Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3471
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3471, 1452 aa
1>>>pF1KE3471 1452 - 1452 aa - 1452 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.2479+/-0.00109; mu= -5.2446+/- 0.066
mean_var=543.4252+/-117.531, 0's: 0 Z-trim(116.3): 355 B-trim: 1082 in 1/55
Lambda= 0.055018
statistics sampled from 16509 (16948) to 16509 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.778), E-opt: 0.2 (0.521), width: 16
Scan time: 5.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5462.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1452) 9679 784.4 0
CCDS5461.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1512) 7130 582.1 4.3e-165
CCDS45666.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17 (1481) 2806 238.9 8.8e-62
CCDS11337.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17 (1490) 2679 228.8 9.5e-59
CCDS6879.1 CDK9 gene_id:1025|Hs108|chr9 ( 372) 976 92.9 1.8e-18
CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 816) 686 70.3 2.7e-11
CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 ( 326) 673 68.8 2.9e-11
>>CCDS5462.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1452 aa)
initn: 9679 init1: 9679 opt: 9679 Z-score: 4171.1 bits: 784.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9679; 100.0% identity (100.0% similar) in 1452 aa overlap (1-1452:1-1452)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQPPPPPPPLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQPPPPPPPLLF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 FSLPQPQQDGGGGASSGGGVTPLVEYEDVSSQSEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FSLPQPQQDGGGGASSGGGVTPLVEYEDVSSQSEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PASSSGTQRRGEGSERRPRRDRRSSSGRSKERHREHRRRDGQRGGSEASKSRSRHSHSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PASSSGTQRRGEGSERRPRRDRRSSSGRSKERHREHRRRDGQRGGSEASKSRSRHSHSGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ERAEVAKSGSSSSSGGRRKSASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ERAEVAKSGSSSSSGGRRKSASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 REDKTEPKAYRRRRSLSPLGGRDDSPVSHRASQSLRSRKSPSPAGGGSSPYSRRLPRSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 REDKTEPKAYRRRRSLSPLGGRDDSPVSHRASQSLRSRKSPSPAGGGSSPYSRRLPRSPS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 PYSRRRSPSYSRHSSYERGGDVSPSPYSSSSWRRSRSPYSPVLRRSGKSRSRSPYSSRHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PYSRRRSPSYSRHSSYERGGDVSPSPYSSSSWRRSRSPYSPVLRRSGKSRSRSPYSSRHS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 RSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EAAAKAAKASNTSTPTKGNTETSASASQTNHVKDVKKIKIEHAPSPSSGGTLKNDKAKTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EAAAKAAKASNTSTPTKGNTETSASASQTNHVKDVKKIKIEHAPSPSSGGTLKNDKAKTK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 PPLQVTKVENNLIVDKATKKAVIVGKESKSAATKEESVSLKEKTKPLTPSIGAKEKEQHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PPLQVTKVENNLIVDKATKKAVIVGKESKSAATKEESVSLKEKTKPLTPSIGAKEKEQHV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 ALVTSTLPPLPLPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ALVTSTLPPLPLPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 LSKSPEEKKTATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSKSPEEKKTATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 KARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 KKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 SNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSC
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 GCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 REEFVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 REEFVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHEL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 WSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPGE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 KQTDPSTPQQESSKPLGGIQPSSQTIQPKVETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KQTDPSTPQQESSKPLGGIQPSSQTIQPKVETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 VLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDMRILELTPEPDRPRILPPDQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDMRILELTPEPDRPRILPPDQR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 PPEPPEPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDPKREGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PPEPPEPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDPKREGG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 IDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNY
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 STASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDIYLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 STASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDIYLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE3 SDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENPSGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHIST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENPSGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHIST
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450
pF1KE3 STGRGRGRGLPY
::::::::::::
CCDS54 STGRGRGRGLPY
1450
>>CCDS5461.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1512 aa)
initn: 7127 init1: 7127 opt: 7130 Z-score: 3077.5 bits: 582.1 E(32554): 4.3e-165
Smith-Waterman score: 9349; 96.0% identity (96.0% similar) in 1484 aa overlap (1-1424:1-1484)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQPPPPPPPLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MPSSSDTALGGGGGLSWAEKKLEERRKRRRFLSPQQPPLLLPLLQPQLLQPPPPPPPLLF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 LAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LAAPGTAAAAAAAAAASSSCFSPGPPLEVKRLARGKRRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 FSLPQPQQDGGGGASSGGGVTPLVEYEDVSSQSEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FSLPQPQQDGGGGASSGGGVTPLVEYEDVSSQSEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 PASSSGTQRRGEGSERRPRRDRRSSSGRSKERHREHRRRDGQRGGSEASKSRSRHSHSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PASSSGTQRRGEGSERRPRRDRRSSSGRSKERHREHRRRDGQRGGSEASKSRSRHSHSGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ERAEVAKSGSSSSSGGRRKSASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ERAEVAKSGSSSSSGGRRKSASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 REDKTEPKAYRRRRSLSPLGGRDDSPVSHRASQSLRSRKSPSPAGGGSSPYSRRLPRSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 REDKTEPKAYRRRRSLSPLGGRDDSPVSHRASQSLRSRKSPSPAGGGSSPYSRRLPRSPS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 PYSRRRSPSYSRHSSYERGGDVSPSPYSSSSWRRSRSPYSPVLRRSGKSRSRSPYSSRHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PYSRRRSPSYSRHSSYERGGDVSPSPYSSSSWRRSRSPYSPVLRRSGKSRSRSPYSSRHS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 RSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKSSLAAELNKNKKARAAEAARAAEAAKAAEATKAA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EAAAKAAKASNTSTPTKGNTETSASASQTNHVKDVKKIKIEHAPSPSSGGTLKNDKAKTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EAAAKAAKASNTSTPTKGNTETSASASQTNHVKDVKKIKIEHAPSPSSGGTLKNDKAKTK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 PPLQVTKVENNLIVDKATKKAVIVGKESKSAATKEESVSLKEKTKPLTPSIGAKEKEQHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PPLQVTKVENNLIVDKATKKAVIVGKESKSAATKEESVSLKEKTKPLTPSIGAKEKEQHV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 ALVTSTLPPLPLPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ALVTSTLPPLPLPPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 LSKSPEEKKTATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSKSPEEKKTATQLHSKRRPKICGPRYGETKEKDIDWGKRCVDKFDIIGIIGEGTYGQVY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 KARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KARDKDTGEMVALKKVRLDNEKEGFPITAIREIKILRQLTHQSIINMKEIVTDKEDALDF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 KKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KKDKGAFYLVFEYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 SNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SNILLNNRGQIKLADFGLARLYSSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSC
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 GCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GCILGELFTKKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 REEFVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 REEFVFIPAAALDLFDYMLALDPSKRCTAEQALQCEFLRDVEPSKMPPPDLPLWQDCHEL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE3 WSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAP--
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WSKKRRRQKQMGMTDDVSTIKAPRKDLSLGLDDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPVK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080
pF1KE3 ----------------------------------------------------------GE
::
CCDS54 TGPGQHLNHSELAILLNLLQSKTSVNMADFVQVLNIKVNSETQQQLNKINLPAGILATGE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 KQTDPSTPQQESSKPLGGIQPSSQTIQPKVETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KQTDPSTPQQESSKPLGGIQPSSQTIQPKVETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 VLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDMRILELTPEPDRPRILPPDQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VLLEERENGSGHEASLQLRPPPEPSTPVSGQDDLIQHQDMRILELTPEPDRPRILPPDQR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 PPEPPEPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDPKREGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PPEPPEPPPVTEEDLDYRTENQHVPTTSSSLTDPHAGVKAALLQLLAQHQPQDDPKREGG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 IDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IDYQAGDTYVSTSDYKDNFGSSSFSSAPYVSNDGLGSSSAPPLERRSFIGNSDIQSLDNY
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 STASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDIYLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 STASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDIYLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE3 SDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENPSGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHIST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SDPSTGPESTHPLPAKMHNYNYGGNLQENPSGPSLMHGQTWTSPAQGPGYSQGYRGHIST
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1450
pF1KE3 STGRGRGRGLPY
CCDS54 STGRGRGRGLPY
1510
>>CCDS45666.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17 (1481 aa)
initn: 2668 init1: 2243 opt: 2806 Z-score: 1222.7 bits: 238.9 E(32554): 8.8e-62
Smith-Waterman score: 3184; 43.3% identity (62.2% similar) in 1519 aa overlap (127-1452:10-1481)
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 RRAGGRQKRRRGPRAGQEAEKRRVFSLPQPQQDGGGGAS------SGGGVTPLVEYEDVS
..::.:::: :::: . : . .
CCDS45 MPNSERHGGKKDGSGGASGTLQPSSGGGSSNSRERHRLV
10 20 30
160 170 180 190 200
pF1KE3 SQ-----SEQGLLLGGASAATAATAAGGTGGSGGSPASSSGTQRRGEGSERRPRR--DRR
:. :... .: .. .:. .. . ::.. . . . :: :.:
CCDS45 SKHKRHKSKHSKDMGLVTPEAASLGTVIKPLVEYDDISSDSDTFSDDMAFKLDRRENDER
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250
pF1KE3 SSSGRS----KERHREHRR-RDGQRGG-SEASKSRSRHSHSGEERAEVAKSGSSSSSGGR
.: :: :.::..::: :: .. .: ::. :.:: . .. ::::. :. .
CCDS45 RGSDRSDRLHKHRHHQHRRSRDLLKAKQTEKEKSQEVSSKSGSMKDRI--SGSSKRSNEE
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 RKS-ASATSSSSSSRKDRDSKAHRSRTKSSKEPPSAYKEPPKAYREDKTEPKAYR-----
. ..: ..:::...:.:: :. .:.. .: :..:. :..:. .: ::.:.
CCDS45 TDDYGKAQVAKSSSKESRSSKLHKEKTRKERELKSGHKDRSKSHRKRET-PKSYKTVDSP
160 170 180 190 200 210
320 330 340
pF1KE3 RRRSLSPL------GGRDDSPV--------------SHRASQSLRSRKSPSPAG---GGS
.::: :: . .:::: :: .:. .:::. .. . :
CCDS45 KRRSRSPHRKWSDSSKQDDSPSGASYGQDYDLSPSRSHTSSNYDSYKKSPGSTSRRQSVS
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390
pF1KE3 SPYS-----RRLPRSPSPYSRRR---SP-SYSRHSSYERGGDVS---PSPYSSSSWRRSR
::. . :::::::::. :: : : :::::.:. : ::::. :::
CCDS45 PPYKEPSAYQSSTRSPSPYSRRQRSVSPYSRRRSSSYERSGSYSGRSPSPYGR---RRSS
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pF1KE3 SPY--------SPV-LRRSGKSRSRSPYSSRHSRSRSRHRLSRSRSRHSSISPSTLTLKS
::. ::. :.: ::::::: :::: :.:... : :::::::::: : :.:
CCDS45 SPFLSKRSLSRSPLPSRKSMKSRSRSPAYSRHSSSHSKKKRSSSRSRHSSISPVRLPLNS
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450 460 470 480 490
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::.:::...:: ::: :: : .: .... . : .. :: :.
CCDS45 SLGAELSRKKKERAAAAAAAKMDGKESKGSPVFLPRKENSSVEAKDSGLESKKLPRSVKL
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pF1KE3 --STP-------TKGNTETSASA----------SQTNHVKDVKK----------IKIE--
:.: :. :::.. :. :. . :::.: .: :
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pF1KE3 ----------------------HAPSPSSGGTLKNDKAKTKPPLQVTKVENNLIVDKATK
: :.. .. ::. . . : .. .
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560 570 580 590 600 610
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. : ... : :. .: .:: . ...: . ....: . . .: . :::::::::
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620 630 640 650 660
pF1KE3 PPMLPEDKEADSLRGNISVKAVKKEVEKKLRCLLADLPLPPELPGGDDLSK--SPEEKK-
::.:: : . :: . .. : :::: :.. : ::.:::::::::::: :: ::: :
CCDS45 PPLLPGDDDMDSPKETLPSKPVKKEKEQRTRHLLTDLPLPPELPGGD-LSPPDSPEPKAI
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670 680 690 700 710 720
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: : :.::::: ::::: .. . :::::::::::::::::::::::::::.::::::
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.::::::::::::::::::::::::::::: :.:..:::::::::.::::::::::::::
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::::::::::::::::::::.:.::::::.::::::.::::::::::::::::::::: :
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:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 QIKLADFGLARLYNSEESRPYTNKVITLWYRPPELLLGEERYTPAIDVWSCGCILGELFT
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pF1KE3 KKPIFQANQELAQLELISRICGSPCPAVWPDVIKLPYFNTMKPKKQYRRKLREEFVFIPA
:::::::: ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::::: :::.
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:::::.:.::.:::::::::::.:: .::.::: ::: ::::: :::::::::::::::.
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pF1KE3 QMGMT-DDVSTIKAPRKDLSLGL--DDSRTNTPQGVLPSSQLKSQGSSNVAPGEKQTDPS
: :.. .. :. ::. . : . ....: :. .:... : : . .
CCDS45 QSGVVVEEPPPSKTSRKETTSGTSTEPVKNSSPAPPQPAPGKVESGAGD-AIGLADITQQ
1060 1070 1080 1090 1100 1110
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pF1KE3 TPQQESSKPLGGIQPSSQTIQPK------VETDAAQAAVQSAFAVLLTQLIKAQQSKQKD
:.: . :. .: ... :. .... . :. .. : .: ...: .
CCDS45 LNQSELAVLLNLLQSQTDLSIPQMAQLLNIHSNPEMQQQLEALNQSISALTEATSQQQDS
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1150 1160 1170 1180
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. .:. . .. . : : :::.. :. : . : :. : .
CCDS45 ETMAPEESLKEAPSAPVILPSAEQTTLEASSTPADMQNILAVLLSQLMKTQEPAGSLEEN
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:. :: : : ..:::::: :::..: :: :
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:. . . .: :::::::. ::. .: . ..:: . .:. :
CCDS45 SAPQELNPAVTAALLQLLS--QPEAEPPGHLPHEHQA-------------LRPMEYSTRP
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: :....: : : :.. :. ... . . . : . ...: .:.. :
CCDS45 R-PNRTYGNTDGPET------GFSAIDT-DERNSGPALTESLVQTLVKNRTFSGSLSHLG
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1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KE3 DI--YLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAVLANSSDPSTGPE--STHPLPAKMHNYNYGG
. : ..: . : ::.: :: .. :.:. ..: : :. . :. . :::
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.: . .: : : : .:.:. .:.. ::: . :::::.::
CCDS45 ELGPGTTGASSSGAGLHWGGPTQSSAYGKLYRGPTRVPPRGGRGRGVPY
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CCDS11 SKHKRHKSKHSKDMGLVTPEAASLGTVIKPLVEYDDISSDSDTFSDDMAFKLDRRENDER
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CCDS11 RGSDRSDRLHKHRHHQHRRSRDLLKAKQTEKEKSQEVSSKSGSMKDRI--SGSSKRSNEE
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. ..: ..:::...:.:: :. .:.. .: :..:. :..:. .: ::.:.
CCDS11 TDDYGKAQVAKSSSKESRSSKLHKEKTRKERELKSGHKDRSKSHRKRET-PKSYKTVDSP
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pF1KE3 RRRSLSPL------GGRDDSPV--------------SHRASQSLRSRKSPSPAG---GGS
.::: :: . .:::: :: .:. .:::. .. . :
CCDS11 KRRSRSPHRKWSDSSKQDDSPSGASYGQDYDLSPSRSHTSSNYDSYKKSPGSTSRRQSVS
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::.:::...:: ::: :: : .: .... . : .. :: :.
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1080 1090
pF1KE3 ------------EKQTDPSTPQ---------------------------------QESSK
..::: : :: :..:.
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.. . ::. .: :..: . .:. .:. .::::.::.:.:. . ::
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::.: .... : : :. : :. : . : :.::::..:::::
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CCDS11 PGPPPPPPPPPLVEGDL------------SSAPQELNPAVTAALLQLLS--QPEAEPPGH
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..:: . .:. : : :....: : : :.. :
CCDS11 LPHEHQA-------------LRPMEYSTRPR-PNRTYGNTDGPET------GFSAIDT-D
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1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KE3 NYSTASSHSGGPPQPSAFSESFPSSVAGYGDI--YLNAGPMLFSGDKDHRFEYSHGPIAV
. ... . . . : . ...: .:.. :. : ..: . : ::.: :: .. :.:.
CCDS11 ERNSGPALTESLVQTLVKNRTFSGSLSHLGESSSYQGTGSVQFPGDQDLRF--ARVPLAL
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1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KE3 LANSSDPSTGPE--STHPLPAKMHNYNYGGNLQENPSGPSLMH-GQTWTSPAQGPGYSQG
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CCDS11 HPVVGQPFLKAEGSSNSVVHAETKLQNYG-ELGPGTTGASSSGAGLHWGGPTQSSAYGKL
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1440 1450
pF1KE3 YRGHISTSTGRGRGRGLPY
::: . :::::.::
CCDS11 YRGPTRVPPRGGRGRGVPY
1480 1490
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CCDS68 ALKKVLMENEKEGFPITALREIKILQLLKHENVVNLIEICRTK--ASPYNRCKGSIYLVF
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pF1KE3 EYMDHDLMGLLESGLVHFNENHIKSFMRQLMEGLDYCHKKNFLHRDIKCSNILLNNRGQI
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CCDS68 DFCEHDLAGLLSNVLVKFTLSEIKRVMQMLLNGLYYIHRNKILHRDMKAANVLITRDGVL
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CCDS68 KLADFGLARAFSLAKNSQPNRYTNRVVTLWYRPPELLLGERDYGPPIDLWGAGCIMAEMW
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CCDS68 TRSPIMQGNTEQHQLALISQLCGSITPEVWPNVDNYELYEKLELVKGQKRKVKDRLKAYV
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CCDS11 SG---TPKGSGAGYGVGFDLEEFLNQSFDMGVADGPQDGQADSASLSASLLADWLEGHGM
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CCDS56 RFVALKRVRVQTGEEGMPLSTIREVAVLRHLETFEHPNVVRLFDVCTVSRTDRETK----
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CCDS56 -LTLVFEHVDQDLTTYLDKVPEPGV---PTETIKDMMFQLLRGLDFLHSHRVVHRDLKPQ
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CCDS56 NILVTSSGQIKLADFGLARIYSFQMA--LTSVVVTLWYRAPEVLLQSSYATP-VDLWSVG
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CCDS56 CIFAEMFRRKPLFRGSSDVDQLGKILDVIGLPGEEDWPRDVALPRQAFHSKSAQPIEKFV
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CCDS56 NTA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]