FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3486, 1792 aa
1>>>pF1KE3486 1792 - 1792 aa - 1792 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.9149+/-0.000572; mu= -22.5973+/- 0.036
mean_var=725.5423+/-148.920, 0's: 0 Z-trim(123.6): 90 B-trim: 855 in 1/55
Lambda= 0.047615
statistics sampled from 43473 (43579) to 43473 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.768), E-opt: 0.2 (0.511), width: 16
Scan time: 19.910
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_008841 (OMIM: 600938) E3 ubiquitin-protein liga (1792) 11889 833.5 0
NP_061173 (OMIM: 600938) E3 ubiquitin-protein liga (1758) 7278 516.7 7.6e-145
NP_116015 (OMIM: 600938) E3 ubiquitin-protein liga ( 118) 654 60.8 9.3e-09
XP_016855518 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 819) 409 44.6 0.0047
XP_016855517 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 819) 409 44.6 0.0047
XP_016855504 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 863) 409 44.6 0.0049
XP_016855516 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 820) 408 44.5 0.0049
XP_005245778 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 902) 409 44.6 0.005
XP_016855503 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 864) 408 44.6 0.0051
XP_016855507 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 903) 408 44.6 0.0053
XP_016855514 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 821) 406 44.4 0.0054
XP_016855515 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 821) 406 44.4 0.0054
XP_016855502 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 865) 406 44.4 0.0056
NP_005830 (OMIM: 605975) serine/arginine repetitiv ( 904) 406 44.4 0.0058
XP_016855508 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 901) 401 44.1 0.0074
>>NP_008841 (OMIM: 600938) E3 ubiquitin-protein ligase R (1792 aa)
initn: 11889 init1: 11889 opt: 11889 Z-score: 4433.2 bits: 833.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 11889; 100.0% identity (100.0% similar) in 1792 aa overlap (1-1792:1-1792)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSCVHYKFSSKLNYDTVTFDGLHISLCDLKKQIMGREKLKAADCDLQITNAQTKEEYTDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 MSCVHYKFSSKLNYDTVTFDGLHISLCDLKKQIMGREKLKAADCDLQITNAQTKEEYTDD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 NALIPKNSSVIVRRIPIGGVKSTSKTYVISRTEPAMATTKAIDDSSASISLAQLTKTANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 NALIPKNSSVIVRRIPIGGVKSTSKTYVISRTEPAMATTKAIDDSSASISLAQLTKTANL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 AEANASEEDKIKAMMSQSGHEYDPINYMKKPLGPPPPSYTCFRCGKPGHYIKNCPTNGDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 AEANASEEDKIKAMMSQSGHEYDPINYMKKPLGPPPPSYTCFRCGKPGHYIKNCPTNGDK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NFESGPRIKKSTGIPRSFMMEVKDPNMKGAMLTNTGKYAIPTIDAEAYAIGKKEKPPFLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 NFESGPRIKKSTGIPRSFMMEVKDPNMKGAMLTNTGKYAIPTIDAEAYAIGKKEKPPFLP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EEPSSSSEEDDPIPDELLCLICKDIMTDAVVIPCCGNSYCDECIRTALLESDEHTCPTCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 EEPSSSSEEDDPIPDELLCLICKDIMTDAVVIPCCGNSYCDECIRTALLESDEHTCPTCH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 QNDVSPDALIANKFLRQAVNNFKNETGYTKRLRKQLPPPPPPIPPPRPLIQRNLQPLMRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 QNDVSPDALIANKFLRQAVNNFKNETGYTKRLRKQLPPPPPPIPPPRPLIQRNLQPLMRS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 PISRQQDPLMIPVTSSSTHPAPSISSLTSNQSSLAPPVSGNPSSAPAPVPDITATVSISV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 PISRQQDPLMIPVTSSSTHPAPSISSLTSNQSSLAPPVSGNPSSAPAPVPDITATVSISV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 HSEKSDGPFRDSDNKILPAAALASEHSKGTSSIAITALMEEKGYQVPVLGTPSLLGQSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 HSEKSDGPFRDSDNKILPAAALASEHSKGTSSIAITALMEEKGYQVPVLGTPSLLGQSLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 HGQLIPTTGPVRINTARPGGGRPGWEHSNKLGYLVSPPQQIRRGERSCYRSINRGRHHSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 HGQLIPTTGPVRINTARPGGGRPGWEHSNKLGYLVSPPQQIRRGERSCYRSINRGRHHSE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 RSQRTQGPSLPATPVFVPVPPPPLYPPPPHTLPLPPGVPPPQFSPQFPPGQPPPAGYSVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 RSQRTQGPSLPATPVFVPVPPPPLYPPPPHTLPLPPGVPPPQFSPQFPPGQPPPAGYSVP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 PPGFPPAPANLSTPWVSSGVQTAHSNTIPTTQAPPLSREEFYREQRRLKEEEKKKSKLDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 PPGFPPAPANLSTPWVSSGVQTAHSNTIPTTQAPPLSREEFYREQRRLKEEEKKKSKLDE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 FTNDFAKELMEYKKIQKERRRSFSRSKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 FTNDFAKELMEYKKIQKERRRSFSRSKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 RSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 RSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 PNKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDMKAYYGRSVDFRDPFEKERYREWERKYREWYEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 PNKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDMKAYYGRSVDFRDPFEKERYREWERKYREWYEK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 YYKGYAAGAQPRPSANRENFSPERFLPLNIRNSPFTRGRREDYVGGQSHRSRNIGSNYPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 YYKGYAAGAQPRPSANRENFSPERFLPLNIRNSPFTRGRREDYVGGQSHRSRNIGSNYPE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 KLSARDGHNQKDNTKSKEKESENAPGDGKGNKHKKHRKRRKGEESEGFLNPELLETSRKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 KLSARDGHNQKDNTKSKEKESENAPGDGKGNKHKKHRKRRKGEESEGFLNPELLETSRKS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 REPTGVEENKTDSLFVLPSRDDATPVRDEPMDAESITFKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 REPTGVEENKTDSLFVLPSRDDATPVRDEPMDAESITFKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 RKNDGSAVSKKENIVKPAKGPQEKVDGERERSPRSEPPIKKAKEETPKTDNTKSSSSSQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 RKNDGSAVSKKENIVKPAKGPQEKVDGERERSPRSEPPIKKAKEETPKTDNTKSSSSSQK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 DEKITGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDYSKDVKSEKLTTKEEKAKKPNEKNKPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 DEKITGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDYSKDVKSEKLTTKEEKAKKPNEKNKPL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 DNKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSMKISKLEVTEIVKPSPKRKMEPDTEKMDRTPEKDKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 DNKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSMKISKLEVTEIVKPSPKRKMEPDTEKMDRTPEKDKI
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 SLSAPAKKIKLNRETGKKIGSTENISNTKEPSEKLESTSSKVKQEKVKGKVRRKVTGTEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 SLSAPAKKIKLNRETGKKIGSTENISNTKEPSEKLESTSSKVKQEKVKGKVRRKVTGTEG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 SSSTLVDYTSTSSTGGSPVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 SSSTLVDYTSTSSTGGSPVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 WDKDDFESEEEDVKSTQPISSVGKPASVIKNVSTKPSNIVKYPEKESEPSEKIQKFTKDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 WDKDDFESEEEDVKSTQPISSVGKPASVIKNVSTKPSNIVKYPEKESEPSEKIQKFTKDV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE3 SHEIIQHEVKSSKNSASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 SHEIIQHEVKSSKNSASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNF
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE3 KSLSQSSKEARTSDKHDSTRASSNKDFTPNRDKKTDYDTREYSSSKRRDEKNELTRRKDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 KSLSQSSKEARTSDKHDSTRASSNKDFTPNRDKKTDYDTREYSSSKRRDEKNELTRRKDS
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE3 PSRNKDSASGQKNKPREERDLPKKGTGDSKKSNSSPSRDRKPHDHKATYDTKRPNEETKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 PSRNKDSASGQKNKPREERDLPKKGTGDSKKSNSSPSRDRKPHDHKATYDTKRPNEETKS
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE3 VDKNPCKDREKHVLEARNNKESSGNKLLYILNPPETQVEKEQITGQIDKSTVKPKPQLSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 VDKNPCKDREKHVLEARNNKESSGNKLLYILNPPETQVEKEQITGQIDKSTVKPKPQLSH
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE3 SSRLSSDLTRETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEESSGNISKDLKDKIVEKAKESLDTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 SSRLSSDLTRETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEESSGNISKDLKDKIVEKAKESLDTA
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE3 AVVQVGISRNQSHSSPSVSPSRSHSPSGSQTRSHSSSASSAESQDSKKKKKKKEKKKHKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 AVVQVGISRNQSHSSPSVSPSRSHSPSGSQTRSHSSSASSAESQDSKKKKKKKEKKKHKK
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE3 HKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 HKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSVTV
1750 1760 1770 1780 1790
>>NP_061173 (OMIM: 600938) E3 ubiquitin-protein ligase R (1758 aa)
initn: 7214 init1: 7214 opt: 7278 Z-score: 2721.4 bits: 516.7 E(85289): 7.6e-145
Smith-Waterman score: 11596; 98.1% identity (98.1% similar) in 1792 aa overlap (1-1792:1-1758)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSCVHYKFSSKLNYDTVTFDGLHISLCDLKKQIMGREKLKAADCDLQITNAQTKEEYTDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 MSCVHYKFSSKLNYDTVTFDGLHISLCDLKKQIMGREKLKAADCDLQITNAQTKEEYTDD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 NALIPKNSSVIVRRIPIGGVKSTSKTYVISRTEPAMATTKAIDDSSASISLAQLTKTANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 NALIPKNSSVIVRRIPIGGVKSTSKTYVISRTEPAMATTKAIDDSSASISLAQLTKTANL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 AEANASEEDKIKAMMSQSGHEYDPINYMKKPLGPPPPSYTCFRCGKPGHYIKNCPTNGDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 AEANASEEDKIKAMMSQSGHEYDPINYMKKPLGPPPPSYTCFRCGKPGHYIKNCPTNGDK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NFESGPRIKKSTGIPRSFMMEVKDPNMKGAMLTNTGKYAIPTIDAEAYAIGKKEKPPFLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 NFESGPRIKKSTGIPRSFMMEVKDPNMKGAMLTNTGKYAIPTIDAEAYAIGKKEKPPFLP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EEPSSSSEEDDPIPDELLCLICKDIMTDAVVIPCCGNSYCDECIRTALLESDEHTCPTCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 EEPSSSSEEDDPIPDELLCLICKDIMTDAVVIPCCGNSYCDECIRTALLESDEHTCPTCH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 QNDVSPDALIANKFLRQAVNNFKNETGYTKRLRKQLPPPPPPIPPPRPLIQRNLQPLMRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 QNDVSPDALIANKFLRQAVNNFKNETGYTKRLRKQLPPPPPPIPPPRPLIQRNLQPLMRS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 PISRQQDPLMIPVTSSSTHPAPSISSLTSNQSSLAPPVSGNPSSAPAPVPDITATVSISV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 PISRQQDPLMIPVTSSSTHPAPSISSLTSNQSSLAPPVSGNPSSAPAPVPDITATVSISV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 HSEKSDGPFRDSDNKILPAAALASEHSKGTSSIAITALMEEKGYQVPVLGTPSLLGQSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 HSEKSDGPFRDSDNKILPAAALASEHSKGTSSIAITALMEEKGYQVPVLGTPSLLGQSLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 HGQLIPTTGPVRINTARPGGGRPGWEHSNKLGYLVSPPQQIRRGERSCYRSINRGRHHSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 HGQLIPTTGPVRINTARPGGGRPGWEHSNKLGYLVSPPQQIRRGERSCYRSINRGRHHSE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 RSQRTQGPSLPATPVFVPVPPPPLYPPPPHTLPLPPGVPPPQFSPQFPPGQPPPAGYSVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 RSQRTQGPSLPATPVFVPVPPPPLYPPPPHTLPLPPGVPPPQFSPQFPPGQPPPAGYSVP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 PPGFPPAPANLSTPWVSSGVQTAHSNTIPTTQAPPLSREEFYREQRRLKEEEKKKSKLDE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 PPGFPPAPANLSTPWVSSGVQTAHSNTIPTTQAPPLSREEFYREQRRLKEE---------
610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 FTNDFAKELMEYKKIQKERRRSFSRSKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 -------------------------SKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFS
660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 RSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 RSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQS
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 PNKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDMKAYYGRSVDFRDPFEKERYREWERKYREWYEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 PNKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDMKAYYGRSVDFRDPFEKERYREWERKYREWYEK
750 760 770 780 790 800
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 YYKGYAAGAQPRPSANRENFSPERFLPLNIRNSPFTRGRREDYVGGQSHRSRNIGSNYPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 YYKGYAAGAQPRPSANRENFSPERFLPLNIRNSPFTRGRREDYVGGQSHRSRNIGSNYPE
810 820 830 840 850 860
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 KLSARDGHNQKDNTKSKEKESENAPGDGKGNKHKKHRKRRKGEESEGFLNPELLETSRKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 KLSARDGHNQKDNTKSKEKESENAPGDGKGNKHKKHRKRRKGEESEGFLNPELLETSRKS
870 880 890 900 910 920
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 REPTGVEENKTDSLFVLPSRDDATPVRDEPMDAESITFKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 REPTGVEENKTDSLFVLPSRDDATPVRDEPMDAESITFKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTK
930 940 950 960 970 980
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 RKNDGSAVSKKENIVKPAKGPQEKVDGERERSPRSEPPIKKAKEETPKTDNTKSSSSSQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 RKNDGSAVSKKENIVKPAKGPQEKVDGERERSPRSEPPIKKAKEETPKTDNTKSSSSSQK
990 1000 1010 1020 1030 1040
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 DEKITGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDYSKDVKSEKLTTKEEKAKKPNEKNKPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 DEKITGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDYSKDVKSEKLTTKEEKAKKPNEKNKPL
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 DNKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSMKISKLEVTEIVKPSPKRKMEPDTEKMDRTPEKDKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 DNKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSMKISKLEVTEIVKPSPKRKMEPDTEKMDRTPEKDKI
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 SLSAPAKKIKLNRETGKKIGSTENISNTKEPSEKLESTSSKVKQEKVKGKVRRKVTGTEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SLSAPAKKIKLNRETGKKIGSTENISNTKEPSEKLESTSSKVKQEKVKGKVRRKVTGTEG
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 SSSTLVDYTSTSSTGGSPVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SSSTLVDYTSTSSTGGSPVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSK
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 WDKDDFESEEEDVKSTQPISSVGKPASVIKNVSTKPSNIVKYPEKESEPSEKIQKFTKDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 WDKDDFESEEEDVKSTQPISSVGKPASVIKNVSTKPSNIVKYPEKESEPSEKIQKFTKDV
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE3 SHEIIQHEVKSSKNSASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SHEIIQHEVKSSKNSASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNF
1350 1360 1370 1380 1390 1400
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE3 KSLSQSSKEARTSDKHDSTRASSNKDFTPNRDKKTDYDTREYSSSKRRDEKNELTRRKDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 KSLSQSSKEARTSDKHDSTRASSNKDFTPNRDKKTDYDTREYSSSKRRDEKNELTRRKDS
1410 1420 1430 1440 1450 1460
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE3 PSRNKDSASGQKNKPREERDLPKKGTGDSKKSNSSPSRDRKPHDHKATYDTKRPNEETKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 PSRNKDSASGQKNKPREERDLPKKGTGDSKKSNSSPSRDRKPHDHKATYDTKRPNEETKS
1470 1480 1490 1500 1510 1520
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE3 VDKNPCKDREKHVLEARNNKESSGNKLLYILNPPETQVEKEQITGQIDKSTVKPKPQLSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 VDKNPCKDREKHVLEARNNKESSGNKLLYILNPPETQVEKEQITGQIDKSTVKPKPQLSH
1530 1540 1550 1560 1570 1580
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE3 SSRLSSDLTRETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEESSGNISKDLKDKIVEKAKESLDTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SSRLSSDLTRETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEESSGNISKDLKDKIVEKAKESLDTA
1590 1600 1610 1620 1630 1640
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE3 AVVQVGISRNQSHSSPSVSPSRSHSPSGSQTRSHSSSASSAESQDSKKKKKKKEKKKHKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 AVVQVGISRNQSHSSPSVSPSRSHSPSGSQTRSHSSSASSAESQDSKKKKKKKEKKKHKK
1650 1660 1670 1680 1690 1700
1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE3 HKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSVTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 HKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSVTV
1710 1720 1730 1740 1750
>>NP_116015 (OMIM: 600938) E3 ubiquitin-protein ligase R (118 aa)
initn: 652 init1: 652 opt: 654 Z-score: 278.2 bits: 60.8 E(85289): 9.3e-09
Smith-Waterman score: 654; 94.4% identity (97.2% similar) in 108 aa overlap (1-108:1-108)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSCVHYKFSSKLNYDTVTFDGLHISLCDLKKQIMGREKLKAADCDLQITNAQTKEEYTDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 MSCVHYKFSSKLNYDTVTFDGLHISLCDLKKQIMGREKLKAADCDLQITNAQTKEEYTDD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 NALIPKNSSVIVRRIPIGGVKSTSKTYVISRTEPAMATTKAIDDSSASISLAQLTKTANL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .. :
NP_116 NALIPKNSSVIVRRIPIGGVKSTSKTYVISRTEPAMATTKAVCKNTISHFFYTLLLPL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 AEANASEEDKIKAMMSQSGHEYDPINYMKKPLGPPPPSYTCFRCGKPGHYIKNCPTNGDK
>>XP_016855518 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/arginine (819 aa)
initn: 250 init1: 140 opt: 409 Z-score: 175.8 bits: 44.6 E(85289): 0.0047
Smith-Waterman score: 452; 23.4% identity (51.9% similar) in 770 aa overlap (1028-1750:27-746)
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 FKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTKRKNDGSAVSKKENIVK-PAKGPQEKVDGERERSPRSE
.: .:::. :. . : . ..:. ..:
XP_016 MMQINLTGFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENIAGIPSAFLELKKEEIKQRQIEQE
10 20 30 40 50
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE3 P--PIKKAKEETPKTDNTKSSSSSQKDEKITGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDY
.:: :. : :. .. :: .: :. . .::. .:.: . .....::..:. :...
XP_016 KLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRER-SRSPRRRKSRSPSPRRRSSPVRRER-KRSH
60 70 80 90 100 110
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE3 SKDVKSEKLTTKEEKAKKPNEKNKPLDNKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSMKISKLE-VT
:.. . . . . : . .::. : . . : :. . ..... :. .:. : : .
XP_016 SRSPRHRTKSRSPSPAPEKKEKTPELPEPSVKVKEPSVQEATST---SDILKVPKPEPIP
120 130 140 150 160 170
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE3 EIVKPSPKR--KMEPDTEKM-----DRTPEKDKISLSAPA--KKIKLNRETGKKIGSTEN
: .:::.. : : . :: .:. ... .:. . . .: ... . .
XP_016 EPKEPSPEKNSKKEKEKEKTRPRSRSRSKSRSRTRSRSPSHTRPRRRHRSRSRSYSPRRR
180 190 200 210 220 230
1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE3 ISNTKEPSEKLESTSSKV----KQEKVKGKVRRKVTGTE---GSSSTLVDYTSTSSTGGS
: ..:: . .. .. .... .. :::. .. ::::. . : :
XP_016 PSPRRRPSPRRRTPPRRMPPPPRHRRSRSPVRRRRRSSASLSGSSSSSSSSRSRSPPKKP
240 250 260 270 280 290
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KE3 PVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSKWDKDDFESEEEDVKSTQ
: : : :.: .. .: .: : .. .. . .....
XP_016 PKRTSSPPRKTRRLSPSASPPRRRHRPSPPA-------TPPPKTRHSPTPQQSNRTRKSR
300 310 320 330 340
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KE3 PISSVGKPASVIKNVSTK----PSNIVKYPEK-ESEPSEKIQKFTKDVSHEIIQH--EVK
: :. .:: :. .:. :: : :.: : ::. .: : .. . .:. . .
XP_016 VSVSPGR-TSVTKHKGTEKRESPSPAPK-PRKVELSESEE-DKGGKMAAADSVQQRRQYR
350 360 370 380 390 400
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KE3 SSKNSASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNFKSLSQSSKEA
.....::..:.. : : : : ::.. :.... : ... .: : :
XP_016 RQNQQSSSDSGSS-----SSSEDERP-KRSHV----KNGEVGRRRRHSPSRSASPS---P
410 420 430 440
1460 1470 1480 1490 1500 1510
pF1KE3 RTSDKHDSTRASSNKDFTPNRDKKTDYDTREYSSSKRRDEKNELTRRKDSPSRNKDSASG
: .:. : :. .. .: .. . .:: :: :: . : :
XP_016 RKRQKETSPRGRRRRSPSPPPTRRRRSPSPAPPPRRRRTPTPPPRRRTPSPPPRRRSPSP
450 460 470 480 490 500
1520 1530 1540 1550 1560 1570
pF1KE3 QKNKPREERDLPKKGTGDSKKSNSSPSRDRKPHDHKATYDTKRPNEETKSVDKNPCKDRE
.. .: .: . :. ..:: : ..:. : . . . : :.:
XP_016 RRYSPPIQRRYSP--SPPPKRRTASPP---PPPKRRAS---PSPPPKRRVSHSPPPKQRS
510 520 530 540 550 560
1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE3 KHVLEARNNKESSGNKLLYILNPPETQVEKEQITGQIDKS-TVKPKPQLSHSSRLSSDLT
. : . :. . :: .. . .. .: . : .: . .:.:. ..: .
XP_016 SPVTKRRSPSLSSKHRK----GSSPSRSTREARSPQPNKRHSPSPRPRAPQTSSSPPPVR
570 580 590 600 610
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE3 RETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEESSGNISKDLKDKIVEKAKESLDTAAVVQVGISR
: :. :. .: : :. ... .:. . : ..:: : . .: .:. ::
XP_016 RG---ASSSPQRRQSPSPSTRPIRR------VSRTPEPKKIKKAA-SPSPQSVRRVSSSR
620 630 640 650 660
1690 1700 1710 1720 1730
pF1KE3 NQSHS------SPSVSPS--RSHSPSGS--------QTRSHSSSASSAESQDSK---KKK
. : : .: . :: .:.::: . ...: . : : ...:.. :::
XP_016 SVSGSPEPAAKKPPAPPSPVQSQSPSTNWSPAVPVKKAKSPTPSPSPPRNSDQEGGGKKK
670 680 690 700 710 720
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE3 KKKEKKKHKKHKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSV
:::. ::::: :::::::::
XP_016 KKKKDKKHKKDKKHKKHKKHKKEKAVAAAAAAAVTPAAIAAATTTLAQEEPVAAPEPKKE
730 740 750 760 770 780
>>XP_016855517 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/arginine (819 aa)
initn: 250 init1: 140 opt: 409 Z-score: 175.8 bits: 44.6 E(85289): 0.0047
Smith-Waterman score: 452; 23.4% identity (51.9% similar) in 770 aa overlap (1028-1750:27-746)
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 FKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTKRKNDGSAVSKKENIVK-PAKGPQEKVDGERERSPRSE
.: .:::. :. . : . ..:. ..:
XP_016 MMQINLTGFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENIAGIPSAFLELKKEEIKQRQIEQE
10 20 30 40 50
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE3 P--PIKKAKEETPKTDNTKSSSSSQKDEKITGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDY
.:: :. : :. .. :: .: :. . .::. .:.: . .....::..:. :...
XP_016 KLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRER-SRSPRRRKSRSPSPRRRSSPVRRER-KRSH
60 70 80 90 100 110
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE3 SKDVKSEKLTTKEEKAKKPNEKNKPLDNKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSMKISKLE-VT
:.. . . . . : . .::. : . . : :. . ..... :. .:. : : .
XP_016 SRSPRHRTKSRSPSPAPEKKEKTPELPEPSVKVKEPSVQEATST---SDILKVPKPEPIP
120 130 140 150 160 170
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE3 EIVKPSPKR--KMEPDTEKM-----DRTPEKDKISLSAPA--KKIKLNRETGKKIGSTEN
: .:::.. : : . :: .:. ... .:. . . .: ... . .
XP_016 EPKEPSPEKNSKKEKEKEKTRPRSRSRSKSRSRTRSRSPSHTRPRRRHRSRSRSYSPRRR
180 190 200 210 220 230
1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE3 ISNTKEPSEKLESTSSKV----KQEKVKGKVRRKVTGTE---GSSSTLVDYTSTSSTGGS
: ..:: . .. .. .... .. :::. .. ::::. . : :
XP_016 PSPRRRPSPRRRTPPRRMPPPPRHRRSRSPVRRRRRSSASLSGSSSSSSSSRSRSPPKKP
240 250 260 270 280 290
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KE3 PVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSKWDKDDFESEEEDVKSTQ
: : : :.: .. .: .: : .. .. . .....
XP_016 PKRTSSPPRKTRRLSPSASPPRRRHRPSPPA-------TPPPKTRHSPTPQQSNRTRKSR
300 310 320 330 340
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KE3 PISSVGKPASVIKNVSTK----PSNIVKYPEK-ESEPSEKIQKFTKDVSHEIIQH--EVK
: :. .:: :. .:. :: : :.: : ::. .: : .. . .:. . .
XP_016 VSVSPGR-TSVTKHKGTEKRESPSPAPK-PRKVELSESEE-DKGGKMAAADSVQQRRQYR
350 360 370 380 390 400
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KE3 SSKNSASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNFKSLSQSSKEA
.....::..:.. : : : : ::.. :.... : ... .: : :
XP_016 RQNQQSSSDSGSS-----SSSEDERP-KRSHV----KNGEVGRRRRHSPSRSASPS---P
410 420 430 440
1460 1470 1480 1490 1500 1510
pF1KE3 RTSDKHDSTRASSNKDFTPNRDKKTDYDTREYSSSKRRDEKNELTRRKDSPSRNKDSASG
: .:. : :. .. .: .. . .:: :: :: . : :
XP_016 RKRQKETSPRGRRRRSPSPPPTRRRRSPSPAPPPRRRRTPTPPPRRRTPSPPPRRRSPSP
450 460 470 480 490 500
1520 1530 1540 1550 1560 1570
pF1KE3 QKNKPREERDLPKKGTGDSKKSNSSPSRDRKPHDHKATYDTKRPNEETKSVDKNPCKDRE
.. .: .: . :. ..:: : ..:. : . . . : :.:
XP_016 RRYSPPIQRRYSP--SPPPKRRTASPP---PPPKRRAS---PSPPPKRRVSHSPPPKQRS
510 520 530 540 550 560
1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE3 KHVLEARNNKESSGNKLLYILNPPETQVEKEQITGQIDKS-TVKPKPQLSHSSRLSSDLT
. : . :. . :: .. . .. .: . : .: . .:.:. ..: .
XP_016 SPVTKRRSPSLSSKHRK----GSSPSRSTREARSPQPNKRHSPSPRPRAPQTSSSPPPVR
570 580 590 600 610
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE3 RETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEESSGNISKDLKDKIVEKAKESLDTAAVVQVGISR
: :. :. .: : :. ... .:. . : ..:: : . .: .:. ::
XP_016 RG---ASSSPQRRQSPSPSTRPIRR------VSRTPEPKKIKKAA-SPSPQSVRRVSSSR
620 630 640 650 660
1690 1700 1710 1720 1730
pF1KE3 NQSHS------SPSVSPS--RSHSPSGS--------QTRSHSSSASSAESQDSK---KKK
. : : .: . :: .:.::: . ...: . : : ...:.. :::
XP_016 SVSGSPEPAAKKPPAPPSPVQSQSPSTNWSPAVPVKKAKSPTPSPSPPRNSDQEGGGKKK
670 680 690 700 710 720
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE3 KKKEKKKHKKHKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSV
:::. ::::: :::::::::
XP_016 KKKKDKKHKKDKKHKKHKKHKKEKAVAAAAAAAVTPAAIAAATTTLAQEEPVAAPEPKKE
730 740 750 760 770 780
>>XP_016855504 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/arginine (863 aa)
initn: 319 init1: 140 opt: 409 Z-score: 175.5 bits: 44.6 E(85289): 0.0049
Smith-Waterman score: 452; 23.4% identity (51.9% similar) in 770 aa overlap (1028-1750:71-790)
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 FKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTKRKNDGSAVSKKENIVK-PAKGPQEKVDGERERSPRSE
.: .:::. :. . : . ..:. ..:
XP_016 PDSKMMQINLTGFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENIAGIPSAFLELKKEEIKQRQIEQE
50 60 70 80 90 100
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE3 P--PIKKAKEETPKTDNTKSSSSSQKDEKITGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDY
.:: :. : :. .. :: .: :. . .::. .:.: . .....::..:. :...
XP_016 KLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRER-SRSPRRRKSRSPSPRRRSSPVRRER-KRSH
110 120 130 140 150
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE3 SKDVKSEKLTTKEEKAKKPNEKNKPLDNKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSMKISKLE-VT
:.. . . . . : . .::. : . . : :. . ..... :. .:. : : .
XP_016 SRSPRHRTKSRSPSPAPEKKEKTPELPEPSVKVKEPSVQEATST---SDILKVPKPEPIP
160 170 180 190 200 210
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE3 EIVKPSPKR--KMEPDTEKM-----DRTPEKDKISLSAPA--KKIKLNRETGKKIGSTEN
: .:::.. : : . :: .:. ... .:. . . .: ... . .
XP_016 EPKEPSPEKNSKKEKEKEKTRPRSRSRSKSRSRTRSRSPSHTRPRRRHRSRSRSYSPRRR
220 230 240 250 260 270
1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE3 ISNTKEPSEKLESTSSKV----KQEKVKGKVRRKVTGTE---GSSSTLVDYTSTSSTGGS
: ..:: . .. .. .... .. :::. .. ::::. . : :
XP_016 PSPRRRPSPRRRTPPRRMPPPPRHRRSRSPVRRRRRSSASLSGSSSSSSSSRSRSPPKKP
280 290 300 310 320 330
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KE3 PVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSKWDKDDFESEEEDVKSTQ
: : : :.: .. .: .: : .. .. . .....
XP_016 PKRTSSPPRKTRRLSPSASPPRRRHRPSPPA-------TPPPKTRHSPTPQQSNRTRKSR
340 350 360 370 380
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KE3 PISSVGKPASVIKNVSTK----PSNIVKYPEK-ESEPSEKIQKFTKDVSHEIIQH--EVK
: :. .:: :. .:. :: : :.: : ::. .: : .. . .:. . .
XP_016 VSVSPGR-TSVTKHKGTEKRESPSPAPK-PRKVELSESEE-DKGGKMAAADSVQQRRQYR
390 400 410 420 430 440
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KE3 SSKNSASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNFKSLSQSSKEA
.....::..:.. : : : : ::.. :.... : ... .: : :
XP_016 RQNQQSSSDSGSS-----SSSEDERP-KRSHV----KNGEVGRRRRHSPSRSASPS---P
450 460 470 480 490
1460 1470 1480 1490 1500 1510
pF1KE3 RTSDKHDSTRASSNKDFTPNRDKKTDYDTREYSSSKRRDEKNELTRRKDSPSRNKDSASG
: .:. : :. .. .: .. . .:: :: :: . : :
XP_016 RKRQKETSPRGRRRRSPSPPPTRRRRSPSPAPPPRRRRTPTPPPRRRTPSPPPRRRSPSP
500 510 520 530 540 550
1520 1530 1540 1550 1560 1570
pF1KE3 QKNKPREERDLPKKGTGDSKKSNSSPSRDRKPHDHKATYDTKRPNEETKSVDKNPCKDRE
.. .: .: . :. ..:: : ..:. : . . . : :.:
XP_016 RRYSPPIQRRYSP--SPPPKRRTASPP---PPPKRRAS---PSPPPKRRVSHSPPPKQRS
560 570 580 590 600
1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE3 KHVLEARNNKESSGNKLLYILNPPETQVEKEQITGQIDKS-TVKPKPQLSHSSRLSSDLT
. : . :. . :: .. . .. .: . : .: . .:.:. ..: .
XP_016 SPVTKRRSPSLSSKHRK----GSSPSRSTREARSPQPNKRHSPSPRPRAPQTSSSPPPVR
610 620 630 640 650 660
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE3 RETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEESSGNISKDLKDKIVEKAKESLDTAAVVQVGISR
: :. :. .: : :. ... .:. . : ..:: : . .: .:. ::
XP_016 RG---ASSSPQRRQSPSPSTRPIRR------VSRTPEPKKIKKAA-SPSPQSVRRVSSSR
670 680 690 700 710
1690 1700 1710 1720 1730
pF1KE3 NQSHS------SPSVSPS--RSHSPSGS--------QTRSHSSSASSAESQDSK---KKK
. : : .: . :: .:.::: . ...: . : : ...:.. :::
XP_016 SVSGSPEPAAKKPPAPPSPVQSQSPSTNWSPAVPVKKAKSPTPSPSPPRNSDQEGGGKKK
720 730 740 750 760 770
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE3 KKKEKKKHKKHKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSV
:::. ::::: :::::::::
XP_016 KKKKDKKHKKDKKHKKHKKHKKEKAVAAAAAAAVTPAAIAAATTTLAQEEPVAAPEPKKE
780 790 800 810 820 830
>>XP_016855516 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/arginine (820 aa)
initn: 319 init1: 140 opt: 408 Z-score: 175.5 bits: 44.5 E(85289): 0.0049
Smith-Waterman score: 453; 23.0% identity (52.6% similar) in 766 aa overlap (1028-1750:27-747)
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 FKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTKRKNDGSAVSKKENIVK-PAKGPQEKVDGERERSPRSE
.: .:::. :. . : . ..:. ..:
XP_016 MMQINLTGFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENIAGIPSAFLELKKEEIKQRQIEQE
10 20 30 40 50
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE3 P--PIKKAKEETPKTDNTKSSSSSQKDEKITGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDY
.:: :. : :. .. :: .: :. . .::. .:.: . .....::..:. :...
XP_016 KLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRER-SRSPRRRKSRSPSPRRRSSPVRRER-KRSH
60 70 80 90 100 110
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE3 SKDVKSEKLTTKEEKAKKPNEKNKPLDNKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSMKISKLE-VT
:.. . . . . : . .::. : . . : :. . ..... :. .:. : : .
XP_016 SRSPRHRTKSRSPSPAPEKKEKTPELPEPSVKVKEPSVQEATST---SDILKVPKPEPIP
120 130 140 150 160 170
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE3 EIVKPSPKR--KMEPDTEKM-----DRTPEKDKISLSAPA--KKIKLNRETGKKIGSTEN
: .:::.. : : . :: .:. ... .:. . . .: ... . .
XP_016 EPKEPSPEKNSKKEKEKEKTRPRSRSRSKSRSRTRSRSPSHTRPRRRHRSRSRSYSPRRR
180 190 200 210 220 230
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE3 ISNTKEPSEKLESTSSKV----KQEKVKGKVRRKVTGTEGSSSTLVDYTSTSSTGGSPVR
: ..:: . .. .. .... .. :::. .. . :.. . .:.:: . :: .
XP_016 PSPRRRPSPRRRTPPRRMPPPPRHRRSRSPVRRRRRSSASLSGS--SSSSSSSRSRSPPK
240 250 260 270 280
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KE3 KSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSKWDKDDFESEEEDVKSTQPIS
: ..:.. . . . . :... . .:.. :: .:
XP_016 KPPKRTSSPPRKTRRLSPSASPPRRRHRPSPPATPPPKTRHSPTPQQSNRTR-KSRVSVS
290 300 310 320 330 340
1350 1360 1370 1380 1390
pF1KE3 SVGKPASVIKNVSTK----PSNIVKYPEKESEPSEKIQKFTKDVSHEIIQH--EVKSSKN
..: :. .:. :: : :.: : ::. .: : .. . .:. . . ...
XP_016 PGRTSGKVTKHKGTEKRESPSPAPK-PRK-VELSESEDKGGKMAAADSVQQRRQYRRQNQ
350 360 370 380 390 400
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KE3 SASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNFKSLSQSSKEARTSD
..::..:.. : : : : ::.. :.... : ... .: : : : .
XP_016 QSSSDSGSS-----SSSEDERP-KRSHV----KNGEVGRRRRHSPSRSASPS---PRKRQ
410 420 430 440 450
1460 1470 1480 1490 1500 1510
pF1KE3 KHDSTRASSNKDFTPNRDKKTDYDTREYSSSKRRDEKNELTRRKDSPSRNKDSASGQKNK
:. : :. .. .: .. . .:: :: :: . : : .. .
XP_016 KETSPRGRRRRSPSPPPTRRRRSPSPAPPPRRRRTPTPPPRRRTPSPPPRRRSPSPRRYS
460 470 480 490 500 510
1520 1530 1540 1550 1560 1570
pF1KE3 PREERDLPKKGTGDSKKSNSSPSRDRKPHDHKATYDTKRPNEETKSVDKNPCKDREKHVL
: .: . :. ..:: : ..:. : . . . : :.: . :
XP_016 PPIQRRYSP--SPPPKRRTASPP---PPPKRRAS---PSPPPKRRVSHSPPPKQRSSPVT
520 530 540 550 560
1580 1590 1600 1610 1620 1630
pF1KE3 EARNNKESSGNKLLYILNPPETQVEKEQITGQIDKS-TVKPKPQLSHSSRLSSDLTRETD
. :. . :: .. . .. .: . : .: . .:.:. ..: . :
XP_016 KRRSPSLSSKHRK----GSSPSRSTREARSPQPNKRHSPSPRPRAPQTSSSPPPVRRG--
570 580 590 600 610
1640 1650 1660 1670 1680 1690
pF1KE3 EAAFEPDYNESDSESNVSVKEEESSGNISKDLKDKIVEKAKESLDTAAVVQVGISRNQSH
:. :. .: : :. ... .:. . : ..:: : . .: .:. ::. :
XP_016 -ASSSPQRRQSPSPSTRPIRR------VSRTPEPKKIKKAA-SPSPQSVRRVSSSRSVSG
620 630 640 650 660 670
1700 1710 1720 1730
pF1KE3 S------SPSVSPS--RSHSPSGS--------QTRSHSSSASSAESQDSK---KKKKKKE
: .: . :: .:.::: . ...: . : : ...:.. ::::::.
XP_016 SPEPAAKKPPAPPSPVQSQSPSTNWSPAVPVKKAKSPTPSPSPPRNSDQEGGGKKKKKKK
680 690 700 710 720 730
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE3 KKKHKKHKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSVTV
::::: :::::::::
XP_016 DKKHKKDKKHKKHKKHKKEKAVAAAAAAAVTPAAIAAATTTLAQEEPVAAPEPKKETESE
740 750 760 770 780 790
>>XP_005245778 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/arginine (902 aa)
initn: 250 init1: 140 opt: 409 Z-score: 175.3 bits: 44.6 E(85289): 0.005
Smith-Waterman score: 452; 23.4% identity (51.9% similar) in 770 aa overlap (1028-1750:110-829)
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 FKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTKRKNDGSAVSKKENIVK-PAKGPQEKVDGERERSPRSE
.: .:::. :. . : . ..:. ..:
XP_005 PDSKMMQINLTGFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENIAGIPSAFLELKKEEIKQRQIEQE
80 90 100 110 120 130
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE3 P--PIKKAKEETPKTDNTKSSSSSQKDEKITGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDY
.:: :. : :. .. :: .: :. . .::. .:.: . .....::..:. :...
XP_005 KLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRER-SRSPRRRKSRSPSPRRRSSPVRRER-KRSH
140 150 160 170 180 190
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE3 SKDVKSEKLTTKEEKAKKPNEKNKPLDNKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSMKISKLE-VT
:.. . . . . : . .::. : . . : :. . ..... :. .:. : : .
XP_005 SRSPRHRTKSRSPSPAPEKKEKTPELPEPSVKVKEPSVQEATST---SDILKVPKPEPIP
200 210 220 230 240 250
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE3 EIVKPSPKR--KMEPDTEKM-----DRTPEKDKISLSAPA--KKIKLNRETGKKIGSTEN
: .:::.. : : . :: .:. ... .:. . . .: ... . .
XP_005 EPKEPSPEKNSKKEKEKEKTRPRSRSRSKSRSRTRSRSPSHTRPRRRHRSRSRSYSPRRR
260 270 280 290 300 310
1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE3 ISNTKEPSEKLESTSSKV----KQEKVKGKVRRKVTGTE---GSSSTLVDYTSTSSTGGS
: ..:: . .. .. .... .. :::. .. ::::. . : :
XP_005 PSPRRRPSPRRRTPPRRMPPPPRHRRSRSPVRRRRRSSASLSGSSSSSSSSRSRSPPKKP
320 330 340 350 360 370
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KE3 PVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSKWDKDDFESEEEDVKSTQ
: : : :.: .. .: .: : .. .. . .....
XP_005 PKRTSSPPRKTRRLSPSASPPRRRHRPSPPA-------TPPPKTRHSPTPQQSNRTRKSR
380 390 400 410 420
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KE3 PISSVGKPASVIKNVSTK----PSNIVKYPEK-ESEPSEKIQKFTKDVSHEIIQH--EVK
: :. .:: :. .:. :: : :.: : ::. .: : .. . .:. . .
XP_005 VSVSPGR-TSVTKHKGTEKRESPSPAPK-PRKVELSESEE-DKGGKMAAADSVQQRRQYR
430 440 450 460 470 480
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KE3 SSKNSASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNFKSLSQSSKEA
.....::..:.. : : : : ::.. :.... : ... .: : :
XP_005 RQNQQSSSDSGSS-----SSSEDERP-KRSHV----KNGEVGRRRRHSPSRSASPS---P
490 500 510 520 530
1460 1470 1480 1490 1500 1510
pF1KE3 RTSDKHDSTRASSNKDFTPNRDKKTDYDTREYSSSKRRDEKNELTRRKDSPSRNKDSASG
: .:. : :. .. .: .. . .:: :: :: . : :
XP_005 RKRQKETSPRGRRRRSPSPPPTRRRRSPSPAPPPRRRRTPTPPPRRRTPSPPPRRRSPSP
540 550 560 570 580 590
1520 1530 1540 1550 1560 1570
pF1KE3 QKNKPREERDLPKKGTGDSKKSNSSPSRDRKPHDHKATYDTKRPNEETKSVDKNPCKDRE
.. .: .: . :. ..:: : ..:. : . . . : :.:
XP_005 RRYSPPIQRRYSP--SPPPKRRTASPP---PPPKRRAS---PSPPPKRRVSHSPPPKQRS
600 610 620 630 640
1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE3 KHVLEARNNKESSGNKLLYILNPPETQVEKEQITGQIDKS-TVKPKPQLSHSSRLSSDLT
. : . :. . :: .. . .. .: . : .: . .:.:. ..: .
XP_005 SPVTKRRSPSLSSKHRK----GSSPSRSTREARSPQPNKRHSPSPRPRAPQTSSSPPPVR
650 660 670 680 690
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE3 RETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEESSGNISKDLKDKIVEKAKESLDTAAVVQVGISR
: :. :. .: : :. ... .:. . : ..:: : . .: .:. ::
XP_005 RG---ASSSPQRRQSPSPSTRPIRR------VSRTPEPKKIKKAA-SPSPQSVRRVSSSR
700 710 720 730 740
1690 1700 1710 1720 1730
pF1KE3 NQSHS------SPSVSPS--RSHSPSGS--------QTRSHSSSASSAESQDSK---KKK
. : : .: . :: .:.::: . ...: . : : ...:.. :::
XP_005 SVSGSPEPAAKKPPAPPSPVQSQSPSTNWSPAVPVKKAKSPTPSPSPPRNSDQEGGGKKK
750 760 770 780 790 800
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE3 KKKEKKKHKKHKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSV
:::. ::::: :::::::::
XP_005 KKKKDKKHKKDKKHKKHKKHKKEKAVAAAAAAAVTPAAIAAATTTLAQEEPVAAPEPKKE
810 820 830 840 850 860
>>XP_016855503 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/arginine (864 aa)
initn: 319 init1: 140 opt: 408 Z-score: 175.1 bits: 44.6 E(85289): 0.0051
Smith-Waterman score: 453; 23.0% identity (52.6% similar) in 766 aa overlap (1028-1750:71-791)
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 FKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTKRKNDGSAVSKKENIVK-PAKGPQEKVDGERERSPRSE
.: .:::. :. . : . ..:. ..:
XP_016 PDSKMMQINLTGFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENIAGIPSAFLELKKEEIKQRQIEQE
50 60 70 80 90 100
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE3 P--PIKKAKEETPKTDNTKSSSSSQKDEKITGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDY
.:: :. : :. .. :: .: :. . .::. .:.: . .....::..:. :...
XP_016 KLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRER-SRSPRRRKSRSPSPRRRSSPVRRER-KRSH
110 120 130 140 150
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE3 SKDVKSEKLTTKEEKAKKPNEKNKPLDNKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSMKISKLE-VT
:.. . . . . : . .::. : . . : :. . ..... :. .:. : : .
XP_016 SRSPRHRTKSRSPSPAPEKKEKTPELPEPSVKVKEPSVQEATST---SDILKVPKPEPIP
160 170 180 190 200 210
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE3 EIVKPSPKR--KMEPDTEKM-----DRTPEKDKISLSAPA--KKIKLNRETGKKIGSTEN
: .:::.. : : . :: .:. ... .:. . . .: ... . .
XP_016 EPKEPSPEKNSKKEKEKEKTRPRSRSRSKSRSRTRSRSPSHTRPRRRHRSRSRSYSPRRR
220 230 240 250 260 270
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE3 ISNTKEPSEKLESTSSKV----KQEKVKGKVRRKVTGTEGSSSTLVDYTSTSSTGGSPVR
: ..:: . .. .. .... .. :::. .. . :.. . .:.:: . :: .
XP_016 PSPRRRPSPRRRTPPRRMPPPPRHRRSRSPVRRRRRSSASLSGS--SSSSSSSRSRSPPK
280 290 300 310 320 330
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KE3 KSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSKWDKDDFESEEEDVKSTQPIS
: ..:.. . . . . :... . .:.. :: .:
XP_016 KPPKRTSSPPRKTRRLSPSASPPRRRHRPSPPATPPPKTRHSPTPQQSNRTR-KSRVSVS
340 350 360 370 380 390
1350 1360 1370 1380 1390
pF1KE3 SVGKPASVIKNVSTK----PSNIVKYPEKESEPSEKIQKFTKDVSHEIIQH--EVKSSKN
..: :. .:. :: : :.: : ::. .: : .. . .:. . . ...
XP_016 PGRTSGKVTKHKGTEKRESPSPAPK-PRK-VELSESEDKGGKMAAADSVQQRRQYRRQNQ
400 410 420 430 440 450
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KE3 SASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNFKSLSQSSKEARTSD
..::..:.. : : : : ::.. :.... : ... .: : : : .
XP_016 QSSSDSGSS-----SSSEDERP-KRSHV----KNGEVGRRRRHSPSRSASPS---PRKRQ
460 470 480 490
1460 1470 1480 1490 1500 1510
pF1KE3 KHDSTRASSNKDFTPNRDKKTDYDTREYSSSKRRDEKNELTRRKDSPSRNKDSASGQKNK
:. : :. .. .: .. . .:: :: :: . : : .. .
XP_016 KETSPRGRRRRSPSPPPTRRRRSPSPAPPPRRRRTPTPPPRRRTPSPPPRRRSPSPRRYS
500 510 520 530 540 550
1520 1530 1540 1550 1560 1570
pF1KE3 PREERDLPKKGTGDSKKSNSSPSRDRKPHDHKATYDTKRPNEETKSVDKNPCKDREKHVL
: .: . :. ..:: : ..:. : . . . : :.: . :
XP_016 PPIQRRYSP--SPPPKRRTASPP---PPPKRRAS---PSPPPKRRVSHSPPPKQRSSPVT
560 570 580 590 600
1580 1590 1600 1610 1620 1630
pF1KE3 EARNNKESSGNKLLYILNPPETQVEKEQITGQIDKS-TVKPKPQLSHSSRLSSDLTRETD
. :. . :: .. . .. .: . : .: . .:.:. ..: . :
XP_016 KRRSPSLSSKHRK----GSSPSRSTREARSPQPNKRHSPSPRPRAPQTSSSPPPVRRG--
610 620 630 640 650 660
1640 1650 1660 1670 1680 1690
pF1KE3 EAAFEPDYNESDSESNVSVKEEESSGNISKDLKDKIVEKAKESLDTAAVVQVGISRNQSH
:. :. .: : :. ... .:. . : ..:: : . .: .:. ::. :
XP_016 -ASSSPQRRQSPSPSTRPIRR------VSRTPEPKKIKKAA-SPSPQSVRRVSSSRSVSG
670 680 690 700 710
1700 1710 1720 1730
pF1KE3 S------SPSVSPS--RSHSPSGS--------QTRSHSSSASSAESQDSK---KKKKKKE
: .: . :: .:.::: . ...: . : : ...:.. ::::::.
XP_016 SPEPAAKKPPAPPSPVQSQSPSTNWSPAVPVKKAKSPTPSPSPPRNSDQEGGGKKKKKKK
720 730 740 750 760 770
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE3 KKKHKKHKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSVTV
::::: :::::::::
XP_016 DKKHKKDKKHKKHKKHKKEKAVAAAAAAAVTPAAIAAATTTLAQEEPVAAPEPKKETESE
780 790 800 810 820 830
>>XP_016855507 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/arginine (903 aa)
initn: 250 init1: 140 opt: 408 Z-score: 174.9 bits: 44.6 E(85289): 0.0053
Smith-Waterman score: 453; 23.0% identity (52.6% similar) in 766 aa overlap (1028-1750:110-830)
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 FKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTKRKNDGSAVSKKENIVK-PAKGPQEKVDGERERSPRSE
.: .:::. :. . : . ..:. ..:
XP_016 PDSKMMQINLTGFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENIAGIPSAFLELKKEEIKQRQIEQE
80 90 100 110 120 130
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE3 P--PIKKAKEETPKTDNTKSSSSSQKDEKITGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDY
.:: :. : :. .. :: .: :. . .::. .:.: . .....::..:. :...
XP_016 KLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRER-SRSPRRRKSRSPSPRRRSSPVRRER-KRSH
140 150 160 170 180 190
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE3 SKDVKSEKLTTKEEKAKKPNEKNKPLDNKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSMKISKLE-VT
:.. . . . . : . .::. : . . : :. . ..... :. .:. : : .
XP_016 SRSPRHRTKSRSPSPAPEKKEKTPELPEPSVKVKEPSVQEATST---SDILKVPKPEPIP
200 210 220 230 240 250
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE3 EIVKPSPKR--KMEPDTEKM-----DRTPEKDKISLSAPA--KKIKLNRETGKKIGSTEN
: .:::.. : : . :: .:. ... .:. . . .: ... . .
XP_016 EPKEPSPEKNSKKEKEKEKTRPRSRSRSKSRSRTRSRSPSHTRPRRRHRSRSRSYSPRRR
260 270 280 290 300 310
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE3 ISNTKEPSEKLESTSSKV----KQEKVKGKVRRKVTGTEGSSSTLVDYTSTSSTGGSPVR
: ..:: . .. .. .... .. :::. .. . :.. . .:.:: . :: .
XP_016 PSPRRRPSPRRRTPPRRMPPPPRHRRSRSPVRRRRRSSASLSGS--SSSSSSSRSRSPPK
320 330 340 350 360 370
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KE3 KSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSKWDKDDFESEEEDVKSTQPIS
: ..:.. . . . . :... . .:.. :: .:
XP_016 KPPKRTSSPPRKTRRLSPSASPPRRRHRPSPPATPPPKTRHSPTPQQSNRTR-KSRVSVS
380 390 400 410 420 430
1350 1360 1370 1380 1390
pF1KE3 SVGKPASVIKNVSTK----PSNIVKYPEKESEPSEKIQKFTKDVSHEIIQH--EVKSSKN
..: :. .:. :: : :.: : ::. .: : .. . .:. . . ...
XP_016 PGRTSGKVTKHKGTEKRESPSPAPK-PRK-VELSESEDKGGKMAAADSVQQRRQYRRQNQ
440 450 460 470 480
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KE3 SASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNFKSLSQSSKEARTSD
..::..:.. : : : : ::.. :.... : ... .: : : : .
XP_016 QSSSDSGSS-----SSSEDERP-KRSHV----KNGEVGRRRRHSPSRSASPS---PRKRQ
490 500 510 520 530
1460 1470 1480 1490 1500 1510
pF1KE3 KHDSTRASSNKDFTPNRDKKTDYDTREYSSSKRRDEKNELTRRKDSPSRNKDSASGQKNK
:. : :. .. .: .. . .:: :: :: . : : .. .
XP_016 KETSPRGRRRRSPSPPPTRRRRSPSPAPPPRRRRTPTPPPRRRTPSPPPRRRSPSPRRYS
540 550 560 570 580 590
1520 1530 1540 1550 1560 1570
pF1KE3 PREERDLPKKGTGDSKKSNSSPSRDRKPHDHKATYDTKRPNEETKSVDKNPCKDREKHVL
: .: . :. ..:: : ..:. : . . . : :.: . :
XP_016 PPIQRRYSP--SPPPKRRTASPP---PPPKRRAS---PSPPPKRRVSHSPPPKQRSSPVT
600 610 620 630 640
1580 1590 1600 1610 1620 1630
pF1KE3 EARNNKESSGNKLLYILNPPETQVEKEQITGQIDKS-TVKPKPQLSHSSRLSSDLTRETD
. :. . :: .. . .. .: . : .: . .:.:. ..: . :
XP_016 KRRSPSLSSKHRK----GSSPSRSTREARSPQPNKRHSPSPRPRAPQTSSSPPPVRRG--
650 660 670 680 690 700
1640 1650 1660 1670 1680 1690
pF1KE3 EAAFEPDYNESDSESNVSVKEEESSGNISKDLKDKIVEKAKESLDTAAVVQVGISRNQSH
:. :. .: : :. ... .:. . : ..:: : . .: .:. ::. :
XP_016 -ASSSPQRRQSPSPSTRPIRR------VSRTPEPKKIKKAA-SPSPQSVRRVSSSRSVSG
710 720 730 740 750
1700 1710 1720 1730
pF1KE3 S------SPSVSPS--RSHSPSGS--------QTRSHSSSASSAESQDSK---KKKKKKE
: .: . :: .:.::: . ...: . : : ...:.. ::::::.
XP_016 SPEPAAKKPPAPPSPVQSQSPSTNWSPAVPVKKAKSPTPSPSPPRNSDQEGGGKKKKKKK
760 770 780 790 800 810
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE3 KKKHKKHKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSVTV
::::: :::::::::
XP_016 DKKHKKDKKHKKHKKHKKEKAVAAAAAAAVTPAAIAAATTTLAQEEPVAAPEPKKETESE
820 830 840 850 860 870
1792 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 17:14:25 2016 done: Mon Nov 7 17:14:27 2016
Total Scan time: 19.910 Total Display time: 0.330
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]