Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3471
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3471, 1452 aa
1>>>pF1KE3471 1452 - 1452 aa - 1452 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.3984+/-0.000499; mu= -15.7841+/- 0.031
mean_var=810.7006+/-174.863, 0's: 0 Z-trim(124.3): 556 B-trim: 2746 in 1/58
Lambda= 0.045045
statistics sampled from 44842 (45783) to 44842 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.791), E-opt: 0.2 (0.537), width: 16
Scan time: 19.040
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_112557 (OMIM: 603309) cyclin-dependent kinase 1 (1452) 9679 645.9 6.4e-184
NP_003709 (OMIM: 603309) cyclin-dependent kinase 1 (1512) 7130 480.3 4.8e-134
XP_016868239 (OMIM: 603309) PREDICTED: cyclin-depe (1542) 5687 386.6 8.2e-106
XP_016868240 (OMIM: 603309) PREDICTED: cyclin-depe (1482) 5673 385.6 1.5e-105
XP_011513899 (OMIM: 603309) PREDICTED: cyclin-depe ( 905) 5661 384.6 1.9e-105
NP_055898 (OMIM: 615514) cyclin-dependent kinase 1 (1481) 2806 199.3 1.8e-49
XP_011523198 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1393) 2679 191.0 5.4e-47
XP_016880234 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1393) 2679 191.0 5.4e-47
XP_016880237 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1393) 2679 191.0 5.4e-47
XP_016880233 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1393) 2679 191.0 5.4e-47
XP_011523199 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1393) 2679 191.0 5.4e-47
XP_011523202 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1393) 2679 191.0 5.4e-47
XP_011523205 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1393) 2679 191.0 5.4e-47
XP_011523197 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1393) 2679 191.0 5.4e-47
XP_011523196 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1393) 2679 191.0 5.4e-47
XP_011523201 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1393) 2679 191.0 5.4e-47
XP_016880236 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1393) 2679 191.0 5.4e-47
XP_016880238 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1393) 2679 191.0 5.4e-47
XP_016880235 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1393) 2679 191.0 5.4e-47
XP_011523200 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1393) 2679 191.0 5.4e-47
XP_011523207 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1393) 2679 191.0 5.4e-47
XP_011523203 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1393) 2679 191.0 5.4e-47
XP_011523195 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1393) 2679 191.0 5.4e-47
XP_011523208 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1393) 2679 191.0 5.4e-47
XP_011523204 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1393) 2679 191.0 5.4e-47
NP_057591 (OMIM: 615514) cyclin-dependent kinase 1 (1490) 2679 191.1 5.6e-47
XP_005257515 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1256) 2674 190.6 6.3e-47
XP_016880240 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1262) 2674 190.7 6.3e-47
XP_016880241 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1262) 2674 190.7 6.3e-47
XP_011523209 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1262) 2674 190.7 6.3e-47
XP_016880239 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1262) 2674 190.7 6.3e-47
XP_005257513 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1489) 2676 190.9 6.4e-47
XP_016880242 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1261) 2671 190.5 7.3e-47
XP_011523194 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-depe (1464) 1854 137.4 7.7e-31
NP_001252 (OMIM: 603251) cyclin-dependent kinase 9 ( 372) 976 79.7 4.7e-14
XP_016870050 (OMIM: 610076) PREDICTED: cyclin-depe ( 351) 776 66.7 3.7e-10
XP_016870051 (OMIM: 610076) PREDICTED: cyclin-depe ( 329) 746 64.7 1.4e-09
XP_006715898 (OMIM: 603368,616080) PREDICTED: cycl ( 326) 673 59.9 3.7e-08
NP_001250 (OMIM: 603368,616080) cyclin-dependent k ( 326) 673 59.9 3.7e-08
NP_001138778 (OMIM: 603368,616080) cyclin-dependen ( 326) 673 59.9 3.7e-08
NP_620603 (OMIM: 602521) mitogen-activated protein ( 816) 686 61.2 3.7e-08
NP_620602 (OMIM: 602521) mitogen-activated protein ( 816) 686 61.2 3.7e-08
NP_002740 (OMIM: 602521) mitogen-activated protein ( 816) 686 61.2 3.7e-08
XP_006721621 (OMIM: 602521) PREDICTED: mitogen-act ( 822) 681 60.9 4.7e-08
XP_006721622 (OMIM: 602521) PREDICTED: mitogen-act ( 822) 681 60.9 4.7e-08
XP_006721620 (OMIM: 602521) PREDICTED: mitogen-act ( 822) 681 60.9 4.7e-08
NP_001790 (OMIM: 601955) cyclin-dependent kinase 7 ( 346) 634 57.4 2.2e-07
NP_001278274 (OMIM: 176873) cyclin-dependent kinas ( 772) 645 58.5 2.3e-07
NP_000066 (OMIM: 123829,609048) cyclin-dependent k ( 303) 627 56.9 2.8e-07
NP_001034892 (OMIM: 610076) cyclin-dependent kinas ( 346) 628 57.0 2.9e-07
>>NP_112557 (OMIM: 603309) cyclin-dependent kinase 13 is (1452 aa)
initn: 9679 init1: 9679 opt: 9679 Z-score: 3423.0 bits: 645.9 E(85289): 6.4e-184
Smith-Waterman score: 9679; 100.0% identity (100.0% similar) in 1452 aa overlap (1-1452:1-1452)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQPPPPPPPLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQPPPPPPPLLF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 LAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 FSLPQPQQDGGGGASSGGGVTPLVEYEDVSSQSEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 FSLPQPQQDGGGGASSGGGVTPLVEYEDVSSQSEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PASSSGTQRRGEGSERRPRRDRRSSSGRSKERHREHRRRDGQRGGSEASKSRSRHSHSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 PASSSGTQRRGEGSERRPRRDRRSSSGRSKERHREHRRRDGQRGGSEASKSRSRHSHSGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ERAEVAKSGSSSSSGGRRKSASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 ERAEVAKSGSSSSSGGRRKSASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 REDKTEPKAYRRRRSLSPLGGRDDSPVSHRASQSLRSRKSPSPAGGGSSPYSRRLPRSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 REDKTEPKAYRRRRSLSPLGGRDDSPVSHRASQSLRSRKSPSPAGGGSSPYSRRLPRSPS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 PYSRRRSPSYSRHSSYERGGDVSPSPYSSSSWRRSRSPYSPVLRRSGKSRSRSPYSSRHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 PYSRRRSPSYSRHSSYERGGDVSPSPYSSSSWRRSRSPYSPVLRRSGKSRSRSPYSSRHS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 RSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 RSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EAAAKAAKASNTSTPTKGNTETSASASQTNHVKDVKKIKIEHAPSPSSGGTLKNDKAKTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 EAAAKAAKASNTSTPTKGNTETSASASQTNHVKDVKKIKIEHAPSPSSGGTLKNDKAKTK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 PPLQVTKVENNLIVDKATKKAVIVGKESKSAATKEESVSLKEKTKPLTPSIGAKEKEQHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 PPLQVTKVENNLIVDKATKKAVIVGKESKSAATKEESVSLKEKTKPLTPSIGAKEKEQHV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 ALVTSTLPPLPLPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 ALVTSTLPPLPLPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 LSKSPEEKKTATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 LSKSPEEKKTATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 KARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 KARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 KKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 KKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 SNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 SNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSC
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 GCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 GCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 REEFVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 REEFVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHEL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 WSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 WSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPGE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 KQTDPSTPQQESSKPLGGIQPSSQTIQPKVETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 KQTDPSTPQQESSKPLGGIQPSSQTIQPKVETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 VLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDMRILELTPEPDRPRILPPDQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 VLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDMRILELTPEPDRPRILPPDQR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 PPEPPEPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDPKREGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 PPEPPEPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDPKREGG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 IDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 IDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNY
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 STASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDIYLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 STASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDIYLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE3 SDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENPSGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHIST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_112 SDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENPSGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHIST
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450
pF1KE3 STGRGRGRGLPY
::::::::::::
NP_112 STGRGRGRGLPY
1450
>>NP_003709 (OMIM: 603309) cyclin-dependent kinase 13 is (1512 aa)
initn: 7127 init1: 7127 opt: 7130 Z-score: 2527.5 bits: 480.3 E(85289): 4.8e-134
Smith-Waterman score: 9349; 96.0% identity (96.0% similar) in 1484 aa overlap (1-1424:1-1484)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQPPPPPPPLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQPPPPPPPLLF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 FSLPQPQQDGGGGASSGGGVTPLVEYEDVSSQSEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 FSLPQPQQDGGGGASSGGGVTPLVEYEDVSSQSEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PASSSGTQRRGEGSERRPRRDRRSSSGRSKERHREHRRRDGQRGGSEASKSRSRHSHSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PASSSGTQRRGEGSERRPRRDRRSSSGRSKERHREHRRRDGQRGGSEASKSRSRHSHSGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ERAEVAKSGSSSSSGGRRKSASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ERAEVAKSGSSSSSGGRRKSASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 REDKTEPKAYRRRRSLSPLGGRDDSPVSHRASQSLRSRKSPSPAGGGSSPYSRRLPRSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 REDKTEPKAYRRRRSLSPLGGRDDSPVSHRASQSLRSRKSPSPAGGGSSPYSRRLPRSPS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 PYSRRRSPSYSRHSSYERGGDVSPSPYSSSSWRRSRSPYSPVLRRSGKSRSRSPYSSRHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PYSRRRSPSYSRHSSYERGGDVSPSPYSSSSWRRSRSPYSPVLRRSGKSRSRSPYSSRHS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 RSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EAAAKAAKASNTSTPTKGNTETSASASQTNHVKDVKKIKIEHAPSPSSGGTLKNDKAKTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EAAAKAAKASNTSTPTKGNTETSASASQTNHVKDVKKIKIEHAPSPSSGGTLKNDKAKTK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 PPLQVTKVENNLIVDKATKKAVIVGKESKSAATKEESVSLKEKTKPLTPSIGAKEKEQHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PPLQVTKVENNLIVDKATKKAVIVGKESKSAATKEESVSLKEKTKPLTPSIGAKEKEQHV
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pF1KE3 ALVTSTLPPLPLPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ALVTSTLPPLPLPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 LSKSPEEKKTATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LSKSPEEKKTATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVY
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730 740 750 760 770 780
pF1KE3 KARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDF
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pF1KE3 KKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKC
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850 860 870 880 890 900
pF1KE3 SNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSC
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pF1KE3 GCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKL
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pF1KE3 REEFVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 REEFVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHEL
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pF1KE3 WSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAP--
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 WSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPVK
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1080
pF1KE3 ----------------------------------------------------------GE
::
NP_003 TGPGQHLNHSELAILLNLLQSKTSVNMADFVQVLNIKVNSETQQQLNKINLPAGILATGE
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1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 KQTDPSTPQQESSKPLGGIQPSSQTIQPKVETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KQTDPSTPQQESSKPLGGIQPSSQTIQPKVETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKD
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1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 VLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDMRILELTPEPDRPRILPPDQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDMRILELTPEPDRPRILPPDQR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 PPEPPEPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDPKREGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PPEPPEPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDPKREGG
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1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 IDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 IDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNY
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 STASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDIYLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 STASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDIYLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE3 SDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENPSGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHIST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENPSGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHIST
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1450
pF1KE3 STGRGRGRGLPY
NP_003 STGRGRGRGLPY
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>>XP_016868239 (OMIM: 603309) PREDICTED: cyclin-dependen (1542 aa)
initn: 8197 init1: 5654 opt: 5687 Z-score: 2020.6 bits: 386.6 E(85289): 8.2e-106
Smith-Waterman score: 9058; 93.9% identity (93.9% similar) in 1484 aa overlap (1-1394:1-1484)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQPPPPPPPLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQPPPPPPPLLF
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pF1KE3 LAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSLPQPQQDGGGGASSGGGVTPLVEYEDVSSQSEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE3 ERAEVAKSGSSSSSGGRRKSASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE3 REDKTEPKAYRRRRSLSPLGGRDDSPVSHRASQSLRSRKSPSPAGGGSSPYSRRLPRSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 REDKTEPKAYRRRRSLSPLGGRDDSPVSHRASQSLRSRKSPSPAGGGSSPYSRRLPRSPS
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pF1KE3 PYSRRRSPSYSRHSSYERGGDVSPSPYSSSSWRRSRSPYSPVLRRSGKSRSRSPYSSRHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PYSRRRSPSYSRHSSYERGGDVSPSPYSSSSWRRSRSPYSPVLRRSGKSRSRSPYSSRHS
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pF1KE3 RSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKAA
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pF1KE3 EAAAKAAKASNTSTPTKGNTETSASASQTNHVKDVKKIKIEHAPSPSSGGTLKNDKAKTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EAAAKAAKASNTSTPTKGNTETSASASQTNHVKDVKKIKIEHAPSPSSGGTLKNDKAKTK
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pF1KE3 PPLQVTKVENNLIVDKATKKAVIVGKESKSAATKEESVSLKEKTKPLTPSIGAKEKEQHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALVTSTLPPLPLPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDD
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pF1KE3 LSKSPEEKKTATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSKSPEEKKTATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVY
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pF1KE3 KARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE3 KKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKC
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pF1KE3 SNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEES------------------------------RPY
::::::::::::::::::::::::::: :::
XP_016 SNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEESAWLMLIWEKVIFIWRILLMQMSAGSFGDSSRPY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE3 GSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREEFVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREEFVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAE
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1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 QALQCEFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QALQCEFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1060 1070
pF1KE3 LDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAP--------------------------------
::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPVKTGPGQHLNHSELAILLNLLQSKTSVNMADF
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pF1KE3 ----------------------------GEKQTDPSTPQQESSKPLGGIQPSSQTIQPKV
::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VQVLNIKVNSETQQQLNKINLPAGILATGEKQTDPSTPQQESSKPLGGIQPSSQTIQPKV
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pF1KE3 ETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKDVLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKDVLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
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pF1KE3 QDDLIQHQDMRILELTPEPDRPRILPPDQRPPEPPEPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QDDLIQHQDMRILELTPEPDRPRILPPDQRPPEPPEPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSS
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pF1KE3 LTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDPKREGGIDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDPKREGGIDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KE3 SNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNYSTASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNYSTASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDI
1390 1400 1410 1420 1430 1440
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pF1KE3 YLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANSSDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANSSDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENP
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pF1KE3 SGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHISTSTGRGRGRGLPY
XP_016 SGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHISTSTGRGRGRGLPY
1510 1520 1530 1540
>>XP_016868240 (OMIM: 603309) PREDICTED: cyclin-dependen (1482 aa)
initn: 5654 init1: 5654 opt: 5673 Z-score: 2015.9 bits: 385.6 E(85289): 1.5e-105
Smith-Waterman score: 9609; 98.0% identity (98.0% similar) in 1482 aa overlap (1-1452:1-1482)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQPPPPPPPLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQPPPPPPPLLF
10 20 30 40 50 60
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pF1KE3 LAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRV
70 80 90 100 110 120
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pF1KE3 FSLPQPQQDGGGGASSGGGVTPLVEYEDVSSQSEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FSLPQPQQDGGGGASSGGGVTPLVEYEDVSSQSEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGS
130 140 150 160 170 180
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pF1KE3 PASSSGTQRRGEGSERRPRRDRRSSSGRSKERHREHRRRDGQRGGSEASKSRSRHSHSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PASSSGTQRRGEGSERRPRRDRRSSSGRSKERHREHRRRDGQRGGSEASKSRSRHSHSGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ERAEVAKSGSSSSSGGRRKSASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ERAEVAKSGSSSSSGGRRKSASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 REDKTEPKAYRRRRSLSPLGGRDDSPVSHRASQSLRSRKSPSPAGGGSSPYSRRLPRSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 REDKTEPKAYRRRRSLSPLGGRDDSPVSHRASQSLRSRKSPSPAGGGSSPYSRRLPRSPS
310 320 330 340 350 360
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pF1KE3 PYSRRRSPSYSRHSSYERGGDVSPSPYSSSSWRRSRSPYSPVLRRSGKSRSRSPYSSRHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PYSRRRSPSYSRHSSYERGGDVSPSPYSSSSWRRSRSPYSPVLRRSGKSRSRSPYSSRHS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 RSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EAAAKAAKASNTSTPTKGNTETSASASQTNHVKDVKKIKIEHAPSPSSGGTLKNDKAKTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EAAAKAAKASNTSTPTKGNTETSASASQTNHVKDVKKIKIEHAPSPSSGGTLKNDKAKTK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 PPLQVTKVENNLIVDKATKKAVIVGKESKSAATKEESVSLKEKTKPLTPSIGAKEKEQHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PPLQVTKVENNLIVDKATKKAVIVGKESKSAATKEESVSLKEKTKPLTPSIGAKEKEQHV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 ALVTSTLPPLPLPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALVTSTLPPLPLPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 LSKSPEEKKTATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSKSPEEKKTATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 KARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 KKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKC
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KE3 SNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEES------------------------------RPY
::::::::::::::::::::::::::: :::
XP_016 SNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEESAWLMLIWEKVIFIWRILLMQMSAGSFGDSSRPY
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KE3 TNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRIC
910 920 930 940 950 960
940 950 960 970 980 990
pF1KE3 GSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREEFVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREEFVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAE
970 980 990 1000 1010 1020
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 QALQCEFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QALQCEFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE3 LDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPGEKQTDPSTPQQESSKPLGGIQPSSQTIQPKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPGEKQTDPSTPQQESSKPLGGIQPSSQTIQPKV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE3 ETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKDVLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKDVLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE3 QDDLIQHQDMRILELTPEPDRPRILPPDQRPPEPPEPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QDDLIQHQDMRILELTPEPDRPRILPPDQRPPEPPEPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KE3 LTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDPKREGGIDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDPKREGGIDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYV
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KE3 SNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNYSTASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNYSTASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDI
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1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE3 YLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANSSDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANSSDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENP
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1420 1430 1440 1450
pF1KE3 SGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHISTSTGRGRGRGLPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHISTSTGRGRGRGLPY
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>>XP_011513899 (OMIM: 603309) PREDICTED: cyclin-dependen (905 aa)
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pF1KE3 MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQPPPPPPPLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQPPPPPPPLLF
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pF1KE3 LAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRV
70 80 90 100 110 120
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pF1KE3 FSLPQPQQDGGGGASSGGGVTPLVEYEDVSSQSEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FSLPQPQQDGGGGASSGGGVTPLVEYEDVSSQSEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGS
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pF1KE3 PASSSGTQRRGEGSERRPRRDRRSSSGRSKERHREHRRRDGQRGGSEASKSRSRHSHSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PASSSGTQRRGEGSERRPRRDRRSSSGRSKERHREHRRRDGQRGGSEASKSRSRHSHSGE
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pF1KE3 ERAEVAKSGSSSSSGGRRKSASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ERAEVAKSGSSSSSGGRRKSASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAY
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pF1KE3 REDKTEPKAYRRRRSLSPLGGRDDSPVSHRASQSLRSRKSPSPAGGGSSPYSRRLPRSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 REDKTEPKAYRRRRSLSPLGGRDDSPVSHRASQSLRSRKSPSPAGGGSSPYSRRLPRSPS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PYSRRRSPSYSRHSSYERGGDVSPSPYSSSSWRRSRSPYSPVLRRSGKSRSRSPYSSRHS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKAA
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pF1KE3 EAAAKAAKASNTSTPTKGNTETSASASQTNHVKDVKKIKIEHAPSPSSGGTLKNDKAKTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EAAAKAAKASNTSTPTKGNTETSASASQTNHVKDVKKIKIEHAPSPSSGGTLKNDKAKTK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PPLQVTKVENNLIVDKATKKAVIVGKESKSAATKEESVSLKEKTKPLTPSIGAKEKEQHV
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pF1KE3 ALVTSTLPPLPLPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALVTSTLPPLPLPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDD
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pF1KE3 LSKSPEEKKTATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSKSPEEKKTATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVY
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pF1KE3 KARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDF
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pF1KE3 KKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKC
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pF1KE3 SNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEESRPYT---NKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDV
::::::::::::::::::::::::::: .::: .:
XP_011 SNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEESAWLMLIWEKVIFIWRILLMQMSAGSFGDSSVQF
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pF1KE3 WSCGCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYR
XP_011 RPYRL
>>NP_055898 (OMIM: 615514) cyclin-dependent kinase 12 is (1481 aa)
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..::.:::: :::: . : . .
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:. :... .: .. .:. .. . ::.. . . . :: :.:
NP_055 SKHKRHKSKHSKDMGLVTPEAASLGTVIKPLVEYDDISSDSDTFSDDMAFKLDRRENDER
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pF1KE3 SSSGRS----KERHREHRR-RDGQRGG-SEASKSRSRHSHSGEERAEVAKSGSSSSSGGR
.: :: :.::..::: :: .. .: ::. :.:: . .. ::::. :. .
NP_055 RGSDRSDRLHKHRHHQHRRSRDLLKAKQTEKEKSQEVSSKSGSMKDRI--SGSSKRSNEE
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pF1KE3 RKS-ASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAYREDKTEPKAYR-----
. ..: ..:::...:.:: :. .:.. .: :..:. :..:. .: ::.:.
NP_055 TDDYGKAQVAKSSSKESRSSKLHKEKTRKERELKSGHKDRSKSHRKRET-PKSYKTVDSP
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pF1KE3 RRRSLSPL------GGRDDSPV--------------SHRASQSLRSRKSPSPAG---GGS
.::: :: . .:::: :: .:. .:::. .. . :
NP_055 KRRSRSPHRKWSDSSKQDDSPSGASYGQDYDLSPSRSHTSSNYDSYKKSPGSTSRRQSVS
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pF1KE3 SPYS-----RRLPRSPSPYSRRR---SP-SYSRHSSYERGGDVS---PSPYSSSSWRRSR
::. . :::::::::. :: : : :::::.:. : ::::. :::
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pF1KE3 SPY--------SPV-LRRSGKSRSRSPYSSRHSRSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKS
::. ::. :.: ::::::: :::: :.:... : :::::::::: : :.:
NP_055 SPFLSKRSLSRSPLPSRKSMKSRSRSPAYSRHSSSHSKKKRSSSRSRHSSISPVRLPLNS
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450 460 470 480 490
pF1KE3 SLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKA----AEAAAKAAKASNT-----------
::.:::...:: ::: :: : .: .... . : .. :: :.
NP_055 SLGAELSRKKKERAAAAAAAKMDGKESKGSPVFLPRKENSSVEAKDSGLESKKLPRSVKL
400 410 420 430 440 450
500 510 520
pF1KE3 --STP-------TKGNTETSASA----------SQTNHVKDVKK----------IKIE--
:.: :. :::.. :. :. . :::.: .: :
NP_055 EKSAPDTELVNVTHLNTEVKNSSDTGKVKLDENSEKHLVKDLKAQGTRDSKPIALKEEIV
460 470 480 490 500 510
530 540 550
pF1KE3 ----------------------HAPSPSSGGTLKNDKAKTKPPLQVTKVENNLIVDKATK
: :.. .. ::. . . : .. .
NP_055 TPKETETSEKETPPPLPTIASPPPPLPTTTPPPQTPPLPPLPPIPALPQQPPLPPSQPAF
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560 570 580 590 600 610
pF1KE3 KAVIVGKESK---SAATKEESVSLKEKTKPLTPSIGAKEKEQHVALV----TSTLPPLPL
. : ... : :. .: .:: . ...: . ....: . . .: . :::::::::
NP_055 SQVPASSTSTLPPSTHSKTSAVSSQANSQPPV-QVSVKTQVSVTAAIPHLKTSTLPPLPL
580 590 600 610 620 630
620 630 640 650 660
pF1KE3 PPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDDLSK--SPEEKK-
::.:: : . :: . .. : :::: :.. : ::.:::::::::::: :: ::: :
NP_055 PPLLPGDDDMDSPKETLPSKPVKKEKEQRTRHLLTDLPLPPELPGGD-LSPPDSPEPKAI
640 650 660 670 680 690
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 TATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKARDKDTGE
: : :.::::: ::::: .. . :::::::::::::::::::::::::::.::::::
NP_055 TPPQQPYKKRPKICCPRYGERRQTESDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVYKAKDKDTGE
700 710 720 730 740 750
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 MVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDFKKDKGAFYL
.::::::::::::::::::::::::::::: :.:..:::::::::.::::::::::::::
NP_055 LVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLIHRSVVNMKEIVTDKQDALDFKKDKGAFYL
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790 800 810 820 830 840
pF1KE3 VFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNRG
::::::::::::::::::::.:.::::::.::::::.::::::::::::::::::::: :
NP_055 VFEYMDHDLMGLLESGLVHFSEDHIKSFMKQLMEGLEYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNSG
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850 860 870 880 890 900
pF1KE3 QIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFT
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QIKLADFGLARLYNSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFT
880 890 900 910 920 930
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 KKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREEFVFIPA
:::::::: ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::: :::.
NP_055 KKPIFQANLELAQLELISRLCGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRRLREEFSFIPS
940 950 960 970 980 990
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 AALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHELWSKKRRRQK
:::::.:.::.:::::::::::.:: .::.::: ::: ::::: :::::::::::::::.
NP_055 AALDLLDHMLTLDPSKRCTAEQTLQSDFLKDVELSKMAPPDLPHWQDCHELWSKKRRRQR
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 QMGMT-DDVSTIKAPRKDLSLGL--DDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPGEKQTDPS
: :.. .. :. ::. . : . ....: :. .:... : : . .
NP_055 QSGVVVEEPPPSKTSRKETTSGTSTEPVKNSSPAPPQPAPGKVESGAGD-AIGLADITQQ
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 TPQQESSKPLGGIQPSSQTIQPK------VETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKD
:.: . :. .: ... :. .... . :. .. : .: ...: .
NP_055 LNQSELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLNIHSNPEMQQQLEALNQSISALTEATSQQQDS
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1150 1160 1170 1180
pF1KE3 VLLEERENGSGHEASLQLRPPPEP------STPVSGQDDL--IQHQDMRILELTPE----
. .:. . .. . : : :::.. :. : . : :. : .
NP_055 ETMAPEESLKEAPSAPVILPSAEQTTLEASSTPADMQNILAVLLSQLMKTQEPAGSLEEN
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1190 1200 1210 1220
pF1KE3 -------PDRPRILP--P-----DQRPPEPP------EPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTS
:. :: : : ..:::::: :::..: :: :
NP_055 NSDKNSGPQGPRRTPTMPQEEAAEKRPPEPPGPPPPPPPPPLVEGDL------------S
1240 1250 1260 1270
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE3 SSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDPKREGGIDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAP
:. . . .: :::::::. ::. .: . ..:: . .:. :
NP_055 SAPQELNPAVTAALLQLLS--QPEAEPPGHLPHEHQA-------------LRPMEYSTRP
1280 1290 1300 1310 1320
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KE3 YVSNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNYSTASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYG
: :....: : : :.. :. ... . . . : . ...: .:.. :
NP_055 R-PNRTYGNTDGPET------GFSAIDT-DERNSGPALTESLVQTLVKNRTFSGSLSHLG
1330 1340 1350 1360 1370
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KE3 DI--YLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANSSDPSTGPE--STHPLPAKMHNYNYGG
. : ..: . : ::.: :: .. :.:. ..: : :. . :. . :::
NP_055 ESSSYQGTGSVQFPGDQDLRF--ARVPLALHPVVGQPFLKAEGSSNSVVHAETKLQNYG-
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1410 1420 1430 1440 1450
pF1KE3 NLQENPSGPSLMH-GQTWTSPAQGPGYSQGYRGHISTSTGRGRGRGLPY
.: . .: : : : .:.:. .:.. ::: . :::::.::
NP_055 ELGPGTTGASSSGAGLHWGGPTQSSAYGKLYRGPTRVPPRGGRGRGVPY
1440 1450 1460 1470 1480
>>XP_011523198 (OMIM: 615514) PREDICTED: cyclin-dependen (1393 aa)
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Smith-Waterman score: 3093; 44.7% identity (62.8% similar) in 1427 aa overlap (127-1328:10-1391)
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 RRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRVFSLPQPQQDGGGGAS------SGGGVTPLVEYEDVS
..::.:::: :::: . : . .
XP_011 MPNSERHGGKKDGSGGASGTLQPSSGGGSSNSRERHRLV
10 20 30
160 170 180 190 200
pF1KE3 SQ-----SEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGSPASSSGTQRRGEGSERRPRR--DRR
:. :... .: .. .:. .. . ::.. . . . :: :.:
XP_011 SKHKRHKSKHSKDMGLVTPEAASLGTVIKPLVEYDDISSDSDTFSDDMAFKLDRRENDER
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250
pF1KE3 SSSGRS----KERHREHRR-RDGQRGG-SEASKSRSRHSHSGEERAEVAKSGSSSSSGGR
.: :: :.::..::: :: .. .: ::. :.:: . .. ::::. :. .
XP_011 RGSDRSDRLHKHRHHQHRRSRDLLKAKQTEKEKSQEVSSKSGSMKDRI--SGSSKRSNEE
100 110 120 130 140 150
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pF1KE3 RKS-ASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAYREDKTEPKAYR-----
. ..: ..:::...:.:: :. .:.. .: :..:. :..:. .: ::.:.
XP_011 TDDYGKAQVAKSSSKESRSSKLHKEKTRKERELKSGHKDRSKSHRKRET-PKSYKTVDSP
160 170 180 190 200 210
320 330 340
pF1KE3 RRRSLSPL------GGRDDSPV--------------SHRASQSLRSRKSPSPAG---GGS
.::: :: . .:::: :: .:. .:::. .. . :
XP_011 KRRSRSPHRKWSDSSKQDDSPSGASYGQDYDLSPSRSHTSSNYDSYKKSPGSTSRRQSVS
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390
pF1KE3 SPYS-----RRLPRSPSPYSRRR---SP-SYSRHSSYERGGDVS---PSPYSSSSWRRSR
::. . :::::::::. :: : : :::::.:. : ::::. :::
XP_011 PPYKEPSAYQSSTRSPSPYSRRQRSVSPYSRRRSSSYERSGSYSGRSPSPYGR---RRSS
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440
pF1KE3 SPY--------SPV-LRRSGKSRSRSPYSSRHSRSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKS
::. ::. :.: ::::::: :::: :.:... : :::::::::: : :.:
XP_011 SPFLSKRSLSRSPLPSRKSMKSRSRSPAYSRHSSSHSKKKRSSSRSRHSSISPVRLPLNS
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490
pF1KE3 SLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKA----AEAAAKAAKASNT-----------
::.:::...:: ::: :: : .: .... . : .. :: :.
XP_011 SLGAELSRKKKERAAAAAAAKMDGKESKGSPVFLPRKENSSVEAKDSGLESKKLPRSVKL
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500 510 520
pF1KE3 --STP-------TKGNTETSASA----------SQTNHVKDVKK----------IKIE--
:.: :. :::.. :. :. . :::.: .: :
XP_011 EKSAPDTELVNVTHLNTEVKNSSDTGKVKLDENSEKHLVKDLKAQGTRDSKPIALKEEIV
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530 540 550
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: :.. .. ::. . . : .. .
XP_011 TPKETETSEKETPPPLPTIASPPPPLPTTTPPPQTPPLPPLPPIPALPQQPPLPPSQPAF
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560 570 580 590 600 610
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. : ... : :. .: .:: . ...: : ....: . . .: . ::::::::
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:::.:: : . :: . .. : :::: :.. : ::.:::::::::::: :: ::: :
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: : :.::::: ::::: .. . :::::::::::::::::::::::::::.:::::
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:.::::::::::::::::::::::::::::: :.:..:::::::::.:::::::::::::
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:::::::::::::::::::::.:.::::::.::::::.:::::::::::::::::::::
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::::::::: ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::: :::
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1080 1090
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. .. . ::. .: :..: . .:. .:. .::::.::.:.:. . :
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. ..:: . .. . : .:... . . . : .:.: : . .... :
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1320 1330 1340 1350 1360 1370
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]