Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3476
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3476, 1551 aa
1>>>pF1KE3476 1551 - 1551 aa - 1551 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.8625+/-0.00121; mu= -17.1900+/- 0.070
mean_var=536.6732+/-119.311, 0's: 0 Z-trim(112.8): 485 B-trim: 323 in 1/54
Lambda= 0.055363
statistics sampled from 12966 (13516) to 12966 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.415), width: 16
Scan time: 6.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11 (1551) 10387 846.2 0
CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1638) 2148 188.1 1.9e-46
CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1719) 2148 188.1 2e-46
CCDS9978.1 CDC42BPB gene_id:9578|Hs108|chr14 (1711) 2021 178.0 2.3e-43
CCDS74400.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 530) 1688 151.0 9.4e-36
CCDS46118.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 624) 1688 151.1 1.1e-35
CCDS46117.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 625) 1688 151.1 1.1e-35
CCDS12674.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 629) 1671 149.7 2.7e-35
CCDS46119.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 639) 1535 138.8 5.2e-32
CCDS11870.2 ROCK1 gene_id:6093|Hs108|chr18 (1354) 1407 128.9 1.1e-28
CCDS42654.1 ROCK2 gene_id:9475|Hs108|chr2 (1388) 1399 128.2 1.7e-28
CCDS9192.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2027) 1364 125.6 1.6e-27
CCDS55891.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2069) 1362 125.4 1.8e-27
CCDS73313.1 RPS6KA4 gene_id:8986|Hs108|chr11 ( 765) 742 75.6 6.9e-13
CCDS8073.1 RPS6KA4 gene_id:8986|Hs108|chr11 ( 772) 742 75.6 7e-13
CCDS45149.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14 ( 549) 729 74.4 1.1e-12
CCDS9893.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14 ( 802) 729 74.5 1.5e-12
CCDS46014.1 MAST3 gene_id:23031|Hs108|chr19 (1309) 728 74.6 2.3e-12
CCDS41326.1 MAST2 gene_id:23139|Hs108|chr1 (1798) 710 73.3 7.8e-12
CCDS9752.1 PRKCH gene_id:5583|Hs108|chr14 ( 683) 693 71.6 9.5e-12
CCDS75254.1 MAST4 gene_id:375449|Hs108|chr5 (2429) 692 72.0 2.7e-11
CCDS47225.1 MAST4 gene_id:375449|Hs108|chr5 (2434) 692 72.0 2.7e-11
CCDS54861.1 MAST4 gene_id:375449|Hs108|chr5 (2623) 692 72.0 2.8e-11
CCDS32921.1 MAST1 gene_id:22983|Hs108|chr19 (1570) 677 70.6 4.4e-11
CCDS1824.1 PRKCE gene_id:5581|Hs108|chr2 ( 737) 660 69.0 6.3e-11
CCDS10618.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 ( 671) 657 68.7 6.9e-11
>>CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11 (1551 aa)
initn: 10387 init1: 10387 opt: 10387 Z-score: 4504.0 bits: 846.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10387; 100.0% identity (100.0% similar) in 1551 aa overlap (1-1551:1-1551)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MERRLRALEQLARGEAGGCPGLDGLLDLLLALHHELSSGPLRRERSVAQFLSWASPFVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MERRLRALEQLARGEAGGCPGLDGLLDLLLALHHELSSGPLRRERSVAQFLSWASPFVSK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VKELRLQRDDFEILKVIGRGAFGEVTVVRQRDTGQIFAMKMLHKWEMLKRAETACFREER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VKELRLQRDDFEILKVIGRGAFGEVTVVRQRDTGQIFAMKMLHKWEMLKRAETACFREER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 DVLVKGDSRWVTTLHYAFQDEEYLYLVMDYYAGGDLLTLLSRFEDRLPPELAQFYLAEMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DVLVKGDSRWVTTLHYAFQDEEYLYLVMDYYAGGDLLTLLSRFEDRLPPELAQFYLAEMV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 LAIHSLHQLGYVHRDVKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLRLNTNGMVDSSVAVGTPDYISP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LAIHSLHQLGYVHRDVKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLRLNTNGMVDSSVAVGTPDYISP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EILQAMEEGKGHYGPQCDWWSLGVCAYELLFGETPFYAESLVETYGKIMNHEDHLQFPPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EILQAMEEGKGHYGPQCDWWSLGVCAYELLFGETPFYAESLVETYGKIMNHEDHLQFPPD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 VPDVPASAQDLIRQLLCRQEERLGRGGLDDFRNHPFFEGVDWERLASSTAPYIPELRGPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VPDVPASAQDLIRQLLCRQEERLGRGGLDDFRNHPFFEGVDWERLASSTAPYIPELRGPM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 DTSNFDVDDDTLNHPGTLPPPSHGAFSGHHLPFVGFTYTSGSHSPESSSEAWAALERKLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DTSNFDVDDDTLNHPGTLPPPSHGAFSGHHLPFVGFTYTSGSHSPESSSEAWAALERKLQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 CLEQEKVELSRKHQEALHAPTDHRELEQLRKEVQTLRDRLPEMLRDKASLSQTDGPPAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CLEQEKVELSRKHQEALHAPTDHRELEQLRKEVQTLRDRLPEMLRDKASLSQTDGPPAGS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 PGQDSDLRQELDRLHRELAEGRAGLQAQEQELCRAQGQQEELLQRLQEAQEREAATASQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PGQDSDLRQELDRLHRELAEGRAGLQAQEQELCRAQGQQEELLQRLQEAQEREAATASQT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 RALSSQLEEARAAQRELEAQVSSLSRQVTQLQGQWEQRLEESSQAKTIHTASETNGMGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RALSSQLEEARAAQRELEAQVSSLSRQVTQLQGQWEQRLEESSQAKTIHTASETNGMGPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 EGGPQEAQLRKEVAALREQLEQAHSHRPSGKEEALCQLQEENRRLSREQERLEAELAQEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EGGPQEAQLRKEVAALREQLEQAHSHRPSGKEEALCQLQEENRRLSREQERLEAELAQEQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 ESKQRLEGERRETESNWEAQLADILSWVNDEKVSRGYLQALATKMAEELESLRNVGTQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ESKQRLEGERRETESNWEAQLADILSWVNDEKVSRGYLQALATKMAEELESLRNVGTQTL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 PARPLDHQWKARRLQKMEASARLELQSALEAEIRAKQGLQERLTQVQEAQLQAERRLQEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PARPLDHQWKARRLQKMEASARLELQSALEAEIRAKQGLQERLTQVQEAQLQAERRLQEA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 EKQSQALQQELAMLREELRARGPVDTKPSNSLIPFLSFRSSEKDSAKDPGISGEATRHGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EKQSQALQQELAMLREELRARGPVDTKPSNSLIPFLSFRSSEKDSAKDPGISGEATRHGG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 EPDLRPEGRRSLRMGAVFPRAPTANTASTEGLPAKPGSHTLRPRSFPSPTKCLRCTSLML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EPDLRPEGRRSLRMGAVFPRAPTANTASTEGLPAKPGSHTLRPRSFPSPTKCLRCTSLML
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 GLGRQGLGCDACGYFCHTTCAPQAPPCPVPPDLLRTALGVHPETGTGTAYEGFLSVPRPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GLGRQGLGCDACGYFCHTTCAPQAPPCPVPPDLLRTALGVHPETGTGTAYEGFLSVPRPS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 GVRRGWQRVFAALSDSRLLLFDAPDLRLSPPSGALLQVLDLRDPQFSATPVLASDVIHAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GVRRGWQRVFAALSDSRLLLFDAPDLRLSPPSGALLQVLDLRDPQFSATPVLASDVIHAQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 SRDLPRIFRVTTSQLAVPPTTCTVLLLAESEGERERWLQVLGELQRLLLDARPRPRPVYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SRDLPRIFRVTTSQLAVPPTTCTVLLLAESEGERERWLQVLGELQRLLLDARPRPRPVYT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 LKEAYDNGLPLLPHTLCAAILDQDRLALGTEEGLFVIHLRSNDIFQVGECRRVQQLTLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LKEAYDNGLPLLPHTLCAAILDQDRLALGTEEGLFVIHLRSNDIFQVGECRRVQQLTLSP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 SAGLLVVLCGRGPSVRLFALAELENIEVAGAKIPESRGCQVLAAGSILQARTPVLCVAVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SAGLLVVLCGRGPSVRLFALAELENIEVAGAKIPESRGCQVLAAGSILQARTPVLCVAVK
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 RQVLCYQLGPGPGPWQRRIRELQAPATVQSLGLLGDRLCVGAAGGFALYPLLNEAAPLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RQVLCYQLGPGPGPWQRRIRELQAPATVQSLGLLGDRLCVGAAGGFALYPLLNEAAPLAL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 GAGLVPEELPPSRGGLGEALGAVELSLSEFLLLFTTAGIYVDGAGRKSRGHELLWPAAPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GAGLVPEELPPSRGGLGEALGAVELSLSEFLLLFTTAGIYVDGAGRKSRGHELLWPAAPM
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 GWGYAAPYLTVFSENSIDVFDVRRAEWVQTVPLKKVRPLNPEGSLFLYGTEKVRLTYLRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GWGYAAPYLTVFSENSIDVFDVRRAEWVQTVPLKKVRPLNPEGSLFLYGTEKVRLTYLRN
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE3 QLAEKDEFDIPDLTDNSRRQLFRTKSKRRFFFRVSEEQQKQQRREMLKDPFVRSKLISPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QLAEKDEFDIPDLTDNSRRQLFRTKSKRRFFFRVSEEQQKQQRREMLKDPFVRSKLISPP
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE3 TNFNHLVHVGPANGRPGARDKSPAPEEKGRVARGSGPQRPHSFSEALRRPASMGSEGLGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TNFNHLVHVGPANGRPGARDKSPAPEEKGRVARGSGPQRPHSFSEALRRPASMGSEGLGG
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550
pF1KE3 DADPMKRKPWTSLSSESVSCPQGSLSPATSLMQVSERPRSLPLSPELESSP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DADPMKRKPWTSLSSESVSCPQGSLSPATSLMQVSERPRSLPLSPELESSP
1510 1520 1530 1540 1550
>>CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1638 aa)
initn: 3862 init1: 1978 opt: 2148 Z-score: 947.2 bits: 188.1 E(32554): 1.9e-46
Smith-Waterman score: 4559; 46.4% identity (71.3% similar) in 1631 aa overlap (2-1528:4-1589)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MERRLRALEQLA-RGEA---GGCPGLDGLLDLLLALHHELSSGPLRRERSVAQFLSWA
: ::: :::. : : : : ... :::.:. :. : ...:::::... ..: ::
CCDS15 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 SPFVSKVKELRLQRDDFEILKVIGRGAFGEVTVVRQRDTGQIFAMKMLHKWEMLKRAETA
.::.::::..::.:.::::::::::::::::.::. ... ..::::.:.:::::::::::
CCDS15 KPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 CFREERDVLVKGDSRWVTTLHYAFQDEEYLYLVMDYYAGGDLLTLLSRFEDRLPPELAQF
::::::::::.::..:.:::::::::.. ::::::::.:::::::::.:::::: ..:.:
CCDS15 CFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEDMARF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 YLAEMVLAIHSLHQLGYVHRDVKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLRLNTNGMVDSSVAVGT
::::::.:: :.::: :::::.::::.:.:.:::::::::::::.: .: :.:::::::
CCDS15 YLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 PDYISPEILQAMEEGKGHYGPQCDWWSLGVCAYELLFGETPFYAESLVETYGKIMNHEDH
:::::::::::::.:::.:::.::::::::: ::.:.::::::::::::::::::::...
CCDS15 PDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHKER
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 LQFPPDVPDVPASAQDLIRQLLCRQEERLGRGGLDDFRNHPFFEGVDWERLASSTAPYIP
.::: .: :: .:.::::.:.: .:.:::..:..::..:::: :.::. . . :::::
CCDS15 FQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIP
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
pF1KE3 ELRGPMDTSNFDVDDDTLNHPGTLPPPSHGAFSGHHLPFVGFTYTSG-----------SH
:. .: :::::::::: :.. :.:::.: ::::::::::::::::. .
CCDS15 EVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHLPFVGFTYTSSCVLSDRSCLRVTA
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440
pF1KE3 SPES------------SSEAWAALERKLQCLEQEKVELSRKHQEALHA-----------P
.: : .. : : ::... :::::.::::: ::. .. :
CCDS15 GPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAYERRIKRLEQEKLELSRKLQESTQTVQALQYSTVDGP
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490
pF1KE3 -TDHRELE--QLRKEVQTLRDRLPEMLRDKASLSQTDGPPAGSPGQDSDLRQELDRLHRE
: ..:: .:..:.. :: .. : . . .: .... .::::: :.
CCDS15 LTASKDLEIKNLKEEIEKLRKQVTESSHLEQQLEEANA-----------VRQELDDAFRQ
490 500 510 520
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 LAEGRAGLQAQEQELCRAQGQQEELLQRLQEAQEREAATASQTRALSSQLEE-ARAAQRE
. .: :... : :..: :..:. : :: ::. : : : :. .. . :
CCDS15 I-------KAYEKQIKTLQ-QEREDLNKLEVHTEALAAEASKDRKLREQSEHYSKQLENE
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590 600
pF1KE3 LEA----QVS------SLSRQ--VTQLQGQWEQRL----EESSQAKTIHTASETNGMGPP
::. :.: :. .: .:.:. . :.. :: :. . :: :.: ...
CCDS15 LEGLKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFYEEELSKREGIH-ANEIKNLKKE
590 600 610 620 630 640
610 620 630 640
pF1KE3 --EGGPQEAQLRKEVAALREQLEQAHSHRPSGKEEALCQ-----------LQEENRRLSR
.. :. : ::. :...::... . : .:: . : :::..:.
CCDS15 LHDSEGQQLALNKEIMILKDKLEKTRRESQSEREEFESEFKQQYEREKVLLTEENKKLTS
650 660 670 680 690 700
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 EQERLEAELAQEQESKQRLEGE------RRETESNWEAQLADILSWVNDEKVSRGYLQAL
: ..: . . . .:.:: : ..:. ..::::...:..::.::: .:::::::
CCDS15 ELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADKKESVAHWEAQITEIIQWVSDEKDARGYLQAL
710 720 730 740 750 760
710 720 730 740 750 760
pF1KE3 ATKMAEELESLRNVGTQTLPARPLDHQWKARRLQKMEASARLELQSALEAEIRAKQGLQE
:.::.::::.::: ..: .: : :: ::. :.. ::::::::::.:::::::..::
CCDS15 ASKMTEELEALRN---SSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQSALDAEIRAKQAIQE
770 780 790 800 810
770 780 790 800 810
pF1KE3 RLTQVQEAQLQAERRLQEAEKQSQALQQELAML---REELRARGPVDTKPSNSLIPFLSF
.:..:. ... .: .:...::.. : .:. .: ::::.. .. . :. ::.:
CCDS15 ELNKVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEELRSEKGIEHQDSQH--SFLAF
820 830 840 850 860 870
820 830 840 850 860 870
pF1KE3 RSSEKDSAKDPGISGEATRHG-GEPDLRPEGRRSLRMGAVFPRAPTANTASTEGLPAKPG
.. : : : . ..: . : :: .: : .. :.: :
CCDS15 LNTPTD-ALDQFETVDSTPLSVHTPTLRKKG------------CP-----GSTGFPPKRK
880 890 900 910
880 890 900 910 920 930
pF1KE3 SHTLRPRSFPSPTKCLRCTSLMLGLGRQGLGCDACGYFCHTTCAPQAPP-CPVPPDLLRT
.: . .:: .:::: .:::::.:: ::: .:..::. :: ::. .:: :::::. .
CCDS15 THQFFVKSFTTPTKCHQCTSLMVGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNKAPTTCPVPPEQTKG
920 930 940 950 960 970
940 950 960 970 980 990
pF1KE3 ALGVHPETGTGTAYEGFLSVPRPSGVRRGWQRVFAALSDSRLLLFDAPDLRLSPPSGALL
::. :. : :::::: . .:.:.::..::::..: . : .:.:.: . . : :: ..
CCDS15 PLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPKPAGVKKGWQRALAIVCDFKLFLYDIAEGKASQPSVVIS
980 990 1000 1010 1020 1030
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 QVLDLRDPQFSATPVLASDVIHAQSRDLPRIFRVTTSQLAVPPTTCTVLLLAESEGERER
::.:.:: .::.. :::::::::. .:.: :::::.:::.. . :..:.::..:.:...
CCDS15 QVIDMRDEEFSVSSVLASDVIHASRKDIPCIFRVTASQLSASNNKCSILMLADTENEKNK
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE3 WLQVLGELQRLLLDARPRPRPVYTLKEAYDNGLPLLPHTLCAAILDQDRLALGTEEGLFV
:. ::.::...: . : : ::. :::::. :::. : :::.:..:.:::.::::::
CCDS15 WVGVLSELHKILKKNKFRDRSVYVPKEAYDSTLPLIKTTQAAAIIDHERIALGNEEGLFV
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE3 IHLRSNDIFQVGECRRVQQLTLSPSAGLLVVLCGRGPSVRLFALAELENIEVAGAKIPES
.:. ...:..::. ....:. : :. :..:. ::. :::: .. :.. :. :. :.
CCDS15 VHVTKDEIIRVGDNKKIHQIELIPNDQLVAVISGRNRHVRLFPMSALDGRETDFYKLSET
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE3 RGCQVLAAGSILQARTPVLCVAVKRQVLCYQLGPGPGPWQRRIRELQAPATVQSLGLLGD
.:::....:.. .. ::::.:::::::.: . .:...:.:.: .:: ......
CCDS15 KGCQTVTSGKVRHGALTCLCVAMKRQVLCYELFQSK-TRHRKFKEIQVPYNVQWMAIFSE
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KE3 RLCVGAAGGFALYPLLNEAAPLALGAGLVPEELPPSRGGLGEALGAVELSLSEFLLLFTT
.:::: .:: ::: .:. : .. . . : .:. :::.: .:.:: :..
CCDS15 QLCVGFQSGFLRYPLNGEGNPYSMLHS-NDHTLSFIAHQPMDAICAVEISSKEYLLCFNS
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KE3 AGIYVDGAGRKSRGHELLWPAAPMGWGYAAPYLTVFSENSIDVFDVRRAEWVQTVPLKKV
:::.: ::.:: .::.::: : . : ::::.:.:::..:.::: ::.::.:::::
CCDS15 IGIYTDCQGRRSRQQELMWPANPSSCCYNAPYLSVYSENAVDIFDVNSMEWIQTLPLKKV
1340 1350 1360 1370 1380 1390
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE3 RPLNPEGSLFLYGTEKVRLTYLRNQLAEKDEFDIPDLTDNSRRQLFRT-KSKRRFFFRVS
:::: :::: : : : .:: :..:..:: ::. .:. .::::.:. :. ..:::. :::
CCDS15 RPLNNEGSLNLLGLETIRLIYFKNKMAEGDELVVPETSDNSRKQMVRNINNKRRYSFRVP
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KE3 EEQQKQQRREMLKDPFVRSKLISPPTNFNHLVHVGPANGRPGARD--KSPAPEEKGRVAR
::.. :::::::.:: .:.:::: ::::::..:.::..: .: .: :.:. :
CCDS15 EEERMQQRREMLRDPEMRNKLISNPTNFNHIAHMGPGDGIQILKDLPMNPRPQESRTVFS
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1480 1490 1500 1510
pF1KE3 GS-----------GPQRPHSFSEAL--RRPASMGS---EGLGGDADPMKRKPWTSLSSES
:: : : : : .: : :. :: . ..: . ::.: : : :
CCDS15 GSVSIPSITKSRPEPGRSMSASSGLSARSSAQNGSALKREFSGGSYSAKRQPMPSPSEGS
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1520 1530 1540 1550
pF1KE3 VSC---PQGSLSPATSLMQVSERPRSLPLSPELESSP
.: ::: .::
CCDS15 LSSGGMDQGSDAPARDFDGEDSDSPRHSTASNSSNLSSPPSPASPRKTKSLSLESTDRGS
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: ::: :::. : : : : ... :::.:. :. : ...:::::... ..: ::
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pF1KE3 SPFVSKVKELRLQRDDFEILKVIGRGAFGEVTVVRQRDTGQIFAMKMLHKWEMLKRAETA
.::.::::..::.:.::::::::::::::::.::. ... ..::::.:.:::::::::::
CCDS15 KPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETA
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pF1KE3 CFREERDVLVKGDSRWVTTLHYAFQDEEYLYLVMDYYAGGDLLTLLSRFEDRLPPELAQF
::::::::::.::..:.:::::::::.. ::::::::.:::::::::.:::::: ..:.:
CCDS15 CFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEDMARF
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::::::.:: :.::: :::::.::::.:.:.:::::::::::::.: .: :.:::::::
CCDS15 YLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGT
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240 250 260 270 280 290
pF1KE3 PDYISPEILQAMEEGKGHYGPQCDWWSLGVCAYELLFGETPFYAESLVETYGKIMNHEDH
:::::::::::::.:::.:::.::::::::: ::.:.::::::::::::::::::::...
CCDS15 PDYISPEILQAMEDGKGRYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHKER
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.::: .: :: .:.::::.:.: .:.:::..:..::..:::: :.::. . . :::::
CCDS15 FQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREHRLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIP
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360 370 380 390 400
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:. .: :::::::::: :.. :.:::.: ::::::::::::::::. .
CCDS15 EVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPPTHTAFSGHHLPFVGFTYTSSCVLSDRSCLRVTA
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pF1KE3 SPES------------SSEAWAALERKLQCLEQEKVELSRKHQEA---------------
.: : .. : : ::... :::::.::::: ::.
CCDS15 GPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAYERRIKRLEQEKLELSRKLQESTQTVQALQYSTVDGP
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440 450 460 470 480
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: : : ..:.:.:::.: : ..: ..:.. .. : :. . : .
CCDS15 LTASKDLEIKNLKEEIEKLRKQV-TESSHLEQQLEEANAVRQELDDAFRQIKAYEKQIKT
490 500 510 520 530
490 500 510 520 530
pF1KE3 LRQELDRLHRELAEGRAGLQAQEQELCRAQGQQEELLQRLQEAQERE-------------
:.:: . :..::... :. : .:: :. :.. .:...: .::
CCDS15 LQQEREDLNKELVQASERLKNQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERLTELHTQKQKLARH
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540 550
pF1KE3 ---------------------------------------AATASQTRALSSQLEE-ARAA
:: ::. : : : :. ..
CCDS15 VRDKEEEVDLVMQKVESLRQELRRTERAKKELEVHTEALAAEASKDRKLREQSEHYSKQL
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pF1KE3 QRELEA----QVS------SLSRQ--VTQLQGQWEQRL----EESSQAKTIHTASETNGM
. :::. :.: :. .: .:.:. . :.. :: :. . :: :.: ...
CCDS15 ENELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFYEEELSKREGIH-ANEIKNL
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pF1KE3 GPP--EGGPQEAQLRKEVAALREQLEQAHSHRPSGKEEALCQ-----------LQEENRR
.. :. : ::. :...::... . : .:: . : :::..
CCDS15 KKELHDSEGQQLALNKEIMILKDKLEKTRRESQSEREEFESEFKQQYEREKVLLTEENKK
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pF1KE3 LSREQERLEAELAQEQESKQRLEGE------RRETESNWEAQLADILSWVNDEKVSRGYL
:. : ..: . . . .:.:: : ..:. ..::::...:..::.::: .::::
CCDS15 LTSELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADKKESVAHWEAQITEIIQWVSDEKDARGYL
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::::.::.::::.::: ..: .: : :: ::. :.. ::::::::::.:::::::.
CCDS15 QALASKMTEELEALRN---SSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQSALDAEIRAKQA
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pF1KE3 LQERLTQVQEAQLQAERRLQEAEKQSQALQQELAML---REELRARGPVDTKPSNSLIPF
.::.:..:. ... .: .:...::.. : .:. .: ::::.. .. . :. :
CCDS15 IQEELNKVKASNIITECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEELRSEKGIEHQDSQH--SF
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pF1KE3 LSFRSSEKDSAKDPGISGEATRHG-GEPDLRPEGRRSLRMGAVFPRAPTANTASTEGLPA
:.: .. : : : . ..: . : :: .: : .. :.:
CCDS15 LAFLNTPTD-ALDQFETVDSTPLSVHTPTLRKKG------------CP-----GSTGFPP
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pF1KE3 KPGSHTLRPRSFPSPTKCLRCTSLMLGLGRQGLGCDACGYFCHTTCAPQAPP-CPVPPDL
: .: . .:: .:::: .:::::.:: ::: .:..::. :: ::. .:: :::::.
CCDS15 KRKTHQFFVKSFTTPTKCHQCTSLMVGLIRQGCSCEVCGFSCHITCVNKAPTTCPVPPEQ
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pF1KE3 LRTALGVHPETGTGTAYEGFLSVPRPSGVRRGWQRVFAALSDSRLLLFDAPDLRLSPPSG
. ::. :. : :::::: . .:.:.::..::::..: . : .:.:.: . . : ::
CCDS15 TKGPLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPKPAGVKKGWQRALAIVCDFKLFLYDIAEGKASQPSV
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pF1KE3 ALLQVLDLRDPQFSATPVLASDVIHAQSRDLPRIFRVTTSQLAVPPTTCTVLLLAESEGE
.. ::.:.:: .::.. :::::::::. .:.: :::::.:::.. . :..:.::..:.:
CCDS15 VISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIHASRKDIPCIFRVTASQLSASNNKCSILMLADTENE
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE3 RERWLQVLGELQRLLLDARPRPRPVYTLKEAYDNGLPLLPHTLCAAILDQDRLALGTEEG
...:. ::.::...: . : : ::. :::::. :::. : :::.:..:.:::.:::
CCDS15 KNKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSVYVPKEAYDSTLPLIKTTQAAAIIDHERIALGNEEG
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CCDS15 LFVVHVTKDEIIRVGDNKKIHQIELIPNDQLVAVISGRNRHVRLFPMSALDGRETDFYKL
1240 1250 1260 1270 1280 1290
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pF1KE3 PESRGCQVLAAGSILQARTPVLCVAVKRQVLCYQLGPGPGPWQRRIRELQAPATVQSLGL
:..:::....:.. .. ::::.:::::::.: . .:...:.:.: .:: ...
CCDS15 SETKGCQTVTSGKVRHGALTCLCVAMKRQVLCYELFQSK-TRHRKFKEIQVPYNVQWMAI
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1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KE3 LGDRLCVGAAGGFALYPLLNEAAPLALGAGLVPEELPPSRGGLGEALGAVELSLSEFLLL
....:::: .:: ::: .:. : .. . . : .:. :::.: .:.::
CCDS15 FSEQLCVGFQSGFLRYPLNGEGNPYSMLHS-NDHTLSFIAHQPMDAICAVEISSKEYLLC
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KE3 FTTAGIYVDGAGRKSRGHELLWPAAPMGWGYAAPYLTVFSENSIDVFDVRRAEWVQTVPL
:.. :::.: ::.:: .::.::: : . : ::::.:.:::..:.::: ::.::.::
CCDS15 FNSIGIYTDCQGRRSRQQELMWPANPSSCCYNAPYLSVYSENAVDIFDVNSMEWIQTLPL
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE3 KKVRPLNPEGSLFLYGTEKVRLTYLRNQLAEKDEFDIPDLTDNSRRQLFRT-KSKRRFFF
::::::: :::: : : : .:: :..:..:: ::. .:. .::::.:. :. ..:::. :
CCDS15 KKVRPLNNEGSLNLLGLETIRLIYFKNKMAEGDELVVPETSDNSRKQMVRNINNKRRYSF
1480 1490 1500 1510 1520 1530
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KE3 RVSEEQQKQQRREMLKDPFVRSKLISPPTNFNHLVHVGPANGRPGARD--KSPAPEEKGR
:: ::.. :::::::.:: .:.:::: ::::::..:.::..: .: .: :.
CCDS15 RVPEEERMQQRREMLRDPEMRNKLISNPTNFNHIAHMGPGDGIQILKDLPMNPRPQESRT
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KE3 VARGSGPQRPHSFSEALRRPASMGSEGLGGDADPMKRKPWTSLSSESVSCPQGSLSPATS
CCDS15 VFSGSVSIPSITKSRPEPGRSMSASSGLSARSSAQNGSALKREFSGGSYSAKRQPMPSPS
1600 1610 1620 1630 1640 1650
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10 20 30 40 50
pF1KE3 MERRLRALEQLA-----RGEAGGCPGLDGLLDLLLALHHELSSGPLRRERSVAQFLSW
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CCDS99 MSAKVRLKKLEQLLLDGPWRNESA--LSVETLLDVLVCLYTECSHSALRRDKYVAEFLEW
10 20 30 40 50
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pF1KE3 ASPFVSKVKELRLQRDDFEILKVIGRGAFGEVTVVRQRDTGQIFAMKMLHKWEMLKRAET
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CCDS99 AKPFTQLVKEMQLHREDFEIIKVIGRGAFGEVAVVKMKNTERIYAMKILNKWEMLKRAET
60 70 80 90 100 110
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pF1KE3 ACFREERDVLVKGDSRWVTTLHYAFQDEEYLYLVMDYYAGGDLLTLLSRFEDRLPPELAQ
:::::::::::.:: .:.:.::::::::..::::::::.:::::::::.:::.:: ..:.
CCDS99 ACFREERDVLVNGDCQWITALHYAFQDENHLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDKLPEDMAR
120 130 140 150 160 170
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pF1KE3 FYLAEMVLAIHSLHQLGYVHRDVKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLRLNTNGMVDSSVAVG
::..:::::: :.::: :::::.::::::::::::::::::::::..: .: :.::::::
CCDS99 FYIGEMVLAIDSIHQLHYVHRDIKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLKMNDDGTVQSSVAVG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 TPDYISPEILQAMEEGKGHYGPQCDWWSLGVCAYELLFGETPFYAESLVETYGKIMNHED
::::::::::::::.: :.:::.::::::::: ::.:.:::::::::::::::::::::.
CCDS99 TPDYISPEILQAMEDGMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHEE
240 250 260 270 280 290
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pF1KE3 HLQFPPDVPDVPASAQDLIRQLLCRQEERLGRGGLDDFRNHPFFEGVDWERLASSTAPYI
..::: : :: :.:::..:.: .:.:::..:..::..: ::::..:: . . ::::
CCDS99 RFQFPSHVTDVSEEAKDLIQRLICSRERRLGQNGIEDFKKHAFFEGLNWENIRNLEAPYI
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KE3 PELRGPMDTSNFDVDDDTLNHPGTLPPPSHGAFSGHHLPFVGFTYTSGS-HSPESS----
:.. .: ::::::::::.: . ::: :: .::: ::::.:::.:. : : ..:
CCDS99 PDVSSPSDTSNFDVDDDVLRNTEILPPGSHTGFSGLHLPFIGFTFTTESCFSDRGSLKSI
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440
pF1KE3 ------------------SEAWAALERKLQCLEQEKVELSRKHQEA------LHAPTD--
: : ::... :::::.::::: ::. ::. .
CCDS99 MQSNTLTKDEDVQRDLEHSLQMEAYERRIRRLEQEKLELSRKLQESTQTVQSLHGSSRAL
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480
pF1KE3 -----HRELEQLRKEVQTLRD------RLPEMLRDKASLSQT--DGPPA--GSPGQDSDL
.:...: .:.. :.. :: ..:.: ..: : :. : : .
CCDS99 SNSNRDKEIKKLNEEIERLKNKIADSNRLERQLEDTVALRQEREDSTQRLRGLEKQHRVV
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 RQELDRLHRELAEGRAGLQAQEQELCRAQGQQEELLQRLQEAQEREAATASQTRALSSQL
::: ..::..:.:. :..: .:: :. :.. ::...: .:: : .: . .: ::
CCDS99 RQEKEELHKQLVEASERLKSQAKELKDAHQQRKLALQEFSELNERMAELRAQKQKVSRQL
540 550 560 570 580 590
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pF1KE3 ----EEARAAQRELEAQVSSLSRQVT---QLQGQWEQRLEESSQAKTI--HTA-------
:: ..: ....:. . . : .:..: .. . :.:. . . :.
CCDS99 RDKEEEMEVATQKVDAMRQEMRRAEKLRKELEAQLDDAVAEASKERKLREHSENFCKQME
600 610 620 630 640 650
600
pF1KE3 SETNGMGPPEGG---------PQEAQ----------------------------------
:: ... .:: :: .
CCDS99 SELEALKVKQGGRGAGATLEHQQEISKIKSELEKKVLFYEEELVRREASHVLEVKNVKKE
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pF1KE3 ----------LRKEVAALREQLEQAHSHRPSGKEEALCQLQE-----------ENRRLSR
:.::. :...::... .: . :::. ... ::..:.
CCDS99 VHDSESHQLALQKEILMLKDKLEKSKRERHNEMEEAVGTIKDKYERERAMLFDENKKLTA
720 730 740 750 760 770
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 EQERLEAELAQEQESKQRLEGE------RRETESNWEAQLADILSWVNDEKVSRGYLQAL
:.:.: . . . ....:: : ..:. ..::::.:.:..::.::: .:::::::
CCDS99 ENEKLCSFVDKLTAQNRQLEDELQDLAAKKESVAHWEAQIAEIIQWVSDEKDARGYLQAL
780 790 800 810 820 830
710 720 730 740 750 760
pF1KE3 ATKMAEELESLRNVGTQTLPARPLDHQWKARRLQKMEASARLELQSALEAEIRAKQGLQE
:.::.::::.:: ...: .: :: ::.:: ::.. :::::::::::::::::: .::
CCDS99 ASKMTEELEALR---SSSLGSRTLDPLWKVRRSQKLDMSARLELQSALEAEIRAKQLVQE
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CCDS12 IVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYL
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360 370 380 390 400 410
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CCDS12 EGATDTCNFDLVEDGLTAMVSGGGETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMALR-DSEVPG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 WAALERKLQCLEQEKVELSRKHQEALHAPTDHRELEQLRKEVQTLRDRLPEMLRDKASLS
. .: :: :. : . : ..::. :. :. .:. :.
CCDS12 PTPME-----LEAEQ--LLEPH---VQAPS-------LEPSVSP-QDETAEV--------
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pF1KE3 QTDGPPAGSPGQDSDLRQELDRLHRELAEGRAGLQAQEQELCRAQGQQEELLQRLQEAQE
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CCDS12 ---AVPAAVPAAEAEAEVTL----RELQEA----------------LEEEVLTRQSLSRE
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pF1KE3 REAATASQTRALSSQLEEARAAQRELEAQVSSLSRQVTQLQGQWEQRLEESSQAKTIHTA
:: .... ..:::.::.: .:.:::.: .:.... ::.. . . ..
CCDS12 MEAIR-TDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPP
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:. .: :: . . : :..: :. :: : ::: :
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610 620
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::: :::...:.:::::.: .::::::.....::..: :: :.:.:..::: :
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:::::: :::.:::: :.::. : .:. :. :...: :: :::. .: :. :
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:: .:: : ::::::..:. . .: . . .: :: :. : . :
CCDS46 TLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMALR-DSEVPGPTPME-----LEAEQ--LLEPH---
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:: :. .::.: : . ..: :: .... ..:::.::.: .:.
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:..: :. :: : ::: :
CCDS46 RRHLLLPARVPRP-GLSEALSLLLFAVVLSRAAALGCIGLVAHAGQLTAVWRRPGAARAP
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CCDS11 KDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQLVRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRSDSA
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CCDS11 FFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD--VPEKWARF
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CCDS11 YTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSGHLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDTAVGT
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CCDS11 PDYISPEVLKS-QGGDGYYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMNHKNS
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CCDS11 LTFPDD-NDISKEAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIKRHLFFKNDQWAWETLRDTVAPV
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CCDS11 VPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPK--AFVGNQLPFVGFTYYSNRRYLSSANPND
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.::.: .:...:: .::. ...:.. .: . ..
CCDS11 NRTSSNADKSLQESLQKTIYKLEEQLHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKIMKELDEEGNQ
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. ::: ::. :.: .:.:...::...: .:. . :. : .
CCDS11 NSKSQTDKDYYQLQAILEAERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEEVKHLKHNLEKVEGERK
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.:. . :. .: :.. . .. .:..:: . . .: . :. .: :.
CCDS11 EAQDMLNHSEKEKNNLEIDLNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKARLTDKHQSIEEAKSVAM
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.. ...:. .: :: .: : ..:. : . . .. .:.:: ..: :
CCDS11 KNLTLQLEQESNKRLLLQNELKTQAFEADNLK--GLEKQMKQEINTLLEAKRLLEFEL-A
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CCDS11 QLTKQYRGNEGQMRELQDQLEAEQYFSTLYKTQVKELKEEIEEKNRENLKKIQELQNEKE
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. : : .:: . : . ::: .. :. :.. . ..:: .
CCDS11 TLATQLDLAETKAESEQLARGLLEEQYFELTQESKKAASRNRQEITDKDHTVSRLEEANS
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CCDS11 MLTKDIEILRRENEELTEKMKKAEEEYKLEKEEEISNLKAAFEKNINTERTLKTQAVNKL
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CCDS11 AEIMNRKDFKIDRKKANTQDLRKKEKENRKLQLELNQEREKFNQMVVKHQKELNDMQAQL
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CCDS11 VEECAHRNELQMQLASKESDIEQLRAKLLDLSDSTSVASFPSADETDGNLPESRIEGWLS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]