|chr15 (520 aa)
initn: 721 init1: 191 opt: 602 Z-score: 649.7 bits: 130.3 E(32554): 7.2e-30
Smith-Waterman score: 724; 27.0% identity (50.0% similar) in 712 aa overlap (7-687:3-520)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MLAMDTCKHVGQ-LQLAQDHSSL---NPQKWHCVDCNTTESIWACLSCSHVACGRYIEEH
: :... . .: : ... .:..: : : ...: :.::.:: : ::::.. :
CCDS32 MECPHLSSSVCIAPDSAKFPNGSPSSWCCSVCRSNKSPWVCLTCSSVHCGRYVNGH
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE3 ALKHFQESS----------------HPVALEVNEMYVFCYLCDDYVLNDNATGDLKLLRR
: ::..... : : .. . . ..:: :::.:.::. : .. .:.
CCDS32 AKKHYEDAQVPLTNHKKSEKQDKVQHTVCMDCSSYSTYCYRCDDFVVNDTKLGLVQKVRE
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 TLSAIKSQNYHCTTRSGRFLRSMGTGDDSYFLHDGAQSLLQSEDQLYTALWHRRRILMGK
: :: :.. .:: :..: :.
CCDS32 HL-----QNL--------------------------------ENSAFTADRHKKRKLL--
120 130
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 IFRTWFEQSPIGRKKQEEPFQEKIVVKREVKKRRQELEYQVKAELESMPPRKSLRLQGLA
:.: .. : :...:
CCDS32 ------ENSTLNSKL--------------------------------------LKVNG--
140 150
230 240 250 260 270 280
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: ... .::::::::
CCDS32 -------------------------------------STTAI--------CATGLRNLGN
160
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 TCYMNSVLQVLSHLLIFRQCFLKLDLNQWLAMTASEKTRSCKHPPVTDTVVYQMNECQEK
::.::..:: ::.. : :..: . : :
CCDS32 TCFMNAILQSLSNIEQF-CCYFK------------------ELPAVE-------------
170 180 190
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 DTGFVCSRQSSLSSGLSGGASKGRKMELIQPKEPTSQYISLCHELHTLFQVMWSGKWALV
: .: . ::. . . .. .:: .:.. . ..:.:. .
CCDS32 ---------------LRNGKTAGRRT--YHTRSQGDNNVSLVEEFRKTLCALWQGSQTAF
200 210 220 230
410 420 430 440 450
pF1KE3 SPFAMLHSVWRLIPAFRGYAQQDAQEFLCELLDKIQRELET--TGTSLPALIP------T
:: .... ::...: :::: ::::.::. :::... ::. .:.: :.. .
CCDS32 SPESLFYVVWKIMPNFRGYQQQDAHEFMRYLLDHLHLELQGGFNGVSRSAILQENSTLSA
240 250 260 270 280 290
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 SQRKLIKQVLNVVNNIFHGQLLSQVTCLACDNKSNTIEPFWDLSLEFPERYQCS-GKDIA
:.. :. . .::. :: : : ..:.:: : ..: ..:: ::::..: ... . .:.
CCDS32 SNKCCINGASTVVTAIFGGILQNEVNCLICGTESRKFDPFLDLSLDIPSQFRSKRSKNQE
300 310 320 330 340 350
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. : : . . : .::. : : : ..:.: .:..:.. . :.. : .::.:
CCDS32 NGPVCSLRDCLRSFTDLEELDETELYMCHKCKKKQK-----------STKKFWIQKLPKV
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: ::::::.:.. :.:. ..: : . ... : .. :: .:::.:::.:::
CCDS32 LCLHLKRFHWTAYL-RNKVDTYVEFP-LRGLDMKCYLLEPENSGPESCLYDLAAVVVHHG
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.: :::::::: .. : : : ::: ... . : ::.::::::... .. : .::
CCDS32 SGVGSGHYTAYA--THEGRWFHFNDSTVTLTDEETVVKAKAYILFYVEHQAKAGSDKL
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CCDS14 VSHQ---QFMTSGFEDKQSTCETKEQEPKLVKPKKKRRKKSVYTVGLRGLINLGNTCFMN
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..:.:.:. .... :: :.: . : .. . . : .:
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350 360 370 380 390 400
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: :. .::..:.::. . :. .
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410 420 430 440 450 460
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:: .: . :: ::::.::: .:: ..:. . . . : :. .: :
CCDS14 LHLIWIHAEHLAGYRQQDAHEFLIAILDVLHRHSKDDSGGQEANNPNCCNCIIDQ-----
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470 480 490 500 510
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:: : : :.::: :: . :.::.: ::.::..: :: . . ..: :
CCDS14 --IFTGGLQSDVTCQACHSVSTTIDPCWDISLDLPGSCATFDSQNPERADSTVSRDDHIP
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. : : :. : ::. : : .. . :..:.: . :. ::: . .:: :
CCDS14 GIPSL-TDCLQWFTRPEHLGSSAKIKCNSCQSYQ-----------ESTKQLTMKKLPIVA
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580 590 600 610 620
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.:::::. :.. :.::.. ..: :.: :. .:. .: .: .: :.:
CCDS14 CFHLKRFEHVGKQ-RRKINTFISFPLELDMTPFLASTKESRMKEGQPPTDCVPNENKYSL
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630 640 650 660 670 680
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::. ::: . :::::.. ... : :.:. .. :.... ...:.::: .. :
CCDS14 FAVINHHGT-LESGHYTSFIRQQKDQ-WFSCDDAIITKATIEDLLYSEGYLLFYHKQGLE
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690 700 710
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CCDS14 KD
710
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CCDS42 ALTHTPLLRDFFL------------SDRHR--------------------------CEMQ
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CCDS42 S-----------------------PSSCLV--C-EMSSLFQEFYSGHRSPHIPYKLLHLV
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410 420 430 440 450 460
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: . :: ::::.::: :: ..:. . .. : :. .: : ::
CCDS42 WTHARHLAGYEQQDAHEFLIAALDVLHRHCKGDDNGKKANNPNHCNCIIDQ-------IF
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CCDS42 TGGLQSDVTCQVCHGVSTTIDPFWDISLDLPGSSTPFWPLSPGSEGNVVNGESHVSGTTT
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.:. : .::. : : .. . :. :.: . :. ::: . .:: : .:::
CCDS42 LTDCLRRFTRPEHLGSSAKIKCSGCHSYQ-----------ESTKQLTMKKLPIVACFHLK
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::. :.. :.:: ..:.: :.: :. : . . .: . :.: :::
CCDS42 RFEHSAKL-RRKITTYVSFPLELDMTPFMASSKESRMNGQYQQPTDSLNNDNKYSLFAVV
420 430 440 450 460
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CCDS42 NHQGT-LESGHYTSFIRQHKDQ-WFKCDDAIITKASIKDVLDSEGYLLFYHKQFLEYE
470 480 490 500 510 520
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10 20 30
230 240 250 260 270 280
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40 50 60 70 80
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:: :. .::. ..::. . :.
CCDS65 VC-------------------------------------EMSSLFRELYSGNPSPHVPYK
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