FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3512, 612 aa
1>>>pF1KE3512 612 - 612 aa - 612 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0906+/-0.00186; mu= 18.3020+/- 0.113
mean_var=290.9895+/-53.393, 0's: 0 Z-trim(106.7): 941 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.075186
statistics sampled from 8105 (9138) to 8105 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.593), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 3.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS65096.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 612) 4356 487.5 2.2e-137
CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 4281 479.3 6.3e-135
CCDS6755.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 584) 4155 465.6 8e-131
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 2097 242.5 1.4e-63
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 2090 241.8 2.4e-63
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 2073 240.2 1e-62
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 2073 240.3 1e-62
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 2050 237.5 4.8e-62
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 2034 235.7 1.5e-61
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 2023 234.4 3.4e-61
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 2020 234.3 4.9e-61
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 2019 234.1 5.1e-61
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 2019 234.2 5.2e-61
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 2017 234.0 6.1e-61
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 2017 234.0 6.1e-61
CCDS12505.1 ZNF571 gene_id:51276|Hs108|chr19 ( 609) 2013 233.3 7.1e-61
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 2004 232.3 1.4e-60
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 2004 232.4 1.5e-60
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 2004 232.4 1.5e-60
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 2004 232.4 1.5e-60
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1985 230.4 6.2e-60
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1971 228.7 1.6e-59
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1971 228.8 1.7e-59
CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 1965 228.2 2.8e-59
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1965 228.3 2.9e-59
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1948 226.7 1.2e-58
CCDS59381.1 ZNF573 gene_id:126231|Hs108|chr19 ( 665) 1940 225.5 1.8e-58
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1939 225.6 2.3e-58
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 1936 224.9 2.3e-58
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 1936 225.0 2.4e-58
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 1936 225.1 2.5e-58
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1939 225.8 2.5e-58
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1939 225.8 2.5e-58
CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029) 1924 224.1 7.3e-58
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 1921 223.6 8.4e-58
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1915 222.6 1.1e-57
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1915 222.8 1.2e-57
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 1917 223.3 1.2e-57
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1911 222.5 1.7e-57
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 1911 222.5 1.8e-57
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 1908 222.5 2.7e-57
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1900 221.1 3.5e-57
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 1899 221.1 4.1e-57
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 1899 221.1 4.3e-57
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1890 220.0 7.6e-57
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1890 220.0 7.7e-57
CCDS33026.2 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 641) 1887 219.7 9.5e-57
CCDS46079.1 ZNF780A gene_id:284323|Hs108|chr19 ( 642) 1887 219.7 9.5e-57
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1884 219.4 1.2e-56
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1884 219.5 1.3e-56
>>CCDS65096.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 (612 aa)
initn: 4356 init1: 4356 opt: 4356 Z-score: 2579.8 bits: 487.5 E(32554): 2.2e-137
Smith-Waterman score: 4356; 100.0% identity (100.0% similar) in 612 aa overlap (1-612:1-612)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MASPSPPPESKEEWDYLDPAQRSLYKDVMMENYGNLVSLDVLNRDKDEEPTVKQEIEEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 MASPSPPPESKEEWDYLDPAQRSLYKDVMMENYGNLVSLDVLNRDKDEEPTVKQEIEEIE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 EEVEPQGVIVTRIKSEIDQDPMGRETFELVGRLDKQRGIFLWEIPRESLTQEQRMFRENT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EEVEPQGVIVTRIKSEIDQDPMGRETFELVGRLDKQRGIFLWEIPRESLTQEQRMFRENT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 NIIRKRPNSEEKCHKCEECGKGFVRKAHFIQHQRVHTGEKPFQCNECGKSFSRSSFVIEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 NIIRKRPNSEEKCHKCEECGKGFVRKAHFIQHQRVHTGEKPFQCNECGKSFSRSSFVIEH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 QRIHTGERPYECNYCGKTFSVSSTLIRHQRIHTGERPYQCNQCKQSFSQRRSLVKHQRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 QRIHTGERPYECNYCGKTFSVSSTLIRHQRIHTGERPYQCNQCKQSFSQRRSLVKHQRIH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 TGEKPHKCSDCGKAFSWKSHLIEHQRTHTGEKPYHCTKCKKSFSRNSLLVEHQRIHTGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 TGEKPHKCSDCGKAFSWKSHLIEHQRTHTGEKPYHCTKCKKSFSRNSLLVEHQRIHTGER
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 PHKCGECGKAFRLSTYLIQHQKIHTGEKPFLCIECGKSFSRSSFLIEHQRIHTGERPYQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PHKCGECGKAFRLSTYLIQHQKIHTGEKPFLCIECGKSFSRSSFLIEHQRIHTGERPYQC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 KECGKSFSQLCNLTRHQRIHTGDKPHKCEECGKAFSRSSGLIQHQRIHTREKTYPYNETK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 KECGKSFSQLCNLTRHQRIHTGDKPHKCEECGKAFSRSSGLIQHQRIHTREKTYPYNETK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 ESFDPNCSLVIQQEVYPKEKSYKCDECGKTFSVSAHLVQHQRIHTGEKPYLCTVCGKSFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 ESFDPNCSLVIQQEVYPKEKSYKCDECGKTFSVSAHLVQHQRIHTGEKPYLCTVCGKSFS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 RSSFLIEHQRIHTGERPYLCRQCGKSFSQLCNLIRHQGVHTGNKPHKCDECGKAFSRNSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 RSSFLIEHQRIHTGERPYLCRQCGKSFSQLCNLIRHQGVHTGNKPHKCDECGKAFSRNSG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 LIQHQRIHTGEKPYKCEKCDKSFSQQRSLVNHQKIHAEVKTQETHECDACGEAFNCRISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LIQHQRIHTGEKPYKCEKCDKSFSQQRSLVNHQKIHAEVKTQETHECDACGEAFNCRISL
550 560 570 580 590 600
610
pF1KE3 IQHQKLHTAWMQ
::::::::::::
CCDS65 IQHQKLHTAWMQ
610
>>CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 (626 aa)
initn: 4281 init1: 4281 opt: 4281 Z-score: 2535.8 bits: 479.3 E(32554): 6.3e-135
Smith-Waterman score: 4318; 97.8% identity (97.8% similar) in 626 aa overlap (1-612:1-626)
10 20 30 40
pF1KE3 MASPSPPPESK--------------EEWDYLDPAQRSLYKDVMMENYGNLVSLDVLNRDK
::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MASPSPPPESKGLLTFEDVAVFFTQEEWDYLDPAQRSLYKDVMMENYGNLVSLDVLNRDK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 DEEPTVKQEIEEIEEEVEPQGVIVTRIKSEIDQDPMGRETFELVGRLDKQRGIFLWEIPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 DEEPTVKQEIEEIEEEVEPQGVIVTRIKSEIDQDPMGRETFELVGRLDKQRGIFLWEIPR
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 ESLTQEQRMFRENTNIIRKRPNSEEKCHKCEECGKGFVRKAHFIQHQRVHTGEKPFQCNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 ESLTQEQRMFRENTNIIRKRPNSEEKCHKCEECGKGFVRKAHFIQHQRVHTGEKPFQCNE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 CGKSFSRSSFVIEHQRIHTGERPYECNYCGKTFSVSSTLIRHQRIHTGERPYQCNQCKQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 CGKSFSRSSFVIEHQRIHTGERPYECNYCGKTFSVSSTLIRHQRIHTGERPYQCNQCKQS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 FSQRRSLVKHQRIHTGEKPHKCSDCGKAFSWKSHLIEHQRTHTGEKPYHCTKCKKSFSRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 FSQRRSLVKHQRIHTGEKPHKCSDCGKAFSWKSHLIEHQRTHTGEKPYHCTKCKKSFSRN
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 SLLVEHQRIHTGERPHKCGECGKAFRLSTYLIQHQKIHTGEKPFLCIECGKSFSRSSFLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 SLLVEHQRIHTGERPHKCGECGKAFRLSTYLIQHQKIHTGEKPFLCIECGKSFSRSSFLI
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 EHQRIHTGERPYQCKECGKSFSQLCNLTRHQRIHTGDKPHKCEECGKAFSRSSGLIQHQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 EHQRIHTGERPYQCKECGKSFSQLCNLTRHQRIHTGDKPHKCEECGKAFSRSSGLIQHQR
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 IHTREKTYPYNETKESFDPNCSLVIQQEVYPKEKSYKCDECGKTFSVSAHLVQHQRIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 IHTREKTYPYNETKESFDPNCSLVIQQEVYPKEKSYKCDECGKTFSVSAHLVQHQRIHTG
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 EKPYLCTVCGKSFSRSSFLIEHQRIHTGERPYLCRQCGKSFSQLCNLIRHQGVHTGNKPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 EKPYLCTVCGKSFSRSSFLIEHQRIHTGERPYLCRQCGKSFSQLCNLIRHQGVHTGNKPH
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 KCDECGKAFSRNSGLIQHQRIHTGEKPYKCEKCDKSFSQQRSLVNHQKIHAEVKTQETHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 KCDECGKAFSRNSGLIQHQRIHTGEKPYKCEKCDKSFSQQRSLVNHQKIHAEVKTQETHE
550 560 570 580 590 600
590 600 610
pF1KE3 CDACGEAFNCRISLIQHQKLHTAWMQ
::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 CDACGEAFNCRISLIQHQKLHTAWMQ
610 620
>>CCDS6755.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 (584 aa)
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Smith-Waterman score: 4155; 100.0% identity (100.0% similar) in 584 aa overlap (29-612:1-584)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MASPSPPPESKEEWDYLDPAQRSLYKDVMMENYGNLVSLDVLNRDKDEEPTVKQEIEEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MMENYGNLVSLDVLNRDKDEEPTVKQEIEEIE
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 EEVEPQGVIVTRIKSEIDQDPMGRETFELVGRLDKQRGIFLWEIPRESLTQEQRMFRENT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 EEVEPQGVIVTRIKSEIDQDPMGRETFELVGRLDKQRGIFLWEIPRESLTQEQRMFRENT
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 NIIRKRPNSEEKCHKCEECGKGFVRKAHFIQHQRVHTGEKPFQCNECGKSFSRSSFVIEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 NIIRKRPNSEEKCHKCEECGKGFVRKAHFIQHQRVHTGEKPFQCNECGKSFSRSSFVIEH
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 QRIHTGERPYECNYCGKTFSVSSTLIRHQRIHTGERPYQCNQCKQSFSQRRSLVKHQRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 QRIHTGERPYECNYCGKTFSVSSTLIRHQRIHTGERPYQCNQCKQSFSQRRSLVKHQRIH
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 TGEKPHKCSDCGKAFSWKSHLIEHQRTHTGEKPYHCTKCKKSFSRNSLLVEHQRIHTGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 TGEKPHKCSDCGKAFSWKSHLIEHQRTHTGEKPYHCTKCKKSFSRNSLLVEHQRIHTGER
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 PHKCGECGKAFRLSTYLIQHQKIHTGEKPFLCIECGKSFSRSSFLIEHQRIHTGERPYQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 PHKCGECGKAFRLSTYLIQHQKIHTGEKPFLCIECGKSFSRSSFLIEHQRIHTGERPYQC
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 KECGKSFSQLCNLTRHQRIHTGDKPHKCEECGKAFSRSSGLIQHQRIHTREKTYPYNETK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 KECGKSFSQLCNLTRHQRIHTGDKPHKCEECGKAFSRSSGLIQHQRIHTREKTYPYNETK
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 ESFDPNCSLVIQQEVYPKEKSYKCDECGKTFSVSAHLVQHQRIHTGEKPYLCTVCGKSFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 ESFDPNCSLVIQQEVYPKEKSYKCDECGKTFSVSAHLVQHQRIHTGEKPYLCTVCGKSFS
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 RSSFLIEHQRIHTGERPYLCRQCGKSFSQLCNLIRHQGVHTGNKPHKCDECGKAFSRNSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 RSSFLIEHQRIHTGERPYLCRQCGKSFSQLCNLIRHQGVHTGNKPHKCDECGKAFSRNSG
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 LIQHQRIHTGEKPYKCEKCDKSFSQQRSLVNHQKIHAEVKTQETHECDACGEAFNCRISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LIQHQRIHTGEKPYKCEKCDKSFSQQRSLVNHQKIHAEVKTQETHECDACGEAFNCRISL
520 530 540 550 560 570
610
pF1KE3 IQHQKLHTAWMQ
::::::::::::
CCDS67 IQHQKLHTAWMQ
580
>>CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 (688 aa)
initn: 2025 init1: 2025 opt: 2097 Z-score: 1255.2 bits: 242.5 E(32554): 1.4e-63
Smith-Waterman score: 2168; 51.5% identity (77.5% similar) in 590 aa overlap (24-608:30-610)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MASPSPPPESKEEWDYLDPAQRSLYKDVMMENYGNLVSLDVLNR--DKDEEPTV
::.:::.:::.::::::. .: .:: :
CCDS12 MARKLVMFRDVAIDFSQEEWECLDSAQRDLYRDVMLENYSNLVSLDLPSRCASKDLSP--
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
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CCDS12 --EKNTYETELS-QWEMSDRLENCDLEESNSRDYLEAKGKMEKQQEN-QKEYFRQGMIIY
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE3 QRM--FRENTNIIRK-RPNSEEKCHKCEECGKGFVRKAHFIQHQRVHTGEKPFQCNECGK
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CCDS12 DKMSIFNQHTYLSQHSRCHSTEKPYKCKECGKAFRRASHLTQHQSIHTGEKPYECKQCGK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
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CCDS12 AFSRDSQLSLHQRLHTGEKPYACKECGKAFTQSSQLILHHRIHTGEKPYKCEECGKAFIR
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pF1KE3 RRSLVKHQRIHTGEKPHKCSDCGKAFSWKSHLIEHQRTHTGEKPYHCTKCKKSFSRNSLL
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CCDS12 SSQLTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLHQRLHTGEKLYECKECRKVFTQLSQL
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CCDS12 ILHKRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGEKPYECKECGRAFIRGSLLMQHQ
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CCDS12 RIHTGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECKECGKMFSHGSQLTQHQRIHT
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CCDS12 GEKPYQCKECGKAFNRGSLLTRHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGSELTQHERIHTGEKP
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CCDS12 YECKECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECRMAFTQSSHLSQHQRLHTGEKPYVCN
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CCDS12 ECGKAFARGLLLIQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFIRGSQLTQHQRIHT---GEKPYECKE
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CCDS12 CGKAFSHGSQLTLHQRIHTGEKPYECRECRKAFTQSSHLSRHQRIHTGEKPYQCKECGKA
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. : .. .:: . .. . : .. .... :. . :: . .. :..
CCDS46 LSPEVIVEKHKRDDSWSSNLLESWEYEGSLERQQANQQTLPKEIKVTEKTIPSWEKGPVN
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: :. . . .. . : :. .: ...:.: ..: :..: ::.::::.:
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CCDS46 GRAFNQNIHLTQHKRIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCEKTF
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CCDS74 FRRRSKLTQHQRIHTGEKPYRCHECGKAFVRFSGLTKHHSIHTGEKPYECKTCGKSFRQR
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CCDS74 IQHQKMYTDERPHECQESVKAFRPSAHLIQHWRIHTGDKPYECKECGKSFTSGSTLNQHQ
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CCDS74 GEKPYDCKECGKSFTFHSALIRHQRIHTGEKPYDCKECGKSFTFRSGLIGHQAIHTGEKP
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CCDS74 YDCKECGKSFTAGSTLIQHQRIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKPYCCK
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CCDS74 KPYECKTCGKSFRQRTHLTLHQRIHTGDRPYECKECGKSFTCGSELIRHQRTHTGEKPYD
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CCDS74 CKECGKAFRCPSQLSQHKRIHTGEKTYQCPECGKAFFYASGLSRHQSVHTGEKPYECKTC
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CCDS74 GKAFKQLTQLTRHQRIHDLT
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CCDS59 CGKSFTFHSALIRHQRIHTGEKPYDCKECGKSFTFRSGLIGHQAIHTGEKPYDC-KECGK
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CCDS59 SFTAGSTLIQHQRIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKPYCCKECGKSFTF
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CCDS59 RSTRNRHQRIHTGEKPYNCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKPYHCKECGKSFTFRSGL
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CCDS59 IGHQAVHTGEKPYDCKECGKSFTSRSALIQHQRIHTGEKPYHCKECGKSFTVGSTLLQHQ
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CCDS59 QIHTGEKPYDCKECGKAFRLRLRLTQHQQIHTGEKPYQCQECGKAFVSVSGLTQHHRIHT
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CCDS59 GEKPYECPDCGKAFRQRTYLNQHRRIHTGEKPYECKECGKSFTFCSGLIQHQQNHTDEKP
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CCDS59 YDGKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKPYDCKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKLYDCK
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pF1KE3 VCGKSFSRSSFLIEHQRIHTGERPYLCRQCGKSFSQLCNLIRHQGVHTGNKPHKCDECGK
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CCDS59 ECGKSFTSHSTLIQHQPLHTGEKPYHCKECGKSFTLRSALIQHRPVHTGEKRYSCKECGK
790 800 810 820 830 840
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 AFSRNSGLIQHQRIHTGEKPYKCEKCDKSFSQQRSLVNHQKIHAEVKTQETHECDACGEA
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CCDS59 SFTSRSTLIEHQRIHTGEKPYHCKECGKSFAFRSAIIQHRRIHT---GEKPYDCKECGKA
850 860 870 880 890 900
600 610
pF1KE3 FNCRISLIQHQKLHTAWMQ
: : .: :::..::
CCDS59 FRRRSKLTQHQRIHTGEKPYRCHECGKAFVRFSGLTKHHSIHTGEKPYECKTCGKSFRQR
910 920 930 940 950 960
>--
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10 20 30 40 50
pF1KE3 MASPSPPPESKEEWDYLDPAQRSLYKDVMMENYGNLVSLDVLNRDKDEEPTVK
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CCDS59 MNMEGLVMFQDLSIDFSQEEWECLDAAQKDLYRDVMMENYSSLVSLGLSIPKPDVISLLE
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pF1KE3 QEIEE--IEEEVEPQGVIVTRIKSEIDQDPMGRETFELVG----RLDKQRGIFLWEIPRE
: : . ..: .... . .. . .: .:... :..: ... . :.
CCDS59 QGKEPWMVSRDVLGGWCRDSEFRCKTKDSCLPKEIYEVTSSQWVRMEKCHSLVGSSV-RD
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 SLTQEQRMFRENTNIIRKRPNSEEKCHKCEECGKGFVRKAHFIQHQRVHTGEKPFQCNEC
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CCDS59 D--WECKGQFQHQDINQER--YLEKAIMTYETTPTFCLQTSLTLHHRIHPGEKLYKSTEC
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 GKSFSRSSFVIEHQRIHTGERPYECNYCGKTFSVSSTLIRHQRIHTGERPYQCNQCKQSF
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CCDS59 -MAFKYGSELTQQQETHTGEKLYKCKECGKAFHHFSYLVKHQRIHTGEKPCACKEYGKAF
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 SQRRSLVKHQRIHTGEKPHKCSDCGKAFSWKSHLIEHQRTHTGEKPYHCTKCKKSFSRNS
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CCDS59 ISGSHLIQHQKMYTDERPHECQESVKAFRPSAHLIQHWRIHTGDKPYECKECGKSFTSGS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 LLVEHQRIHTGERPHKCGECGKAFRLSTYLIQHQKIHTGEKPFLCIECGKSFSRSSFLIE
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CCDS59 TLNQHQQIHTGEKPYHCKQCGKSFTVGSTLIRHQQIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALIR
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 HQRIHTGERPYQCKECGKSFSQLCNLTRHQRIHTGDKPHKCEECGKAFSRSSGLIQHQRI
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CCDS59 HQRIHTGEKPYDCKECGKSFTFHSALIRHQRIHTGEKPYDCKECGKSFTFRSGLIGHQAI
360 370 380 390 400 410
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pF1KE3 HTREKTYPYNETKESFDPNCSLVIQQEVYPKEKSYKCDECGKTFSVSAHLVQHQRIHTGE
CCDS59 HTGEKPYDCKECGKSFTAGSTLIQHQRIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGE
420 430 440 450 460 470
>--
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CCDS59 HTGEKPYDCKECGKAFRRRSKLTQHQRIHTGEKPYRCHECGKAFVRFSGLTKHHSIHTGE
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250 260 270 280 290 300
pF1KE3 KPHKCSDCGKAFSWKSHLIEHQRTHTGEKPYHCTKCKKSFSRNSLLVEHQRIHTGERPHK
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CCDS59 KPYECKTCGKSFRQRTHLTLHQRIHTGDRPYECKECGKSFTCGSELIRHQRTHTGEKPYD
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pF1KE3 CGECGKAFRLSTYLIQHQKIHTGEKPFLCIECGKSFSRSSFLIEHQRIHTGERPYQCKEC
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CCDS59 CKECGKAFRCPSQLSQHKRIHTGEKTYQCPECGKAFFYASGLSRHQSVHTGEKPYECKTC
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pF1KE3 GKSFSQLCNLTRHQRIHTGDKPHKCEECGKAFSRSSGLIQHQRIHTREKTYPYNETKESF
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CCDS59 GKAFKQLTQLTRHQRIHDLT
1080 1090
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CCDS31 SLIKHQSRHIRDIAFGCGNCGKTFPQKSQFITHHRTHTGEKPYNCSQCGKAFSQKSQLTS
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CCDS31 HQRTHTGEKPYECGECGKAFSRKSHLISHWRTHTGEKPYGCNECGRAFSEKSNLINHQRI
290 300 310 320 330 340
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 HTGERPYQCNQCKQSFSQRRSLVKHQRIHTGEKPHKCSDCGKAFSWKSHLIEHQRTHTGE
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CCDS31 HTGEKPFECRECGKAFSRKSQLVTHHRTHTGTKPFGCSDCRKAFFEKSELIRHQTIHTGE
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pF1KE3 KPYHCTKCKKSFSRNSLLVEHQRIHTGERPHKCGECGKAFRLSTYLIQHQKIHTGEKPFL
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CCDS31 KPYECSECRKAFRERSSLINHQRTHTGEKPHGCIQCGKAFSQKSHLISHQMTHTGEKPFI
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pF1KE3 CIECGKSFSRSSFLIEHQRIHTGERPYQCKECGKSFSQLCNLTRHQRIHTGDKPHKCEEC
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CCDS31 CSKCGKAFSRKSQLVRHQRTHTGEKPYECSECGKAFSEKLSLTNHQRIHTGEKPYVCSEC
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pF1KE3 GKAFSRSSGLIQHQRIHTREKTYPYNETKESFDPNCSLVIQQEVYPKEKSYKCDECGKTF
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CCDS31 GKAFCQKSHLISHQRTHTGEKPYECSECGKAFGEKSSLATHQRTHTGEKPYECRDCEKAF
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460 470 480 490 500 510
pF1KE3 SVSAHLVQHQRIHTGEKPYLCTVCGKSFSRSSFLIEHQRIHTGERPYLCRQCGKSFSQLC
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CCDS31 SQKSQLNTHQRIHTGEKPYECSLCRKAFFEKSELIRHLRTHTGEKPYECNECRKAFREKS
590 600 610 620 630 640
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 NLIRHQGVHTGNKPHKCDECGKAFSRNSGLIQHQRIHTGEKPYKCEKCDKSFSQQRSLVN
.:: :: .:::.:: .:.::::::::.: :: ::: ::::::: : .: :.:::. .:::
CCDS31 SLINHQRIHTGEKPFECSECGKAFSRKSHLIPHQRTHTGEKPYGCSECRKAFSQKSQLVN
650 660 670 680 690 700
580 590 600 610
pF1KE3 HQKIHAEVKTQETHECDACGEAFNCRISLIQHQKLHTAWMQ
::.::. .. ..: ::.::. . .::.::. ::
CCDS31 HQRIHT---GEKPYRCIECGKAFSQKSQLINHQRTHTVKKS
710 720 730
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10 20 30 40 50
pF1KE3 MASPSPPPESKEEWDYLDPAQRSLYKDVMMENYGNLVSLDVLNR--DKDEEP
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10 20 30 40 50 60
60 70 80
pF1KE3 TVKQEIEE------IE--EEVEPQGVIVTRI-KSEID-----QDPMGR-------ETFEL
:... : .: : . :. .. :. : .: : . .:
CCDS46 KGKNNMGEAFYTVKLERLESCDTVGLSFQEVQKNTYDFECQWKDDEGNYKTVLMLQKENL
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130
pF1KE3 VGR-------------LDKQRGI-FLWEIPR-ESLTQEQRMFRENTNIIRKRPNSEEKCH
:: ...: :. : ..:. ... .: .... : ..: ::.. : .
CCDS46 PGRRAQRDRRAAGNRHIENQLGVSFQSHLPELQQFQHEGKIYEYNQ--VEKSPNNRGKHY
130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 KCEECGKGFVRKAHFIQHQRVHTGEKPFQCNECGKSFS-RSSFVIEHQRIHTGERPYECN
::.:::: : ..... .:.:.::::::.:::.:::.:. ::...: :: :::::.::.::
CCDS46 KCDECGKVFSQNSRLTSHKRIHTGEKPYQCNKCGKAFTVRSNLTI-HQVIHTGEKPYKCN
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pF1KE3 YCGKTFSVSSTLIRHQRIHTGERPYQCNQCKQSFSQRRSLVKHQRIHTGEKPHKCSDCGK
:::.:: :.: ::::::::.::.::.: ..: . .:. :: :::::::.::..:::
CCDS46 ECGKVFSQPSNLAGHQRIHTGEKPYKCNECGKAFRAHSKLTTHQVIHTGEKPYKCKECGK
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 AFSWKSHLIEHQRTHTGEKPYHCTKCKKSFSRNSLLVEHQRIHTGERPHKCGECGKAFRL
:. .::: :.: :::::::.:..: :.:: : :. :: :::::.:.::.::::.::
CCDS46 CFTQNSHLASHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRH
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 STYLIQHQKIHTGEKPFLCIECGKSFSRSSFLIEHQRIHTGERPYQCKECGKSFSQLCNL
..:: .:..:::::::. : ::::.:: : : .:: :::::.:..:.:: : :.: .:
CCDS46 NSYLAKHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTKHQIIHTGEKPFKCNECVKVFTQYSHL
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 TRHQRIHTGDKPHKCEECGKAFSRSSGLIQHQRIHTREKTYPYNETKESFDPNCSLVIQQ
. :.:::::.::..:.::::::: :.: :: ::: :: : :. . : : :. ..
CCDS46 ANHRRIHTGEKPYRCDECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGEKPYKCNDCGKVFTQNSHLASHR
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KE3 EVYPKEKSYKCDECGKTFSVSAHLVQHQRIHTGEKPYLCTVCGKSFSRSSFLIEHQRIHT
.. :: ::::::::.:: ...:..: :.::::::: :. :::.:: : : :: :::
CCDS46 GIHSGEKPYKCDECGKAFSQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNECGKAFSVHSSLTIHQTIHT
480 490 500 510 520 530
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pF1KE3 GERPYLCRQCGKSFSQLCNLIRHQGVHTGNKPHKCDECGKAFSRNSGLIQHQRIHTGEKP
:..:: : .::: : . : :: .:::.::.::.::::::: .:.: :: :::::::
CCDS46 GQKPYKCNDCGKVFRHNSYLAIHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSVHSNLATHQVIHTGEKP
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KE3 YKCEKCDKSFSQQRSLVNHQKIHAEVKTQETHECDACGEAFNCRISLIQHQKLHTAWMQ
:::..: : :.:. :.::..::. .. ..:. ::.::. : .: :. .::
CCDS46 YKCNECGKVFTQNSHLANHRRIHT---GEKPYRCNECGKAFSVRSTLTTHMAVHTGDKPY
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CCDS46 KCNQCGKVFTQNSNLAKHRRIHSG
660 670
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Smith-Waterman score: 2023; 46.7% identity (72.9% similar) in 606 aa overlap (10-607:24-618)
10 20 30 40
pF1KE3 MASPSPPPESKEEWDYLDPAQRSLYKDVMMENYGNLVSLDVLNRDK
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CCDS46 MAHKYVGLQYHGSVTFEDVAIAFSQQEWESLDSSQRGLYRDVMLENYRNLVSMG-HSRSK
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pF1KE3 DEEPTVKQEIEEIEEEVEPQGV-IVTRIKSEID-----QDPMGRE--TFELVGRLDKQRG
. .. .. .: : :. .: : .. : : . : ... .: : ....:.
CCDS46 PHVIALLEQWKEPEVTVRKDGRRWCTDLQLEDDTIGCKEMPTSENCPSFALHQKISRQK-
60 70 80 90 100 110
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pF1KE3 IFLWEIPRESLTQEQRMFRENTNIIRKRPNSEEKCHKCEECGKGFVRKAHFIQHQRVHTG
::: . . ... . ..: .: :: ..:.::::.: .. :::.:.:
CCDS46 ------PRECQEYGKTLCQDSKPVQHERIHSSEKPNRCKECGKNFSNGHQLTIHQRLHVG
120 130 140 150 160 170
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pF1KE3 EKPFQCNECGKSFSRSSFVIEHQRIHTGERPYECNYCGKTFSVSSTLIRHQRIHTGERPY
:::.. ..:::.: .: ..: ::::::.: .:. ::::.: : : :. ::::..::
CCDS46 EKPYKYEKCGKAFISGSAFVKHGRIHTGEKPLKCKQCGKTISGSYQLTVHKSIHTGKKPY
180 190 200 210 220 230
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pF1KE3 QCNQCKQSFSQRRSLVKHQRIHTGEKPHKCSDCGKAFSWKSHLIEHQRTHTGEKPYHCTK
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CCDS46 ECGECGKAFLVYGKLTRHQSTHTGEKPFGCEECGKAFSTFSYLVQHQRIHTSEKPYECKE
240 250 260 270 280 290
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pF1KE3 CKKSFSRNSLLVEHQRIHTGERPHKCGECGKAFRLSTYLIQHQKIHTGEKPFLCIECGKS
: :.:: .: :..::::::::.:..: ::::.: . : .::.:::::::: : ::::.
CCDS46 CGKAFSTSSPLAKHQRIHTGEKPYECKECGKSFTVYGQLTRHQSIHTGEKPFECKECGKA
300 310 320 330 340 350
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pF1KE3 FSRSSFLIEHQRIHTGERPYQCKECGKSFSQLCNLTRHQRIHTGDKPHKCEECGKAFSRS
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CCDS46 FRLSSFLHAHQRIHAEIKPYGCKECGRTFSRASYLVQHGRLHTGEKPYECKECGKAFSTG
360 370 380 390 400 410
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pF1KE3 SGLIQHQRIHTREKTYPYNETKESFDPNCSLVIQQEVYPKEKSYKCDECGKTFSVSAHLV
: :.::::::: :: : .: ..: .:...:.:. :: :.: ::::.: : .::.
CCDS46 SYLVQHQRIHTGEKPYECKECGKAFISRHQLTVHQRVHTGEKPYECKECGKAFRVHVHLT
420 430 440 450 460 470
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pF1KE3 QHQRIHTGEKPYLCTVCGKSFSRSSFLIEHQRIHTGERPYLCRQCGKSFSQLCNLIRHQG
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CCDS46 QHRKIHTDVKPYECKECGKTFSRASYLVQHSRIHTGKKPYECKECGKAFSSGSYLVQHQR
480 490 500 510 520 530
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pF1KE3 VHTGNKPHKCDECGKAFSRNSGLIQHQRIHTGEKPYKCEKCDKSFSQQRSLVNHQKIHAE
.:::.::..:..:::::. . :: :: .::::::..:..: :.: . :..::..:.
CCDS46 IHTGEKPYECNKCGKAFTVYGQLIGHQSVHTGEKPFECKECGKAFRLNSFLTEHQRVHT-
540 550 560 570 580 590
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pF1KE3 VKTQETHECDACGEAFNCRISLIQHQKLHTAWMQ
.. .: ::..: .: : . :
CCDS46 --GEKPFKCKKCGKTFRYSSALKVHLRKHMSVIP
600 610 620
612 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 19:00:21 2016 done: Fri Nov 4 19:00:21 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]